Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5ekd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 3.A NE SER 35.A OG ARG 3.A HE 2.806 1.934 ARG 3.A NH1 TYR 138.A O ARG 3.A HH11 2.749 1.930 ARG 3.A NH2 SER 35.A OG ARG 3.A HH21 3.351 2.695 VAL 4.A N SER 35.A O VAL 4.A H 3.114 2.289 PHE 5.A N HIS 142.A O PHE 5.A H 3.145 2.356 SER 6.A N LEU 37.A O SER 6.A H 3.190 2.436 ILE 8.A N SER 39.A O ILE 8.A H 3.074 2.300 HIS 15.A N ASN 18.A OD1 HIS 15.A H 3.135 2.182 LEU 16.A N VAL 205.A O LEU 16.A H 2.968 2.306 TYR 19.A N HIS 15.A O TYR 19.A H 2.966 2.142 LEU 20.A N LEU 16.A O LEU 20.A H 2.937 2.090 GLY 21.A N GLY 17.A O GLY 21.A H 2.807 2.007 ALA 22.A N ASN 18.A O ALA 22.A H 2.959 2.190 ILE 23.A N ASN 18.A O ILE 23.A H 3.054 2.239 GLU 24.A N TYR 19.A O GLU 24.A H 2.961 2.120 TRP 26.A N ALA 22.A O TRP 26.A H 3.116 2.252 VAL 27.A N ILE 23.A O VAL 27.A H 3.184 2.387 ARG 28.A N GLU 24.A O ARG 28.A H 3.276 2.436 ARG 28.A NH1 GLU 32.A OE2 ARG 28.A HH11 2.852 2.031 LEU 29.A N SER 25.A O LEU 29.A H 2.823 2.018 GLN 30.A N TRP 26.A O GLN 30.A H 3.229 2.565 GLN 30.A NE2 GLY 70.A O GLN 30.A HE22 2.813 1.986 ASP 31.A N ARG 28.A O ASP 31.A H 3.228 2.425 GLU 32.A N LEU 29.A O GLU 32.A H 3.109 2.451 TYR 33.A N LEU 29.A O TYR 33.A H 3.048 2.243 LEU 37.A N VAL 4.A O LEU 37.A H 2.909 2.101 TYR 38.A N ILE 77.A O TYR 38.A H 2.808 1.975 SER 39.A N SER 6.A O SER 39.A H 2.986 2.176 ILE 40.A N PHE 79.A O ILE 40.A H 2.929 2.116 VAL 41.A N ILE 8.A O VAL 41.A H 3.084 2.290 ASP 42.A N ILE 40.A O ASP 42.A H 3.111 2.461 LEU 43.A N GLN 81.A OE1 LEU 43.A H 3.001 2.319 HIS 44.A N VAL 41.A O HIS 44.A H 3.160 2.461 HIS 44.A NE2 ASP 134.A OD2 HIS 44.A HE2 2.816 1.835 SER 45.A N ASP 42.A O SER 45.A H 3.137 2.525 THR 47.A N HIS 44.A O THR 47.A H 3.191 2.362 THR 47.A OG1 HIS 44.A O THR 47.A HG1 2.826 2.036 VAL 54.A N ASP 51.A OD1 VAL 54.A H 2.990 2.190 LEU 55.A N ASP 51.A O LEU 55.A H 2.974 2.155 ARG 56.A N PRO 52.A O ARG 56.A H 2.994 2.191 GLN 57.A N ALA 53.A O GLN 57.A H 3.138 2.302 GLN 57.A NE2 ASP 61.A OD1 GLN 57.A HE21 3.395 2.780 SER 58.A N VAL 54.A O SER 58.A H 2.888 2.072 SER 58.A OG VAL 54.A O SER 58.A HG 2.846 2.072 ILE 59.A N LEU 55.A O ILE 59.A H 3.142 2.384 ASP 61.A N GLN 57.A O ASP 61.A H 2.928 2.103 MET 62.A N SER 58.A O MET 62.A H 2.900 2.071 THR 63.A N ILE 59.A O THR 63.A H 3.142 2.419 THR 63.A N LEU 60.A O THR 63.A H 3.154 2.569 THR 63.A OG1 ILE 59.A O THR 63.A HG1 2.868 2.070 ALA 64.A N LEU 60.A O ALA 64.A H 3.125 2.352 VAL 65.A N ASP 61.A O VAL 65.A H 2.902 2.065 LEU 66.A N MET 62.A O LEU 66.A H 2.978 2.162 LEU 67.A N THR 63.A O LEU 67.A H 3.161 2.336 ALA 68.A N ALA 64.A O ALA 68.A H 2.874 2.046 CYS 69.A N VAL 65.A O CYS 69.A H 2.912 2.130 CYS 69.A SG VAL 65.A O CYS 69.A HG 3.371 2.456 GLY 70.A N LEU 67.A O GLY 70.A H 2.969 2.152 ILE 71.A N LEU 66.A O ILE 71.A H 3.131 2.299 ASN 72.A N GLN 30.A OE1 ASN 72.A H 2.976 2.140 GLU 74.A N ASN 72.A OD1 GLU 74.A H 2.658 1.870 LYS 75.A N ASN 72.A O LYS 75.A H 2.924 2.157 LYS 75.A NZ ASP 31.A OD1 LYS 75.A HZ3 2.572 1.656 SER 76.A N ASN 72.A O SER 76.A H 2.842 2.012 SER 76.A OG GLN 30.A OE1 SER 76.A HG 3.185 2.514 ILE 77.A N VAL 36.A O ILE 77.A H 2.946 2.110 PHE 79.A N TYR 38.A O PHE 79.A H 3.087 2.292 GLN 80.A N SER 306.A OG GLN 80.A H 3.095 2.254 GLN 80.A NE2 ASP 42.A OD2 GLN 80.A HE21 2.975 2.145 GLN 81.A N ILE 40.A O GLN 81.A H 3.159 2.324 GLN 81.A NE2 ASP 134.A OD1 GLN 81.A HE21 2.951 2.215 SER 82.A N ASP 42.A OD1 SER 82.A H 2.964 2.227 GLN 83.A N GLN 80.A O GLN 83.A H 3.032 2.215 VAL 84.A N GLN 81.A O VAL 84.A H 3.093 2.263 GLU 86.A N GLU 86.A OE1 GLU 86.A H 2.751 2.047 HIS 87.A N VAL 84.A O HIS 87.A H 3.363 2.371 HIS 87.A ND1 ASP 134.A OD1 HIS 87.A HD1 2.747 1.739 LEU 90.A N GLU 86.A O LEU 90.A H 3.055 2.218 SER 91.A N HIS 87.A O SER 91.A H 3.035 2.282 TRP 92.A N THR 88.A O TRP 92.A H 3.012 2.091 ILE 93.A N GLN 89.A O ILE 93.A H 3.355 2.547 LEU 94.A N LEU 90.A O LEU 94.A H 3.035 2.208 SER 95.A N SER 91.A O SER 95.A H 2.865 2.075 SER 95.A OG TRP 92.A O SER 95.A HG 2.898 2.204 CYS 96.A N TRP 92.A O CYS 96.A H 3.315 2.619 CYS 96.A N ILE 93.A O CYS 96.A H 3.297 2.604 MET 97.A N LEU 94.A O MET 97.A H 2.949 2.140 ARG 102.A N ARG 99.A O ARG 102.A H 3.122 2.440 ARG 102.A NH2 ASP 158.A OD2 ARG 102.A HH21 2.829 2.105 GLN 104.A N LEU 100.A O GLN 104.A H 3.007 2.202 HIS 105.A N PRO 101.A O HIS 105.A H 2.949 2.132 LEU 106.A N LEU 103.A O LEU 106.A H 3.362 2.558 HIS 107.A N GLN 151.A OE1 HIS 107.A H 2.891 1.900 GLN 108.A NE2 ASP 148.A O GLN 108.A HE21 3.665 2.881 TRP 109.A N LEU 106.A O TRP 109.A H 3.028 2.166 LYS 110.A N LEU 106.A O LYS 110.A H 2.740 1.896 ALA 111.A N HIS 107.A O ALA 111.A H 2.930 2.114 LYS 112.A N TRP 109.A O LYS 112.A H 3.071 2.256 THR 113.A N GLN 116.A OE1 THR 113.A H 2.981 2.163 GLN 116.A N THR 113.A OG1 GLN 116.A H 3.072 2.261 LYS 117.A N THR 113.A O LYS 117.A H 2.869 2.044 LYS 117.A NZ LYS 110.A O LYS 117.A HZ1 3.152 2.254 HIS 118.A N THR 114.A O HIS 118.A H 2.960 2.016 ASP 119.A N LYS 115.A O ASP 119.A H 2.888 2.077 GLY 120.A N GLN 116.A O GLY 120.A H 2.859 2.147 THR 121.A OG1 THR 47.A O THR 121.A HG1 3.034 2.391 LEU 124.A N THR 121.A OG1 LEU 124.A H 3.035 2.232 LEU 125.A N THR 121.A O LEU 125.A H 3.142 2.337 THR 126.A N VAL 122.A O THR 126.A H 2.956 2.225 THR 126.A OG1 VAL 122.A O THR 126.A HG1 2.714 1.939 THR 126.A OG1 GLY 123.A O THR 126.A HG1 3.444 3.015 VAL 129.A N THR 126.A O VAL 129.A H 2.950 2.279 GLN 131.A N TYR 127.A O GLN 131.A H 2.851 2.046 GLN 131.A NE2 GLN 149.A OE1 GLN 131.A HE22 2.773 2.000 ALA 132.A N PRO 128.A O ALA 132.A H 2.941 2.171 ALA 133.A N VAL 129.A O ALA 133.A H 3.093 2.300 ASP 134.A N LEU 130.A O ASP 134.A H 2.798 2.039 ILE 135.A N GLN 131.A O ILE 135.A H 3.213 2.402 LEU 136.A N ALA 132.A O LEU 136.A H 2.906 2.060 LEU 137.A N ALA 133.A O LEU 137.A H 2.979 2.181 LYS 139.A N LEU 136.A O LYS 139.A H 2.979 2.147 LYS 139.A NZ GLU 319.A OE1 LYS 139.A HZ2 3.135 2.440 SER 140.A N ILE 135.A O SER 140.A H 3.445 2.625 THR 141.A N ARG 3.A O THR 141.A H 2.798 2.009 THR 141.A OG1 ARG 3.A O THR 141.A HG1 3.128 2.372 HIS 142.A N ARG 3.A O HIS 142.A H 3.109 2.141 HIS 142.A ND1 THR 141.A OG1 HIS 142.A HD1 2.749 1.940 VAL 143.A N GLU 175.A O VAL 143.A H 2.807 2.026 VAL 145.A N ILE 177.A O VAL 145.A H 3.198 2.420 GLU 147.A N LYS 182.A O GLU 147.A H 2.894 2.058 GLN 149.A N GLY 146.A O GLN 149.A H 3.183 2.355 GLN 149.A NE2 ASP 148.A O GLN 149.A HE22 3.469 2.899 VAL 150.A N GLU 147.A O VAL 150.A H 3.298 2.463 HIS 152.A ND1 GLN 149.A OE1 HIS 152.A HD1 2.778 1.807 MET 153.A N GLN 149.A O MET 153.A H 3.113 2.403 MET 153.A N VAL 150.A O MET 153.A H 3.016 2.427 GLU 154.A N VAL 150.A O GLU 154.A H 3.312 2.586 GLU 154.A N GLN 151.A O GLU 154.A H 3.171 2.545 VAL 156.A N HIS 152.A O VAL 156.A H 3.054 2.267 GLN 157.A N MET 153.A O GLN 157.A H 2.982 2.212 ASP 158.A N GLU 154.A O ASP 158.A H 2.897 2.097 LEU 159.A N LEU 155.A O LEU 159.A H 2.836 2.025 ALA 160.A N VAL 156.A O ALA 160.A H 3.117 2.301 GLN 161.A N GLN 157.A O GLN 161.A H 3.023 2.196 GLY 162.A N ASP 158.A O GLY 162.A H 2.858 2.028 PHE 163.A N LEU 159.A O PHE 163.A H 2.975 2.144 ASN 164.A N ALA 160.A O ASN 164.A H 3.030 2.230 ASN 164.A ND2 PHE 171.A O ASN 164.A HD22 2.926 2.128 LYS 165.A N GLN 161.A O LYS 165.A H 2.914 2.170 LYS 166.A N GLY 162.A O LYS 166.A H 3.304 2.481 TYR 167.A N PHE 163.A O TYR 167.A H 2.984 2.159 GLY 168.A N ASN 164.A O GLY 168.A H 2.940 2.266 PHE 170.A N ASN 164.A OD1 PHE 170.A H 2.987 2.146 PHE 171.A N ASN 164.A OD1 PHE 171.A H 3.025 2.187 GLU 175.A N THR 141.A O GLU 175.A H 2.842 2.019 ILE 177.A N VAL 143.A O ILE 177.A H 2.963 2.163 THR 179.A OG1 LEU 20.A O THR 179.A HG1 3.029 2.233 LYS 185.A N ASN 241.A OD1 LYS 185.A H 2.987 2.152 LYS 185.A NZ LYS 183.A O LYS 185.A HZ1 2.822 1.921 SER 186.A N ALA 192.A O SER 186.A H 2.776 1.943 LEU 187.A N ALA 203.A O LEU 187.A H 3.153 2.308 ARG 188.A N SER 186.A OG ARG 188.A H 3.169 2.548 ARG 188.A NH1 LYS 220.A O ARG 188.A HH11 3.134 2.381 ASP 189.A N SER 186.A OG ASP 189.A H 2.988 2.235 SER 191.A N ASP 189.A OD1 SER 191.A H 3.269 2.510 ALA 192.A N ASP 189.A O ALA 192.A H 2.996 2.163 LYS 193.A NZ MET 194.A O LYS 193.A HZ1 3.140 2.539 LYS 193.A NZ SER 195.A OG LYS 193.A HZ3 2.754 1.815 MET 194.A N VAL 184.A O MET 194.A H 2.991 2.162 LYS 196.A NZ THR 11.A O LYS 196.A HZ1 3.255 2.371 ASP 198.A N SER 195.A O ASP 198.A H 3.133 2.295 ASP 200.A N ASP 198.A OD1 ASP 200.A H 2.898 2.053 LEU 202.A N ASP 200.A OD1 LEU 202.A H 3.096 2.380 ALA 203.A N ASP 200.A O ALA 203.A H 3.080 2.301 ARG 206.A N ASP 209.A OD2 ARG 206.A H 3.024 2.240 ILE 207.A N LEU 14.A O ILE 207.A H 3.077 2.247 ASP 209.A N ARG 206.A O ASP 209.A H 3.033 2.194 SER 210.A N GLU 213.A OE1 SER 210.A H 2.659 1.829 GLU 213.A N SER 210.A OG GLU 213.A H 3.031 2.211 ILE 214.A N SER 210.A O ILE 214.A H 2.913 2.091 VAL 215.A N PRO 211.A O VAL 215.A H 3.025 2.188 GLN 216.A N GLU 212.A O GLN 216.A H 3.142 2.317 LYS 217.A N GLU 213.A O LYS 217.A H 3.051 2.259 LYS 217.A NZ THR 204.A O LYS 217.A HZ1 2.689 1.747 LYS 217.A NZ ASP 209.A OD2 LYS 217.A HZ3 2.670 1.754 PHE 218.A N ILE 214.A O PHE 218.A H 3.144 2.311 ARG 219.A N VAL 215.A O ARG 219.A H 2.822 2.036 LYS 220.A N GLN 216.A O LYS 220.A H 2.957 2.178 ALA 221.A N PHE 218.A O ALA 221.A H 3.342 2.558 VAL 222.A N LEU 187.A O VAL 222.A H 2.959 2.152 THR 226.A N ASP 224.A OD1 THR 226.A H 2.951 2.169 ASP 232.A N SER 240.A OG ASP 232.A H 2.784 1.970 GLY 235.A N ASP 232.A OD1 GLY 235.A H 3.145 2.324 ARG 236.A N ASP 232.A O ARG 236.A H 2.574 1.737 ARG 236.A NE ASP 224.A OD2 ARG 236.A HE 2.641 1.742 ARG 236.A NH1 GLU 228.A O ARG 236.A HH12 2.850 2.061 ARG 236.A NH1 THR 230.A OG1 ARG 236.A HH11 2.767 2.002 ARG 236.A NH2 ASP 224.A OD1 ARG 236.A HH21 3.064 2.305 ARG 236.A NH2 ASP 224.A OD2 ARG 236.A HH21 3.514 2.937 ARG 236.A NH2 GLU 228.A O ARG 236.A HH22 3.011 2.285 SER 240.A N ARG 236.A O SER 240.A H 2.974 2.159 SER 240.A OG ARG 236.A O SER 240.A HG 2.720 2.018 ASN 241.A N ALA 237.A O ASN 241.A H 3.030 2.242 ILE 242.A N GLY 238.A O ILE 242.A H 3.048 2.217 VAL 243.A N VAL 239.A O VAL 243.A H 2.915 2.098 ALA 244.A N SER 240.A O ALA 244.A H 2.903 2.086 VAL 245.A N ASN 241.A O VAL 245.A H 2.969 2.158 HIS 246.A N ILE 242.A O HIS 246.A H 3.059 2.127 HIS 246.A ND1 TYR 269.A OH HIS 246.A HD1 2.838 1.881 ALA 247.A N VAL 243.A O ALA 247.A H 2.988 2.166 ALA 248.A N ALA 244.A O ALA 248.A H 2.997 2.177 VAL 249.A N VAL 245.A O VAL 249.A H 3.021 2.185 THR 250.A N HIS 246.A O THR 250.A H 3.084 2.390 THR 250.A OG1 HIS 246.A O THR 250.A HG1 2.903 2.123 GLY 251.A N ALA 247.A O GLY 251.A H 3.022 2.338 LEU 252.A N THR 250.A OG1 LEU 252.A H 3.158 2.315 GLU 256.A N SER 253.A OG GLU 256.A H 3.061 2.232 VAL 257.A N SER 253.A O VAL 257.A H 3.071 2.244 VAL 258.A N VAL 254.A O VAL 258.A H 3.048 2.235 ARG 259.A N GLU 255.A O ARG 259.A H 3.105 2.303 ARG 259.A NH1 GLU 256.A OE1 ARG 259.A HH11 3.293 2.451 ARG 260.A N GLU 256.A O ARG 260.A H 2.909 2.080 ARG 260.A NE GLU 256.A OE2 ARG 260.A HE 2.828 1.872 ARG 260.A NH2 GLU 256.A OE2 ARG 260.A HH21 3.527 2.886 SER 261.A N VAL 258.A O SER 261.A H 3.273 2.498 ALA 262.A N ARG 259.A O ALA 262.A H 3.256 2.421 MET 264.A N SER 261.A O MET 264.A H 2.927 2.109 THR 266.A N SER 227.A O THR 266.A H 3.101 2.470 ARG 268.A N ASN 265.A OD1 ARG 268.A H 2.990 2.156 TYR 269.A N ASN 265.A O TYR 269.A H 2.939 2.139 LYS 270.A N THR 266.A O LYS 270.A H 2.835 2.059 LYS 270.A NZ PHE 218.A O LYS 270.A HZ3 3.351 2.686 LYS 270.A NZ ARG 219.A O LYS 270.A HZ2 3.137 2.552 ALA 272.A N ARG 268.A O ALA 272.A H 3.321 2.567 VAL 273.A N TYR 269.A O VAL 273.A H 3.140 2.355 ALA 274.A N LYS 270.A O ALA 274.A H 3.120 2.321 ASP 275.A N LEU 271.A O ASP 275.A H 3.101 2.299 ALA 276.A N ALA 272.A O ALA 276.A H 3.088 2.296 VAL 277.A N VAL 273.A O VAL 277.A H 3.007 2.211 ILE 278.A N ALA 274.A O ILE 278.A H 2.947 2.137 GLU 279.A N ASP 275.A O GLU 279.A H 3.098 2.316 LYS 280.A N ALA 276.A O LYS 280.A H 3.143 2.316 PHE 281.A N VAL 277.A O PHE 281.A H 3.022 2.186 ALA 282.A N GLU 279.A O ALA 282.A H 3.302 2.522 LYS 285.A N PHE 281.A O LYS 285.A H 2.976 2.155 LYS 285.A NZ ASP 209.A O LYS 285.A HZ3 3.508 2.569 ARG 286.A N ALA 282.A O ARG 286.A H 3.198 2.454 GLU 287.A N PRO 283.A O GLU 287.A H 3.187 2.368 ILE 288.A N ILE 284.A O ILE 288.A H 3.005 2.184 GLU 289.A N LYS 285.A O GLU 289.A H 3.179 2.417 LYS 290.A N ARG 286.A O LYS 290.A H 3.319 2.559 LEU 291.A N GLU 287.A O LEU 291.A H 2.974 2.133 LYS 292.A N ILE 288.A O LYS 292.A H 2.965 2.215 LEU 293.A N LYS 290.A O LEU 293.A H 3.383 2.546 ASP 294.A N LEU 291.A O ASP 294.A H 3.190 2.338 GLU 299.A N LYS 295.A O GLU 299.A H 3.049 2.225 LYS 300.A N ASP 296.A O LYS 300.A H 2.903 2.093 VAL 301.A N HIS 297.A O VAL 301.A H 2.951 2.213 LEU 302.A N LEU 298.A O LEU 302.A H 3.346 2.543 GLN 303.A N GLU 299.A O GLN 303.A H 3.086 2.270 ILE 304.A N LYS 300.A O ILE 304.A H 3.100 2.261 GLY 305.A N VAL 301.A O GLY 305.A H 3.131 2.319 SER 306.A N LEU 302.A O SER 306.A H 2.810 2.011 SER 306.A OG LEU 302.A O SER 306.A HG 2.927 2.209 ALA 307.A N GLN 303.A O ALA 307.A H 3.026 2.238 LYS 308.A N ILE 304.A O LYS 308.A H 3.121 2.318 ALA 309.A N GLY 305.A O ALA 309.A H 3.080 2.258 LYS 310.A N SER 306.A O LYS 310.A H 2.961 2.157 LYS 310.A NZ GLU 86.A OE2 LYS 310.A HZ2 2.797 2.037 GLU 311.A N ALA 307.A O GLU 311.A H 3.291 2.518 ALA 313.A N ALA 309.A O ALA 313.A H 2.856 2.038 TYR 314.A N LYS 310.A O TYR 314.A H 2.911 2.081 CYS 317.A N ALA 313.A O CYS 317.A H 2.943 2.128 GLN 318.A N TYR 314.A O GLN 318.A H 3.040 2.221 GLU 319.A N THR 315.A O GLU 319.A H 3.283 2.472 VAL 320.A N VAL 316.A O VAL 320.A H 2.989 2.228 LYS 321.A N CYS 317.A O LYS 321.A H 2.974 2.184 LYS 321.A NZ GLN 89.A OE1 LYS 321.A HZ2 3.404 2.549 LYS 322.A N GLN 318.A O LYS 322.A H 3.247 2.445 LEU 323.A N GLU 319.A O LEU 323.A H 3.148 2.364 VAL 324.A N VAL 320.A O VAL 324.A H 3.045 2.243 GLY 325.A N LYS 321.A O GLY 325.A H 3.117 2.367 PHE 326.A N LYS 321.A O PHE 326.A H 3.028 2.425 LEU 327.A N LYS 321.A O LEU 327.A H 3.361 2.565