Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5d1r_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ILE 5.A N ARG 2.A O ILE 5.A H 2.639 2.006 GLU 6.A N ARG 2.A O GLU 6.A H 2.920 2.087 ALA 7.A N GLU 3.A O ALA 7.A H 3.218 2.450 ILE 9.A N ILE 5.A O ILE 9.A H 2.975 2.158 VAL 10.A N GLU 6.A O VAL 10.A H 2.778 1.935 GLU 11.A N ALA 7.A O GLU 11.A H 2.783 1.930 LEU 12.A N LYS 8.A O LEU 12.A H 2.917 2.088 GLY 13.A N ILE 9.A O GLY 13.A H 2.773 1.997 ARG 14.A N VAL 10.A O ARG 14.A H 2.791 1.964 ARG 14.A NE ASP 58.A OD2 ARG 14.A HE 2.877 2.257 ARG 14.A NH1 GLU 11.A OE1 ARG 14.A HH11 2.926 2.323 ARG 14.A NH2 ASP 58.A OD1 ARG 14.A HH21 3.122 2.423 ARG 14.A NH2 ASP 58.A OD2 ARG 14.A HH21 2.887 2.279 ARG 15.A N GLU 11.A O ARG 15.A H 3.157 2.349 GLN 16.A N LEU 12.A O GLN 16.A H 3.028 2.219 GLN 16.A NE2 SER 26.A O GLN 16.A HE22 3.043 2.184 LEU 17.A N GLY 13.A O LEU 17.A H 3.060 2.256 LEU 18.A N ARG 14.A O LEU 18.A H 3.162 2.337 ASP 19.A N ARG 15.A O ASP 19.A H 3.103 2.439 ASP 19.A N GLN 16.A O ASP 19.A H 3.126 2.441 HIS 20.A N GLN 16.A O HIS 20.A H 2.642 1.835 GLY 21.A N LEU 17.A O GLY 21.A H 2.719 1.958 LEU 25.A N ALA 22.A O LEU 25.A H 3.280 2.450 SER 26.A N GLN 16.A OE1 SER 26.A H 3.041 2.231 ALA 29.A N SER 26.A OG ALA 29.A H 2.905 2.054 ILE 30.A N SER 26.A O ILE 30.A H 3.013 2.173 ALA 31.A N LEU 27.A O ALA 31.A H 2.677 1.858 ARG 32.A N ARG 28.A O ARG 32.A H 3.041 2.278 ASN 33.A N ALA 29.A O ASN 33.A H 2.935 2.120 MET 36.A N ALA 31.A O MET 36.A H 2.827 2.071 ALA 40.A N VAL 37.A O ALA 40.A H 2.840 2.187 VAL 41.A N SER 38.A O VAL 41.A H 2.910 2.133 ARG 43.A N ALA 40.A O ARG 43.A H 3.304 2.525 TYR 44.A N VAL 41.A O TYR 44.A H 2.839 2.021 VAL 45.A N VAL 41.A O VAL 45.A H 2.890 2.036 ARG 48.A NH2 ASP 49.A OD1 ARG 48.A HH21 2.920 2.169 GLU 50.A N SER 47.A OG GLU 50.A H 2.980 2.159 LEU 51.A N SER 47.A O LEU 51.A H 2.925 2.103 LEU 52.A N ARG 48.A O LEU 52.A H 2.899 2.059 THR 53.A N ASP 49.A O THR 53.A H 2.884 2.072 THR 53.A OG1 ASP 49.A O THR 53.A HG1 3.170 2.445 LEU 54.A N GLU 50.A O LEU 54.A H 2.909 2.057 LEU 55.A N LEU 51.A O LEU 55.A H 2.948 2.137 LEU 56.A N LEU 52.A O LEU 56.A H 2.818 1.994 VAL 57.A N THR 53.A O VAL 57.A H 2.921 2.069 ASP 58.A N LEU 54.A O ASP 58.A H 2.951 2.098 ALA 59.A N LEU 55.A O ALA 59.A H 2.992 2.204 TYR 60.A N LEU 56.A O TYR 60.A H 2.877 2.023 SER 61.A N VAL 57.A O SER 61.A H 2.970 2.161 ASP 62.A N ASP 58.A O ASP 62.A H 2.932 2.110 LEU 63.A N ALA 59.A O LEU 63.A H 2.933 2.081 ALA 64.A N TYR 60.A O ALA 64.A H 2.998 2.167 ASP 65.A N SER 61.A O ASP 65.A H 2.858 2.058 THR 66.A N ASP 62.A O THR 66.A H 2.927 2.102 VAL 67.A N LEU 63.A O VAL 67.A H 3.017 2.196 ASP 68.A N ALA 64.A O ASP 68.A H 2.916 2.094 ARG 69.A N ASP 65.A O ARG 69.A H 3.008 2.218 ALA 70.A N THR 66.A O ALA 70.A H 3.116 2.299 ARG 71.A N VAL 67.A O ARG 71.A H 2.977 2.211 ARG 71.A NE ASP 82.A OD2 ARG 71.A HE 2.982 2.130 ARG 71.A NH2 ASP 82.A OD1 ARG 71.A HH21 2.989 2.135 ARG 71.A NH2 ASP 132.A OD2.B ARG 71.A HH22 3.017 2.172 ASP 72.A N ASP 68.A O ASP 72.A H 3.181 2.481 ASP 72.A N ARG 69.A O ASP 72.A H 3.186 2.549 ASP 73.A N ALA 70.A O ASP 73.A H 3.362 2.570 THR 74.A N ARG 71.A O THR 74.A H 3.193 2.393 THR 74.A OG1 ALA 70.A O THR 74.A HG1 3.143 2.354 TRP 79.A NE1 ASP 142.A OD1 TRP 79.A HE1 2.948 2.187 ASP 81.A N SER 78.A OG ASP 81.A H 3.289 2.443 ASP 82.A N SER 78.A O ASP 82.A H 3.085 2.271 VAL 83.A N TRP 79.A O VAL 83.A H 2.979 2.143 ILE 84.A N SER 80.A O ILE 84.A H 2.926 2.092 ALA 85.A N ASP 81.A O ALA 85.A H 2.851 2.037 ILE 86.A N ASP 82.A O ILE 86.A H 2.802 1.979 ALA 87.A N VAL 83.A O ALA 87.A H 3.062 2.211 ARG 88.A N ILE 84.A O ARG 88.A H 2.886 2.039 ARG 88.A NE ASP 209.A OD1 ARG 88.A HE 3.137 2.385 ARG 88.A NE ASP 209.A OD2 ARG 88.A HE 2.960 2.153 ARG 88.A NH2 ASP 209.A OD2 ARG 88.A HH21 3.398 2.726 ALA 89.A N ALA 85.A O ALA 89.A H 3.046 2.247 VAL 90.A N ILE 86.A O VAL 90.A H 2.968 2.160 ARG 91.A N ALA 87.A O ARG 91.A H 3.088 2.246 ARG 91.A NE GLU 191.A OE1 ARG 91.A HE 2.788 1.951 ARG 91.A NH2 GLU 191.A OE1 ARG 91.A HH21 3.438 2.797 ARG 91.A NH2 GLU 191.A OE2 ARG 91.A HH21 2.734 1.959 GLY 92.A N ARG 88.A O GLY 92.A H 2.886 2.039 TRP 93.A N ALA 89.A O TRP 93.A H 2.931 2.103 TRP 93.A NE1 ASP 62.A OD2.A TRP 93.A HE1 2.861 2.014 ALA 94.A N VAL 90.A O ALA 94.A H 2.967 2.171 VAL 95.A N ARG 91.A O VAL 95.A H 2.920 2.100 THR 96.A N GLY 92.A O THR 96.A H 3.100 2.298 ASN 97.A N ALA 94.A O ASN 97.A H 3.199 2.483 ASN 97.A ND2 TRP 93.A O ASN 97.A HD21 2.944 2.149 ARG 100.A N ASN 97.A O ARG 100.A H 3.063 2.472 ARG 100.A NH1 ASP 62.A OD2.A ARG 100.A HH12 3.458 2.690 ARG 100.A NH1 ASN 97.A OD1 ARG 100.A HH11 3.060 2.316 ARG 100.A NH2 ASP 62.A OD2.B ARG 100.A HH22 2.853 2.024 TRP 101.A N ASN 97.A O TRP 101.A H 2.854 2.014 TRP 101.A NE1 SER 189.A OG TRP 101.A HE1 2.998 2.155 ALA 102.A N PRO 98.A O ALA 102.A H 2.983 2.139 LEU 103.A N ALA 99.A O LEU 103.A H 3.101 2.342 LEU 104.A N ARG 100.A O LEU 104.A H 2.957 2.135 TYR 105.A N TRP 101.A O TYR 105.A H 2.771 1.922 GLY 106.A N ALA 102.A O GLY 106.A H 2.845 2.139 TYR 112.A N VAL 109.A O TYR 112.A H 3.050 2.202 ARG 118.A N PRO 115.A O ARG 118.A H 2.929 2.080 ARG 118.A NH1 GLU 50.A OE1 ARG 118.A HH12 3.353 2.685 ARG 118.A NH1 GLU 50.A OE2 ARG 118.A HH12 2.753 1.941 ARG 118.A NH2 GLU 50.A OE1 ARG 118.A HH22 2.815 1.970 THR 119.A N PRO 115.A O THR 119.A H 3.264 2.595 ALA 120.A N PRO 116.A O ALA 120.A H 2.949 2.119 ALA 123.A N THR 119.A O ALA 123.A H 3.066 2.319 THR 124.A N GLY 121.A O THR 124.A H 3.041 2.196 ARG 125.A N VAL 122.A O ARG 125.A H 3.239 2.382 ARG 125.A NH1 ASP 65.A OD1 ARG 125.A HH12 3.269 2.565 ARG 125.A NH2 ASP 65.A OD1 ARG 125.A HH22 2.863 2.026 ARG 125.A NH2 ASP 68.A OD2 ARG 125.A HH21 2.840 2.066 GLY 128.A N THR 124.A O GLY 128.A H 2.874 2.074 ALA 129.A N ARG 125.A O ALA 129.A H 3.015 2.235 PHE 130.A N VAL 126.A O PHE 130.A H 2.969 2.164 PHE 131.A N VAL 127.A O PHE 131.A H 3.058 2.249 ASP 132.A N GLY 128.A O ASP 132.A H 3.008 2.180 ALA 133.A N ALA 129.A O ALA 133.A H 2.951 2.112 ILE 134.A N PHE 130.A O ILE 134.A H 2.925 2.117 ALA 135.A N PHE 131.A O ALA 135.A H 2.865 2.081 ALA 136.A N ALA 133.A O ALA 136.A H 3.265 2.571 ILE 138.A N ILE 134.A O ILE 138.A H 3.072 2.307 ALA 139.A N ALA 135.A O ALA 139.A H 2.942 2.121 THR 140.A N ALA 136.A O THR 140.A H 3.103 2.285 THR 140.A OG1 GLY 137.A O THR 140.A HG1 3.396 2.711 GLY 141.A N ILE 138.A O GLY 141.A H 3.252 2.466 ILE 143.A N GLY 137.A O ILE 143.A H 3.099 2.266 THR 146.A N ASP 170.A OD1 THR 146.A H 2.772 1.939 THR 146.A OG1 ASP 148.A OD2 THR 146.A HG1 2.847 2.121 ASP 148.A N THR 146.A OG1 ASP 148.A H 3.271 2.515 ALA 150.A N ASP 171.A OD2 ALA 150.A H 2.851 2.036 MET 154.A N PRO 151.A O MET 154.A H 2.868 2.186 SER 156.A N GLN 152.A OE1 SER 156.A H 3.201 2.444 ASP 157.A N PRO 153.A O ASP 157.A H 2.978 2.140 PHE 158.A N MET 154.A O PHE 158.A H 2.762 1.963 GLU 159.A N SER 155.A O GLU 159.A H 3.143 2.392 ILE 161.A N ASP 157.A O ILE 161.A H 3.130 2.327 ARG 162.A N PHE 158.A O ARG 162.A H 2.958 2.107 GLN 163.A N GLU 159.A O GLN 163.A H 3.182 2.357 GLU 164.A N LYS 160.A O GLU 164.A H 3.022 2.211 PHE 165.A N ILE 161.A O PHE 165.A H 2.991 2.233 PHE 167.A N ARG 162.A O PHE 167.A H 2.871 2.055 ARG 172.A NH2.B ARG 144.A O ARG 172.A HH21.B 2.744 2.125 VAL 173.A N ASP 170.A OD2 VAL 173.A H 2.787 1.929 VAL 174.A N ASP 170.A O VAL 174.A H 3.297 2.485 THR 175.A N ASP 171.A O THR 175.A H 3.010 2.178 THR 175.A OG1 ASP 171.A O THR 175.A HG1 3.157 2.340 LYS 176.A N ARG 172.A O LYS 176.A H 3.223 2.441 LYS 176.A NZ VAL 218.A O LYS 176.A HZ1 2.919 2.105 LYS 176.A NZ GLU 221.A OE1 LYS 176.A HZ2 2.770 1.886 CYS 177.A N VAL 173.A O CYS 177.A H 2.877 2.182 CYS 177.A SG VAL 173.A O CYS 177.A HG 3.325 2.253 PHE 178.A N VAL 174.A O PHE 178.A H 2.915 2.112 LEU 179.A N THR 175.A O LEU 179.A H 2.965 2.182 LEU 180.A N LYS 176.A O LEU 180.A H 3.013 2.210 TRP 181.A N CYS 177.A O TRP 181.A H 3.064 2.227 ALA 182.A N PHE 178.A O ALA 182.A H 2.968 2.108 GLY 183.A N LEU 179.A O GLY 183.A H 2.835 2.005 VAL 184.A N LEU 180.A O VAL 184.A H 2.912 2.078 VAL 185.A N TRP 181.A O VAL 185.A H 2.864 2.004 GLY 186.A N ALA 182.A O GLY 186.A H 2.855 2.052 ALA 187.A N GLY 183.A O ALA 187.A H 2.876 2.032 ILE 188.A N VAL 184.A O ILE 188.A H 3.086 2.238 SER 189.A N VAL 185.A O SER 189.A H 2.881 2.051 LEU 190.A N GLY 186.A O LEU 190.A H 3.019 2.179 GLU 191.A N ALA 187.A O GLU 191.A H 3.245 2.459 VAL 192.A N ILE 188.A O VAL 192.A H 2.797 1.940 PHE 193.A N SER 189.A O PHE 193.A H 2.867 2.020 GLY 194.A N GLU 191.A O GLY 194.A H 3.201 2.457 GLN 195.A N LEU 190.A O GLN 195.A H 3.004 2.337 GLY 205.A N ASP 203.A OD1 GLY 205.A H 2.869 2.065 VAL 206.A N ASP 203.A O VAL 206.A H 3.167 2.362 PHE 208.A N PRO 204.A O PHE 208.A H 2.999 2.188 ASP 209.A N GLY 205.A O ASP 209.A H 3.055 2.236 ALA 210.A N VAL 206.A O ALA 210.A H 3.134 2.325 GLN 211.A N VAL 207.A O GLN 211.A H 2.915 2.085 THR 212.A N PHE 208.A O THR 212.A H 2.937 2.150 ARG 213.A N ASP 209.A O ARG 213.A H 2.994 2.155 LEU 214.A N ALA 210.A O LEU 214.A H 3.017 2.197 LEU 215.A N GLN 211.A O LEU 215.A H 2.997 2.246 VAL 216.A N THR 212.A O VAL 216.A H 2.908 2.087 ALA 217.A N ARG 213.A O ALA 217.A H 2.975 2.154 VAL 218.A N LEU 214.A O VAL 218.A H 2.941 2.199 LEU 219.A N LEU 215.A O LEU 219.A H 3.008 2.173 ALA 220.A N VAL 216.A O ALA 220.A H 2.964 2.183 GLU 221.A N VAL 218.A O GLU 221.A H 3.172 2.323 HIS 222.A N ALA 217.A O HIS 222.A H 2.935 2.125 HIS 223.A N GLU 221.A O no hydrogen 3.202 N/A HIS 224.A NE2 HIS 226.A NE2 no hydrogen 3.123 N/A