Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5hio_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 4.A NE GLY 223.A O ARG 4.A HE 3.089 2.508 ARG 4.A NH2 GLY 223.A O ARG 4.A HH21 2.932 2.321 LEU 5.A N LEU 225.A O LEU 5.A H 2.775 2.021 GLY 9.A N LEU 17.A O GLY 9.A H 2.967 2.109 GLN 10.A NE2 ASP 12.A O GLN 10.A HE21 3.212 2.419 GLN 10.A NE2 ASP 13.A O GLN 10.A HE21 3.671 3.051 LEU 11.A N LEU 15.A O LEU 11.A H 2.808 1.958 ASP 12.A N LEU 15.A O ASP 12.A H 3.209 2.395 ASP 13.A N ASP 12.A OD1 ASP 13.A H 2.759 2.023 LEU 15.A N ASP 12.A O LEU 15.A H 3.207 2.349 CYS 16.A N LEU 27.A O CYS 16.A H.A 2.887 2.075 LEU 17.A N GLY 9.A O LEU 17.A H 2.781 1.941 LEU 18.A N VAL 25.A O LEU 18.A H 2.734 1.887 GLY 19.A N ASP 52.A OD2 GLY 19.A H 2.784 1.929 GLN 22.A N ASP 20.A OD1.B GLN 22.A H 2.788 1.932 GLN 22.A NE2 ASP 276.A OD2 GLN 22.A HE22 2.801 1.981 VAL 23.A N ASP 20.A O VAL 23.A H.A 3.033 2.340 VAL 25.A N LEU 18.A O VAL 25.A H 3.112 2.263 PHE 26.A N VAL 38.A O PHE 26.A H 2.946 2.087 LEU 27.A N CYS 16.A O LEU 27.A H 2.795 1.966 LEU 28.A N ALA 36.A O LEU 28.A H 2.757 1.908 ARG 29.A N ASP 14.A O ARG 29.A H 2.878 2.056 ARG 29.A NE GLY 31.A O ARG 29.A HE 3.109 2.274 ARG 29.A NH2 GLU 32.A O ARG 29.A HH21 3.019 2.295 LEU 30.A N SER 34.A O LEU 30.A H 2.822 2.041 SER 34.A OG HIS 64.A ND1 SER 34.A HG 2.962 2.159 TRP 35.A N GLN 62.A O TRP 35.A H 3.031 2.360 ALA 36.A N LEU 28.A O ALA 36.A H 2.926 2.126 LEU 37.A N TYR 65.A O LEU 37.A H 2.804 1.986 VAL 38.A N PHE 26.A O VAL 38.A H 2.877 2.122 GLU 39.A N LEU 67.A O GLU 39.A H 2.847 2.018 GLY 40.A N HIS 75.A O GLY 40.A H 2.946 2.345 SER 43.A N ASN 114.A OD1 SER 43.A H 2.908 2.101 SER 43.A OG GLY 77.A O SER 43.A HG 2.696 1.879 ARG 44.A NE ASP 45.A OD1 ARG 44.A HE 2.768 2.011 ARG 44.A NH1 LEU 117.A O ARG 44.A HH11 3.002 2.217 ARG 44.A NH2 ASP 276.A O ARG 44.A HH22 3.250 2.464 ARG 44.A NH2 ASP 276.A OD2 ARG 44.A HH22 3.035 2.445 ASP 45.A N ILE 42.A O ASP 45.A H 3.076 2.233 ALA 46.A N SER 43.A O ALA 46.A H 3.000 2.215 VAL 49.A N ASP 45.A O VAL 49.A H 2.829 1.974 TRP 50.A N ALA 46.A O TRP 50.A H 2.902 2.056 ALA 51.A N GLU 47.A O ALA 51.A H 2.992 2.158 ASP 52.A N LEU 48.A O ASP 52.A H 3.052 2.214 LEU 53.A N VAL 49.A O LEU 53.A H 2.768 1.910 CYS 54.A N TRP 50.A O CYS 54.A H 2.946 2.119 CYS 54.A SG TRP 50.A O CYS 54.A HG 3.351 2.435 ARG 55.A N ALA 51.A O ARG 55.A H 3.262 2.594 ARG 55.A N ASP 52.A O ARG 55.A H 2.948 2.263 TRP 56.A N LEU 53.A O TRP 56.A H 2.881 2.073 VAL 57.A N LEU 53.A O VAL 57.A H 2.905 2.168 SER 61.A N ASP 59.A OD1 SER 61.A H 3.068 2.258 GLN 62.A N ASP 59.A O GLN 62.A H 2.919 2.071 VAL 63.A N PRO 60.A O VAL 63.A H 3.072 2.216 HIS 64.A N TRP 35.A O HIS 64.A H 2.849 2.020 TRP 66.A N GLN 90.A O TRP 66.A H 2.921 2.150 TRP 66.A NE1 GLU 39.A O TRP 66.A HE1 2.867 2.010 LEU 67.A N LEU 37.A O LEU 67.A H 2.777 1.945 ILE 68.A N LEU 92.A O ILE 68.A H 3.045 2.295 HIS 70.A NE2 HIS 72.A ND1 no hydrogen 3.027 N/A LYS 71.A N ASP 163.A OD2 LYS 71.A H 2.808 2.196 TYR 73.A OH PHE 277.A O TYR 73.A HH 2.583 1.779 ASP 74.A N ASP 74.A OD1 ASP 74.A H 2.584 1.863 HIS 75.A N HIS 72.A O HIS 75.A H 2.892 2.047 HIS 75.A ND1 GLU 39.A OE1 HIS 75.A HD1 2.869 2.019 CYS 76.A SG HIS 72.A O CYS 76.A HG 3.484 2.293 GLY 77.A N GLY 41.A O GLY 77.A H 2.788 2.002 LEU 78.A N GLY 40.A O LEU 78.A H 2.858 2.018 LEU 79.A N CYS 76.A O LEU 79.A H 3.259 2.423 TYR 81.A N LEU 78.A O TYR 81.A H 2.996 2.288 LEU 82.A N LEU 78.A O LEU 82.A H 2.959 2.140 CYS 83.A N LEU 79.A O CYS 83.A H.B 3.002 2.177 ARG 85.A N LEU 82.A O ARG 85.A H 2.854 2.151 ARG 85.A NH1 GLU 47.A OE1 ARG 85.A HH12 2.863 2.009 ARG 85.A NH1 GLU 47.A OE2 ARG 85.A HH12 3.405 2.815 ARG 85.A NH2 GLU 47.A OE1 ARG 85.A HH22 3.562 2.919 ARG 85.A NH2 GLU 47.A OE2 ARG 85.A HH22 2.659 1.845 LEU 86.A N CYS 83.A O LEU 86.A H 3.042 2.194 ASN 88.A ND2 SER 61.A O ASN 88.A HD22 2.924 2.088 VAL 89.A N LEU 86.A O VAL 89.A H 3.154 2.297 GLN 90.A N HIS 64.A O GLN 90.A H 2.885 2.114 VAL 91.A N PRO 134.A O VAL 91.A H 2.706 1.875 LEU 92.A N TRP 66.A O LEU 92.A H 2.833 1.995 ALA 93.A N ARG 136.A O ALA 93.A H 3.386 2.592 SER 94.A OG THR 97.A OG1 SER 94.A HG 2.804 2.067 ARG 96.A NH1 ASP 162.A O ARG 96.A HH11 2.701 1.878 THR 97.A N SER 94.A OG THR 97.A H 3.025 2.171 THR 97.A OG1 ASP 163.A OD2 THR 97.A HG1 2.629 1.804 CYS 98.A N SER 94.A O CYS 98.A H 2.872 2.026 GLN 99.A N GLU 95.A O GLN 99.A H 2.948 2.173 GLN 99.A NE2 GLU 95.A OE2 GLN 99.A HE21 3.065 2.292 ALA 100.A N ARG 96.A O ALA 100.A H 3.152 2.387 ALA 100.A N THR 97.A O ALA 100.A H 3.066 2.466 TRP 101.A N CYS 98.A O TRP 101.A H 3.076 2.406 LYS 102.A N GLN 99.A O LYS 102.A H 2.873 2.087 LYS 102.A NZ ASP 131.A O LYS 102.A HZ3 2.901 2.102 SER 103.A N ALA 100.A O SER 103.A H 3.192 2.347 SER 105.A OG SER 103.A OG SER 105.A HG 3.070 2.398 ALA 106.A N SER 103.A OG ALA 106.A H 3.174 2.330 VAL 107.A N SER 103.A O VAL 107.A H 2.901 2.043 ARG 108.A N GLU 104.A O ARG 108.A H 2.824 2.065 VAL 109.A N SER 105.A O VAL 109.A H 3.256 2.446 VAL 110.A N ALA 106.A O VAL 110.A H 3.156 2.310 GLU 111.A N VAL 107.A O GLU 111.A H 2.932 2.106 ARG 112.A N ARG 108.A O ARG 112.A H 2.987 2.138 LEU 113.A N VAL 109.A O LEU 113.A H 2.953 2.109 ASN 114.A N VAL 110.A O ASN 114.A H 3.044 2.211 ASN 114.A ND2 TYR 73.A O ASN 114.A HD21 3.076 2.252 ASN 114.A ND2 VAL 110.A O ASN 114.A HD22 3.141 2.414 ARG 115.A N GLU 111.A O ARG 115.A H.A 2.738 1.922 GLN 116.A N ARG 112.A O GLN 116.A H 3.122 2.379 LEU 117.A N ASN 114.A O LEU 117.A H 3.119 2.302 LEU 118.A N ARG 115.A O LEU 118.A H 3.253 2.395 ARG 119.A N GLN 122.A OE1 ARG 119.A H 2.778 2.038 GLN 122.A N ARG 119.A O GLN 122.A H 2.868 2.087 GLN 122.A NE2 ARG 44.A O GLN 122.A HE22 3.057 2.443 CYS 128.A N PRO 80.A O CYS 128.A H 2.867 2.116 TRP 130.A NE1 GLU 111.A OE2 TRP 130.A HE1 2.932 2.226 ALA 132.A N ALA 129.A O ALA 132.A H 2.904 2.079 ARG 136.A N VAL 91.A O ARG 136.A H 2.671 1.849 ARG 136.A NH1 GLN 90.A OE1 ARG 136.A HH11 3.458 2.617 ARG 136.A NH2 GLU 142.A OE2 ARG 136.A HH21 2.826 2.064 VAL 138.A N ALA 93.A O VAL 138.A H 2.771 1.989 ALA 139.A N GLU 142.A OE1 ALA 139.A H 2.903 2.079 GLY 141.A N VAL 154.A O GLY 141.A H 2.726 1.932 GLU 142.A N ALA 139.A O GLU 142.A H 3.028 2.179 LEU 144.A N LEU 152.A O LEU 144.A H 2.708 1.858 LEU 146.A N HIS 150.A O LEU 146.A H 3.022 2.392 GLY 147.A N HIS 150.A O GLY 147.A H 3.185 2.382 HIS 150.A N GLY 147.A O HIS 150.A H 3.147 2.288 HIS 150.A NE2 ASP 14.A OD2 HIS 150.A HE2 2.799 1.953 ARG 151.A NE GLU 145.A OE2 ARG 151.A HE 3.008 2.260 LEU 152.A N LEU 144.A O LEU 152.A H 3.028 2.216 GLN 153.A N TYR 168.A O GLN 153.A H 2.842 2.026 GLN 153.A NE2 GLY 141.A O GLN 153.A HE21 3.300 2.444 VAL 154.A N GLU 142.A O VAL 154.A H 2.892 2.042 ILE 155.A N VAL 166.A O ILE 155.A H 2.931 2.109 GLU 156.A N ASP 140.A OD1 GLU 156.A H 2.843 1.987 ALA 157.A N HIS 164.A O ALA 157.A H 2.832 1.995 GLY 159.A N SER 161.A O GLY 159.A H 3.098 2.323 HIS 160.A ND1 LEU 194.A O HIS 160.A HD1 2.722 1.911 HIS 160.A NE2 HIS 72.A ND1 no hydrogen 3.076 N/A VAL 165.A N THR 69.A O VAL 165.A H 2.976 2.140 VAL 166.A N ILE 155.A O VAL 166.A H 2.881 2.056 PHE 167.A N PHE 176.A O PHE 167.A H 3.068 2.248 TYR 168.A N GLN 153.A O TYR 168.A H 2.920 2.124 ASP 169.A N ARG 174.A O ASP 169.A H 2.765 1.915 ARG 172.A N ASP 169.A OD1 ARG 172.A H 3.179 2.388 ARG 172.A NH1 ARG 149.A O ARG 172.A HH12 2.875 2.104 ARG 172.A NH1 ASP 169.A OD2 ARG 172.A HH11 2.856 2.060 ARG 172.A NH2 ARG 149.A O ARG 172.A HH22 2.959 2.220 ARG 173.A N VAL 170.A O ARG 173.A H 3.027 2.201 ARG 173.A NH1 THR 214.A O ARG 173.A HH11 2.862 2.036 ARG 174.A N ASP 169.A O ARG 174.A H 2.945 2.108 ARG 174.A NE GLN 217.A OE1 ARG 174.A HE 2.772 1.932 ARG 174.A NH1 ASP 14.A OD2 ARG 174.A HH12 2.774 1.937 ARG 174.A NH2 ASP 12.A OD2 ARG 174.A HH21 3.184 2.540 ARG 174.A NH2 ASP 14.A OD1 ARG 174.A HH22 2.843 1.984 ARG 174.A NH2 ASP 14.A OD2 ARG 174.A HH22 3.558 2.947 ARG 174.A NH2 GLN 217.A OE1 ARG 174.A HH21 3.184 2.499 LEU 175.A N GLN 217.A O LEU 175.A H 2.959 2.152 PHE 176.A N PHE 167.A O PHE 176.A H 2.888 2.075 CYS 177.A N ILE 219.A O CYS 177.A H 2.998 2.231 ASP 179.A N HIS 164.A NE2 ASP 179.A H 2.985 2.188 ALA 180.A N CYS 177.A O ALA 180.A H 3.128 2.273 GLY 182.A N ASP 179.A O GLY 182.A H 3.085 2.260 GLU 183.A N ARG 192.A O GLU 183.A H 2.797 1.982 ASP 185.A N VAL 190.A O ASP 185.A H 2.752 1.907 GLU 186.A N GLN 273.A OE1 GLU 186.A H 2.827 1.984 ALA 187.A N ASP 185.A OD1 ALA 187.A H 3.028 2.402 GLU 188.A N ASP 185.A OD1 GLU 188.A H 2.960 2.250 GLY 189.A N ASP 185.A O GLY 189.A H 2.740 1.920 ARG 192.A N GLU 183.A O ARG 192.A H 2.787 1.938 ARG 192.A NE ASP 185.A OD2 ARG 192.A HE 2.869 2.078 ARG 192.A NH1 GLU 183.A OE1 ARG 192.A HH11 2.896 2.073 ARG 192.A NH2 ASP 185.A OD2 ARG 192.A HH21 2.952 2.218 ASP 197.A N GLY 159.A O ASP 197.A H 2.983 2.258 ASP 198.A N GLY 159.A O ASP 198.A H 3.001 2.199 ALA 201.A N ASP 198.A OD1 ALA 201.A H 2.969 2.124 TYR 202.A N ASP 198.A O TYR 202.A H 3.055 2.222 LEU 203.A N MET 199.A O LEU 203.A H 2.962 2.117 GLU 204.A N GLU 200.A O GLU 204.A H 2.876 2.050 SER 205.A N ALA 201.A O SER 205.A H 2.818 1.995 SER 205.A OG HIS 158.A O SER 205.A HG 2.866 2.280 LEU 206.A N TYR 202.A O LEU 206.A H 3.185 2.375 GLU 207.A N LEU 203.A O GLU 207.A H 2.952 2.117 ARG 208.A N GLU 204.A O ARG 208.A H 3.063 2.236 ARG 208.A NE GLU 204.A OE1 ARG 208.A HE 2.993 2.181 ARG 208.A NE GLU 204.A OE2 ARG 208.A HE 2.935 2.207 ARG 208.A NH1 GLU 156.A O ARG 208.A HH12 2.858 2.106 ARG 208.A NH2 GLU 156.A O ARG 208.A HH22 2.833 2.071 ARG 208.A NH2 GLU 204.A OE1 ARG 208.A HH21 3.098 2.337 LEU 209.A N SER 205.A O LEU 209.A H 2.838 2.016 GLN 210.A N LEU 206.A O GLN 210.A H.A 2.858 2.052 GLN 210.A NE2.B ALA 235.A O GLN 210.A HE21.B 3.427 2.702 ARG 211.A N ARG 208.A O ARG 211.A H 2.997 2.233 LEU 212.A N LEU 209.A O LEU 212.A H 3.101 2.267 LEU 216.A N ARG 173.A O LEU 216.A H 2.772 1.974 GLN 217.A N ARG 173.A O GLN 217.A H 3.038 2.218 GLN 217.A NE2 ASP 12.A OD2 GLN 217.A HE22 2.857 2.057 LEU 218.A N LEU 226.A O LEU 218.A H 2.799 1.964 ILE 219.A N LEU 175.A O ILE 219.A H 2.858 2.041 GLY 221.A N GLY 178.A O GLY 221.A H 2.773 2.055 HIS 222.A ND1 GLN 22.A O HIS 222.A HD1 2.814 2.041 GLY 223.A N VAL 21.A O GLY 223.A H 2.856 2.041 LEU 225.A N LEU 5.A O LEU 225.A H 2.851 2.010 LEU 226.A N LEU 218.A O LEU 226.A H 2.819 1.975 ARG 227.A N LEU 3.A O ARG 227.A H 2.871 2.070 ARG 227.A NE MET 2.A O ARG 227.A HE 2.646 1.878 ARG 227.A NH2 MET 2.A O ARG 227.A HH21 2.797 2.083 LEU 230.A N ARG 227.A O LEU 230.A H 3.165 2.528 ALA 231.A N GLY 228.A O ALA 231.A H 3.083 2.480 ALA 232.A N GLY 228.A O ALA 232.A H 3.066 2.230 ASP 233.A N ARG 229.A O ASP 233.A H 2.844 2.044 GLY 234.A N ALA 231.A O GLY 234.A H 3.285 2.427 SER 237.A N ASP 233.A O SER 237.A H 2.899 2.064 SER 237.A OG ASP 233.A O SER 237.A HG 3.069 2.354 ALA 238.A N GLY 234.A O ALA 238.A H 2.817 1.966 TYR 239.A N ALA 235.A O TYR 239.A H 3.065 2.239 THR 240.A N GLU 236.A O THR 240.A H 2.992 2.157 THR 240.A OG1 GLU 236.A O THR 240.A HG1 3.265 2.567 GLU 241.A N SER 237.A O GLU 241.A H 2.830 2.006 CYS 242.A N ALA 238.A O CYS 242.A H 3.030 2.244 LEU 243.A N TYR 239.A O LEU 243.A H 3.073 2.244 ARG 244.A N THR 240.A O ARG 244.A H 2.922 2.110 LEU 245.A N GLU 241.A O LEU 245.A H 3.057 2.273 CYS 246.A N CYS 242.A O CYS 246.A H.A 3.036 2.222 ARG 247.A N LEU 243.A O ARG 247.A H 2.970 2.132 ARG 248.A N ARG 244.A O ARG 248.A H 2.998 2.171 LEU 249.A N LEU 245.A O LEU 249.A H 2.865 2.048 LEU 250.A N CYS 246.A O LEU 250.A H 2.990 2.173 TRP 251.A N ARG 247.A O TRP 251.A H 2.825 1.987 ARG 252.A N ARG 248.A O ARG 252.A H 3.101 2.270 ARG 252.A NH1 GLU 257.A OE1 ARG 252.A HH11 2.901 2.144 GLN 253.A N LEU 249.A O GLN 253.A H 2.919 2.073 GLN 253.A NE2 SER 295.A OG.B GLN 253.A HE22 3.297 2.568 SER 254.A N LEU 250.A O SER 254.A H 2.877 2.051 SER 254.A OG TRP 251.A O SER 254.A HG 2.555 1.727 MET 255.A N TRP 251.A O MET 255.A H 3.179 2.534 MET 255.A N ARG 252.A O MET 255.A H 2.989 2.321 GLY 256.A N GLN 253.A O GLY 256.A H 2.838 2.021 GLU 257.A N ARG 252.A O GLU 257.A H 3.130 2.291 ASP 260.A N SER 258.A OG ASP 260.A H 3.219 2.436 GLU 261.A N SER 258.A O GLU 261.A H 3.240 2.447 SER 263.A N LEU 259.A O SER 263.A H 3.023 2.191 SER 263.A OG LEU 259.A O SER 263.A HG 2.744 2.019 GLU 264.A N ASP 260.A O GLU 264.A H 2.948 2.137 GLU 265.A N GLU 261.A O GLU 265.A H 3.039 2.216 LEU 266.A N LEU 262.A O LEU 266.A H 2.806 1.962 HIS 267.A N SER 263.A O HIS 267.A H 2.892 2.051 HIS 267.A ND1 HIS 283.A ND1 HIS 267.A HD1 3.023 2.174 ARG 268.A N GLU 264.A O ARG 268.A H 2.842 2.003 ARG 268.A NE GLU 265.A OE1 ARG 268.A HE 3.057 2.247 ARG 268.A NE GLU 265.A OE2 ARG 268.A HE 3.332 2.619 ARG 268.A NH1 GLU 265.A OE2 ARG 268.A HH11 2.886 2.051 ALA 269.A N GLU 265.A O ALA 269.A H 2.749 1.915 TRP 270.A N LEU 266.A O TRP 270.A H 2.753 1.997 GLY 271.A N HIS 267.A O GLY 271.A H 2.833 2.039 GLN 273.A NE2 PHE 184.A O GLN 273.A HE22 2.955 2.123 VAL 275.A N GLY 272.A O VAL 275.A H 3.474 2.623 PHE 277.A N SER 274.A O PHE 277.A H 3.027 2.212 LEU 278.A N SER 274.A O LEU 278.A H 2.921 2.234 LEU 282.A N PRO 279.A O LEU 282.A H 3.049 2.194 GLY 285.A N GLU 281.A O GLY 285.A H 3.022 2.178 SER 286.A N LEU 282.A O SER 286.A H 2.687 1.871 SER 286.A OG LEU 282.A O SER 286.A HG 2.798 2.087 MET 287.A N HIS 283.A O MET 287.A H 2.834 2.016 ARG 288.A N LEU 284.A O ARG 288.A H 3.023 2.217 ARG 288.A NE ASP 260.A OD1 ARG 288.A HE 2.751 1.928 ARG 288.A NH2 ASP 260.A OD1 ARG 288.A HH21 3.406 2.783 ARG 289.A N GLY 285.A O ARG 289.A H 2.893 2.046 MET 290.A N SER 286.A O MET 290.A H 2.953 2.116 LEU 291.A N MET 287.A O LEU 291.A H 2.995 2.174 GLU 292.A N ARG 288.A O GLU 292.A H 2.846 2.006 ILE 293.A N ARG 289.A O ILE 293.A H 2.937 2.108 LEU 294.A N MET 290.A O LEU 294.A H 2.826 1.983 SER 295.A N LEU 291.A O SER 295.A H.B 2.681 1.872 SER 295.A OG.A LEU 291.A O SER 295.A HG.A 2.507 1.704 ARG 296.A N GLU 292.A O ARG 296.A H 2.965 2.155 GLN 297.A N ILE 293.A O GLN 297.A H 3.276 2.467 ALA 298.A N LEU 294.A O ALA 298.A H 2.865 2.064 LEU 299.A N SER 295.A O LEU 299.A H 2.815 2.047