Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yp2_B.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 2.A N LEU 49.A O VAL 2.A H 3.039 2.223 PHE 4.A N HIS 51.A O PHE 4.A H 2.915 2.126 LEU 6.A N PHE 53.A O LEU 6.A H 2.974 2.140 ALA 9.A N LEU 6.A O ALA 9.A H 3.073 2.226 ASP 10.A N SER 13.A OG ASP 10.A H 3.110 2.278 SER 13.A N ASP 10.A OD1 SER 13.A H 2.869 2.025 TYR 14.A N ASP 10.A O TYR 14.A H 2.977 2.122 TYR 14.A OH THR 157.A O TYR 14.A HH 2.687 1.855 GLY 15.A N PRO 11.A O GLY 15.A H 2.959 2.131 MET 16.A N ARG 12.A O MET 16.A H 2.986 2.185 PHE 17.A N SER 13.A O PHE 17.A H 2.943 2.125 ILE 18.A N TYR 14.A O ILE 18.A H 2.944 2.120 LYS 19.A N GLY 15.A O LYS 19.A H 2.986 2.154 ASP 20.A N MET 16.A O ASP 20.A H 2.925 2.131 LEU 21.A N PHE 17.A O LEU 21.A H 2.803 2.009 ARG 22.A N ILE 18.A O ARG 22.A H 2.957 2.107 ARG 22.A NE ALA 162.A O ARG 22.A HE 2.821 1.971 ARG 22.A NH1 GLU 168.A OE1 ARG 22.A HH12 3.022 2.327 ARG 22.A NH2 ALA 161.A O ARG 22.A HH21 2.854 2.164 ARG 22.A NH2 GLU 168.A OE1 ARG 22.A HH22 2.807 2.045 ASN 23.A N LYS 19.A O ASN 23.A H 2.944 2.132 ALA 24.A N ASP 20.A O ALA 24.A H 2.998 2.391 ALA 24.A N LEU 21.A O ALA 24.A H 3.210 2.478 LEU 25.A N ARG 22.A O LEU 25.A H 3.154 2.305 VAL 31.A N ILE 34.A O VAL 31.A H 2.945 2.132 ILE 34.A N VAL 31.A O ILE 34.A H 3.009 2.183 LEU 36.A N GLU 29.A O LEU 36.A H 3.000 2.148 LEU 37.A N LEU 240.A O LEU 37.A H 2.908 2.082 ARG 46.A N GLY 43.A O ARG 46.A H 3.165 2.314 ARG 46.A NE ASP 65.A OD2 ARG 46.A HE 2.831 2.043 ARG 46.A NH1 VAL 41.A O ARG 46.A HH11 3.159 2.341 ARG 46.A NH2 ASP 65.A OD2 ARG 46.A HH21 3.394 2.763 TYR 47.A N ALA 44.A O TYR 47.A H 3.112 2.269 LEU 48.A N VAL 64.A O LEU 48.A H 2.834 2.009 MET 50.A N VAL 62.A O MET 50.A H 2.837 2.004 HIS 51.A N VAL 2.A O HIS 51.A H 2.769 1.936 HIS 51.A NE2 ASP 1.A OD2 no hydrogen 2.739 N/A LEU 52.A N ILE 60.A O LEU 52.A H 2.918 2.067 PHE 53.A N PHE 4.A O PHE 53.A H 2.969 2.155 ASN 54.A N LYS 58.A O ASN 54.A H 2.776 1.981 ASN 54.A ND2 SER 137.A OG ASN 54.A HD22 2.884 2.100 TYR 55.A N ASP 133.A OD1 TYR 55.A H 2.722 1.897 GLY 57.A N ASN 54.A O GLY 57.A H 2.874 2.037 LYS 58.A N ASN 54.A OD1 LYS 58.A H 2.954 2.253 THR 59.A OG1 LEU 52.A O THR 59.A HG1 2.889 2.149 ILE 60.A N LEU 52.A O ILE 60.A H 3.005 2.240 THR 61.A N LEU 75.A O THR 61.A H 3.021 2.223 THR 61.A OG1 HIS 51.A ND1 THR 61.A HG1 3.028 2.335 VAL 62.A N MET 50.A O VAL 62.A H 2.799 1.962 ALA 63.A N GLY 73.A O ALA 63.A H 2.907 2.062 VAL 64.A N LEU 48.A O VAL 64.A H 2.817 1.981 ASP 65.A N TYR 70.A O ASP 65.A H 2.826 1.983 VAL 66.A N ARG 46.A O VAL 66.A H 2.869 2.034 THR 67.A N ASP 65.A OD1 THR 67.A H 2.843 2.024 THR 67.A OG1 ASP 65.A OD1 THR 67.A HG1 2.626 1.787 ASN 68.A N ASP 65.A O ASN 68.A H 3.288 2.456 VAL 69.A N ASP 65.A O VAL 69.A H 2.794 2.117 TYR 70.A N ASN 68.A OD1 TYR 70.A H 2.936 2.091 MET 72.A N ALA 63.A O MET 72.A H 2.883 2.036 TYR 74.A N TYR 81.A O TYR 74.A H 2.847 2.096 LEU 75.A N THR 61.A O LEU 75.A H 2.718 1.915 ALA 76.A N THR 79.A O ALA 76.A H 2.912 2.060 THR 79.A N ALA 76.A O THR 79.A H 3.122 2.270 SER 80.A N ARG 101.A O SER 80.A H 3.011 2.199 TYR 81.A N TYR 74.A O TYR 81.A H 2.850 2.094 PHE 82.A N ILE 103.A O PHE 82.A H 3.043 2.274 PHE 83.A N MET 72.A O PHE 83.A H 3.170 2.350 ASN 84.A N TYR 107.A O ASN 84.A H 2.933 2.073 GLU 85.A N PHE 83.A O GLU 85.A H 3.112 2.516 ALA 88.A N GLU 85.A O ALA 88.A H 3.119 2.498 GLU 89.A N GLU 85.A O GLU 89.A H 3.052 2.228 LEU 90.A N PRO 86.A O LEU 90.A H 2.948 2.103 ALA 91.A N ALA 87.A O ALA 91.A H 3.052 2.262 SER 92.A N ALA 88.A O SER 92.A H 2.961 2.203 SER 92.A N GLU 89.A O SER 92.A H 3.193 2.599 SER 92.A OG GLU 89.A O SER 92.A HG 2.737 1.914 GLN 93.A N LEU 90.A O GLN 93.A H 2.944 2.120 TYR 94.A N ALA 91.A O TYR 94.A H 2.870 2.025 VAL 95.A N ALA 91.A O VAL 95.A H 3.044 2.251 ALA 99.A N PHE 96.A O ALA 99.A H 3.075 2.225 ARG 100.A N THR 78.A O ARG 100.A H 2.776 2.075 ARG 101.A NE THR 79.A OG1 ARG 101.A HE 2.848 1.999 ARG 101.A NH1 THR 79.A OG1 ARG 101.A HH11 3.279 2.578 ILE 103.A N SER 80.A O ILE 103.A H 2.803 1.959 LEU 105.A N PHE 82.A O LEU 105.A H 2.810 2.004 TYR 107.A OH SER 144.A O TYR 107.A HH 2.781 1.994 GLY 109.A N.A GLU 85.A OE1 GLY 109.A H.A 2.782 1.937 GLY 109.A N.B GLU 85.A OE1 GLY 109.A H.B 2.792 1.965 TYR 111.A OH GLU 160.A OE2 TYR 111.A HH 2.605 1.842 ARG 113.A N ASN 110.A OD1 ARG 113.A H 2.921 2.085 LEU 114.A N ASN 110.A O LEU 114.A H 3.018 2.166 GLN 115.A N TYR 111.A O GLN 115.A H 2.882 2.052 ILE 116.A N GLU 112.A O ILE 116.A H 3.257 2.423 ALA 117.A N ARG 113.A O ALA 117.A H 3.076 2.252 ALA 118.A N LEU 114.A O ALA 118.A H 2.836 2.039 GLY 119.A N GLN 115.A O GLY 119.A H 2.895 2.282 GLY 119.A N ILE 116.A O GLY 119.A H 3.213 2.499 LYS 120.A N GLN 115.A O LYS 120.A H 3.222 2.562 ARG 122.A N GLN 115.A OE1 ARG 122.A H 2.881 2.027 ARG 122.A NE GLN 115.A OE1 ARG 122.A HE 3.013 2.175 ARG 122.A NH1 GLU 189.A OE1 ARG 122.A HH11 2.868 2.039 ARG 122.A NH1 ASN 190.A OD1 ARG 122.A HH12 2.853 2.095 ARG 122.A NH2 ASN 190.A OD1 ARG 122.A HH22 2.911 2.177 GLU 123.A N GLU 123.A OE1 GLU 123.A H 2.784 2.050 LYS 124.A N PRO 121.A O LYS 124.A H 2.951 2.095 ILE 125.A N ARG 122.A O ILE 125.A H 3.104 2.247 ILE 127.A N GLU 179.A O ILE 127.A H 3.022 2.168 LEU 129.A N ARG 174.A O LEU 129.A H 3.015 2.241 ALA 131.A N ASP 178.A OD1 ALA 131.A H 2.884 2.149 LEU 132.A N GLY 128.A O LEU 132.A H 3.012 2.251 ASP 133.A N LEU 129.A O ASP 133.A H 2.947 2.119 SER 134.A N PRO 130.A O SER 134.A H 2.995 2.168 ALA 135.A N ALA 131.A O ALA 135.A H 2.832 2.058 ILE 136.A N LEU 132.A O ILE 136.A H 2.917 2.072 SER 137.A N ASP 133.A O SER 137.A H 3.137 2.311 SER 137.A OG ASP 133.A O SER 137.A HG 3.009 2.238 THR 138.A N SER 134.A O THR 138.A H 2.891 2.066 LEU 139.A N ALA 135.A O LEU 139.A H 2.972 2.168 LEU 140.A N ILE 136.A O LEU 140.A H 3.191 2.577 LEU 140.A N SER 137.A O LEU 140.A H 3.291 2.548 HIS 141.A N THR 138.A O HIS 141.A H 3.287 2.477 ALA 146.A N ASP 143.A OD1 ALA 146.A H 3.150 2.291 ALA 147.A N ASP 143.A O ALA 147.A H 2.764 1.944 ALA 148.A N SER 144.A O ALA 148.A H 3.103 2.400 ALA 148.A N THR 145.A O ALA 148.A H 3.251 2.585 ALA 150.A N ALA 146.A O ALA 150.A H 3.064 2.220 LEU 151.A N ALA 147.A O LEU 151.A H 2.801 1.979 LEU 152.A N ALA 148.A O LEU 152.A H 3.031 2.220 VAL 153.A N GLY 149.A O VAL 153.A H 3.098 2.292 LEU 154.A N ALA 150.A O LEU 154.A H 2.862 2.036 ILE 155.A N LEU 151.A O ILE 155.A H 2.851 2.002 GLN 156.A N LEU 152.A O GLN 156.A H 3.367 2.549 GLN 156.A NE2 GLU 189.A OE2 GLN 156.A HE21 2.573 1.726 THR 157.A N VAL 153.A O THR 157.A H 3.019 2.250 THR 157.A OG1 VAL 153.A O THR 157.A HG1 2.923 2.129 THR 157.A OG1 LEU 154.A O THR 157.A HG1 3.362 2.870 THR 158.A N LEU 154.A O THR 158.A H 3.095 2.502 THR 158.A OG1 LEU 154.A O THR 158.A HG1 2.719 1.892 GLU 160.A N ILE 155.A O GLU 160.A H 3.071 2.239 ALA 162.A N THR 158.A O ALA 162.A H 2.874 2.055 ARG 163.A N ALA 159.A O ARG 163.A H 3.012 2.235 ARG 163.A NH1 GLU 160.A OE1 ARG 163.A HH11 2.922 2.113 ARG 163.A NH2 ASN 68.A O ARG 163.A HH21 2.771 1.940 PHE 164.A N GLU 160.A O PHE 164.A H 3.006 2.302 LYS 165.A N ASN 236.A O LYS 165.A H 2.918 2.063 LYS 165.A NZ GLU 168.A OE1 LYS 165.A HZ2 3.029 2.392 TYR 166.A N ASN 236.A OD1 TYR 166.A H 3.018 2.159 TYR 166.A OH SER 182.A OG TYR 166.A HH 2.786 1.956 GLU 168.A N PHE 164.A O GLU 168.A H 3.106 2.266 GLN 169.A N LYS 165.A O GLN 169.A H 2.904 2.080 GLN 170.A N TYR 166.A O GLN 170.A H 2.899 2.109 ILE 171.A N ILE 167.A O ILE 171.A H 2.998 2.197 GLN 172.A N GLU 168.A O GLN 172.A H 2.944 2.125 GLN 172.A NE2 PRO 11.A O GLN 172.A HE21 2.912 2.075 GLU 173.A N GLN 169.A O GLU 173.A H 2.944 2.135 ARG 174.A N ILE 171.A O ARG 174.A H 2.890 2.199 ARG 174.A NE GLU 179.A O ARG 174.A HE 2.993 2.162 ARG 174.A NH1 GLN 170.A O ARG 174.A HH11 3.002 2.189 ARG 174.A NH1 GLN 170.A OE1.B ARG 174.A HH12 2.966 2.367 ARG 174.A NH2 GLN 170.A OE1.B ARG 174.A HH22 3.421 2.907 ARG 174.A NH2 VAL 180.A O ARG 174.A HH21 2.899 2.053 ALA 175.A N GLN 172.A O ALA 175.A H 3.220 2.531 GLU 179.A N ILE 127.A O GLU 179.A H 2.989 2.186 SER 182.A N GLN 170.A OE1.A SER 182.A H 3.089 2.231 SER 182.A OG THR 185.A OG1 SER 182.A HG 3.139 2.430 THR 185.A N SER 182.A OG THR 185.A H 3.129 2.312 THR 185.A OG1 GLN 170.A OE1.A THR 185.A HG1 2.682 2.023 ILE 186.A N SER 182.A O ILE 186.A H 3.194 2.374 SER 187.A N LEU 183.A O SER 187.A H 2.976 2.160 SER 187.A OG ALA 184.A O SER 187.A HG 2.917 2.099 LEU 188.A N ALA 184.A O LEU 188.A H 2.948 2.128 GLU 189.A N THR 185.A O GLU 189.A H 3.027 2.169 ASN 190.A N ILE 186.A O ASN 190.A H 2.950 2.138 SER 191.A N LEU 188.A O SER 191.A H 3.026 2.248 SER 191.A OG SER 187.A O SER 191.A HG 2.752 2.058 TRP 192.A NE1 LEU 239.A O TRP 192.A HE1 2.880 2.049 LEU 195.A N SER 191.A O LEU 195.A H 2.781 1.924 SER 196.A N TRP 192.A O SER 196.A H 2.911 2.068 SER 196.A OG TRP 192.A O SER 196.A HG 2.811 2.098 LYS 197.A N SER 193.A O LYS 197.A H 2.920 2.092 GLN 198.A N GLY 194.A O GLN 198.A H 3.030 2.203 ILE 199.A N LEU 195.A O ILE 199.A H 2.929 2.105 GLN 200.A N SER 196.A O GLN 200.A H 3.123 2.279 GLN 200.A NE2 SER 196.A O GLN 200.A HE21 2.964 2.204 GLN 200.A NE2 LEU 241.A O GLN 200.A HE22 2.693 1.921 LEU 201.A N LYS 197.A O LEU 201.A H 2.856 2.033 ALA 202.A N GLN 198.A O ALA 202.A H 2.822 2.136 GLN 203.A N GLN 200.A O GLN 203.A H 3.191 2.497 ASN 205.A N ALA 202.A O ASN 205.A H 2.906 2.080 ASN 205.A ND2 ILE 208.A O ASN 205.A HD22 2.946 2.130 GLY 207.A N ALA 202.A O GLY 207.A H 3.003 2.181 ILE 208.A N ASN 205.A O ILE 208.A H 2.989 2.154 PHE 209.A N THR 226.A O PHE 209.A H 2.837 1.994 THR 211.A N GLN 198.A OE1 THR 211.A H 2.939 2.114 ILE 213.A N ILE 225.A O ILE 213.A H 3.056 2.257 LEU 215.A N VAL 223.A O LEU 215.A H 2.919 2.088 VAL 216.A N SER 187.A OG VAL 216.A H 3.177 2.318 ASP 217.A N ASN 221.A O ASP 217.A H 2.837 2.014 LYS 219.A N ASP 217.A OD1 LYS 219.A H 2.922 2.201 GLY 220.A N ASP 217.A O GLY 220.A H 2.968 2.128 ASN 221.A N ASP 217.A OD1 ASN 221.A H 2.929 2.093 VAL 223.A N LEU 215.A O VAL 223.A H 2.874 2.050 ILE 225.A N ILE 213.A O ILE 225.A H 2.792 1.933 ASN 227.A ND2 THR 226.A OG1 ASN 227.A HD21 3.106 2.436 VAL 228.A N GLY 207.A O VAL 228.A H 2.900 2.146 THR 229.A N ASN 227.A OD1 THR 229.A H 2.959 2.127 THR 229.A OG1 ASN 227.A OD1 THR 229.A HG1 2.683 1.845 SER 230.A N ASN 227.A O SER 230.A H 3.289 2.432 VAL 232.A N SER 230.A OG VAL 232.A H 3.166 2.376 VAL 233.A N SER 230.A O VAL 233.A H 2.856 2.097 THR 234.A N SER 230.A O THR 234.A H 2.940 2.124 SER 235.A N.A LYS 231.A O SER 235.A H.A 2.947 2.169 SER 235.A N.B LYS 231.A O SER 235.A H.B 2.965 2.130 SER 235.A OG.A THR 234.A OG1 SER 235.A HG.A 3.180 2.346 ASN 236.A N LYS 231.A O ASN 236.A H 3.113 2.435 ILE 237.A N VAL 232.A O ILE 237.A H 2.956 2.103 GLN 238.A N ARG 163.A O GLN 238.A H 2.755 1.955 GLN 238.A NE2 SER 235.A O.A GLN 238.A HE21 3.488 3.031 GLN 238.A NE2 ASN 236.A O GLN 238.A HE21 3.095 2.288 LEU 240.A N PRO 35.A O LEU 240.A H 2.958 2.179 LEU 241.A N SER 196.A OG LEU 241.A H 2.985 2.210 ASN 242.A ND2 LEU 37.A O ASN 242.A HD22 2.992 2.150 THR 243.A N GLN 200.A OE1 THR 243.A H 3.041 2.221 ARG 244.A N ASN 242.A OD1 ARG 244.A H 2.999 2.145 ASN 245.A N ASN 242.A O ASN 245.A H 2.855 2.018 ASN 245.A ND2 PRO 39.A O ASN 245.A HD21 2.964 2.155 ILE 246.A N THR 243.A O ILE 246.A H 2.996 2.169