Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5k0k_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 5.A N LEU 1.A O VAL 5.A H 2.938 2.096 ILE 6.A N VAL 76.A O ILE 6.A H 2.711 1.952 ARG 8.A NE GLU 79.A OE1 ARG 8.A HE 2.943 2.101 ARG 8.A NH1 ARG 8.A O ARG 8.A HH11 2.962 2.127 ARG 8.A NH2 GLU 79.A OE1 ARG 8.A HH21 3.331 2.625 LEU 10.A N ASP 7.A O LEU 10.A H 2.987 2.161 LEU 11.A N ARG 8.A O LEU 11.A H 3.043 2.239 ILE 12.A N ASN 26.A O ILE 12.A H 3.218 2.409 GLY 14.A N GLU 24.A O GLY 14.A H 2.953 2.161 LYS 15.A N GLU 24.A OE2 LYS 15.A H 2.929 2.104 LEU 17.A N VAL 22.A O LEU 17.A H 2.916 2.105 SER 21.A N THR 41.A OG1 SER 21.A H 3.086 2.319 VAL 22.A N GLY 18.A O VAL 22.A H 2.659 1.802 MET 23.A N VAL 39.A O MET 23.A H 3.035 2.350 GLU 24.A N LYS 15.A O GLU 24.A H 2.943 2.118 ASN 26.A N ILE 12.A O ASN 26.A H 3.011 2.240 LEU 27.A N LEU 35.A O LEU 27.A H 2.638 1.810 LYS 28.A N LEU 10.A O LYS 28.A H 2.915 2.061 GLN 29.A N THR 33.A O GLN 29.A H 2.925 2.078 GLY 32.A N GLN 29.A O GLY 32.A H 3.438 2.626 THR 33.A N ASP 31.A OD1 THR 33.A H 2.950 2.189 THR 33.A OG1 ASP 31.A OD1 THR 33.A HG1 2.644 1.793 LEU 35.A N LEU 27.A O LEU 35.A H 2.672 1.835 LYS 36.A NZ GLU 24.A OE1 LYS 36.A HZ3 3.196 2.356 LYS 36.A NZ ASN 26.A OD1 LYS 36.A HZ1 2.979 2.376 VAL 37.A N GLY 25.A O VAL 37.A H 2.813 1.966 ALA 38.A N LEU 86.A O ALA 38.A H 2.818 2.015 VAL 39.A N MET 23.A O VAL 39.A H 2.697 1.865 LYS 40.A N VAL 84.A O LYS 40.A H 3.016 2.238 THR 41.A N SER 21.A O THR 41.A H 2.978 2.198 MET 42.A N PRO 82.A O MET 42.A H 3.360 2.541 LYS 43.A NZ LEU 44.A O LYS 43.A HZ2 3.248 2.430 ASP 45.A N GLU 51.A OE1 ASP 45.A H 2.897 2.043 SER 47.A N ASP 45.A OD2 SER 47.A H 3.079 2.254 SER 47.A OG ASP 45.A OD2 SER 47.A HG 2.589 1.904 GLU 53.A N GLN 49.A O GLU 53.A H 2.981 2.229 GLU 53.A N ARG 50.A O GLU 53.A H 3.197 2.612 GLU 54.A N ARG 50.A O GLU 54.A H 3.271 2.452 PHE 55.A N ILE 52.A O PHE 55.A H 3.110 2.491 LEU 56.A N ILE 52.A O LEU 56.A H 2.874 2.031 SER 57.A N GLU 53.A O SER 57.A H 3.030 2.373 GLU 58.A N GLU 54.A O GLU 58.A H 3.480 2.626 ALA 59.A N PHE 55.A O ALA 59.A H 3.234 2.407 MET 62.A N GLU 58.A O MET 62.A H 2.546 1.733 LYS 63.A N ALA 59.A O LYS 63.A H 2.914 2.194 LYS 63.A NZ ASP 3.A O LYS 63.A HZ2 3.126 2.292 LYS 63.A NZ LEU 74.A O LYS 63.A HZ1 2.862 2.065 ASP 64.A N CYS 61.A O ASP 64.A H 3.039 2.268 PHE 65.A N MET 62.A O PHE 65.A H 3.378 2.590 SER 66.A N TYR 128.A OH SER 66.A H 2.815 1.973 ASN 69.A ND2 VAL 152.A O ASN 69.A HD21 2.901 2.055 VAL 70.A N HIS 67.A O VAL 70.A H 2.917 2.087 ILE 71.A N VAL 154.A O ILE 71.A H 3.041 2.254 LEU 74.A N ILE 85.A O LEU 74.A H 2.978 2.138 VAL 76.A N VAL 4.A O VAL 76.A H 2.850 2.068 CYS 77.A N MET 83.A O CYS 77.A H 3.097 2.298 GLU 79.A N LYS 81.A O GLU 79.A H 3.196 2.497 VAL 84.A N LYS 40.A O VAL 84.A H 3.030 2.202 ILE 85.A N GLY 75.A O ILE 85.A H 2.958 2.133 LEU 86.A N ALA 38.A O LEU 86.A H 3.066 2.223 PHE 88.A N LYS 36.A O PHE 88.A H 3.163 2.313 GLY 92.A N MET 89.A O GLY 92.A H 2.984 2.154 LEU 94.A N CYS 144.A O LEU 94.A H 2.715 1.924 HIS 95.A NE2 GLY 194.A O HIS 95.A HE2 3.177 2.486 THR 96.A N ASP 93.A OD2 THR 96.A H 2.737 1.891 THR 96.A OG1 ASP 93.A OD2 THR 96.A HG1 2.931 2.095 TYR 97.A N ASP 93.A O TYR 97.A H 3.418 2.609 LEU 98.A N LEU 94.A O LEU 98.A H 2.969 2.163 LEU 99.A N HIS 95.A O LEU 99.A H 3.265 2.462 TYR 100.A N THR 96.A O TYR 100.A H 2.892 2.044 SER 101.A N TYR 97.A O SER 101.A H 2.899 2.187 SER 101.A N LEU 98.A O SER 101.A H 3.197 2.599 ARG 102.A N LEU 99.A O ARG 102.A H 3.000 2.194 ARG 102.A NE ARG 193.A O ARG 102.A HE 3.244 2.485 ARG 102.A NH1 ARG 193.A O ARG 102.A HH11 3.325 2.600 LEU 103.A N TYR 100.A O LEU 103.A H 2.807 1.970 THR 105.A OG1 GLU 104.A O THR 105.A HG1 2.368 1.586 GLN 113.A N GLN 113.A OE1 GLN 113.A H 2.623 1.819 GLN 113.A NE2 PRO 259.A O GLN 113.A HE21 3.309 2.678 THR 114.A N PRO 111.A O THR 114.A H 3.050 2.379 LEU 115.A N PRO 111.A O LEU 115.A H 3.093 2.328 LEU 116.A N LEU 112.A O LEU 116.A H 2.920 2.103 LYS 117.A N GLN 113.A O LYS 117.A H 3.279 2.485 LYS 117.A NZ ASP 121.A OD1 LYS 117.A HZ2 2.904 2.017 LYS 117.A NZ ASP 121.A OD2 LYS 117.A HZ2 3.428 2.766 PHE 118.A N THR 114.A O PHE 118.A H 3.120 2.357 MET 119.A N LEU 115.A O MET 119.A H 3.308 2.559 VAL 120.A N LEU 116.A O VAL 120.A H 2.800 1.984 ASP 121.A N LYS 117.A O ASP 121.A H 3.029 2.178 ILE 122.A N PHE 118.A O ILE 122.A H 3.184 2.359 ALA 123.A N MET 119.A O ALA 123.A H 2.826 1.988 LEU 124.A N VAL 120.A O LEU 124.A H 2.764 1.928 GLY 125.A N ASP 121.A O GLY 125.A H 2.948 2.129 MET 126.A N ILE 122.A O MET 126.A H 2.772 1.949 GLU 127.A N ALA 123.A O GLU 127.A H 2.742 1.964 TYR 128.A N LEU 124.A O TYR 128.A H 3.109 2.383 TYR 128.A N GLY 125.A O TYR 128.A H 3.190 2.557 LEU 129.A N GLY 125.A O LEU 129.A H 3.244 2.424 SER 130.A N MET 126.A O SER 130.A H 2.800 1.997 ASN 131.A N GLU 127.A O ASN 131.A H 3.051 2.263 ARG 132.A N LEU 129.A O ARG 132.A H 3.131 2.401 ARG 132.A NH1 TYR 128.A O ARG 132.A HH11 3.458 2.676 ASN 133.A N SER 130.A O ASN 133.A H 2.878 2.047 PHE 134.A N LEU 129.A O PHE 134.A H 2.830 1.994 HIS 136.A N ASP 179.A OD2 HIS 136.A H 2.846 1.993 ARG 137.A N ASP 179.A OD1 ARG 137.A H 2.973 2.125 ALA 140.A N ASN 143.A OD1.B ALA 140.A H 3.095 2.332 ALA 141.A N GLU 189.A OE1 ALA 141.A H 3.162 2.305 ASN 143.A N.A ALA 140.A O ASN 143.A H.A 2.839 2.029 ASN 143.A N.B ALA 140.A O ASN 143.A H.B 3.021 2.210 ASN 143.A ND2.A ASP 138.A O ASN 143.A HD21.A 2.593 1.870 ASN 143.A ND2.A ASP 138.A OD2 ASN 143.A HD22.A 3.388 2.770 ASN 143.A ND2.B ASP 138.A O ASN 143.A HD22.B 2.730 2.166 CYS 144.A N ALA 141.A O CYS 144.A H 3.164 2.331 CYS 144.A SG ALA 140.A O CYS 144.A HG 3.517 2.414 MET 145.A N CYS 153.A O MET 145.A H 2.810 1.979 LEU 146.A N GLY 92.A O LEU 146.A H 3.161 2.306 ARG 147.A N THR 151.A O ARG 147.A H 2.761 1.905 ARG 147.A NE PRO 68.A O ARG 147.A HE 2.470 1.669 ARG 147.A NH2 PRO 68.A O ARG 147.A HH21 2.825 2.170 MET 150.A N ARG 147.A O MET 150.A H 2.830 2.042 THR 151.A N ASP 149.A OD1 THR 151.A H 3.094 2.256 THR 151.A OG1 ASP 149.A OD1 THR 151.A HG1 2.607 1.810 VAL 152.A N ASP 121.A OD2 VAL 152.A H 3.130 2.284 CYS 153.A N MET 145.A O CYS 153.A H 2.802 1.978 VAL 154.A N ASN 69.A O VAL 154.A H 3.194 2.394 LEU 159.A N GLU 58.A OE1 LEU 159.A H 2.431 1.728 LYS 162.A NZ TYR 198.A O LYS 162.A HZ2 2.886 2.195 LYS 162.A NZ VAL 201.A O LYS 162.A HZ3 2.751 2.014 TRP 163.A N PRO 160.A O TRP 163.A H 3.011 2.167 TRP 163.A NE1 GLU 189.A OE1 TRP 163.A HE1 2.838 2.016 ILE 164.A N VAL 161.A O ILE 164.A H 3.122 2.339 GLU 167.A N GLU 167.A OE1 GLU 167.A H 2.637 1.819 SER 168.A N ALA 165.A O SER 168.A H 3.064 2.415 SER 168.A OG VAL 173.A O SER 168.A HG 2.530 1.726 LEU 169.A N ILE 166.A O LEU 169.A H 3.366 2.581 ASP 171.A N GLU 167.A O ASP 171.A H 2.977 2.294 THR 175.A N SER 178.A OG THR 175.A H 2.950 2.090 THR 175.A OG1 SER 178.A OG THR 175.A HG1 3.277 2.671 LYS 177.A NZ ARG 241.A O LYS 177.A HZ3 2.986 2.143 SER 178.A N THR 175.A O SER 178.A H 2.985 2.206 SER 178.A OG GLU 167.A OE2 SER 178.A HG 3.383 2.549 ASP 179.A N SER 176.A O ASP 179.A H 3.056 2.468 VAL 180.A N SER 176.A O VAL 180.A H 3.014 2.246 TRP 181.A N LYS 177.A O TRP 181.A H 3.371 2.597 ALA 182.A N SER 178.A O ALA 182.A H 3.265 2.463 PHE 183.A N ASP 179.A O PHE 183.A H 2.749 1.992 GLY 184.A N VAL 180.A O GLY 184.A H 2.974 2.249 GLY 184.A N TRP 181.A O GLY 184.A H 3.163 2.543 VAL 185.A N TRP 181.A O VAL 185.A H 3.229 2.465 THR 186.A N ALA 182.A O THR 186.A H 2.889 2.118 THR 186.A OG1 ALA 182.A O THR 186.A HG1 2.948 2.117 MET 187.A N PHE 183.A O MET 187.A H 2.957 2.200 TRP 188.A N GLY 184.A O TRP 188.A H 3.141 2.437 TRP 188.A NE1 LYS 217.A O TRP 188.A HE1 2.887 2.088 GLU 189.A N VAL 185.A O GLU 189.A H 2.925 2.103 ILE 190.A N THR 186.A O ILE 190.A H 3.049 2.226 ALA 191.A N MET 187.A O ALA 191.A H 2.924 2.105 THR 192.A N TRP 188.A O THR 192.A H 2.929 2.257 THR 192.A N GLU 189.A O THR 192.A H 3.315 2.626 THR 192.A OG1 TRP 188.A O THR 192.A HG1 2.791 1.985 ARG 193.A N ILE 190.A O ARG 193.A H 3.016 2.215 ARG 193.A NH1 ASP 221.A OD2 ARG 193.A HH12 3.244 2.521 ARG 193.A NH2 ILE 110.A O ARG 193.A HH21 2.552 1.777 GLY 194.A N GLU 189.A O GLY 194.A H 2.888 2.065 VAL 201.A N TYR 198.A O VAL 201.A H 3.187 2.366 GLN 202.A N GLU 205.A OE2 GLN 202.A H 3.111 2.320 GLU 205.A N GLN 202.A O GLU 205.A H 3.052 2.225 MET 206.A N ASN 203.A O MET 206.A H 3.203 2.350 TYR 209.A N GLU 205.A O TYR 209.A H 3.073 2.267 LEU 210.A N MET 206.A O LEU 210.A H 2.911 2.071 LEU 211.A N TYR 207.A O LEU 211.A H 2.691 1.861 HIS 212.A N ASP 208.A O HIS 212.A H 3.082 2.355 HIS 212.A ND1 ASP 208.A O HIS 212.A HD1 2.546 1.727 GLY 213.A N LEU 210.A O GLY 213.A H 2.766 1.944 HIS 214.A N TYR 209.A O HIS 214.A H 3.304 2.554 ARG 215.A NE TRP 234.A O ARG 215.A HE 2.813 1.980 ARG 215.A NH1 LEU 210.A O ARG 215.A HH12 2.881 2.035 ARG 215.A NH1 HIS 214.A O ARG 215.A HH11 2.866 2.057 ARG 215.A NH2 TRP 234.A O ARG 215.A HH21 3.303 2.634 GLN 218.A NE2 CYS 222.A O GLN 218.A HE21 2.851 2.062 GLN 218.A NE2 ASP 224.A OD1 GLN 218.A HE22 3.234 2.406 ASP 221.A N ASP 221.A OD1 ASP 221.A H 2.562 1.888 CYS 222.A N PRO 219.A O CYS 222.A H 3.159 2.320 CYS 222.A SG LEU 223.A O CYS 222.A HG 3.697 2.518 LEU 226.A N LEU 223.A O LEU 226.A H 3.033 2.372 TYR 227.A N LEU 223.A O TYR 227.A H 3.008 2.206 TYR 227.A OH LEU 216.A O TYR 227.A HH 2.676 1.832 GLU 228.A N ASP 224.A O GLU 228.A H 3.021 2.285 MET 230.A N LEU 226.A O MET 230.A H 3.258 2.437 TYR 231.A N TYR 227.A O TYR 231.A H 2.804 2.003 SER 232.A N GLU 228.A O SER 232.A H 2.940 2.128 SER 232.A OG ILE 229.A O SER 232.A HG 2.709 1.914 CYS 233.A N MET 230.A O CYS 233.A H 3.043 2.271 TRP 234.A N TYR 231.A O TRP 234.A H 2.826 1.982 ARG 235.A NH1 ASP 240.A O ARG 235.A HH11 3.476 2.635 LEU 239.A N ASP 237.A OD1 LEU 239.A H 2.962 2.103 ASP 240.A N ASP 237.A O ASP 240.A H 2.897 2.160 ARG 241.A NE ARG 235.A O ARG 241.A HE 2.696 1.875 ARG 241.A NH1 GLU 167.A OE1 ARG 241.A HH12 3.427 2.839 ARG 241.A NH1 GLU 167.A OE2 ARG 241.A HH12 2.699 1.983 ARG 241.A NH1 LYS 177.A O ARG 241.A HH11 2.754 1.975 ARG 241.A NH2 GLU 167.A OE1 ARG 241.A HH22 2.603 1.761 ARG 241.A NH2 ARG 235.A O ARG 241.A HH21 3.152 2.493 ARG 241.A NH2 THR 236.A O ARG 241.A HH21 3.339 2.661 VAL 246.A N THR 243.A O VAL 246.A H 3.258 2.581 LEU 247.A N THR 243.A O LEU 247.A H 3.017 2.172 ARG 248.A N PHE 244.A O ARG 248.A H 2.893 2.106 ARG 248.A NE GLU 127.A OE1 ARG 248.A HE 2.766 1.926 ARG 248.A NH1 GLU 252.A OE1 ARG 248.A HH11 3.065 2.231 ARG 248.A NH2 GLU 127.A OE1 ARG 248.A HH21 3.396 2.756 ARG 248.A NH2 GLU 127.A OE2 ARG 248.A HH21 2.675 1.820 GLN 250.A N VAL 246.A O GLN 250.A H 3.007 2.210 LEU 251.A N LEU 247.A O LEU 251.A H 2.983 2.184 GLU 252.A N ARG 248.A O GLU 252.A H 3.000 2.187 LYS 253.A N LEU 249.A O LYS 253.A H 2.966 2.167 LEU 254.A N GLN 250.A O LEU 254.A H 3.005 2.179 LEU 255.A N LEU 251.A O LEU 255.A H 2.983 2.147 GLU 256.A N GLU 252.A O GLU 256.A H 3.176 2.431 GLU 256.A N LYS 253.A O GLU 256.A H 3.170 2.582 SER 257.A N LYS 253.A O SER 257.A H 3.137 2.539 SER 257.A N LEU 254.A O SER 257.A H 3.119 2.395 LEU 258.A N LEU 255.A O LEU 258.A H 3.216 2.399