Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5ayj_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TYR 5.A N VAL 47.A O TYR 5.A H 3.086 2.313 TYR 5.A OH VAL 65.A O TYR 5.A HH 2.570 1.790 LYS 7.A N ILE 45.A O LYS 7.A H 2.988 2.270 LYS 7.A NZ THR 67.A OG1 LYS 7.A HZ3 3.072 2.340 VAL 10.A N VAL 43.A O VAL 10.A H 3.052 2.227 ALA 12.A N VAL 41.A O ALA 12.A H 2.942 2.201 ARG 14.A N PHE 39.A O ARG 14.A H 2.729 1.882 ARG 14.A NE THR 15.A O ARG 14.A HE 3.306 2.596 ARG 14.A NH1 LEU 78.A O ARG 14.A HH11 2.713 1.995 ARG 14.A NH1 TYR 81.A O ARG 14.A HH12 3.199 2.404 TYR 16.A N ILE 37.A O TYR 16.A H 2.910 2.085 LEU 20.A N ARG 34.A O LEU 20.A H 3.160 2.563 GLU 28.A N GLU 28.A OE1 GLU 28.A H 2.723 1.977 SER 29.A N ILE 26.A O SER 29.A H 3.311 2.468 SER 29.A OG ASP 225.A OD2 SER 29.A HG 2.740 1.946 PHE 31.A N SER 29.A OG PHE 31.A H 3.147 2.293 ARG 34.A N LEU 20.A O ARG 34.A H 3.006 2.216 ARG 34.A NE GLU 221.A OE2 ARG 34.A HE 2.863 2.017 ARG 34.A NH2 GLU 221.A OE1 ARG 34.A HH21 2.812 1.981 ARG 34.A NH2 GLU 221.A OE2 ARG 34.A HH21 3.523 2.877 HIS 36.A NE2 THR 84.A O HIS 36.A HE2 3.118 2.310 PHE 39.A N ARG 14.A O PHE 39.A H 2.813 2.006 VAL 41.A N ALA 12.A O VAL 41.A H 2.942 2.106 ASN 42.A N GLU 112.A O ASN 42.A H 2.694 1.853 ASN 42.A ND2 ASP 9.A OD1 ASN 42.A HD21 3.340 2.494 VAL 43.A N VAL 10.A O VAL 43.A H 2.793 1.960 LYS 44.A N ILE 110.A O LYS 44.A H 2.799 1.970 ILE 45.A N LYS 7.A O ILE 45.A H 2.943 2.111 SER 46.A N SER 108.A O SER 46.A H 2.906 2.087 VAL 47.A N TYR 5.A O VAL 47.A H 2.897 2.070 GLY 48.A N LYS 106.A O GLY 48.A H 2.942 2.183 THR 50.A N GLU 105.A OE1 THR 50.A H 3.305 2.509 LEU 52.A N GLY 49.A O LEU 52.A H 3.074 2.230 LEU 53.A N THR 50.A O LEU 53.A H 3.132 2.311 SER 55.A N LEU 52.A O SER 55.A H 3.042 2.303 SER 55.A OG LEU 52.A O SER 55.A HG 2.561 1.729 PHE 56.A N LEU 53.A O PHE 56.A H 2.976 2.289 THR 57.A N LEU 53.A O THR 57.A H 2.899 2.088 LYS 58.A N THR 54.A O LYS 58.A H 2.807 2.005 ASP 60.A N THR 54.A O ASP 60.A H 3.247 2.401 SER 62.A N ASP 60.A OD1 SER 62.A H 3.131 2.279 SER 62.A OG ASP 60.A OD1 SER 62.A HG 2.687 1.939 VAL 64.A N ASN 61.A O VAL 64.A H 2.885 2.038 MET 70.A N ALA 66.A O MET 70.A H 3.054 2.288 LYS 71.A N THR 67.A O LYS 71.A H 3.066 2.244 LYS 71.A NZ ASP 68.A OD1 LYS 71.A HZ1 2.951 2.162 ASN 72.A N ASP 68.A O ASN 72.A H 3.137 2.340 PHE 73.A N SER 69.A O PHE 73.A H 2.788 1.975 ILE 74.A N MET 70.A O ILE 74.A H 2.988 2.170 GLN 75.A N LYS 71.A O GLN 75.A H 3.095 2.247 GLN 75.A NE2 PHE 11.A O GLN 75.A HE21 3.299 2.497 LYS 76.A N ASN 72.A O LYS 76.A H 2.886 2.042 HIS 77.A N PHE 73.A O HIS 77.A H 2.915 2.140 HIS 77.A ND1 PHE 73.A O HIS 77.A HD1 2.791 2.077 HIS 77.A NE2 SER 96.A OG no hydrogen 2.727 N/A LEU 78.A N ILE 74.A O LEU 78.A H 3.082 2.380 LEU 78.A N GLN 75.A O LEU 78.A H 3.131 2.469 ALA 79.A N GLN 75.A O ALA 79.A H 3.336 2.570 TYR 81.A N HIS 77.A O TYR 81.A H 2.972 2.380 THR 85.A OG1 PHE 210.A O THR 85.A HG1 2.777 2.262 GLU 87.A N GLU 87.A OE1 GLU 87.A H 2.837 2.046 GLY 88.A N THR 85.A OG1 GLY 88.A H 2.823 2.007 PHE 89.A N THR 85.A O PHE 89.A H 2.817 2.022 LEU 90.A N ILE 86.A O LEU 90.A H 2.906 2.125 GLU 91.A N GLU 87.A O GLU 91.A H 3.164 2.349 TYR 92.A N GLY 88.A O TYR 92.A H 3.060 2.254 VAL 93.A N PHE 89.A O VAL 93.A H 3.024 2.182 ALA 94.A N LEU 90.A O ALA 94.A H 2.921 2.079 THR 95.A N GLU 91.A O THR 95.A H 2.974 2.117 THR 95.A OG1 GLU 91.A OE2 THR 95.A HG1 2.528 1.862 SER 96.A N TYR 92.A O SER 96.A H 3.054 2.227 PHE 97.A N VAL 93.A O PHE 97.A H 2.829 2.026 LEU 98.A N ALA 94.A O LEU 98.A H 3.033 2.173 LYS 99.A N THR 95.A O LYS 99.A H 2.951 2.100 LYS 100.A N SER 96.A O LYS 100.A H 3.010 2.311 LYS 100.A N PHE 97.A O LYS 100.A H 3.132 2.481 TYR 101.A N PHE 97.A O TYR 101.A H 2.979 2.179 HIS 103.A NE2 LEU 63.A O HIS 103.A HE2 2.933 2.264 ILE 104.A N TYR 101.A O ILE 104.A H 3.147 2.303 GLU 105.A N GLY 48.A O GLU 105.A H 2.904 2.125 LYS 106.A N GLY 48.A O LYS 106.A H 3.218 2.417 ILE 107.A N MET 144.A O ILE 107.A H 2.916 2.079 SER 108.A N SER 46.A O SER 108.A H 2.779 1.946 SER 108.A OG ASN 143.A OD1 SER 108.A HG 2.538 1.753 LEU 109.A N LEU 142.A O LEU 109.A H 2.761 1.918 ILE 110.A N LYS 44.A O ILE 110.A H 2.884 2.051 GLY 111.A N ALA 140.A O GLY 111.A H 2.865 2.019 GLU 112.A N ASN 42.A O GLU 112.A H 2.872 2.057 GLU 113.A N ALA 138.A O GLU 113.A H 2.829 1.978 ILE 114.A N GLY 40.A O ILE 114.A H 2.963 2.130 GLU 117.A N LYS 131.A O GLU 117.A H 2.821 1.992 THR 119.A OG1 VAL 129.A O THR 119.A HG1 2.598 1.935 ALA 121.A N ALA 124.A O ALA 121.A H 2.938 2.089 ALA 124.A N ALA 121.A O ALA 124.A H 2.810 1.987 SER 126.A N THR 119.A O SER 126.A H 2.976 2.148 GLU 127.A N GLU 127.A OE1 GLU 127.A H 2.582 1.803 LEU 128.A N SER 126.A OG LEU 128.A H 3.032 2.195 VAL 129.A N SER 126.A OG VAL 129.A H 2.759 1.915 LYS 131.A N GLU 117.A O LYS 131.A H 2.853 2.018 SER 133.A N PRO 115.A O SER 133.A H 2.983 2.125 ASN 135.A N SER 133.A OG ASN 135.A H 2.924 2.077 GLU 136.A N GLU 136.A OE1 GLU 136.A H 2.728 1.923 TYR 137.A N ALA 162.A O TYR 137.A H 2.984 2.192 ALA 138.A N GLU 113.A OE1 ALA 138.A H 2.801 1.943 THR 139.A N GLY 160.A O THR 139.A H 2.724 1.890 ALA 140.A N GLY 111.A O ALA 140.A H 2.881 2.110 TYR 141.A N GLN 158.A O TYR 141.A H 2.762 2.101 LEU 142.A N LEU 109.A O LEU 142.A H 2.945 2.129 ASN 143.A N GLU 156.A O ASN 143.A H 2.945 2.106 ASN 143.A ND2 TYR 141.A OH ASN 143.A HD21 2.538 1.815 MET 144.A N ILE 107.A O MET 144.A H 2.842 2.008 VAL 145.A N ASN 153.A O VAL 145.A H 2.756 1.944 ARG 146.A N GLU 105.A O ARG 146.A H 2.820 2.010 ARG 146.A NE ILE 104.A O ARG 146.A HE 3.137 2.378 ARG 146.A NH1 LEU 98.A O ARG 146.A HH12 3.562 2.976 ARG 146.A NH2 LEU 98.A O ARG 146.A HH22 2.688 1.831 ARG 146.A NH2 ILE 104.A O ARG 146.A HH21 2.958 2.157 ASN 147.A N THR 151.A O ASN 147.A H 2.868 2.041 ASN 147.A ND2 THR 151.A OG1 ASN 147.A HD21 2.934 2.077 ASN 147.A ND2 ASN 153.A OD1 ASN 147.A HD22 2.357 1.629 ASN 150.A N ASN 147.A O ASN 150.A H 2.815 1.991 THR 151.A N ASP 149.A OD1 THR 151.A H 3.024 2.179 THR 151.A OG1 ASP 149.A OD1 THR 151.A HG1 2.557 1.770 ASN 153.A N VAL 145.A O ASN 153.A H 2.883 2.072 THR 155.A N ASN 143.A O THR 155.A H 2.866 2.070 GLN 157.A NE2 SER 159.A OG GLN 157.A HE22 3.072 2.257 GLN 158.A N TYR 141.A O GLN 158.A H 3.011 2.196 SER 159.A N TRP 201.A O SER 159.A H 2.896 2.065 GLY 160.A N THR 139.A O GLY 160.A H 2.877 2.144 LEU 161.A N ILE 199.A O LEU 161.A H 2.705 1.868 ALA 162.A N TYR 137.A O ALA 162.A H 2.891 2.050 GLY 163.A N ASN 198.A OD1 GLY 163.A H 2.976 2.202 LEU 164.A N LEU 197.A O LEU 164.A H 3.118 2.272 LEU 166.A N VAL 195.A O LEU 166.A H 3.001 2.188 LYS 168.A N LEU 193.A O LYS 168.A H 2.896 2.076 LYS 168.A NZ GLY 171.A O LYS 168.A HZ1 3.339 2.462 LYS 168.A NZ PHE 231.A O LYS 168.A HZ3 3.035 2.243 GLY 171.A N ASN 190.A OD1 GLY 171.A H 2.905 2.126 ASN 172.A ND2 LYS 168.A O ASN 172.A HD21 3.068 2.545 ASN 172.A ND2 ARG 191.A O ASN 172.A HD22 2.921 2.086 SER 173.A N THR 236.A O SER 173.A H 2.849 2.007 PHE 174.A N ASP 188.A O PHE 174.A H 2.791 1.958 GLY 176.A N GLU 187.A OE2 GLY 176.A H 2.520 1.716 ARG 179.A NH1 LEU 185.A O ARG 179.A HH12 2.851 2.074 ARG 179.A NH2 LEU 185.A O ARG 179.A HH22 3.033 2.317 GLU 181.A N GLU 181.A OE1 GLU 181.A H 2.711 1.878 TYR 182.A N ASP 180.A OD1 TYR 182.A H 2.933 2.085 THR 183.A N ASP 180.A O THR 183.A H 3.133 2.275 THR 183.A OG1 ILE 178.A O THR 183.A HG1 3.183 2.463 ASP 188.A N PHE 174.A O ASP 188.A H 3.213 2.367 ASN 190.A N ASP 188.A OD1 ASN 190.A H 2.975 2.128 ARG 191.A N ASN 172.A O ARG 191.A H 2.862 2.057 PHE 194.A N THR 268.A OG1 PHE 194.A H 3.111 2.266 VAL 195.A N LEU 166.A O VAL 195.A H 2.895 2.130 TYR 196.A N GLN 265.A O TYR 196.A H 2.828 1.996 LEU 197.A N LEU 164.A O LEU 197.A H 2.678 1.857 ASN 198.A N GLU 263.A O ASN 198.A H 2.858 2.028 ILE 199.A N LEU 161.A O ILE 199.A H 2.813 1.967 LYS 200.A N TYR 261.A O LYS 200.A H 2.817 1.975 TRP 201.A N SER 159.A O TRP 201.A H 2.731 1.939 LYS 202.A N GLU 259.A O LYS 202.A H 3.099 2.285 LYS 204.A N GLN 256.A O LYS 204.A H 2.957 2.111 LYS 204.A NZ PRO 255.A O LYS 204.A HZ2 2.713 1.987 ASP 208.A N ASN 205.A O ASP 208.A H 3.069 2.287 SER 209.A N THR 206.A O SER 209.A H 2.895 2.075 SER 209.A OG THR 206.A O SER 209.A HG 2.899 2.159 PHE 210.A N GLU 207.A O PHE 210.A H 2.999 2.168 ASN 216.A N ASN 213.A O ASN 216.A H 2.942 2.100 ASN 216.A ND2 ASP 208.A OD1 ASN 216.A HD22 3.323 2.551 TYR 217.A N PRO 214.A O TYR 217.A H 3.034 2.204 TYR 217.A OH GLU 87.A OE1 TYR 217.A HH 2.638 1.817 TYR 217.A OH GLU 87.A OE2 TYR 217.A HH 3.288 2.626 VAL 218.A N TYR 203.A OH VAL 218.A H 2.784 1.928 ALA 219.A N GLN 222.A OE1 ALA 219.A H 3.228 2.380 GLU 221.A N GLU 221.A OE1 GLU 221.A H 2.734 1.925 GLN 222.A N ALA 219.A O GLN 222.A H 2.968 2.338 GLN 222.A NE2 ARG 24.A O GLN 222.A HE22 2.916 2.106 ILE 223.A N ALA 219.A O ILE 223.A H 3.254 2.467 ARG 224.A N ALA 220.A O ARG 224.A H 2.920 2.089 ARG 224.A NE ASP 225.A OD1 ARG 224.A HE 2.949 2.121 ARG 224.A NH2 ASP 225.A OD1 ARG 224.A HH21 3.525 2.871 ARG 224.A NH2 ASP 225.A OD2 ARG 224.A HH21 3.203 2.360 ASP 225.A N GLU 221.A O ASP 225.A H 3.216 2.466 ILE 226.A N GLN 222.A O ILE 226.A H 3.045 2.249 ALA 227.A N ILE 223.A O ALA 227.A H 2.958 2.120 THR 228.A N ARG 224.A O THR 228.A H 3.134 2.353 SER 229.A N ASP 225.A O SER 229.A H 2.920 2.079 SER 229.A OG GLU 233.A OE2 SER 229.A HG 2.781 2.013 VAL 230.A N ILE 226.A O VAL 230.A H 2.841 1.996 PHE 231.A N ALA 227.A O PHE 231.A H 3.088 2.268 HIS 232.A N THR 228.A O HIS 232.A H 2.944 2.130 GLU 233.A N SER 229.A O GLU 233.A H 2.868 2.039 THR 234.A OG1 VAL 230.A O THR 234.A HG1 2.537 1.797 THR 236.A N GLY 171.A O THR 236.A H 3.328 2.613 THR 236.A OG1 ASN 172.A OD1 THR 236.A HG1 2.760 2.228 LEU 237.A N HIS 241.A ND1 LEU 237.A H 2.986 2.244 GLN 240.A N GLN 240.A OE1 GLN 240.A H 2.621 1.879 HIS 241.A N SER 238.A OG HIS 241.A H 2.834 2.011 LEU 242.A N SER 238.A O LEU 242.A H 3.225 2.420 ILE 243.A N ILE 239.A O ILE 243.A H 2.966 2.122 TYR 244.A N GLN 240.A O TYR 244.A H 3.239 2.427 LEU 245.A N HIS 241.A O LEU 245.A H 3.326 2.521 ILE 246.A N LEU 242.A O ILE 246.A H 2.883 2.073 GLY 247.A N ILE 243.A O GLY 247.A H 2.923 2.070 ARG 248.A N TYR 244.A O ARG 248.A H 2.867 2.071 ARG 249.A N LEU 245.A O ARG 249.A H 3.075 2.273 ARG 249.A NH1 GLU 28.A OE2 ARG 249.A HH11 3.051 2.343 ARG 249.A NH1 GLU 233.A OE2 ARG 249.A HH12 3.208 2.352 ARG 249.A NH2 GLU 233.A OE1 ARG 249.A HH22 3.240 2.393 ILE 250.A N ILE 246.A O ILE 250.A H 2.999 2.170 LEU 251.A N GLY 247.A O LEU 251.A H 3.055 2.249 GLU 252.A N ARG 248.A O GLU 252.A H 3.078 2.363 ARG 253.A N ARG 249.A O ARG 253.A H 3.024 2.194 ARG 253.A NE GLU 28.A OE1 ARG 253.A HE 2.708 1.877 ARG 253.A NE GLU 28.A OE2 ARG 253.A HE 2.881 2.223 ARG 253.A NH2 GLU 28.A OE2 ARG 253.A HH21 2.657 1.944 PHE 254.A N ILE 250.A O PHE 254.A H 2.902 2.133 GLN 256.A N GLN 256.A OE1 GLN 256.A H 2.720 1.897 GLN 256.A NE2 ASN 216.A O GLN 256.A HE21 2.985 2.153 LEU 257.A N PHE 254.A O LEU 257.A H 3.011 2.170 GLN 258.A N LYS 202.A O GLN 258.A H 2.702 1.852 VAL 260.A N VAL 294.A O VAL 260.A H 2.862 2.027 TYR 261.A N LYS 200.A O TYR 261.A H 2.645 1.792 PHE 262.A N PHE 292.A O PHE 262.A H 2.751 1.941 GLU 263.A N ASN 198.A O GLU 263.A H 2.918 2.069 SER 264.A N GLN 290.A O SER 264.A H 2.950 2.112 SER 264.A OG GLN 290.A OE1 SER 264.A HG 3.033 2.306 GLN 265.A N TYR 196.A O GLN 265.A H 2.854 2.080 ASN 266.A N GLY 288.A O ASN 266.A H 2.796 1.976 HIS 267.A N PHE 194.A O HIS 267.A H 2.912 2.064 HIS 267.A NE2 GLN 265.A OE1 HIS 267.A HE2 2.770 1.944 THR 268.A N ASN 266.A OD1 THR 268.A H 2.948 2.121 THR 268.A OG1 ASN 266.A OD1 THR 268.A HG1 2.639 1.848 ASP 270.A N THR 281.A O ASP 270.A H 2.917 2.214 ILE 272.A N VAL 279.A O ILE 272.A H 2.870 2.019 VAL 273.A N VAL 279.A O VAL 273.A H 3.204 2.368 VAL 279.A N VAL 273.A O VAL 279.A H 3.197 2.396 THR 281.A N ASP 270.A O THR 281.A H 2.708 1.933 GLN 290.A N SER 264.A O GLN 290.A H 3.019 2.225 PHE 292.A N PHE 262.A O PHE 292.A H 3.070 2.286 VAL 294.A N VAL 260.A O VAL 294.A H 2.782 1.956 GLN 296.A N GLN 258.A O GLN 296.A H 3.081 2.397 GLN 296.A NE2 LEU 251.A O GLN 296.A HE22 3.035 2.229 GLN 296.A NE2 PHE 254.A O GLN 296.A HE22 3.642 3.106 GLN 296.A NE2 LEU 257.A O GLN 296.A HE21 2.970 2.110