Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5jca_S.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): PHE 3.A N ILE 83.A O PHE 3.A H 2.918 2.137 ILE 5.A N ASP 81.A O ILE 5.A H 2.941 2.081 LEU 6.A N GLU 19.A O LEU 6.A H 2.726 1.974 ARG 7.A N GLU 19.A O ARG 7.A H 3.321 2.560 ARG 7.A NE GLU 19.A OE2 ARG 7.A HE 2.970 2.118 ARG 7.A NH1 GLU 9.A OE1 ARG 7.A HH12 2.939 2.136 LYS 8.A NZ GLY 75.A O LYS 8.A HZ1 2.765 1.969 LYS 8.A NZ TYR 77.A O LYS 8.A HZ2 2.766 1.919 GLU 9.A N LEU 17.A O GLU 9.A H 2.926 2.118 LEU 11.A N ILE 15.A O LEU 11.A H 2.920 2.139 ILE 15.A N ALA 12.A O ILE 15.A H 2.919 2.074 ASN 16.A N ALA 64.A O ASN 16.A H 3.075 2.219 ASN 16.A ND2 GLU 66.A OE1 ASN 16.A HD21 2.881 2.142 LEU 17.A N GLU 9.A O LEU 17.A H 2.801 1.947 PHE 18.A N ILE 62.A O PHE 18.A H 2.841 1.997 GLU 19.A N ARG 7.A O GLU 19.A H 2.898 2.077 ILE 20.A N ILE 60.A O ILE 20.A H 2.801 1.964 GLU 21.A N LYS 4.A O GLU 21.A H 2.860 2.018 SER 22.A N GLY 58.A O SER 22.A H 2.839 2.040 ALA 26.A N SER 22.A O ALA 26.A H 2.946 2.097 LYS 27.A N PRO 23.A O LYS 27.A H 2.979 2.193 HIS 28.A N ARG 24.A O HIS 28.A H 3.297 2.627 HIS 28.A N ILE 25.A O HIS 28.A H 3.130 2.408 HIS 28.A ND1 ARG 24.A O HIS 28.A HD1 2.735 1.951 ALA 29.A N ILE 25.A O ALA 29.A H 2.850 2.166 LYS 30.A N GLN 33.A OE1 LYS 30.A H 2.837 2.067 GLN 33.A N LYS 30.A O GLN 33.A H 3.150 2.304 GLN 33.A NE2 GLY 91.A O GLN 33.A HE21 2.869 2.021 PHE 34.A N LEU 90.A O PHE 34.A H 2.985 2.178 VAL 35.A N LEU 48.A O VAL 35.A H 2.808 1.966 MET 36.A N LEU 87.A O MET 36.A H 2.982 2.232 ILE 37.A N ILE 46.A O ILE 37.A H 2.874 2.053 ARG 38.A N ASP 85.A O ARG 38.A H 2.943 2.143 ARG 38.A NE ASP 85.A OD2 ARG 38.A HE 2.749 1.978 ARG 38.A NH2 ASP 85.A OD2 ARG 38.A HH21 2.814 2.076 HIS 40.A NE2 GLU 73.A OE1 HIS 40.A HE2 2.887 2.056 LYS 42.A N HIS 40.A ND1 LYS 42.A H 3.203 2.538 GLY 43.A N HIS 40.A O GLY 43.A H 2.913 2.075 ARG 45.A NE VAL 217.A O ARG 45.A HE 2.797 2.013 ARG 45.A NH2 ASP 218.A O ARG 45.A HH21 2.861 2.084 ILE 46.A N ILE 37.A O ILE 46.A H 2.934 2.137 LEU 48.A N VAL 35.A O LEU 48.A H 2.935 2.121 THR 49.A OG1 GLU 113.A OE2 THR 49.A HG1 2.670 2.004 ILE 50.A N GLN 33.A O ILE 50.A H 3.009 2.155 ALA 51.A N THR 61.A O ALA 51.A H 2.791 2.066 VAL 53.A N ASP 52.A OD1 VAL 53.A H 2.996 2.334 ASP 54.A N SER 59.A O ASP 54.A H 2.873 2.033 SER 56.A OG ASP 54.A OD1 SER 56.A HG 2.719 1.895 LYS 57.A N ASP 54.A O LYS 57.A H 3.184 2.550 LYS 57.A N ASP 54.A OD1 LYS 57.A H 3.097 2.336 LYS 57.A NZ GLU 19.A OE1 LYS 57.A HZ3 3.040 2.344 LYS 57.A NZ GLU 19.A OE2 LYS 57.A HZ3 3.332 2.567 GLY 58.A N ILE 55.A O GLY 58.A H 2.968 2.181 SER 59.A N ASP 54.A O SER 59.A H 2.975 2.136 SER 59.A OG GLU 19.A OE1 SER 59.A HG 2.681 1.841 ILE 60.A N ILE 20.A O ILE 60.A H 2.970 2.158 THR 61.A N ASP 52.A O THR 61.A H 2.894 2.104 ILE 62.A N PHE 18.A O ILE 62.A H 2.960 2.138 ALA 64.A N ASN 16.A O ALA 64.A H 2.856 2.025 GLU 66.A N GLY 14.A O GLU 66.A H 2.761 1.940 VAL 67.A N THR 71.A OG1 VAL 67.A H 2.871 2.022 LYS 69.A NZ GLU 73.A OE1 LYS 69.A HZ3 2.742 1.899 THR 71.A OG1 GLY 68.A O THR 71.A HG1 3.442 3.033 ARG 72.A N GLY 68.A O ARG 72.A H 2.876 2.040 ARG 72.A NH1 GLU 273.A OE2 ARG 72.A HH12 3.109 2.420 ARG 72.A NH2 GLU 273.A OE2 ARG 72.A HH22 2.904 2.150 GLU 73.A N LYS 69.A O GLU 73.A H 2.875 2.037 LEU 74.A N THR 70.A O LEU 74.A H 2.873 2.023 GLY 75.A N THR 71.A O GLY 75.A H 2.992 2.248 THR 76.A N GLU 73.A O THR 76.A H 3.021 2.215 THR 76.A OG1 GLU 73.A O THR 76.A HG1 2.736 1.899 TYR 77.A N LEU 74.A O TYR 77.A H 2.894 2.051 GLU 78.A N ASP 81.A OD2 GLU 78.A H 2.824 1.980 GLY 80.A N ILE 5.A O GLY 80.A H 2.860 2.016 ASP 81.A N GLU 78.A O ASP 81.A H 2.994 2.164 ILE 83.A N PHE 3.A O ILE 83.A H 2.853 2.041 LEU 84.A N LEU 39.A O LEU 84.A H 3.346 2.535 ASP 85.A N ARG 38.A O ASP 85.A H 3.044 2.212 LEU 87.A N MET 36.A O LEU 87.A H 2.829 1.990 LEU 90.A N PHE 34.A O LEU 90.A H 2.771 1.939 LYS 92.A N GLY 241.A O LYS 92.A H 2.790 1.942 LYS 92.A NZ ASP 240.A O LYS 92.A HZ2 3.049 2.246 SER 94.A N PRO 31.A O SER 94.A H 2.846 2.032 SER 94.A OG GLU 243.A OE1 SER 94.A HG 3.474 2.826 SER 94.A OG GLU 243.A OE2 SER 94.A HG 2.668 1.850 HIS 95.A NE2 ASP 97.A OD2 HIS 95.A HE2 2.037 1.197 PHE 99.A N ASN 126.A OD1 PHE 99.A H 2.764 1.934 GLY 100.A N ASN 126.A OD1 GLY 100.A H 3.060 2.292 THR 101.A N ASP 183.A OD2 THR 101.A H 2.834 1.992 VAL 102.A N TYR 127.A O VAL 102.A H 2.808 1.974 VAL 103.A N LEU 184.A O VAL 103.A H 2.838 2.009 MET 104.A N ILE 129.A O MET 104.A H 2.764 1.960 ILE 105.A N HIS 186.A O ILE 105.A H 2.754 1.944 GLY 106.A N ILE 131.A O GLY 106.A H 2.993 2.188 GLY 107.A N VAL 188.A O GLY 107.A H 2.915 2.096 GLY 108.A N GLY 133.A O GLY 108.A H 2.817 1.958 GLY 110.A N GLY 107.A O GLY 110.A H 2.814 2.040 VAL 111.A N GLY 108.A O VAL 111.A H 2.965 2.116 ALA 112.A N VAL 109.A O ALA 112.A H 2.928 2.294 GLU 113.A N VAL 109.A O GLU 113.A H 3.282 2.492 ILE 114.A N GLY 110.A O ILE 114.A H 2.899 2.165 TYR 115.A N ALA 112.A O TYR 115.A H 3.264 2.494 ALA 118.A N ILE 114.A O ALA 118.A H 2.789 1.934 LYS 119.A N TYR 115.A O LYS 119.A H 2.944 2.098 ALA 120.A N PRO 116.A O ALA 120.A H 2.996 2.175 MET 121.A N VAL 117.A O MET 121.A H 2.831 1.986 LYS 122.A N ALA 118.A O LYS 122.A H 2.900 2.076 GLU 123.A N LYS 119.A O GLU 123.A H 2.926 2.101 LYS 124.A N ALA 120.A O LYS 124.A H 3.035 2.302 LYS 124.A NZ ILE 96.A O LYS 124.A HZ2 3.374 2.757 GLY 125.A N LYS 122.A O GLY 125.A H 2.931 2.091 ASN 126.A N MET 121.A O ASN 126.A H 3.192 2.397 ASN 126.A ND2 ASP 97.A O ASN 126.A HD21 3.050 2.190 ASN 126.A ND2 MET 121.A O ASN 126.A HD22 2.904 2.086 TYR 127.A N GLY 100.A O TYR 127.A H 2.900 2.117 TYR 127.A OH GLU 152.A OE2 TYR 127.A HH 2.575 1.746 VAL 128.A N ASP 151.A OD2 VAL 128.A H 2.884 2.054 ILE 129.A N VAL 102.A O ILE 129.A H 2.941 2.103 SER 130.A N GLU 152.A O SER 130.A H 2.876 2.043 ILE 131.A N MET 104.A O ILE 131.A H 2.754 1.939 LEU 132.A N ILE 154.A O LEU 132.A H 2.856 2.022 GLY 133.A N GLY 106.A O GLY 133.A H 2.776 1.954 PHE 134.A N THR 156.A O PHE 134.A H 2.987 2.180 THR 136.A OG1 ASP 159.A OD1 THR 136.A HG1 3.547 2.748 THR 136.A OG1 ASP 159.A OD2 THR 136.A HG1 2.591 1.901 LYS 137.A N SER 161.A OG LYS 137.A H 2.886 2.233 LEU 139.A N THR 136.A O LEU 139.A H 3.005 2.184 VAL 140.A N LYS 137.A O VAL 140.A H 3.031 2.184 LEU 146.A N TRP 142.A O LEU 146.A H 2.883 2.030 ARG 147.A N GLU 143.A O ARG 147.A H 2.889 2.064 ARG 147.A NH2 GLU 143.A OE1 ARG 147.A HH21 2.686 1.919 SER 148.A N ASP 144.A O SER 148.A H 2.942 2.245 SER 148.A N LYS 145.A O SER 148.A H 3.190 2.535 SER 148.A OG LYS 145.A O SER 148.A HG 2.606 1.770 VAL 149.A N LEU 146.A O VAL 149.A H 3.069 2.257 SER 150.A N ARG 147.A O no hydrogen 3.267 N/A SER 150.A OG SER 130.A OG no hydrogen 2.778 N/A SER 150.A OG LEU 146.A O no hydrogen 2.720 N/A ASP 151.A N VAL 128.A O ASP 151.A H 2.715 1.967 GLU 152.A N VAL 128.A O GLU 152.A H 3.168 2.378 ILE 154.A N SER 130.A O ILE 154.A H 2.855 2.034 THR 156.A N LEU 132.A O THR 156.A H 2.834 1.993 THR 156.A OG1 LEU 132.A O THR 156.A HG1 2.948 2.141 THR 157.A N MET 164.A O THR 157.A H 2.957 2.184 THR 157.A OG1 TYR 162.A O THR 157.A HG1 2.653 1.952 ASN 158.A N PHE 134.A O ASN 158.A H 3.025 2.295 GLY 160.A N THR 157.A O GLY 160.A H 3.106 2.276 SER 161.A N ASP 159.A OD1 SER 161.A H 2.986 2.139 SER 161.A OG ASP 159.A OD1 SER 161.A HG 2.662 1.907 TYR 162.A N THR 157.A OG1 TYR 162.A H 3.078 2.230 TYR 162.A OH GLU 143.A OE2 TYR 162.A HH 2.649 1.864 MET 164.A N VAL 155.A O MET 164.A H 2.849 2.023 GLY 166.A N THR 157.A O GLY 166.A H 2.924 2.088 HIS 170.A N PHE 167.A O HIS 170.A H 2.862 2.224 ALA 171.A N PHE 167.A O ALA 171.A H 3.343 2.556 LEU 172.A N THR 168.A O LEU 172.A H 3.006 2.187 GLN 173.A N THR 169.A O GLN 173.A H 2.855 2.010 GLN 173.A NE2 GLU 177.A OE2 GLN 173.A HE21 2.881 2.070 LYS 174.A N HIS 170.A O LYS 174.A H 3.009 2.201 LYS 174.A NZ GLU 178.A OE2 LYS 174.A HZ3 3.138 2.464 LEU 175.A N ALA 171.A O LEU 175.A H 3.101 2.276 ILE 176.A N LEU 172.A O ILE 176.A H 3.002 2.178 GLU 177.A N GLN 173.A O GLU 177.A H 2.884 2.044 GLU 178.A N LYS 174.A O GLU 178.A H 2.916 2.143 GLY 179.A N ILE 176.A O GLY 179.A H 2.888 2.062 ARG 180.A N LEU 175.A O ARG 180.A H 3.112 2.266 ARG 180.A NH1 GLU 152.A OE1 ARG 180.A HH12 3.084 2.233 ARG 180.A NH1 GLU 152.A OE2 ARG 180.A HH12 3.569 2.966 ARG 180.A NH2 GLU 152.A OE2 ARG 180.A HH22 2.810 2.001 LYS 181.A NZ ASP 183.A OD2 LYS 181.A HZ3 2.739 1.961 ASP 183.A N THR 101.A O ASP 183.A H 2.863 2.047 LEU 184.A N THR 101.A O no hydrogen 3.284 N/A VAL 185.A N LYS 207.A O VAL 185.A H 2.880 2.053 HIS 186.A N VAL 103.A O no hydrogen 2.891 N/A ALA 187.A N VAL 209.A O ALA 187.A H 2.873 2.071 VAL 188.A N ILE 105.A O VAL 188.A H 2.905 2.087 MET 194.A N PRO 190.A O MET 194.A H 2.953 2.131 LYS 195.A N ALA 191.A O LYS 195.A H 2.897 2.041 LYS 195.A NZ ASP 252.A OD1 LYS 195.A HZ2 2.899 2.037 ALA 196.A N ILE 192.A O ALA 196.A H 3.054 2.244 VAL 197.A N MET 193.A O VAL 197.A H 2.904 2.081 ALA 198.A N MET 194.A O ALA 198.A H 2.932 2.090 GLU 199.A N LYS 195.A O GLU 199.A H 2.916 2.095 LEU 200.A N ALA 196.A O LEU 200.A H 3.023 2.249 THR 201.A N VAL 197.A O THR 201.A H 3.018 2.227 LYS 202.A N ALA 198.A O LYS 202.A H 2.988 2.285 TYR 204.A N THR 201.A O TYR 204.A H 3.031 2.329 GLY 205.A N LYS 202.A O GLY 205.A H 3.028 2.187 THR 208.A OG1 THR 201.A OG1 THR 208.A HG1 2.742 1.921 VAL 209.A N VAL 185.A O VAL 209.A H 2.837 2.013 ALA 210.A N PHE 244.A O ALA 210.A H 3.011 2.201 SER 211.A N ALA 187.A O SER 211.A H 3.105 2.307 LEU 212.A N PRO 242.A O LEU 212.A H 2.851 2.012 THR 220.A N ASP 218.A OD2 THR 220.A H 2.921 2.101 THR 220.A OG1 ASP 218.A OD2 THR 220.A HG1 2.864 2.142 MET 222.A N ASP 218.A OD2 MET 222.A H 3.009 2.162 CYS 223.A SG ASP 218.A OD1 no hydrogen 3.200 N/A ARG 227.A N GLY 224.A O ARG 227.A H 3.089 2.305 ARG 227.A NH1 GLY 224.A O ARG 227.A HH11 2.930 2.131 VAL 228.A N LYS 235.A O VAL 228.A H 2.912 2.112 THR 229.A OG1 GLN 253.A OE1 THR 229.A HG1 2.772 2.022 VAL 230.A N GLU 233.A O VAL 230.A H 2.857 2.019 GLY 231.A N LEU 248.A O GLY 231.A H 2.804 1.984 GLU 233.A N VAL 230.A O GLU 233.A H 3.032 2.188 LYS 235.A N VAL 228.A O LYS 235.A H 2.899 2.064 PHE 236.A N ASP 240.A OD2 PHE 236.A H 2.868 2.042 ALA 237.A N CYS 226.A O ALA 237.A H 3.175 2.317 VAL 239.A N PHE 236.A O VAL 239.A H 3.255 2.511 ASP 240.A N PHE 236.A O ASP 240.A H 2.849 1.996 GLY 241.A N ALA 237.A O GLY 241.A H 2.990 2.262 PHE 244.A N ALA 210.A O PHE 244.A H 3.039 2.235 ALA 246.A N THR 208.A O ALA 246.A H 2.861 2.042 HIS 247.A N ASP 245.A OD1 HIS 247.A H 2.929 2.155 LEU 248.A N ASP 245.A O LEU 248.A H 3.009 2.159 ASP 250.A N THR 229.A O ASP 250.A H 2.975 2.176 TRP 251.A NE1 ALA 246.A O TRP 251.A HE1 2.938 2.162 GLN 253.A N ASP 250.A OD1 GLN 253.A H 3.042 2.194 LEU 254.A N ASP 250.A O LEU 254.A H 3.085 2.253 MET 255.A N TRP 251.A O MET 255.A H 2.965 2.129 ASN 256.A N ASP 252.A O ASN 256.A H 2.879 2.042 ARG 257.A N GLN 253.A O ARG 257.A H 2.910 2.076 ARG 257.A NH2 ALA 225.A O ARG 257.A HH21 3.278 2.437 LEU 258.A N LEU 254.A O LEU 258.A H 2.928 2.120 ALA 259.A N MET 255.A O ALA 259.A H 3.246 2.618 ALA 259.A N ASN 256.A O ALA 259.A H 3.143 2.390 TYR 260.A N ARG 257.A O TYR 260.A H 3.260 2.407 ARG 262.A N ALA 259.A O ARG 262.A H 3.178 2.343 GLU 265.A N TYR 261.A O GLU 265.A H 2.827 1.983 LYS 266.A N ARG 262.A O LYS 266.A H 3.053 2.239 ILE 267.A N ASP 263.A O ILE 267.A H 3.027 2.212 SER 268.A N LEU 264.A O SER 268.A H 2.934 2.122 LEU 269.A N GLU 265.A O LEU 269.A H 3.025 2.173 GLU 270.A N LYS 266.A O GLU 270.A H 2.854 2.013 LYS 271.A N ILE 267.A O LYS 271.A H 2.964 2.162 LYS 271.A NZ GLU 275.A OE2 LYS 271.A HZ3 3.252 2.448 TRP 272.A N SER 268.A O TRP 272.A H 3.075 2.242 GLU 273.A N LEU 269.A O GLU 273.A H 2.944 2.114 ARG 274.A N GLU 270.A O ARG 274.A H 2.837 2.021 GLU 275.A N LYS 271.A O GLU 275.A H 3.003 2.227 ARG 276.A N GLU 273.A O ARG 276.A H 3.180 2.346 ARG 277.A NE ARG 274.A O ARG 277.A HE 2.792 1.938