Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5kn2_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TYR 6.A OH VAL 9.A O TYR 6.A HH 2.739 1.927 ASP 7.A N GLN 60.A OE1 ASP 7.A H 2.917 2.158 VAL 9.A N ASP 7.A OD1 VAL 9.A H 3.012 2.167 ARG 11.A N GLU 56.A OE1 ARG 11.A H 2.955 2.102 ARG 11.A N GLU 56.A OE2 ARG 11.A H 3.212 2.577 ARG 11.A NE GLU 63.A OE2 ARG 11.A HE 2.950 2.162 ARG 11.A NH1 ASP 7.A OD1 ARG 11.A HH12 3.054 2.228 ARG 11.A NH2 ASP 7.A OD2 ARG 11.A HH22 2.819 1.967 VAL 12.A N GLU 56.A OE2 VAL 12.A H 2.778 1.953 ASN 14.A ND2 ASP 77.A OD2 ASN 14.A HD21 2.674 1.824 VAL 15.A N MET 71.A O VAL 15.A H 2.572 1.730 ASN 16.A N ASN 19.A OD1 ASN 16.A H 2.858 2.009 ASN 16.A ND2 ASN 14.A OD1 ASN 16.A HD22 2.831 2.009 LYS 18.A N ASN 16.A OD1 LYS 18.A H 3.109 2.395 ASN 19.A N ASN 16.A O ASN 19.A H 3.248 2.577 ASN 19.A ND2 ASN 14.A O ASN 19.A HD21 3.035 2.190 TYR 20.A N ASN 16.A O TYR 20.A H 3.056 2.382 ASN 22.A N ASN 19.A O ASN 22.A H 2.891 2.292 VAL 23.A N ASN 19.A O VAL 23.A H 3.017 2.223 PHE 24.A N TYR 20.A O PHE 24.A H 3.017 2.159 LYS 25.A N LYS 21.A O LYS 25.A H 3.130 2.373 LYS 26.A N ASN 22.A O LYS 26.A H 2.831 2.117 LYS 26.A N VAL 23.A O LYS 26.A H 2.937 2.339 LYS 26.A NZ TYR 27.A OH LYS 26.A HZ3 3.320 2.622 VAL 29.A N GLY 66.A O VAL 29.A H 3.031 2.178 LEU 30.A N PHE 95.A O LEU 30.A H 3.408 2.623 ALA 31.A N GLY 68.A O ALA 31.A H 2.778 1.948 LEU 32.A N TYR 93.A O LEU 32.A H 2.831 2.016 LEU 33.A N GLY 70.A O LEU 33.A H 2.865 2.056 TYR 34.A N SER 91.A O TYR 34.A H 3.077 2.236 HIS 35.A N VAL 72.A O HIS 35.A H 3.033 2.184 HIS 35.A ND1 GLU 36.A O HIS 35.A HD1 3.029 2.184 SER 44.A N ASP 41.A OD2 SER 44.A H 2.928 2.104 GLN 45.A N ASP 41.A O GLN 45.A H 3.019 2.201 GLN 45.A NE2 GLU 39.A O GLN 45.A HE21 2.817 2.108 ARG 46.A N LYS 42.A O ARG 46.A H 2.789 1.954 GLN 47.A N ALA 43.A O GLN 47.A H 2.831 1.981 GLN 47.A NE2 ASP 51.A OD1 GLN 47.A HE21 2.977 2.366 PHE 48.A N SER 44.A O PHE 48.A H 2.877 2.060 GLU 49.A N GLN 45.A O GLU 49.A H 2.821 1.999 MET 50.A N ARG 46.A O MET 50.A H 2.897 2.085 ASP 51.A N GLN 47.A O ASP 51.A H 2.911 2.109 GLU 52.A N PHE 48.A O GLU 52.A H 3.088 2.267 LEU 53.A N GLU 49.A O LEU 53.A H 3.063 2.252 ILE 54.A N MET 50.A O ILE 54.A H 3.210 2.444 LEU 55.A N ASP 51.A O LEU 55.A H 3.401 2.601 GLU 56.A N GLU 52.A O GLU 56.A H 2.893 2.084 LEU 57.A N LEU 53.A O LEU 57.A H 3.068 2.254 ALA 58.A N ILE 54.A O ALA 58.A H 3.108 2.264 ALA 59.A N LEU 55.A O ALA 59.A H 2.762 1.937 GLN 60.A N GLU 56.A O GLN 60.A H 2.885 2.057 GLN 60.A NE2 GLU 5.A O GLN 60.A HE22 3.091 2.261 VAL 61.A N LEU 57.A O VAL 61.A H 2.988 2.171 LEU 62.A N ALA 58.A O LEU 62.A H 3.006 2.231 GLU 63.A N GLN 60.A O GLU 63.A H 3.369 2.510 LYS 65.A N LEU 62.A O LYS 65.A H 3.122 2.306 GLY 66.A N GLU 63.A O GLY 66.A H 3.143 2.305 VAL 67.A N LEU 62.A O VAL 67.A H 3.385 2.548 GLY 68.A N VAL 29.A O GLY 68.A H 2.863 2.068 GLY 70.A N ALA 31.A O GLY 70.A H 2.891 2.108 MET 71.A N VAL 13.A O MET 71.A H 3.092 2.335 VAL 72.A N LEU 33.A O VAL 72.A H 2.854 2.018 ASP 73.A N ASP 77.A OD2 ASP 73.A H 2.828 2.022 SER 74.A N HIS 35.A O SER 74.A H 2.737 1.944 SER 74.A OG GLU 89.A OE2 SER 74.A HG 3.054 2.230 GLU 75.A N ASP 73.A OD1 GLU 75.A H 2.876 2.078 LYS 76.A N ASP 73.A OD1 LYS 76.A H 2.963 2.172 LYS 76.A NZ ASN 14.A OD1 LYS 76.A HZ1 2.795 1.936 LYS 76.A NZ ASP 77.A OD1 LYS 76.A HZ2 2.754 2.058 ASP 77.A N ASP 73.A O ASP 77.A H 2.713 1.935 ALA 78.A N GLU 75.A O ALA 78.A H 3.341 2.555 ALA 81.A N ASP 77.A O ALA 81.A H 2.883 2.035 LYS 82.A N ALA 78.A O LYS 82.A H 2.907 2.126 LYS 83.A N ALA 79.A O LYS 83.A H 3.037 2.198 LEU 84.A N VAL 80.A O LEU 84.A H 2.914 2.105 GLY 85.A N LYS 82.A O GLY 85.A H 3.309 2.545 LEU 86.A N ALA 81.A O LEU 86.A H 2.941 2.130 THR 87.A N TYR 93.A OH THR 87.A H 3.176 2.369 GLU 88.A N TYR 93.A OH GLU 88.A H 2.928 2.113 ASP 90.A N TYR 34.A O ASP 90.A H 2.651 1.846 SER 91.A N GLU 88.A O SER 91.A H 3.134 2.317 SER 91.A OG GLU 102.A OE2 SER 91.A HG 2.820 2.202 VAL 92.A N TYR 103.A O VAL 92.A H 2.916 2.089 TYR 93.A N LEU 32.A O TYR 93.A H 2.854 2.022 VAL 94.A N ILE 101.A O VAL 94.A H 2.762 1.911 PHE 95.A N LEU 30.A O PHE 95.A H 2.807 1.973 LYS 96.A N GLU 99.A O LYS 96.A H 3.235 2.453 LYS 96.A NZ VAL 119.A O LYS 96.A HZ2 2.836 1.980 GLU 99.A N LYS 96.A O GLU 99.A H 2.951 2.104 ILE 101.A N VAL 94.A O ILE 101.A H 2.840 1.987 TYR 103.A N VAL 92.A O TYR 103.A H 2.668 1.814 TYR 103.A OH GLU 106.A O TYR 103.A HH 2.649 1.848 GLU 106.A N PRO 232.A O GLU 106.A H 2.724 1.890 THR 111.A N ASP 110.A OD1 THR 111.A H 2.512 1.871 THR 111.A OG1 GLU 106.A OE2 THR 111.A HG1 2.817 2.050 LEU 112.A N SER 108.A O LEU 112.A H 2.824 1.979 VAL 113.A N ALA 109.A O VAL 113.A H 2.874 2.027 GLU 114.A N ASP 110.A O GLU 114.A H 3.031 2.182 PHE 115.A N THR 111.A O PHE 115.A H 3.031 2.217 LEU 116.A N LEU 112.A O LEU 116.A H 2.904 2.065 LEU 117.A N VAL 113.A O LEU 117.A H 2.886 2.039 ASP 118.A N GLU 114.A O ASP 118.A H 3.105 2.324 VAL 119.A N PHE 115.A O VAL 119.A H 2.869 2.073 LEU 120.A N LEU 116.A O LEU 120.A H 2.900 2.124 GLU 121.A N ASP 118.A O GLU 121.A H 3.240 2.491 GLU 125.A N PHE 173.A O GLU 125.A H 3.102 2.293 ILE 127.A N ALA 175.A O ILE 127.A H 2.864 2.161 GLU 128.A N GLU 132.A OE2 GLU 128.A H 2.764 1.962 LEU 133.A N GLY 129.A O LEU 133.A H 3.155 2.346 GLN 134.A N GLU 130.A O GLN 134.A H 2.956 2.157 GLN 134.A NE2 GLN 134.A O GLN 134.A HE21 3.257 2.792 GLN 134.A NE2 ASN 138.A OD1 GLN 134.A HE21 2.935 2.171 ALA 135.A N ARG 131.A O ALA 135.A H 2.984 2.181 PHE 136.A N GLU 132.A O PHE 136.A H 3.022 2.223 GLU 137.A N LEU 133.A O GLU 137.A H 2.992 2.184 ASN 138.A N GLN 134.A O ASN 138.A H 3.018 2.299 ILE 139.A N PHE 136.A O ILE 139.A H 3.188 2.359 ASN 143.A ND2 LYS 223.A O ASN 143.A HD21 2.949 2.316 LYS 144.A N TYR 195.A O LYS 144.A H 3.037 2.244 LYS 144.A NZ PHE 136.A O LYS 144.A HZ2 2.849 2.093 LYS 144.A NZ ILE 139.A O LYS 144.A HZ3 2.707 1.847 LEU 145.A N PRO 172.A O LEU 145.A H 3.228 2.408 ILE 146.A N ASP 193.A O ILE 146.A H 2.987 2.181 GLY 147.A N PHE 174.A O GLY 147.A H 3.081 2.334 TYR 148.A N GLU 191.A O TYR 148.A H 3.232 2.438 PHE 149.A N THR 176.A O PHE 149.A H 2.992 2.170 LYS 152.A NZ ASP 153.A OD1 LYS 152.A HZ3 3.106 2.326 ASP 153.A N ASN 151.A OD1 ASP 153.A H 2.877 2.150 SER 154.A N ASN 151.A O SER 154.A H 3.098 2.260 HIS 156.A N SER 154.A OG HIS 156.A H 3.102 2.364 LYS 158.A N SER 154.A O LYS 158.A H 3.076 2.269 ALA 159.A N GLU 155.A O ALA 159.A H 3.117 2.304 TYR 160.A N HIS 156.A O TYR 160.A H 2.998 2.204 TYR 160.A OH PHE 174.A O TYR 160.A HH 2.591 1.967 GLU 161.A N TYR 157.A O GLU 161.A H 2.754 1.931 ASP 162.A N LYS 158.A O ASP 162.A H 2.962 2.146 ALA 163.A N ALA 159.A O ALA 163.A H 2.979 2.174 ALA 164.A N TYR 160.A O ALA 164.A H 2.931 2.137 GLU 165.A N GLU 161.A O GLU 165.A H 3.234 2.512 GLU 166.A N ALA 163.A O GLU 166.A H 3.124 2.383 PHE 167.A N ALA 164.A O PHE 167.A H 3.262 2.502 HIS 168.A NE2 VAL 119.A O HIS 168.A HE2 3.003 2.300 TYR 170.A N PHE 167.A O TYR 170.A H 2.876 2.112 TYR 170.A OH GLU 102.A O TYR 170.A HH 2.663 1.918 PHE 174.A N LEU 145.A O PHE 174.A H 2.772 1.946 ALA 175.A N GLU 125.A O ALA 175.A H 3.045 2.254 THR 176.A N GLY 147.A O THR 176.A H 2.874 2.066 THR 176.A OG1 ILE 127.A O THR 176.A HG1 2.990 2.219 ASP 178.A N THR 176.A OG1 ASP 178.A H 3.066 2.215 LYS 180.A N ASP 178.A OD1 LYS 180.A H 3.035 2.237 ALA 182.A N ASP 178.A O ALA 182.A H 2.882 2.036 LYS 183.A N SER 179.A O LYS 183.A H 2.854 2.064 LYS 184.A N LYS 180.A O LYS 184.A H 3.178 2.339 LEU 185.A N VAL 181.A O LEU 185.A H 2.960 2.180 THR 186.A N LYS 183.A O THR 186.A H 3.008 2.189 THR 186.A OG1 LEU 185.A O THR 186.A HG1 2.469 1.705 LEU 187.A N ALA 182.A O LEU 187.A H 2.854 2.026 LYS 188.A N GLU 191.A OE1 LYS 188.A H 3.138 2.284 ASN 190.A N TYR 148.A O ASN 190.A H 2.545 1.736 GLU 191.A N LYS 188.A O GLU 191.A H 2.798 1.952 ASP 193.A N ILE 146.A O ASP 193.A H 2.905 2.072 PHE 194.A N VAL 203.A O PHE 194.A H 2.750 1.892 TYR 195.A N LYS 144.A O TYR 195.A H 2.751 1.908 ALA 197.A N ASN 143.A OD1 ALA 197.A H 2.814 2.007 PHE 198.A N GLU 140.A O PHE 198.A H 2.711 2.068 MET 199.A N GLU 196.A O MET 199.A H 2.956 2.117 VAL 203.A N PHE 194.A O VAL 203.A H 2.813 1.968 THR 204.A OG1 ASP 193.A OD1 THR 204.A HG1 2.666 1.839 ILE 205.A N ILE 192.A O ILE 205.A H 2.827 1.985 ASN 210.A ND2 PRO 206.A O ASN 210.A HD21 2.857 2.092 ASN 210.A ND2 GLU 214.A OE1 ASN 210.A HD22 3.384 2.542 SER 211.A N GLU 214.A OE1 SER 211.A H 2.972 2.178 GLU 214.A N SER 211.A OG GLU 214.A H 3.211 2.382 ILE 215.A N SER 211.A O ILE 215.A H 3.035 2.214 VAL 216.A N GLU 212.A O VAL 216.A H 2.905 2.052 SER 217.A N GLU 213.A O SER 217.A H 3.034 2.181 PHE 218.A N GLU 214.A O PHE 218.A H 3.114 2.295 VAL 219.A N ILE 215.A O VAL 219.A H 2.880 2.044 GLU 220.A N VAL 216.A O GLU 220.A H 2.918 2.072 ALA 221.A N SER 217.A O ALA 221.A H 3.174 2.418 ALA 221.A N PHE 218.A O ALA 221.A H 3.050 2.449 HIS 222.A N PHE 218.A O HIS 222.A H 3.137 2.456 HIS 222.A N VAL 219.A O HIS 222.A H 3.096 2.421 HIS 222.A ND1 PHE 218.A O HIS 222.A HD1 2.927 2.074 LYS 223.A NZ GLU 220.A OE1 LYS 223.A HZ3 2.832 2.091 LYS 223.A NZ GLU 220.A OE2 LYS 223.A HZ3 3.523 2.655 ARG 224.A NE ASP 241.A OD2 ARG 224.A HE 2.932 2.121 ARG 224.A NH2 ASP 241.A OD1 ARG 224.A HH21 2.819 1.997 ARG 224.A NH2 ASP 241.A OD2 ARG 224.A HH21 3.228 2.522 THR 226.A N GLU 196.A OE2 THR 226.A H 2.708 1.863 THR 226.A OG1 GLU 196.A OE2 THR 226.A HG1 3.325 2.628 ARG 228.A N ILE 281.A O ARG 228.A H 2.893 2.060 ARG 228.A NH1 ASP 241.A OD2 ARG 228.A HH12 2.980 2.243 ARG 228.A NH2 ASP 241.A O ARG 228.A HH22 2.936 2.121 LEU 230.A N TRP 283.A O LEU 230.A H 2.921 2.101 LYS 231.A NZ ASP 141.A O LYS 231.A HZ1 3.467 2.816 LYS 231.A NZ ASP 142.A OD1 LYS 231.A HZ2 2.820 2.174 SER 234.A N LYS 231.A O SER 234.A H 2.991 2.176 TYR 236.A N ASP 104.A O TYR 236.A H 3.215 2.561 GLU 237.A N ASP 104.A O GLU 237.A H 3.158 2.399 THR 238.A N SER 234.A O THR 238.A H 2.984 2.134 THR 238.A OG1 SER 234.A O THR 238.A HG1 3.049 2.299 TRP 239.A N MET 235.A O TRP 239.A H 2.846 2.017 GLU 240.A N TYR 236.A O GLU 240.A H 2.742 1.922 ASP 241.A N THR 238.A O ASP 241.A H 3.073 2.275 LEU 243.A N ILE 246.A O LEU 243.A H 3.370 2.544 GLY 245.A N ASP 242.A OD1 GLY 245.A H 2.647 1.886 ILE 246.A N LEU 243.A O ILE 246.A H 3.248 2.512 HIS 247.A N VAL 312.A O HIS 247.A H 3.037 2.216 HIS 247.A NE2 TRP 239.A O HIS 247.A HE2 2.720 1.870 VAL 249.A N GLY 310.A O VAL 249.A H 2.903 2.087 ALA 250.A N ILE 282.A O ALA 250.A H 2.746 1.904 PHE 251.A N GLN 308.A O PHE 251.A H 2.719 1.947 ALA 252.A N ILE 284.A O ALA 252.A H 3.275 2.476 GLU 254.A N ASP 285.A OD2 GLU 254.A H 3.001 2.142 ASP 256.A N GLU 253.A O ASP 256.A H 3.098 2.347 ASP 258.A N ASP 256.A OD2 ASP 258.A H 2.951 2.283 GLY 259.A N ASP 256.A OD2 GLY 259.A H 3.255 2.469 TYR 260.A N ASP 256.A O TYR 260.A H 2.750 1.902 GLU 261.A N PRO 257.A O GLU 261.A H 3.035 2.209 PHE 262.A N ASP 258.A O PHE 262.A H 3.055 2.222 LEU 263.A N GLY 259.A O LEU 263.A H 2.710 1.873 GLU 264.A N TYR 260.A O GLU 264.A H 2.776 1.950 THR 265.A N GLU 261.A O THR 265.A H 3.246 2.430 LEU 266.A N PHE 262.A O LEU 266.A H 2.867 2.039 LYS 267.A N LEU 263.A O LYS 267.A H 2.851 2.009 ALA 268.A N GLU 264.A O ALA 268.A H 3.053 2.223 VAL 269.A N THR 265.A O VAL 269.A H 2.990 2.172 ALA 270.A N LEU 266.A O ALA 270.A H 2.912 2.073 GLN 271.A N LYS 267.A O GLN 271.A H 2.988 2.178 GLN 271.A NE2 PHE 198.A O GLN 271.A HE21 3.064 2.210 ASP 272.A N ALA 268.A O ASP 272.A H 3.183 2.359 ASN 273.A N VAL 269.A O ASN 273.A H 3.143 2.510 ASN 273.A N ALA 270.A O ASN 273.A H 3.234 2.497 ASN 273.A ND2 VAL 269.A O ASN 273.A HD22 2.973 2.114 ASN 273.A ND2 GLU 337.A OE2 ASN 273.A HD21 2.973 2.119 THR 274.A OG1 GLU 196.A OE2 no hydrogen 3.254 N/A THR 274.A OG1 THR 226.A OG1 no hydrogen 3.345 N/A ASN 276.A N ASN 273.A O ASN 276.A H 3.135 2.286 ASP 278.A N ASN 276.A OD1 ASP 278.A H 2.844 2.047 LEU 279.A N ASN 276.A O LEU 279.A H 3.163 2.307 ILE 281.A N THR 226.A O ILE 281.A H 2.807 1.985 ILE 282.A N ILE 248.A O ILE 282.A H 2.825 1.967 TRP 283.A N ARG 228.A O TRP 283.A H 2.872 2.050 TRP 283.A NE1 ALA 252.A O TRP 283.A HE1 2.863 2.008 ILE 284.A N ALA 250.A O ILE 284.A H 2.884 2.060 ASP 287.A N ASP 285.A OD1 ASP 287.A H 2.994 2.194 ASP 288.A N ASP 285.A O ASP 288.A H 2.836 1.981 PHE 289.A N PRO 286.A O PHE 289.A H 3.016 2.177 LEU 292.A N PHE 289.A O LEU 292.A H 2.913 2.114 VAL 293.A N PRO 290.A O VAL 293.A H 3.291 2.472 TRP 296.A N LEU 292.A O TRP 296.A H 2.851 2.022 GLU 297.A N VAL 293.A O GLU 297.A H 2.877 2.048 LYS 298.A N PRO 294.A O LYS 298.A H 2.986 2.153 THR 299.A N TYR 295.A O THR 299.A H 2.855 2.010 THR 299.A OG1 TYR 295.A O THR 299.A HG1 2.872 2.143 PHE 300.A N TRP 296.A O PHE 300.A H 2.919 2.065 ASN 301.A N GLU 297.A O ASN 301.A H 2.846 2.217 ILE 302.A N GLU 297.A O ILE 302.A H 3.335 2.622 LEU 304.A N GLU 297.A OE2 LEU 304.A H 2.964 2.140 SER 305.A N ASP 303.A OD1 SER 305.A H 2.989 2.162 SER 305.A OG ASP 303.A OD1 SER 305.A HG 2.722 1.890 ALA 306.A N ASP 303.A O ALA 306.A H 3.269 2.428 GLN 308.A N PHE 251.A O GLN 308.A H 3.057 2.249 GLN 308.A NE2 ASP 303.A O GLN 308.A HE21 3.007 2.198 GLN 308.A NE2 ALA 306.A O GLN 308.A HE21 3.700 3.107 GLY 310.A N VAL 249.A O GLY 310.A H 2.894 2.123 VAL 311.A N VAL 320.A O VAL 311.A H 2.844 2.042 VAL 312.A N HIS 247.A O VAL 312.A H 2.732 1.906 ASN 313.A N ASP 318.A O ASN 313.A H 2.903 2.050 ASN 313.A ND2 THR 350.A OG1 ASN 313.A HD21 3.211 2.380 ASP 316.A N ASN 313.A OD1 ASP 316.A H 3.431 2.596 ASP 316.A N ASP 316.A OD1 ASP 316.A H 2.678 2.020 ASP 318.A N ASN 313.A O ASP 318.A H 3.298 2.596 VAL 320.A N VAL 311.A O VAL 320.A H 3.147 2.368 TRP 321.A NE1 SER 319.A OG TRP 321.A HE1 2.625 1.881 MET 322.A N ILE 309.A O MET 322.A H 2.843 2.004 ASP 325.A N ASP 329.A OD2 ASP 325.A H 2.786 1.948 GLU 328.A N ASP 326.A OD1 GLU 328.A H 2.932 2.187 ASP 329.A N ASP 326.A O ASP 329.A H 3.029 2.191 SER 332.A N GLU 335.A OE1 SER 332.A H 3.017 2.209 GLU 335.A N SER 332.A OG GLU 335.A H 3.152 2.299 LEU 336.A N SER 332.A O LEU 336.A H 2.834 2.021 GLU 337.A N ALA 333.A O GLU 337.A H 2.879 2.025 ASP 338.A N GLU 334.A O ASP 338.A H 3.037 2.188 TRP 339.A N GLU 335.A O TRP 339.A H 3.049 2.261 LEU 340.A N LEU 336.A O LEU 340.A H 2.890 2.060 GLU 341.A N GLU 337.A O GLU 341.A H 2.757 1.936 ASP 342.A N ASP 338.A O ASP 342.A H 3.032 2.251 VAL 343.A N TRP 339.A O VAL 343.A H 3.116 2.390 VAL 343.A N LEU 340.A O VAL 343.A H 3.089 2.495 LEU 344.A N LEU 340.A O LEU 344.A H 3.055 2.306 LEU 344.A N GLU 341.A O LEU 344.A H 3.119 2.506 GLU 345.A N GLU 341.A O GLU 345.A H 2.784 1.933 ILE 348.A N ASP 342.A O ILE 348.A H 2.912 2.112