Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5kn1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TYR 6.A OH VAL 9.A O TYR 6.A HH 2.635 1.846 ASP 7.A N GLN 60.A OE1 ASP 7.A H 2.844 2.065 VAL 9.A N ASP 7.A OD1 VAL 9.A H 3.019 2.172 ARG 11.A N GLU 56.A OE1 ARG 11.A H 3.020 2.162 ARG 11.A NE GLU 63.A OE2 ARG 11.A HE 3.220 2.442 ARG 11.A NH1 ASP 7.A OD1 ARG 11.A HH12 3.068 2.258 ARG 11.A NH2 ASP 7.A OD1 ARG 11.A HH22 3.488 2.800 ARG 11.A NH2 ASP 7.A OD2 ARG 11.A HH22 2.793 1.941 VAL 12.A N GLU 56.A OE2 VAL 12.A H 3.007 2.188 ASN 14.A ND2 ASP 77.A OD2 ASN 14.A HD21 2.888 2.055 VAL 15.A N MET 71.A O VAL 15.A H 2.708 1.864 ASN 16.A N ASN 19.A OD1 ASN 16.A H 2.738 1.885 ASN 16.A ND2 ASN 14.A OD1 ASN 16.A HD22 2.740 1.895 LYS 18.A N ASN 16.A OD1 LYS 18.A H 2.945 2.252 ASN 19.A N ASN 16.A O ASN 19.A H 3.166 2.510 ASN 19.A N ASN 16.A OD1 ASN 19.A H 3.243 2.533 ASN 19.A ND2 ASN 14.A O ASN 19.A HD21 2.914 2.060 TYR 20.A N ASN 16.A O TYR 20.A H 2.947 2.262 VAL 23.A N ASN 19.A O VAL 23.A H 2.902 2.090 PHE 24.A N TYR 20.A O PHE 24.A H 3.008 2.150 LYS 25.A N LYS 21.A O LYS 25.A H 3.258 2.516 LYS 26.A N ASN 22.A O LYS 26.A H 2.893 2.200 LYS 26.A N VAL 23.A O LYS 26.A H 2.952 2.351 VAL 29.A N GLY 66.A O VAL 29.A H 2.975 2.125 LEU 30.A N PHE 95.A O LEU 30.A H 3.383 2.590 ALA 31.A N GLY 68.A O ALA 31.A H 2.832 2.005 LEU 32.A N TYR 93.A O LEU 32.A H 2.847 2.027 LEU 33.A N GLY 70.A O LEU 33.A H 2.833 2.019 TYR 34.A N SER 91.A O TYR 34.A H 3.052 2.204 HIS 35.A N VAL 72.A O HIS 35.A H 3.028 2.184 HIS 35.A ND1 GLU 36.A O HIS 35.A HD1 2.839 1.992 SER 44.A N ASP 41.A OD2 SER 44.A H 2.972 2.158 SER 44.A OG ASP 41.A OD2 SER 44.A HG 3.083 2.296 GLN 45.A N ASP 41.A O GLN 45.A H 2.986 2.178 GLN 45.A NE2 GLU 39.A O GLN 45.A HE21 2.888 2.238 ARG 46.A N LYS 42.A O ARG 46.A H 2.828 1.997 ARG 46.A NH2 GLU 49.A OE2 ARG 46.A HH21 3.488 2.914 GLN 47.A N ALA 43.A O GLN 47.A H 2.940 2.092 GLN 47.A NE2 ASP 51.A OD1 GLN 47.A HE21 2.755 2.131 PHE 48.A N SER 44.A O PHE 48.A H 3.042 2.224 GLU 49.A N GLN 45.A O GLU 49.A H 2.928 2.113 MET 50.A N ARG 46.A O MET 50.A H 2.796 1.995 ASP 51.A N GLN 47.A O ASP 51.A H 2.830 2.008 GLU 52.A N PHE 48.A O GLU 52.A H 2.969 2.146 LEU 53.A N GLU 49.A O LEU 53.A H 2.968 2.149 ILE 54.A N MET 50.A O ILE 54.A H 3.106 2.322 LEU 55.A N ASP 51.A O LEU 55.A H 3.243 2.435 GLU 56.A N GLU 52.A O GLU 56.A H 2.781 1.972 LEU 57.A N LEU 53.A O LEU 57.A H 2.974 2.166 ALA 58.A N ILE 54.A O ALA 58.A H 3.147 2.299 ALA 59.A N LEU 55.A O ALA 59.A H 2.838 2.015 GLN 60.A N GLU 56.A O GLN 60.A H 2.970 2.132 GLN 60.A NE2 GLU 5.A O GLN 60.A HE22 3.049 2.215 VAL 61.A N LEU 57.A O VAL 61.A H 2.956 2.147 LEU 62.A N ALA 58.A O LEU 62.A H 3.037 2.275 GLU 63.A N GLN 60.A O GLU 63.A H 3.398 2.539 LYS 65.A N LEU 62.A O LYS 65.A H 3.094 2.270 GLY 66.A N GLU 63.A O GLY 66.A H 3.274 2.430 GLY 68.A N VAL 29.A O GLY 68.A H 2.830 2.038 GLY 70.A N ALA 31.A O GLY 70.A H 2.879 2.098 MET 71.A N VAL 13.A O MET 71.A H 3.153 2.383 VAL 72.A N LEU 33.A O VAL 72.A H 2.809 1.980 ASP 73.A N ASP 77.A OD2 ASP 73.A H 2.945 2.157 SER 74.A N HIS 35.A O SER 74.A H 2.764 1.973 SER 74.A OG GLU 89.A OE2 SER 74.A HG 3.244 2.450 GLU 75.A N ASP 73.A OD1 GLU 75.A H 2.879 2.080 LYS 76.A N ASP 73.A OD1 LYS 76.A H 2.983 2.188 LYS 76.A NZ ASN 14.A OD1 LYS 76.A HZ1 2.798 1.964 LYS 76.A NZ ASP 77.A OD1 LYS 76.A HZ2 2.731 2.012 ASP 77.A N ASP 73.A O ASP 77.A H 2.794 1.997 ALA 81.A N ASP 77.A O ALA 81.A H 2.862 2.019 LYS 82.A N ALA 78.A O LYS 82.A H 2.995 2.196 LYS 83.A N ALA 79.A O LYS 83.A H 3.083 2.243 LEU 84.A N VAL 80.A O LEU 84.A H 2.943 2.136 GLY 85.A N LYS 82.A O GLY 85.A H 3.129 2.357 LEU 86.A N ALA 81.A O LEU 86.A H 2.814 1.994 THR 87.A N TYR 93.A OH THR 87.A H 3.175 2.375 GLU 88.A N TYR 93.A OH GLU 88.A H 2.840 2.028 ASP 90.A N TYR 34.A O ASP 90.A H 2.687 1.882 SER 91.A N GLU 88.A O SER 91.A H 3.194 2.377 SER 91.A OG GLU 102.A OE2 SER 91.A HG 2.792 2.200 VAL 92.A N TYR 103.A O VAL 92.A H 3.006 2.182 TYR 93.A N LEU 32.A O TYR 93.A H 2.853 2.029 VAL 94.A N ILE 101.A O VAL 94.A H 2.686 1.844 PHE 95.A N LEU 30.A O PHE 95.A H 2.842 1.994 LYS 96.A N GLU 99.A O LYS 96.A H 3.137 2.363 LYS 96.A NZ VAL 119.A O LYS 96.A HZ2 2.897 2.036 GLU 99.A N LYS 96.A O GLU 99.A H 2.863 2.013 ILE 101.A N VAL 94.A O ILE 101.A H 2.703 1.855 TYR 103.A N VAL 92.A O TYR 103.A H 2.694 1.839 TYR 103.A OH GLU 106.A O TYR 103.A HH 2.691 1.867 GLU 106.A N PRO 232.A O GLU 106.A H 2.754 1.921 THR 111.A N ASP 110.A OD1 THR 111.A H 2.625 1.980 THR 111.A OG1 GLU 106.A OE2 THR 111.A HG1 2.792 2.005 LEU 112.A N SER 108.A O LEU 112.A H 2.900 2.063 VAL 113.A N ALA 109.A O VAL 113.A H 2.856 2.016 GLU 114.A N ASP 110.A O GLU 114.A H 2.909 2.059 PHE 115.A N THR 111.A O PHE 115.A H 2.998 2.181 LEU 116.A N LEU 112.A O LEU 116.A H 2.917 2.077 LEU 117.A N VAL 113.A O LEU 117.A H 2.814 1.967 ASP 118.A N GLU 114.A O ASP 118.A H 2.989 2.218 VAL 119.A N PHE 115.A O VAL 119.A H 2.811 2.020 LEU 120.A N LEU 116.A O LEU 120.A H 2.953 2.174 GLU 121.A N ASP 118.A O GLU 121.A H 3.172 2.396 GLU 125.A N PHE 173.A O GLU 125.A H 3.031 2.204 ILE 127.A N ALA 175.A O ILE 127.A H 2.845 2.144 GLU 128.A N GLU 132.A OE2 GLU 128.A H 2.776 1.997 LEU 133.A N GLY 129.A O LEU 133.A H 3.118 2.299 GLN 134.A N GLU 130.A O GLN 134.A H 2.891 2.085 GLN 134.A NE2 GLN 134.A O GLN 134.A HE21 3.366 2.888 GLN 134.A NE2 ASN 138.A OD1 GLN 134.A HE21 2.933 2.145 ALA 135.A N ARG 131.A O ALA 135.A H 2.995 2.184 PHE 136.A N GLU 132.A O PHE 136.A H 2.996 2.213 GLU 137.A N LEU 133.A O GLU 137.A H 2.977 2.163 ASN 138.A N GLN 134.A O ASN 138.A H 2.951 2.240 ILE 139.A N PHE 136.A O ILE 139.A H 3.173 2.353 ASN 143.A ND2 LYS 223.A O ASN 143.A HD21 2.865 2.231 LYS 144.A N TYR 195.A O LYS 144.A H 3.064 2.266 LYS 144.A NZ PHE 136.A O LYS 144.A HZ2 2.781 2.042 LYS 144.A NZ ILE 139.A O LYS 144.A HZ3 2.745 1.887 LEU 145.A N PRO 172.A O LEU 145.A H 3.180 2.357 ILE 146.A N ASP 193.A O ILE 146.A H 2.997 2.196 GLY 147.A N PHE 174.A O GLY 147.A H 3.070 2.318 TYR 148.A N GLU 191.A O TYR 148.A H 3.212 2.406 PHE 149.A N THR 176.A O PHE 149.A H 2.995 2.174 LYS 152.A NZ ASP 153.A OD1 LYS 152.A HZ3 3.219 2.426 ASP 153.A N ASN 151.A OD1 ASP 153.A H 2.871 2.147 SER 154.A N ASN 151.A O SER 154.A H 3.197 2.363 HIS 156.A N SER 154.A OG HIS 156.A H 3.025 2.291 TYR 157.A N SER 154.A OG TYR 157.A H 3.417 2.624 LYS 158.A N SER 154.A O LYS 158.A H 2.992 2.184 LYS 158.A NZ ASP 153.A O LYS 158.A HZ2 3.466 2.908 ALA 159.A N GLU 155.A O ALA 159.A H 3.011 2.197 TYR 160.A N HIS 156.A O TYR 160.A H 3.127 2.325 TYR 160.A OH PHE 174.A O TYR 160.A HH 2.589 1.919 GLU 161.A N TYR 157.A O GLU 161.A H 2.869 2.045 ASP 162.A N LYS 158.A O ASP 162.A H 2.935 2.123 ALA 163.A N ALA 159.A O ALA 163.A H 2.982 2.177 ALA 164.A N TYR 160.A O ALA 164.A H 2.860 2.075 GLU 165.A N GLU 161.A O GLU 165.A H 3.248 2.509 GLU 166.A N ALA 163.A O GLU 166.A H 3.057 2.309 PHE 167.A N ALA 164.A O PHE 167.A H 3.191 2.427 HIS 168.A NE2 VAL 119.A O HIS 168.A HE2 2.918 2.175 TYR 170.A N PHE 167.A O TYR 170.A H 2.828 2.068 TYR 170.A OH GLU 102.A O TYR 170.A HH 2.663 1.918 ILE 171.A N PHE 167.A O ILE 171.A H 3.383 2.615 PHE 174.A N LEU 145.A O PHE 174.A H 2.774 1.948 ALA 175.A N GLU 125.A O ALA 175.A H 2.962 2.189 THR 176.A N GLY 147.A O THR 176.A H 2.895 2.086 THR 176.A OG1 ILE 127.A O THR 176.A HG1 2.937 2.180 ASP 178.A N THR 176.A OG1 ASP 178.A H 2.975 2.128 LYS 180.A N ASP 178.A OD1 LYS 180.A H 3.033 2.240 ALA 182.A N ASP 178.A O ALA 182.A H 2.916 2.078 LYS 183.A N SER 179.A O LYS 183.A H 3.060 2.275 LYS 184.A N LYS 180.A O LYS 184.A H 3.261 2.435 LEU 185.A N VAL 181.A O LEU 185.A H 3.035 2.230 THR 186.A N LYS 183.A O THR 186.A H 2.978 2.179 THR 186.A OG1 LEU 185.A O THR 186.A HG1 2.674 1.931 LEU 187.A N ALA 182.A O LEU 187.A H 2.843 2.029 LYS 188.A N GLU 191.A OE1 LYS 188.A H 3.120 2.272 ASN 190.A N TYR 148.A O ASN 190.A H 2.616 1.827 GLU 191.A N LYS 188.A O GLU 191.A H 2.866 2.017 ASP 193.A N ILE 146.A O ASP 193.A H 2.900 2.059 PHE 194.A N VAL 203.A O PHE 194.A H 2.789 1.930 TYR 195.A N LYS 144.A O TYR 195.A H 2.741 1.896 ALA 197.A N ASN 143.A OD1 ALA 197.A H 2.816 1.997 PHE 198.A N GLU 140.A O PHE 198.A H 2.875 2.198 MET 199.A N GLU 196.A O MET 199.A H 3.019 2.175 VAL 203.A N PHE 194.A O VAL 203.A H 2.787 1.953 THR 204.A OG1 ASP 193.A OD1 THR 204.A HG1 2.733 1.896 ILE 205.A N ILE 192.A O ILE 205.A H 2.868 2.035 ASN 210.A ND2 PRO 206.A O ASN 210.A HD21 2.828 2.083 ASN 210.A ND2 GLU 214.A OE1 ASN 210.A HD22 3.513 2.678 SER 211.A N GLU 214.A OE1 SER 211.A H 2.908 2.105 GLU 214.A N SER 211.A OG GLU 214.A H 3.194 2.358 ILE 215.A N SER 211.A O ILE 215.A H 3.086 2.274 VAL 216.A N GLU 212.A O VAL 216.A H 2.858 2.006 SER 217.A N GLU 213.A O SER 217.A H 2.897 2.043 PHE 218.A N GLU 214.A O PHE 218.A H 3.083 2.256 VAL 219.A N ILE 215.A O VAL 219.A H 2.844 2.005 GLU 220.A N VAL 216.A O GLU 220.A H 2.921 2.068 ALA 221.A N SER 217.A O ALA 221.A H 3.178 2.413 ALA 221.A N PHE 218.A O ALA 221.A H 3.122 2.535 HIS 222.A N PHE 218.A O HIS 222.A H 3.120 2.430 HIS 222.A N VAL 219.A O HIS 222.A H 3.146 2.481 HIS 222.A ND1 PHE 218.A O HIS 222.A HD1 2.867 2.021 LYS 223.A NZ GLU 220.A OE1 LYS 223.A HZ3 2.844 2.014 ARG 224.A NE ASP 241.A OD2 ARG 224.A HE 2.805 1.971 ARG 224.A NH2 ASP 241.A OD1 ARG 224.A HH21 2.720 1.887 ARG 224.A NH2 ASP 241.A OD2 ARG 224.A HH21 3.297 2.627 THR 226.A N GLU 196.A OE2 THR 226.A H 2.701 1.860 ARG 228.A N ILE 281.A O ARG 228.A H 2.921 2.091 ARG 228.A NH1 ASP 241.A OD2 ARG 228.A HH12 2.687 1.925 ARG 228.A NH2 ASP 241.A O ARG 228.A HH22 2.762 1.989 ARG 228.A NH2 ASP 241.A OD2 ARG 228.A HH22 3.309 2.727 ARG 228.A NH2 SER 280.A OG ARG 228.A HH21 3.254 2.607 LEU 230.A N TRP 283.A O LEU 230.A H 2.834 2.009 LYS 231.A NZ ASP 141.A O LYS 231.A HZ1 3.334 2.690 LYS 231.A NZ ASP 141.A OD1 LYS 231.A HZ1 3.066 2.283 LYS 231.A NZ ASP 142.A OD1 LYS 231.A HZ2 2.883 2.216 SER 234.A N LYS 231.A O SER 234.A H 2.990 2.171 TYR 236.A N ASP 104.A O TYR 236.A H 3.129 2.483 GLU 237.A N ASP 104.A O GLU 237.A H 3.105 2.340 THR 238.A N SER 234.A O THR 238.A H 3.035 2.187 TRP 239.A N MET 235.A O TRP 239.A H 2.991 2.159 GLU 240.A N TYR 236.A O GLU 240.A H 2.860 2.035 ASP 241.A N THR 238.A O ASP 241.A H 3.107 2.326 LEU 243.A N ILE 246.A O LEU 243.A H 3.322 2.492 GLY 245.A N ASP 242.A OD2 GLY 245.A H 2.664 1.925 ILE 246.A N LEU 243.A O ILE 246.A H 3.147 2.405 HIS 247.A N VAL 312.A O HIS 247.A H 2.951 2.105 HIS 247.A NE2 TRP 239.A O HIS 247.A HE2 2.819 1.974 VAL 249.A N GLY 310.A O VAL 249.A H 2.849 2.012 ALA 250.A N ILE 282.A O ALA 250.A H 2.842 1.994 PHE 251.A N GLN 308.A O PHE 251.A H 2.781 1.985 ALA 252.A N ILE 284.A O ALA 252.A H 3.131 2.343 GLU 254.A N ASP 285.A OD2 GLU 254.A H 2.851 1.994 ASP 256.A N GLU 253.A O ASP 256.A H 3.042 2.285 ASP 258.A N ASP 256.A OD2 ASP 258.A H 3.026 2.356 GLY 259.A N ASP 256.A OD2 GLY 259.A H 3.299 2.518 TYR 260.A N ASP 256.A O TYR 260.A H 2.752 1.906 GLU 261.A N PRO 257.A O GLU 261.A H 3.019 2.196 PHE 262.A N ASP 258.A O PHE 262.A H 3.056 2.221 LEU 263.A N GLY 259.A O LEU 263.A H 2.875 2.053 GLU 264.A N TYR 260.A O GLU 264.A H 2.927 2.112 THR 265.A N GLU 261.A O THR 265.A H 3.247 2.434 LEU 266.A N PHE 262.A O LEU 266.A H 2.913 2.087 LYS 267.A N LEU 263.A O LYS 267.A H 2.841 2.007 LYS 267.A NZ GLU 264.A OE2 LYS 267.A HZ2 3.303 2.544 ALA 268.A N GLU 264.A O ALA 268.A H 2.966 2.141 VAL 269.A N THR 265.A O VAL 269.A H 2.931 2.128 ALA 270.A N LEU 266.A O ALA 270.A H 2.868 2.029 GLN 271.A N LYS 267.A O GLN 271.A H 2.860 2.040 GLN 271.A NE2 PHE 198.A O GLN 271.A HE21 2.845 1.989 ASP 272.A N ALA 268.A O ASP 272.A H 3.067 2.240 ASN 273.A N VAL 269.A O ASN 273.A H 3.155 2.535 ASN 273.A N ALA 270.A O ASN 273.A H 3.133 2.395 ASN 273.A ND2 VAL 269.A O ASN 273.A HD22 2.873 2.020 ASN 273.A ND2 GLU 337.A OE1 ASN 273.A HD21 3.043 2.214 ASN 276.A N ASN 273.A O ASN 276.A H 3.046 2.208 ASP 278.A N ASN 276.A OD1 ASP 278.A H 2.826 2.025 LEU 279.A N ASN 276.A O LEU 279.A H 3.136 2.277 ILE 281.A N THR 226.A O ILE 281.A H 2.847 2.025 ILE 282.A N ILE 248.A O ILE 282.A H 2.769 1.916 TRP 283.A N ARG 228.A O TRP 283.A H 2.876 2.058 TRP 283.A NE1 ALA 252.A O TRP 283.A HE1 2.883 2.029 ILE 284.A N ALA 250.A O ILE 284.A H 2.845 2.005 ASP 287.A N ASP 285.A OD1 ASP 287.A H 2.895 2.082 ASP 288.A N ASP 285.A O ASP 288.A H 2.886 2.039 PHE 289.A N PRO 286.A O PHE 289.A H 3.102 2.272 LEU 292.A N PHE 289.A O LEU 292.A H 2.966 2.161 VAL 293.A N PRO 290.A O VAL 293.A H 3.265 2.445 TRP 296.A N LEU 292.A O TRP 296.A H 2.861 2.032 GLU 297.A N VAL 293.A O GLU 297.A H 2.936 2.106 LYS 298.A N PRO 294.A O LYS 298.A H 3.054 2.229 THR 299.A N TYR 295.A O THR 299.A H 2.862 2.023 THR 299.A OG1 TYR 295.A O THR 299.A HG1 2.812 2.070 PHE 300.A N TRP 296.A O PHE 300.A H 2.938 2.085 ASN 301.A N GLU 297.A O ASN 301.A H 2.836 2.232 ILE 302.A N GLU 297.A O ILE 302.A H 3.237 2.522 LEU 304.A N GLU 297.A OE2 LEU 304.A H 2.738 1.915 SER 305.A N ASP 303.A OD1 SER 305.A H 2.940 2.131 SER 305.A OG ASP 303.A OD1 SER 305.A HG 2.583 1.748 ALA 306.A N ASP 303.A O ALA 306.A H 3.257 2.410 GLN 308.A N PHE 251.A O GLN 308.A H 3.106 2.291 GLN 308.A NE2 ASP 303.A O GLN 308.A HE21 2.865 2.049 GLY 310.A N VAL 249.A O GLY 310.A H 2.897 2.103 VAL 311.A N VAL 320.A O VAL 311.A H 2.848 2.054 VAL 312.A N HIS 247.A O VAL 312.A H 2.745 1.891 ASN 313.A N ASP 318.A O ASN 313.A H 2.662 1.819 VAL 314.A N GLY 245.A O VAL 314.A H 2.912 2.224 ASP 316.A N ASN 313.A OD1 ASP 316.A H 2.794 1.974 ASP 318.A N ASN 313.A O ASP 318.A H 3.197 2.419 SER 319.A N ASP 318.A OD1 SER 319.A H 2.897 2.256 VAL 320.A N VAL 311.A O VAL 320.A H 3.005 2.230 TRP 321.A NE1 SER 319.A OG TRP 321.A HE1 2.875 2.154 MET 322.A N ILE 309.A O MET 322.A H 2.877 2.040 ASP 325.A N ASP 329.A OD2 ASP 325.A H 2.886 2.051 GLU 328.A N ASP 326.A OD1 GLU 328.A H 2.846 2.090 ASP 329.A N ASP 326.A O ASP 329.A H 3.013 2.168 SER 332.A N GLU 335.A OE1 SER 332.A H 2.930 2.109 GLU 335.A N SER 332.A OG GLU 335.A H 3.056 2.206 LEU 336.A N SER 332.A O LEU 336.A H 2.827 2.013 GLU 337.A N ALA 333.A O GLU 337.A H 2.852 2.000 ASP 338.A N GLU 334.A O ASP 338.A H 2.914 2.065 TRP 339.A N GLU 335.A O TRP 339.A H 2.853 2.065 LEU 340.A N LEU 336.A O LEU 340.A H 3.063 2.217 GLU 341.A N GLU 337.A O GLU 341.A H 3.008 2.163 ASP 342.A N ASP 338.A O ASP 342.A H 2.958 2.153 VAL 343.A N TRP 339.A O VAL 343.A H 3.076 2.264 LEU 344.A N LEU 340.A O LEU 344.A H 2.909 2.112 GLU 345.A N GLU 341.A O GLU 345.A H 2.967 2.188 GLY 346.A N LEU 344.A O GLY 346.A H 2.637 1.950