Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yzd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 4.A N ILE 7.A O VAL 4.A H 3.165 2.502 LYS 6.A N GLU 70.A OE2 LYS 6.A H 3.152 2.434 SER 8.A N MET 28.A O SER 8.A H 3.069 2.375 PHE 9.A N VAL 2.A O PHE 9.A H 3.410 2.585 LEU 15.A N VAL 24.A O LEU 15.A H 2.746 1.996 GLY 16.A N VAL 24.A O GLY 16.A H 3.402 2.594 GLY 18.A N THR 22.A O GLY 18.A H 2.550 1.698 THR 22.A N ALA 19.A O THR 22.A H 3.201 2.373 THR 22.A OG1 ALA 19.A O THR 22.A HG1 2.634 1.968 ILE 23.A N ARG 38.A O ILE 23.A H 3.115 2.317 VAL 24.A N GLY 16.A O VAL 24.A H 2.993 2.154 TYR 25.A N VAL 36.A O TYR 25.A H 2.635 1.808 GLY 27.A N VAL 34.A O GLY 27.A H 2.819 1.985 MET 28.A N SER 8.A O MET 28.A H 2.597 1.754 PHE 29.A N ARG 32.A O PHE 29.A H 3.263 2.608 VAL 34.A N GLY 27.A O VAL 34.A H 2.489 1.647 ALA 35.A N ILE 80.A O ALA 35.A H 2.790 1.943 VAL 36.A N TYR 25.A O VAL 36.A H 2.793 1.954 LYS 37.A N ILE 78.A O LYS 37.A H 2.784 1.944 ARG 38.A N ILE 23.A O ARG 38.A H 2.673 1.819 ILE 39.A N GLN 76.A O ILE 39.A H 2.987 2.135 GLU 42.A N GLU 42.A OE1 GLU 42.A H 2.708 1.905 CYS 43.A N LEU 40.A O CYS 43.A H 2.799 2.015 PHE 44.A N LEU 40.A O PHE 44.A H 3.033 2.267 SER 45.A N CYS 153.A O SER 45.A H 2.762 1.921 ALA 47.A N GLY 151.A O ALA 47.A H 3.331 2.487 VAL 51.A N ALA 47.A O VAL 51.A H 3.376 2.544 GLN 52.A N ASP 48.A O GLN 52.A H 3.005 2.176 GLN 52.A NE2 GLU 56.A OE2 GLN 52.A HE21 2.776 1.917 LEU 53.A N ARG 49.A O LEU 53.A H 2.947 2.106 LEU 54.A N GLU 50.A O LEU 54.A H 3.193 2.381 ARG 55.A N VAL 51.A O ARG 55.A H 3.034 2.247 GLU 56.A N GLN 52.A O GLU 56.A H 2.933 2.211 SER 57.A N LEU 54.A O SER 57.A H 3.379 2.535 HIS 60.A NE2 SER 112.A OG HIS 60.A HE2 2.784 2.008 ASN 62.A N HIS 60.A ND1 ASN 62.A H 3.044 2.241 ASN 62.A ND2 ALA 145.A O ASN 62.A HD22 3.034 2.238 VAL 63.A N HIS 60.A O VAL 63.A H 3.091 2.254 ILE 64.A N ILE 147.A O ILE 64.A H 3.139 2.312 ARG 65.A NE GLU 81.A OE1 ARG 65.A HE 3.326 2.502 TYR 66.A OH PHE 150.A O TYR 66.A HH 2.731 1.908 PHE 67.A N ALA 79.A O PHE 67.A H 2.831 2.089 GLU 70.A N TYR 77.A O GLU 70.A H 2.903 2.110 LYS 71.A NZ GLN 76.A OE1 LYS 71.A HZ1 3.094 2.463 ASP 72.A N PHE 75.A O ASP 72.A H 3.272 2.544 PHE 75.A N ASP 72.A OD1 PHE 75.A H 2.626 1.818 GLN 76.A N ILE 39.A O GLN 76.A H 2.960 2.167 TYR 77.A N GLU 70.A O TYR 77.A H 2.598 1.752 ILE 78.A N LYS 37.A O ILE 78.A H 2.988 2.196 ALA 79.A N CYS 68.A O ALA 79.A H 2.987 2.173 ILE 80.A N ALA 35.A O ILE 80.A H 2.803 1.973 ALA 84.A N ILE 134.A O ALA 84.A H 2.851 2.129 THR 86.A N GLU 89.A OE1 THR 86.A H 3.209 2.469 THR 86.A OG1 GLU 89.A OE1 THR 86.A HG1 2.439 1.625 LEU 87.A N PRO 129.A O LEU 87.A H 3.137 2.343 LEU 87.A N ILE 132.A O LEU 87.A H 2.910 2.283 GLN 88.A N THR 86.A OG1 GLN 88.A H 3.195 2.473 GLN 88.A NE2 GLU 92.A OE2 GLN 88.A HE21 3.246 2.457 GLU 89.A N GLU 89.A OE1 GLU 89.A H 2.591 1.829 TYR 90.A N THR 86.A O TYR 90.A H 3.331 2.524 TYR 90.A OH LEU 101.A O TYR 90.A HH 2.655 1.880 VAL 91.A N LEU 87.A O VAL 91.A H 2.942 2.136 GLU 92.A N GLN 88.A O GLU 92.A H 2.828 2.000 GLN 93.A N GLU 89.A O GLN 93.A H 2.654 1.984 ALA 97.A N LYS 94.A O ALA 97.A H 2.993 2.279 HIS 98.A N ASP 95.A O HIS 98.A H 3.407 2.557 HIS 98.A NE2 TYR 90.A O HIS 98.A HE2 3.052 2.303 LEU 101.A N HIS 98.A O LEU 101.A H 3.303 2.446 THR 105.A OG1 GLU 102.A O THR 105.A HG1 3.201 2.397 LEU 106.A N GLU 102.A O LEU 106.A H 2.867 2.089 LEU 107.A N PRO 103.A O LEU 107.A H 2.954 2.108 GLN 108.A N ILE 104.A O GLN 108.A H 2.883 2.107 GLN 109.A N THR 105.A O GLN 109.A H 2.841 2.007 THR 110.A N LEU 106.A O THR 110.A H 2.940 2.110 THR 111.A N LEU 107.A O THR 111.A H 2.874 2.026 THR 111.A OG1 LEU 107.A O THR 111.A HG1 2.812 2.014 SER 112.A N GLN 108.A O SER 112.A H 2.785 1.993 GLY 113.A N GLN 109.A O GLY 113.A H 3.016 2.156 LEU 114.A N THR 110.A O LEU 114.A H 2.948 2.195 ALA 115.A N THR 111.A O ALA 115.A H 2.937 2.155 HIS 116.A N SER 112.A O HIS 116.A H 3.015 2.304 LEU 117.A N GLY 113.A O LEU 117.A H 3.323 2.540 HIS 118.A N LEU 114.A O HIS 118.A H 3.125 2.273 HIS 118.A NE2 ASP 176.A OD2 HIS 118.A HE2 2.994 2.142 SER 119.A N ALA 115.A O SER 119.A H 2.838 2.093 LEU 120.A N LEU 117.A O LEU 120.A H 2.770 2.048 ASN 121.A N HIS 118.A O ASN 121.A H 2.899 2.058 ILE 122.A N LEU 117.A O ILE 122.A H 3.076 2.226 HIS 124.A N ASP 176.A OD2 HIS 124.A H 2.588 1.775 ARG 125.A N ASP 176.A OD1 ARG 125.A H 3.054 2.200 ARG 125.A NH1 LEU 152.A O ARG 125.A HH12 3.483 2.783 LYS 128.A NZ THR 160.A OG1 LYS 128.A HZ1 2.747 1.920 HIS 130.A NE2 GLN 88.A OE1 HIS 130.A HE2 2.602 1.967 ASN 131.A N LYS 128.A O ASN 131.A H 3.016 2.358 ASN 131.A ND2 ASP 126.A O ASN 131.A HD21 3.407 2.609 ASN 131.A ND2 ASP 126.A OD2 ASN 131.A HD22 2.992 2.338 ILE 132.A N LYS 128.A O ILE 132.A H 3.152 2.436 ILE 132.A N PRO 129.A O ILE 132.A H 3.219 2.548 LEU 133.A N MET 146.A O LEU 133.A H 2.827 1.974 ILE 134.A N ALA 85.A O ILE 134.A H 2.743 1.888 SER 135.A N LYS 144.A O SER 135.A H 3.007 2.149 SER 135.A OG LYS 144.A O SER 135.A HG 3.281 2.546 ASN 138.A N LYS 142.A O ASN 138.A H 3.387 2.580 GLY 141.A N ASN 138.A O GLY 141.A H 2.613 1.758 LYS 144.A NZ PRO 61.A O LYS 144.A HZ2 3.176 2.374 ALA 145.A N GLN 109.A OE1 ALA 145.A H 2.871 2.139 MET 146.A N LEU 133.A O MET 146.A H 2.861 2.054 ILE 147.A N ASN 62.A O ILE 147.A H 2.999 2.247 SER 148.A N ASN 131.A O SER 148.A H 2.750 2.061 CYS 153.A N SER 45.A O CYS 153.A H 3.163 2.303 LYS 155.A N CYS 43.A O LYS 155.A H 2.618 1.784 THR 160.A OG1 ASP 126.A OD1 THR 160.A HG1 3.162 2.416 THR 160.A OG1 ASP 126.A OD2 THR 160.A HG1 3.396 2.745 GLY 162.A N GLN 202.A OE1 GLY 162.A H 2.491 1.675 TRP 163.A N THR 160.A O TRP 163.A H 2.981 2.160 GLU 167.A N GLU 167.A OE1 GLU 167.A H 2.801 1.995 MET 168.A N ALA 165.A O MET 168.A H 3.328 2.611 SER 170.A N PRO 166.A O SER 170.A H 3.001 2.256 VAL 175.A N THR 172.A O VAL 175.A H 3.275 2.434 ASP 176.A N TYR 173.A O ASP 176.A H 3.114 2.441 PHE 178.A N THR 174.A O PHE 178.A H 3.248 2.474 SER 179.A N VAL 175.A O SER 179.A H 3.243 2.402 ALA 180.A N ASP 176.A O ALA 180.A H 2.770 1.922 GLY 181.A N ILE 177.A O GLY 181.A H 2.886 2.081 CYS 182.A N PHE 178.A O CYS 182.A H 3.102 2.308 CYS 182.A SG PHE 178.A O CYS 182.A HG 3.582 2.509 VAL 183.A N SER 179.A O VAL 183.A H 2.870 2.050 PHE 184.A N ALA 180.A O PHE 184.A H 2.617 1.805 TYR 185.A N GLY 181.A O TYR 185.A H 3.177 2.334 TYR 186.A N CYS 182.A O TYR 186.A H 2.857 2.099 VAL 187.A N VAL 183.A O VAL 187.A H 2.878 2.076 ILE 188.A N PHE 184.A O ILE 188.A H 3.128 2.268 SER 189.A N TYR 185.A O SER 189.A H 2.764 1.929 SER 189.A OG TYR 185.A O SER 189.A HG 2.358 1.600 SER 189.A OG TYR 186.A O SER 189.A HG 3.234 2.795 GLU 190.A N VAL 187.A O GLU 190.A H 3.208 2.378 GLY 191.A N TYR 186.A O GLY 191.A H 3.190 2.331 HIS 193.A ND1 PHE 195.A O no hydrogen 2.982 N/A PHE 195.A N HIS 193.A ND1 PHE 195.A H 3.140 2.327 ARG 201.A NE LYS 197.A O ARG 201.A HE 3.381 2.622 GLN 202.A NE2 ILE 164.A O GLN 202.A HE21 3.446 2.608 ASN 204.A N GLN 200.A O ASN 204.A H 2.736 1.927 ILE 205.A N ARG 201.A O ILE 205.A H 2.805 2.007 LEU 206.A N GLN 202.A O LEU 206.A H 3.201 2.425 LEU 207.A N ALA 203.A O LEU 207.A H 3.410 2.605 GLY 208.A N ILE 205.A O GLY 208.A H 3.249 2.469 ALA 209.A N ASN 204.A O ALA 209.A H 2.963 2.165 SER 211.A N PRO 194.A O SER 211.A H 3.075 2.227 CYS 214.A N TYR 185.A OH CYS 214.A H 3.405 2.549 HIS 216.A N ASP 222.A OD2 HIS 216.A H 3.005 2.156 GLU 218.A N HIS 216.A ND1 GLU 218.A H 3.262 2.494 GLU 221.A N GLU 221.A OE1.A GLU 221.A H.A 2.528 1.777 VAL 223.A N LYS 219.A O VAL 223.A H 2.735 1.963 ILE 224.A N HIS 220.A O ILE 224.A H 3.019 2.176 ALA 225.A N GLU 221.A O ALA 225.A H 3.453 2.616 ARG 226.A N ASP 222.A O ARG 226.A H 2.871 2.057 ARG 226.A NH1 LEU 212.A O ARG 226.A HH12 3.069 2.436 ARG 226.A NH2 LEU 212.A O ARG 226.A HH22 3.000 2.353 GLU 227.A N VAL 223.A O GLU 227.A H 3.101 2.252 LEU 228.A N ILE 224.A O LEU 228.A H 3.236 2.425 ILE 229.A N ALA 225.A O ILE 229.A H 2.884 2.044 GLU 230.A N ARG 226.A O GLU 230.A H 3.043 2.193 LYS 231.A NZ GLU 227.A OE2 LYS 231.A HZ1 2.645 1.783 MET 232.A N LEU 228.A O MET 232.A H 3.308 2.528 ILE 233.A N ILE 229.A O ILE 233.A H 3.066 2.273 ALA 234.A N LYS 231.A O ALA 234.A H 3.298 2.469 GLN 238.A N ASP 236.A OD1 GLN 238.A H 3.311 2.497 LYS 239.A N ASP 236.A O LYS 239.A H 2.972 2.134 ARG 240.A N PRO 237.A O ARG 240.A H 3.189 2.338 ARG 240.A NE ALA 234.A O ARG 240.A HE 2.774 1.957 ARG 240.A NH1 GLU 167.A OE1 ARG 240.A HH12 3.268 2.690 ARG 240.A NH1 GLU 167.A OE2 ARG 240.A HH12 2.571 1.895 ARG 240.A NH1 THR 174.A O ARG 240.A HH11 2.916 2.177 ARG 240.A NH2 GLU 167.A OE1 ARG 240.A HH22 2.583 1.797 ARG 240.A NH2 ALA 234.A O ARG 240.A HH21 3.087 2.388 ARG 240.A NH2 MET 235.A O ARG 240.A HH21 3.375 2.758 SER 242.A OG HIS 245.A ND1 SER 242.A HG 2.971 2.316 HIS 245.A N SER 242.A OG HIS 245.A H 3.159 2.323 VAL 246.A N SER 242.A O VAL 246.A H 3.108 2.312 LEU 247.A N ALA 243.A O LEU 247.A H 3.266 2.499 LYS 248.A N HIS 245.A O LYS 248.A H 3.140 2.398 LYS 248.A NZ GLN 377.A O LYS 248.A HZ2 3.405 2.719 LYS 248.A NZ PRO 378.A O LYS 248.A HZ2 3.527 2.897 HIS 249.A N VAL 246.A O HIS 249.A H 2.926 2.086 HIS 249.A NE2 GLU 227.A OE1 HIS 249.A HE2 2.325 1.503 PHE 251.A N HIS 249.A ND1 PHE 251.A H 3.074 2.276 PHE 252.A N HIS 249.A O PHE 252.A H 3.137 2.309 TRP 253.A N PRO 250.A O TRP 253.A H 3.181 2.356 TRP 253.A NE1 LYS 248.A O TRP 253.A HE1 3.055 2.422 LYS 257.A N SER 254.A OG LYS 257.A H 3.217 2.388 LYS 257.A NZ PRO 378.A O LYS 257.A HZ1 3.365 2.494 GLN 258.A N SER 254.A O GLN 258.A H 2.972 2.146 LEU 259.A N LEU 255.A O LEU 259.A H 2.895 2.056 GLN 260.A N GLU 256.A O GLN 260.A H 2.737 1.954 GLN 260.A NE2 ASP 264.A OD1 GLN 260.A HE21 2.889 2.122 PHE 261.A N LYS 257.A O PHE 261.A H 2.733 1.956 PHE 262.A N GLN 258.A O PHE 262.A H 3.093 2.267 GLN 263.A N LEU 259.A O GLN 263.A H 2.967 2.168 ASP 264.A N GLN 260.A O ASP 264.A H 2.961 2.102 VAL 265.A N PHE 261.A O VAL 265.A H 2.821 2.021 SER 266.A N PHE 262.A O SER 266.A H 3.113 2.274 ASP 267.A N GLN 263.A O ASP 267.A H 3.189 2.360 ARG 268.A N VAL 265.A O ARG 268.A H 2.985 2.383 ARG 268.A NE GLU 373.A OE2 ARG 268.A HE 2.838 1.980 ARG 268.A NH1 GLU 272.A OE2 ARG 268.A HH12 2.811 2.157 ARG 268.A NH2 GLU 373.A OE1 ARG 268.A HH21 2.360 1.653 ILE 269.A N VAL 265.A O ILE 269.A H 3.226 2.513 ILE 269.A N SER 266.A O ILE 269.A H 3.190 2.514 GLY 276.A N SER 273.A O GLY 276.A H 2.916 2.144 LYS 280.A N GLY 276.A O LYS 280.A H 2.795 1.980 GLN 281.A N PRO 277.A O GLN 281.A H 3.130 2.295 LEU 282.A N ILE 278.A O LEU 282.A H 3.051 2.249 GLU 283.A N VAL 279.A O GLU 283.A H 2.928 2.080 ARG 284.A N GLN 281.A O ARG 284.A H 3.344 2.565 LYS 291.A N ALA 288.A O LYS 291.A H 2.820 2.007 LYS 291.A NZ ARG 355.A O LYS 291.A HZ2 3.039 2.320 MET 292.A N ARG 287.A O MET 292.A H 3.245 2.466 TRP 294.A N GLY 313.A O TRP 294.A H 2.899 2.120 ARG 295.A N ASP 293.A OD1 ARG 295.A H 2.735 2.047 ARG 295.A NE ASP 293.A OD1 ARG 295.A HE 2.968 2.202 ASN 297.A N TRP 294.A O ASN 297.A H 2.943 2.184 THR 299.A N TYR 351.A OH THR 299.A H 2.806 2.031 GLN 303.A N THR 299.A O GLN 303.A H 3.136 2.342 GLN 303.A NE2 ILE 298.A O GLN 303.A HE21 2.490 1.657 THR 304.A N VAL 300.A O THR 304.A H 2.978 2.153 THR 304.A OG1 VAL 300.A O THR 304.A HG1 3.313 2.505 ASP 305.A N PRO 301.A O ASP 305.A H 3.176 2.323 LEU 306.A N LEU 302.A O LEU 306.A H 2.960 2.173 ARG 307.A N THR 304.A O ARG 307.A H 2.822 2.039 LYS 308.A N ASP 305.A O LYS 308.A H 3.353 2.555 LYS 312.A N ASP 318.A OD2 LYS 312.A H 2.504 1.658 SER 315.A OG GLU 283.A OE2 SER 315.A HG 2.375 1.671 VAL 316.A N GLU 283.A OE1 VAL 316.A H 3.341 2.550 ARG 317.A N GLU 283.A OE2 ARG 317.A H 2.945 2.117 ARG 317.A NE ILE 269.A O ARG 317.A HE 2.740 1.894 ARG 317.A NH2 ILE 269.A O ARG 317.A HH21 3.230 2.557 ASP 318.A N SER 315.A OG ASP 318.A H 3.148 2.330 LEU 319.A N SER 315.A O LEU 319.A H 3.222 2.402 LEU 320.A N VAL 316.A O LEU 320.A H 2.811 1.981 ARG 321.A N ARG 317.A O ARG 321.A H 2.891 2.092 ALA 322.A N ASP 318.A O ALA 322.A H 2.919 2.109 MET 323.A N LEU 319.A O MET 323.A H 3.069 2.258 ARG 324.A N LEU 320.A O ARG 324.A H 3.017 2.171 ARG 324.A NE ASP 267.A OD1 ARG 324.A HE 2.669 2.012 ASN 325.A N ARG 321.A O ASN 325.A H 2.846 2.100 LYS 326.A N ALA 322.A O LYS 326.A H 2.929 2.099 LYS 326.A NZ ASP 305.A OD2 LYS 326.A HZ3 2.501 1.701 LYS 327.A N MET 323.A O LYS 327.A H 3.139 2.381 HIS 328.A N ARG 324.A O HIS 328.A H 3.105 2.258 HIS 329.A N ASN 325.A O HIS 329.A H 3.154 2.318 HIS 329.A ND1 ASN 325.A OD1 no hydrogen 3.157 N/A TYR 330.A N LYS 327.A O TYR 330.A H 3.421 2.574 GLU 332.A N HIS 329.A O GLU 332.A H 2.643 1.866 LEU 333.A N TYR 330.A O LEU 333.A H 3.131 2.273 VAL 337.A N PRO 334.A O VAL 337.A H 2.751 2.097 ARG 338.A N PRO 334.A O ARG 338.A H 3.080 2.264 ARG 338.A NH1 LEU 333.A O ARG 338.A HH11 2.275 1.660 GLU 339.A N ALA 335.A O GLU 339.A H 3.175 2.489 THR 340.A OG1 THR 299.A OG1 THR 340.A HG1 2.972 2.285 GLY 342.A N ARG 338.A O GLY 342.A H 3.123 2.359 SER 343.A OG ASP 347.A OD2 SER 343.A HG 3.465 2.657 PHE 348.A N SER 343.A O PHE 348.A H 2.974 2.330 VAL 349.A N PRO 345.A O VAL 349.A H 3.061 2.218 CYS 350.A N ASP 346.A O CYS 350.A H 3.069 2.219 TYR 351.A N ASP 347.A O TYR 351.A H 3.134 2.454 TYR 351.A N PHE 348.A O TYR 351.A H 3.221 2.563 PHE 352.A N VAL 349.A O PHE 352.A H 3.130 2.525 THR 353.A N VAL 349.A O THR 353.A H 2.970 2.117 THR 353.A OG1 VAL 349.A O THR 353.A HG1 3.295 2.540 SER 354.A N CYS 350.A O SER 354.A H 2.983 2.156 ARG 355.A NH1 TYR 351.A O ARG 355.A HH11 3.229 2.422 PHE 356.A N PHE 352.A O PHE 356.A H 2.704 1.982 LEU 359.A N PHE 356.A O LEU 359.A H 3.144 2.293 HIS 362.A N HIS 358.A O HIS 362.A H 2.792 1.956 HIS 362.A NE2 LEU 282.A O HIS 362.A HE2 2.513 1.767 THR 363.A N LEU 359.A O THR 363.A H 2.843 1.987 TYR 364.A N LEU 360.A O TYR 364.A H 2.817 2.022 TYR 364.A OH TYR 379.A O TYR 364.A HH 2.725 1.902 ARG 365.A N ALA 361.A O ARG 365.A H 3.105 2.282 ALA 366.A N HIS 362.A O ALA 366.A H 3.118 2.268 MET 367.A N THR 363.A O MET 367.A H 3.057 2.334 GLU 368.A N ARG 365.A O GLU 368.A H 3.327 2.475 CYS 370.A N MET 367.A O CYS 370.A H 3.065 2.225 SER 371.A N GLU 368.A O SER 371.A H 2.892 2.049 GLU 373.A N CYS 370.A O GLU 373.A H 2.802 1.996 TYR 379.A N PHE 376.A O TYR 379.A H 2.861 2.147 TYR 379.A OH ASP 264.A OD2 TYR 379.A HH 3.269 2.436 TYR 380.A N PHE 376.A O TYR 380.A H 3.127 2.524 TYR 380.A OH TYR 364.A O TYR 380.A HH 2.544 1.787