Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5dkm_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ILE 1.A N ASN 126.A O ILE 1.A H2 2.883 2.121 ILE 1.A N ASP 178.A OD2 ILE 1.A H1 2.675 1.859 VAL 2.A N ASP 173.A O VAL 2.A H 2.787 1.962 GLU 5.A N.A LYS 139.A O.A GLU 5.A H.A 2.908 2.143 GLU 5.A N.A LYS 139.A O.B GLU 5.A H.A 2.910 2.150 GLU 5.A N.A LYS 139.A O.C GLU 5.A H.A 2.936 2.173 GLU 5.A N.B LYS 139.A O.A GLU 5.A H.B 2.887 2.111 GLU 5.A N.B LYS 139.A O.B GLU 5.A H.B 2.888 2.117 GLU 5.A N.B LYS 139.A O.C GLU 5.A H.B 2.912 2.139 ALA 7.A N LEU 137.A O ALA 7.A H 2.936 2.108 VAL 9.A N THR 59.A OG1 VAL 9.A H 2.938 2.088 GLN 10.A N GLN 10.A OE1 GLN 10.A H 2.790 1.974 ASP 11.A N ASN 8.A O ASP 11.A H 2.941 2.133 HIS 12.A N VAL 9.A O HIS 12.A H 2.956 2.162 THR 15.A N HIS 12.A O THR 15.A H 2.958 2.109 THR 15.A OG1 HIS 12.A O THR 15.A HG1 3.049 2.380 VAL 16.A N GLY 29.A O VAL 16.A H 2.986 2.132 ALA 17.A N VAL 55.A O ALA 17.A H 2.968 2.123 LEU 18.A N CYS 27.A O LEU 18.A H 2.873 2.028 VAL 19.A N.A ASN 53.A O VAL 19.A H.A 2.921 2.075 VAL 19.A N.B ASN 53.A O VAL 19.A H.B 2.940 2.113 THR 20.A N GLN 24.A O THR 20.A H 2.924 2.130 GLY 23.A N.A THR 20.A O GLY 23.A H.A 2.864 2.034 GLY 23.A N.B THR 20.A O GLY 23.A H.B 2.893 2.101 GLN 24.A N THR 20.A OG1 GLN 24.A H 3.135 2.336 GLN 24.A N ASP 22.A OD1.B GLN 24.A H 2.919 2.128 GLN 24.A NE2 GLN 25.A O GLN 24.A HE21 2.909 2.053 GLN 24.A NE2 GLN 133.A OE1.A GLN 24.A HE22 3.051 2.211 GLN 25.A NE2 CYS 27.A O GLN 25.A HE21 3.098 2.280 GLN 25.A NE2 GLY 177.A O GLN 25.A HE22 2.979 2.179 PHE 26.A N LEU 18.A O PHE 26.A H 2.933 2.099 CYS 27.A SG PHE 26.A O no hydrogen 3.180 N/A CYS 27.A SG SER 179.A OG.B no hydrogen 3.055 N/A GLY 28.A N SER 179.A O.A GLY 28.A H 2.775 1.935 GLY 28.A N SER 179.A O.B GLY 28.A H 2.803 1.966 GLY 29.A N VAL 16.A O GLY 29.A H 2.901 2.242 THR 30.A N VAL 38.A O THR 30.A H 2.895 2.116 LEU 31.A N PHE 14.A O LEU 31.A H 2.805 1.981 ALA 32.A N LYS 36.A O ALA 32.A H 2.915 2.081 ALA 33.A N LYS 36.A O ALA 33.A H 3.409 2.622 LYS 36.A N ALA 33.A O LYS 36.A H 3.196 2.340 LYS 36.A NZ THR 93.A OG1 LYS 36.A HZ3 2.825 1.945 LYS 36.A NZ GLN 221.A O LYS 36.A HZ2 2.926 2.216 VAL 37.A N LEU 92.A O VAL 37.A H 2.897 2.075 VAL 38.A N THR 30.A O VAL 38.A H 2.809 2.002 THR 39.A N SER 90.A O THR 39.A H 2.903 2.062 THR 39.A OG1 GLY 28.A O THR 39.A HG1 2.775 2.111 HIS 42.A N.A ASP 88.A OD1 HIS 42.A H.A 2.827 2.032 HIS 42.A N.B ASP 88.A OD1 HIS 42.A H.B 2.854 2.100 HIS 42.A ND1.B ASP 88.A OD2 HIS 42.A HD1.B 2.572 1.864 HIS 42.A NE2.B SER 179.A OG.A no hydrogen 2.366 N/A CYS 43.A N ALA 40.A O CYS 43.A H 3.071 2.338 CYS 43.A SG SER 179.A O.A no hydrogen 3.413 N/A CYS 43.A SG SER 179.A O.B no hydrogen 3.375 N/A CYS 43.A SG SER 179.A OG.B no hydrogen 3.497 N/A THR 44.A N ALA 41.A O THR 44.A H 3.018 2.205 THR 44.A OG1 SER 90.A OG THR 44.A HG1 2.794 1.981 VAL 45.A N ALA 41.A O VAL 45.A H 2.806 2.022 SER 47.A N.B THR 44.A O SER 47.A H.B 3.116 2.280 GLN 48.A N.A ASP 51.A OD2 GLN 48.A H.A 2.841 2.072 GLN 48.A N.B ASP 51.A OD2 GLN 48.A H.B 2.998 2.150 GLN 48.A NE2.A ASP 51.A OD1 GLN 48.A HE21.A 2.988 2.168 ASP 51.A N GLN 48.A O.A ASP 51.A H 2.946 2.114 ASP 51.A N GLN 48.A O.B ASP 51.A H 2.878 2.036 ILE 52.A N PRO 49.A O ILE 52.A H 3.164 2.313 ASN 53.A N VAL 19.A O.A ASN 53.A H 2.889 2.036 ASN 53.A N VAL 19.A O.B ASN 53.A H 2.876 2.032 VAL 54.A N SER 69.A O VAL 54.A H 2.947 2.108 VAL 55.A N ALA 17.A O VAL 55.A H 2.819 1.978 SER 56.A N THR 67.A O SER 56.A H 2.980 2.170 ARG 58.A NE GLU 65.A O.A ARG 58.A HE 2.807 1.958 ARG 58.A NE GLU 65.A O.B ARG 58.A HE 2.757 1.905 ARG 58.A NH2 GLU 65.A O.A ARG 58.A HH21 3.252 2.561 ARG 58.A NH2 GLU 65.A O.B ARG 58.A HH21 3.269 2.594 THR 59.A OG1 GLN 10.A OE1 THR 59.A HG1 3.350 2.831 MET 61.A N.A ASP 135.A O MET 61.A H.A 2.830 1.993 MET 61.A N.B ASP 135.A O MET 61.A H.B 2.848 2.020 SER 62.A N ASP 135.A OD1 SER 62.A H 2.768 2.073 SER 62.A OG ASP 135.A OD1 SER 62.A HG 3.301 2.683 SER 63.A N VAL 60.A O SER 63.A H 3.018 2.230 SER 63.A OG VAL 60.A O SER 63.A HG 2.737 1.904 THR 67.A N SER 56.A O THR 67.A H 2.855 2.029 SER 69.A N VAL 54.A O SER 69.A H 2.745 1.888 LYS 70.A N GLU 95.A OE1.C LYS 70.A H 2.911 2.053 THR 72.A N.A THR 93.A O THR 72.A H.A 2.808 1.978 THR 72.A N.B THR 93.A O THR 72.A H.B 2.836 2.018 TRP 75.A N VAL 91.A O TRP 75.A H 2.921 2.061 HIS 77.A N VAL 89.A O HIS 77.A H 3.116 2.285 GLU 79.A N HIS 77.A ND1 GLU 79.A H 2.995 2.138 TYR 80.A N HIS 77.A O TYR 80.A H 2.996 2.143 ALA 84.A N ASP 82.A OD2 ALA 84.A H 3.118 2.320 LYS 85.A N ASP 82.A O LYS 85.A H 2.871 2.068 GLY 86.A N ALA 83.A O GLY 86.A H 3.136 2.288 PHE 87.A N TYR 214.A OH PHE 87.A H 2.965 2.228 VAL 89.A N PHE 87.A O VAL 89.A H 2.870 2.149 SER 90.A N THR 39.A O SER 90.A H 2.920 2.216 SER 90.A OG TRP 75.A O SER 90.A HG 2.693 1.939 VAL 91.A N TRP 75.A O VAL 91.A H 2.920 2.148 LEU 92.A N VAL 37.A O LEU 92.A H 2.818 1.995 THR 93.A N ASN 73.A O.A THR 93.A H 3.020 2.183 THR 93.A N ASN 73.A O.B THR 93.A H 3.002 2.163 LEU 94.A N ASN 35.A O LEU 94.A H 2.869 2.035 GLU 95.A N.B LYS 70.A O no hydrogen 2.899 N/A GLU 95.A N.C LYS 70.A O no hydrogen 2.882 N/A GLU 95.A O.C LEU 94.A O no hydrogen 3.505 N/A GLU 95.A OE1.B GLU 95.A OE2.B no hydrogen 2.196 N/A GLU 95.A OE1.C GLU 95.A OE2.C no hydrogen 2.207 N/A GLU 95.A OE2.B GLU 95.A OE1.B no hydrogen 2.196 N/A GLU 95.A OE2.C GLU 95.A OE1.C no hydrogen 2.207 N/A VAL 98.A N PRO 34.A O VAL 98.A H 2.941 2.116 ILE 103.A N.A LEU 31.A O ILE 103.A H.A 3.085 2.288 ILE 103.A N.B LEU 31.A O ILE 103.A H.B 2.884 2.115 ALA 106.A N LEU 189.A O ALA 106.A H 2.984 2.129 ASP 110.A N LYS 107.A O ASP 110.A H 3.040 2.226 GLY 112.A N ASP 110.A OD2 GLY 112.A H 2.827 1.997 TYR 113.A N ASP 110.A O TYR 113.A H 3.258 2.399 TYR 113.A OH ILE 190.A O TYR 113.A HH 2.672 1.890 ALA 114.A N ALA 111.A O ALA 114.A H 3.164 2.317 ASP 116.A N VAL 144.A O.A ASP 116.A H 2.688 1.838 ASP 116.A N VAL 144.A O.B ASP 116.A H 2.798 1.949 THR 117.A N ALA 114.A O THR 117.A H 3.189 2.371 THR 117.A OG1 ALA 114.A O THR 117.A HG1 2.668 1.950 ALA 119.A N VAL 142.A O ALA 119.A H 2.816 1.962 THR 120.A N VAL 184.A O.A THR 120.A H 2.904 2.060 THR 120.A N VAL 184.A O.B THR 120.A H 2.905 2.067 ILE 121.A N ALA 140.A O ILE 121.A H 2.928 2.088 GLY 123.A N GLN 138.A O GLY 123.A H 3.007 2.214 TRP 124.A NE1 THR 59.A O TRP 124.A HE1 2.964 2.115 GLY 125.A N ASP 178.A OD1 GLY 125.A H 2.799 1.999 ASN 126.A N GLN 176.A O ASN 126.A H 2.777 1.924 THR 127.A N GLN 132.A O THR 127.A H 3.027 2.247 GLY 131.A N SER 128.A O GLY 131.A H 2.877 2.124 GLN 133.A NE2.B GLN 25.A O GLN 133.A HE21.B 2.910 2.182 GLN 133.A NE2.B GLN 25.A OE1 GLN 133.A HE22.B 2.777 2.052 ALA 134.A N TRP 124.A O ALA 134.A H 3.010 2.241 HIS 136.A ND1 LEU 137.A O HIS 136.A HD1 2.930 2.076 LEU 137.A N THR 59.A O LEU 137.A H 2.969 2.165 GLN 138.A N GLY 123.A O GLN 138.A H 2.975 2.144 GLN 138.A NE2 ASP 6.A OD1 GLN 138.A HE22 2.857 2.057 GLN 138.A NE2 HIS 136.A O GLN 138.A HE21 2.994 2.139 LYS 139.A N.A GLU 5.A O.A LYS 139.A H.A 2.882 2.071 LYS 139.A N.A GLU 5.A O.B LYS 139.A H.A 2.887 2.069 LYS 139.A N.B GLU 5.A O.A LYS 139.A H.B 2.863 2.047 LYS 139.A N.B GLU 5.A O.B LYS 139.A H.B 2.867 2.048 LYS 139.A N.C GLU 5.A O.A LYS 139.A H.C 2.870 2.058 LYS 139.A N.C GLU 5.A O.B LYS 139.A H.C 2.875 2.059 LYS 139.A NZ.A ASP 6.A O LYS 139.A HZ2.A 2.899 2.276 ALA 140.A N ILE 121.A O ALA 140.A H 2.918 2.114 VAL 142.A N ALA 119.A O VAL 142.A H 2.884 2.076 VAL 144.A N.A THR 117.A O VAL 144.A H.A 2.831 2.005 VAL 144.A N.B THR 117.A O VAL 144.A H.B 2.835 2.010 ASN 145.A N CYS 164.A O.A ASN 145.A H 2.818 1.962 ASN 145.A N CYS 164.A O.B ASN 145.A H 2.923 2.079 ASN 145.A ND2 PRO 143.A O ASN 145.A HD22 3.015 2.456 ASN 145.A ND2 GLY 166.A O ASN 145.A HD21 2.935 2.100 THR 149.A OG1 SER 146.A OG THR 149.A HG1 2.921 2.222 CYS 150.A N.A SER 146.A O CYS 150.A H.A 2.942 2.110 CYS 150.A N.B SER 146.A O CYS 150.A H.B 2.994 2.196 CYS 150.A SG.A ASN 145.A O no hydrogen 3.935 N/A CYS 150.A SG.A SER 146.A O no hydrogen 3.228 N/A LYS 151.A N ASP 147.A O LYS 151.A H 2.929 2.106 LYS 151.A NZ GLY 155.A O LYS 151.A HZ3 2.777 1.944 GLN 152.A N.A ASP 148.A O GLN 152.A H.A 3.060 2.275 GLN 152.A N.B ASP 148.A O GLN 152.A H.B 3.047 2.246 ALA 153.A N THR 149.A O ALA 153.A H 3.233 2.501 ALA 153.A N CYS 150.A O.A ALA 153.A H 3.065 2.438 ALA 153.A N CYS 150.A O.B ALA 153.A H 3.166 2.571 TYR 154.A N CYS 150.A O.A TYR 154.A H 2.908 2.189 TYR 154.A N CYS 150.A O.B TYR 154.A H 2.850 2.118 GLU 156.A N GLU 156.A OE1 GLU 156.A H 2.825 2.028 TYR 157.A N TYR 154.A O TYR 157.A H 2.983 2.145 TYR 157.A OH ASP 147.A OD1 TYR 157.A HH 2.684 1.883 ASP 160.A N THR 158.A OG1 ASP 160.A H 3.009 2.177 ALA 161.A N THR 158.A O ALA 161.A H 3.090 2.239 MET 162.A N.A THR 158.A O MET 162.A H.A 2.920 2.289 MET 162.A N.B THR 158.A O MET 162.A H.B 2.952 2.393 VAL 163.A N TYR 208.A O VAL 163.A H 2.893 2.085 ALA 165.A N GLY 206.A O ALA 165.A H 2.970 2.192 GLY 166.A N PRO 143.A O GLY 166.A H 2.992 2.209 GLU 169.A N GLU 169.A OE1 GLU 169.A H 2.697 1.885 GLY 170.A N VAL 167.A O GLY 170.A H 2.889 2.049 GLY 171.A N ALA 200.A O GLY 171.A H 2.848 2.060 ASP 173.A N VAL 2.A O ASP 173.A H 3.058 2.286 CYS 175.A N ASP 178.A OD2 CYS 175.A H 2.890 2.145 CYS 175.A SG SER 128.A O no hydrogen 3.805 N/A CYS 175.A SG GLN 176.A OE1 no hydrogen 3.497 N/A ASP 178.A N CYS 175.A O ASP 178.A H 2.887 2.061 SER 179.A OG.A SER 194.A O SER 179.A HG.A 3.272 2.826 GLY 180.A N THR 193.A O GLY 180.A H 2.882 2.040 GLY 181.A N ASP 178.A O GLY 181.A H 3.029 2.186 MET 183.A N.A GLY 191.A O MET 183.A H.A 2.939 2.148 MET 183.A N.B GLY 191.A O MET 183.A H.B 2.977 2.221 VAL 184.A N.A THR 120.A O VAL 184.A H.A 2.905 2.134 VAL 184.A N.B THR 120.A O VAL 184.A H.B 2.861 2.062 VAL 185.A N LYS 188.A O.A VAL 185.A H 3.060 2.269 VAL 185.A N LYS 188.A O.B VAL 185.A H 3.066 2.281 LYS 188.A N.A VAL 185.A O LYS 188.A H.A 3.074 2.241 LYS 188.A N.B VAL 185.A O LYS 188.A H.B 3.054 2.229 LYS 188.A NZ.A ASP 110.A OD1 LYS 188.A HZ2.A 2.663 1.946 LYS 188.A NZ.B ASP 110.A OD1 LYS 188.A HZ1.B 2.910 2.068 LEU 189.A N GLU 104.A O.A LEU 189.A H 2.937 2.106 LEU 189.A N GLU 104.A O.B LEU 189.A H 2.836 2.009 ILE 190.A N MET 183.A O.A ILE 190.A H 2.865 2.087 ILE 190.A N MET 183.A O.B ILE 190.A H 2.916 2.129 GLY 191.A N MET 183.A O.A GLY 191.A H 3.103 2.316 GLY 191.A N MET 183.A O.B GLY 191.A H 3.124 2.352 VAL 192.A N ALA 209.A O VAL 192.A H 3.074 2.306 THR 193.A N GLY 181.A O THR 193.A H 2.987 2.159 SER 194.A N VAL 207.A O SER 194.A H 3.029 2.329 SER 194.A OG ASP 88.A OD2 SER 194.A HG 2.612 1.778 TRP 195.A N VAL 207.A O TRP 195.A H 2.994 2.181 CYS 199.A N GLU 129.A OE1.A CYS 199.A H 2.839 2.034 CYS 199.A SG GLN 176.A OE1 no hydrogen 3.225 N/A ALA 200.A N ASP 173.A OD2 ALA 200.A H 2.810 1.951 ARG 201.A NE GLU 129.A OE1.A ARG 201.A HE 2.900 2.061 ARG 201.A NE GLU 129.A OE2.B ARG 201.A HE 3.210 2.594 ARG 201.A NH1 GLU 197.A OE2 ARG 201.A HH11 2.745 2.029 ARG 201.A NH2 GLU 129.A OE2.A ARG 201.A HH21 2.849 2.001 ARG 201.A NH2 GLU 129.A OE2.B ARG 201.A HH21 2.688 1.917 GLY 203.A N PRO 168.A O GLY 203.A H 2.910 2.205 LYS 204.A N ARG 201.A O LYS 204.A H 3.166 2.362 LYS 204.A NZ ALA 153.A O LYS 204.A HZ3 2.725 1.963 GLY 206.A N ALA 165.A O GLY 206.A H 2.950 2.295 VAL 207.A N TRP 195.A O VAL 207.A H 2.819 2.003 TYR 208.A N VAL 163.A O TYR 208.A H 2.819 2.021 ALA 209.A N VAL 192.A O ALA 209.A H 2.803 2.061 ARG 210.A N.A ALA 161.A O ARG 210.A H.A 2.959 2.115 ARG 210.A N.B ALA 161.A O ARG 210.A H.B 2.955 2.133 ARG 210.A NE.A MET 162.A O.A ARG 210.A HE.A 2.786 2.007 ARG 210.A NE.A MET 162.A O.B ARG 210.A HE.A 2.764 1.988 ARG 210.A NH1.B MET 162.A O.A ARG 210.A HH11.B 3.001 2.184 ARG 210.A NH1.B MET 162.A O.B ARG 210.A HH11.B 2.975 2.158 ARG 210.A NH2.A MET 162.A O.A ARG 210.A HH21.A 2.885 2.157 ARG 210.A NH2.A MET 162.A O.B ARG 210.A HH21.A 2.861 2.137 VAL 211.A N ILE 190.A O VAL 211.A H 3.135 2.318 GLY 212.A N TYR 113.A OH GLY 212.A H 2.891 2.061 ALA 213.A N ARG 210.A O.A ALA 213.A H 3.035 2.360 ALA 213.A N ARG 210.A O.B ALA 213.A H 2.966 2.297 TYR 214.A N VAL 211.A O TYR 214.A H 2.878 2.112 LEU 218.A N TYR 214.A O LEU 218.A H 2.930 2.081 MET 219.A N TYR 215.A O MET 219.A H 2.877 2.034 GLU 220.A N ASP 216.A O GLU 220.A H 3.006 2.211 GLN 221.A N VAL 217.A O.B GLN 221.A H 3.379 2.588 ILE 222.A N LEU 218.A O ILE 222.A H 2.892 2.063 ASN 223.A N MET 219.A O ASN 223.A H 2.885 2.066 ALA 224.A N GLN 221.A O ALA 224.A H 3.281 2.439 ALA 226.A N ASN 223.A O ALA 226.A H 2.914 2.062 SER 228.A OG ALA 229.A O SER 228.A HG 2.843 2.022