Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5iai_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N ASP 4.A OD2 LYS 1.A H 2.699 1.849 LYS 1.A NZ GLN 30.A O LYS 1.A HZ3 3.161 2.405 LEU 3.A N THR 32.A O LEU 3.A H 2.804 2.015 ASP 4.A N LYS 1.A O ASP 4.A H 3.171 2.314 VAL 6.A N LEU 3.A O VAL 6.A H 3.003 2.167 LEU 8.A N ASP 35.A O LEU 8.A H 2.774 1.951 THR 9.A N ASP 61.A OD2 THR 9.A H 2.857 2.016 LEU 10.A N LYS 37.A O LEU 10.A H 2.864 2.037 ALA 11.A N LEU 62.A O ALA 11.A H 2.938 2.121 SER 12.A N GLU 39.A O SER 12.A H 2.877 2.046 GLN 13.A N THR 64.A OG1 GLN 13.A H 2.998 2.184 GLN 13.A NE2 ASP 15.A OD1 GLN 13.A HE21 3.119 2.313 GLY 18.A N ASP 15.A O GLY 18.A H 2.901 2.082 VAL 20.A N PRO 16.A O VAL 20.A H 3.418 2.611 LEU 21.A N PHE 17.A O LEU 21.A H 2.774 1.923 THR 22.A N GLY 18.A O THR 22.A H 3.120 2.293 THR 22.A OG1 GLY 18.A O THR 22.A HG1 2.983 2.211 LYS 23.A N ALA 19.A O LYS 23.A H 2.949 2.154 LYS 23.A NZ ASP 311.A OD2 LYS 23.A HZ2 3.353 2.627 LEU 24.A N VAL 20.A O LEU 24.A H 2.814 2.033 ALA 25.A N THR 22.A O ALA 25.A H 3.335 2.525 PHE 28.A N LEU 24.A O PHE 28.A H 3.024 2.213 LYS 29.A N ALA 25.A O LYS 29.A H 2.931 2.105 GLN 30.A N ALA 26.A O GLN 30.A H 2.952 2.165 ASP 31.A N GLU 27.A O ASP 31.A H 2.925 2.220 THR 32.A N PHE 28.A O THR 32.A H 2.895 2.133 THR 32.A OG1 PHE 28.A O THR 32.A HG1 2.925 2.086 GLY 33.A N LYS 29.A O GLY 33.A H 2.810 2.038 ALA 34.A N THR 32.A OG1 ALA 34.A H 3.240 2.405 ASP 35.A N VAL 6.A O ASP 35.A H 2.889 2.037 LYS 37.A N LEU 8.A O LYS 37.A H 2.775 1.925 GLU 39.A N LEU 10.A O GLU 39.A H 2.791 1.940 TYR 42.A OH ASP 65.A OD2 TYR 42.A HH 2.665 1.833 THR 44.A N ASP 41.A OD1 THR 44.A H 2.985 2.130 THR 44.A OG1 ASP 41.A OD1 THR 44.A HG1 3.006 2.299 LEU 45.A N ASP 41.A O LEU 45.A H 2.753 1.904 LEU 46.A N TYR 42.A O LEU 46.A H 3.012 2.186 THR 47.A N GLY 43.A O THR 47.A H 2.958 2.113 LYS 48.A N THR 44.A O LYS 48.A H 2.839 1.983 THR 49.A N LEU 45.A O THR 49.A H 2.994 2.144 THR 49.A OG1 LEU 45.A O THR 49.A HG1 2.715 1.917 THR 49.A OG1 LEU 46.A O THR 49.A HG1 3.529 3.040 THR 50.A N LEU 46.A O THR 50.A H 2.987 2.148 THR 50.A OG1 LEU 46.A O THR 50.A HG1 2.687 1.967 ALA 51.A N THR 47.A O ALA 51.A H 2.975 2.139 ASP 52.A N LYS 48.A O ASP 52.A H 3.024 2.235 PHE 53.A N THR 49.A O PHE 53.A H 2.877 2.042 VAL 54.A N THR 50.A O VAL 54.A H 2.848 1.994 GLY 55.A N ALA 51.A O GLY 55.A H 2.903 2.072 LYS 56.A N PHE 53.A O LYS 56.A H 2.993 2.183 THR 57.A N ASP 52.A O THR 57.A H 3.268 2.450 THR 57.A OG1 ASP 52.A OD1 THR 57.A HG1 2.728 1.929 GLY 59.A N ASP 52.A OD1 GLY 59.A H 2.823 1.993 TYR 60.A N ASP 52.A OD2 TYR 60.A H 3.042 2.209 TYR 60.A OH GLU 39.A OE1 TYR 60.A HH 3.076 2.244 ASP 61.A N THR 9.A O ASP 61.A H 2.848 2.161 LEU 62.A N THR 9.A O LEU 62.A H 3.144 2.325 VAL 63.A N ALA 280.A O VAL 63.A H 2.936 2.140 THR 64.A N ALA 11.A O THR 64.A H 2.952 2.113 ILE 66.A N GLY 277.A O ILE 66.A H 2.940 2.121 TRP 68.A N ASP 65.A O TRP 68.A H 2.819 1.988 TRP 68.A NE1 TYR 42.A OH TRP 68.A HE1 2.933 2.272 ALA 69.A N ILE 66.A O ALA 69.A H 3.210 2.370 GLY 70.A N ARG 349.A O GLY 70.A H 2.858 2.168 TYR 72.A N TRP 68.A O TYR 72.A H 2.851 2.009 GLN 73.A N ALA 69.A O GLN 73.A H 2.943 2.137 ALA 74.A N GLY 70.A O ALA 74.A H 2.921 2.083 ASN 75.A N ALA 71.A O ASN 75.A H 3.078 2.294 ASN 75.A ND2 ALA 71.A O ASN 75.A HD22 2.964 2.234 GLY 76.A N TYR 72.A O GLY 76.A H 2.954 2.350 SER 78.A OG VAL 113.A O SER 78.A HG 2.790 2.113 VAL 79.A N ILE 281.A O VAL 79.A H 2.771 1.977 LEU 81.A N TYR 112.A O LEU 81.A H 2.865 2.095 THR 82.A N ASP 80.A OD1 THR 82.A H 3.032 2.179 THR 82.A OG1 ASP 80.A OD1 THR 82.A HG1 2.627 1.869 VAL 85.A N LEU 81.A O VAL 85.A H 2.830 1.988 LYS 86.A N THR 82.A O LYS 86.A H 3.164 2.332 ARG 87.A N ASP 83.A O ARG 87.A H 2.878 2.058 ARG 87.A NE ASP 88.A OD1 ARG 87.A HE 2.890 2.057 ARG 87.A NH1 ASP 88.A OD2 ARG 87.A HH11 2.989 2.144 ASP 88.A N TRP 84.A O ASP 88.A H 2.921 2.110 ALA 89.A N LYS 86.A O ALA 89.A H 3.425 2.574 GLU 91.A N ASP 88.A O GLU 91.A H 2.994 2.306 LEU 92.A N ALA 89.A O LEU 92.A H 2.824 2.024 ASP 96.A N ASP 93.A O ASP 96.A H 3.112 2.345 ILE 97.A N LEU 94.A O ILE 97.A H 2.951 2.100 ILE 101.A N TYR 98.A O ILE 101.A H 2.907 2.229 LEU 102.A N TYR 98.A O LEU 102.A H 3.189 2.379 GLN 103.A N PRO 99.A O GLN 103.A H 2.952 2.108 SER 104.A N VAL 100.A O SER 104.A H 2.889 2.096 SER 104.A OG VAL 100.A O SER 104.A HG 3.002 2.461 LEU 105.A N.A ILE 101.A O LEU 105.A H.A 2.968 2.135 LEU 105.A N.B ILE 101.A O LEU 105.A H.B 2.971 2.136 GLY 106.A N LEU 102.A O GLY 106.A H 3.142 2.474 GLN 107.A N GLN 103.A O GLN 107.A H 3.192 2.422 GLN 107.A NE2 LEU 102.A O GLN 107.A HE21 3.384 2.554 TYR 108.A N HIS 111.A O TYR 108.A H 2.934 2.148 HIS 111.A N TYR 108.A O HIS 111.A H 3.091 2.244 TYR 112.A N THR 82.A OG1 TYR 112.A H 3.013 2.184 VAL 113.A N GLY 106.A O VAL 113.A H 2.800 2.159 ALA 114.A N GLY 106.A O ALA 114.A H 3.166 2.405 PHE 117.A N TRP 278.A O PHE 117.A H 3.206 2.350 ALA 118.A N TRP 278.A O ALA 118.A H 3.145 2.352 ALA 119.A N SER 315.A O ALA 119.A H 3.259 2.435 TYR 120.A N GLY 276.A O TYR 120.A H 2.884 2.048 TYR 120.A OH ASP 15.A OD2 TYR 120.A HH 2.656 1.851 ALA 121.A N SER 240.A OG ALA 121.A H 2.870 2.017 ASN 122.A N GLY 274.A O ASN 122.A H 2.880 2.070 ASN 122.A ND2 GLN 177.A OE1 ASN 122.A HD21 2.648 1.959 VAL 123.A N THR 238.A O VAL 123.A H 2.861 2.012 LEU 124.A N THR 261.A O LEU 124.A H 2.889 2.074 TYR 126.A N GLY 259.A O TYR 126.A H 3.020 2.210 ARG 127.A N ALA 236.A O ARG 127.A H 2.818 2.019 ARG 127.A NE ASP 129.A OD1 ARG 127.A HE 2.813 1.991 ARG 127.A NH1 GLY 233.A O ARG 127.A HH12 3.006 2.302 ARG 127.A NH2 ASP 129.A OD1 ARG 127.A HH21 3.554 2.962 ARG 127.A NH2 ASP 129.A OD2 ARG 127.A HH21 2.892 2.041 LYS 128.A N LYS 257.A O LYS 128.A H 2.739 2.072 LEU 130.A N ARG 127.A O LEU 130.A H 3.115 2.527 PHE 131.A N ARG 127.A O PHE 131.A H 3.095 2.252 GLN 132.A N LYS 128.A O GLN 132.A H 2.978 2.124 ALA 133.A N ASP 129.A O ALA 133.A H 2.997 2.161 ALA 134.A N LEU 130.A O ALA 134.A H 3.186 2.436 ALA 134.A N PHE 131.A O ALA 134.A H 3.132 2.536 GLY 135.A N GLN 132.A O GLY 135.A H 2.993 2.173 LEU 136.A N PHE 131.A O LEU 136.A H 2.986 2.173 THR 140.A N GLU 144.A OE1 THR 140.A H 2.907 2.050 THR 140.A OG1 GLU 144.A OE1 THR 140.A HG1 3.298 2.620 THR 141.A N GLU 144.A OE1 THR 141.A H 3.280 2.589 VAL 142.A N VAL 265.A O VAL 142.A H 3.012 2.259 GLU 143.A N GLU 143.A OE2 GLU 143.A H 2.672 1.884 GLU 144.A N THR 141.A OG1 GLU 144.A H 2.998 2.165 LEU 145.A N THR 141.A O LEU 145.A H 3.139 2.355 VAL 146.A N VAL 142.A O VAL 146.A H 3.082 2.278 SER 147.A N GLU 143.A O SER 147.A H 2.970 2.115 ASP 148.A N GLU 144.A O ASP 148.A H 2.641 1.788 ALA 149.A N LEU 145.A O ALA 149.A H 2.802 1.989 LYS 150.A N VAL 146.A O LYS 150.A H 3.151 2.337 LYS 151.A N SER 147.A O LYS 151.A H 3.032 2.187 LEU 152.A N ASP 148.A O LEU 152.A H 2.890 2.130 THR 153.A N LYS 150.A O THR 153.A H 3.167 2.319 THR 153.A OG1 ALA 149.A O THR 153.A HG1 2.675 1.867 ASP 154.A N GLN 159.A O ASP 154.A H 2.926 2.078 SER 156.A N ASP 154.A OD1 SER 156.A H 3.272 2.552 LYS 157.A N ASP 154.A O LYS 157.A H 2.956 2.155 LYS 158.A N PRO 155.A O LYS 158.A H 2.788 1.944 GLN 159.A N ASP 154.A O GLN 159.A H 3.394 2.551 GLN 159.A NE2 LEU 152.A O GLN 159.A HE21 3.415 2.597 TYR 160.A N ALA 234.A O TYR 160.A H 3.047 2.218 GLY 161.A N THR 153.A OG1 GLY 161.A H 2.974 2.211 ASN 165.A N ASP 175.A OD2 ASN 165.A H 2.778 1.982 ASN 165.A ND2 ALA 171.A O ASN 165.A HD22 3.063 2.223 GLY 166.A N TYR 221.A O GLY 166.A H 2.952 2.262 GLN 167.A N TYR 221.A O GLN 167.A H 2.943 2.101 VAL 172.A N GLN 167.A O VAL 172.A H 3.136 2.365 ALA 173.A N GLY 169.A O ALA 173.A H 3.135 2.289 GLN 174.A N PRO 170.A O GLN 174.A H 2.856 2.009 GLN 174.A NE2 GLN 357.A OE1 GLN 174.A HE21 2.891 2.041 ASP 175.A N ALA 171.A O ASP 175.A H 3.233 2.405 TRP 176.A N VAL 172.A O TRP 176.A H 3.232 2.386 TRP 176.A NE1 SER 202.A OG TRP 176.A HE1 3.094 2.424 GLN 177.A N GLN 174.A O GLN 177.A H 2.915 2.086 TYR 178.A N ASP 175.A O TYR 178.A H 3.222 2.373 ASN 179.A N TRP 176.A O ASN 179.A H 2.830 1.999 ASN 179.A ND2 SER 184.A O ASN 179.A HD21 3.608 3.098 ASN 179.A ND2 ASN 199.A OD1 ASN 179.A HD21 2.947 2.153 ASN 180.A ND2 TYR 346.A O ASN 180.A HD21 2.939 2.419 GLN 181.A N GLN 177.A O GLN 181.A H 3.042 2.262 GLN 181.A NE2 PRO 264.A O GLN 181.A HE21 2.923 2.075 GLY 182.A N ASN 180.A O GLY 182.A H 2.797 1.979 GLY 183.A N ASN 179.A O GLY 183.A H 2.839 2.017 SER 184.A OG LEU 186.A O SER 184.A HG 2.850 2.433 ASP 187.A N LYS 191.A O ASP 187.A H 2.758 1.949 ASP 189.A N ASP 187.A OD1 ASP 189.A H 2.859 2.210 GLY 190.A N ASP 187.A O GLY 190.A H 2.971 2.145 LYS 191.A N ASP 187.A OD1 LYS 191.A H 2.927 2.085 ALA 193.A N ILE 185.A O ALA 193.A H 2.756 1.922 LEU 194.A N GLN 382.A OE1 LEU 194.A H 2.907 2.122 ASN 195.A ND2 ASP 379.A OD1 ASN 195.A HD22 2.869 2.015 ASN 199.A N SER 196.A OG ASN 199.A H 3.244 2.449 ASN 199.A ND2 SER 184.A O ASN 199.A HD21 2.945 2.125 ASN 199.A ND2 LEU 194.A O ASN 199.A HD22 3.129 2.299 VAL 200.A N SER 196.A O VAL 200.A H 3.014 2.204 LYS 201.A N PRO 197.A O LYS 201.A H 2.975 2.122 SER 202.A N GLU 198.A O SER 202.A H 2.865 2.048 SER 202.A OG ASN 179.A OD1 SER 202.A HG 2.798 2.036 LEU 203.A N ASN 199.A O LEU 203.A H 2.881 2.051 THR 204.A N VAL 200.A O THR 204.A H 3.004 2.211 THR 204.A OG1 VAL 200.A O THR 204.A HG1 2.736 1.965 VAL 205.A N LYS 201.A O VAL 205.A H 3.041 2.210 TYR 206.A N SER 202.A O TYR 206.A H 2.911 2.072 LYS 207.A N LEU 203.A O LYS 207.A H 2.836 2.014 LYS 207.A NZ VAL 367.A O LYS 207.A HZ2 3.249 2.597 GLN 208.A N THR 204.A O GLN 208.A H 3.165 2.313 GLN 208.A NE2 GLU 212.A OE2 GLN 208.A HE21 2.962 2.273 LEU 209.A N VAL 205.A O LEU 209.A H 2.929 2.097 PHE 210.A N TYR 206.A O PHE 210.A H 2.859 2.023 VAL 211.A N LYS 207.A O VAL 211.A H 2.823 1.980 GLU 212.A N GLN 208.A O GLU 212.A H 2.905 2.110 THR 213.A N LEU 209.A O THR 213.A H 2.925 2.179 THR 213.A OG1 LEU 209.A O THR 213.A HG1 2.729 1.889 ALA 214.A N PHE 210.A O ALA 214.A H 3.180 2.372 ALA 218.A N PRO 215.A O ALA 218.A H 2.951 2.109 GLU 220.A N GLY 217.A O GLU 220.A H 3.098 2.255 TYR 221.A N ALA 218.A O TYR 221.A H 2.941 2.104 GLY 225.A N ASP 222.A OD1 GLY 225.A H 2.989 2.198 ARG 226.A N ASP 222.A O ARG 226.A H 2.909 2.094 ARG 226.A NE ASP 175.A OD2 ARG 226.A HE 2.752 1.993 ARG 226.A NH1 THR 238.A OG1 ARG 226.A HH12 2.944 2.135 ARG 226.A NH2 ASP 175.A OD1 ARG 226.A HH21 2.967 2.136 ARG 226.A NH2 ASP 175.A OD2 ARG 226.A HH21 3.485 2.910 GLU 227.A N TRP 223.A O GLU 227.A H 2.923 2.079 GLU 228.A N GLY 224.A O GLU 228.A H 2.970 2.158 SER 229.A N GLY 225.A O SER 229.A H 3.032 2.198 PHE 230.A N ARG 226.A O PHE 230.A H 2.938 2.109 ARG 231.A N GLU 227.A O ARG 231.A H 2.853 2.000 ARG 231.A NE SER 251.A O ARG 231.A HE 3.169 2.444 GLN 232.A N GLU 228.A O GLN 232.A H 2.890 2.106 GLY 233.A N PHE 230.A O GLY 233.A H 2.982 2.189 ALA 234.A N SER 229.A O ALA 234.A H 3.091 2.237 ALA 236.A N TYR 160.A O ALA 236.A H 2.964 2.302 GLN 237.A NE2 ASN 122.A OD1 GLN 237.A HE21 2.813 1.955 THR 238.A N VAL 123.A O THR 238.A H 2.901 2.064 THR 238.A OG1 GLU 227.A OE2 THR 238.A HG1 2.564 1.806 SER 240.A 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PHE 296.A N ALA 292.A O PHE 296.A H 2.924 2.112 ILE 297.A N ALA 293.A O ILE 297.A H 2.960 2.144 LYS 298.A N TRP 294.A O LYS 298.A H 2.971 2.121 LYS 298.A NZ ASP 88.A OD2 LYS 298.A HZ3 2.936 2.051 LYS 298.A NZ GLU 91.A OE1 LYS 298.A HZ2 2.811 1.954 TRP 299.A N THR 295.A O TRP 299.A H 2.986 2.159 TRP 299.A NE1 ASP 31.A OD2 TRP 299.A HE1 2.944 2.123 LEU 300.A N PHE 296.A O LEU 300.A H 2.867 2.067 VAL 301.A N ILE 297.A O VAL 301.A H 3.095 2.279 SER 302.A N LYS 298.A O SER 302.A H 3.186 2.560 SER 302.A N TRP 299.A O SER 302.A H 3.353 2.592 SER 302.A OG TRP 299.A O SER 302.A HG 2.772 2.005 LYS 303.A NZ ASP 93.A OD2 LYS 303.A HZ2 2.450 1.613 ILE 305.A N SER 302.A OG ILE 305.A H 3.410 2.566 HIS 306.A N SER 302.A O HIS 306.A H 2.789 1.938 HIS 306.A NE2 PHE 117.A O HIS 306.A HE2 2.739 1.911 LYS 307.A N LYS 303.A O LYS 307.A H 2.987 2.196 LYS 307.A NZ ASP 322.A OD2 LYS 307.A HZ2 2.657 1.841 LYS 307.A NZ ASP 324.A OD2 LYS 307.A HZ1 2.791 1.941 GLU 308.A N LYS 304.A O GLU 308.A H 3.194 2.364 PHE 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GLY 342.A H 3.184 2.404 ASN 343.A N TYR 273.A O ASN 343.A H 2.863 2.016 GLU 345.A N ASN 343.A OD1 GLU 345.A H 2.843 2.134 TYR 346.A N ASN 343.A O TYR 346.A H 3.233 2.549 TYR 346.A OH GLN 181.A OE1 TYR 346.A HH 2.641 1.863 ARG 349.A NE GLU 345.A OE2 ARG 349.A HE 2.775 2.022 ARG 349.A NH1 SER 104.A O ARG 349.A HH11 2.837 2.240 ARG 349.A NH1 GLN 107.A O ARG 349.A HH12 2.767 1.918 TYR 353.A N ILE 350.A O TYR 353.A H 2.947 2.092 TYR 353.A OH GLN 357.A OE1 TYR 353.A HH 2.715 1.987 ILE 356.A N GLU 352.A O ILE 356.A H 3.015 2.167 GLN 357.A N TYR 353.A O GLN 357.A H 2.722 1.888 GLN 357.A NE2 TYR 42.A OH GLN 357.A HE22 3.186 2.373 ASP 358.A N PRO 354.A O ASP 358.A H 3.198 2.396 ILE 359.A N GLU 355.A O ILE 359.A H 3.099 2.258 LEU 360.A N ILE 356.A O LEU 360.A H 2.787 1.932 GLY 361.A N GLN 357.A O GLY 361.A H 2.848 2.055 SER 362.A N ASP 358.A O SER 362.A H 3.023 2.205 SER 362.A OG ILE 359.A O SER 362.A HG 2.582 1.891 ALA 363.A N ILE 359.A O ALA 363.A H 3.166 2.344 VAL 364.A N LEU 360.A O VAL 364.A 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