Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5cd1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N ALA 4.A O no hydrogen 3.155 N/A SER 1.A N GLU 6.A OE2 no hydrogen 3.368 N/A SER 1.A OG ALA 4.A O SER 1.A HG 3.381 2.566 ILE 9.A N ARG 51.A O ILE 9.A H 3.130 2.299 LYS 10.A NZ GLU 6.A OE1 LYS 10.A HZ1 2.683 1.966 LYS 10.A NZ ASP 13.A OD1 LYS 10.A HZ2 3.076 2.385 LYS 10.A NZ ASP 13.A OD2 LYS 10.A HZ2 3.210 2.332 GLY 12.A N VAL 29.A O GLY 12.A H 3.203 2.389 ASP 13.A N LYS 10.A O ASP 13.A H 3.289 2.460 ALA 15.A N VAL 27.A O ALA 15.A H 2.924 2.159 ILE 16.A N LEU 68.A O ILE 16.A H 3.288 2.431 LEU 17.A N VAL 25.A O LEU 17.A H 2.817 2.019 SER 18.A N TYR 66.A O SER 18.A H 3.093 2.237 LEU 19.A N ALA 23.A O LEU 19.A H 3.224 2.568 GLY 20.A N ALA 23.A O GLY 20.A H 3.470 2.629 ALA 23.A N GLY 20.A O ALA 23.A H 2.799 2.054 VAL 25.A N LEU 17.A O VAL 25.A H 3.058 2.320 VAL 27.A N ALA 15.A O VAL 27.A H 2.888 2.123 VAL 29.A N ASP 13.A O VAL 29.A H 3.167 2.352 GLY 32.A N SER 45.A OG GLY 32.A H 2.734 2.034 ALA 33.A N GLN 30.A O ALA 33.A H 3.337 2.572 THR 35.A N LEU 42.A O THR 35.A H 3.335 2.538 THR 37.A N GLY 40.A O THR 37.A H 3.207 2.487 THR 37.A OG1 GLY 40.A O THR 37.A HG1 2.790 2.150 HIS 39.A NE2 LEU 19.A O HIS 39.A HE2 2.795 2.069 GLY 40.A N THR 37.A OG1 GLY 40.A H 3.323 2.498 LEU 42.A N THR 35.A O LEU 42.A H 3.449 2.600 ARG 43.A N ASP 47.A OD2 ARG 43.A H 3.075 2.220 HIS 44.A N ALA 33.A O HIS 44.A H 3.224 2.383 HIS 44.A NE2 THR 35.A OG1 HIS 44.A HE2 2.752 2.036 VAL 46.A N ARG 43.A O VAL 46.A H 3.267 2.464 ASP 47.A N ARG 43.A O ASP 47.A H 2.936 2.161 ILE 49.A N HIS 44.A O ILE 49.A H 3.307 2.462 GLY 50.A N ILE 9.A O GLY 50.A H 2.998 2.156 ARG 51.A N LEU 48.A O ARG 51.A H 2.863 2.025 PHE 53.A N GLU 7.A O PHE 53.A H 3.245 2.456 VAL 57.A N VAL 65.A O VAL 57.A H 2.852 2.161 CYS 59.A N GLY 63.A O CYS 59.A H 2.468 1.860 GLY 62.A N GLY 60.A O GLY 62.A H 2.776 2.096 LEU 68.A N ILE 16.A O LEU 68.A H 2.827 2.038 HIS 69.A ND1 PRO 70.A O HIS 69.A HD1 2.931 2.212 LEU 74.A N THR 71.A OG1 LEU 74.A H 3.312 2.508 TRP 75.A N THR 71.A O TRP 75.A H 2.869 2.034 THR 76.A N PRO 72.A O THR 76.A H 2.911 2.129 THR 76.A OG1 PRO 72.A O THR 76.A HG1 2.732 1.947 LEU 77.A N LEU 74.A O LEU 77.A H 3.291 2.519 ASN 78.A ND2 LEU 74.A O ASN 78.A HD22 2.792 2.013 LEU 79.A N TRP 75.A O LEU 79.A H 2.837 2.093 ARG 82.A NH1 GLU 146.A OE2 ARG 82.A HH12 2.649 2.030 ARG 82.A NH2 GLU 146.A OE1 ARG 82.A HH22 2.887 2.143 THR 83.A N SER 113.A OG THR 83.A H 3.121 2.428 THR 83.A OG1 SER 113.A OG THR 83.A HG1 2.877 2.144 ILE 85.A N GLN 84.A OE1 ILE 85.A H 2.609 1.935 ASP 90.A N TYR 87.A O ASP 90.A H 3.068 2.468 ILE 91.A N TYR 87.A O ILE 91.A H 3.205 2.356 ALA 92.A N SER 88.A O ALA 92.A H 3.116 2.332 ILE 94.A N ASP 90.A O ILE 94.A H 3.127 2.303 THR 95.A N ILE 91.A O THR 95.A H 2.859 2.060 THR 95.A OG1 ILE 91.A O THR 95.A HG1 2.847 2.077 MET 97.A N LEU 93.A O MET 97.A H 3.088 2.233 LEU 98.A N ILE 94.A O LEU 98.A H 3.108 2.348 GLU 99.A N MET 96.A O GLU 99.A H 2.916 2.079 LEU 100.A N THR 95.A O LEU 100.A H 3.408 2.588 GLY 103.A N ILE 124.A O GLY 103.A H 3.276 2.452 SER 104.A N ARG 101.A O SER 104.A H 3.094 2.295 VAL 105.A N ASP 175.A OD2 VAL 105.A H 3.130 2.413 VAL 106.A N HIS 129.A O VAL 106.A H 3.274 2.524 CYS 107.A N ALA 176.A O CYS 107.A H 3.169 2.403 SER 109.A N PHE 178.A O SER 109.A H 3.306 2.551 THR 111.A N VAL 133.A O THR 111.A H 2.956 2.310 GLY 112.A N GLU 134.A OE1 GLY 112.A H 3.067 2.243 GLY 114.A N THR 111.A O GLY 114.A H 3.256 2.540 SER 115.A OG LEU 86.A O SER 115.A HG 3.035 2.443 SER 117.A OG GLU 108.A OE1 SER 117.A HG 2.636 2.041 SER 117.A OG GLU 108.A OE2 SER 117.A HG 3.489 2.791 ILE 120.A N VAL 116.A O ILE 120.A H 3.116 2.448 ILE 120.A N SER 117.A O ILE 120.A H 3.331 2.625 ILE 121.A N SER 117.A O ILE 121.A H 3.264 2.420 ARG 122.A N HIS 118.A O ARG 122.A H 3.368 2.529 ARG 122.A NE ALA 119.A O ARG 122.A HE 3.072 2.418 ARG 122.A NE THR 123.A OG1 ARG 122.A HE 3.042 2.412 ARG 122.A NH1 GLU 73.A OE1 ARG 122.A HH12 3.266 2.444 ARG 122.A NH1 GLU 73.A OE2 ARG 122.A HH12 2.983 2.252 ARG 122.A NH2 GLU 73.A OE2 ARG 122.A HH22 2.815 2.025 ARG 122.A NH2 ALA 119.A O ARG 122.A HH21 3.129 2.503 THR 123.A N ILE 120.A O THR 123.A H 2.852 2.168 ILE 124.A N ILE 120.A O ILE 124.A H 3.042 2.203 GLY 128.A N ILE 124.A O GLY 128.A H 2.779 2.035 HIS 129.A N SER 104.A O HIS 129.A H 3.119 2.382 HIS 131.A N VAL 106.A O HIS 131.A H 3.179 2.383 VAL 133.A N GLU 108.A O VAL 133.A H 2.855 2.165 GLU 134.A N ARG 159.A O GLU 134.A H 3.385 2.579 GLN 138.A N GLN 138.A OE1 GLN 138.A H 2.589 1.883 ALA 140.A N HIS 136.A O ALA 140.A H 3.232 2.433 GLU 141.A N GLN 137.A O GLU 141.A H 3.327 2.485 LYS 142.A N GLN 138.A O LYS 142.A H 2.780 1.924 ALA 143.A N ARG 139.A O ALA 143.A H 2.922 2.176 ALA 143.A N ALA 140.A O ALA 143.A H 3.243 2.625 ARG 144.A N ALA 140.A O ARG 144.A H 3.138 2.309 ARG 144.A NH1 THR 160.A OG1 ARG 144.A HH12 3.410 2.694 ARG 144.A NH2 VAL 158.A O ARG 144.A HH21 2.741 2.048 ARG 144.A NH2 THR 160.A OG1 ARG 144.A HH22 3.006 2.166 GLU 145.A N GLU 141.A O GLU 145.A H 2.917 2.131 GLU 146.A N LYS 142.A O GLU 146.A H 3.256 2.418 PHE 147.A N ALA 143.A O PHE 147.A H 2.908 2.096 GLN 148.A N ARG 144.A O GLN 148.A H 3.030 2.354 GLN 148.A N GLU 145.A O GLN 148.A H 2.859 2.204 GLU 149.A N GLU 145.A O GLU 149.A H 2.779 1.953 HIS 150.A N GLU 146.A O HIS 150.A H 2.951 2.205 ARG 151.A N GLN 148.A O ARG 151.A H 3.179 2.459 VAL 152.A N PHE 147.A O VAL 152.A H 2.851 2.019 TRP 155.A N VAL 152.A O TRP 155.A H 3.076 2.227 TRP 155.A NE1 PRO 126.A O TRP 155.A HE1 2.771 1.991 THR 157.A N LEU 130.A O THR 157.A H 2.827 2.194 ARG 159.A N THR 132.A O ARG 159.A H 3.097 2.294 CYS 164.A N ASP 162.A OD1 CYS 164.A H 2.908 2.164 SER 166.A N ASP 162.A O SER 166.A H 3.217 2.463 GLY 167.A N VAL 163.A O GLY 167.A H 3.159 2.526 SER 171.A OG ASP 193.A O SER 171.A HG 3.306 2.638 HIS 172.A N ASP 193.A O HIS 172.A H 2.743 2.034 HIS 172.A ND1 ASP 193.A O HIS 172.A HD1 2.847 2.136 VAL 173.A N ALA 194.A O VAL 173.A H 3.048 2.235 ALA 174.A N ALA 194.A O ALA 174.A H 2.912 2.086 ASP 175.A N VAL 105.A O ASP 175.A H 2.986 2.163 PHE 178.A N CYS 107.A O PHE 178.A H 3.039 2.223 LEU 179.A N CYS 203.A O LEU 179.A H 2.998 2.317 ASP 180.A N SER 109.A O ASP 180.A H 2.870 2.040 ALA 187.A N PRO 184.A O ALA 187.A H 3.008 2.185 ALA 191.A N ALA 187.A O ALA 191.A H 2.941 2.186 TRP 192.A N VAL 188.A O TRP 192.A H 3.232 2.452 ASP 193.A N GLY 189.A O ASP 193.A H 3.257 2.441 ALA 194.A N HIS 190.A O ALA 194.A H 2.849 2.129 LEU 195.A N ALA 191.A O LEU 195.A H 2.947 2.117 LYS 196.A N ALA 174.A O LYS 196.A H 2.656 1.888 LYS 196.A NZ ASP 175.A OD1 LYS 196.A HZ2 2.817 2.059 GLU 198.A N GLU 198.A OE1 GLU 198.A H 2.874 2.134 GLY 200.A N LYS 278.A O GLY 200.A H 3.013 2.242 ARG 201.A N ASP 175.A O ARG 201.A H 3.265 2.477 ARG 201.A NE MET 97.A O ARG 201.A HE 2.842 2.089 ARG 201.A NH1 THR 277.A OG1 ARG 201.A HH11 2.756 2.101 ARG 201.A NH2 MET 97.A O ARG 201.A HH21 3.030 2.350 SER 204.A N THR 274.A O SER 204.A H 2.786 2.018 PHE 205.A N LEU 179.A O PHE 205.A H 2.827 1.979 SER 206.A N TYR 272.A O SER 206.A H 3.045 2.271 CYS 208.A N GLN 211.A OE1 CYS 208.A H 2.973 2.169 GLU 210.A N GLU 210.A OE1 GLU 210.A H 2.737 1.978 VAL 212.A N ILE 209.A O VAL 212.A H 2.873 2.248 GLN 213.A N ILE 209.A O GLN 213.A H 2.905 2.092 ARG 214.A N GLU 210.A O ARG 214.A H 2.937 2.148 THR 215.A N GLN 211.A O THR 215.A H 3.055 2.267 THR 215.A OG1 GLN 211.A O THR 215.A HG1 2.564 1.825 CYS 216.A N VAL 212.A O CYS 216.A H 2.864 2.007 CYS 216.A SG VAL 212.A O CYS 216.A HG 3.306 2.432 GLN 217.A N GLN 213.A O GLN 217.A H 3.237 2.441 ALA 218.A N ARG 214.A O ALA 218.A H 2.959 2.295 ALA 218.A N THR 215.A O ALA 218.A H 3.180 2.509 LEU 219.A N THR 215.A O LEU 219.A H 2.817 2.030 ALA 220.A N CYS 216.A O ALA 220.A H 3.017 2.165 ALA 221.A N ALA 218.A O ALA 221.A H 3.152 2.548 ARG 222.A N ALA 218.A O ARG 222.A H 3.204 2.502 ARG 222.A N LEU 219.A O ARG 222.A H 3.214 2.554 ARG 222.A NH1 ARG 222.A O ARG 222.A HH11 3.546 2.785 ARG 222.A NH2 ASP 193.A OD1 ARG 222.A HH21 3.414 2.707 GLY 223.A N LEU 219.A O GLY 223.A H 3.104 2.326 PHE 224.A N LEU 219.A O PHE 224.A H 3.132 2.309 SER 225.A N THR 277.A O SER 225.A H 2.856 2.069 SER 228.A N PHE 275.A O SER 228.A H 3.373 2.563 THR 229.A OG1 THR 274.A OG1 THR 229.A HG1 3.072 2.340 LEU 230.A N LEU 273.A O LEU 230.A H 2.701 1.932 GLN 235.A NE2 VAL 236.A O GLN 235.A HE21 3.472 2.712 ASN 238.A N THR 261.A O ASN 238.A H 2.575 1.896 ASN 238.A ND2 VAL 239.A O ASN 238.A HD22 3.141 2.460 ARG 240.A N SER 259.A O ARG 240.A H 3.159 2.365 VAL 242.A N PHE 257.A O VAL 242.A H 3.173 2.317 GLY 250.A N ASP 248.A OD1 GLY 250.A H 3.281 2.450 PHE 257.A N VAL 242.A O PHE 257.A H 3.200 2.373 SER 259.A N ARG 240.A O SER 259.A H 3.186 2.490 THR 261.A N ASN 238.A O THR 261.A H 3.212 2.462 MET 263.A N VAL 236.A O MET 263.A H 2.978 2.277 HIS 269.A ND1 GLU 231.A OE1 HIS 269.A HD1 2.540 1.931 HIS 269.A NE2 PRO 207.A O HIS 269.A HE2 3.148 2.317 THR 270.A OG1 ASP 90.A OD1 THR 270.A HG1 3.237 2.427 TYR 272.A N SER 206.A O TYR 272.A H 2.848 2.079 LEU 273.A N LEU 230.A O LEU 273.A H 2.876 2.065 THR 274.A N SER 204.A O THR 274.A H 2.990 2.136 PHE 275.A N SER 228.A O PHE 275.A H 3.113 2.256 ALA 276.A N PHE 202.A O ALA 276.A H 3.241 2.474 THR 277.A N SER 225.A O THR 277.A H 2.738 1.979 THR 277.A OG1 GLU 226.A OE1 THR 277.A HG1 2.916 2.158 LYS 278.A N GLY 200.A O LYS 278.A H 2.855 2.018 LYS 278.A NZ TRP 192.A O LYS 278.A HZ2 2.618 1.967 LYS 278.A NZ LEU 195.A O LYS 278.A HZ3 3.217 2.450 LYS 278.A NZ LYS 196.A O LYS 278.A HZ3 3.204 2.627