Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5afy_H.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ILE 1.A N GLY 142.A O no hydrogen 3.389 N/A ILE 1.A N ASN 143.A O no hydrogen 2.898 N/A ILE 1.A N ASP 197.A OD2 no hydrogen 2.658 N/A VAL 2.A N ASP 192.A O VAL 2.A H 2.827 2.000 SER 5.A N VAL 155.A O SER 5.A H.A 2.941 2.150 ALA 7.A N LEU 153.A O ALA 7.A H 2.802 1.948 MET 11.A N GLU 8.A O MET 11.A H 3.119 2.313 GLN 15.A N SER 12.A O GLN 15.A H.B 2.913 2.061 GLN 15.A NE2.A THR 139.A O GLN 15.A HE22.A 3.428 2.844 GLN 15.A NE2.B THR 139.A O GLN 15.A HE22.B 3.153 2.450 VAL 16.A N ALA 30.A O VAL 16.A H 2.922 2.127 MET 17.A N ARG 62.A O MET 17.A H 2.893 2.038 LEU 18.A N CYS 28.A O LEU 18.A H.A 2.878 2.050 PHE 19.A N LEU 60.A O PHE 19.A H 2.901 2.068 ARG 20.A N GLU 25.A O ARG 20.A H 2.873 2.041 ARG 20.A NE GLU 25.A OE2 ARG 20.A HE 2.740 2.081 LYS 21.A N ASP 58.A O LYS 21.A H 3.099 2.244 LYS 21.A NZ ASN 57.A O LYS 21.A HZ3 2.913 2.180 LEU 27.A N LEU 18.A O LEU 27.A H 2.861 2.005 CYS 28.A SG LEU 27.A O no hydrogen 2.910 N/A CYS 28.A SG SER 198.A OG.A no hydrogen 3.636 N/A GLY 29.A N SER 198.A O.A GLY 29.A H 2.899 2.193 GLY 29.A N SER 198.A O.B GLY 29.A H 2.733 2.002 SER 31.A N LEU 39.A O SER 31.A H 2.880 2.126 SER 31.A OG GLN 214.A OE1 SER 31.A HG 2.649 1.820 LEU 32.A N TRP 14.A O LEU 32.A H 2.840 2.064 ILE 33.A N TRP 37.A O ILE 33.A H 3.031 2.184 ARG 36.A N SER 34.A OG ARG 36.A H 3.214 2.358 VAL 38.A N MET 103.A O VAL 38.A H 2.922 2.104 LEU 39.A N SER 31.A O LEU 39.A H 2.831 2.017 THR 40.A N ALA 101.A O THR 40.A H 2.949 2.110 THR 40.A OG1 GLY 29.A O THR 40.A HG1 2.874 2.206 HIS 43.A N ASP 99.A OD1 HIS 43.A H 2.828 2.037 HIS 43.A ND1 ASP 99.A OD2 no hydrogen 2.664 N/A HIS 43.A NE2 SER 198.A OG.A no hydrogen 2.808 N/A CYS 44.A N ALA 41.A O CYS 44.A H 3.062 2.273 CYS 44.A SG SER 198.A O.A no hydrogen 3.384 N/A LEU 45.A N ALA 42.A O LEU 45.A H 2.900 2.066 LEU 46.A N ALA 42.A O LEU 46.A H 2.872 2.100 GLU 56.A N GLU 56.A OE1 GLU 56.A H 2.741 1.931 ASP 58.A N THR 55I.A O ASP 58.A H 3.030 2.202 LEU 59.A N GLU 56.A O LEU 59.A H 3.330 2.495 LEU 60.A N PHE 19.A O LEU 60.A H 2.848 2.010 VAL 61.A N SER 79.A O VAL 61.A H 3.053 2.208 ARG 62.A N MET 17.A O ARG 62.A H 2.880 2.065 ARG 62.A NE GLU 76.A OE1 ARG 62.A HE 2.797 1.968 ARG 62.A NH2 GLU 76.A OE1 ARG 62.A HH21 3.298 2.621 ARG 62.A NH2 GLU 76.A OE2 ARG 62.A HH21 2.927 2.114 ILE 63.A N LYS 77.A O ILE 63.A H 2.847 2.022 LYS 65.A NZ ARG 70.A O.A LYS 65.A HZ2 2.827 2.261 LYS 65.A NZ GLU 72.A OE1 LYS 65.A HZ3 2.848 2.014 LYS 65.A NZ GLU 76.A OE2 LYS 65.A HZ1 2.835 2.053 HIS 66.A N GLU 72.A OE1 HIS 66.A H 2.858 2.035 HIS 66.A N GLU 72.A OE2 HIS 66.A H 3.368 2.628 SER 67.A N GLU 72.A OE2 SER 67.A H 2.879 2.054 ARG 68.A N SER 151.A O ARG 68.A H 2.933 2.092 ARG 68.A NE PRO 150.A O ARG 68.A HE 2.755 1.923 ARG 70.A N.A SER 67.A OG ARG 70.A H.A 3.131 2.290 ARG 70.A N.B SER 67.A OG ARG 70.A H.B 3.090 2.263 GLU 72.A N GLU 76.A OE2 GLU 72.A H 2.851 1.997 ILE 75.A N GLU 72.A O ILE 75.A H 2.976 2.181 GLU 76.A N GLU 72.A O GLU 76.A H 2.952 2.160 LYS 77.A N ILE 63.A O LYS 77.A H 2.833 2.025 SER 79.A N VAL 61.A O SER 79.A H 2.910 2.076 GLU 82.A N LYS 104.A O GLU 82.A H 2.751 1.969 LYS 83.A N LYS 104.A O LYS 83.A H 3.390 2.595 ILE 84.A N GLU 56.A OE2 ILE 84.A H 2.874 2.049 TYR 85.A N LEU 102.A O TYR 85.A H 2.836 1.997 HIS 87.A N ILE 100.A O HIS 87.A H 3.238 2.388 ARG 89.A N HIS 87.A ND1 ARG 89.A H 2.945 2.096 TYR 90.A N HIS 87.A O TYR 90.A H 3.081 2.225 TYR 90.A OH LEU 46.A O TYR 90.A HH 2.762 1.961 ASN 91.A N ASP 97.A O ASN 91.A H 2.857 2.021 ASN 95.A ND2 ARG 173.A O ASN 95.A HD21 2.866 2.053 LEU 96.A N ASN 91.A O LEU 96.A H 2.835 2.171 ASP 97.A N ASN 95.A OD1 ASP 97.A H 3.140 2.370 ARG 98.A NH1 ARG 89.A O ARG 98.A HH11 2.823 2.102 ALA 101.A N THR 40.A O ALA 101.A H 2.952 2.172 LEU 102.A N TYR 85.A O LEU 102.A H 2.835 2.013 MET 103.A N VAL 38.A O MET 103.A H 2.821 2.009 LYS 104.A N LYS 83.A O LYS 104.A H 2.922 2.093 LYS 104.A NZ PHE 250.A O LYS 104.A HZ3 2.633 1.752 LEU 105.A N ARG 36.A O LEU 105.A H 2.823 1.986 LYS 106.A N MET 80.A O LYS 106.A H 2.998 2.164 VAL 109.A N ASP 35.A O VAL 109.A H 2.892 2.085 SER 112.A N ILE 115.A O SER 112.A H 2.992 2.163 TYR 114.A N SER 112.A OG TYR 114.A H 3.017 2.196 ILE 115.A N SER 112.A O ILE 115.A H 3.322 2.494 HIS 116.A N PRO 13.A O HIS 116.A H 3.040 2.246 VAL 118.A N LEU 32.A O VAL 118.A H 3.012 2.207 CYS 119.A N TRP 212.A O CYS 119.A H 3.115 2.285 THR 125.A N ASP 122.A OD2 THR 125.A H 2.806 1.986 THR 125.A OG1 ASP 122.A OD2 THR 125.A HG1 3.322 2.534 ALA 126.A N ASP 122.A O ALA 126.A H 3.059 2.208 LEU 130.A N ALA 126.A O LEU 130.A H 2.962 2.131 GLN 131.A N LEU 129C.A O GLN 131.A H 2.897 2.236 GLN 131.A NE2 SER 128B.A O GLN 131.A HE21 2.793 1.934 GLY 133.A N ILE 160.A O GLY 133.A H 2.812 1.959 TYR 134.A N GLN 131.A O TYR 134.A H 3.028 2.208 GLY 136.A N LEU 158.A O GLY 136.A H 2.949 2.161 ARG 137.A N VAL 203.A O ARG 137.A H 2.816 2.074 ARG 137.A NE ASN 157.A OD1 ARG 137.A HE 3.063 2.248 VAL 138.A N VAL 156.A O VAL 138.A H 2.866 2.021 THR 139.A OG1 GLN 15.A OE1.B THR 139.A HG1 2.581 2.092 GLY 140.A N GLN 154.A O GLY 140.A H 3.039 2.264 TRP 141.A NE1 HIS 66.A O TRP 141.A HE1 2.906 2.046 GLY 142.A N ASP 197.A OD1 GLY 142.A H 2.763 1.944 ASN 143.A N GLU 195.A O ASN 143.A H 2.830 2.026 LEU 144.A N GLY 148.A O LEU 144.A H 2.781 1.927 GLN 149.A NE2 ASN 143.A OD1 GLN 149.A HE21 3.230 2.379 LEU 153.A N HIS 66.A O LEU 153.A H 2.856 2.098 GLN 154.A N GLY 140.A O GLN 154.A H 3.016 2.166 GLN 154.A NE2 ASP 6.A OD1 GLN 154.A HE22 2.884 2.053 GLN 154.A NE2 VAL 152.A O GLN 154.A HE21 3.028 2.173 VAL 155.A N SER 5.A O VAL 155.A H.A 2.883 2.136 VAL 156.A N VAL 138.A O VAL 156.A H 2.959 2.155 LEU 158.A N GLY 136.A O LEU 158.A H 2.830 2.024 ILE 160.A N TYR 134.A O ILE 160.A H 2.853 2.000 VAL 161.A N CYS 180.A O VAL 161.A H 2.959 2.135 GLU 162.A N GLU 162.A OE1 GLU 162.A H 2.770 1.929 ARG 163.A NH1 MET 178.A O ARG 163.A HH12 2.820 2.015 ARG 163.A NH2 THR 175.A O ARG 163.A HH22 2.881 2.303 ARG 163.A NH2 MET 178.A O ARG 163.A HH22 3.036 2.306 CYS 166.A N GLU 162.A O CYS 166.A H 3.042 2.212 CYS 166.A SG VAL 161.A O no hydrogen 3.646 N/A CYS 166.A SG GLU 162.A O no hydrogen 3.512 N/A LYS 167.A N ARG 163.A O LYS 167.A H.A 2.943 2.105 ASP 168.A N PRO 164.A O ASP 168.A H 2.927 2.140 SER 169.A N CYS 166.A O SER 169.A H 3.245 2.411 SER 169.A OG CYS 166.A O SER 169.A HG 2.724 1.890 THR 170.A OG1 GLU 222.A OE1 THR 170.A HG1 2.856 2.169 ILE 172.A N THR 170.A OG1 ILE 172.A H 3.061 2.213 ARG 173.A NE GLU 94A.A OE2 ARG 173.A HE 3.016 2.174 ARG 173.A NH2 GLU 94A.A OE1 ARG 173.A HH21 2.776 1.933 THR 175.A OG1 ASP 97.A OD1 THR 175.A HG1 2.718 1.881 ASN 177.A N THR 175.A OG1 ASN 177.A H 3.069 2.292 ASN 177.A ND2 ASP 97.A OD1 ASN 177.A HD21 2.944 2.100 MET 178.A N THR 175.A O MET 178.A H 3.080 2.300 PHE 179.A N TYR 233.A O PHE 179.A H 2.964 2.171 ALA 181.A N GLY 231.A O ALA 181.A H 2.976 2.212 GLY 182.A N PRO 159.A O GLY 182.A H 2.905 2.089 LYS 184.A N GLU 187B.A OE1 LYS 184.A H.B 2.739 1.894 LYS 184.A NZ.A GLU 162.A OE1 LYS 184.A HZ2.A 3.038 2.202 LYS 184.A NZ.B GLU 162.A OE1 LYS 184.A HZ2.B 2.851 1.999 LYS 184.A NZ.B GLU 162.A OE2 LYS 184.A HZ2.B 3.490 2.759 ARG 190.A NE ASP 225.A OD2 ARG 190.A HE 2.777 1.942 ARG 190.A NH1 ASP 227.A OD1 ARG 190.A HH12 2.946 2.227 ARG 190.A NH2 ASP 225.A O ARG 190.A HH21 2.801 2.068 ARG 190.A NH2 ASP 225.A OD2 ARG 190.A HH21 3.521 2.886 ARG 190.A NH2 ASP 227.A OD1 ARG 190.A HH22 2.914 2.192 GLY 191.A N ASP 225.A OD1 GLY 191.A H 2.872 2.031 ASP 192.A N VAL 2.A O ASP 192.A H 3.212 2.453 CYS 194.A N ASP 197.A OD2 CYS 194.A H 2.853 2.078 CYS 194.A SG LYS 145.A O no hydrogen 3.725 N/A ASP 197.A N CYS 194.A O ASP 197.A H 2.953 2.105 SER 198.A OG.B SER 219.A O SER 198.A HG.B 3.458 2.894 GLY 199.A N VAL 218.A O GLY 199.A H.A 2.892 2.041 GLY 200.A N ASP 197.A O GLY 200.A H 3.096 2.253 PHE 202.A N GLY 216.A O PHE 202.A H 2.945 2.087 VAL 203.A N ARG 137.A O VAL 203.A H 2.903 2.081 MET 204.A N TYR 213.A O MET 204.A H 2.886 2.086 SER 206.A N ARG 211.A O SER 206.A H 2.820 1.996 ASN 210.A N SER 206.A O ASN 210.A H 2.889 2.171 ARG 211.A N ASN 209B.A OD1 ARG 211.A H 3.172 2.357 TYR 213.A N MET 204.A O TYR 213.A H 2.871 2.020 GLN 214.A N CYS 119.A O GLN 214.A H 2.856 2.034 GLN 214.A NE2 GLY 216.A O GLN 214.A HE21 2.990 2.171 MET 215.A N PHE 202.A O MET 215.A H 2.922 2.263 GLY 216.A N PHE 202.A O GLY 216.A H 3.104 2.285 ILE 217.A N THR 234.A O ILE 217.A H 3.195 2.485 VAL 218.A N GLY 200.A O VAL 218.A H 2.853 2.021 SER 219.A N PHE 232.A O SER 219.A H 2.978 2.192 SER 219.A OG ASP 99.A OD2 SER 219.A HG 2.730 1.894 TRP 220.A N PHE 232.A O TRP 220.A H 3.096 2.289 CYS 224.A N GLU 146.A OE1 CYS 224.A H 3.008 2.201 ASP 225.A N ASP 192.A OD2 ASP 225.A H 2.826 1.973 LYS 229.A N ARG 226A.A O LYS 229.A H 3.140 2.300 LYS 229.A NZ SER 169.A O LYS 229.A HZ1 2.949 2.171 LYS 229.A NZ GLU 222.A OE1 LYS 229.A HZ3 3.202 2.328 GLY 231.A N ALA 181.A O GLY 231.A H 3.074 2.288 PHE 232.A N TRP 220.A O PHE 232.A H 2.834 1.994 TYR 233.A N PHE 179.A O TYR 233.A H 2.851 2.043 THR 234.A N ILE 217.A O THR 234.A H 2.893 2.126 THR 234.A OG1 ASP 99.A O THR 234.A HG1 2.830 2.017 HIS 235.A N ASN 177.A O HIS 235.A H 2.869 2.025 VAL 236.A N MET 215.A O VAL 236.A H 3.094 2.258 ARG 238.A N HIS 235.A ND1 ARG 238.A H 3.371 2.561 ARG 238.A NE ASN 177.A OD1 ARG 238.A HE 3.172 2.380 ARG 238.A NH2 ASN 177.A OD1 ARG 238.A HH21 3.180 2.431 LEU 239.A N VAL 236.A O LEU 239.A H 3.008 2.255 LYS 240.A N PHE 237.A O LYS 240.A H 3.081 2.229 LYS 240.A NZ PRO 121.A O LYS 240.A HZ3 3.062 2.291 TRP 242.A N LEU 239.A O TRP 242.A H 3.133 2.530 ILE 243.A N LEU 239.A O ILE 243.A H 3.228 2.409 GLN 244.A N LYS 240.A O GLN 244.A H 2.887 2.052 GLN 244.A NE2 ASP 248.A OD1 GLN 244.A HE21 2.935 2.117 LYS 245.A N LYS 241.A O LYS 245.A H 2.943 2.131 VAL 246.A N TRP 242.A O VAL 246.A H 2.989 2.163 ILE 247.A N ILE 243.A O ILE 247.A H 3.002 2.157 ASP 248.A N GLN 244.A O ASP 248.A H 2.812 1.979 GLN 249.A N LYS 245.A O GLN 249.A H 3.059 2.289 PHE 250.A N VAL 246.A O no hydrogen 2.893 N/A GLY 251.A N ILE 247.A O no hydrogen 2.931 N/A TYR 47A.A N LYS 52F.A O TYR 47A.A H 2.774 1.936 ARG 73A.A N TYR 71.A O ARG 73A.A H 2.999 2.367 GLU 94A.A N ASN 91.A OD1 GLU 94A.A H 2.969 2.256 ALA 127A.A N ARG 123.A O ALA 127A.A H 2.900 2.076 PHE 208A.A N SER 206.A OG PHE 208A.A H 3.076 2.298 ARG 226A.A NE GLU 146.A OE1 ARG 226A.A HE 2.976 2.137 ARG 226A.A NH2 GLU 146.A OE2 ARG 226A.A HH21 2.784 1.925 SER 128B.A N GLU 124.A O SER 128B.A H.A 2.943 2.133 GLU 187B.A N LYS 184.A O GLU 187B.A H 2.924 2.076 ASN 209B.A ND2 TYR 213.A OH ASN 209B.A HD22 2.892 2.060 LEU 129C.A N THR 125.A O LEU 129C.A H 2.959 2.191 TRP 50D.A N TYR 47A.A O TRP 50D.A H 2.990 2.175 LYS 189D.A N GLU 187B.A O LYS 189D.A H 2.975 2.289 ASP 51E.A N PRO 48B.A O ASP 51E.A H 2.960 2.107 LYS 52F.A N TYR 47A.A O LYS 52F.A H 3.151 2.301 PHE 54H.A N LEU 45.A O PHE 54H.A H 2.906 2.090 THR 55I.A N ASP 58.A OD2 THR 55I.A H 2.822 1.971