Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5cvd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): HIS 8.A N GLU 12.A OE1 HIS 8.A H 2.734 1.884 THR 10.A N ASP 151.A OD2 THR 10.A H 2.770 1.932 GLU 12.A N MET 9.A O GLU 12.A H 3.091 2.260 VAL 13.A N THR 10.A O VAL 13.A H 2.991 2.166 ILE 14.A N THR 10.A O ILE 14.A H 2.902 2.128 GLN 19.A N ASP 16.A OD1 GLN 19.A H 3.045 2.224 PHE 20.A N ASP 16.A O PHE 20.A H 2.913 2.107 TYR 21.A N GLU 17.A O TYR 21.A H 3.085 2.265 SER 22.A N LYS 18.A O SER 22.A H 2.964 2.135 LYS 23.A N GLN 19.A O LYS 23.A H 2.853 2.002 LYS 23.A NZ ASP 186.A OD1 LYS 23.A HZ1 3.455 2.835 ALA 24.A N PHE 20.A O ALA 24.A H 3.305 2.490 LYS 25.A N TYR 21.A O LYS 25.A H 3.022 2.207 THR 26.A N SER 22.A O THR 26.A H 3.062 2.217 TYR 27.A N LYS 23.A O TYR 27.A H 2.901 2.089 TRP 28.A N ALA 24.A O TRP 28.A H 3.075 2.251 TRP 28.A NE1 HIS 148.A NE2 TRP 28.A HE1 2.980 2.141 LYS 29.A N LYS 25.A O LYS 29.A H 3.146 2.324 GLN 30.A N TYR 27.A O GLN 30.A H 3.090 2.274 GLN 30.A NE2 THR 26.A O GLN 30.A HE21 3.431 2.912 ILE 31.A N TRP 28.A O ILE 31.A H 3.154 2.297 THR 34.A N PRO 32.A O THR 34.A H 2.848 2.152 GLY 37.A N THR 34.A OG1 GLY 37.A H 2.943 2.136 MET 38.A N THR 34.A O MET 38.A H 2.867 2.046 LEU 39.A N VAL 35.A O LEU 39.A H 2.990 2.290 GLY 40.A N GLY 37.A O GLY 40.A H 3.340 2.484 GLY 41.A N ASP 36.A O GLY 41.A H 2.950 2.093 TYR 42.A N LEU 39.A O TYR 42.A H 2.981 2.201 TYR 42.A OH GLU 221.A OE2 TYR 42.A HH 2.634 1.799 GLY 43.A N ASP 36.A OD1 GLY 43.A H 2.854 2.012 ILE 45.A N TYR 42.A O ILE 45.A H 2.886 2.032 SER 46.A N GLY 43.A O SER 46.A H 3.119 2.268 ASP 49.A N ILE 45.A O ASP 49.A H 3.061 2.222 ILE 50.A N SER 46.A O ILE 50.A H 2.872 2.025 ASN 51.A N SER 47.A O ASN 51.A H 2.907 2.057 SER 52.A N ILE 48.A O SER 52.A H 3.269 2.439 SER 53.A N ASP 49.A O SER 53.A H 2.961 2.119 ARG 54.A N ILE 50.A O ARG 54.A H 2.884 2.081 ARG 54.A NH1 ASN 51.A OD1 ARG 54.A HH12 2.858 2.068 ARG 54.A NH2 ARG 86.A O ARG 54.A HH21 2.937 2.177 LYS 55.A N ASN 51.A O LYS 55.A H 3.232 2.407 PHE 56.A N SER 52.A O PHE 56.A H 2.950 2.118 LEU 57.A N SER 53.A O LEU 57.A H 2.861 2.044 GLN 58.A N ARG 54.A O GLN 58.A H 2.848 2.041 ARG 59.A NE PHE 56.A O ARG 59.A HE 2.929 2.120 ARG 59.A NH2 PHE 56.A O ARG 59.A HH21 3.078 2.334 PHE 60.A N LEU 57.A O PHE 60.A H 2.973 2.273 LEU 61.A N GLN 58.A O LEU 61.A H 3.048 2.444 ARG 62.A N GLN 58.A O ARG 62.A H 2.850 2.210 GLU 63.A N ARG 59.A O GLU 63.A H 3.091 2.327 LYS 67.A NZ ARG 62.A O LYS 67.A HZ2 2.735 1.852 LYS 67.A NZ GLY 64.A O LYS 67.A HZ3 3.100 2.378 THR 68.A N PHE 60.A O THR 68.A H 2.889 2.073 THR 68.A OG1 ASN 168.A O THR 68.A HG1 2.782 1.946 SER 71.A N.A ASP 138.A OD2 SER 71.A H.A 2.851 2.191 SER 71.A N.B ASP 138.A OD2 SER 71.A H.B 2.836 2.072 SER 71.A OG.A ASP 138.A OD2 SER 71.A HG.A 2.482 1.685 CYS 72.A N ASP 138.A OD2 CYS 72.A H.B 3.102 2.387 CYS 72.A SG.A SER 71.A OG.A CYS 72.A HG.A 3.376 2.302 ALA 73.A N GLU 94.A O ALA 73.A H 3.065 2.286 LEU 74.A N VAL 139.A O LEU 74.A H 2.910 2.109 ASP 75.A N ASP 96.A O ASP 75.A H 2.867 2.026 CYS 76.A N TRP 141.A O CYS 76.A H 2.787 1.934 ALA 78.A N VAL 98.A O ALA 78.A H 3.144 2.322 GLY 79.A N ASP 99.A OD2 GLY 79.A H 2.801 1.977 GLY 81.A N ALA 78.A O GLY 81.A H 3.038 2.241 ARG 82.A NH1 SER 46.A OG ARG 82.A HH11 3.014 2.176 ARG 82.A NH1 ASP 49.A OD2 ARG 82.A HH12 2.793 2.015 ARG 82.A NH2 ASP 49.A OD2 ARG 82.A HH22 2.901 2.159 THR 84.A OG1 ASP 75.A OD2 THR 84.A HG1 2.676 1.854 LYS 85.A N GLY 81.A O LYS 85.A H 2.763 1.939 LYS 85.A NZ TYR 111.A O LYS 85.A HZ2 2.984 2.247 ARG 86.A N ARG 82.A O ARG 86.A H 3.423 2.601 ARG 86.A NH1 SER 47.A OG ARG 86.A HH12 2.853 2.076 ARG 86.A NH2 SER 47.A OG ARG 86.A HH22 2.963 2.224 LEU 87.A N ILE 83.A O LEU 87.A H 2.816 2.000 LEU 88.A N ILE 83.A O LEU 88.A H 3.095 2.304 LEU 89.A N THR 84.A O LEU 89.A H 2.815 1.969 LEU 91.A N LEU 88.A O LEU 91.A H 2.933 2.114 PHE 92.A N LEU 88.A O PHE 92.A H 2.880 2.136 ARG 93.A N THR 70.A O ARG 93.A H 3.010 2.206 GLU 94.A N SER 71.A O.A GLU 94.A H 2.964 2.284 VAL 95.A N ARG 118.A O VAL 95.A H 3.194 2.375 ASP 96.A N ALA 73.A O ASP 96.A H 2.852 2.029 MET 97.A N ASN 121.A O MET 97.A H 2.886 2.057 VAL 98.A N ASP 75.A O VAL 98.A H 2.954 2.116 ASP 99.A N PHE 123.A O ASP 99.A H 3.012 2.210 THR 101.A N ASP 99.A OD1 THR 101.A H 2.869 2.020 PHE 104.A N THR 101.A O PHE 104.A H 3.030 2.314 VAL 106.A N GLU 102.A O VAL 106.A H 2.890 2.075 GLN 107.A N ASP 103.A O GLN 107.A H 2.968 2.140 ALA 108.A N PHE 104.A O ALA 108.A H 2.894 2.150 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 3.151 2.416 LYS 109.A NZ LEU 105.A O LYS 109.A HZ2 3.005 2.442 THR 110.A N GLN 107.A O THR 110.A H 2.937 2.312 TYR 111.A N GLN 107.A O TYR 111.A H 2.824 1.976 LEU 112.A N ALA 108.A O LEU 112.A H 2.820 1.989 GLY 113.A N THR 110.A O GLY 113.A H 3.166 2.407 GLY 116.A N LEU 112.A O GLY 116.A H 3.283 2.580 GLY 116.A N GLY 113.A O GLY 116.A H 3.015 2.320 LYS 117.A N GLU 114.A O LYS 117.A H 3.021 2.170 LYS 117.A NZ GLU 114.A OE2 LYS 117.A HZ2 3.094 2.265 ARG 118.A N GLU 115.A O ARG 118.A H 3.038 2.185 ARG 118.A NH1 LEU 89.A O ARG 118.A HH12 3.173 2.473 ARG 118.A NH1 PHE 92.A O ARG 118.A HH12 2.837 2.194 ARG 118.A NH1 ARG 93.A O ARG 118.A HH11 3.004 2.175 ARG 118.A NH2 LEU 89.A O ARG 118.A HH22 2.798 1.971 ARG 118.A NH2 GLU 115.A OE1 ARG 118.A HH21 2.799 1.944 VAL 119.A N GLY 116.A O VAL 119.A H 2.917 2.085 ARG 120.A N VAL 95.A O ARG 120.A H 2.902 2.119 ARG 120.A NE ASP 96.A OD1 ARG 120.A HE 3.011 2.201 ARG 120.A NH1 ASP 96.A OD1 ARG 120.A HH11 3.294 2.579 ARG 120.A NH1 ASP 96.A OD2 ARG 120.A HH11 2.479 1.651 ASN 121.A N ASP 96.A OD1 ASN 121.A H 2.949 2.115 ASN 121.A ND2 ASP 96.A OD2 ASN 121.A HD22 3.007 2.175 PHE 123.A N MET 97.A O PHE 123.A H 2.746 1.912 CYS 125.A N ASP 99.A O CYS 125.A H 3.041 2.279 CYS 125.A SG GLY 126.A O CYS 125.A HG 3.381 2.254 GLN 128.A N GLN 128.A OE1 GLN 128.A H 2.760 1.935 ASP 129.A N GLY 126.A O ASP 129.A H 2.944 2.116 PHE 130.A N LEU 127.A O PHE 130.A H 3.072 2.218 ASP 135.A N GLY 163.A O ASP 135.A H 3.270 2.476 SER 136.A N SER 164.A O SER 136.A H 2.750 1.890 SER 136.A OG PRO 134.A O SER 136.A HG 2.999 2.171 TYR 137.A N SER 164.A O TYR 137.A H 3.039 2.204 TYR 137.A OH ASP 96.A OD2 TYR 137.A HH 2.631 1.806 ASP 138.A N CYS 72.A O ASP 138.A H 2.790 2.029 ILE 140.A N ILE 170.A O ILE 140.A H 2.980 2.168 TRP 141.A N LEU 74.A O TRP 141.A H 2.802 1.949 TRP 141.A NE1 GLN 143.A OE1 TRP 141.A HE1 2.825 1.984 ILE 142.A N VAL 172.A O ILE 142.A H 2.779 1.955 GLN 143.A NE2 ASP 49.A OD1 GLN 143.A HE22 2.882 2.069 GLN 143.A NE2 ASP 49.A OD2 GLN 143.A HE22 3.362 2.725 TRP 144.A N LYS 174.A O TRP 144.A H 2.981 2.215 TRP 144.A NE1 ASN 176.A OD1 TRP 144.A HE1 2.881 2.138 VAL 145.A N ASP 175.A OD1 VAL 145.A H 2.918 2.193 ILE 146.A N ASP 175.A OD1 ILE 146.A H 2.952 2.113 HIS 148.A N VAL 145.A O HIS 148.A H 2.956 2.113 HIS 148.A ND1 SER 189.A O HIS 148.A HD1 3.058 2.463 LEU 149.A N ILE 146.A O LEU 149.A H.A 3.154 2.300 THR 150.A N TYR 21.A OH THR 150.A H 3.066 2.238 ASP 151.A N THR 10.A OG1 ASP 151.A H 2.967 2.134 GLN 152.A NE2 GLU 156.A OE2 GLN 152.A HE21 2.876 2.023 HIS 153.A N THR 150.A OG1 HIS 153.A H 3.127 2.278 HIS 153.A ND1 TYR 21.A OH HIS 153.A HD1 2.632 1.811 LEU 154.A N THR 150.A O LEU 154.A H 2.806 1.970 ALA 155.A N ASP 151.A O ALA 155.A H 2.970 2.120 GLU 156.A N GLN 152.A O GLU 156.A H 3.030 2.186 PHE 157.A N HIS 153.A O PHE 157.A H 2.812 1.975 LEU 158.A N LEU 154.A O LEU 158.A H 2.937 2.089 ARG 159.A N ALA 155.A O ARG 159.A H 3.042 2.240 ARG 159.A NH2 SER 204.A O ARG 159.A HH21 2.788 1.992 ARG 160.A N GLU 156.A O ARG 160.A H 2.933 2.105 ARG 160.A NE PHE 130.A O ARG 160.A HE 2.900 2.125 ARG 160.A NH2 PHE 130.A O ARG 160.A HH21 2.952 2.205 CYS 161.A N PHE 157.A O CYS 161.A H 2.844 2.024 LYS 162.A N LEU 158.A O LYS 162.A H 2.944 2.159 LYS 162.A NZ GLY 206.A O LYS 162.A HZ2 2.846 1.982 GLY 163.A N ARG 159.A O GLY 163.A H 3.354 2.561 SER 164.A N CYS 161.A O SER 164.A H 2.832 2.054 SER 164.A OG GLU 133.A O SER 164.A HG 2.703 1.892 LEU 165.A N LYS 162.A O LEU 165.A H 3.293 2.439 ARG 166.A N.A TYR 137.A O ARG 166.A H.A 2.858 2.027 ARG 166.A N.B TYR 137.A O ARG 166.A H.B 2.843 2.006 ARG 166.A NE.A ASP 135.A O ARG 166.A HE.A 3.124 2.267 ARG 166.A NH1.B ASP 138.A OD2 ARG 166.A HH11.B 3.070 2.284 ARG 166.A NH2.A SER 71.A OG.A ARG 166.A HH21.A 3.071 2.354 ASN 168.A ND2 LYS 67.A O ASN 168.A HD22 3.070 2.351 GLY 169.A N ARG 166.A O.A GLY 169.A H 2.746 1.956 GLY 169.A N ARG 166.A O.B GLY 169.A H 2.939 2.117 ILE 170.A N ASP 138.A O ILE 170.A H 2.951 2.180 ILE 171.A N LEU 230.A O ILE 171.A H 2.853 2.024 VAL 172.A N ILE 140.A O VAL 172.A H 2.801 1.974 ILE 173.A N PHE 228.A O ILE 173.A H 2.963 2.194 LYS 174.A N ILE 142.A O LYS 174.A H 2.897 2.081 LYS 174.A NZ ASP 49.A O LYS 174.A HZ3 3.237 2.689 LYS 174.A NZ ASP 49.A OD1 LYS 174.A HZ3 2.850 2.189 LYS 174.A NZ GLN 215.A OE1 LYS 174.A HZ1 2.693 1.846 ASP 175.A N TYR 226.A O ASP 175.A H 2.999 2.221 ASN 176.A N ASP 175.A OD2 ASN 176.A H 2.884 2.157 MET 177.A N HIS 224.A O MET 177.A H 2.845 2.021 ALA 178.A N ARG 193.A O ALA 178.A H 2.961 2.151 GLN 179.A NE2 GLN 179.A O GLN 179.A HE21 3.388 2.764 GLY 181.A N ASP 194.A OD2 GLY 181.A H 2.741 1.912 VAL 182.A N SER 7.A O VAL 182.A H 3.096 2.470 ILE 183.A N CYS 192.A O ILE 183.A H 2.860 2.025 ASP 185.A N SER 190.A O ASP 185.A H 2.800 1.955 VAL 187.A N ASP 185.A OD1 VAL 187.A H 2.836 2.060 ASP 188.A N ASP 185.A OD1 ASP 188.A H 3.161 2.358 SER 189.A N ASP 185.A O SER 189.A H 2.944 2.350 SER 189.A OG PHE 20.A O SER 189.A HG 2.738 2.214 SER 190.A N ASP 185.A O SER 190.A H 3.134 2.340 SER 190.A OG ASP 188.A OD1 SER 190.A HG 2.682 1.926 VAL 191.A N GLY 147.A O VAL 191.A H 2.802 1.988 CYS 192.A N ILE 183.A O CYS 192.A H 2.874 2.097 ARG 193.A NE ASP 151.A OD1 ARG 193.A HE 2.932 2.151 ARG 193.A NH1 ILE 146.A O ARG 193.A HH12 2.935 2.150 ARG 193.A NH2 LEU 149.A O ARG 193.A HH22 2.727 1.902 ARG 193.A NH2 ASP 151.A OD1 ARG 193.A HH21 2.907 2.134 ASP 194.A N GLY 181.A O ASP 194.A H 2.880 2.203 VAL 197.A N ASP 194.A OD1 VAL 197.A H 2.899 2.074 VAL 198.A N ASP 194.A O VAL 198.A H 3.149 2.309 ARG 199.A N LEU 195.A O ARG 199.A H 2.912 2.073 ARG 200.A N ASP 196.A O ARG 200.A H 2.961 2.153 ARG 200.A NE ASP 196.A OD2 ARG 200.A HE 2.908 2.082 ILE 201.A N VAL 197.A O ILE 201.A H 3.043 2.251 ILE 202.A N VAL 198.A O ILE 202.A H 2.909 2.066 CYS 203.A N ARG 199.A O CYS 203.A H.A 2.983 2.137 CYS 203.A SG.B ARG 199.A O CYS 203.A HG.B 3.460 2.572 SER 204.A N ARG 200.A O SER 204.A H.A 2.960 2.183 SER 204.A OG.A ILE 201.A O SER 204.A HG.A 2.820 2.026 SER 204.A OG.B ARG 200.A O SER 204.A HG.B 2.641 1.806 ALA 205.A N ILE 201.A O ALA 205.A H 3.123 2.464 ALA 205.A N ILE 202.A O ALA 205.A H 3.160 2.440 GLY 206.A N CYS 203.A O GLY 206.A H 2.954 2.115 LEU 207.A N ILE 202.A O LEU 207.A H 3.304 2.467 SER 208.A N ARG 231.A O SER 208.A H 2.712 1.865 LEU 210.A N ALA 229.A O LEU 210.A H 2.718 1.865 GLU 213.A N SER 227.A O GLU 213.A H 2.924 2.153 GLN 215.A N VAL 225.A O GLN 215.A H 2.781 1.938 GLN 215.A NE2 ILE 48.A O GLN 215.A HE22 3.605 3.004 GLN 215.A NE2 SER 52.A OG GLN 215.A HE22 2.899 2.107 GLN 215.A NE2 GLU 216.A O GLN 215.A HE21 2.986 2.163 GLU 221.A N GLU 221.A OE1 GLU 221.A H 2.746 1.970 ILE 222.A N PRO 219.A O ILE 222.A H 3.465 2.609 TYR 226.A N ASP 175.A O TYR 226.A H 3.040 2.231 SER 227.A N GLU 213.A O SER 227.A H 2.823 1.991 PHE 228.A N ILE 173.A O PHE 228.A H 2.765 1.949 ALA 229.A N ALA 211.A O ALA 229.A H 2.926 2.120 LEU 230.A N ILE 171.A O LEU 230.A H 2.767 2.032 ARG 231.A N SER 208.A O ARG 231.A H 3.142 2.379 ARG 231.A NE GLY 169.A O ARG 231.A HE 2.932 2.112 ARG 231.A NH2 ASN 168.A O ARG 231.A HH21 2.970 2.213