Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5iyn_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A NZ GLU 237.A O LYS 1.A HZ3 2.708 2.014 THR 9.A N GLU 12.A OE1 THR 9.A H 2.987 2.153 GLU 12.A N THR 9.A O GLU 12.A H 3.024 2.250 MET 13.A N VAL 10.A O MET 13.A H 3.115 2.276 SER 14.A N GLU 229.A OE1 SER 14.A H 2.817 1.991 SER 14.A OG GLU 229.A OE2 SER 14.A HG 2.742 1.961 ASN 15.A N ILE 20.A O ASN 15.A H 2.844 2.009 ASN 15.A ND2 SER 209.A OG ASN 15.A HD22 2.909 2.079 ASN 15.A ND2 LEU 222.A O ASN 15.A HD21 3.341 2.659 SER 16.A OG LEU 226.A O SER 16.A HG 2.666 2.223 ARG 17.A N ASN 15.A OD1 ARG 17.A H 2.786 1.966 ARG 17.A NE ASP 101.A OD1 ARG 17.A HE 3.022 2.265 ARG 17.A NE ASP 101.A OD2 ARG 17.A HE 3.094 2.350 ARG 17.A NH1 GLN 175.A OE1 ARG 17.A HH12 3.057 2.432 ARG 17.A NH1 ASP 223.A O ARG 17.A HH11 2.819 1.989 ARG 17.A NH2 ASP 101.A OD1 ARG 17.A HH21 2.885 2.103 ARG 17.A NH2 GLN 175.A O ARG 17.A HH22 2.752 1.966 ILE 20.A N PHE 18.A O ILE 20.A H 2.813 2.122 LEU 22.A N MET 13.A O LEU 22.A H 2.936 2.093 GLU 23.A N ARG 208.A O GLU 23.A H 2.892 2.051 LYS 24.A N ARG 208.A O LYS 24.A H 3.199 2.434 TYR 26.A N PHE 206.A O TYR 26.A H 2.996 2.162 THR 27.A N TYR 278.A O THR 27.A H 2.981 2.152 THR 27.A OG1 LEU 204.A O THR 27.A HG1 2.765 1.931 GLN 36.A NE2 ALA 192.A O GLN 36.A HE21 2.957 2.119 GLN 38.A N ASP 101.A OD2 GLN 38.A H 2.913 2.171 GLN 38.A NE2 GLN 36.A O GLN 38.A HE21 2.982 2.151 GLN 38.A NE2 ALA 192.A O GLN 38.A HE22 3.215 2.368 ASN 39.A N ASP 101.A OD2 ASN 39.A H 2.997 2.136 ASN 39.A ND2 THR 99.A O ASN 39.A HD21 2.832 2.060 ARG 41.A N THR 52.A OG1 ARG 41.A H 2.878 2.034 ARG 41.A NH1 PRO 37.A O ARG 41.A HH11 2.818 2.040 ARG 41.A NH1 PRO 193.A O ARG 41.A HH12 2.892 2.137 ARG 41.A NH2 PRO 193.A O ARG 41.A HH22 2.862 2.092 THR 43.A N VAL 47.A O THR 43.A H 2.972 2.165 THR 44.A N LYS 266.A O THR 44.A H 2.863 2.054 GLY 46.A N THR 43.A O GLY 46.A H 2.966 2.128 VAL 47.A N THR 43.A OG1 VAL 47.A H 2.963 2.117 LEU 49.A N ARG 41.A O LEU 49.A H 2.952 2.119 THR 51.A N GLN 38.A O THR 51.A H 2.960 2.188 THR 51.A OG1 ASN 39.A OD1 THR 51.A HG1 2.855 2.067 THR 52.A N LEU 49.A O THR 52.A H 3.068 2.230 THR 52.A OG1 GLN 38.A O THR 52.A HG1 2.930 2.276 THR 52.A OG1 LEU 49.A O THR 52.A HG1 3.077 2.496 GLN 53.A NE2 SER 55.A O GLN 53.A HE22 2.853 2.020 SER 55.A N GLN 53.A OE1 no hydrogen 3.288 N/A VAL 57.A N SER 55.A OG.A VAL 57.A H 3.294 2.473 ASN 58.A N SER 55.A O ASN 58.A H 3.295 2.440 ILE 59.A N ALA 56.A O ILE 59.A H 3.230 2.373 CYS 60.A N GLY 98.A O CYS 60.A H 2.806 1.952 ASN 61.A N ASN 58.A O ASN 61.A H 3.326 2.485 ASN 61.A ND2 ILE 59.A O ASN 61.A HD22 3.004 2.292 PHE 62.A N PHE 159.A O PHE 62.A H 3.359 2.562 GLY 64.A N THR 157.A O GLY 64.A H 2.997 2.204 THR 67.A N THR 76.A O THR 67.A H 2.951 2.178 ARG 68.A NE GLY 70.A O ARG 68.A HE 2.969 2.199 ARG 68.A NH1 ASN 148.A O ARG 68.A HH11 2.764 1.996 VAL 69.A N ASP 74.A O VAL 69.A H 2.804 1.947 SER 72.A N VAL 69.A O SER 72.A H 3.013 2.188 SER 72.A OG VAL 69.A O SER 72.A HG 2.706 1.922 ASP 74.A N SER 72.A OG ASP 74.A H 2.951 2.110 TYR 75.A N PHE 143.A O TYR 75.A H 2.884 2.075 THR 76.A N THR 67.A O THR 76.A H 2.865 2.033 MET 77.A N VAL 141.A O MET 77.A H 2.796 1.948 ASN 78.A N ASP 65.A O ASN 78.A H 2.973 2.159 ASN 78.A ND2 ASP 65.A OD2 ASN 78.A HD22 3.377 2.531 LEU 79.A N GLY 139.A O LEU 79.A H 2.931 2.093 VAL 80.A N ARG 63.A O VAL 80.A H 2.903 2.068 SER 81.A N ASN 85.A O SER 81.A H 2.756 1.917 TRP 84.A N SER 81.A O TRP 84.A H 2.882 2.038 ASN 85.A N SER 81.A OG ASN 85.A H 3.086 2.364 ASN 85.A N ASN 83.A OD1 ASN 85.A H 3.186 2.430 ASN 85.A ND2 ASN 83.A OD1 ASN 85.A HD21 2.941 2.387 THR 90.A N ASP 88.A OD1 THR 90.A H 2.869 2.033 THR 90.A OG1 ASP 88.A OD1 THR 90.A HG1 2.769 1.933 THR 90.A OG1 ASP 88.A OD2 THR 90.A HG1 3.312 2.689 GLU 91.A N ASP 88.A O GLU 91.A H 3.122 2.293 ILE 93.A N GLU 91.A O ILE 93.A H 2.903 2.160 GLY 98.A N THR 51.A O GLY 98.A H 2.783 1.993 THR 99.A N PRO 96.A O THR 99.A H 3.123 2.307 THR 99.A OG1 PRO 96.A O THR 99.A HG1 2.571 1.820 GLY 104.A N THR 129.A OG1 GLY 104.A H 2.896 2.116 LYS 105.A NZ ASP 167.A OD2 LYS 105.A HZ3 3.009 2.211 LYS 105.A NZ GLU 172.A OE1 LYS 105.A HZ2 3.368 2.690 LYS 105.A NZ GLU 172.A OE2 LYS 105.A HZ2 3.089 2.227 ILE 106.A N VAL 127.A O ILE 106.A H 2.915 2.078 GLN 107.A N GLY 163.A O GLN 107.A H 2.824 2.027 GLN 107.A NE2 THR 126.A OG1.A GLN 107.A HE21 3.045 2.194 GLY 108.A N ALA 125.A O GLY 108.A H 2.896 2.085 LEU 109.A N THR 160.A O LEU 109.A H 3.131 2.370 LEU 110.A N HIS 123.A O LEU 110.A H 2.877 2.050 THR 111.A N LYS 158.A O THR 111.A H 2.837 1.997 GLN 112.A N ARG 121.A O GLN 112.A H 2.973 2.224 GLN 112.A NE2 GLN 152.A O GLN 112.A HE22 2.923 2.236 GLN 112.A NE2 THR 157.A OG1 GLN 112.A HE21 2.873 2.022 THR 113.A N ASN 156.A O THR 113.A H 3.289 2.488 THR 114.A N SER 119.A O THR 114.A H 2.831 1.989 THR 114.A OG1 GLN 152.A OE1 THR 114.A HG1 2.632 2.076 ARG 115.A N GLN 155.A OE1 ARG 115.A H 2.977 2.143 GLY 118.A N THR 114.A O GLY 118.A H 2.810 2.070 SER 119.A N ASP 117.A OD1 SER 119.A H 2.953 2.113 SER 119.A OG ASP 117.A OD1 SER 119.A HG 2.714 1.920 ARG 121.A N GLN 112.A O ARG 121.A H 3.078 2.355 ARG 121.A NH1 GLN 112.A OE1 ARG 121.A HH11 2.991 2.243 ARG 121.A NH1 THR 114.A OG1 ARG 121.A HH12 2.912 2.186 ARG 121.A NH2 THR 114.A OG1 ARG 121.A HH22 3.064 2.373 ARG 121.A NH2 SER 119.A OG ARG 121.A HH22 3.041 2.401 HIS 123.A N LEU 110.A O HIS 123.A H 2.917 2.118 HIS 123.A NE2 ASP 150.A OD2 HIS 123.A HE2 2.628 1.790 LYS 124.A N ASP 146.A OD2 LYS 124.A H 2.896 2.152 ALA 125.A N GLY 108.A O ALA 125.A H 2.995 2.182 THR 126.A N THR 144.A O no hydrogen 2.788 N/A THR 126.A OG1.B ILE 106.A O no hydrogen 3.294 N/A VAL 127.A N ILE 106.A O VAL 127.A H 2.914 2.103 THR 129.A N GLY 104.A O THR 129.A H 2.809 1.956 THR 129.A OG1 PHE 102.A O THR 129.A HG1 2.681 1.883 SER 131.A N SER 128.A O SER 131.A H 3.221 2.378 HIS 133.A N SER 131.A OG HIS 133.A H 2.935 2.080 PHE 134.A N SER 131.A O PHE 134.A H 3.044 2.196 THR 135.A N SER 140.A O THR 135.A H 3.062 2.320 THR 135.A OG1 SER 140.A O THR 135.A HG1 2.969 2.442 LYS 137.A N TYR 181.A O LYS 137.A H 3.011 2.187 LYS 137.A NZ PRO 89.A O LYS 137.A HZ2 2.848 2.157 LYS 137.A NZ ILE 93.A O LYS 137.A HZ3 2.915 2.046 LEU 138.A N THR 135.A O LEU 138.A H 2.904 2.211 GLY 139.A N PRO 136.A O GLY 139.A H 2.929 2.204 SER 140.A N THR 135.A O SER 140.A H 3.217 2.362 VAL 141.A N MET 77.A O VAL 141.A H 3.157 2.388 GLN 142.A NE2 ASP 74.A OD2 GLN 142.A HE21 2.843 1.995 PHE 143.A N TYR 75.A O PHE 143.A H 2.778 1.932 THR 144.A N THR 126.A O THR 144.A H 2.876 2.081 THR 144.A OG1 ASP 74.A OD1 THR 144.A HG1 2.884 2.074 THR 144.A OG1 ASP 74.A OD2 THR 144.A HG1 3.364 2.684 THR 145.A N HIS 73.A O THR 145.A H 2.870 2.053 THR 145.A OG1 HIS 73.A O THR 145.A HG1 3.027 2.202 ASP 146.A N LYS 124.A O ASP 146.A H 3.104 2.443 THR 147.A N THR 145.A OG1 THR 147.A H 3.077 2.225 ASN 149.A N THR 147.A OG1 no hydrogen 3.237 N/A GLN 152.A N GLN 112.A OE1 GLN 152.A H 2.834 1.983 THR 157.A N GLY 64.A O THR 157.A H 2.946 2.255 THR 157.A OG1 GLN 155.A O THR 157.A HG1 2.841 2.055 LYS 158.A N THR 111.A O LYS 158.A H 2.897 2.086 PHE 159.A N PHE 62.A O PHE 159.A H 2.772 1.943 THR 160.A N LEU 109.A O THR 160.A H 2.947 2.106 VAL 162.A N GLN 107.A O VAL 162.A H 2.859 2.048 GLY 163.A N GLN 107.A O GLY 163.A H 3.117 2.292 VAL 164.A N PRO 212.A O VAL 164.A H 2.902 2.117 ILE 165.A N LYS 105.A O ILE 165.A H 2.953 2.157 GLN 166.A N SER 215.A O GLN 166.A H 2.968 2.170 GLN 166.A NE2 GLY 168.A O GLN 166.A HE22 3.016 2.210 GLN 166.A NE2 ASN 171.A OD1 GLN 166.A HE21 2.878 2.049 ASP 167.A N GLU 172.A OE2 ASP 167.A H 2.959 2.159 GLN 170.A N TYR 217.A O GLN 170.A H 2.724 1.934 ASN 171.A ND2 ASP 167.A O ASN 171.A HD21 3.679 2.858 GLN 174.A N VAL 103.A O no hydrogen 2.835 N/A GLN 174.A NE2.B ASN 171.A O no hydrogen 2.757 N/A GLN 175.A NE2 ASP 223.A OD2 GLN 175.A HE22 2.935 2.148 VAL 177.A N GLN 174.A O VAL 177.A H 3.211 2.363 TYR 181.A N ASN 188.A OD1 TYR 181.A H 2.894 2.085 GLY 183.A N ASN 180.A O GLY 183.A H 2.975 2.129 SER 185.A N SER 182.A O SER 185.A H 3.210 2.401 ASN 188.A ND2 PRO 179.A O ASN 188.A HD21 2.885 2.046 ALA 192.A N GLN 38.A OE1 ALA 192.A H 2.791 1.996 VAL 195.A N VAL 35.A O VAL 195.A H 2.868 2.080 GLU 202.A N PHE 199.A O GLU 202.A H 3.250 2.469 GLN 203.A N VAL 272.A O GLN 203.A H 2.856 2.040 GLN 203.A NE2 THR 27.A OG1 GLN 203.A HE21 3.065 2.263 GLN 203.A NE2 GLY 276.A O GLN 203.A HE22 2.898 2.040 LEU 205.A N ILE 270.A O LEU 205.A H 2.878 2.046 PHE 206.A N TYR 26.A O PHE 206.A H 2.740 1.885 PHE 207.A N CYS 224.A O PHE 207.A H 2.921 2.062 ARG 208.A N LYS 24.A O ARG 208.A H 2.866 2.010 ARG 208.A NE ASP 223.A OD1 ARG 208.A HE 2.719 1.875 ARG 208.A NH2 ASP 223.A OD1 ARG 208.A HH21 3.550 2.949 ARG 208.A NH2 ASP 223.A OD2 ARG 208.A HH21 2.851 2.003 SER 209.A N LEU 222.A O SER 209.A H 2.897 2.053 THR 210.A N GLU 23.A OE2 THR 210.A H 2.802 2.013 THR 210.A OG1 GLU 23.A OE1 THR 210.A HG1 2.722 2.010 MET 211.A N MET 220.A O MET 211.A H 2.718 1.885 CYS 214.A N VAL 164.A O CYS 214.A H 2.858 2.073 TYR 217.A N GLN 166.A OE1 TYR 217.A H 2.841 1.995 ASN 219.A N GLU 172.A O ASN 219.A H 2.935 2.114 ASN 221.A N ASN 219.A OD1 ASN 221.A H 3.197 2.388 LEU 222.A N SER 209.A O LEU 222.A H 3.057 2.254 ASP 223.A N GLN 175.A OE1 ASP 223.A H 2.821 1.972 CYS 224.A N PHE 207.A O CYS 224.A H 2.816 1.978 GLN 228.A N SER 14.A O GLN 228.A H 2.997 2.150 GLN 228.A NE2 GLN 53.A O GLN 228.A HE22 2.908 2.152 GLU 229.A N GLU 229.A OE1 GLU 229.A H 2.714 1.977 TRP 230.A N PRO 227.A O TRP 230.A H 2.983 2.324 VAL 231.A N PRO 227.A O VAL 231.A H 3.230 2.409 SER 232.A N GLN 228.A O no hydrogen 3.023 N/A SER 232.A OG.A GLU 229.A O no hydrogen 3.123 N/A HIS 233.A N GLU 229.A O HIS 233.A H 3.056 2.253 HIS 233.A NE2 THR 4.A OG1 HIS 233.A HE2 2.898 2.077 PHE 234.A N TRP 230.A O PHE 234.A H 2.862 2.008 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 2.991 2.145 GLN 236.A N SER 232.A O GLN 236.A H 3.095 2.307 GLN 236.A NE2 SER 232.A O GLN 236.A HE21 3.418 2.647 GLN 236.A NE2 SER 232.A OG.B GLN 236.A HE21 3.290 2.625 GLU 237.A N HIS 233.A O GLU 237.A H 2.898 2.047 ALA 238.A N PHE 234.A O ALA 238.A H 2.902 2.067 SER 243.A OG VAL 294.A O SER 243.A HG 2.597 1.945 VAL 245.A N SER 243.A OG VAL 245.A H 3.255 2.406 ALA 246.A N LEU 264.A O ALA 246.A H 2.763 1.905 LEU 247.A N SER 292.A O LEU 247.A H 2.702 1.850 LEU 248.A N CYS 262.A O LEU 248.A H 2.927 2.094 ARG 249.A N ARG 289.A O ARG 249.A H 2.873 2.039 ARG 249.A NE GLU 261.A OE1 ARG 249.A HE 2.839 2.029 ARG 249.A NH1 ASP 291.A OD2 ARG 249.A HH11 2.739 1.898 ARG 249.A NH2 GLU 261.A OE1 ARG 249.A HH21 3.039 2.310 PHE 250.A N PHE 260.A O PHE 250.A H 2.858 2.008 VAL 251.A N TYR 287.A O no hydrogen 2.802 N/A ASN 252.A N ARG 257.A O ASN 252.A H 2.922 2.066 ASP 254.A N ASN 252.A OD1 ASP 254.A H 3.091 2.311 THR 255.A N ASN 252.A O THR 255.A H 3.165 2.319 GLY 256.A N ASN 252.A O GLY 256.A H 2.743 2.101 ARG 257.A N THR 255.A OG1 ARG 257.A H 3.145 2.310 LEU 259.A N PHE 250.A O LEU 259.A H 2.833 2.024 CYS 262.A N LEU 248.A O CYS 262.A H 2.882 2.082 LYS 263.A N THR 271.A O LYS 263.A H 2.928 2.085 LYS 263.A NZ GLU 202.A OE2 LYS 263.A HZ2 2.772 1.907 LYS 263.A NZ TYR 298.A O LYS 263.A HZ1 2.762 2.073 LEU 264.A N ALA 246.A O LEU 264.A H 2.736 1.898 HIS 265.A N TYR 269.A O HIS 265.A H 2.830 2.011 HIS 265.A NE2 THR 271.A OG1 HIS 265.A HE2 2.972 2.117 LYS 266.A N ASP 244.A O LYS 266.A H 2.936 2.104 GLY 268.A N HIS 265.A O GLY 268.A H 2.806 1.970 THR 271.A N LYS 263.A O THR 271.A H 2.891 2.101 THR 271.A OG1 GLU 202.A OE1 THR 271.A HG1 2.748 2.092 VAL 272.A N GLN 203.A O VAL 272.A H 2.824 2.008 GLY 276.A N GLN 203.A OE1 GLY 276.A H 2.821 1.981 TYR 278.A N THR 27.A O TYR 278.A H 2.798 2.018 LEU 280.A N LEU 25.A O LEU 280.A H 3.000 2.187 ASN 285.A ND2 ASP 254.A OD1 ASN 285.A HD22 3.207 2.497 ASN 285.A ND2 ASP 254.A OD2 ASN 285.A HD22 3.130 2.319 GLY 286.A N PRO 283.A O GLY 286.A H 3.066 2.212 TYR 287.A N VAL 251.A O TYR 287.A H 3.078 2.294 ARG 289.A N ARG 249.A O ARG 289.A H 2.793 2.042 ARG 289.A NE ASP 291.A OD1 ARG 289.A HE 2.727 1.942 ARG 289.A NH2 ASP 291.A OD2 ARG 289.A HH21 3.035 2.185 ASP 291.A N LEU 247.A O ASP 291.A H 2.919 2.060 VAL 294.A N VAL 245.A O VAL 294.A H 2.929 2.076 PHE 297.A N ASN 295.A OD1 PHE 297.A H 2.507 1.799 TYR 298.A N ASN 295.A O no hydrogen 3.289 N/A ALA 301.A N GLU 261.A OE2 ALA 301.A H 2.872 2.022 MET 303.A N ALA 273.A O MET 303.A H 2.986 2.139