Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5k1p_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 3.A N GLN 6.A OE1 THR 3.A H 3.079 2.265 LYS 4.A NZ ASP 8.A OD1 LYS 4.A HZ2 2.643 1.761 LYS 4.A NZ ASP 8.A OD2 LYS 4.A HZ2 3.407 2.736 SER 5.A OG HIS 269.A NE2 SER 5.A HG 2.943 2.290 GLN 6.A N THR 3.A OG1 GLN 6.A H 3.086 2.271 THR 7.A N THR 3.A O THR 7.A H 2.919 2.073 ASP 8.A N LYS 4.A O ASP 8.A H 2.871 2.031 ARG 9.A N SER 5.A O ARG 9.A H 3.063 2.252 ARG 9.A NH1 ASN 265.A O ARG 9.A HH12 2.981 2.251 ARG 9.A NH2 ASN 265.A O ARG 9.A HH22 2.820 2.032 ARG 9.A NH2 HIS 267.A O ARG 9.A HH21 2.717 2.042 LEU 10.A N GLN 6.A O LEU 10.A H 2.982 2.152 GLU 11.A N THR 7.A O GLU 11.A H 2.886 2.062 VAL 12.A N ASP 8.A O VAL 12.A H 3.112 2.335 LEU 13.A N ARG 9.A O LEU 13.A H 3.307 2.559 LEU 13.A N LEU 10.A O LEU 13.A H 3.107 2.513 LEU 14.A N GLU 11.A O LEU 14.A H 3.344 2.600 ASN 15.A N ASP 18.A OD2 ASN 15.A H 2.892 2.036 ASN 15.A ND2 GLY 261.A O ASN 15.A HD21 3.413 2.731 ASP 18.A N ASN 15.A O ASP 18.A H 3.033 2.216 ASN 23.A N SER 21.A OG ASN 23.A H 3.212 2.467 SER 24.A OG SER 21.A O SER 24.A HG 2.905 2.349 LEU 31.A N PRO 27.A O LEU 31.A H 3.217 2.370 GLU 32.A N PHE 28.A O GLU 32.A H 2.757 1.904 SER 33.A N ARG 29.A O SER 33.A H 2.849 2.046 GLU 34.A N GLU 30.A O GLU 34.A H 3.127 2.273 LEU 35.A N LEU 31.A O LEU 35.A H 2.987 2.149 LEU 36.A N GLU 32.A O LEU 36.A H 2.849 1.993 SER 37.A N SER 33.A O SER 37.A H 3.033 2.217 SER 37.A OG SER 33.A O SER 37.A HG 3.087 2.389 ARG 38.A N GLU 34.A O ARG 38.A H 3.014 2.190 ARG 38.A NE GLU 34.A OE2 ARG 38.A HE 2.628 1.771 ARG 38.A NH1 ASP 18.A OD1 ARG 38.A HH11 3.189 2.412 ARG 38.A NH2 GLU 34.A OE2 ARG 38.A HH21 3.304 2.675 ARG 39.A N LEU 35.A O ARG 39.A H 2.914 2.087 ARG 39.A NE ASP 42.A OD2 ARG 39.A HE 2.913 2.136 ARG 39.A NH1 LEU 13.A O ARG 39.A HH11 2.747 1.922 ARG 39.A NH1 ASP 18.A OD2 ARG 39.A HH12 2.712 1.915 ARG 39.A NH2 ASP 18.A OD1 ARG 39.A HH22 3.109 2.264 ARG 39.A NH2 ASP 42.A OD2 ARG 39.A HH21 2.989 2.247 LYS 40.A N LEU 36.A O LYS 40.A H 3.008 2.153 LYS 41.A N SER 37.A O LYS 41.A H 3.056 2.209 ASP 42.A N ARG 38.A O ASP 42.A H 2.883 2.107 LEU 43.A N ARG 39.A O LEU 43.A H 2.963 2.134 GLN 44.A N LYS 40.A O GLN 44.A H 2.867 2.029 GLN 45.A N LYS 41.A O GLN 45.A H 2.931 2.126 GLN 45.A NE2 GLU 49.A OE1.B GLN 45.A HE21 2.886 2.050 ILE 46.A N ASP 42.A O ILE 46.A H 3.095 2.251 TYR 47.A N LEU 43.A O TYR 47.A H 2.939 2.114 ALA 48.A N GLN 44.A O ALA 48.A H 2.939 2.194 GLU 49.A N.A GLN 45.A O GLU 49.A H.A 2.971 2.222 GLU 49.A N.B GLN 45.A O GLU 49.A H.B 2.922 2.313 GLU 49.A N.B ILE 46.A O GLU 49.A H.B 3.388 2.630 GLU 50.A N.B ILE 46.A O GLU 50.A H.B 3.215 2.419 ARG 51.A N ILE 46.A O ARG 51.A H.A 3.005 2.312 ARG 51.A NH1 TYR 47.A O ARG 51.A HH11 2.945 2.096 ARG 51.A NH1 ALA 48.A O ARG 51.A HH12 3.153 2.536 TYR 54.A N ASN 260.A OD1 TYR 54.A H 2.854 2.028 GLY 56.A N ASN 53.A OD1 GLY 56.A H 3.009 2.194 LYS 57.A N ASN 53.A O LYS 57.A H 2.763 1.917 LYS 57.A NZ GLU 50.A OE1.A LYS 57.A HZ3 2.257 1.504 LEU 58.A N TYR 54.A O LEU 58.A H 2.985 2.157 GLU 59.A N LEU 55.A O GLU 59.A H 3.016 2.160 ARG 60.A N GLY 56.A O ARG 60.A H 2.991 2.179 ARG 60.A NH2 GLU 52.A OE1 ARG 60.A HH21 2.849 2.040 GLU 61.A N LYS 57.A O GLU 61.A H 2.918 2.105 ILE 62.A N LEU 58.A O ILE 62.A H 2.847 1.991 THR 63.A N GLU 59.A O THR 63.A H 2.851 2.018 THR 63.A OG1 GLU 59.A O THR 63.A HG1 2.744 1.995 ARG 64.A N ARG 60.A O ARG 64.A H 3.069 2.239 PHE 65.A N GLU 61.A O PHE 65.A H 3.126 2.302 PHE 66.A N ILE 62.A O PHE 66.A H 3.080 2.257 VAL 67.A N THR 63.A O VAL 67.A H 2.874 2.014 ASP 68.A N ARG 64.A O ASP 68.A H 2.910 2.076 ARG 69.A N PHE 66.A O ARG 69.A H 3.079 2.385 ARG 69.A NH1 PHE 65.A O ARG 69.A HH11 2.944 2.156 GLY 70.A N VAL 67.A O GLY 70.A H 3.104 2.253 PHE 71.A N PHE 66.A O PHE 71.A H 3.043 2.193 LEU 72.A N LYS 133.A O LEU 72.A H 2.795 1.957 ILE 74.A N PHE 135.A O ILE 74.A H 2.819 1.986 LYS 75.A NZ GLU 59.A OE1 LYS 75.A HZ1 2.853 2.034 SER 76.A N GLU 136.A OE2 SER 76.A H 2.849 1.992 SER 76.A OG GLU 136.A OE1 SER 76.A HG 2.661 1.988 SER 76.A OG GLU 136.A OE2 SER 76.A HG 3.176 2.363 ILE 80.A N CYS 108.A O ILE 80.A H 2.934 2.097 LEU 82.A N ASN 106.A O LEU 82.A H 2.878 2.031 TYR 84.A N PRO 81.A O TYR 84.A H 3.006 2.195 ILE 85.A N LEU 82.A O ILE 85.A H 2.951 2.231 ARG 87.A N GLU 83.A O ARG 87.A H 3.029 2.243 ARG 87.A NH1 GLU 83.A OE1 ARG 87.A HH11 3.467 2.627 ARG 87.A NH2 GLU 222.A O ARG 87.A HH21 3.002 2.158 MET 88.A N TYR 84.A O MET 88.A H 3.042 2.355 MET 88.A N ILE 85.A O MET 88.A H 3.118 2.449 GLY 89.A N GLU 86.A O GLY 89.A H 2.908 2.116 ILE 90.A N ILE 85.A O ILE 90.A H 3.386 2.564 ASP 93.A N ASP 91.A OD1 ASP 93.A H 2.681 1.833 THR 94.A N ASP 91.A O THR 94.A H 3.072 2.227 THR 94.A OG1 ASP 91.A O THR 94.A HG1 2.651 1.868 GLU 95.A N GLU 95.A OE1 GLU 95.A H 2.571 1.742 SER 97.A N THR 94.A OG1 SER 97.A H 3.190 2.359 LYS 98.A N THR 94.A O LYS 98.A H 3.169 2.436 LYS 98.A N GLU 95.A O LYS 98.A H 3.080 2.483 GLN 99.A N LEU 96.A O GLN 99.A H 2.793 1.987 GLN 99.A NE2 LYS 143.A O GLN 99.A HE21 2.790 1.947 GLN 99.A NE2 GLU 144.A OE2 GLN 99.A HE22 2.964 2.365 ILE 100.A N SER 97.A O ILE 100.A H 3.345 2.514 ARG 102.A NH2 LYS 105.A O ARG 102.A HH21 2.653 2.009 VAL 103.A N PHE 107.A O VAL 103.A H 2.861 2.003 PHE 107.A N VAL 103.A O PHE 107.A H 3.193 2.455 CYS 108.A N ILE 80.A O CYS 108.A H 2.934 2.160 LEU 109.A N PHE 101.A O LEU 109.A H 2.957 2.171 ARG 110.A N ILE 78.A O ARG 110.A H 2.869 2.051 ARG 110.A NE PRO 139.A O ARG 110.A HE 2.851 2.027 ARG 110.A NH1 PRO 77.A O ARG 110.A HH11 3.122 2.550 ARG 110.A NH1 GLU 136.A OE2 ARG 110.A HH12 2.949 2.142 ARG 110.A NH2 PRO 139.A O ARG 110.A HH21 3.029 2.291 LEU 117.A N LEU 113.A O LEU 117.A H 3.204 2.375 TYR 118.A N ALA 114.A O TYR 118.A H 2.777 1.938 TYR 118.A OH ASP 220.A OD1 TYR 118.A HH 2.738 1.929 ASN 119.A N PRO 115.A O ASN 119.A H 3.096 2.278 TYR 120.A N ASN 116.A O TYR 120.A H 3.005 2.182 LEU 121.A N LEU 117.A O LEU 121.A H 2.856 2.019 ARG 122.A N TYR 118.A O ARG 122.A H 3.061 2.220 ARG 122.A NH1 ASN 119.A OD1 ARG 122.A HH12 2.894 2.081 ARG 122.A NH1 TRP 223.A O ARG 122.A HH11 2.953 2.132 ARG 122.A NH2 ASN 119.A OD1 ARG 122.A HH22 3.208 2.499 LYS 123.A N ASN 119.A O LYS 123.A H 3.005 2.166 LEU 124.A N TYR 120.A O LEU 124.A H 2.833 1.991 ASP 125.A N LEU 121.A O ASP 125.A H 3.099 2.339 ARG 126.A N LYS 123.A O ARG 126.A H 3.170 2.351 ALA 127.A N LEU 124.A O ALA 127.A H 2.875 2.026 LEU 128.A N LEU 124.A O LEU 128.A H 2.825 2.012 ILE 132.A N MET 162.A O ILE 132.A H 2.963 2.153 LYS 133.A NZ ARG 69.A O LYS 133.A HZ1 2.851 2.242 ILE 134.A N ALA 160.A O ILE 134.A H 2.987 2.155 PHE 135.A N LEU 72.A O PHE 135.A H 2.973 2.162 GLU 136.A N ALA 158.A O GLU 136.A H 2.913 2.105 GLY 138.A N MET 156.A O.A GLY 138.A H 2.986 2.201 GLY 138.A N MET 156.A O.B GLY 138.A H 2.894 2.141 CYS 140.A N PHE 154.A O CYS 140.A H 2.865 2.032 TYR 141.A N ARG 110.A O TYR 141.A H 2.892 2.138 TYR 141.A OH GLU 153.A OE2 TYR 141.A HH 2.687 1.897 ARG 142.A N GLU 152.A O ARG 142.A H 2.984 2.203 ARG 142.A NE PRO 111.A O ARG 142.A HE 2.925 2.122 ARG 142.A NH1 PRO 111.A O ARG 142.A HH11 3.041 2.290 LYS 143.A N GLN 99.A O LYS 143.A H 2.670 1.829 GLU 144.A N GLU 152.A OE2 GLU 144.A H 3.049 2.226 PHE 154.A N CYS 140.A O PHE 154.A H 2.988 2.132 THR 155.A N GLU 237.A OE1 THR 155.A H 2.797 1.979 THR 155.A OG1 GLU 237.A OE2 THR 155.A HG1 2.693 1.927 MET 156.A N.A GLY 138.A O MET 156.A H.A 2.934 2.104 MET 156.A N.B GLY 138.A O MET 156.A H.B 2.908 2.065 LEU 157.A N PHE 234.A O LEU 157.A H.A 2.828 2.008 ALA 158.A N GLU 136.A O ALA 158.A H 2.825 2.015 PHE 159.A N ALA 232.A O PHE 159.A H 3.007 2.243 ALA 160.A N ILE 134.A O ALA 160.A H 2.895 2.080 GLN 161.A N ILE 230.A O GLN 161.A H 2.839 2.020 GLN 161.A NE2 SER 164.A O GLN 161.A HE21 3.032 2.210 MET 162.A N ILE 132.A O MET 162.A H 2.840 2.102 GLY 163.A N PRO 228.A O GLY 163.A H 2.914 2.112 SER 164.A N ASP 130.A OD1 SER 164.A H 2.729 1.902 CYS 166.A SG SER 164.A O CYS 166.A HG 3.504 2.319 ARG 168.A NH1 GLU 172.A OE2 ARG 168.A HH11 2.709 1.959 GLU 169.A N GLU 169.A OE1 GLU 169.A H 2.799 2.012 ASN 170.A N THR 167.A OG1 ASN 170.A H 2.980 2.134 ASN 170.A ND2 GLY 165.A O ASN 170.A HD22 2.837 2.024 LEU 171.A N THR 167.A O LEU 171.A H 2.970 2.116 GLU 172.A N ARG 168.A O GLU 172.A H 2.833 1.979 SER 173.A N.A GLU 169.A O SER 173.A H.A 2.912 2.132 SER 173.A N.B GLU 169.A O SER 173.A H.B 2.894 2.090 SER 173.A OG.A ASN 170.A O SER 173.A HG.A 2.809 1.979 ILE 174.A N ASN 170.A O ILE 174.A H.A 2.897 2.108 ILE 175.A N LEU 171.A O ILE 175.A H 3.069 2.212 THR 176.A N GLU 172.A O THR 176.A H 2.855 2.029 THR 176.A OG1 GLU 172.A O THR 176.A HG1 2.856 2.101 ASP 177.A N SER 173.A O.A ASP 177.A H 2.956 2.115 ASP 177.A N SER 173.A O.B ASP 177.A H 2.898 2.055 PHE 178.A N ILE 174.A O PHE 178.A H 2.893 2.067 LEU 179.A N ILE 175.A O LEU 179.A H 2.910 2.064 ASN 180.A N THR 176.A O ASN 180.A H 2.850 2.001 HIS 181.A N ASP 177.A O HIS 181.A H 3.016 2.219 LEU 182.A N PHE 178.A O LEU 182.A H 3.085 2.323 GLY 183.A N ASN 180.A O GLY 183.A H 2.927 2.154 ILE 184.A N LEU 179.A O ILE 184.A H 2.966 2.114 LYS 187.A N MET 203.A O LYS 187.A H 2.950 2.144 VAL 189.A N ASP 201.A O VAL 189.A H 2.874 2.051 ASP 191.A N THR 199.A O ASP 191.A H 3.090 2.259 SER 192.A N ASP 191.A OD1 SER 192.A H 2.559 1.823 CYS 193.A N GLY 197.A O CYS 193.A H 2.472 1.844 GLY 197.A N CYS 193.A O GLY 197.A H 2.856 2.129 THR 199.A N ASP 191.A O THR 199.A H 2.872 2.039 LEU 200.A N ALA 212.A O LEU 200.A H 2.890 2.058 ASP 201.A N VAL 189.A O ASP 201.A H 2.691 1.841 VAL 202.A N SER 210.A O VAL 202.A H 2.856 2.006 MET 203.A N LYS 187.A O MET 203.A H 2.826 1.971 HIS 204.A N LEU 207.A O HIS 204.A H 2.833 1.993 HIS 204.A ND1 ASP 185.A O HIS 204.A HD1 2.824 1.972 LEU 207.A N HIS 204.A O LEU 207.A H 3.005 2.160 LEU 209.A N VAL 202.A O LEU 209.A H 2.773 2.013 SER 210.A N VAL 202.A O SER 210.A H 3.370 2.603 SER 210.A OG GLY 233.A O SER 210.A HG 2.806 2.059 SER 211.A N GLY 233.A O SER 211.A H 3.270 2.617 SER 211.A OG ASP 201.A OD1 no hydrogen 2.815 N/A SER 211.A OG GLU 208.A OE2 no hydrogen 3.233 N/A ALA 212.A N LEU 200.A O ALA 212.A H 2.863 2.112 VAL 213.A N GLY 231.A O VAL 213.A H 2.878 2.061 GLY 215.A N TRP 229.A O GLY 215.A H 2.765 1.992 ILE 217.A N ASP 220.A OD2 ILE 217.A H 2.899 2.082 ASP 220.A N ILE 217.A O ASP 220.A H 2.986 2.148 GLU 222.A N LEU 219.A O GLU 222.A H 3.019 2.279 TRP 223.A N ASP 220.A O TRP 223.A H 2.935 2.140 GLY 224.A N ARG 221.A O GLY 224.A H 3.151 2.299 ILE 225.A N ASP 220.A O ILE 225.A H 3.110 2.261 LYS 227.A NZ ASP 125.A OD1 LYS 227.A HZ2 2.861 1.986 TRP 229.A NE1 ASP 220.A OD1 TRP 229.A HE1 3.053 2.318 TRP 229.A NE1 ASP 220.A OD2 TRP 229.A HE1 2.944 2.195 ILE 230.A N GLN 161.A O ILE 230.A H 2.883 2.094 GLY 231.A N VAL 213.A O GLY 231.A H 3.062 2.285 ALA 232.A N PHE 159.A O ALA 232.A H 3.056 2.289 GLY 233.A N SER 211.A O GLY 233.A H 3.020 2.184 PHE 234.A N LEU 157.A O PHE 234.A H 2.761 1.942 LEU 236.A N THR 155.A O LEU 236.A H 2.828 1.990 GLU 237.A N GLU 237.A OE1 GLU 237.A H 2.828 2.048 ARG 238.A NE GLU 149.A O ARG 238.A HE 2.977 2.277 ARG 238.A NH1 GLU 208.A O ARG 238.A HH11 2.864 2.039 ARG 238.A NH2 GLU 149.A O ARG 238.A HH21 2.892 2.139 LEU 239.A N GLY 235.A O LEU 239.A H 3.109 2.301 LEU 240.A N LEU 236.A O LEU 240.A H 2.954 2.131 LYS 241.A N GLU 237.A O LYS 241.A H 2.827 1.996 LYS 241.A NZ PHE 246.A O LYS 241.A HZ3 3.352 2.716 VAL 242.A N ARG 238.A O VAL 242.A H 3.060 2.244 LYS 243.A N LEU 239.A O LYS 243.A H 2.910 2.062 HIS 244.A N LEU 240.A O HIS 244.A H 2.934 2.134 PHE 246.A N LYS 241.A O PHE 246.A H 3.109 2.453 ILE 249.A N LYS 148.A O ILE 249.A H 2.963 2.131 LYS 250.A N ASN 248.A OD1 LYS 250.A H 2.809 1.952 ARG 251.A N ASN 248.A O ARG 251.A H 3.092 2.237 ARG 251.A NH1 LEU 14.A O ARG 251.A HH12 3.010 2.321 ARG 251.A NH1 ASN 15.A OD1 ARG 251.A HH12 3.073 2.397 ARG 251.A NH1 GLY 261.A O ARG 251.A HH11 3.044 2.307 ARG 251.A NH2 LEU 14.A O ARG 251.A HH22 2.872 2.139 ALA 252.A N ILE 249.A O ALA 252.A H 2.971 2.138 ALA 253.A N LYS 250.A O ALA 253.A H 3.343 2.498 SER 257.A N SER 255.A OG SER 257.A H 2.675 1.861 TYR 259.A N ILE 262.A O TYR 259.A H 2.802 1.975 ASN 260.A ND2 GLU 52.A O ASN 260.A HD21 3.002 2.148 ILE 262.A N TYR 259.A O ILE 262.A H 2.831 1.995 SER 263.A OG ASN 265.A O SER 263.A HG 3.443 3.014 THR 264.A N SER 257.A O THR 264.A H 3.006 2.165 THR 264.A OG1 GLU 256.A O THR 264.A HG1 2.609 1.843 HIS 268.A ND1 GLU 32.A OE1 no hydrogen 3.248 N/A HIS 269.A N GLU 32.A OE2 HIS 269.A H 2.704 1.849