Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5c8y_F.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TYR 2.A N GLN 26.A O TYR 2.A H 2.977 2.242 TYR 2.A OH PRO 323.A O TYR 2.A HH 2.605 1.795 THR 3.A N ASN 38.A OD1 THR 3.A H 3.054 2.262 THR 3.A OG1 ARG 36.A O THR 3.A HG1 3.191 2.481 PHE 4.A N LYS 28.A O PHE 4.A H 2.997 2.211 VAL 5.A N LEU 39.A O VAL 5.A H 3.194 2.461 ARG 7.A N LEU 41.A O ARG 7.A H 2.935 2.085 ARG 7.A NE GLU 43.A OE2 ARG 7.A HE 2.923 2.142 ARG 7.A NH1 LYS 32.A O ARG 7.A HH11 3.112 2.384 ARG 7.A NH2 GLU 43.A OE1 ARG 7.A HH21 3.212 2.384 SER 11.A N ASP 8.A O SER 11.A H 3.452 2.614 TYR 14.A N SER 11.A OG TYR 14.A H 3.055 2.218 ALA 15.A N SER 11.A O ALA 15.A H 2.987 2.284 GLU 16.A N VAL 13.A O GLU 16.A H 3.031 2.325 VAL 17.A N VAL 13.A O VAL 17.A H 3.226 2.500 SER 18.A N TYR 14.A O SER 18.A H 3.024 2.173 ARG 19.A N ALA 15.A O ARG 19.A H 3.281 2.484 ARG 19.A NE GLU 16.A OE1 ARG 19.A HE 3.110 2.367 ARG 19.A NE GLU 16.A OE2 ARG 19.A HE 3.044 2.357 ARG 19.A NH2 GLU 16.A OE2 ARG 19.A HH21 2.661 1.863 LEU 20.A N GLU 16.A O LEU 20.A H 2.982 2.183 LEU 21.A N VAL 17.A O LEU 21.A H 2.932 2.125 LEU 22.A N SER 18.A O LEU 22.A H 3.027 2.178 ALA 23.A N ARG 19.A O ALA 23.A H 3.275 2.600 ALA 23.A N LEU 20.A O ALA 23.A H 3.117 2.460 THR 24.A N LEU 21.A O THR 24.A H 3.084 2.242 THR 24.A OG1 LEU 21.A O THR 24.A HG1 2.503 1.690 GLY 25.A N LEU 22.A O GLY 25.A H 3.377 2.567 LYS 28.A N TYR 2.A O LYS 28.A H 2.912 2.091 ARG 29.A NH2 GLU 9.A OE2 ARG 29.A HH22 3.135 2.495 LEU 30.A N PHE 4.A O LEU 30.A H 2.884 2.038 ASN 34.A N ARG 31.A O ASN 34.A H 3.479 2.624 ARG 36.A N ASN 34.A OD1 ARG 36.A H 3.082 2.240 ASN 38.A N THR 3.A O ASN 38.A H 2.717 1.904 ASN 38.A ND2 VAL 59.A O ASN 38.A HD22 3.316 2.481 LEU 39.A N THR 3.A O LEU 39.A H 3.057 2.315 MET 40.A N LEU 61.A O MET 40.A H 2.712 2.007 LEU 41.A N VAL 5.A O LEU 41.A H 3.091 2.259 GLY 42.A N ASN 63.A OD1 GLY 42.A H 3.020 2.285 GLU 43.A N GLU 43.A OE2 GLU 43.A H 2.521 1.741 PHE 49.A N LEU 47.A O PHE 49.A H 2.850 2.244 ARG 51.A N PRO 48.A O ARG 51.A H 3.461 2.617 LEU 52.A N PHE 49.A O LEU 52.A H 3.156 2.314 GLY 53.A N GLN 60.A OE1 GLY 53.A H 2.585 1.738 GLN 60.A NE2 PRO 35.A O GLN 60.A HE22 3.368 2.871 GLN 60.A NE2 PHE 37.A O GLN 60.A HE21 3.394 2.672 LEU 61.A N ASN 38.A O LEU 61.A H 2.878 2.274 VAL 62.A N GLN 273.A O VAL 62.A H 3.153 2.434 ASN 63.A N MET 40.A O ASN 63.A H 3.229 2.454 TYR 65.A N GLN 276.A OE1 TYR 65.A H 2.671 1.813 TYR 65.A OH ASP 175.A O TYR 65.A HH 2.708 1.926 ALA 68.A N TYR 65.A O ALA 68.A H 3.046 2.210 LYS 70.A N GLY 67.A O LYS 70.A H 3.406 2.561 LEU 71.A N ALA 68.A O LEU 71.A H 2.893 2.061 CYS 72.A N ASP 69.A O CYS 72.A H 3.038 2.339 CYS 72.A SG ALA 68.A O CYS 72.A HG 3.550 2.532 LEU 77.A N ARG 73.A O LEU 77.A H 2.616 1.794 VAL 78.A N LYS 74.A O VAL 78.A H 3.239 2.399 LEU 80.A N SER 76.A O LEU 80.A H 2.777 1.945 ILE 81.A N LEU 77.A O ILE 81.A H 2.976 2.184 LYS 82.A N VAL 78.A O LYS 82.A H 2.955 2.148 LYS 82.A NZ SER 97.A O LYS 82.A HZ1 2.605 2.020 LYS 82.A NZ GLU 105.A OE1 LYS 82.A HZ2 3.097 2.366 LYS 82.A NZ GLU 105.A OE2 LYS 82.A HZ3 2.893 2.271 THR 83.A N LYS 79.A O THR 83.A H 2.976 2.284 THR 83.A OG1 LYS 79.A O THR 83.A HG1 2.577 1.781 THR 83.A OG1 LEU 80.A O THR 83.A HG1 3.539 3.091 SER 84.A N LEU 80.A O SER 84.A H 3.104 2.377 SER 84.A OG LEU 80.A O SER 84.A HG 2.663 2.029 GLU 86.A N GLU 86.A OE2 GLU 86.A H 2.696 1.980 LEU 87.A N SER 84.A O LEU 87.A H 3.031 2.250 SER 88.A N SER 84.A O SER 88.A H 2.539 1.732 SER 90.A OG SER 88.A OG SER 90.A HG 3.272 2.625 SER 97.A OG PRO 95.A O SER 97.A HG 2.909 2.085 TYR 98.A N ILE 149.A O TYR 98.A H 2.819 2.041 TYR 98.A OH GLU 96.A OE1 TYR 98.A HH 2.394 1.746 VAL 99.A N GLU 105.A OE1 VAL 99.A H 2.724 1.895 ILE 100.A N HIS 147.A O ILE 100.A H 3.093 2.261 TYR 101.A N ASP 104.A OD2 TYR 101.A H 3.191 2.357 GLU 105.A N VAL 99.A O GLU 105.A H 3.349 2.497 ARG 106.A NH2 ASP 141.A OD1 ARG 106.A HH22 3.549 2.821 GLU 107.A N GLU 107.A OE2 GLU 107.A H 2.877 2.079 PHE 109.A N GLU 105.A O PHE 109.A H 3.170 2.450 PHE 109.A N ARG 106.A O PHE 109.A H 3.101 2.502 LEU 110.A N ARG 106.A O LEU 110.A H 3.156 2.377 ALA 111.A N GLU 107.A O ALA 111.A H 3.320 2.595 TYR 113.A N PHE 109.A O TYR 113.A H 2.988 2.257 TYR 113.A OH SER 131.A O TYR 113.A HH 3.000 2.184 ASN 114.A N LEU 110.A O ASN 114.A H 3.112 2.451 ARG 116.A N ALA 112.A O ARG 116.A H 3.372 2.591 ARG 116.A NE GLY 122.A O ARG 116.A HE 3.145 2.536 ARG 117.A N ASN 114.A O ARG 117.A H 2.888 2.281 GLU 118.A N ASN 114.A O GLU 118.A H 2.524 1.687 GLU 121.A N ARG 116.A O GLU 121.A H 3.322 2.484 ASN 123.A ND2 TYR 113.A O ASN 123.A HD21 3.293 2.695 VAL 124.A N GLU 154.A OE2 VAL 124.A H 2.879 2.071 TRP 125.A N SER 130.A O TRP 125.A H 2.970 2.117 TRP 125.A NE1 ASN 123.A OD1 TRP 125.A HE1 2.606 1.751 ILE 126.A N GLN 150.A O ILE 126.A H 2.770 2.006 ALA 127.A N LEU 128.A O ALA 127.A H 3.322 2.575 SER 130.A N TRP 125.A O SER 130.A H 3.323 2.591 GLU 132.A N SER 130.A OG GLU 132.A H 3.125 2.283 LEU 137.A N ALA 133.A O LEU 137.A H 3.251 2.402 ASP 138.A N SER 134.A O ASP 138.A H 3.243 2.405 PHE 139.A N LEU 136.A O PHE 139.A H 3.010 2.390 ILE 140.A N LEU 136.A O ILE 140.A H 3.050 2.248 ASP 141.A N LEU 137.A O ASP 141.A H 3.172 2.344 GLU 142.A N PHE 139.A O GLU 142.A H 3.173 2.422 GLN 143.A N PHE 139.A O GLN 143.A H 3.193 2.588 GLN 143.A N ILE 140.A O GLN 143.A H 3.299 2.543 GLN 145.A N GLN 145.A OE1 GLN 145.A H 2.447 1.821 HIS 147.A N ILE 100.A O HIS 147.A H 3.368 2.558 HIS 147.A ND1 GLN 145.A O no hydrogen 3.339 N/A ILE 149.A N TYR 98.A O ILE 149.A H 2.893 2.110 GLN 150.A N ILE 126.A O GLN 150.A H 2.779 1.938 GLN 150.A NE2 SER 97.A OG GLN 150.A HE21 3.105 2.418 LYS 151.A N GLU 96.A O LYS 151.A H 2.808 2.006 LYS 151.A NZ VAL 124.A O LYS 151.A HZ2 3.495 2.745 TYR 152.A N VAL 124.A O TYR 152.A H 2.921 2.114 LEU 157.A N VAL 284.A O LEU 157.A H 3.074 2.226 LEU 159.A N ARG 164.A O LEU 159.A H 2.938 2.183 GLY 162.A N GLU 160.A OE1 GLY 162.A H 3.143 2.468 HIS 163.A N GLU 160.A OE1 HIS 163.A H 2.986 2.310 HIS 163.A ND1 GLU 160.A OE2 no hydrogen 2.855 N/A ARG 164.A N LEU 159.A O ARG 164.A H 3.130 2.335 ARG 164.A NH1 GLU 220.A OE1 ARG 164.A HH12 2.546 1.850 LYS 165.A NZ HIS 206.A O LYS 165.A HZ3 2.995 2.156 ASP 167.A N ARG 189.A O ASP 167.A H 3.155 2.419 ILE 168.A N PHE 282.A O ILE 168.A H 3.108 2.319 ARG 169.A N VAL 187.A O ARG 169.A H 3.036 2.192 ARG 169.A NE ASP 281.A OD1 ARG 169.A HE 2.864 2.085 ARG 169.A NH2 ASP 281.A OD1 ARG 169.A HH21 3.172 2.501 ARG 169.A NH2 ASP 281.A OD2 ARG 169.A HH21 3.413 2.629 SER 170.A N PHE 280.A O SER 170.A H 2.763 1.917 VAL 172.A N PHE 278.A O VAL 172.A H 2.994 2.188 LEU 173.A N TYR 181.A O LEU 173.A H 2.783 1.958 VAL 174.A N GLN 276.A O VAL 174.A H 3.101 2.251 ASP 175.A N ASN 179.A O ASP 175.A H 3.296 2.503 TYR 178.A N ASP 175.A O TYR 178.A H 3.098 2.299 TYR 178.A OH LEU 258.A O TYR 178.A HH 2.598 1.808 ASN 179.A N ASP 175.A OD1 ASN 179.A H 2.469 1.779 ASN 179.A ND2 ASP 175.A OD2 ASN 179.A HD22 2.996 2.415 TYR 181.A N LEU 173.A O TYR 181.A H 2.904 2.068 LEU 182.A N ILE 330.A O LEU 182.A H 2.808 1.948 TYR 183.A N TRP 171.A O TYR 183.A H 2.989 2.138 TYR 183.A OH GLU 308.A OE1 TYR 183.A HH 2.696 1.999 ARG 184.A N ILE 328.A O ARG 184.A H 3.085 2.253 ARG 184.A NH2 GLU 308.A OE2 ARG 184.A HH21 2.573 1.788 LEU 188.A N MET 225.A O LEU 188.A H 2.765 1.912 ARG 189.A N ASP 167.A O ARG 189.A H 2.958 2.211 ARG 189.A NE ASP 167.A OD1 ARG 189.A HE 3.051 2.388 ARG 189.A NH1 ASP 167.A OD1 ARG 189.A HH11 2.687 1.927 THR 190.A N ASN 223.A O THR 190.A H 3.196 2.372 THR 190.A OG1 GLU 220.A OE2 THR 190.A HG1 2.745 2.091 SER 191.A N LYS 165.A O SER 191.A H 2.737 1.882 SER 191.A OG GLU 193.A O SER 191.A HG 2.974 2.359 SER 192.A N GLN 213.A OE1 SER 192.A H 2.963 2.122 SER 192.A OG ASN 215.A O SER 192.A HG 2.952 2.364 TYR 195.A N HIS 163.A O TYR 195.A H 2.814 1.972 ASN 199.A N ASN 196.A OD1 ASN 199.A H 2.575 1.756 ASP 202.A N ASN 199.A OD1 ASP 202.A H 2.926 2.151 CYS 205.A SG HIS 206.A ND1 CYS 205.A HG 3.585 2.432 GLN 213.A N ASN 209.A O GLN 213.A H 3.220 2.376 GLN 213.A NE2 THR 204.A O GLN 213.A HE22 2.832 2.145 GLN 213.A NE2 LEU 207.A O GLN 213.A HE21 3.454 2.684 LYS 214.A N CYS 211.A O LYS 214.A H 3.012 2.258 GLY 217.A N ASN 223.A OD1 GLY 217.A H 2.978 2.166 ARG 218.A N ASN 215.A O ARG 218.A H 3.284 2.486 ASN 223.A N GLU 220.A O ASN 223.A H 3.370 2.581 ASN 223.A ND2 THR 190.A O ASN 223.A HD22 3.365 2.694 MET 225.A N LEU 188.A O MET 225.A H 3.044 2.203 PHE 230.A N PHE 226.A O PHE 230.A H 3.279 2.431 ASN 231.A N PHE 227.A O ASN 231.A H 2.782 1.958 GLN 232.A N GLU 228.A O GLN 232.A H 3.361 2.580 TYR 233.A N GLU 229.A O TYR 233.A H 2.831 2.040 LEU 234.A N PHE 230.A O LEU 234.A H 3.131 2.329 MET 235.A N ASN 231.A O MET 235.A H 3.125 2.328 ASP 236.A N GLN 232.A O ASP 236.A H 3.020 2.222 ALA 237.A N TYR 233.A O ALA 237.A H 2.723 1.913 LEU 238.A N LEU 234.A O LEU 238.A H 2.782 2.003 ASN 239.A N MET 235.A O ASN 239.A H 3.241 2.588 THR 240.A N LEU 234.A O THR 240.A H 3.201 2.363 LEU 242.A N ASN 231.A OD1 LEU 242.A H 2.929 2.076 ASN 244.A N THR 241.A OG1 ASN 244.A H 3.320 2.485 SER 245.A N THR 241.A O SER 245.A H 3.015 2.162 SER 245.A OG THR 241.A O SER 245.A HG 2.590 1.796 ILE 246.A N LEU 242.A O ILE 246.A H 3.303 2.527 LEU 247.A N LEU 242.A O LEU 247.A H 2.878 2.064 GLN 249.A NE2 SER 245.A O GLN 249.A HE21 3.017 2.434 GLN 249.A NE2 LEU 288.A O GLN 249.A HE22 3.278 2.467 ILE 250.A N ILE 246.A O ILE 250.A H 3.122 2.305 LYS 251.A N LEU 247.A O LYS 251.A H 2.907 2.054 LYS 251.A NZ GLU 243.A OE2 LYS 251.A HZ1 2.651 1.914 HIS 252.A N LEU 248.A O HIS 252.A H 2.997 2.276 ILE 253.A N GLN 249.A O ILE 253.A H 2.889 2.075 ILE 254.A N ILE 250.A O ILE 254.A H 2.920 2.064 ARG 255.A N LYS 251.A O ARG 255.A H 3.090 2.270 SER 256.A N HIS 252.A O SER 256.A H 2.863 2.117 SER 256.A OG HIS 252.A O SER 256.A HG 2.600 1.815 CYS 257.A N ILE 253.A O CYS 257.A H 2.963 2.120 CYS 257.A SG ILE 253.A O CYS 257.A HG 3.460 2.621 LEU 258.A N ILE 254.A O LEU 258.A H 3.288 2.448 MET 259.A N ARG 255.A O MET 259.A H 3.197 2.414 CYS 260.A N SER 256.A O CYS 260.A H 3.188 2.459 ALA 264.A N ILE 261.A O ALA 264.A H 2.967 2.167 ILE 265.A N ILE 261.A O ILE 265.A H 3.202 2.487 SER 266.A N GLU 262.A O SER 266.A H 2.915 2.150 LYS 268.A N SER 266.A OG LYS 268.A H 3.349 2.538 LEU 270.A N THR 267.A O LEU 270.A H 3.310 2.469 GLN 273.A N GLN 60.A O GLN 273.A H 3.260 2.495 SER 274.A N THR 267.A OG1 SER 274.A H 3.285 2.620 PHE 275.A N VAL 62.A O PHE 275.A H 3.021 2.187 GLN 276.A N VAL 174.A O GLN 276.A H 3.113 2.380 GLN 276.A NE2 GLY 297.A O GLN 276.A HE21 3.180 2.416 PHE 278.A N VAL 172.A O PHE 278.A H 2.608 1.755 GLY 279.A N ASN 296.A O GLY 279.A H 2.867 2.151 PHE 280.A N SER 170.A O PHE 280.A H 2.836 2.059 ASP 281.A N GLU 294.A O ASP 281.A H 3.142 2.284 PHE 282.A N ILE 168.A O PHE 282.A H 2.746 1.925 MET 283.A N TRP 291.A O MET 283.A H 2.810 2.085 ASP 285.A N LYS 289.A O ASP 285.A H 3.333 2.541 GLU 286.A N LYS 155.A O GLU 286.A H 3.251 2.462 LEU 288.A N ASP 285.A O LEU 288.A H 2.927 2.180 LYS 289.A N ASP 285.A OD1 LYS 289.A H 2.585 1.861 LYS 289.A NZ THR 92.A O LYS 289.A HZ1 3.219 2.629 VAL 290.A N GLN 249.A OE1 VAL 290.A H 2.850 2.027 TRP 291.A N MET 283.A O TRP 291.A H 2.865 2.102 TRP 291.A NE1 ASP 285.A OD2 TRP 291.A HE1 3.047 2.190 LEU 292.A N TRP 93.A O LEU 292.A H 2.804 1.951 ILE 293.A N ASP 281.A O ILE 293.A H 2.956 2.104 ASN 296.A N GLY 279.A O ASN 296.A H 2.811 1.993 LEU 305.A N ALA 302.A O LEU 305.A H 2.907 2.158 LEU 309.A N LEU 305.A O LEU 309.A H 2.830 1.974 CYS 310.A N TYR 306.A O CYS 310.A H 3.136 2.320 GLN 311.A NE2 ASP 315.A OD2 GLN 311.A HE21 2.662 2.024 GLY 312.A N GLU 308.A O GLY 312.A H 3.096 2.317 ILE 313.A N LEU 309.A O ILE 313.A H 2.909 2.128 VAL 314.A N CYS 310.A O VAL 314.A H 3.288 2.484 ASP 315.A N GLN 311.A O ASP 315.A H 2.988 2.218 VAL 316.A N GLY 312.A O VAL 316.A H 3.099 2.279 ALA 317.A N ILE 313.A O ALA 317.A H 3.122 2.319 SER 319.A N VAL 314.A O SER 319.A H 2.745 1.896 SER 320.A OG VAL 316.A O SER 320.A HG 2.538 2.048 VAL 321.A N ILE 318.A O VAL 321.A H 3.065 2.384 PHE 322.A N ILE 318.A O PHE 322.A H 2.883 2.030 ALA 325.A N GLN 26.A OE1 ALA 325.A H 3.324 2.510 PHE 329.A N SER 327.A OG PHE 329.A H 3.247 2.388 ILE 330.A N LEU 182.A O ILE 330.A H 2.604 1.811 LEU 332.A N ILE 180.A O LEU 332.A H 2.872 2.057 HIS 334.A NE2 TYR 178.A O no hydrogen 3.278 N/A