Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5kka_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 2.A N ASP 71.A OD2 LYS 2.A H 2.810 2.025 LYS 2.A NZ GLU 68.A O LYS 2.A HZ3 2.768 1.898 VAL 3.A N GLU 29.A O VAL 3.A H 2.909 2.089 ALA 4.A N VAL 72.A O ALA 4.A H 2.877 2.042 VAL 5.A N SER 31.A O VAL 5.A H 2.852 2.025 LEU 6.A N LEU 74.A O LEU 6.A H 2.855 2.019 GLY 7.A N TYR 33.A O GLY 7.A H 2.828 2.082 ALA 8.A N TYR 33.A O ALA 8.A H 3.360 2.521 ALA 9.A N ASP 34.A OD2 ALA 9.A H 2.965 2.170 GLY 10.A N GLY 7.A O GLY 10.A H 3.192 2.339 GLN 14.A N GLY 10.A O GLN 14.A H 2.851 2.009 GLN 14.A NE2 ALA 9.A O GLN 14.A HE21 2.979 2.133 ALA 15.A N GLY 11.A O ALA 15.A H 3.469 2.628 LEU 16.A N ILE 12.A O LEU 16.A H 2.851 1.994 ALA 17.A N GLY 13.A O ALA 17.A H 2.821 1.985 LEU 18.A N GLN 14.A O LEU 18.A H 2.934 2.088 LEU 19.A N ALA 15.A O LEU 19.A H 2.999 2.173 LEU 20.A N LEU 16.A O LEU 20.A H 2.794 1.960 LYS 21.A N ALA 17.A O LYS 21.A H 2.855 2.040 LYS 21.A NZ THR 51.A OG1 LYS 21.A HZ2 2.844 1.961 LYS 21.A NZ VAL 53.A O LYS 21.A HZ3 2.715 1.836 THR 22.A N LEU 18.A O THR 22.A H 3.256 2.479 THR 22.A OG1 LEU 18.A O THR 22.A HG1 2.913 2.109 GLN 23.A N LEU 19.A O GLN 23.A H 2.847 2.240 GLN 23.A N LEU 20.A O GLN 23.A H 3.323 2.617 LEU 24.A N LEU 20.A O LEU 24.A H 2.966 2.116 GLY 27.A N ALA 52.A O GLY 27.A H 2.713 1.896 SER 28.A N PRO 25.A O SER 28.A H 2.992 2.226 SER 28.A OG PRO 25.A O SER 28.A HG 2.684 1.949 GLU 29.A N MET 1.A O GLU 29.A H 2.790 1.976 LEU 30.A N LYS 54.A O LEU 30.A H 2.749 1.922 SER 31.A N VAL 3.A O SER 31.A H 2.843 2.014 SER 31.A OG ALA 66.A O SER 31.A HG 2.652 1.812 LEU 32.A N LYS 56.A O LEU 32.A H 2.890 2.069 TYR 33.A N VAL 5.A O TYR 33.A H 2.865 2.043 TYR 33.A OH GLY 60.A O TYR 33.A HH 2.675 2.000 ASP 34.A N PHE 58.A O ASP 34.A H 3.167 2.367 ALA 36.A N ASP 34.A OD1 ALA 36.A H 2.843 1.995 THR 39.A N ALA 36.A O THR 39.A H 3.217 2.377 THR 39.A OG1 ALA 36.A O THR 39.A HG1 2.792 2.021 GLY 41.A N VAL 38.A O GLY 41.A H 2.881 2.282 VAL 42.A N VAL 38.A O VAL 42.A H 3.021 2.239 ALA 43.A N THR 39.A O ALA 43.A H 3.187 2.356 VAL 44.A N PRO 40.A O VAL 44.A H 3.008 2.220 ASP 45.A N GLY 41.A O ASP 45.A H 2.861 2.001 LEU 46.A N VAL 42.A O LEU 46.A H 3.059 2.219 SER 47.A N ALA 43.A O SER 47.A H 2.747 2.024 SER 47.A OG VAL 44.A O SER 47.A HG 2.680 1.842 HIS 48.A N ASP 45.A O HIS 48.A H 3.249 2.410 ILE 49.A N LEU 46.A O ILE 49.A H 3.042 2.192 THR 51.A N ILE 49.A O THR 51.A H 2.814 2.084 THR 51.A OG1 LYS 21.A O THR 51.A HG1 2.773 1.959 LYS 54.A N SER 28.A O LYS 54.A H 3.132 2.366 LYS 56.A N LEU 30.A O LYS 56.A H 3.099 2.337 PHE 58.A N LEU 32.A O PHE 58.A H 2.835 2.181 SER 59.A OG.B ASP 34.A O SER 59.A HG.B 2.854 2.064 ALA 63.A N GLN 93.A OE1 ALA 63.A H 2.839 1.990 THR 64.A N ASP 62.A OD1 THR 64.A H 3.072 2.225 THR 64.A OG1 ASP 62.A OD1 THR 64.A HG1 2.686 1.983 ALA 66.A N ALA 63.A O ALA 66.A H 2.974 2.337 LEU 67.A N ALA 63.A O LEU 67.A H 3.129 2.408 LEU 67.A N THR 64.A O LEU 67.A H 3.007 2.349 GLU 68.A N THR 64.A O GLU 68.A H 2.917 2.220 ALA 70.A N LEU 67.A O ALA 70.A H 2.961 2.121 ASP 71.A N LYS 2.A O ASP 71.A H 2.801 1.999 VAL 72.A N LYS 2.A O VAL 72.A H 3.243 2.468 VAL 73.A N CYS 102.A O VAL 73.A H 2.771 1.955 LEU 74.A N ALA 4.A O LEU 74.A H 2.839 2.000 ILE 75.A N GLY 104.A O ILE 75.A H 2.914 2.083 SER 76.A N LEU 6.A O SER 76.A H 2.820 2.067 ASN 83.A N LEU 79.A O ASN 83.A H 3.037 2.188 ASN 83.A ND2 ASN 108.A O ASN 83.A HD22 3.171 2.348 ALA 84.A N PHE 80.A O ALA 84.A H 2.757 1.902 GLY 85.A N ASN 81.A O GLY 85.A H 2.911 2.096 ILE 86.A N VAL 82.A O ILE 86.A H 3.060 2.266 VAL 87.A N ASN 83.A O VAL 87.A H 3.009 2.192 LYS 88.A N ALA 84.A O LYS 88.A H 3.019 2.167 ASN 89.A N GLY 85.A O ASN 89.A H 2.878 2.030 LEU 90.A N ILE 86.A O LEU 90.A H 2.925 2.086 VAL 91.A N VAL 87.A O VAL 91.A H 2.834 1.982 GLN 92.A N LYS 88.A O GLN 92.A H 3.013 2.200 GLN 93.A N LEU 90.A O GLN 93.A H 3.065 2.473 GLN 93.A NE2 ASN 89.A O GLN 93.A HE21 3.686 2.892 GLN 93.A NE2 ASN 89.A OD1 GLN 93.A HE21 3.067 2.476 VAL 94.A N LEU 90.A O VAL 94.A H 2.985 2.159 ALA 95.A N VAL 91.A O ALA 95.A H 2.842 2.016 LYS 96.A N GLN 92.A O LYS 96.A H 3.251 2.521 LYS 96.A N GLN 93.A O LYS 96.A H 3.224 2.618 THR 97.A N GLN 93.A O THR 97.A H 3.019 2.335 THR 97.A N VAL 94.A O THR 97.A H 3.286 2.600 THR 97.A OG1 GLN 93.A O THR 97.A HG1 3.337 2.726 CYS 98.A N VAL 94.A O CYS 98.A H 2.923 2.124 ALA 101.A N CYS 98.A O ALA 101.A H 3.096 2.239 CYS 102.A N ASP 71.A O CYS 102.A H 2.932 2.145 ILE 103.A N LYS 131.A O ILE 103.A H 2.789 1.961 GLY 104.A N VAL 73.A O GLY 104.A H 2.725 1.882 ILE 105.A N PHE 133.A O ILE 105.A H 2.761 1.912 ILE 106.A N ILE 75.A O ILE 106.A H 2.904 2.091 THR 107.A N ILE 75.A O THR 107.A H 3.222 2.478 THR 107.A OG1 ALA 77.A O THR 107.A HG1 2.657 2.028 VAL 110.A N ASN 108.A OD1 VAL 110.A H 2.873 2.067 ASN 111.A ND2 THR 170.A OG1 ASN 111.A HD21 3.174 2.336 ASN 111.A ND2 ASP 291.A OD2 ASN 111.A HD22 2.916 2.057 THR 112.A N PRO 109.A O THR 112.A H 2.834 2.058 THR 112.A OG1 ASP 291.A O THR 112.A HG1 2.864 2.030 THR 113.A N PRO 109.A O THR 113.A H 2.820 1.993 THR 113.A OG1 THR 107.A O THR 113.A HG1 2.856 2.033 VAL 114.A N VAL 110.A O VAL 114.A H 3.147 2.294 ILE 116.A N THR 112.A O ILE 116.A H 3.002 2.198 ALA 117.A N THR 113.A O ALA 117.A H 2.942 2.130 ALA 118.A N VAL 114.A O ALA 118.A H 2.924 2.116 GLU 119.A N ALA 115.A O GLU 119.A H 3.076 2.253 VAL 120.A N ILE 116.A O VAL 120.A H 2.997 2.167 LEU 121.A N ALA 117.A O LEU 121.A H 2.959 2.139 LYS 122.A N ALA 118.A O LYS 122.A H 2.869 2.065 LYS 122.A NZ GLU 119.A OE2 LYS 122.A HZ2 3.281 2.432 LYS 123.A N GLU 119.A O LYS 123.A H 2.898 2.079 ALA 124.A N VAL 120.A O ALA 124.A H 3.090 2.316 GLY 125.A N LYS 122.A O GLY 125.A H 2.952 2.174 VAL 126.A N LEU 121.A O VAL 126.A H 3.129 2.286 TYR 127.A OH GLU 244.A OE1 TYR 127.A HH 2.703 1.906 LYS 129.A NZ GLY 245.A O LYS 129.A HZ1 2.974 2.128 ASN 130.A N ASP 128.A OD1 ASN 130.A H 2.910 2.085 LYS 131.A N ASP 128.A O LYS 131.A H 2.923 2.083 LYS 131.A NZ LYS 100.A O LYS 131.A HZ3 2.864 2.024 PHE 133.A N ILE 103.A O PHE 133.A H 2.869 2.085 GLY 134.A N TYR 242.A O GLY 134.A H 2.784 1.938 VAL 135.A N ILE 105.A O VAL 135.A H 2.918 2.060 ASP 139.A N THR 136.A O ASP 139.A H 2.806 2.065 ILE 141.A N THR 137.A O ILE 141.A H 2.972 2.151 ARG 142.A N LEU 138.A O ARG 142.A H 3.002 2.153 SER 143.A N ASP 139.A O SER 143.A H 3.041 2.204 SER 143.A OG ASP 139.A O SER 143.A HG 2.858 2.101 ASN 144.A N ILE 140.A O ASN 144.A H 2.845 2.020 ASN 144.A ND2 GLU 159.A OE1 ASN 144.A HD21 2.938 2.191 THR 145.A N ILE 141.A O THR 145.A H 2.997 2.165 PHE 146.A N ARG 142.A O PHE 146.A H 2.941 2.111 VAL 147.A N SER 143.A O VAL 147.A H 2.903 2.048 ALA 148.A N ASN 144.A O ALA 148.A H 2.947 2.098 GLU 149.A N THR 145.A O GLU 149.A H 3.050 2.241 LEU 150.A N PHE 146.A O LEU 150.A H 3.089 2.247 LYS 151.A N VAL 147.A O LYS 151.A H 2.947 2.203 LYS 151.A NZ SER 182.A O LYS 151.A HZ1 2.890 2.108 GLY 152.A N GLU 149.A O GLY 152.A H 3.424 2.568 LYS 153.A N ALA 148.A O LYS 153.A H 2.989 2.234 GLU 157.A N GLN 154.A O GLU 157.A H 3.005 2.170 VAL 158.A N PRO 155.A O VAL 158.A H 3.360 2.518 VAL 160.A N ASN 144.A OD1 VAL 160.A H 2.865 2.156 ILE 163.A N LEU 172.A O ILE 163.A H 2.928 2.087 GLY 164.A N SER 254.A O GLY 164.A H 2.962 2.171 GLY 165.A N THR 170.A O GLY 165.A H 2.716 1.871 HIS 166.A N ASN 111.A OD1 HIS 166.A H 2.797 2.030 HIS 166.A ND1 ASP 139.A OD2 HIS 166.A HD1 2.661 1.907 SER 167.A N THR 170.A OG1 SER 167.A H 3.195 2.349 THR 170.A N SER 167.A O THR 170.A H 3.031 2.235 THR 170.A OG1 SER 167.A O THR 170.A HG1 2.603 1.769 ILE 171.A N GLY 168.A O ILE 171.A H 3.111 2.258 LEU 172.A N ILE 163.A O LEU 172.A H 3.022 2.235 LEU 174.A N PRO 161.A O LEU 174.A H 2.771 1.925 SER 176.A N GLU 277.A OE2 SER 176.A H 2.905 2.069 GLN 177.A N LEU 174.A O GLN 177.A H 2.969 2.114 GLN 177.A NE2 ILE 270.A O GLN 177.A HE22 2.827 1.970 GLN 177.A NE2 THR 272.A O GLN 177.A HE21 2.915 2.070 VAL 181.A N VAL 178.A O VAL 181.A H 3.298 2.526 THR 184.A N GLU 187.A OE2 THR 184.A H 2.961 2.153 GLN 186.A NE2 ASP 190.A OD1 GLN 186.A HE21 3.102 2.403 GLN 186.A NE2 ASP 190.A OD2 GLN 186.A HE21 3.306 2.466 GLU 187.A N THR 184.A OG1 GLU 187.A H 3.097 2.253 VAL 188.A N THR 184.A O VAL 188.A H 2.858 2.033 ALA 189.A N GLU 185.A O ALA 189.A H 2.946 2.144 ASP 190.A N GLN 186.A O ASP 190.A H 2.988 2.138 LEU 191.A N GLU 187.A O LEU 191.A H 2.842 2.000 THR 192.A N VAL 188.A O THR 192.A H 2.799 1.972 THR 192.A OG1 VAL 188.A O THR 192.A HG1 2.727 1.990 LYS 193.A N ALA 189.A O LYS 193.A H 3.146 2.311 ARG 194.A N ASP 190.A O ARG 194.A H 2.977 2.189 ARG 194.A NE GLU 201.A OE2 ARG 194.A HE 2.824 1.964 ARG 194.A NH2 GLU 201.A OE1 ARG 194.A HH21 3.123 2.271 ILE 195.A N LEU 191.A O ILE 195.A H 2.943 2.112 GLN 196.A N THR 192.A O GLN 196.A H 2.916 2.095 GLN 196.A NE2 ILE 171.A O GLN 196.A HE21 2.897 2.041 ASN 197.A N LYS 193.A O ASN 197.A H 3.008 2.350 ASN 197.A N ARG 194.A O ASN 197.A H 3.266 2.565 ALA 198.A N ILE 195.A O ALA 198.A H 3.442 2.589 THR 200.A N ASN 197.A O THR 200.A H 2.985 2.224 GLU 201.A N ALA 198.A O GLU 201.A H 3.012 2.371 VAL 202.A N GLY 199.A O VAL 202.A H 3.186 2.564 VAL 203.A N GLY 199.A O VAL 203.A H 3.126 2.306 GLU 204.A N THR 200.A O GLU 204.A H 2.865 2.016 ALA 205.A N GLU 201.A O ALA 205.A H 3.163 2.352 LYS 206.A N VAL 202.A O LYS 206.A H 2.875 2.074 LYS 206.A NZ SER 211.A O LYS 206.A HZ2 2.615 1.727 ALA 207.A N GLU 204.A O ALA 207.A H 3.004 2.215 GLY 208.A N VAL 203.A O GLY 208.A H 3.085 2.288 GLY 209.A N LYS 206.A O GLY 209.A H 2.696 1.893 GLY 217.A N THR 213.A O GLY 217.A H 2.832 2.021 GLN 218.A N LEU 214.A O GLN 218.A H 3.025 2.222 ALA 219.A N SER 215.A O ALA 219.A H 2.845 2.019 ALA 220.A N MET 216.A O ALA 220.A H 2.769 1.919 ALA 221.A N GLY 217.A O ALA 221.A H 2.864 2.085 ARG 222.A N GLN 218.A O ARG 222.A H 2.898 2.055 ARG 222.A NE GLU 239.A OE1 ARG 222.A HE 3.188 2.408 ARG 222.A NE GLU 239.A OE2 ARG 222.A HE 3.230 2.515 ARG 222.A NH1 GLU 159.A OE1 ARG 222.A HH12 3.217 2.385 ARG 222.A NH2 GLU 159.A OE2 ARG 222.A HH22 2.546 1.701 ARG 222.A NH2 GLU 239.A OE1 ARG 222.A HH21 3.076 2.283 PHE 223.A N ALA 219.A O PHE 223.A H 3.007 2.168 GLY 224.A N ALA 220.A O GLY 224.A H 2.829 1.972 LEU 225.A N ALA 221.A O LEU 225.A H 2.784 1.937 SER 226.A N ARG 222.A O SER 226.A H 2.981 2.190 SER 226.A OG GLU 239.A OE2 SER 226.A HG 2.648 1.836 LEU 227.A N PHE 223.A O LEU 227.A H 2.986 2.169 VAL 228.A N GLY 224.A O VAL 228.A H 2.945 2.123 ARG 229.A N LEU 225.A O ARG 229.A H 2.973 2.151 ARG 229.A NE GLU 234.A OE1 ARG 229.A HE 3.346 2.526 ALA 230.A N SER 226.A O ALA 230.A H 3.071 2.224 LEU 231.A N LEU 227.A O LEU 231.A H 2.793 1.947 GLN 232.A N VAL 228.A O GLN 232.A H 3.113 2.348 GLN 232.A N ARG 229.A O GLN 232.A H 3.146 2.538 GLN 232.A NE2 VAL 228.A O GLN 232.A HE21 3.597 2.791 GLY 233.A N ALA 230.A O GLY 233.A H 2.885 2.057 GLU 234.A N ARG 229.A O GLU 234.A H 3.101 2.286 GLU 239.A N LEU 257.A O GLU 239.A H 2.999 2.240 CYS 240.A SG VAL 162.A O CYS 240.A HG 3.472 2.748 TYR 242.A N GLY 134.A O TYR 242.A H 3.131 2.307 TYR 242.A OH ASN 111.A O TYR 242.A HH 2.833 2.119 VAL 243.A N PHE 253.A O VAL 243.A H 3.234 2.381 GLY 245.A N ARG 251.A O GLY 245.A H 3.234 2.436 GLN 248.A N ASP 246.A OD1 GLN 248.A H 2.952 2.111 ARG 251.A NH1 GLU 244.A OE2 ARG 251.A HH11 2.767 1.966 PHE 253.A N VAL 243.A O PHE 253.A H 2.972 2.179 SER 254.A N GLY 164.A O SER 254.A H 2.770 1.931 GLN 255.A NE2 LYS 268.A O GLN 255.A HE21 2.770 1.992 LEU 257.A N GLU 239.A O LEU 257.A H 2.877 2.162 LEU 258.A N GLU 266.A O LEU 258.A H 2.818 2.053 LEU 259.A N VAL 237.A O LEU 259.A H 2.851 1.999 GLY 260.A N GLY 263.A O GLY 260.A H 2.731 1.898 GLY 263.A N GLY 260.A O GLY 263.A H 3.291 2.501 VAL 264.A N ASN 130.A O VAL 264.A H 2.749 1.915 GLU 265.A N LEU 258.A O GLU 265.A H 2.760 1.957 GLU 266.A N LEU 258.A O GLU 266.A H 3.058 2.244 ARG 267.A NE GLU 244.A O ARG 267.A HE 3.080 2.464 ARG 267.A NH1 ASN 130.A OD1 ARG 267.A HH12 2.853 2.018 ARG 267.A NH2 ASN 130.A OD1 ARG 267.A HH22 3.282 2.588 ARG 267.A NH2 GLU 244.A O ARG 267.A HH21 2.841 2.184 LYS 268.A N PRO 256.A O LYS 268.A H 2.914 2.092 GLY 271.A N SER 269.A OG GLY 271.A H 2.919 2.105 SER 274.A N GLU 277.A OE1 SER 274.A H 2.910 2.075 GLU 277.A N SER 274.A OG GLU 277.A H 3.024 2.179 GLN 278.A N SER 274.A O GLN 278.A H 2.846 1.997 GLN 278.A NE2 LEU 273.A O GLN 278.A HE21 2.940 2.137 ASN 279.A N ALA 275.A O ASN 279.A H 3.030 2.185 ALA 280.A N PHE 276.A O ALA 280.A H 2.940 2.128 LEU 281.A N GLU 277.A O LEU 281.A H 2.885 2.056 GLU 282.A N GLN 278.A O GLU 282.A H 3.045 2.189 GLY 283.A N ASN 279.A O GLY 283.A H 2.953 2.207 MET 284.A N LEU 281.A O MET 284.A H 3.283 2.463 LEU 288.A N MET 284.A O LEU 288.A H 3.019 2.173 LYS 289.A N LEU 285.A O LYS 289.A H 2.877 2.038 LYS 290.A N ASP 286.A O LYS 290.A H 3.082 2.310 ASP 291.A N THR 287.A O ASP 291.A H 2.950 2.127 ILE 292.A N LEU 288.A O ILE 292.A H 3.014 2.207 ALA 293.A N LYS 289.A O ALA 293.A H 3.011 2.187 LEU 294.A N LYS 290.A O LEU 294.A H 3.035 2.230 GLY 295.A N ILE 292.A O GLY 295.A H 2.992 2.317 GLU 296.A N ILE 292.A O GLU 296.A H 3.241 2.415 GLU 297.A N ALA 293.A O GLU 297.A H 2.944 2.106 PHE 298.A N LEU 294.A O PHE 298.A H 3.055 2.287 VAL 299.A N GLY 295.A O VAL 299.A H 3.367 2.591 ASN 300.A N GLU 297.A O ASN 300.A H 2.879 2.257