Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5bp3_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): HIS 7.A NE2 GLU 55.A OE2 no hydrogen 2.682 N/A LEU 9.A N HIS 7.A ND1 LEU 9.A H 3.014 2.193 LEU 10.A N HIS 7.A ND1 LEU 10.A H 3.189 2.357 GLY 11.A N HIS 7.A O GLY 11.A H 3.056 2.214 SER 12.A N GLN 26.A O SER 12.A H 3.027 2.305 HIS 13.A NE2 HIS 23.A ND1 no hydrogen 2.807 N/A VAL 14.A N LEU 24.A O VAL 14.A H 2.833 1.986 LEU 16.A N GLU 22.A O LEU 16.A H 2.831 1.994 GLN 18.A N LEU 16.A O GLN 18.A H 2.909 2.230 HIS 23.A N ALA 92.A O HIS 23.A H 2.841 2.000 HIS 23.A ND1 HIS 13.A NE2 no hydrogen 2.807 N/A HIS 23.A NE2 GLU 21.A OE2 no hydrogen 2.736 N/A LEU 24.A N VAL 14.A O LEU 24.A H 2.904 2.064 TRP 25.A N VAL 90.A O TRP 25.A H 2.861 2.030 GLN 26.A N SER 12.A O GLN 26.A H 2.875 2.096 GLY 27.A N VAL 88.A O GLY 27.A H 2.863 2.024 VAL 29.A N THR 86.A O VAL 29.A H 2.884 2.057 GLY 30.A N ASP 28.A OD1 GLY 30.A H 2.913 2.104 THR 31.A N ASP 83.A O THR 31.A H 2.956 2.166 GLU 32.A N ASP 84.A O GLU 32.A H.A 3.025 2.195 HIS 34.A N GLY 30.A O HIS 34.A H 2.995 2.262 LEU 37.A N HIS 34.A O LEU 37.A H 2.898 2.083 SER 38.A N PRO 35.A O SER 38.A H 2.964 2.151 ASP 39.A N TRP 36.A O ASP 39.A H 3.037 2.196 HIS 40.A N LEU 37.A O HIS 40.A H 3.363 2.510 HIS 40.A ND1 VAL 47.A O no hydrogen 2.810 N/A ARG 41.A N GLY 157.A O ARG 41.A H 2.856 2.037 ARG 41.A NE GLN 44.A O ARG 41.A HE 3.179 2.425 ARG 41.A NH1 GLN 44.A O ARG 41.A HH11 2.979 2.181 ARG 41.A NH2 SER 38.A O ARG 41.A HH21 2.826 2.014 VAL 42.A N VAL 45.A O VAL 42.A H 2.921 2.130 HIS 43.A N GLY 155.A O HIS 43.A H 2.774 1.975 VAL 45.A N VAL 42.A O VAL 45.A H.A 3.137 2.281 VAL 47.A N HIS 40.A O VAL 47.A H 3.064 2.222 LEU 48.A N LEU 80.A O LEU 48.A H 2.903 2.107 ALA 52.A N PRO 49.A O ALA 52.A H 2.890 2.117 CYS 54.A N GLY 50.A O CYS 54.A H 3.193 2.396 CYS 54.A SG GLY 50.A O CYS 54.A HG 3.564 2.469 GLU 55.A N ALA 51.A O GLU 55.A H 3.092 2.287 MET 56.A N.A ALA 52.A O MET 56.A H.A 2.943 2.104 MET 56.A N.B ALA 52.A O MET 56.A H.B 2.960 2.148 ALA 57.A N TYR 53.A O ALA 57.A H.A 2.980 2.135 LEU 58.A N CYS 54.A O LEU 58.A H 2.958 2.110 ALA 59.A N GLU 55.A O ALA 59.A H 2.802 1.999 ALA 60.A N MET 56.A O.A ALA 60.A H 3.054 2.422 ALA 60.A N ALA 57.A O ALA 60.A H 3.135 2.419 VAL 61.A N LEU 58.A O VAL 61.A H 3.447 2.623 VAL 64.A N ALA 60.A O VAL 64.A H 3.253 2.484 LEU 65.A N VAL 61.A O LEU 65.A H 2.825 1.981 GLY 66.A N THR 62.A O GLY 66.A H 2.718 1.968 GLY 69.A N.B ASP 67.A OD2.B GLY 69.A H.B 2.684 1.885 GLU 70.A N ARG 118.A O GLU 70.A H.B 2.839 2.028 VAL 71.A N LEU 231.A O VAL 71.A H 2.894 2.060 HIS 72.A N VAL 116.A O HIS 72.A H 2.771 1.915 HIS 72.A NE2 GLU 70.A OE2 no hydrogen 2.653 N/A ASP 73.A N ARG 229.A O ASP 73.A H 2.807 1.975 LEU 74.A N VAL 228.A O LEU 74.A H 2.979 2.261 LYS 75.A N THR 114.A O LYS 75.A H 2.901 2.096 PHE 76.A N LEU 226.A O PHE 76.A H.A 2.932 2.087 LEU 82.A N ALA 46.A O LEU 82.A H 2.944 2.091 ASP 83.A N THR 86.A OG1 ASP 83.A H 2.894 2.048 THR 86.A N ASP 28.A OD1 THR 86.A H 2.891 2.089 VAL 88.A N GLY 27.A O VAL 88.A H 3.011 2.198 TRP 89.A N GLU 105.A O TRP 89.A H 2.895 2.039 VAL 90.A N TRP 25.A O VAL 90.A H 2.968 2.154 SER 91.A N GLY 103.A O SER 91.A H 2.871 2.047 ALA 92.A N HIS 23.A O ALA 92.A H 3.115 2.338 ALA 93.A N GLU 101.A O ALA 93.A H 2.874 2.077 VAL 94.A N GLU 21.A O VAL 94.A H 2.949 2.108 THR 95.A N THR 99.A O THR 95.A H 2.994 2.202 THR 99.A N ALA 96.A O THR 99.A H 2.967 2.119 ALA 100.A N LEU 117.A O ALA 100.A H 2.989 2.196 GLU 101.A N ALA 93.A O GLU 101.A H 2.820 2.072 PHE 102.A N ALA 115.A O PHE 102.A H 2.847 2.002 GLY 103.A N SER 91.A O GLY 103.A H 2.982 2.203 VAL 104.A N ALA 113.A O VAL 104.A H 2.976 2.195 GLU 105.A N TRP 89.A O GLU 105.A H 2.840 2.038 THR 106.A N THR 110.A O THR 106.A H 2.951 2.123 ARG 109.A NH1 GLU 105.A OE2 ARG 109.A HH11 3.247 2.391 THR 110.A N THR 106.A O THR 110.A H 2.874 2.032 GLN 111.A NE2 ALA 113.A O GLN 111.A HE21 2.985 2.270 ARG 112.A N VAL 104.A O ARG 112.A H 2.716 1.859 ARG 112.A NE THR 106.A OG1 ARG 112.A HE 2.862 2.032 ARG 112.A NH1 THR 106.A OG1 ARG 112.A HH11 3.196 2.486 ARG 112.A NH2 ASP 78.A O ARG 112.A HH21 2.872 2.072 ALA 113.A N VAL 104.A O ALA 113.A H 3.276 2.503 THR 114.A N LYS 75.A O THR 114.A H 3.077 2.306 ALA 115.A N PHE 102.A O ALA 115.A H 2.984 2.216 VAL 116.A N HIS 72.A O VAL 116.A H 2.910 2.056 LEU 117.A N ALA 100.A O LEU 117.A H 2.712 1.889 ARG 118.A N GLU 70.A O ARG 118.A H 2.847 2.006 ARG 118.A NE ASP 120.A OD2 ARG 118.A HE 2.914 2.133 ARG 118.A NH1 ASP 120.A OD1 ARG 118.A HH11 2.588 1.980 ARG 118.A NH1 ASP 120.A OD2 ARG 118.A HH11 3.001 2.277 GLY 119.A N GLY 98.A O GLY 119.A H 2.892 2.075 ARG 125.A N GLU 124.A OE2.A ARG 125.A H 2.808 1.985 ARG 125.A NH1 VAL 268.A O ARG 125.A HH11 2.985 2.253 HIS 129.A N GLY 266.A O HIS 129.A H 2.895 2.077 HIS 129.A NE2 GLU 260.A OE1 no hydrogen 2.708 N/A ALA 133.A N SER 130.A OG ALA 133.A H 3.032 2.187 LEU 134.A N SER 130.A O LEU 134.A H 2.946 2.112 LEU 135.A N ILE 131.A O LEU 135.A H 2.897 2.048 ALA 136.A N ASP 132.A O ALA 136.A H 2.886 2.064 ALA 137.A N ALA 133.A O ALA 137.A H 3.213 2.492 ALA 137.A N LEU 134.A O ALA 137.A H 3.181 2.508 HIS 138.A N LEU 135.A O HIS 138.A H 3.046 2.215 HIS 138.A ND1 LEU 134.A O no hydrogen 2.724 N/A ASN 140.A N VAL 170.A O ASN 140.A H 2.894 2.052 ASN 140.A ND2 VAL 170.A O ASN 140.A HD22 3.574 3.040 ASN 140.A ND2 ALA 171.A O ASN 140.A HD22 2.960 2.184 ARG 141.A NE GLU 167.A OE2 no hydrogen 2.404 N/A ARG 141.A NH1 ASP 143.A OD1 ARG 141.A HH12 3.384 2.753 ARG 141.A NH2 ASP 143.A OD1 ARG 141.A HH22 2.840 2.047 VAL 142.A N ALA 168.A O VAL 142.A H 2.666 1.821 GLY 144.A N SER 166.A O GLY 144.A H 2.983 2.206 GLU 146.A N ASP 143.A OD2 GLU 146.A H 2.897 2.124 LEU 147.A N ASP 143.A O LEU 147.A H 2.903 2.093 ARG 148.A N GLY 144.A O ARG 148.A H 2.920 2.084 ARG 148.A NH1 LEU 165.A O ARG 148.A HH12 2.740 1.884 ARG 148.A NH2 ASP 145.A OD1 ARG 148.A HH21 2.819 1.998 ARG 148.A NH2 LEU 165.A O ARG 148.A HH22 3.453 2.818 ALA 149.A N ASP 145.A O ALA 149.A H 2.865 2.070 GLY 150.A N GLU 146.A O GLY 150.A H 3.030 2.227 PHE 151.A N LEU 147.A O PHE 151.A H 3.050 2.234 GLY 152.A N ARG 148.A O GLY 152.A H 2.971 2.155 THR 153.A N ALA 149.A O THR 153.A H 3.222 2.581 THR 153.A N GLY 150.A O THR 153.A H 3.005 2.307 THR 153.A OG1 GLY 150.A O THR 153.A HG1 2.676 1.837 VAL 154.A N PHE 151.A O VAL 154.A H 3.036 2.250 GLY 155.A N GLY 152.A O GLY 155.A H 3.013 2.209 ILE 156.A N PHE 151.A O ILE 156.A H 3.066 2.223 GLY 157.A N ARG 41.A O GLY 157.A H 2.800 1.949 GLY 159.A N ASP 39.A O GLY 159.A H 2.746 1.939 ALA 161.A N ASP 39.A OD2 ALA 161.A H 2.856 2.003 PHE 162.A N GLY 159.A O PHE 162.A H 2.809 2.070 ALA 163.A N ALA 160.A O ALA 163.A H 3.116 2.290 SER 166.A N ALA 181.A O SER 166.A H 2.898 2.087 ALA 168.A N VAL 142.A O ALA 168.A H 2.837 2.004 TYR 169.A N VAL 179.A O TYR 169.A H 2.703 1.959 VAL 170.A N ASN 140.A O VAL 170.A H 2.827 2.016 THR 172.A N GLU 175.A OE1 THR 172.A H 2.823 2.027 THR 172.A OG1 GLU 175.A OE1 THR 172.A HG1 2.658 1.827 ALA 174.A N THR 172.A OG1 ALA 174.A H 3.106 2.289 GLU 175.A N THR 172.A O GLU 175.A H 3.063 2.234 THR 177.A OG1 HIS 138.A NE2 THR 177.A HG1 2.642 1.982 VAL 178.A N SER 245.A O VAL 178.A H 2.969 2.166 VAL 179.A N TYR 169.A O VAL 179.A H 2.963 2.117 ALA 180.A N CYS 243.A O ALA 180.A H 2.846 2.037 ALA 181.A N GLU 167.A O ALA 181.A H 2.882 2.069 VAL 182.A N.A ARG 241.A O.A VAL 182.A H.A 3.164 2.344 VAL 182.A N.A ARG 241.A O.C VAL 182.A H.A 2.765 1.923 VAL 182.A N.B ARG 241.A O.A VAL 182.A H.B 3.178 2.389 VAL 182.A N.B ARG 241.A O.C VAL 182.A H.B 2.776 1.965 ALA 183.A N GLY 164.A O ALA 183.A H.A 3.054 2.253 LEU 188.A N PRO 185.A O LEU 188.A H 2.979 2.144 ARG 189.A N GLY 186.A O ARG 189.A H 2.964 2.121 ARG 189.A NH1 ARG 238.A O ARG 189.A HH12 2.967 2.132 GLY 191.A N LEU 188.A O GLY 191.A H 3.079 2.391 TYR 195.A N GLN 192.A O TYR 195.A H 3.135 2.293 THR 196.A N GLU 55.A OE2 THR 196.A H 2.797 2.020 VAL 197.A N GLU 55.A OE1 VAL 197.A H 2.824 1.986 ALA 200.A N HIS 198.A ND1 ALA 200.A H 3.026 2.188 LEU 201.A N HIS 198.A O LEU 201.A H 2.946 2.317 LEU 202.A N HIS 198.A O LEU 202.A H 3.038 2.202 ASP 203.A N PRO 199.A O ASP 203.A H 2.907 2.078 ALA 204.A N ALA 200.A O ALA 204.A H 3.289 2.476 CYS 205.A N LEU 201.A O CYS 205.A H 3.053 2.257 CYS 205.A SG LEU 201.A O CYS 205.A HG 3.493 2.428 PHE 206.A N LEU 202.A O PHE 206.A H 3.004 2.194 GLN 207.A N ASP 203.A O GLN 207.A H 2.868 2.068 GLN 207.A NE2 PHE 162.A O GLN 207.A HE22 3.074 2.224 GLN 207.A NE2 ASP 203.A OD2 GLN 207.A HE21 2.871 2.029 SER 208.A N ALA 204.A O SER 208.A H 3.241 2.550 SER 208.A N CYS 205.A O SER 208.A H 3.044 2.385 SER 208.A OG CYS 205.A O SER 208.A HG 2.637 1.799 VAL 209.A N PHE 206.A O VAL 209.A H 3.187 2.417 ILE 210.A N GLN 207.A O ILE 210.A H 2.979 2.208 ALA 211.A N SER 208.A O ALA 211.A H 3.070 2.275 HIS 212.A N VAL 209.A O HIS 212.A H 3.117 2.264 HIS 212.A NE2 GLU 175.A O no hydrogen 2.653 N/A GLU 214.A N HIS 212.A ND1 GLU 214.A H 2.925 2.162 GLN 216.A N HIS 212.A O GLN 216.A H 2.929 2.102 GLN 216.A NE2 ILE 210.A O GLN 216.A HE21 2.770 1.911 ASN 217.A N PRO 213.A O ASN 217.A H 2.921 2.153 ILE 218.A N.A GLU 214.A O ILE 218.A H.A 3.151 2.446 ILE 218.A N.B GLU 214.A O ILE 218.A H.B 3.251 2.489 ALA 219.A N.A VAL 215.A O ALA 219.A H.A 2.988 2.224 ALA 219.A N.B GLN 216.A O ALA 219.A H.B 2.995 2.373 SER 220.A OG.A ILE 218.A O.B no hydrogen 2.380 N/A SER 220.A OG.B SER 252.A O no hydrogen 3.270 N/A LEU 224.A N GLY 278.A O LEU 224.A H 2.820 1.966 LEU 226.A N GLN 276.A O.A LEU 226.A H 2.854 2.031 LEU 226.A N GLN 276.A O.B LEU 226.A H 2.688 1.882 VAL 228.A N LEU 74.A O VAL 228.A H 2.868 2.095 ARG 229.A N GLY 274.A O ARG 229.A H 3.190 2.469 ARG 229.A NH1.B GLU 256.A OE1 ARG 229.A HH12.B 2.532 1.679 ARG 229.A NH2.B GLN 276.A OE1.A ARG 229.A HH22.B 3.364 2.765 ARG 230.A N MET 273.A O ARG 230.A H.B 3.001 2.229 ARG 230.A NE GLU 70.A OE1 ARG 230.A HE 3.357 2.709 ARG 230.A NE GLU 70.A OE2 ARG 230.A HE 2.937 2.101 ARG 230.A NH2 GLU 70.A OE1 ARG 230.A HH21 2.882 2.119 LEU 231.A N VAL 71.A O LEU 231.A H 2.946 2.133 ARG 232.A N SER 271.A O ARG 232.A H 3.013 2.209 ARG 232.A NH1 GLU 70.A OE1 ARG 232.A HH11 2.840 2.017 ARG 232.A NH1 VAL 121.A O ARG 232.A HH12 2.786 2.112 ARG 232.A NH2 VAL 121.A O ARG 232.A HH22 3.444 2.911 TYR 234.A N LEU 269.A O TYR 234.A H 2.853 1.998 TYR 234.A OH SER 271.A OG TYR 234.A HH 2.855 2.022 THR 237.A OG1 THR 196.A O THR 237.A HG1 2.801 2.188 ARG 238.A N SER 236.A OG ARG 238.A H 3.102 2.246 ARG 238.A NH2.B ARG 189.A O ARG 238.A HH22.B 3.114 2.274 ASN 239.A N.A ASN 239.A OD1.A ASN 239.A H.A 2.585 1.933 VAL 240.A N THR 237.A O VAL 240.A H.B 3.279 2.422 ARG 241.A N.A LEU 262.A O ARG 241.A H.A 2.866 2.028 ARG 241.A N.C LEU 262.A O ARG 241.A H.C 2.881 2.052 TYR 242.A N LEU 262.A O TYR 242.A H.A 3.113 2.285 CYS 243.A N ALA 180.A O CYS 243.A H 2.889 2.109 CYS 243.A SG SER 245.A OG.B CYS 243.A HG 3.745 2.716 LEU 244.A N GLU 260.A O LEU 244.A H 2.895 2.089 SER 245.A N VAL 178.A O SER 245.A H.B 2.883 2.040 ARG 246.A N ASP 258.A O ARG 246.A H 2.799 2.007 ILE 247.A N PRO 176.A O ILE 247.A H 2.715 1.870 VAL 248.A N GLU 256.A O VAL 248.A H 2.769 1.979 LYS 249.A N GLU 256.A O LYS 249.A H 3.162 2.336 ASP 251.A N GLY 254.A O ASP 251.A H 3.020 2.183 PHE 253.A N ASP 251.A OD1 PHE 253.A H 2.891 2.078 GLY 254.A N ASP 251.A O GLY 254.A H 3.185 2.345 VAL 255.A N LEU 277.A O VAL 255.A H 2.983 2.188 GLU 256.A N LYS 249.A O GLU 256.A H 2.847 2.021 ALA 257.A N LEU 275.A O ALA 257.A H 2.913 2.140 ASP 258.A N ARG 246.A O ASP 258.A H 2.939 2.147 LEU 259.A N ALA 272.A O LEU 259.A H 2.798 1.983 GLU 260.A N LEU 244.A O GLU 260.A H 2.820 1.993 LEU 261.A N LEU 270.A O LEU 261.A H 2.895 2.078 LEU 262.A N TYR 242.A O LEU 262.A H 2.836 1.986 ASP 263.A N THR 267.A O ASP 263.A H 2.983 2.224 ASP 265.A N ASP 263.A OD1 ASP 265.A H 2.862 2.177 GLY 266.A N ASP 263.A O GLY 266.A H 3.009 2.163 THR 267.A N ASP 263.A OD1 THR 267.A H 3.016 2.198 LEU 269.A N LEU 261.A O LEU 269.A H 2.751 1.892 SER 271.A N ARG 232.A O SER 271.A H 2.856 2.025 ALA 272.A N LEU 259.A O ALA 272.A H 2.918 2.077 MET 273.A N ARG 230.A O MET 273.A H.A 2.754 1.935 GLY 274.A N ASP 258.A OD1 GLY 274.A H 2.860 2.056 LEU 275.A N ALA 257.A O LEU 275.A H 2.827 2.208 GLN 276.A N.A GLY 227.A O GLN 276.A H.A 2.886 2.041 GLN 276.A N.B GLY 227.A O GLN 276.A H.B 2.900 2.095 LEU 277.A N VAL 255.A O LEU 277.A H.A 2.822 1.981 GLY 278.A N LEU 224.A O GLY 278.A H 2.920 2.111 LYS 284.A NZ ASP 78.A OD1 no hydrogen 2.649 N/A LYS 284.A NZ MET 79.A O no hydrogen 2.347 N/A GLU 286.A N SER 282.A O no hydrogen 3.164 N/A