Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5ll8_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.926 2.076 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.842 2.125 ASN 8.A N GLY 5.A O ASN 8.A H 3.307 2.534 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD22 3.124 2.407 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.761 1.921 HIS 12.A NE2 LYS 6.A O HIS 12.A HE2 3.006 2.368 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.036 2.326 TRP 13.A NE1 ASN 8.A O TRP 13.A HE1 3.109 2.476 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.138 2.295 LYS 15.A NZ HIS 12.A ND1 LYS 15.A HZ1 2.848 1.996 ASP 16.A N TRP 13.A O ASP 16.A H 3.194 2.551 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.891 2.134 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.847 1.990 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.141 2.284 GLY 22.A N ILE 19.A O GLY 22.A H 2.770 2.040 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 2.975 2.142 ARG 24.A NE GLY 192.A O ARG 24.A HE 3.007 2.279 ARG 24.A NH1 PRO 134.A O ARG 24.A HH12 3.265 2.565 ARG 24.A NH2 PRO 134.A O ARG 24.A HH22 3.201 2.477 ARG 24.A NH2 GLY 192.A O ARG 24.A HH21 3.001 2.286 ARG 24.A NH2 VAL 203.A O ARG 24.A HH21 3.061 2.444 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE22 3.107 2.254 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE21 3.031 2.182 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.862 2.131 SER 26.A OG TYR 190.A OH SER 26.A HG 2.764 2.082 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.792 1.944 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H.B 2.819 1.988 THR 32.A OG1 ASP 107.A OD1 THR 32.A HG1 3.365 2.563 HIS 33.A N ASP 31.A OD1.B HIS 33.A H 2.985 2.328 THR 34.A N ASP 31.A O.A THR 34.A H 3.092 2.424 THR 34.A N ASP 31.A O.B THR 34.A H 3.238 2.593 THR 34.A N ASP 31.A OD1.B THR 34.A H 3.139 2.385 THR 34.A N ASP 31.A OD2.A THR 34.A H 3.249 2.582 THR 34.A OG1 ASP 31.A OD2.A THR 34.A HG1 2.803 2.084 ALA 35.A N ASP 31.A O.A ALA 35.A H 3.027 2.253 ALA 35.A N ASP 31.A O.B ALA 35.A H 3.023 2.245 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 3.232 2.452 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 2.967 2.185 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 2.909 2.111 SER 40.A OG ASP 38.A OD1 SER 40.A HG 2.665 1.843 SER 40.A OG ASP 38.A OD2 SER 40.A HG 3.331 2.678 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 3.265 2.422 LYS 42.A N GLY 79.A O LYS 42.A H 3.193 2.392 SER 45.A N LYS 77.A O SER 45.A H 2.825 1.990 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.865 2.011 SER 47.A OG SER 45.A OG SER 47.A HG 3.317 2.701 TYR 48.A OH HIS 119.A NE2 TYR 48.A HH 2.760 1.950 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.069 2.226 SER 53.A OG PHE 172.A O SER 53.A HG 2.566 1.996 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.777 1.974 ARG 55.A NE GLU 66.A OE1 ARG 55.A HE 2.778 1.965 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE1 ARG 55.A HH21 3.288 2.645 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE2 ARG 55.A HH21 2.855 2.019 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.917 2.090 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 2.912 2.150 ASN 58.A N LYS 168.A O ASN 58.A H 2.918 2.077 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.092 2.263 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 3.185 2.337 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.119 2.322 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.815 1.976 HIS 61.A N ASN 59.A OD1 HIS 61.A H 2.842 2.020 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.940 2.136 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 2.852 2.070 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.865 2.068 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.857 2.007 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.926 2.124 ASP 68.A N THR 52.A O ASP 68.A H 2.856 2.026 SER 70.A N ASP 68.A OD1 SER 70.A H 2.957 2.108 SER 70.A OG ASP 68.A OD1 SER 70.A HG 2.667 1.875 LYS 73.A N.B GLN 71.A O LYS 73.A H.B 2.803 2.172 LYS 73.A NZ.A THR 52.A OG1 LYS 73.A HZ3.A 3.096 2.365 LYS 73.A NZ.A ASP 68.A OD2 LYS 73.A HZ2.A 2.784 2.061 LYS 73.A NZ.B THR 52.A OG1 LYS 73.A HZ3.B 3.069 2.271 LYS 73.A NZ.B ASP 68.A OD2 LYS 73.A HZ2.B 2.728 1.941 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 2.945 2.144 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.790 1.963 LYS 77.A N SER 45.A O LYS 77.A H 2.946 2.124 GLY 79.A N LYS 42.A O GLY 79.A H 2.958 2.339 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 3.126 2.391 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.875 2.033 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.040 2.235 TYR 85.A OH ASP 135.A O TYR 85.A HH 3.003 2.384 ARG 86.A N TRP 120.A O ARG 86.A H 2.833 2.027 ARG 86.A NE.A ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE.A 3.023 2.307 ARG 86.A NE.A ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE.A 2.869 2.117 ARG 86.A NE.B ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE.B 2.491 1.633 ARG 86.A NE.B ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE.B 2.389 1.533 ARG 86.A NH1.A ASP 69.A O ARG 86.A HH11.A 2.834 1.991 ARG 86.A NH1.B ASP 69.A O ARG 86.A HH11.B 3.139 2.411 ARG 86.A NH2.A ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HH21.A 2.742 1.949 ARG 86.A NH2.A ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HH21.A 2.789 2.027 ARG 86.A NH2.B ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HH21.B 3.238 2.635 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.875 2.021 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.927 2.077 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.945 2.181 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.062 2.285 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.770 1.913 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.908 2.111 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.758 1.916 TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.829 1.997 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.808 2.140 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 3.033 2.311 GLN 100.A N LEU 97.A O GLN 100.A H 3.275 2.431 GLN 100.A NE2.A ASP 239.A OD1 GLN 100.A HE22.A 2.871 2.036 GLN 100.A NE2.B ASP 239.A OD1 GLN 100.A HE22.B 2.940 2.281 GLN 100.A NE2.B ASP 239.A OD2 GLN 100.A HE22.B 3.443 2.853 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.962 2.223 SER 102.A OG HIS 104.A O SER 102.A HG 2.776 2.251 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.836 2.088 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.843 2.159 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.762 1.913 THR 105.A OG1 ASP 29.A OD1 THR 105.A HG1 2.671 1.895 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.077 2.288 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.855 2.015 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.775 1.971 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.855 2.025 TYR 111.A N SER 102.A OG TYR 111.A H 2.914 2.117 ALA 112.A N LEU 144.A O ALA 112.A H 3.101 2.508 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.898 2.141 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.779 1.935 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.822 1.966 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.736 1.899 LEU 117.A N LEU 140.A O LEU 117.A H 2.905 2.054 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.862 2.006 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.921 2.193 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 3.007 2.234 TRP 120.A N ARG 86.A O TRP 120.A H 2.960 2.200 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.782 2.020 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.805 1.981 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.088 2.244 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.932 2.083 THR 122.A OG1 THR 84.A O THR 122.A HG1 3.270 2.470 LYS 123.A N ASN 121.A OD1 LYS 123.A H 3.107 2.264 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.061 2.202 TYR 124.A OH ASP 135.A OD1 TYR 124.A HH 2.557 1.769 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.134 2.315 ASP 126.A N.A TYR 124.A O ASP 126.A H.A 2.918 2.219 LYS 129.A N ASP 126.A OD1.A no hydrogen 2.761 N/A LYS 129.A N ASP 126.A OD1.B no hydrogen 3.185 N/A ALA 130.A N ASP 126.A O.A ALA 130.A H 2.944 2.147 ALA 130.A N ASP 126.A O.B ALA 130.A H 3.066 2.284 VAL 131.A N.A PHE 127.A O VAL 131.A H.A 3.045 2.302 VAL 131.A N.B PHE 127.A O VAL 131.A H.B 3.013 2.252 GLN 132.A N LYS 129.A O GLN 132.A H 3.119 2.289 GLN 132.A NE2 GLY 128.A O GLN 132.A HE21 3.191 2.338 GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 3.013 2.235 GLN 133.A NE2 LYS 129.A O GLN 133.A HE21 3.050 2.230 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 3.178 2.413 LEU 137.A N CYS 202.A O.A LEU 137.A H 2.950 2.117 LEU 137.A N CYS 202.A O.B LEU 137.A H 3.313 2.459 LEU 137.A N CYS 202.A O.C LEU 137.A H 2.837 2.048 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.890 2.077 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.123 2.361 LEU 140.A N LEU 117.A O LEU 140.A H 2.929 2.119 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.805 1.976 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.888 2.114 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.937 2.092 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.946 2.114 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.768 1.939 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 3.010 2.174 LYS 150.A NZ LEU 181.A O.A LYS 150.A HZ1 2.857 1.969 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 2.998 2.174 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.122 2.271 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1 GLN 154.A HE21 3.057 2.369 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD2 GLN 154.A HE21 3.348 2.534 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.120 2.291 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.879 2.097 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.136 2.371 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.271 2.436 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 2.979 2.159 SER 162.A OG VAL 159.A O SER 162.A HG 2.706 1.877 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 3.030 2.196 LYS 166.A N ASN 228.A O LYS 166.A H 2.895 2.064 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.804 1.971 LYS 168.A N THR 165.A O LYS 168.A H 3.081 2.233 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.890 2.128 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 3.001 2.151 THR 173.A N ASP 171.A OD1 THR 173.A H 3.030 2.211 THR 173.A OG1 ASP 171.A OD1 THR 173.A HG1 2.833 2.012 PHE 175.A N SER 53.A OG PHE 175.A H 2.889 2.036 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 2.966 2.154 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 3.036 2.202 ARG 178.A NE ASP 176.A OD2 ARG 178.A HE 3.184 2.475 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 2.861 2.060 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.192 2.345 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 3.007 2.161 LEU 181.A N.A ARG 178.A O LEU 181.A H.A 3.395 2.537 LEU 181.A N.B ARG 178.A O LEU 181.A H.B 3.351 2.513 GLU 183.A N GLU 210.A OE2.B GLU 183.A H 3.110 2.328 SER 184.A N GLU 210.A OE1.A SER 184.A H 2.978 2.151 SER 184.A N GLU 210.A OE1.B SER 184.A H 2.878 2.085 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.032 2.172 TYR 187.A N SER 255.A OG TYR 187.A H 2.932 2.119 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.881 2.052 THR 189.A N LYS 253.A O THR 189.A H 2.835 2.064 THR 189.A OG1 TRP 205.A O THR 189.A HG1 2.737 1.956 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.234 2.483 TYR 190.A OH HIS 104.A NE2 TYR 190.A HH 2.665 1.838 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.797 1.937 SER 193.A N SER 26.A OG SER 193.A H 2.919 2.103 SER 193.A OG LEU 194.A O SER 193.A HG 2.746 1.957 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 2.918 2.128 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.606 1.798 THR 196.A OG1 PRO 197.A O THR 196.A HG1 2.983 2.153 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.781 2.046 CYS 202.A N.C LEU 200.A O CYS 202.A H.C 3.024 2.393 CYS 202.A SG.A VAL 131.A O.A no hydrogen 3.083 N/A CYS 202.A SG.A VAL 131.A O.B no hydrogen 2.143 N/A CYS 202.A SG.B VAL 131.A O.B no hydrogen 2.487 N/A CYS 202.A SG.C LEU 200.A O no hydrogen 3.635 N/A VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.245 2.414 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.865 2.025 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.975 2.153 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.949 2.132 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 2.983 2.146 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.816 1.971 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.875 2.049 LYS 209.A N ASP 186.A O LYS 209.A H 2.920 2.081 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.854 2.069 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.882 2.050 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.036 2.214 GLU 217.A N GLU 217.A OE1 GLU 217.A H 2.795 2.018 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.153 2.351 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE22 3.023 2.177 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE21 2.965 2.147 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.150 2.327 LEU 220.A N SER 216.A O LEU 220.A H 2.860 2.037 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H 3.236 2.499 LYS 221.A N GLN 218.A O LYS 221.A H 3.165 2.514 ARG 223.A N VAL 219.A O ARG 223.A H 3.234 2.486 ARG 223.A N LEU 220.A O ARG 223.A H 3.154 2.550 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.837 2.064 ARG 223.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH12 3.566 2.929 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.837 1.978 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.191 2.364 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.208 2.369 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.810 2.034 ASN 226.A ND2 GLU 234.A OE2 ASN 226.A HD21 2.941 2.103 PHE 227.A N GLU 235.A O PHE 227.A H 2.876 2.066 ASN 228.A ND2 ASN 226.A OD1 ASN 228.A HD21 3.476 2.751 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 2.953 2.128 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.847 2.048 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 3.187 2.384 GLU 235.A N ASN 228.A OD1 GLU 235.A H 2.791 1.942 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.791 1.937 ASP 239.A N TRP 94.A O ASP 239.A H 2.879 2.287 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O ASN 240.A HD22 2.914 2.066 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 3.015 2.170 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.789 1.942 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.763 1.948 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.823 2.070 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.185 2.487 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.360 2.737 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.810 2.003 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE21 2.841 2.000 LYS 248.A NZ GLY 22.A O LYS 248.A HZ2 2.882 2.090 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.821 1.962 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 3.020 2.292 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.881 2.037 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.817 2.020 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.893 2.208 ARG 250.A NH2 LEU 247.A O ARG 250.A HH21 3.538 2.904 LYS 253.A N THR 189.A O LYS 253.A H 2.993 2.144 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.820 1.978 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.877 2.058