Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5dq1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.866 2.004 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.817 1.991 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.951 2.148 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.975 2.153 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.667 1.928 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.970 2.133 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.931 2.115 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.530 2.946 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.871 2.196 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.880 2.089 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.876 2.077 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.046 2.269 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.309 2.453 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.031 2.173 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.666 1.869 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.875 2.050 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.906 2.108 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.823 2.036 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.960 2.147 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.100 2.279 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.876 2.069 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.831 1.994 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.033 2.234 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.748 2.099 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.788 1.950 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.023 2.176 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.944 2.133 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.826 1.966 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.900 2.061 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.862 2.024 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.901 2.067 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.914 2.113 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.772 2.224 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.883 2.070 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.322 2.468 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.643 2.013 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.616 1.820 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.958 2.242 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.835 2.059 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.974 2.146 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.914 2.102 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.695 1.879 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.972 2.229 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.999 2.191 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.101 2.259 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.722 2.029 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.988 2.154 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.948 2.109 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.853 2.021 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.111 2.261 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.787 1.985 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 2.977 2.162 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 3.064 2.271 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.955 2.189 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.959 2.108 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.704 1.932 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.825 1.991 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.053 2.235 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.929 2.083 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.802 2.000 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.365 2.736 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.880 2.065 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.579 1.840 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.276 2.436 LYS 68.A N.A THR 91.A O LYS 68.A H.A 2.974 2.168 LYS 68.A N.B THR 91.A O LYS 68.A H.B 2.968 2.166 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.852 2.002 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.093 2.246 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.876 2.052 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.052 2.270 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.172 2.390 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.359 2.597 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.989 2.154 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.835 1.997 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.752 1.913 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 3.178 2.322 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 3.005 2.221 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.151 2.370 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 2.958 2.185 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.014 2.225 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.099 2.463 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.915 2.056 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.705 1.894 THR 91.A N LYS 68.A O.A THR 91.A H 2.829 2.029 THR 91.A N LYS 68.A O.B THR 91.A H 2.820 2.026 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 3.018 2.237 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.724 1.982 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.885 2.045 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.789 1.968 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.865 2.076 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.971 2.116 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.726 1.896 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.858 2.003 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.995 2.354 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.105 2.277 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.211 2.433 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.731 1.892 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.893 2.055 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.832 2.068 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.941 2.104 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.783 1.995 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.132 2.295 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.941 2.119 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.863 2.093 SER 113.A OG SER 84.A O SER 113.A HG 3.295 2.607 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 2.983 2.278 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.338 2.510 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.689 1.881 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.890 2.083 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.093 2.287 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.128 2.306 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.756 1.920 ILE 122.A N ASP 119.A O ILE 122.A H 3.459 2.610 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.899 2.053 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.932 2.233 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.998 2.172 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.038 2.354 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.832 2.013 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.933 2.080 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.043 2.191 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 2.993 2.134 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 3.014 2.162 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 3.002 2.145 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.037 2.284 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.092 2.324 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.730 1.908 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.940 2.109 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.824 1.986 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.894 2.226 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.950 2.107 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.954 2.100 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.984 2.136 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.076 2.252 ASP 146.A N.A THR 143.A OG1 ASP 146.A H.A 2.998 2.155 ASP 146.A N.B THR 143.A OG1 ASP 146.A H.B 3.023 2.172 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.974 2.147 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.840 2.006 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.998 2.237 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.925 2.203 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H 3.175 2.409 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.957 2.165 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.819 2.136 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.023 2.208 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.773 1.976 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.849 2.043 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.909 2.152 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.279 2.607 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.843 1.999 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.835 2.012 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.888 2.108 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.910 2.095 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.093 2.315 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.808 1.957 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.842 2.010 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.937 2.130 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.393 2.836 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.644 1.806 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.043 2.201 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.937 2.132 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.920 2.081 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.821 2.068 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.824 2.034 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.226 2.372 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 2.866 2.140 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.840 1.997 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.858 2.022 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.872 2.038 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.846 2.085 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.724 1.906 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.243 2.458 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.781 1.950 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.106 2.350 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.925 2.148 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.809 1.961 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.851 2.023 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.809 1.955 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.077 2.299 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.959 2.127 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.921 2.096 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 3.008 2.265 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 3.005 2.178 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.035 2.181 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.878 2.063 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.751 2.210 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.906 2.140 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.264 2.409 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.652 1.891 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.065 2.206 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.865 2.026 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.983 2.187 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.072 2.242 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.910 2.075 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.093 2.279 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.056 2.286 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.730 1.908 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.042 2.195 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.864 2.030 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.985 2.184 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.030 2.189 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.017 2.172 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.037 2.184 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.053 2.246 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.828 1.970 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.008 2.170 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.798 2.015 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.130 2.366 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.810 1.984 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.910 2.075 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.846 2.081 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.865 2.016 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 4.009 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.909 2.059 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.935 2.130 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.868 2.015 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.921 2.134 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.894 2.093 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.982 2.146 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.843 2.070 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 2.992 2.259 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.832 2.074 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.932 2.084 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.760 1.914 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H 2.988 2.208 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.959 2.122 ASP 279.A N ASP 276.A O ASP 279.A H 3.275 2.423 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 3.018 2.220 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.852 2.037 ILE 283.A N SER 289.A O.A ILE 283.A H 2.829 2.053 ILE 283.A N SER 289.A O.B ILE 283.A H 2.810 2.038 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.959 2.109 SER 289.A N.A SER 287.A OG SER 289.A H.A 3.035 2.180 SER 289.A N.B SER 287.A OG SER 289.A H.B 3.029 2.175 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.781 1.932 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.894 2.082 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.058 2.216 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.781 2.132 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.948 2.120 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 2.996 2.173 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.866 2.045 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.807 1.994 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.597 1.806 ALA 298.A N SER 296.A OG ALA 298.A H 3.011 2.159 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H 2.870 2.035 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O.A ASN 303.A HD22 2.895 2.073 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O.B ASN 303.A HD22 2.781 1.949 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.879 2.081 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.784 2.011 GLY 306.A N LEU 224.A O GLY 306.A H 3.237 2.626 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.789 1.969 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.075 2.327 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.965 2.299 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.968 2.118 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H 2.821 1.974 LYS 311.A NZ ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2 2.799 1.997 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.132 2.327 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.944 2.124 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.818 1.993 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.033 2.207 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.785 1.953 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.821 1.982 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.985 2.176 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.909 2.070 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.747 1.987 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.099 2.332 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.112 2.363 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.111 2.263 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.848 2.028 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.920 2.099 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.905 2.099 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.781 1.940 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.868 2.131 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.163 2.562 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.792 1.925