Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5iyp_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A NZ GLU 237.A O LYS 1.A HZ1 2.818 1.969 THR 9.A N GLU 12.A OE1 THR 9.A H 2.951 2.116 GLU 12.A N THR 9.A O GLU 12.A H 3.046 2.305 MET 13.A N VAL 10.A O MET 13.A H 3.039 2.207 SER 14.A N GLU 229.A OE1 SER 14.A H 2.819 2.000 ASN 15.A N ILE 20.A O ASN 15.A H 2.886 2.043 ASN 15.A ND2 SER 209.A OG ASN 15.A HD22 2.928 2.096 ASN 15.A ND2 LEU 222.A O ASN 15.A HD21 3.222 2.515 SER 16.A OG LEU 226.A O SER 16.A HG 2.686 2.251 ARG 17.A N ASN 15.A OD1 ARG 17.A H 2.835 2.044 ARG 17.A NE ASP 101.A OD1 ARG 17.A HE 3.026 2.262 ARG 17.A NE ASP 101.A OD2 ARG 17.A HE 3.150 2.391 ARG 17.A NH1 GLN 175.A OE1 ARG 17.A HH12 2.983 2.339 ARG 17.A NH1 ASP 223.A O ARG 17.A HH11 2.771 1.936 ARG 17.A NH2 ASP 101.A O ARG 17.A HH21 3.538 2.878 ARG 17.A NH2 ASP 101.A OD1 ARG 17.A HH21 2.920 2.138 ARG 17.A NH2 GLN 175.A O ARG 17.A HH22 2.799 2.018 ILE 20.A N PHE 18.A O ILE 20.A H 2.806 2.113 LEU 22.A N MET 13.A O LEU 22.A H 2.949 2.119 GLU 23.A N ARG 208.A O GLU 23.A H 2.866 2.034 LYS 24.A N ARG 208.A O LYS 24.A H 3.217 2.466 TYR 26.A N PHE 206.A O TYR 26.A H 2.995 2.170 THR 27.A N TYR 278.A O THR 27.A H 3.030 2.202 THR 27.A OG1 LEU 204.A O THR 27.A HG1 2.778 1.944 GLN 36.A NE2 ALA 192.A O GLN 36.A HE21 2.972 2.132 GLN 38.A N ASP 101.A OD2 GLN 38.A H 2.843 2.106 GLN 38.A NE2 GLN 36.A O GLN 38.A HE21 2.956 2.122 GLN 38.A NE2 ALA 192.A O GLN 38.A HE22 3.194 2.347 ASN 39.A N ASP 101.A OD2 ASN 39.A H 2.999 2.143 ASN 39.A ND2 THR 99.A O ASN 39.A HD21 2.828 2.073 ARG 41.A N THR 52.A OG1 ARG 41.A H 2.867 2.041 ARG 41.A NH1 PRO 37.A O ARG 41.A HH11 2.846 2.068 ARG 41.A NH1 PRO 193.A O ARG 41.A HH12 2.912 2.157 ARG 41.A NH2 PRO 193.A O ARG 41.A HH22 2.850 2.074 CYS 42.A SG THR 43.A O CYS 42.A HG 3.430 2.252 THR 43.A N VAL 47.A O THR 43.A H 2.971 2.156 THR 44.A N LYS 266.A O THR 44.A H 2.831 2.026 GLY 46.A N THR 43.A O GLY 46.A H 2.906 2.067 VAL 47.A N THR 43.A OG1 VAL 47.A H 2.914 2.066 LEU 49.A N ARG 41.A O LEU 49.A H 2.969 2.158 THR 51.A N GLN 38.A O THR 51.A H 2.945 2.174 THR 51.A OG1 ASN 39.A OD1 THR 51.A HG1 2.825 2.035 THR 52.A N LEU 49.A O THR 52.A H 2.993 2.152 THR 52.A OG1 GLN 38.A O THR 52.A HG1 2.943 2.249 THR 52.A OG1 LEU 49.A O THR 52.A HG1 3.131 2.579 GLN 53.A NE2 SER 55.A O GLN 53.A HE22 2.884 2.046 SER 55.A N GLN 53.A OE1 SER 55.A H 3.177 2.323 VAL 57.A N SER 55.A OG VAL 57.A H 3.244 2.434 ASN 58.A N SER 55.A O ASN 58.A H 3.293 2.442 ILE 59.A N ALA 56.A O ILE 59.A H 3.177 2.319 CYS 60.A N GLY 98.A O CYS 60.A H 2.839 1.986 ASN 61.A N ASN 58.A O ASN 61.A H 3.306 2.464 ASN 61.A ND2 ILE 59.A O ASN 61.A HD22 3.057 2.335 PHE 62.A N PHE 159.A O PHE 62.A H 3.228 2.433 GLY 64.A N THR 157.A O GLY 64.A H 3.032 2.238 THR 67.A N THR 76.A O THR 67.A H 2.958 2.169 ARG 68.A NE GLY 70.A O ARG 68.A HE 2.913 2.140 ARG 68.A NH1 ASN 148.A O ARG 68.A HH11 2.790 2.032 VAL 69.A N ASP 74.A O VAL 69.A H 2.833 1.976 SER 72.A N VAL 69.A O SER 72.A H 3.005 2.178 SER 72.A OG VAL 69.A O SER 72.A HG 2.698 1.915 ASP 74.A N SER 72.A OG ASP 74.A H 2.983 2.140 TYR 75.A N PHE 143.A O TYR 75.A H 2.856 2.056 THR 76.A N THR 67.A O THR 76.A H 2.821 2.017 MET 77.A N VAL 141.A O MET 77.A H 2.836 1.987 ASN 78.A N ASP 65.A O ASN 78.A H 2.930 2.144 ASN 78.A ND2 ASP 65.A OD2 ASN 78.A HD22 3.176 2.330 LEU 79.A N GLY 139.A O LEU 79.A H 2.877 2.046 VAL 80.A N ARG 63.A O VAL 80.A H 2.874 2.041 SER 81.A N ASN 85.A O SER 81.A H 2.760 1.922 TRP 84.A N SER 81.A O TRP 84.A H 2.852 2.006 ASN 85.A N SER 81.A OG ASN 85.A H 3.055 2.354 ASN 85.A ND2 ASN 83.A OD1 ASN 85.A HD22 2.903 2.336 THR 90.A N ASP 88.A OD1 THR 90.A H 2.887 2.070 THR 90.A OG1 ASP 88.A OD1 THR 90.A HG1 2.740 1.902 THR 90.A OG1 ASP 88.A OD2 THR 90.A HG1 3.206 2.630 GLU 91.A N ASP 88.A O GLU 91.A H 3.086 2.251 ILE 93.A N GLU 91.A O ILE 93.A H 2.806 2.050 GLY 98.A N THR 51.A O GLY 98.A H 2.823 2.037 THR 99.A N PRO 96.A O THR 99.A H 3.078 2.234 VAL 103.A N VAL 177.A O VAL 103.A H 2.950 2.353 GLY 104.A N THR 129.A OG1 GLY 104.A H 2.891 2.122 LYS 105.A NZ ASP 167.A OD2 LYS 105.A HZ3 2.967 2.129 LYS 105.A NZ GLU 172.A OE1 LYS 105.A HZ2 3.158 2.507 LYS 105.A NZ GLU 172.A OE2 LYS 105.A HZ2 2.840 1.962 ILE 106.A N VAL 127.A O ILE 106.A H 2.906 2.078 GLN 107.A N GLY 163.A O GLN 107.A H 2.806 2.015 GLN 107.A NE2 THR 126.A OG1 GLN 107.A HE21 2.993 2.139 GLY 108.A N ALA 125.A O GLY 108.A H 2.892 2.102 LEU 109.A N THR 160.A O LEU 109.A H 3.134 2.401 LEU 110.A N HIS 123.A O LEU 110.A H 2.875 2.040 THR 111.A N LYS 158.A O THR 111.A H 2.796 1.960 GLN 112.A N ARG 121.A O GLN 112.A H 2.984 2.226 GLN 112.A NE2 GLN 152.A O GLN 112.A HE22 2.908 2.229 GLN 112.A NE2 THR 157.A OG1 GLN 112.A HE21 2.928 2.069 THR 113.A N ASN 156.A O THR 113.A H 3.287 2.487 THR 114.A N SER 119.A O THR 114.A H 2.842 2.006 THR 114.A OG1 GLN 152.A OE1 THR 114.A HG1 2.723 2.150 ARG 115.A N GLN 155.A OE1 ARG 115.A H 3.005 2.186 ARG 115.A NH1 GLY 154.A O ARG 115.A HH12 2.754 1.946 ARG 115.A NH2 GLY 154.A O ARG 115.A HH22 3.314 2.678 ARG 115.A NH2 ASN 156.A OD1 ARG 115.A HH21 3.108 2.439 GLY 118.A N THR 114.A O GLY 118.A H 2.894 2.129 SER 119.A N ASP 117.A OD1 SER 119.A H 2.971 2.128 SER 119.A OG ASP 117.A OD1 SER 119.A HG 2.701 1.914 ARG 121.A N GLN 112.A O ARG 121.A H 3.107 2.447 ARG 121.A NH1 GLN 112.A OE1 ARG 121.A HH11 2.943 2.212 ARG 121.A NH1 THR 114.A OG1 ARG 121.A HH12 2.887 2.161 ARG 121.A NH2 THR 114.A OG1 ARG 121.A HH22 2.977 2.266 ARG 121.A NH2 SER 119.A OG ARG 121.A HH22 2.967 2.341 HIS 123.A N LEU 110.A O HIS 123.A H 2.959 2.158 HIS 123.A ND1 ASP 146.A OD1 HIS 123.A HD1 2.677 1.981 HIS 123.A NE2 ASP 150.A OD2 HIS 123.A HE2 2.670 1.818 LYS 124.A N ASP 146.A OD2 LYS 124.A H 2.959 2.196 ALA 125.A N GLY 108.A O ALA 125.A H 3.019 2.229 THR 126.A N THR 144.A O THR 126.A H 2.845 2.041 VAL 127.A N ILE 106.A O VAL 127.A H 2.851 2.046 THR 129.A N GLY 104.A O THR 129.A H 2.886 2.029 THR 129.A OG1 PHE 102.A O THR 129.A HG1 2.699 1.893 SER 131.A N SER 128.A O SER 131.A H 3.167 2.324 HIS 133.A N SER 131.A OG HIS 133.A H 2.962 2.115 PHE 134.A N SER 131.A O PHE 134.A H 2.987 2.139 THR 135.A N SER 140.A O THR 135.A H 3.071 2.352 THR 135.A OG1 SER 140.A O THR 135.A HG1 3.011 2.461 LYS 137.A N TYR 181.A O LYS 137.A H 2.957 2.139 LYS 137.A NZ PRO 89.A O LYS 137.A HZ1 2.846 2.091 LYS 137.A NZ ILE 93.A O LYS 137.A HZ2 2.854 2.005 LEU 138.A N THR 135.A O LEU 138.A H 2.866 2.142 GLY 139.A N PRO 136.A O GLY 139.A H 2.879 2.108 SER 140.A N THR 135.A O SER 140.A H 3.234 2.382 VAL 141.A N MET 77.A O VAL 141.A H 3.209 2.452 GLN 142.A NE2 ASP 74.A OD2 GLN 142.A HE21 2.792 1.945 PHE 143.A N TYR 75.A O PHE 143.A H 2.782 1.940 THR 144.A N THR 126.A O THR 144.A H 2.918 2.132 THR 144.A OG1 ASP 74.A OD1 THR 144.A HG1 2.919 2.109 THR 144.A OG1 ASP 74.A OD2 THR 144.A HG1 3.382 2.706 THR 145.A N HIS 73.A O THR 145.A H 2.924 2.136 ASP 146.A N LYS 124.A O ASP 146.A H 3.095 2.440 THR 147.A N THR 145.A OG1 THR 147.A H 3.070 2.218 ASN 149.A N THR 147.A OG1 ASN 149.A H 3.113 2.258 ASP 150.A N THR 147.A OG1 ASP 150.A H 3.013 2.269 GLN 152.A N GLN 112.A OE1 GLN 152.A H 2.868 2.016 GLN 155.A NE2 THR 153.A O GLN 155.A HE21 3.509 2.772 THR 157.A N GLY 64.A O THR 157.A H 2.901 2.208 THR 157.A OG1 GLN 155.A O THR 157.A HG1 2.787 2.035 LYS 158.A N THR 111.A O LYS 158.A H 2.887 2.076 PHE 159.A N PHE 62.A O PHE 159.A H 2.770 1.943 THR 160.A N LEU 109.A O THR 160.A H 2.976 2.137 VAL 162.A N GLN 107.A O VAL 162.A H 2.843 2.033 GLY 163.A N GLN 107.A O GLY 163.A H 3.072 2.248 VAL 164.A N PRO 212.A O VAL 164.A H 2.895 2.114 ILE 165.A N LYS 105.A O ILE 165.A H 2.959 2.166 GLN 166.A N SER 215.A O GLN 166.A H 3.016 2.237 GLN 166.A NE2 GLY 168.A O GLN 166.A HE22 2.835 2.028 GLN 166.A NE2 ASN 171.A OD1 GLN 166.A HE21 3.064 2.244 ASP 167.A N GLU 172.A OE2 ASP 167.A H 2.956 2.174 GLN 170.A N TYR 217.A O GLN 170.A H 2.710 1.919 GLN 174.A N VAL 103.A O no hydrogen 2.838 N/A GLN 174.A NE2.B ASN 171.A O no hydrogen 2.762 N/A GLN 175.A NE2 ASP 223.A OD2 GLN 175.A HE22 2.984 2.190 VAL 177.A N GLN 174.A O VAL 177.A H 3.179 2.324 TYR 181.A N ASN 188.A OD1 TYR 181.A H 2.918 2.111 GLY 183.A N ASN 180.A O GLY 183.A H 2.931 2.079 SER 185.A N SER 182.A O SER 185.A H 3.198 2.411 SER 185.A OG SER 182.A O SER 185.A HG 2.774 1.938 ASN 188.A ND2 PRO 179.A O ASN 188.A HD21 2.810 1.970 ALA 192.A N GLN 38.A OE1 ALA 192.A H 2.807 2.024 VAL 195.A N VAL 35.A O no hydrogen 2.887 N/A GLU 202.A N PHE 199.A O GLU 202.A H 3.217 2.434 GLN 203.A N VAL 272.A O GLN 203.A H 2.902 2.089 GLN 203.A NE2 THR 27.A OG1 GLN 203.A HE21 3.083 2.270 GLN 203.A NE2 GLY 276.A O GLN 203.A HE22 2.892 2.033 LEU 205.A N ILE 270.A O LEU 205.A H 2.891 2.061 PHE 206.A N TYR 26.A O PHE 206.A H 2.768 1.927 PHE 207.A N CYS 224.A O PHE 207.A H 2.938 2.081 ARG 208.A N LYS 24.A O ARG 208.A H 2.852 1.997 ARG 208.A NE ASP 223.A OD1 ARG 208.A HE 2.748 1.897 ARG 208.A NH2 ASP 223.A OD1 ARG 208.A HH21 3.532 2.917 ARG 208.A NH2 ASP 223.A OD2 ARG 208.A HH21 2.878 2.021 SER 209.A N LEU 222.A O SER 209.A H 2.892 2.051 SER 209.A OG PRO 21.A O SER 209.A HG 2.720 2.152 THR 210.A N GLU 23.A OE2 THR 210.A H 2.903 2.101 MET 211.A N MET 220.A O MET 211.A H 2.792 1.987 CYS 214.A N VAL 164.A O CYS 214.A H 2.811 2.009 TYR 217.A N GLN 166.A OE1 TYR 217.A H 2.839 2.010 ASN 219.A N GLU 172.A O ASN 219.A H 2.853 2.034 ASN 221.A N ASN 219.A OD1 ASN 221.A H 3.089 2.260 LEU 222.A N SER 209.A O LEU 222.A H 2.934 2.133 ASP 223.A N GLN 175.A OE1 ASP 223.A H 2.853 1.997 CYS 224.A N PHE 207.A O CYS 224.A H 2.836 1.993 GLN 228.A N SER 14.A O GLN 228.A H 2.997 2.151 GLN 228.A NE2 GLN 53.A O GLN 228.A HE22 2.927 2.143 GLU 229.A N GLU 229.A OE1 GLU 229.A H 2.744 2.030 TRP 230.A N PRO 227.A O TRP 230.A H 2.974 2.271 VAL 231.A N PRO 227.A O VAL 231.A H 3.257 2.442 SER 232.A N GLN 228.A O no hydrogen 3.037 N/A SER 232.A OG.A GLU 229.A O no hydrogen 3.075 N/A HIS 233.A N GLU 229.A O HIS 233.A H 3.022 2.234 HIS 233.A NE2 THR 4.A OG1 no hydrogen 2.815 N/A PHE 234.A N TRP 230.A O PHE 234.A H 2.906 2.056 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 2.985 2.132 GLN 236.A N SER 232.A O GLN 236.A H 3.097 2.283 GLN 236.A NE2 SER 232.A O GLN 236.A HE21 3.398 2.617 GLN 236.A NE2 SER 232.A OG.B GLN 236.A HE21 3.303 2.648 GLU 237.A N HIS 233.A O GLU 237.A H 2.854 2.011 ALA 238.A N PHE 234.A O ALA 238.A H 2.867 2.043 GLN 242.A NE2.A PRO 240.A O no hydrogen 3.590 N/A ALA 246.A N LEU 264.A O ALA 246.A H 2.834 1.977 LEU 247.A N SER 292.A O LEU 247.A H 2.755 1.903 LEU 248.A N CYS 262.A O LEU 248.A H 2.936 2.095 ARG 249.A N ARG 289.A O ARG 249.A H 2.864 2.041 ARG 249.A NE GLU 261.A OE1 ARG 249.A HE 2.750 1.940 ARG 249.A NH1 ASP 291.A OD2 ARG 249.A HH11 2.816 1.975 ARG 249.A NH2 GLU 261.A OE1 ARG 249.A HH21 2.966 2.246 PHE 250.A N PHE 260.A O PHE 250.A H 2.816 1.958 VAL 251.A N TYR 287.A O no hydrogen 2.850 N/A ASN 252.A N ARG 257.A O ASN 252.A H 2.943 2.092 ASP 254.A N ASN 252.A OD1 ASP 254.A H 2.999 2.196 THR 255.A N ASN 252.A O THR 255.A H 3.085 2.243 GLY 256.A N ASN 252.A O GLY 256.A H 2.787 2.098 ARG 257.A N THR 255.A OG1 ARG 257.A H 3.093 2.252 LEU 259.A N PHE 250.A O no hydrogen 2.765 N/A CYS 262.A N LEU 248.A O CYS 262.A H 2.860 2.070 LYS 263.A N THR 271.A O LYS 263.A H 2.897 2.062 LYS 263.A NZ GLU 202.A OE2 LYS 263.A HZ2 2.734 1.856 LYS 263.A NZ GLN 296.A O.A LYS 263.A HZ3 3.131 2.501 LYS 263.A NZ TYR 298.A O.A LYS 263.A HZ1 2.814 2.145 LYS 263.A NZ TYR 298.A O.B LYS 263.A HZ1 2.802 2.067 LEU 264.A N ALA 246.A O LEU 264.A H 2.752 1.907 HIS 265.A N TYR 269.A O HIS 265.A H 2.798 1.972 HIS 265.A NE2 THR 271.A OG1 HIS 265.A HE2 2.971 2.122 LYS 266.A N ASP 244.A O LYS 266.A H 2.892 2.054 GLY 268.A N HIS 265.A O GLY 268.A H 2.807 1.986 THR 271.A N LYS 263.A O THR 271.A H 2.926 2.152 THR 271.A OG1 GLU 202.A OE1 THR 271.A HG1 2.704 2.061 VAL 272.A N GLN 203.A O VAL 272.A H 2.887 2.075 GLY 276.A N GLN 203.A OE1 GLY 276.A H 2.839 1.995 TYR 278.A N THR 27.A O TYR 278.A H 2.812 2.046 LEU 280.A N LEU 25.A O LEU 280.A H 3.033 2.259 ASN 285.A ND2.A ASP 254.A OD1 no hydrogen 3.371 N/A ASN 285.A ND2.B ASN 252.A OD1 no hydrogen 2.938 N/A GLY 286.A N PRO 283.A O GLY 286.A H 3.034 2.184 TYR 287.A N VAL 251.A O TYR 287.A H 3.077 2.295 ARG 289.A N ARG 249.A O ARG 289.A H 2.793 2.035 ARG 289.A NE ASP 291.A OD1 ARG 289.A HE 2.691 1.926 ARG 289.A NH2 ASP 291.A OD2 ARG 289.A HH21 2.945 2.097 ASP 291.A N LEU 247.A O ASP 291.A H 2.933 2.073 VAL 294.A N.A VAL 245.A O no hydrogen 2.848 N/A VAL 294.A N.B VAL 245.A O no hydrogen 2.896 N/A PHE 297.A N.A ASN 295.A OD1.A no hydrogen 2.755 N/A PHE 297.A N.B ASN 295.A OD1.B no hydrogen 3.039 N/A TYR 298.A N.A ASN 295.A O.A no hydrogen 3.176 N/A TYR 298.A N.B ASN 295.A O.A no hydrogen 3.208 N/A ALA 301.A N GLU 261.A OE2 ALA 301.A H 2.834 1.986 MET 303.A N ALA 273.A O MET 303.A H 2.924 2.071