Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5lpd_H.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ILE 1.A N ASN 143.A O no hydrogen 2.877 N/A ILE 1.A N ASP 198.A OD2 no hydrogen 2.711 N/A VAL 2.A N ASP 193.A O VAL 2.A H 2.825 1.990 SER 5.A N VAL 156.A O.A SER 5.A H 2.848 2.068 SER 5.A N VAL 156.A O.B SER 5.A H 2.921 2.124 ALA 7.A N LEU 154.A O ALA 7.A H 2.817 1.967 MET 11.A N GLU 8.A O MET 11.A H 3.089 2.286 SER 12.A OG GLN 15.A OE1.B SER 12.A HG 2.827 2.214 GLN 15.A N.A SER 12.A O GLN 15.A H.A 2.907 2.057 GLN 15.A N.B SER 12.A O GLN 15.A H.B 2.890 2.043 GLN 15.A NE2.A VAL 16.A O GLN 15.A HE21.A 3.309 2.632 GLN 15.A NE2.B THR 139.A O GLN 15.A HE22.B 3.163 2.421 VAL 16.A N ALA 30.A O VAL 16.A H.B 2.922 2.139 MET 17.A N ARG 62.A O MET 17.A H 2.921 2.064 LEU 18.A N.A CYS 28.A O LEU 18.A H.A 2.878 2.047 LEU 18.A N.B CYS 28.A O LEU 18.A H.B 2.880 2.086 PHE 19.A N LEU 60.A O PHE 19.A H.A 2.861 2.014 ARG 20.A N GLU 25.A O ARG 20.A H 2.831 2.013 ARG 20.A NH2 GLU 25.A OE2 ARG 20.A HH21 3.130 2.384 LYS 21.A N ASP 58.A O LYS 21.A H 3.040 2.196 LYS 21.A NZ ASN 57.A O LYS 21.A HZ2 3.090 2.339 LEU 27.A N LEU 18.A O.A LEU 27.A H 2.736 1.888 LEU 27.A N LEU 18.A O.B LEU 27.A H 2.910 2.053 CYS 28.A SG LEU 27.A O no hydrogen 2.887 N/A GLY 29.A N SER 199.A O GLY 29.A H 2.739 1.988 SER 31.A N LEU 39.A O SER 31.A H 2.871 2.121 SER 31.A OG GLN 215.A OE1 SER 31.A HG 2.646 1.816 LEU 32.A N TRP 14.A O LEU 32.A H 2.807 2.042 ILE 33.A N TRP 37.A O ILE 33.A H 3.071 2.213 ARG 36.A N SER 34.A OG ARG 36.A H 3.063 2.210 ARG 36.A NE LEU 105.A O ARG 36.A HE 2.732 2.027 ARG 36.A NH1 LEU 105.A O ARG 36.A HH11 3.048 2.444 TRP 37.A N SER 34.A OG TRP 37.A H 3.201 2.597 VAL 38.A N MET 103.A O VAL 38.A H 2.896 2.072 LEU 39.A N SER 31.A O LEU 39.A H 2.833 2.014 THR 40.A N ALA 101.A O THR 40.A H 2.949 2.106 THR 40.A OG1 GLY 29.A O THR 40.A HG1 2.880 2.230 HIS 43.A N ASP 99.A OD1 HIS 43.A H 2.876 2.103 HIS 43.A ND1 ASP 99.A OD2 HIS 43.A HD1 2.713 1.876 CYS 44.A N ALA 41.A O CYS 44.A H 3.027 2.241 CYS 44.A SG THR 40.A OG1 no hydrogen 3.717 N/A LEU 45.A N ALA 42.A O LEU 45.A H 2.916 2.094 LEU 46.A N ALA 42.A O LEU 46.A H 2.853 2.075 GLU 56.A N GLU 56.A OE1 GLU 56.A H 2.678 1.868 ASP 58.A N THR 55I.A O ASP 58.A H 3.076 2.250 LEU 59.A N GLU 56.A O LEU 59.A H 3.317 2.492 LEU 60.A N PHE 19.A O LEU 60.A H 2.836 2.002 VAL 61.A N.A SER 79.A O VAL 61.A H.A 3.036 2.203 VAL 61.A N.B SER 79.A O VAL 61.A H.B 3.045 2.201 ARG 62.A N MET 17.A O ARG 62.A H.B 2.869 2.066 ARG 62.A NE GLU 76.A OE1 ARG 62.A HE 2.767 1.920 ARG 62.A NH2 GLU 76.A OE1 ARG 62.A HH21 3.259 2.581 ARG 62.A NH2 GLU 76.A OE2 ARG 62.A HH21 2.890 2.079 ILE 63.A N LYS 77.A O ILE 63.A H 2.827 1.990 LYS 65.A NZ GLU 72.A OE1 LYS 65.A HZ2 2.853 2.011 LYS 65.A NZ GLU 76.A OE2 LYS 65.A HZ3 2.846 2.079 HIS 66.A N GLU 72.A OE1 HIS 66.A H 2.861 2.037 HIS 66.A N GLU 72.A OE2 HIS 66.A H 3.350 2.621 SER 67.A N GLU 72.A OE2 SER 67.A H 2.847 2.012 ARG 68.A N SER 152.A O ARG 68.A H 2.850 2.011 ARG 68.A NE PRO 151.A O ARG 68.A HE 2.791 1.976 ARG 70.A N.A SER 67.A OG ARG 70.A H.A 3.128 2.289 ARG 70.A N.B SER 67.A OG ARG 70.A H.B 3.161 2.332 GLU 72.A N GLU 76.A OE2 GLU 72.A H 2.874 2.021 ILE 75.A N GLU 72.A O ILE 75.A H 2.993 2.194 GLU 76.A N GLU 72.A O GLU 76.A H 2.938 2.139 LYS 77.A N ILE 63.A O LYS 77.A H 2.850 2.036 SER 79.A N VAL 61.A O.A SER 79.A H 2.865 2.044 SER 79.A N VAL 61.A O.B SER 79.A H 2.907 2.080 GLU 82.A N LYS 104.A O GLU 82.A H 2.690 1.890 LYS 83.A N LYS 104.A O LYS 83.A H 3.402 2.621 ILE 84.A N GLU 56.A OE2 ILE 84.A H 2.875 2.052 TYR 85.A N LEU 102.A O TYR 85.A H 2.814 1.971 HIS 87.A N ILE 100.A O HIS 87.A H 3.193 2.353 ARG 89.A N HIS 87.A ND1 ARG 89.A H 2.942 2.091 TYR 90.A N HIS 87.A O TYR 90.A H 3.120 2.265 TYR 90.A OH LEU 46.A O TYR 90.A HH 2.721 1.916 ASN 91.A N ASP 97.A O ASN 91.A H 2.834 2.016 ARG 93.A N.A ASN 91.A OD1 ARG 93.A H.A 3.159 2.583 ASN 95.A ND2 ARG 174.A O ASN 95.A HD22 2.920 2.100 LEU 96.A N ASN 91.A O LEU 96.A H 2.823 2.219 ASP 97.A N ASN 95.A OD1 ASP 97.A H 3.098 2.339 ARG 98.A NH1 ARG 89.A O ARG 98.A HH11 2.822 2.096 ALA 101.A N THR 40.A O ALA 101.A H 2.951 2.175 LEU 102.A N TYR 85.A O LEU 102.A H 2.801 1.981 MET 103.A N VAL 38.A O MET 103.A H 2.821 2.017 LYS 104.A N LYS 83.A O LYS 104.A H 2.906 2.081 LEU 105.A N ARG 36.A O LEU 105.A H 2.812 1.973 LYS 106.A N MET 80.A O.A LYS 106.A H 2.869 2.026 LYS 106.A N MET 80.A O.B LYS 106.A H 2.955 2.122 VAL 109.A N ASP 35.A O VAL 109.A H 2.947 2.136 SER 112.A N ILE 115.A O SER 112.A H 2.956 2.129 TYR 114.A N SER 112.A OG TYR 114.A H 3.036 2.205 ILE 115.A N SER 112.A O ILE 115.A H 3.416 2.573 HIS 116.A N PRO 13.A O HIS 116.A H 3.015 2.221 VAL 118.A N LEU 32.A O VAL 118.A H 3.047 2.231 CYS 119.A N TRP 213.A O CYS 119.A H 3.151 2.330 THR 125.A N.A ASP 122.A OD1 THR 125.A H.A 2.948 2.103 THR 125.A N.B ASP 122.A OD1 THR 125.A H.B 2.954 2.112 THR 125.A OG1.A ASP 122.A OD1 THR 125.A HG1.A 3.405 2.724 THR 125.A OG1.B ASP 122.A O THR 125.A HG1.B 2.993 2.574 THR 125.A OG1.B ASP 122.A OD1 THR 125.A HG1.B 3.005 2.182 ALA 126.A N ASP 122.A O ALA 126.A H.A 2.999 2.148 LEU 130.A N ALA 126.A O LEU 130.A H 2.889 2.054 GLN 131.A N LEU 129C.A O GLN 131.A H 2.875 2.232 GLN 131.A NE2 SER 128B.A O GLN 131.A HE21 2.660 1.817 GLY 133.A N ILE 161.A O GLY 133.A H 2.816 1.965 TYR 134.A N GLN 131.A O TYR 134.A H 3.038 2.243 GLY 136.A N LEU 159.A O GLY 136.A H 2.925 2.118 ARG 137.A N VAL 204.A O ARG 137.A H 2.783 2.037 ARG 137.A NE ASN 158.A OD1 ARG 137.A HE 3.071 2.253 VAL 138.A N VAL 157.A O VAL 138.A H 2.859 2.016 THR 139.A OG1 GLN 15.A OE1.A THR 139.A HG1 2.685 2.063 GLY 140.A N GLN 155.A O GLY 140.A H 3.048 2.279 TRP 141.A NE1 HIS 66.A O TRP 141.A HE1 2.884 2.023 GLY 142.A N ASP 198.A OD1 GLY 142.A H 2.788 1.981 ASN 143.A N GLU 196.A O ASN 143.A H 2.833 2.018 LEU 144.A N GLY 149.A O LEU 144.A H 2.858 2.001 GLN 150.A NE2 ASN 143.A OD1 GLN 150.A HE21 3.645 2.916 LEU 154.A N HIS 66.A O LEU 154.A H 2.832 2.074 GLN 155.A N GLY 140.A O GLN 155.A H 2.986 2.139 GLN 155.A NE2 ASP 6.A OD1 GLN 155.A HE22 2.838 2.012 GLN 155.A NE2 VAL 153.A O GLN 155.A HE21 3.058 2.203 GLN 155.A NE2 LEU 154.A O GLN 155.A HE21 3.560 3.099 VAL 156.A N.A SER 5.A O VAL 156.A H.A 2.834 2.095 VAL 156.A N.B SER 5.A O VAL 156.A H.B 2.847 2.097 VAL 157.A N VAL 138.A O VAL 157.A H.A 2.978 2.184 LEU 159.A N GLY 136.A O LEU 159.A H 2.804 1.997 ILE 161.A N TYR 134.A O ILE 161.A H 2.826 1.971 VAL 162.A N CYS 181.A O VAL 162.A H 2.965 2.136 GLU 163.A N GLU 163.A OE1 GLU 163.A H 2.692 1.853 ARG 164.A NH1 THR 176.A O ARG 164.A HH12 2.902 2.276 ARG 164.A NH1 MET 179.A O ARG 164.A HH12 3.131 2.423 ARG 164.A NH2 MET 179.A O ARG 164.A HH22 2.826 2.016 CYS 167.A N GLU 163.A O CYS 167.A H 3.020 2.191 CYS 167.A SG VAL 162.A O no hydrogen 3.634 N/A CYS 167.A SG GLU 163.A O no hydrogen 3.534 N/A LYS 168.A N.A ARG 164.A O LYS 168.A H.A 2.937 2.118 LYS 168.A N.B ARG 164.A O LYS 168.A H.B 2.917 2.074 ASP 169.A N PRO 165.A O ASP 169.A H.B 2.922 2.128 SER 170.A N CYS 167.A O SER 170.A H 3.231 2.405 SER 170.A OG CYS 167.A O SER 170.A HG 2.703 1.869 THR 171.A N LYS 168.A O.B THR 171.A H 3.397 2.574 THR 171.A OG1 GLU 223.A OE1 THR 171.A HG1 2.821 2.097 ILE 173.A N THR 171.A OG1 ILE 173.A H 3.038 2.205 ARG 174.A NE GLU 94A.A OE2 ARG 174.A HE 3.016 2.176 ARG 174.A NH2 GLU 94A.A OE1 ARG 174.A HH21 2.879 2.030 THR 176.A OG1 ASP 97.A OD1 THR 176.A HG1 2.656 1.828 ASN 178.A N THR 176.A OG1 ASN 178.A H 3.076 2.289 ASN 178.A ND2 ASP 97.A OD1 ASN 178.A HD22 2.946 2.104 MET 179.A N THR 176.A O MET 179.A H 3.111 2.339 PHE 180.A N TYR 234.A O PHE 180.A H 2.969 2.174 ALA 182.A N GLY 232.A O ALA 182.A H 2.894 2.108 GLY 183.A N PRO 160.A O GLY 183.A H 2.895 2.081 LYS 185.A N GLU 188B.A OE1 LYS 185.A H 2.691 1.851 LYS 185.A NZ GLU 163.A OE1 LYS 185.A HZ1 3.075 2.221 ARG 191.A NE ASP 226.A OD2 ARG 191.A HE 2.739 1.899 ARG 191.A NH1 ASP 228.A OD1 ARG 191.A HH12 2.963 2.226 ARG 191.A NH2 ASP 226.A O ARG 191.A HH21 2.762 2.045 ARG 191.A NH2 ASP 226.A OD2 ARG 191.A HH21 3.458 2.832 ARG 191.A NH2 ASP 228.A OD1 ARG 191.A HH22 3.030 2.315 GLY 192.A N ASP 226.A OD1 GLY 192.A H 2.898 2.061 ASP 193.A N VAL 2.A O ASP 193.A H 3.222 2.480 CYS 195.A N ASP 198.A OD2 CYS 195.A H 2.881 2.111 CYS 195.A SG LYS 145.A O no hydrogen 3.698 N/A CYS 195.A SG GLU 196.A OE1 no hydrogen 3.233 N/A GLU 196.A N GLU 196.A OE1 GLU 196.A H 2.871 2.130 ASP 198.A N CYS 195.A O ASP 198.A H 2.969 2.126 GLY 200.A N VAL 219.A O GLY 200.A H 2.944 2.085 GLY 201.A N ASP 198.A O GLY 201.A H 3.049 2.206 PHE 203.A N GLY 217.A O PHE 203.A H 2.901 2.044 VAL 204.A N ARG 137.A O VAL 204.A H 2.858 2.035 MET 205.A N TYR 214.A O MET 205.A H 2.895 2.095 SER 207.A N ARG 212.A O SER 207.A H 2.849 2.030 ASN 211.A N SER 207.A O ASN 211.A H 2.809 2.110 ARG 212.A N ASN 210B.A OD1 ARG 212.A H 3.217 2.424 TYR 214.A N MET 205.A O TYR 214.A H 2.875 2.028 GLN 215.A N CYS 119.A O GLN 215.A H 2.852 2.025 GLN 215.A NE2 GLY 217.A O GLN 215.A HE21 3.010 2.180 MET 216.A N PHE 203.A O MET 216.A H 2.837 2.111 GLY 217.A N PHE 203.A O GLY 217.A H 3.107 2.308 ILE 218.A N THR 235.A O ILE 218.A H 3.208 2.528 VAL 219.A N GLY 201.A O VAL 219.A H 2.852 2.016 SER 220.A N PHE 233.A O SER 220.A H 3.043 2.287 SER 220.A OG ASP 99.A OD2 SER 220.A HG 2.732 1.897 TRP 221.A N PHE 233.A O TRP 221.A H 3.047 2.245 CYS 225.A N GLU 146.A OE1 CYS 225.A H 3.050 2.240 CYS 225.A SG ALA 194.A O no hydrogen 3.938 N/A CYS 225.A SG GLU 196.A OE1 no hydrogen 3.184 N/A ASP 226.A N ASP 193.A OD2 ASP 226.A H 2.824 1.968 LYS 230.A N ARG 227A.A O LYS 230.A H 3.112 2.278 LYS 230.A NZ SER 170.A O LYS 230.A HZ3 3.131 2.376 LYS 230.A NZ GLU 223.A OE1 LYS 230.A HZ2 3.014 2.130 GLY 232.A N ALA 182.A O GLY 232.A H 3.059 2.280 PHE 233.A N TRP 221.A O PHE 233.A H 2.765 1.944 TYR 234.A N PHE 180.A O TYR 234.A H 2.843 2.034 THR 235.A N ILE 218.A O THR 235.A H 2.894 2.138 THR 235.A OG1 ASP 99.A O THR 235.A HG1 2.818 2.007 HIS 236.A N ASN 178.A O HIS 236.A H 2.862 2.011 VAL 237.A N MET 216.A O VAL 237.A H 3.045 2.196 ARG 239.A NE ASN 178.A OD1 ARG 239.A HE 3.207 2.432 ARG 239.A NH1 ASN 178.A OD1 ARG 239.A HH11 3.128 2.353 LEU 240.A N VAL 237.A O LEU 240.A H 3.027 2.295 LYS 241.A N PHE 238.A O LYS 241.A H 3.008 2.153 LYS 241.A NZ PRO 121.A O LYS 241.A HZ2 2.962 2.179 ILE 244.A N LEU 240.A O ILE 244.A H 3.189 2.369 GLN 245.A N LYS 241.A O GLN 245.A H 2.867 2.026 GLN 245.A NE2 ASP 249.A OD1 GLN 245.A HE21 3.348 2.503 LYS 246.A N LYS 242.A O LYS 246.A H 2.953 2.154 VAL 247.A N TRP 243.A O VAL 247.A H 2.978 2.150 ILE 248.A N ILE 244.A O ILE 248.A H 3.010 2.163 ASP 249.A N GLN 245.A O ASP 249.A H 2.844 2.004 GLN 250.A N LYS 246.A O GLN 250.A H 2.990 2.226 PHE 251.A N VAL 247.A O PHE 251.A H 2.898 2.123 TYR 47A.A N LYS 52F.A O TYR 47A.A H 2.777 1.933 ARG 73A.A N TYR 71.A O ARG 73A.A H 2.981 2.338 GLU 94A.A N ASN 91.A OD1 GLU 94A.A H.B 2.960 2.248 ALA 127A.A N ARG 123.A O ALA 127A.A H 2.915 2.090 PHE 209A.A N SER 207.A OG PHE 209A.A H 3.066 2.271 ARG 227A.A NE GLU 146.A OE1 ARG 227A.A HE 3.002 2.202 ARG 227A.A NH2 GLU 146.A OE2 ARG 227A.A HH21 2.820 1.966 SER 128B.A N GLU 124.A O SER 128B.A H 2.933 2.134 SER 128B.A OG GLU 124.A O SER 128B.A HG 2.880 2.110 GLU 188B.A N LYS 185.A O GLU 188B.A H 2.991 2.152 ASN 210B.A ND2 TYR 214.A OH ASN 210B.A HD21 2.891 2.063 LEU 129C.A N THR 125.A O.A LEU 129C.A H 2.945 2.179 LEU 129C.A N THR 125.A O.B LEU 129C.A H 2.983 2.220 TRP 50D.A N TYR 47A.A O TRP 50D.A H 3.005 2.204 LYS 190D.A N GLU 188B.A O LYS 190D.A H 2.924 2.235 ASP 51E.A N PRO 48B.A O ASP 51E.A H 2.957 2.105 LYS 52F.A N TYR 47A.A O LYS 52F.A H 3.167 2.316 PHE 54H.A N LEU 45.A O PHE 54H.A H 2.859 2.040 THR 55I.A N ASP 58.A OD2 THR 55I.A H 2.908 2.060