Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5k1s_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): HIS 2.A ND1 HIS 1.A O HIS 2.A HD1 2.508 1.825 ALA 6.A N HIS 4.A ND1 ALA 6.A H 3.057 2.365 TYR 10.A N ALA 6.A O TYR 10.A H 3.270 2.454 TYR 10.A OH HIS 4.A O TYR 10.A HH 3.000 2.322 PHE 11.A N GLU 7.A O PHE 11.A H 2.969 2.194 GLN 12.A N ASN 8.A O GLN 12.A H 3.148 2.407 MET 15.A N MET 34.A O MET 15.A H 2.621 1.841 LYS 16.A N GLN 137.A OE1 LYS 16.A H 2.704 1.845 ALA 17.A N GLU 32.A O ALA 17.A H 2.988 2.204 VAL 18.A N TYR 135.A O VAL 18.A H 2.996 2.262 VAL 19.A N LYS 30.A O VAL 19.A H 2.873 2.023 LEU 20.A N ALA 72.A O LEU 20.A H 2.974 2.179 ARG 21.A NE GLU 32.A OE1 ARG 21.A HE 3.142 2.486 ARG 21.A NE GLU 32.A OE2 ARG 21.A HE 3.000 2.236 ARG 21.A NH2 GLU 32.A OE1 ARG 21.A HH21 2.778 2.031 GLY 24.A N ARG 61.A O GLY 24.A H 3.186 2.430 ASN 28.A N GLU 25.A O ASN 28.A H 3.025 2.169 ASN 28.A ND2 SER 22.A O ASN 28.A HD22 2.684 1.834 LEU 29.A N ALA 26.A O LEU 29.A H 3.240 2.380 LYS 30.A N VAL 19.A O LYS 30.A H 3.202 2.392 GLU 32.A N ALA 17.A O GLU 32.A H 2.819 1.997 MET 34.A N MET 15.A O MET 34.A H 2.727 1.919 MET 36.A N GLY 13.A O MET 36.A H 2.814 1.962 ARG 38.A NH1 GLN 12.A OE1 ARG 38.A HH12 2.459 1.750 GLY 40.A N GLU 43.A OE1 GLY 40.A H 2.882 2.036 GLY 42.A N PRO 87.A O GLY 42.A H 2.761 1.907 GLU 43.A N GLY 40.A O GLU 43.A H 2.981 2.164 VAL 44.A N ALA 141.A O VAL 44.A H 2.938 2.333 LEU 45.A N GLU 84.A O LEU 45.A H 2.902 2.056 LEU 46.A N MET 139.A O LEU 46.A H 2.766 1.924 ARG 47.A N GLU 81.A O ARG 47.A H 2.718 1.913 VAL 48.A N GLN 137.A O VAL 48.A H 2.791 2.057 HIS 49.A N ALA 79.A O HIS 49.A H 3.022 2.248 ALA 50.A N ALA 79.A O ALA 50.A H 3.258 2.522 CYS 51.A N LEU 354.A O CYS 51.A H 2.880 2.104 GLY 52.A N GLU 77.A O GLY 52.A H 2.691 1.871 VAL 53.A N LEU 352.A O VAL 53.A H 3.032 2.181 CYS 54.A N ASP 57.A OD2 CYS 54.A H 3.078 2.227 CYS 54.A SG HIS 76.A NE2 no hydrogen 3.829 N/A HIS 56.A NE2 GLU 129.A OE2 HIS 56.A HE2 2.717 1.877 ASP 57.A N CYS 54.A O ASP 57.A H 2.536 1.762 ILE 59.A N TYR 55.A O ILE 59.A H 3.198 2.395 ASN 60.A N HIS 56.A O ASN 60.A H 2.940 2.099 ASN 60.A ND2 GLY 128.A O ASN 60.A HD21 2.725 2.007 ARG 61.A N ASP 57.A O ARG 61.A H 2.827 2.030 ARG 61.A NE HIS 340.A ND1 ARG 61.A HE 3.064 2.235 ARG 62.A N VAL 58.A O ARG 62.A H 3.132 2.404 ARG 62.A N ILE 59.A O ARG 62.A H 3.147 2.492 ARG 62.A NH2 GLU 344.A OE2 ARG 62.A HH21 2.919 2.227 GLY 63.A N ASN 60.A O GLY 63.A H 3.038 2.190 ASN 64.A N ILE 59.A O ASN 64.A H 3.292 2.485 ARG 67.A NE GLU 130.A OE1.B ARG 67.A HE 2.775 2.005 ARG 67.A NE GLU 130.A OE2.A ARG 67.A HE 2.653 2.036 ARG 67.A NH1 ASN 124.A O ARG 67.A HH11 3.454 2.780 THR 68.A N LEU 65.A O THR 68.A H 3.181 2.347 THR 68.A OG1 ASN 60.A OD1 THR 68.A HG1 2.564 1.747 ALA 72.A N LEU 20.A O ALA 72.A H 2.997 2.298 ALA 78.A N THR 100.A OG1 ALA 78.A H 3.054 2.211 ALA 79.A N ALA 50.A O ALA 79.A H 2.889 2.045 GLY 80.A N ALA 98.A O GLY 80.A H 2.967 2.157 GLU 81.A N ARG 47.A O GLU 81.A H 3.030 2.310 VAL 82.A N ASP 96.A O VAL 82.A H 2.883 2.035 ILE 83.A N LEU 45.A O ILE 83.A H 3.110 2.313 GLY 86.A N GLU 43.A O GLY 86.A H 3.180 2.323 THR 89.A OG1 GLY 86.A O THR 89.A HG1 2.745 2.155 TRP 92.A N THR 89.A O TRP 92.A H 3.051 2.200 LYS 93.A N ASP 96.A OD2 LYS 93.A H 2.636 1.778 LYS 93.A NZ ASP 96.A OD1 no hydrogen 3.335 N/A GLY 95.A N VAL 82.A O GLY 95.A H 2.574 1.728 ASP 96.A N LYS 93.A O ASP 96.A H 3.212 2.377 ARG 97.A NE PRO 150.A O ARG 97.A HE 3.415 2.744 ALA 98.A N GLY 80.A O ALA 98.A H 3.091 2.243 ALA 99.A N GLY 147.A O ALA 99.A H 2.731 2.013 THR 100.A N ALA 78.A O THR 100.A H 2.824 2.013 THR 100.A OG1 HIS 76.A O THR 100.A HG1 3.057 2.377 LEU 101.A N GLY 145.A O LEU 101.A H 2.935 2.110 ARG 103.A NH1 ASN 117.A O ARG 103.A HH12 2.738 2.028 MET 104.A N ARG 125.A O MET 104.A H 2.663 1.891 CYS 106.A SG THR 122.A OG1 no hydrogen 2.782 N/A CYS 112.A SG SER 105.A OG no hydrogen 2.787 N/A ARG 113.A N CYS 109.A O ARG 113.A H 2.899 2.051 ARG 113.A NH2 ASP 108.A O ARG 113.A HH21 2.605 1.868 SER 114.A N LEU 111.A O SER 114.A H 3.050 2.317 SER 114.A OG ALA 110.A O SER 114.A HG 2.735 1.911 GLY 115.A N CYS 112.A O GLY 115.A H 2.966 2.118 ARG 116.A N LEU 111.A O ARG 116.A H 2.884 2.104 SER 118.A OG TYR 304.A O SER 118.A HG 2.441 1.860 LEU 119.A N ARG 116.A O LEU 119.A H 2.852 2.012 CYS 120.A N ASN 117.A O CYS 120.A H 3.064 2.206 CYS 120.A SG THR 122.A OG1 no hydrogen 3.266 N/A CYS 120.A SG ASP 123.A O no hydrogen 3.913 N/A ARG 125.A N ASP 123.A OD1 ARG 125.A H 3.259 2.404 PHE 126.A N GLU 130.A OE2.B PHE 126.A H 3.091 2.248 PHE 127.A N GLN 102.A O PHE 127.A H 2.984 2.174 GLY 128.A N LEU 131.A O GLY 128.A H 2.938 2.259 GLU 129.A N PHE 126.A O GLU 129.A H 3.364 2.556 GLU 130.A N GLU 130.A OE2.B GLU 130.A H 3.148 2.384 GLY 133.A N ILE 73.A O GLY 133.A H 2.823 2.126 GLY 134.A N GLY 75.A O GLY 134.A H 3.069 2.367 TYR 135.A N LEU 74.A O TYR 135.A H 2.960 2.163 GLN 137.A N LYS 16.A O GLN 137.A H 3.132 2.335 GLN 137.A NE2 PRO 357.A O GLN 137.A HE21 2.843 1.997 MET 139.A N LEU 46.A O MET 139.A H 3.176 2.435 ALA 141.A N VAL 44.A O ALA 141.A H 2.798 2.050 VAL 143.A N GLY 42.A O VAL 143.A H 3.104 2.267 GLY 145.A N PRO 142.A O GLY 145.A H 2.893 2.035 LEU 146.A N VAL 143.A O LEU 146.A H 3.349 2.565 GLY 147.A N ALA 99.A O GLY 147.A H 2.670 1.840 ARG 148.A N ASP 312.A OD1 ARG 148.A H 2.653 1.838 ARG 148.A NH2 GLY 91.A O ARG 148.A HH22 2.290 1.617 VAL 149.A N ARG 97.A O VAL 149.A H 2.920 2.072 LEU 153.A N PRO 150.A O LEU 153.A H 3.007 2.172 ALA 158.A N PRO 154.A O ALA 158.A H 3.082 2.304 ALA 159.A N TRP 155.A O ALA 159.A H 2.776 2.038 THR 160.A OG1 GLN 325.A OE1 THR 160.A HG1 3.010 2.328 VAL 161.A N ALA 158.A O VAL 161.A H 3.362 2.540 CYS 163.A N GLU 77.A OE2 CYS 163.A H 3.419 2.620 CYS 163.A SG HIS 76.A NE2 no hydrogen 2.929 N/A THR 164.A N VAL 161.A O THR 164.A H 3.192 2.355 THR 164.A OG1 THR 160.A O THR 164.A HG1 2.625 2.042 THR 164.A OG1 VAL 161.A O THR 164.A HG1 3.407 2.951 GLY 166.A N VAL 161.A O GLY 166.A H 2.622 1.770 ALA 168.A N THR 164.A O ALA 168.A H 2.868 2.078 VAL 169.A N THR 165.A O VAL 169.A H 2.951 2.126 HIS 170.A N GLY 166.A O HIS 170.A H 3.276 2.430 HIS 170.A ND1 GLU 310.A OE2 HIS 170.A HD1 2.712 2.033 THR 171.A N THR 167.A O THR 171.A H 2.822 2.017 THR 171.A OG1 THR 167.A O THR 171.A HG1 2.854 2.085 VAL 172.A N ALA 168.A O VAL 172.A H 2.583 1.727 ARG 173.A N VAL 169.A O ARG 173.A H 2.916 2.104 ARG 173.A NE ASP 204.A OD2 ARG 173.A HE 3.459 2.648 ARG 173.A NH1 GLU 313.A OE2 ARG 173.A HH12 3.186 2.380 ARG 173.A NH2 ASP 204.A OD1 ARG 173.A HH21 3.483 2.663 THR 174.A N VAL 169.A O THR 174.A H 3.144 2.341 THR 174.A OG1 GLU 310.A OE2 THR 174.A HG1 3.051 2.233 ARG 175.A N HIS 170.A O ARG 175.A H 2.895 2.089 ARG 175.A NE GLY 302.A O ARG 175.A HE 2.831 2.184 ARG 175.A NH2 GLY 302.A O ARG 175.A HH21 3.071 2.497 GLY 176.A N THR 171.A O GLY 176.A H 2.722 1.980 LYS 177.A N ARG 173.A O LYS 177.A H 2.864 2.172 VAL 178.A N VAL 172.A O VAL 178.A H 3.065 2.216 ARG 179.A N GLU 182.A OE1 ARG 179.A H 2.949 2.093 GLY 181.A N GLY 205.A O GLY 181.A H 2.543 1.791 GLU 182.A N ARG 179.A O GLU 182.A H 3.194 2.337 THR 183.A N ASP 251.A OD1 THR 183.A H 3.002 2.148 VAL 184.A N ARG 207.A O VAL 184.A H 2.748 1.909 LEU 185.A N VAL 252.A O LEU 185.A H 2.932 2.104 ILE 186.A N ILE 209.A O ILE 186.A H 2.978 2.164 THR 187.A N VAL 254.A O THR 187.A H 3.146 2.309 THR 187.A OG1 GLU 255.A OE2 THR 187.A HG1 2.664 1.839 GLY 191.A N GLY 188.A O GLY 191.A H 2.999 2.143 LEU 195.A N GLY 191.A O LEU 195.A H 2.919 2.062 SER 196.A N GLY 192.A O SER 196.A H 3.438 2.594 SER 197.A N VAL 193.A O SER 197.A H 2.910 2.093 SER 197.A OG VAL 193.A O SER 197.A HG 2.897 2.107 VAL 198.A N GLY 194.A O VAL 198.A H 2.770 1.929 GLN 199.A N LEU 195.A O GLN 199.A H 3.198 2.344 GLN 199.A NE2 LEU 195.A O GLN 199.A HE21 3.406 2.610 GLN 199.A NE2 ARG 324.A O GLN 199.A HE22 3.290 2.473 LEU 200.A N SER 196.A O LEU 200.A H 2.885 2.044 ALA 201.A N SER 197.A O ALA 201.A H 2.755 1.923 ARG 202.A N VAL 198.A O ARG 202.A H 2.922 2.064 LEU 203.A N GLN 199.A O LEU 203.A H 2.741 1.976 ASP 204.A N LEU 200.A O ASP 204.A H 3.107 2.433 ASP 204.A N ALA 201.A O ASP 204.A H 2.943 2.282 GLY 205.A N ARG 202.A O GLY 205.A H 3.374 2.571 ALA 206.A N ALA 201.A O ALA 206.A H 3.340 2.612 ARG 207.A N GLU 182.A O ARG 207.A H 3.042 2.329 ARG 207.A NE ASP 227.A OD2 ARG 207.A HE 2.639 1.960 ARG 207.A NH1 ARG 244.A O ARG 207.A HH12 3.414 2.837 ARG 207.A NH2 GLU 228.A OE2 ARG 207.A HH21 3.198 2.389 ARG 207.A NH2 ARG 244.A O ARG 207.A HH22 2.936 2.239 ILE 209.A N VAL 184.A O ILE 209.A H 2.777 1.928 ALA 210.A N GLU 228.A O ALA 210.A H 2.877 2.040 VAL 211.A N ILE 186.A O VAL 211.A H 2.819 2.059 THR 212.A N ILE 230.A O THR 212.A H 3.138 2.386 LYS 222.A N VAL 218.A O LYS 222.A H 2.883 2.023 GLU 223.A N GLN 219.A O GLU 223.A H 3.357 2.525 ALA 224.A N ALA 220.A O ALA 224.A H 2.647 1.944 ALA 224.A N LEU 221.A O ALA 224.A H 3.175 2.588 GLY 225.A N LYS 222.A O GLY 225.A H 3.066 2.219 ALA 226.A N LEU 221.A O ALA 226.A H 2.997 2.196 ASP 227.A N VAL 208.A O ASP 227.A H 2.986 2.374 GLU 228.A N VAL 208.A O GLU 228.A H 3.039 2.241 ILE 230.A N ALA 210.A O ILE 230.A H 2.844 2.080 SER 232.A N THR 212.A O SER 232.A H 3.281 2.461 SER 232.A OG ASP 236.A OD1 SER 232.A HG 2.300 1.657 GLY 234.A N SER 232.A OG GLY 234.A H 3.030 2.240 ALA 238.A N GLN 264.A OE1 ALA 238.A H 3.308 2.494 VAL 241.A N PHE 237.A O VAL 241.A H 2.948 2.185 VAL 241.A N ALA 238.A O VAL 241.A H 3.224 2.613 ARG 242.A N ALA 238.A O ARG 242.A H 3.152 2.302 LYS 243.A N SER 239.A O LYS 243.A H 2.912 2.201 ARG 244.A N ASP 240.A O ARG 244.A H 2.919 2.124 THR 245.A N VAL 241.A O THR 245.A H 2.733 2.122 THR 245.A OG1 VAL 241.A O THR 245.A HG1 2.698 1.899 GLY 247.A N ARG 242.A O GLY 247.A H 2.448 1.699 ALA 248.A N THR 245.A O ALA 248.A H 3.075 2.228 GLY 249.A N THR 245.A OG1 GLY 249.A H 3.076 2.271 VAL 250.A N SER 268.A O VAL 250.A H 3.212 2.470 ASP 251.A N THR 183.A O ASP 251.A H 3.111 2.394 ASP 251.A N THR 183.A OG1 ASP 251.A H 3.264 2.551 VAL 252.A N THR 183.A O VAL 252.A H 3.359 2.521 ALA 253.A N ARG 274.A O ALA 253.A H 3.022 2.255 VAL 254.A N LEU 185.A O VAL 254.A H 2.521 1.683 GLU 255.A N VAL 276.A O GLU 255.A H 2.964 2.143 ILE 256.A N THR 187.A OG1 ILE 256.A H 2.956 2.265 VAL 257.A N THR 187.A OG1 VAL 257.A H 3.205 2.360 GLY 258.A N GLU 255.A OE2 GLY 258.A H 2.914 2.055 SER 259.A N ASN 280.A OD1 SER 259.A H 2.736 1.916 SER 259.A OG ASN 280.A OD1 SER 259.A HG 3.274 2.554 THR 261.A N GLY 258.A O THR 261.A H 3.265 2.539 PHE 262.A N SER 259.A O PHE 262.A H 3.397 2.593 THR 265.A N THR 261.A O THR 265.A H 2.922 2.104 THR 265.A OG1 GLU 255.A OE1 THR 265.A HG1 2.840 2.099 LEU 266.A N PHE 262.A O LEU 266.A H 3.022 2.199 LYS 267.A N ASP 263.A O LYS 267.A H 3.482 2.626 SER 268.A N GLN 264.A O SER 268.A H 2.995 2.369 SER 268.A N THR 265.A O SER 268.A H 2.891 2.193 MET 269.A N LEU 266.A O MET 269.A H 2.835 1.984 ALA 270.A N VAL 250.A O ALA 270.A H 2.889 2.039 GLY 272.A N LYS 296.A O GLY 272.A H 2.691 1.858 GLY 273.A N ALA 270.A O GLY 273.A H 2.867 2.068 ARG 274.A N ASP 251.A O ARG 274.A H 3.091 2.324 ARG 274.A NE GLY 176.A O ARG 274.A HE 2.825 1.994 ARG 274.A NH1 GLU 182.A OE2 ARG 274.A HH12 3.135 2.343 ARG 274.A NH2 GLY 176.A O ARG 274.A HH21 3.232 2.544 ARG 274.A NH2 GLU 182.A OE1 ARG 274.A HH22 2.883 2.101 ARG 274.A NH2 GLU 182.A OE2 ARG 274.A HH22 3.213 2.447 VAL 275.A N GLU 299.A O VAL 275.A H 2.482 1.655 VAL 276.A N ALA 253.A O VAL 276.A H 2.784 1.938 VAL 277.A N LEU 301.A O VAL 277.A H 2.539 1.737 VAL 278.A N GLU 255.A O VAL 278.A H 3.137 2.285 GLY 279.A N GLU 255.A O GLY 279.A H 3.405 2.613 ASN 280.A ND2 GLY 284.A O ASN 280.A HD21 3.101 2.242 LEU 281.A N VAL 257.A O LEU 281.A H 2.755 1.957 SER 283.A N ASN 280.A O SER 283.A H 3.271 2.500 LEU 292.A N ASN 289.A OD1 LEU 292.A H 2.864 2.064 ILE 294.A N PRO 290.A O ILE 294.A H 2.903 2.106 VAL 295.A N GLY 291.A O VAL 295.A H 2.894 2.069 GLU 297.A N ILE 294.A O GLU 297.A H 2.762 1.968 LEU 298.A N VAL 293.A O LEU 298.A H 2.961 2.177 GLU 299.A N GLY 273.A O GLU 299.A H 2.960 2.159 LEU 301.A N VAL 275.A O LEU 301.A H 2.588 1.768 ALA 303.A N VAL 277.A O ALA 303.A H 2.990 2.236 THR 307.A N GLU 310.A OE1 THR 307.A H 2.817 2.007 GLN 308.A NE2 VAL 143.A O GLN 308.A HE22 2.655 2.129 GLN 308.A NE2 LEU 146.A O GLN 308.A HE21 2.960 2.152 GLU 310.A N THR 307.A OG1 GLU 310.A H 3.160 2.323 LEU 311.A N THR 307.A O LEU 311.A H 2.993 2.161 ASP 312.A N GLN 308.A O ASP 312.A H 3.184 2.337 GLU 313.A N ALA 309.A O GLU 313.A H 2.970 2.158 ALA 314.A N GLU 310.A O ALA 314.A H 2.685 1.857 LEU 315.A N LEU 311.A O LEU 315.A H 2.718 1.858 ARG 316.A N ASP 312.A O ARG 316.A H 3.066 2.281 ARG 316.A NE GLU 313.A OE1 ARG 316.A HE 3.091 2.234 ARG 316.A NH2 GLU 313.A OE2 ARG 316.A HH21 2.504 1.671 LEU 317.A N GLU 313.A O LEU 317.A H 2.882 2.103 THR 318.A N ALA 314.A O THR 318.A H 3.137 2.373 ALA 319.A N LEU 315.A O ALA 319.A H 3.186 2.369 THR 320.A N ARG 316.A O THR 320.A H 3.069 2.274 THR 320.A OG1 ARG 316.A O THR 320.A HG1 3.178 2.427 THR 320.A OG1 LEU 317.A O THR 320.A HG1 3.030 2.532 GLY 321.A N LEU 317.A O GLY 321.A H 3.009 2.271 VAL 323.A N LEU 317.A O VAL 323.A H 3.343 2.507 ARG 324.A N GLN 199.A OE1 ARG 324.A H 2.730 1.893 GLN 325.A NE2 THR 164.A OG1 GLN 325.A HE22 3.007 2.184 THR 328.A N ARG 351.A O THR 328.A H 3.082 2.331 VAL 331.A N VAL 353.A O VAL 331.A H 2.741 1.888 LEU 333.A N VAL 355.A O LEU 333.A H 2.976 2.258 GLU 335.A N PRO 332.A O GLU 335.A H 3.061 2.250 ALA 336.A N LEU 333.A O ALA 336.A H 3.034 2.436 ALA 339.A N GLU 335.A O ALA 339.A H 3.108 2.316 HIS 340.A N ALA 336.A O HIS 340.A H 3.000 2.184 HIS 340.A NE2 TYR 135.A OH HIS 340.A HE2 3.143 2.307 PHE 341.A N ALA 337.A O PHE 341.A H 2.991 2.142 ARG 342.A N LYS 338.A O ARG 342.A H 2.948 2.095 LEU 343.A N ALA 339.A O LEU 343.A H 2.919 2.102 GLU 344.A N HIS 340.A O GLU 344.A H 2.647 1.819 ASN 345.A N PHE 341.A O ASN 345.A H 3.121 2.273 ARG 346.A N LEU 343.A O ARG 346.A H 3.421 2.579 GLU 347.A N ARG 342.A O GLU 347.A H 3.196 2.484 ARG 351.A N PHE 326.A O ARG 351.A H 3.343 2.555 LEU 354.A N CYS 51.A O LEU 354.A H 2.882 2.022 VAL 355.A N VAL 331.A O VAL 355.A H 2.848 2.048