Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5gkp_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 2.A NE ASP 22.A OD1 ARG 2.A HE 2.787 2.061 ARG 2.A NH1 HIS 40.A ND1 ARG 2.A HH12 2.999 2.148 ARG 2.A NH2 ASP 22.A OD1 ARG 2.A HH21 2.587 1.808 ARG 2.A NH2 HIS 40.A O ARG 2.A HH22 2.961 2.250 GLU 5.A N SER 1.A O GLU 5.A H 3.157 2.483 GLU 5.A N ARG 2.A O GLU 5.A H 2.836 2.148 ILE 6.A N ARG 2.A O ILE 6.A H 2.852 2.031 MET 7.A N SER 3.A O MET 7.A H 2.914 2.224 GLY 10.A N MET 7.A O GLY 10.A H 2.932 2.075 ASN 16.A ND2 TYR 27.A O ASN 16.A HD22 3.192 2.371 ARG 18.A N LEU 25.A O ARG 18.A H 2.819 2.030 ARG 18.A NE THR 61.A OG1 ARG 18.A HE 2.936 2.087 ARG 18.A NH1 VAL 17.A O ARG 18.A HH11 2.968 2.152 ARG 18.A NH2 THR 61.A O ARG 18.A HH21 2.704 1.855 TYR 20.A N PHE 23.A O TYR 20.A H 2.882 2.058 TYR 20.A OH ASP 59.A OD2 TYR 20.A HH 2.434 1.654 GLU 21.A N GLN 98.A OE1 GLU 21.A H 2.921 2.092 VAL 24.A N CYS 38.A O VAL 24.A H 3.112 2.282 LEU 25.A N ARG 18.A O LEU 25.A H 2.855 2.019 SER 26.A N TRP 36.A O SER 26.A H 3.007 2.181 SER 26.A OG THR 15.A O SER 26.A HG 2.651 1.811 TYR 27.A N ASN 16.A O TYR 27.A H 3.063 2.242 TYR 27.A OH PHE 66.A O TYR 27.A HH 2.649 1.821 ASP 28.A N THR 33.A O ASP 28.A H 3.034 2.237 LYS 30.A N ASP 28.A OD2 LYS 30.A H 2.929 2.153 THR 31.A OG1 ASP 28.A OD1 THR 31.A HG1 2.965 2.336 ARG 32.A N ASP 28.A O ARG 32.A H 2.775 2.029 ARG 32.A NH1 ASN 164.A O ARG 32.A HH11 3.322 2.670 THR 33.A OG1 MET 105.A O THR 33.A HG1 2.691 1.895 HIS 35.A N SER 26.A O HIS 35.A H 2.645 1.906 VAL 37.A N THR 139.A O VAL 37.A H 2.759 1.971 CYS 38.A N VAL 24.A O CYS 38.A H 2.851 2.050 GLU 39.A N ILE 137.A O GLU 39.A H 2.774 2.001 HIS 40.A NE2 ASN 134.A OD1 HIS 40.A HE2 2.747 1.920 LEU 41.A N SER 135.A O LEU 41.A H 2.680 1.851 ARG 45.A N THR 42.A OG1 ARG 45.A H 2.993 2.199 LEU 46.A N THR 42.A O LEU 46.A H 3.182 2.503 LEU 46.A N PRO 43.A O LEU 46.A H 3.292 2.556 ASP 50.A N GLN 93.A OE1 ASP 50.A H 3.026 2.210 LYS 52.A N ASP 50.A OD1 LYS 52.A H 3.149 2.327 CYS 54.A N ARG 51.A O CYS 54.A H 3.087 2.341 LYS 57.A NZ ASP 97.A O LYS 57.A HZ1 3.277 2.678 LYS 57.A NZ ASP 97.A OD2 LYS 57.A HZ1 3.211 2.432 THR 61.A N ASP 59.A OD1 THR 61.A H 2.809 2.028 THR 61.A OG1 ASP 59.A OD1 THR 61.A HG1 2.813 2.008 PHE 62.A N ASP 59.A O PHE 62.A H 3.390 2.560 PHE 66.A N PRO 63.A O PHE 66.A H 3.064 2.275 LEU 67.A N GLN 64.A O LEU 67.A H 2.965 2.136 GLN 69.A N ASP 72.A OD2 GLN 69.A H 2.778 2.055 ASN 70.A ND2 ALA 56.A O ASN 70.A HD21 2.952 2.102 ASP 72.A N GLN 69.A O ASP 72.A H 2.721 1.936 LYS 74.A N ASN 70.A O LYS 74.A H 2.906 2.102 SER 76.A N TYR 73.A O SER 76.A H 2.787 1.953 SER 76.A OG TYR 73.A O SER 76.A HG 2.524 1.805 PHE 78.A N SER 76.A OG PHE 78.A H 3.178 2.343 ASP 79.A N GLN 108.A O ASP 79.A H 2.808 2.044 ARG 80.A NH1 ASN 70.A OD1 ARG 80.A HH11 2.794 2.061 GLY 81.A N SER 106.A O GLY 81.A H 2.846 2.053 LEU 83.A N ASN 104.A O LEU 83.A H 2.872 2.040 ALA 84.A N ASN 104.A OD1 ALA 84.A H 2.948 2.095 ALA 85.A N GLU 39.A OE2 ALA 85.A H 3.193 2.590 ASN 88.A N ALA 85.A O ASN 88.A H 2.951 2.112 ASN 88.A ND2 GLU 39.A OE1 ASN 88.A HD22 3.559 2.860 ASN 88.A ND2 GLU 39.A OE2 ASN 88.A HD22 2.986 2.189 HIS 89.A N ALA 86.A O HIS 89.A H 2.838 2.034 HIS 89.A ND1 ASP 22.A OD2 HIS 89.A HD1 2.738 1.897 HIS 89.A NE2 GLU 39.A OE2 HIS 89.A HE2 2.772 2.078 ARG 90.A NE GLY 87.A O ARG 90.A HE 2.856 2.103 GLN 93.A NE2 ASP 50.A O GLN 93.A HE22 2.794 1.984 ALA 95.A N SER 92.A OG ALA 95.A H 2.858 2.041 VAL 96.A N SER 92.A O VAL 96.A H 3.391 2.548 ASP 97.A N GLN 93.A O ASP 97.A H 2.948 2.182 GLN 98.A N LEU 94.A O GLN 98.A H 2.903 2.151 THR 99.A N VAL 96.A O THR 99.A H 3.222 2.616 THR 99.A OG1 VAL 96.A O THR 99.A HG1 2.786 1.958 PHE 100.A N ASP 97.A O PHE 100.A H 2.978 2.167 TYR 101.A N GLN 98.A O TYR 101.A H 2.911 2.078 LEU 102.A N LYS 57.A O LEU 102.A H 3.040 2.252 SER 103.A OG TYR 20.A OH SER 103.A HG 3.071 2.271 ASN 104.A N TYR 101.A O ASN 104.A H 2.868 2.093 ASN 104.A ND2 ALA 84.A O ASN 104.A HD21 2.944 2.133 ASN 104.A ND2 THR 99.A O ASN 104.A HD22 2.918 2.106 MET 105.A N LEU 102.A O MET 105.A H 3.005 2.170 SER 106.A N GLY 81.A O SER 106.A H 2.806 2.005 SER 106.A OG THR 33.A OG1 SER 106.A HG 2.588 1.877 GLN 108.A N ASP 79.A O GLN 108.A H 3.050 2.216 VAL 109.A N ASN 193.A OD1 VAL 109.A H 2.902 2.064 GLY 112.A N ASP 116.A OD2 GLY 112.A H 2.670 1.822 PHE 113.A N GLY 110.A O PHE 113.A H 3.066 2.232 ASN 114.A N VAL 109.A O ASN 114.A H 2.882 2.034 ASN 114.A ND2 ASP 79.A OD2 ASN 114.A HD22 3.210 2.368 ARG 115.A N GLY 110.A O ARG 115.A H 3.017 2.182 ARG 115.A NE ASP 79.A OD2 ARG 115.A HE 2.815 2.111 ASP 116.A N PHE 113.A O ASP 116.A H 2.935 2.131 LYS 117.A NZ ASP 120.A OD2 LYS 117.A HZ3 3.535 2.787 LYS 117.A NZ ASP 198.A O LYS 117.A HZ1 2.933 2.128 LYS 117.A NZ VAL 200.A O LYS 117.A HZ2 2.713 1.911 TRP 118.A N PHE 113.A O TRP 118.A H 2.954 2.242 ASP 120.A N ASP 116.A O ASP 120.A H 2.731 1.912 LEU 121.A N LYS 117.A O LEU 121.A H 2.952 2.196 GLU 122.A N TRP 118.A O GLU 122.A H 3.024 2.222 MET 123.A N ASN 119.A O MET 123.A H 2.959 2.154 HIS 124.A N ASP 120.A O HIS 124.A H 3.036 2.252 CYS 125.A N LEU 121.A O CYS 125.A H 3.105 2.295 CYS 125.A SG LEU 121.A O CYS 125.A HG 3.650 2.669 ARG 126.A N GLU 122.A O ARG 126.A H 3.040 2.202 ARG 126.A NE ASN 88.A OD1 ARG 126.A HE 2.725 1.917 ARG 126.A NH2 ASN 88.A OD1 ARG 126.A HH21 3.180 2.526 ARG 127.A N MET 123.A O ARG 127.A H 3.024 2.199 VAL 128.A N HIS 124.A O VAL 128.A H 3.017 2.193 ALA 129.A N CYS 125.A O ALA 129.A H 2.973 2.188 LYS 130.A N ARG 126.A O LYS 130.A H 3.118 2.467 LYS 131.A N VAL 128.A O LYS 131.A H 3.265 2.422 MET 132.A N ALA 129.A O MET 132.A H 3.282 2.549 ILE 133.A N GLU 178.A O ILE 133.A H 2.919 2.154 ASN 134.A ND2 GLU 178.A OE2 ASN 134.A HD22 2.596 1.738 SER 135.A N LEU 41.A O SER 135.A H 2.733 1.964 TYR 136.A N LEU 176.A O TYR 136.A H 2.875 2.058 ILE 137.A N GLU 39.A O ILE 137.A H 2.804 1.972 ILE 138.A N VAL 174.A O ILE 138.A H 2.824 1.981 THR 139.A N VAL 37.A O THR 139.A H 2.895 2.092 GLY 140.A N PHE 172.A O GLY 140.A H 3.128 2.313 LEU 142.A N HIS 170.A O LEU 142.A H 2.778 1.964 LEU 144.A N THR 169.A OG1 LEU 144.A H 2.946 2.113 LYS 146.A N TYR 154.A O LYS 146.A H 2.878 2.074 GLU 148.A N LYS 152.A O GLU 148.A H 3.000 2.186 GLY 151.A N GLU 148.A O GLY 151.A H 2.940 2.105 LYS 152.A N ASP 150.A OD2 LYS 152.A H 3.062 2.218 TYR 154.A N LYS 146.A O TYR 154.A H 3.005 2.169 TYR 154.A OH ASP 150.A OD1 TYR 154.A HH 2.728 1.915 ILE 160.A N VAL 165.A O ILE 160.A H 2.885 2.114 ASN 163.A N ASP 72.A OD1 ASN 163.A H 3.005 2.148 ASN 163.A ND2 ASP 72.A OD2 ASN 163.A HD22 2.793 2.003 ASN 164.A N GLY 161.A O ASN 164.A H 3.197 2.356 VAL 165.A N ILE 160.A O VAL 165.A H 2.897 2.073 ALA 166.A N THR 31.A O ALA 166.A H 2.914 2.064 VAL 167.A N GLN 158.A O VAL 167.A H 2.960 2.140 THR 169.A N LEU 142.A O THR 169.A H 2.967 2.368 THR 169.A OG1 LEU 142.A O THR 169.A HG1 3.428 2.638 HIS 170.A N LEU 142.A O HIS 170.A H 3.359 2.514 HIS 170.A ND1 THR 169.A OG1 HIS 170.A HD1 2.585 1.754 PHE 171.A N LEU 191.A O PHE 171.A H 2.797 1.975 PHE 172.A N GLY 140.A O PHE 172.A H 2.810 1.974 LYS 173.A N TYR 189.A O LYS 173.A H 2.921 2.114 LYS 173.A NZ THR 139.A OG1 LYS 173.A HZ3 2.672 1.850 VAL 174.A N ILE 138.A O VAL 174.A H 2.871 2.048 ALA 175.A N GLU 187.A O ALA 175.A H 2.772 1.946 LEU 176.A N TYR 136.A O LEU 176.A H 2.684 1.860 PHE 177.A N GLU 185.A O PHE 177.A H 2.579 1.723 GLU 178.A N ASN 134.A O GLU 178.A H 2.908 2.056 VAL 179.A N LYS 183.A O VAL 179.A H 2.728 1.996 LYS 183.A N THR 180.A O LYS 183.A H 2.634 1.932 PHE 184.A N SER 228.A O PHE 184.A H 2.870 2.168 GLU 185.A N PHE 177.A O GLU 185.A H 2.589 1.792 LEU 186.A N LYS 231.A O LEU 186.A H 2.908 2.068 GLU 187.A N ALA 175.A O GLU 187.A H 2.878 2.048 SER 188.A N ASN 233.A OD1 SER 188.A H 2.877 2.054 TYR 189.A N LYS 173.A O TYR 189.A H 2.871 2.025 TYR 189.A OH GLU 187.A OE1 TYR 189.A HH 2.692 1.894 ILE 190.A N PHE 205.A O ILE 190.A H 3.049 2.269 LEU 191.A N PHE 171.A O LEU 191.A H 2.860 2.054 ASN 193.A N THR 169.A O ASN 193.A H 3.032 2.176 ASN 193.A ND2 PRO 107.A O ASN 193.A HD21 3.048 2.326 ASN 193.A ND2 PRO 168.A O ASN 193.A HD22 2.910 2.084 ILE 196.A N GLY 112.A O ILE 196.A H 2.784 1.928 VAL 200.A N GLU 197.A O VAL 200.A H 3.006 2.179 LYS 204.A N GLU 201.A O LYS 204.A H 3.019 2.224 PHE 205.A N ILE 202.A O PHE 205.A H 2.833 1.998 HIS 206.A N SER 203.A O HIS 206.A H 3.053 2.200 HIS 206.A ND1 SER 188.A O HIS 206.A HD1 3.283 2.441 VAL 207.A N SER 188.A O VAL 207.A H 2.933 2.130 ALA 211.A N PRO 208.A O ALA 211.A H 2.952 2.250 GLU 213.A N LEU 209.A O GLU 213.A H 2.968 2.155 ARG 214.A N ASP 210.A O ARG 214.A H 3.050 2.222 ARG 214.A NE ASP 210.A OD1 ARG 214.A HE 3.164 2.396 ARG 214.A NE ASP 210.A OD2 ARG 214.A HE 3.427 2.669 SER 215.A N ALA 211.A O SER 215.A H 3.086 2.241 ALA 216.A N VAL 212.A O ALA 216.A H 2.862 2.043 GLY 217.A N GLU 213.A O GLY 217.A H 2.752 2.107 LEU 218.A N GLU 213.A O LEU 218.A H 3.142 2.352 GLU 219.A N PRO 12.A O GLU 219.A H 2.989 2.145 ILE 220.A N GLU 213.A OE2 ILE 220.A H 3.291 2.509 ARG 223.A N HIS 9.A O ARG 223.A H 3.088 2.415 LYS 227.A N ASP 225.A OD1 LYS 227.A H 2.842 2.004 SER 228.A N ASP 225.A O SER 228.A H 3.216 2.394 SER 228.A OG ASP 225.A O SER 228.A HG 2.849 2.185 VAL 230.A N PHE 184.A O VAL 230.A H 2.766 1.997 LYS 231.A NZ GLU 185.A OE2 LYS 231.A HZ3 2.995 2.206 GLU 232.A N ALA 235.A O GLU 232.A H 3.207 2.364 ASN 233.A N LEU 186.A O ASN 233.A H 2.924 2.070 ASN 233.A ND2 SER 188.A O ASN 233.A HD21 3.655 3.064 ASN 233.A ND2 VAL 207.A O ASN 233.A HD21 2.865 2.111 ALA 235.A N GLU 232.A O ALA 235.A H 3.154 2.301