Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5iyr_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A NZ GLU 237.A O LYS 1.A HZ3 2.818 1.981 THR 9.A N GLU 12.A OE1 THR 9.A H 2.995 2.168 GLU 12.A N THR 9.A O GLU 12.A H 3.040 2.270 MET 13.A N VAL 10.A O MET 13.A H 3.061 2.229 SER 14.A N GLU 229.A OE1 SER 14.A H 2.832 1.994 ASN 15.A N ILE 20.A O ASN 15.A H 2.901 2.049 ASN 15.A ND2 SER 209.A OG ASN 15.A HD22 2.908 2.080 ASN 15.A ND2 LEU 222.A O ASN 15.A HD21 3.216 2.527 ARG 17.A N ASN 15.A OD1 ARG 17.A H 2.835 2.026 ARG 17.A NE ASP 101.A OD1 ARG 17.A HE 3.026 2.257 ARG 17.A NE ASP 101.A OD2 ARG 17.A HE 3.201 2.454 ARG 17.A NH1 GLN 175.A OE1 ARG 17.A HH12 3.001 2.389 ARG 17.A NH1 ASP 223.A O ARG 17.A HH11 2.774 1.933 ARG 17.A NH2 ASP 101.A O ARG 17.A HH21 3.484 2.832 ARG 17.A NH2 ASP 101.A OD1 ARG 17.A HH21 2.946 2.165 ARG 17.A NH2 GLN 175.A O ARG 17.A HH22 2.765 1.961 ILE 20.A N PHE 18.A O ILE 20.A H 2.766 2.067 LEU 22.A N MET 13.A O LEU 22.A H 2.938 2.101 GLU 23.A N ARG 208.A O GLU 23.A H 2.878 2.046 LYS 24.A N ARG 208.A O LYS 24.A H 3.198 2.441 TYR 26.A N PHE 206.A O TYR 26.A H 2.985 2.163 THR 27.A N TYR 278.A O THR 27.A H 2.997 2.165 THR 27.A OG1 LEU 204.A O THR 27.A HG1 2.763 1.928 GLN 36.A NE2 ALA 192.A O GLN 36.A HE21 2.920 2.085 GLN 38.A N ASP 101.A OD2 GLN 38.A H 2.792 2.049 GLN 38.A NE2 GLN 36.A O GLN 38.A HE21 2.958 2.125 GLN 38.A NE2 ALA 192.A O GLN 38.A HE22 3.239 2.388 ASN 39.A N ASP 101.A OD2 ASN 39.A H 2.994 2.136 ASN 39.A ND2 THR 99.A O ASN 39.A HD21 2.793 2.040 ARG 41.A N THR 52.A OG1 ARG 41.A H 2.847 2.006 ARG 41.A NH1 PRO 37.A O ARG 41.A HH11 2.863 2.097 ARG 41.A NH1 PRO 193.A O ARG 41.A HH12 2.938 2.188 ARG 41.A NH2 PRO 193.A O ARG 41.A HH22 2.871 2.098 CYS 42.A SG VAL 231.A O CYS 42.A HG 3.957 2.758 THR 43.A N VAL 47.A O THR 43.A H 2.944 2.130 THR 44.A N LYS 266.A O THR 44.A H 2.849 2.034 GLY 46.A N THR 43.A O GLY 46.A H 2.954 2.114 VAL 47.A N THR 43.A OG1 VAL 47.A H 2.947 2.097 LEU 49.A N ARG 41.A O LEU 49.A H 2.974 2.145 THR 51.A N GLN 38.A O THR 51.A H 2.900 2.154 THR 51.A OG1 ASN 39.A OD1 THR 51.A HG1 2.810 2.025 THR 52.A N LEU 49.A O THR 52.A H 3.022 2.181 THR 52.A OG1 GLN 38.A O THR 52.A HG1 2.967 2.263 THR 52.A OG1 LEU 49.A O THR 52.A HG1 3.135 2.587 GLN 53.A NE2 SER 55.A O GLN 53.A HE22 2.914 2.072 SER 55.A N GLN 53.A OE1 no hydrogen 3.090 N/A SER 55.A OG ASN 58.A OD1.A no hydrogen 2.247 N/A ASN 58.A N SER 55.A O no hydrogen 3.373 N/A ILE 59.A N ALA 56.A O ILE 59.A H 3.315 2.457 CYS 60.A N GLY 98.A O CYS 60.A H 2.819 1.971 ASN 61.A N ASN 58.A O ASN 61.A H 3.310 2.476 ASN 61.A ND2 ILE 59.A O ASN 61.A HD21 3.020 2.308 PHE 62.A N PHE 159.A O PHE 62.A H 3.275 2.478 ARG 63.A NH1 ASN 58.A OD1.B ARG 63.A HH12 3.029 2.236 GLY 64.A N THR 157.A O GLY 64.A H 2.996 2.199 THR 67.A N THR 76.A O no hydrogen 2.904 N/A ARG 68.A NE GLY 70.A O ARG 68.A HE 2.909 2.128 ARG 68.A NH1 ASN 148.A O ARG 68.A HH11 2.826 2.107 VAL 69.A N ASP 74.A O VAL 69.A H 2.818 1.962 SER 72.A N VAL 69.A O SER 72.A H 3.047 2.214 SER 72.A OG VAL 69.A O SER 72.A HG 2.667 1.882 ASP 74.A N SER 72.A OG ASP 74.A H 2.969 2.122 TYR 75.A N PHE 143.A O TYR 75.A H 2.888 2.081 THR 76.A N THR 67.A O THR 76.A H 2.848 2.043 MET 77.A N VAL 141.A O MET 77.A H 2.844 1.996 ASN 78.A N ASP 65.A O ASN 78.A H 2.922 2.147 ASN 78.A ND2 ASP 65.A OD2 ASN 78.A HD22 3.273 2.438 LEU 79.A N GLY 139.A O LEU 79.A H 2.849 2.021 VAL 80.A N ARG 63.A O VAL 80.A H 2.868 2.034 SER 81.A N ASN 85.A O SER 81.A H 2.778 1.931 TRP 84.A N SER 81.A O TRP 84.A H 2.908 2.059 ASN 85.A N SER 81.A OG ASN 85.A H 3.051 2.328 ASN 85.A ND2 ASN 83.A OD1 ASN 85.A HD21 3.333 2.811 THR 90.A N ASP 88.A OD1 THR 90.A H 2.853 2.029 THR 90.A OG1 ASP 88.A OD1 THR 90.A HG1 2.678 1.838 THR 90.A OG1 ASP 88.A OD2 THR 90.A HG1 3.183 2.608 GLU 91.A N ASP 88.A O GLU 91.A H 3.117 2.284 ILE 93.A N GLU 91.A O ILE 93.A H 2.817 2.064 GLY 98.A N THR 51.A O GLY 98.A H 2.826 2.041 THR 99.A N PRO 96.A O THR 99.A H 3.126 2.284 THR 99.A OG1 PRO 96.A O THR 99.A HG1 2.634 1.867 VAL 103.A N VAL 177.A O VAL 103.A H 2.957 2.353 GLY 104.A N THR 129.A OG1 GLY 104.A H 2.851 2.096 LYS 105.A NZ ASP 167.A OD2 LYS 105.A HZ3 3.137 2.412 LYS 105.A NZ GLU 172.A OE2 LYS 105.A HZ2 3.035 2.192 ILE 106.A N VAL 127.A O ILE 106.A H 2.887 2.053 GLN 107.A N GLY 163.A O GLN 107.A H 2.770 1.978 GLN 107.A NE2 THR 126.A OG1 GLN 107.A HE21 3.010 2.157 GLY 108.A N ALA 125.A O GLY 108.A H 2.881 2.080 LEU 109.A N THR 160.A O LEU 109.A H 3.102 2.377 LEU 110.A N HIS 123.A O LEU 110.A H 2.903 2.060 THR 111.A N LYS 158.A O THR 111.A H 2.803 1.961 GLN 112.A N ARG 121.A O GLN 112.A H 2.991 2.237 GLN 112.A NE2 GLN 152.A O GLN 112.A HE22 2.912 2.194 GLN 112.A NE2 THR 157.A OG1 GLN 112.A HE21 2.960 2.106 THR 113.A N ASN 156.A O THR 113.A H 3.273 2.465 THR 114.A N SER 119.A O THR 114.A H 2.795 1.961 THR 114.A OG1 GLN 152.A OE1 THR 114.A HG1 2.671 2.132 ARG 115.A N GLN 155.A OE1 ARG 115.A H 3.022 2.203 ARG 115.A NH2 GLY 154.A O ARG 115.A HH21 3.247 2.690 GLY 118.A N THR 114.A O GLY 118.A H 2.860 2.107 SER 119.A N ASP 117.A OD1 SER 119.A H 2.938 2.104 SER 119.A OG ASP 117.A OD1 SER 119.A HG 2.655 1.887 ARG 121.A N GLN 112.A O ARG 121.A H 3.053 2.371 ARG 121.A NH1 GLN 112.A OE1 ARG 121.A HH11 2.894 2.158 ARG 121.A NH1 THR 114.A OG1 ARG 121.A HH12 2.939 2.232 ARG 121.A NH2 THR 114.A OG1 ARG 121.A HH22 2.964 2.250 ARG 121.A NH2 SER 119.A OG ARG 121.A HH22 2.991 2.386 HIS 123.A N LEU 110.A O HIS 123.A H 2.952 2.151 HIS 123.A ND1 ASP 146.A OD1 HIS 123.A HD1 2.865 2.211 HIS 123.A NE2 ASP 150.A OD2 HIS 123.A HE2 2.652 1.799 LYS 124.A N ASP 146.A OD2 LYS 124.A H 3.004 2.268 ALA 125.A N GLY 108.A O ALA 125.A H 3.026 2.210 THR 126.A N THR 144.A O THR 126.A H 2.838 2.041 VAL 127.A N ILE 106.A O VAL 127.A H 2.893 2.084 THR 129.A N GLY 104.A O THR 129.A H 2.837 1.980 THR 129.A OG1 PHE 102.A O THR 129.A HG1 2.693 1.894 SER 131.A N SER 128.A O SER 131.A H 3.184 2.342 HIS 133.A N SER 131.A OG HIS 133.A H 2.992 2.140 PHE 134.A N SER 131.A O PHE 134.A H 2.998 2.149 THR 135.A N SER 140.A O THR 135.A H 3.092 2.362 THR 135.A OG1 SER 140.A O THR 135.A HG1 3.008 2.483 LYS 137.A N TYR 181.A O LYS 137.A H 2.964 2.144 LYS 137.A NZ PRO 89.A O LYS 137.A HZ2 2.840 2.125 LYS 137.A NZ ILE 93.A O LYS 137.A HZ3 2.889 2.022 LEU 138.A N THR 135.A O LEU 138.A H 2.877 2.149 GLY 139.A N PRO 136.A O GLY 139.A H 2.950 2.212 SER 140.A N THR 135.A O SER 140.A H 3.268 2.416 VAL 141.A N MET 77.A O VAL 141.A H 3.217 2.459 GLN 142.A NE2 ASP 74.A OD2 GLN 142.A HE21 2.818 2.003 PHE 143.A N TYR 75.A O PHE 143.A H 2.812 1.967 THR 144.A N THR 126.A O THR 144.A H 2.892 2.091 THR 144.A OG1 ASP 74.A OD1 THR 144.A HG1 2.982 2.174 THR 144.A OG1 ASP 74.A OD2 THR 144.A HG1 3.313 2.630 THR 145.A N HIS 73.A O THR 145.A H 2.946 2.139 THR 145.A OG1 HIS 73.A O THR 145.A HG1 2.942 2.108 ASP 146.A N LYS 124.A O ASP 146.A H 3.098 2.459 THR 147.A N THR 145.A OG1 THR 147.A H 3.038 2.186 ASN 149.A N THR 147.A OG1 ASN 149.A H 3.188 2.348 ASN 149.A ND2 ASN 148.A OD1 ASN 149.A HD22 2.833 2.033 GLN 152.A N GLN 112.A OE1 GLN 152.A H 2.883 2.026 GLN 155.A NE2 THR 153.A O GLN 155.A HE21 3.487 2.750 THR 157.A N GLY 64.A O THR 157.A H 2.878 2.163 LYS 158.A N THR 111.A O LYS 158.A H 2.867 2.052 PHE 159.A N PHE 62.A O PHE 159.A H 2.767 1.940 THR 160.A N LEU 109.A O THR 160.A H 2.958 2.114 VAL 162.A N GLN 107.A O VAL 162.A H 2.868 2.053 GLY 163.A N GLN 107.A O GLY 163.A H 3.100 2.270 VAL 164.A N PRO 212.A O VAL 164.A H 2.888 2.108 ILE 165.A N LYS 105.A O ILE 165.A H 2.959 2.159 GLN 166.A N SER 215.A O GLN 166.A H 2.997 2.213 GLN 166.A NE2 GLY 168.A O GLN 166.A HE22 2.966 2.173 GLN 166.A NE2 ASN 171.A OD1 GLN 166.A HE21 3.165 2.337 ASP 167.A N GLU 172.A OE2 ASP 167.A H 2.950 2.116 GLN 170.A N TYR 217.A O GLN 170.A H 2.687 1.918 GLN 174.A N VAL 103.A O GLN 174.A H 2.874 2.029 GLN 175.A NE2 ASP 223.A OD2 GLN 175.A HE22 2.983 2.205 VAL 177.A N GLN 174.A O VAL 177.A H 3.207 2.349 TYR 181.A N ASN 188.A OD1 TYR 181.A H 2.922 2.108 GLY 183.A N ASN 180.A O GLY 183.A H 2.949 2.102 SER 185.A N SER 182.A O SER 185.A H 3.167 2.376 ASN 188.A ND2 PRO 179.A O ASN 188.A HD21 2.799 1.959 ALA 192.A N GLN 38.A OE1 ALA 192.A H 2.791 2.013 VAL 195.A N VAL 35.A O VAL 195.A H 2.846 2.029 GLU 202.A N PHE 199.A O GLU 202.A H 3.162 2.386 GLN 203.A N VAL 272.A O GLN 203.A H 2.895 2.077 GLN 203.A NE2 THR 27.A OG1 GLN 203.A HE21 3.095 2.281 GLN 203.A NE2 GLY 276.A O GLN 203.A HE22 2.863 2.003 LEU 205.A N ILE 270.A O LEU 205.A H 2.872 2.039 PHE 206.A N TYR 26.A O PHE 206.A H 2.777 1.930 PHE 207.A N CYS 224.A O PHE 207.A H 2.939 2.091 ARG 208.A N LYS 24.A O ARG 208.A H 2.863 2.012 ARG 208.A NE ASP 223.A OD1 ARG 208.A HE 2.747 1.889 ARG 208.A NH2 ASP 223.A OD1 ARG 208.A HH21 3.549 2.939 ARG 208.A NH2 ASP 223.A OD2 ARG 208.A HH21 2.913 2.056 SER 209.A N LEU 222.A O SER 209.A H 2.913 2.073 SER 209.A OG PRO 21.A O SER 209.A HG 2.748 2.215 THR 210.A N GLU 23.A OE2 THR 210.A H 2.859 2.036 THR 210.A OG1 GLU 23.A OE1 THR 210.A HG1 2.751 1.986 MET 211.A N MET 220.A O MET 211.A H 2.820 2.025 CYS 214.A N VAL 164.A O CYS 214.A H 2.834 2.038 TYR 217.A N GLN 166.A OE1 TYR 217.A H 2.852 2.022 ASN 219.A N GLU 172.A O ASN 219.A H 2.830 2.011 ASN 221.A N ASN 219.A OD1 ASN 221.A H 3.146 2.317 LEU 222.A N SER 209.A O LEU 222.A H 2.998 2.190 ASP 223.A N GLN 175.A OE1 ASP 223.A H 2.826 1.970 CYS 224.A N PHE 207.A O CYS 224.A H 2.828 1.985 GLN 228.A N SER 14.A O GLN 228.A H 2.985 2.143 GLN 228.A NE2 GLN 53.A O GLN 228.A HE22 2.937 2.167 GLU 229.A N GLU 229.A OE1 GLU 229.A H 2.681 1.952 TRP 230.A N PRO 227.A O TRP 230.A H 2.997 2.301 VAL 231.A N PRO 227.A O VAL 231.A H 3.251 2.430 SER 232.A N GLN 228.A O no hydrogen 3.034 N/A SER 232.A OG.A GLU 229.A O no hydrogen 3.087 N/A HIS 233.A N GLU 229.A O HIS 233.A H 3.014 2.218 HIS 233.A NE2 THR 4.A OG1 no hydrogen 2.859 N/A PHE 234.A N TRP 230.A O PHE 234.A H 2.880 2.034 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 2.979 2.130 GLN 236.A N SER 232.A O GLN 236.A H 3.065 2.265 GLN 236.A NE2 SER 232.A O GLN 236.A HE21 3.391 2.632 GLN 236.A NE2 SER 232.A OG.B GLN 236.A HE21 3.238 2.565 GLU 237.A N HIS 233.A O GLU 237.A H 2.883 2.045 ALA 238.A N PHE 234.A O ALA 238.A H 2.828 1.988 GLN 242.A NE2 PRO 240.A O GLN 242.A HE21 3.647 3.093 SER 243.A OG VAL 294.A O SER 243.A HG 2.741 2.035 VAL 245.A N SER 243.A OG VAL 245.A H 3.166 2.317 ALA 246.A N LEU 264.A O ALA 246.A H 2.810 1.950 LEU 247.A N SER 292.A O LEU 247.A H 2.752 1.907 LEU 248.A N CYS 262.A O LEU 248.A H 2.903 2.066 ARG 249.A N ARG 289.A O ARG 249.A H 2.899 2.069 ARG 249.A NE GLU 261.A OE1 ARG 249.A HE 2.845 2.043 ARG 249.A NH1 ASP 291.A OD2 ARG 249.A HH11 2.663 1.833 ARG 249.A NH2 GLU 261.A OE1 ARG 249.A HH21 3.027 2.299 PHE 250.A N PHE 260.A O PHE 250.A H 2.838 1.985 VAL 251.A N TYR 287.A O VAL 251.A H 2.842 2.005 ASN 252.A N ARG 257.A O ASN 252.A H 2.926 2.071 ASP 254.A N ASN 252.A OD1 ASP 254.A H 2.970 2.168 THR 255.A N ASN 252.A O no hydrogen 3.108 N/A THR 255.A OG1.B ASN 252.A O no hydrogen 3.411 N/A GLY 256.A N ASN 252.A O GLY 256.A H 2.665 2.019 ARG 257.A N THR 255.A OG1.B ARG 257.A H 3.155 2.314 LEU 259.A N PHE 250.A O LEU 259.A H 2.755 1.913 CYS 262.A N LEU 248.A O CYS 262.A H 2.888 2.096 LYS 263.A N THR 271.A O LYS 263.A H 2.941 2.103 LYS 263.A NZ GLU 202.A OE2 LYS 263.A HZ2 2.718 1.851 LYS 263.A NZ TYR 298.A O LYS 263.A HZ1 2.797 2.059 LEU 264.A N ALA 246.A O LEU 264.A H 2.764 1.918 HIS 265.A N TYR 269.A O HIS 265.A H 2.822 2.001 HIS 265.A NE2 THR 271.A OG1 HIS 265.A HE2 2.976 2.123 LYS 266.A N ASP 244.A O LYS 266.A H 2.880 2.046 GLY 268.A N HIS 265.A O GLY 268.A H 2.817 1.985 THR 271.A N LYS 263.A O THR 271.A H 2.897 2.113 THR 271.A OG1 GLU 202.A OE1 THR 271.A HG1 2.718 2.080 VAL 272.A N GLN 203.A O VAL 272.A H 2.880 2.066 GLY 276.A N GLN 203.A OE1 GLY 276.A H 2.826 1.987 TYR 278.A N THR 27.A O TYR 278.A H 2.772 1.986 LEU 280.A N LEU 25.A O LEU 280.A H 3.065 2.280 ASN 285.A ND2 ASP 254.A OD1 ASN 285.A HD22 3.196 2.345 GLY 286.A N PRO 283.A O GLY 286.A H 3.084 2.233 TYR 287.A N VAL 251.A O TYR 287.A H 3.110 2.333 ARG 289.A N ARG 249.A O ARG 289.A H 2.824 2.121 ARG 289.A NE ASP 291.A OD1 ARG 289.A HE 2.852 2.088 ARG 289.A NH2 ASP 291.A OD2 ARG 289.A HH21 3.104 2.257 ASP 291.A N LEU 247.A O ASP 291.A H 2.959 2.100 VAL 294.A N VAL 245.A O VAL 294.A H 2.893 2.053 PHE 297.A N ASN 295.A OD1 no hydrogen 2.813 N/A ALA 301.A N GLU 261.A OE2 ALA 301.A H 2.904 2.055 MET 303.A N ALA 273.A O MET 303.A H 2.918 2.068