Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5dpk_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): PHE 7.A N PRO 3.A O PHE 7.A H 3.136 2.303 GLN 8.A N ALA 4.A O GLN 8.A H 2.707 1.932 ARG 9.A N ARG 5.A O ARG 9.A H 3.189 2.519 ARG 9.A NH2 ASP 13.A OD1 ARG 9.A HH21 2.199 1.361 ASP 10.A N GLU 6.A O ASP 10.A H 3.227 2.395 LEU 11.A N PHE 7.A O LEU 11.A H 3.205 2.533 LEU 12.A N GLN 8.A O LEU 12.A H 3.397 2.555 ASP 13.A N ARG 9.A O ASP 13.A H 3.012 2.188 PHE 15.A N LEU 11.A O PHE 15.A H 2.830 2.033 ALA 16.A N LEU 12.A O ALA 16.A H 2.923 2.070 ARG 17.A N ASP 13.A O ARG 17.A H 2.901 2.177 GLU 18.A N TRP 14.A O GLU 18.A H 2.647 1.987 GLU 18.A N PHE 15.A O GLU 18.A H 2.940 2.281 ARG 19.A N PHE 15.A O ARG 19.A H 2.664 1.961 ARG 20.A N GLU 186.A OE2 ARG 20.A H 3.191 2.401 ARG 20.A NE GLU 186.A OE2 ARG 20.A HE 2.621 1.835 ARG 20.A NH2 GLU 186.A OE1 ARG 20.A HH21 2.804 1.974 ARG 25.A N LEU 22.A O ARG 25.A H 3.062 2.223 ARG 25.A NE ARG 20.A O ARG 25.A HE 3.269 2.552 ARG 25.A NH1 GLU 186.A OE1 ARG 25.A HH12 3.257 2.474 ARG 25.A NH2 ARG 20.A O ARG 25.A HH21 2.964 2.173 ARG 25.A NH2 GLU 186.A OE1 ARG 25.A HH22 3.280 2.503 ARG 25.A NH2 GLU 186.A OE2 ARG 25.A HH22 2.961 2.182 ARG 28.A NH1 LEU 128.A O ARG 28.A HH11 2.435 1.768 ASP 29.A N ASP 27.A OD1 ASP 29.A H 3.160 2.318 TYR 31.A N ASP 29.A OD1 TYR 31.A H 3.307 2.528 TYR 31.A OH PHE 59.A O TYR 31.A HH 2.687 1.878 VAL 33.A N ASP 29.A O VAL 33.A H 3.000 2.140 TRP 34.A N PRO 30.A O TRP 34.A H 2.824 2.013 VAL 35.A N TYR 31.A O VAL 35.A H 2.950 2.114 SER 36.A N LYS 32.A O SER 36.A H 2.961 2.115 SER 36.A OG LYS 32.A O SER 36.A HG 3.464 2.915 SER 36.A OG VAL 33.A O SER 36.A HG 2.756 1.986 GLU 37.A N VAL 33.A O GLU 37.A H 2.911 2.155 VAL 38.A N TRP 34.A O VAL 38.A H 3.103 2.318 MET 39.A N VAL 35.A O MET 39.A H 3.015 2.159 LEU 40.A N SER 36.A O LEU 40.A H 2.976 2.241 GLN 41.A N VAL 38.A O GLN 41.A H 3.129 2.342 THR 43.A N LEU 40.A O THR 43.A H 3.020 2.222 THR 43.A OG1 GLN 41.A O THR 43.A HG1 2.925 2.103 VAL 48.A N ARG 44.A O VAL 48.A H 3.160 2.418 VAL 48.A N VAL 45.A O VAL 48.A H 2.965 2.371 ILE 49.A N VAL 45.A O ILE 49.A H 3.084 2.347 TYR 51.A OH GLU 78.A O TYR 51.A HH 3.085 2.271 PHE 52.A N VAL 48.A O PHE 52.A H 2.838 2.006 GLU 53.A N ILE 49.A O GLU 53.A H 3.310 2.559 GLU 53.A N PRO 50.A O GLU 53.A H 3.218 2.587 GLN 54.A N PRO 50.A O GLN 54.A H 3.023 2.171 PHE 55.A N TYR 51.A O PHE 55.A H 2.793 1.968 ILE 56.A N PHE 52.A O ILE 56.A H 2.981 2.139 ASP 57.A N GLU 53.A O ASP 57.A H 2.975 2.183 ARG 58.A N GLN 54.A O ARG 58.A H 3.025 2.250 ARG 58.A NH2 GLU 72.A OE1 ARG 58.A HH21 2.712 1.967 PHE 59.A N PHE 55.A O PHE 59.A H 2.751 2.013 GLU 63.A N GLU 63.A OE2 GLU 63.A H 2.364 1.694 ALA 64.A N THR 61.A OG1 ALA 64.A H 2.863 2.030 LEU 65.A N THR 61.A O LEU 65.A H 3.244 2.437 ALA 66.A N LEU 62.A O ALA 66.A H 2.979 2.158 ASP 67.A N GLU 63.A O ASP 67.A H 2.741 1.922 ALA 68.A N LEU 65.A O ALA 68.A H 3.423 2.583 GLU 72.A N ASP 69.A O GLU 72.A H 3.138 2.458 VAL 73.A N ASP 69.A O VAL 73.A H 3.315 2.487 LEU 74.A N GLU 70.A O LEU 74.A H 2.959 2.126 LYS 75.A N ASP 71.A O LYS 75.A H 2.870 2.084 LYS 75.A NZ GLU 78.A OE1 LYS 75.A HZ2 2.705 1.970 LYS 75.A NZ TYR 331.A O LYS 75.A HZ3 3.131 2.467 ALA 76.A N GLU 72.A O ALA 76.A H 3.207 2.424 TRP 77.A N LEU 74.A O TRP 77.A H 3.092 2.395 TRP 77.A NE1 GLY 81.A O TRP 77.A HE1 3.243 2.489 GLU 78.A N LYS 75.A O GLU 78.A H 3.127 2.290 GLY 79.A N TYR 83.A OH GLY 79.A H 3.151 2.377 LEU 80.A N TRP 77.A O LEU 80.A H 3.024 2.168 ARG 85.A N TYR 82.A O ARG 85.A H 3.133 2.304 ARG 85.A NE TYR 82.A O ARG 85.A HE 3.148 2.340 ARG 85.A NH1 VAL 38.A O ARG 85.A HH11 2.758 2.078 ARG 85.A NH1 MET 39.A O ARG 85.A HH12 2.860 2.097 ARG 85.A NH2 GLY 81.A O ARG 85.A HH21 2.797 1.941 VAL 86.A N TYR 83.A O VAL 86.A H 3.216 2.507 ARG 87.A N TYR 83.A O ARG 87.A H 3.377 2.551 ASN 88.A N SER 84.A O ASN 88.A H 2.886 2.064 LEU 89.A N ARG 85.A O LEU 89.A H 2.980 2.191 HIS 90.A N VAL 86.A O HIS 90.A H 2.834 1.978 HIS 90.A NE2 ALA 68.A O HIS 90.A HE2 2.919 2.296 ALA 91.A N ARG 87.A O ALA 91.A H 3.097 2.268 ALA 92.A N ASN 88.A O ALA 92.A H 2.701 1.855 VAL 93.A N LEU 89.A O VAL 93.A H 2.791 2.036 LYS 94.A N HIS 90.A O LYS 94.A H 2.906 2.047 LYS 94.A NZ ALA 66.A O LYS 94.A HZ3 2.572 1.774 GLU 95.A N ALA 91.A O GLU 95.A H 2.879 2.116 VAL 96.A N ALA 92.A O VAL 96.A H 3.273 2.483 LYS 97.A N VAL 93.A O LYS 97.A H 3.143 2.390 THR 98.A N LYS 94.A O THR 98.A H 3.029 2.185 ARG 99.A N GLU 95.A O ARG 99.A H 2.701 1.866 ARG 99.A NH1 TYR 100.A OH ARG 99.A HH11 3.494 2.707 GLY 101.A N LYS 97.A O GLY 101.A H 2.760 2.038 GLY 102.A N VAL 96.A O GLY 102.A H 2.591 1.760 GLU 110.A N ASP 107.A OD2 GLU 110.A H 2.961 2.196 PHE 111.A N ASP 107.A O PHE 111.A H 2.775 2.004 SER 112.A N PRO 108.A O SER 112.A H 2.879 2.023 SER 112.A OG VAL 117.A O no hydrogen 3.530 N/A LEU 114.A N PHE 111.A O LEU 114.A H 3.148 2.290 VAL 117.A N LEU 114.A O VAL 117.A H 3.259 2.425 TYR 120.A OH GLU 37.A OE1 TYR 120.A HH 2.406 1.680 VAL 122.A N GLY 118.A O VAL 122.A H 3.146 2.289 GLY 123.A N PRO 119.A O GLY 123.A H 3.261 2.426 ALA 124.A N TYR 120.A O ALA 124.A H 2.795 1.986 VAL 125.A N THR 121.A O VAL 125.A H 2.836 1.977 LEU 126.A N VAL 122.A O LEU 126.A H 3.155 2.325 SER 127.A N GLY 123.A O SER 127.A H 3.089 2.297 SER 127.A OG GLY 123.A O SER 127.A HG 2.470 1.879 SER 127.A OG ALA 124.A O SER 127.A HG 3.430 2.726 LEU 128.A N ALA 124.A O LEU 128.A H 3.289 2.528 ALA 129.A N VAL 125.A O ALA 129.A H 2.807 1.955 TYR 130.A N LEU 126.A O TYR 130.A H 3.113 2.391 TYR 130.A OH VAL 104.A O TYR 130.A HH 2.903 2.281 VAL 132.A N LEU 126.A O VAL 132.A H 3.078 2.392 GLU 134.A N VAL 132.A O GLU 134.A H 2.869 2.176 ASN 140.A ND2 ASP 138.A OD2 ASN 140.A HD22 3.049 2.315 VAL 141.A N ASP 138.A OD1 VAL 141.A H 2.832 1.983 MET 142.A N ASP 138.A O MET 142.A H 2.963 2.109 ARG 143.A N GLY 139.A O ARG 143.A H 3.080 2.294 ARG 143.A NE CYS 192.A O ARG 143.A HE 2.799 1.954 ARG 143.A NH2 ASN 140.A OD1 ARG 143.A HH22 2.685 1.952 ARG 143.A NH2 GLY 188.A O ARG 143.A HH21 2.814 2.018 VAL 144.A N ASN 140.A O VAL 144.A H 2.959 2.195 LEU 145.A N VAL 141.A O LEU 145.A H 2.843 1.992 SER 146.A N MET 142.A O SER 146.A H 3.175 2.443 SER 146.A OG ARG 143.A O SER 146.A HG 3.037 2.220 ARG 147.A N VAL 144.A O ARG 147.A H 3.045 2.367 ARG 147.A NE ALA 216.A O ARG 147.A HE 3.059 2.358 ARG 147.A NH1 THR 193.A O ARG 147.A HH12 3.071 2.266 ARG 147.A NH2 THR 193.A O ARG 147.A HH22 3.246 2.498 ARG 147.A NH2 PRO 194.A O ARG 147.A HH22 3.349 2.729 ARG 147.A NH2 ALA 216.A O ARG 147.A HH21 3.311 2.739 ARG 147.A NH2 LEU 219.A O ARG 147.A HH21 3.101 2.392 LEU 148.A N VAL 144.A O LEU 148.A H 2.980 2.153 PHE 149.A N LEU 145.A O PHE 149.A H 3.134 2.278 ILE 155.A N VAL 221.A O ILE 155.A H 2.951 2.117 ALA 156.A N ASP 154.A OD1 ALA 156.A H 2.644 1.863 THR 160.A OG1 ASP 154.A O THR 160.A HG1 2.723 2.034 ARG 161.A NE GLU 165.A OE1 ARG 161.A HE 3.121 2.314 ARG 161.A NH2 GLU 165.A OE1 ARG 161.A HH21 3.249 2.499 ARG 161.A NH2 GLU 165.A OE2 ARG 161.A HH21 3.233 2.491 LYS 162.A N PRO 158.A O LYS 162.A H 2.986 2.232 ARG 163.A N SER 159.A O ARG 163.A H 2.994 2.240 ARG 163.A NH2 ASP 153.A OD2 ARG 163.A HH22 2.425 1.585 PHE 164.A N THR 160.A O PHE 164.A H 2.932 2.101 GLU 165.A N ARG 161.A O GLU 165.A H 2.909 2.143 GLN 166.A N LYS 162.A O GLN 166.A H 3.152 2.407 ILE 167.A N ARG 163.A O ILE 167.A H 2.937 2.109 VAL 168.A N PHE 164.A O VAL 168.A H 2.922 2.146 ARG 169.A N GLU 165.A O ARG 169.A H 3.247 2.394 ARG 169.A NH1 GLU 134.A OE2 ARG 169.A HH12 3.095 2.255 GLU 170.A N GLN 166.A O GLU 170.A H 3.021 2.316 GLU 170.A N ILE 167.A O GLU 170.A H 3.238 2.608 ILE 171.A N ILE 167.A O ILE 171.A H 3.182 2.365 MET 172.A N VAL 168.A O MET 172.A H 2.788 2.159 TYR 174.A OH ARG 169.A O TYR 174.A HH 2.346 1.544 GLU 175.A N GLU 175.A OE2 GLU 175.A H 2.272 1.607 PHE 180.A N ASN 176.A O PHE 180.A H 3.009 2.224 ASN 181.A N PRO 177.A O ASN 181.A H 2.649 1.832 ASN 181.A ND2 SER 127.A OG ASN 181.A HD22 3.135 2.305 ASN 181.A ND2 GLU 134.A O ASN 181.A HD21 3.026 2.311 GLU 182.A N GLY 178.A O GLU 182.A H 3.030 2.172 ALA 183.A N ALA 179.A O ALA 183.A H 3.058 2.288 LEU 184.A N PHE 180.A O LEU 184.A H 3.158 2.364 ILE 185.A N ASN 181.A O ILE 185.A H 3.036 2.194 GLU 186.A N GLU 182.A O GLU 186.A H 2.705 1.852 LEU 187.A N ALA 183.A O LEU 187.A H 2.760 1.933 GLY 188.A N LEU 184.A O GLY 188.A H 3.027 2.175 ALA 189.A N ILE 185.A O ALA 189.A H 2.934 2.238 ALA 189.A N GLU 186.A O ALA 189.A H 2.984 2.391 LEU 190.A N GLU 186.A O LEU 190.A H 2.794 1.996 VAL 191.A N LEU 187.A O VAL 191.A H 2.816 2.002 CYS 192.A N LEU 187.A O CYS 192.A H 2.977 2.280 THR 193.A N VAL 191.A O THR 193.A H 2.622 1.990 THR 193.A OG1 ARG 195.A O THR 193.A HG1 2.774 2.138 SER 198.A N VAL 191.A O SER 198.A H 3.444 2.618 CYS 199.A SG PRO 197.A O no hydrogen 3.646 N/A CYS 202.A N SER 198.A O CYS 202.A H 2.619 1.926 TYR 207.A N VAL 204.A O TYR 207.A H 3.236 2.536 CYS 208.A N GLN 205.A O CYS 208.A H 3.360 2.517 CYS 208.A SG ARG 147.A O no hydrogen 3.553 N/A GLN 209.A N LEU 148.A O GLN 209.A H 3.323 2.479 ALA 210.A N ARG 147.A O ALA 210.A H 3.175 2.388 ALA 212.A N CYS 208.A O ALA 212.A H 3.065 2.208 GLU 213.A N GLN 209.A O GLU 213.A H 2.894 2.175 GLY 214.A N PHE 211.A O GLY 214.A H 2.772 2.160 VAL 215.A N ALA 210.A O VAL 215.A H 2.771 1.953 GLU 218.A N VAL 215.A O GLU 218.A H 2.902 2.105 LEU 219.A N ALA 216.A O LEU 219.A H 3.012 2.168 VAL 231.A N VAL 300.A O VAL 231.A H 2.851 2.156 LEU 233.A N GLN 302.A O LEU 233.A H 2.654 1.817 ALA 234.A N CYS 265.A O.A ALA 234.A H 3.164 2.374 ALA 234.A N CYS 265.A O.B ALA 234.A H 3.195 2.409 VAL 235.A N THR 304.A O VAL 235.A H 2.816 1.968 ALA 236.A N PRO 263.A O ALA 236.A H 2.926 2.110 VAL 237.A N PHE 306.A O VAL 237.A H 2.995 2.172 ALA 239.A N GLY 308.A O ALA 239.A H 3.220 2.405 ASP 240.A N ARG 244.A O ASP 240.A H 3.009 2.256 GLU 242.A N ASP 240.A OD1 GLU 242.A H 2.713 2.068 GLY 243.A N ASP 240.A O GLY 243.A H 3.185 2.358 ARG 244.A N ASP 240.A OD1 ARG 244.A H 3.049 2.399 ARG 244.A NE ASP 240.A OD2 ARG 244.A HE 2.910 2.132 ARG 244.A NH2 ASP 240.A OD2 ARG 244.A HH21 3.331 2.682 VAL 245.A N ALA 323.A O VAL 245.A H 2.787 1.931 LEU 246.A N LEU 238.A O LEU 246.A H 3.128 2.352 ILE 247.A N ARG 321.A O ILE 247.A H 3.000 2.164 ARG 248.A N GLU 261.A O ARG 248.A H 3.027 2.209 ARG 248.A NE GLU 261.A OE2 ARG 248.A HE 2.926 2.202 ARG 248.A NH2 GLU 261.A OE2 ARG 248.A HH21 3.392 2.815 ARG 248.A NH2 SER 264.A O ARG 248.A HH22 2.547 1.952 LYS 249.A N PRO 319.A O LYS 249.A H 3.309 2.508 LYS 249.A NZ GLU 70.A OE1 LYS 249.A HZ1 3.478 2.660 ARG 250.A N LEU 259.A O ARG 250.A H 2.855 2.032 ARG 250.A NE LEU 255.A O ARG 250.A HE 3.020 2.243 ARG 250.A NH1 GLU 261.A OE1 ARG 250.A HH11 2.827 1.997 ARG 250.A NH2 LEU 255.A O ARG 250.A HH21 3.155 2.434 ASP 251.A N ASP 251.A OD1 ASP 251.A H 2.483 1.768 THR 253.A OG1 ASP 251.A OD2 no hydrogen 3.203 N/A ASN 258.A N ASP 251.A O ASN 258.A H 2.990 2.234 LEU 259.A N LEU 256.A O LEU 259.A H 3.283 2.437 TRP 260.A N ALA 332.A O TRP 260.A H 2.932 2.102 GLU 261.A N ARG 248.A O GLU 261.A H 3.004 2.326 PHE 262.A N HIS 337.A ND1 PHE 262.A H 3.067 2.276 CYS 265.A N.A ALA 234.A O CYS 265.A H.A 3.059 2.324 CYS 265.A N.B ALA 234.A O CYS 265.A H.B 3.063 2.331 THR 267.A N PRO 232.A O THR 267.A H 2.987 2.133 LEU 276.A N GLY 272.A O LEU 276.A H 2.829 1.974 GLU 277.A N LYS 273.A O GLU 277.A H 2.790 1.952 GLN 278.A N GLU 274.A O GLN 278.A H 3.021 2.185 MET 279.A N LYS 275.A O MET 279.A H 3.036 2.196 VAL 280.A N LEU 276.A O VAL 280.A H 3.165 2.338 GLY 281.A N GLU 277.A O GLY 281.A H 3.119 2.319 GLU 282.A N GLN 278.A O GLU 282.A H 3.140 2.383 THR 286.A N PRO 307.A O THR 286.A H 3.172 2.339 ILE 289.A N VAL 305.A O ILE 289.A H 3.226 2.456 SER 291.A OG LEU 303.A O SER 291.A HG 3.142 2.365 HIS 294.A N TRP 301.A O HIS 294.A H 2.762 2.008 PHE 296.A N LEU 299.A O PHE 296.A H 2.721 1.923 SER 297.A OG TYR 82.A OH SER 297.A HG 3.192 2.515 VAL 300.A N LYS 229.A O VAL 300.A H 2.883 2.076 TRP 301.A N HIS 294.A O TRP 301.A H 2.775 1.920 GLN 302.A N VAL 231.A O GLN 302.A H 2.966 2.131 GLN 302.A NE2 GLN 230.A OE1 GLN 302.A HE21 2.965 2.478 GLN 302.A NE2 GLU 293.A OE2 GLN 302.A HE21 3.521 2.767 LEU 303.A N PHE 292.A O LEU 303.A H 2.788 1.996 VAL 305.A N VAL 290.A O VAL 305.A H 3.211 2.367 PHE 306.A N VAL 235.A O PHE 306.A H 2.698 1.904 GLY 308.A N VAL 237.A O GLY 308.A H 3.000 2.395 TYR 320.A N GLU 317.A O TYR 320.A H 2.882 2.162 ARG 321.A N ILE 247.A O ARG 321.A H 2.732 2.003 ARG 321.A NE TYR 331.A OH ARG 321.A HE 3.250 2.410 ALA 323.A N VAL 245.A O ALA 323.A H 2.810 1.964 GLU 327.A N PRO 324.A O GLU 327.A H 2.857 2.052 LEU 328.A N GLU 325.A O LEU 328.A H 3.329 2.498 ALA 330.A N GLU 327.A O ALA 330.A H 3.121 2.290 TYR 331.A N LEU 328.A O TYR 331.A H 2.792 1.938 PHE 333.A N GLU 78.A OE2 PHE 333.A H 2.991 2.207 GLN 338.A N PRO 334.A O GLN 338.A H 2.961 2.179 GLN 338.A NE2 PHE 333.A O GLN 338.A HE21 2.748 1.924 ARG 339.A N VAL 335.A O ARG 339.A H 3.166 2.384 ARG 339.A NE GLU 343.A OE1 ARG 339.A HE 3.229 2.477 ARG 339.A NH2 GLU 343.A OE1 ARG 339.A HH21 3.414 2.724 VAL 340.A N SER 336.A O VAL 340.A H 3.093 2.268 TRP 341.A N HIS 337.A O TRP 341.A H 3.209 2.399 ARG 342.A N GLN 338.A O ARG 342.A H 3.202 2.384 GLU 343.A N ARG 339.A O GLU 343.A H 2.704 1.871 TYR 344.A N VAL 340.A O TYR 344.A H 3.024 2.207 LYS 345.A N TRP 341.A O LYS 345.A H 2.844 2.051 GLU 346.A N ARG 342.A O GLU 346.A H 2.991 2.205 TRP 347.A N GLU 343.A O TRP 347.A H 2.907 2.079 ALA 348.A N TYR 344.A O ALA 348.A H 3.126 2.326 SER 349.A OG GLU 346.A O SER 349.A HG 2.708 1.917