Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5lvm_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 2.A NZ GLU 26.A OE2 LYS 2.A HZ2 2.746 1.888 ARG 3.A N ASP 6.A OD2 ARG 3.A H 2.816 2.063 ASP 6.A N ARG 3.A O ASP 6.A H 2.911 2.099 PHE 7.A N PRO 4.A O PHE 7.A H 3.026 2.205 LYS 8.A N ARG 25.A O LYS 8.A H 2.842 2.013 GLY 10.A N LEU 23.A O GLY 10.A H 2.737 1.876 LEU 13.A N VAL 21.A O LEU 13.A H 2.705 1.881 GLY 14.A N VAL 21.A O GLY 14.A H 3.197 2.435 GLY 16.A N SER 19.A O GLY 16.A H 2.880 2.059 THR 20.A N ILE 37.A O THR 20.A H 3.008 2.219 VAL 21.A N GLY 14.A O VAL 21.A H 2.810 1.970 VAL 22.A N ILE 35.A O VAL 22.A H 2.866 2.055 LEU 23.A N LYS 11.A O LEU 23.A H 2.920 2.081 ALA 24.A N TYR 33.A O ALA 24.A H 2.879 2.106 ARG 25.A N LYS 8.A O ARG 25.A H 2.917 2.085 ARG 25.A NH1 SER 30.A O ARG 25.A HH11 2.700 1.910 GLU 26.A N ARG 31.A O GLU 26.A H 2.843 2.014 LEU 27.A N ASP 6.A O LEU 27.A H 2.875 2.033 THR 29.A N GLU 26.A O THR 29.A H 3.384 2.591 SER 30.A N GLU 26.A O SER 30.A H 2.755 2.008 ARG 31.A N THR 29.A OG1 ARG 31.A H.A 3.108 2.252 TYR 33.A N ALA 24.A O TYR 33.A H 2.890 2.064 ALA 34.A N LEU 84.A O ALA 34.A H 2.915 2.166 ILE 35.A N VAL 22.A O ILE 35.A H 2.841 1.983 LYS 36.A N PHE 82.A O LYS 36.A H.B 2.906 2.119 LYS 36.A NZ.A GLU 55.A OE1 LYS 36.A HZ2.A 3.445 2.745 LYS 36.A NZ.A GLU 55.A OE2 LYS 36.A HZ2.A 2.813 1.967 LYS 36.A NZ.B GLU 55.A OE1 LYS 36.A HZ3.B 3.010 2.194 LYS 36.A NZ.B GLU 55.A OE2 LYS 36.A HZ3.B 2.922 2.148 ILE 37.A N THR 20.A O ILE 37.A H 2.751 1.937 LEU 38.A N LEU 80.A O LEU 38.A H 2.850 2.016 LYS 40.A N GLU 78.A O LYS 40.A H 2.800 1.961 LYS 40.A NZ GLN 75.A OE1 LYS 40.A HZ1 2.371 1.579 LYS 40.A NZ ASP 76.A O LYS 40.A HZ2 2.863 2.036 ILE 43.A N.A GLU 39.A O ILE 43.A H.A 3.006 2.156 ILE 43.A N.B GLU 39.A O ILE 43.A H.B 3.051 2.216 ILE 44.A N LYS 40.A O ILE 44.A H.B 2.934 2.094 LYS 45.A N ARG 41.A O LYS 45.A H 2.944 2.116 GLU 46.A N HIS 42.A O.A GLU 46.A H 2.854 2.060 GLU 46.A N HIS 42.A O.B GLU 46.A H 2.822 2.030 ASN 47.A N ILE 44.A O ASN 47.A H 3.333 2.483 LYS 48.A N ILE 43.A O.A LYS 48.A H 3.006 2.156 LYS 48.A N ILE 43.A O.B LYS 48.A H 2.927 2.101 TYR 51.A N LYS 48.A O TYR 51.A H.A 3.010 2.385 VAL 52.A N LYS 48.A O VAL 52.A H 3.118 2.289 THR 53.A N VAL 49.A O THR 53.A H 2.930 2.071 THR 53.A OG1 VAL 49.A O THR 53.A HG1 3.024 2.287 ARG 54.A N PRO 50.A O ARG 54.A H 2.905 2.128 ARG 54.A NH1 ALA 152.A O ARG 54.A HH11 2.887 2.049 GLU 55.A N TYR 51.A O GLU 55.A H 2.980 2.162 ARG 56.A N VAL 52.A O ARG 56.A H 3.129 2.281 ASP 57.A N THR 53.A O ASP 57.A H.B 2.904 2.057 VAL 58.A N ARG 54.A O VAL 58.A H 2.833 1.983 MET 59.A N GLU 55.A O MET 59.A H 2.967 2.115 SER 60.A N ARG 56.A O SER 60.A H.B 2.994 2.221 SER 60.A OG.A ARG 56.A O SER 60.A HG.A 2.698 1.951 SER 60.A OG.B ASP 57.A O SER 60.A HG.B 2.871 2.048 ARG 61.A N VAL 58.A O ARG 61.A H 2.979 2.176 ARG 61.A NE ASP 57.A OD2.B ARG 61.A HE 3.056 2.232 ARG 61.A NH2 ASP 57.A OD2.B ARG 61.A HH21 3.258 2.525 LEU 62.A N MET 59.A O LEU 62.A H 3.114 2.258 PHE 66.A N HIS 64.A ND1 PHE 66.A H 2.988 2.140 PHE 67.A N HIS 64.A O PHE 67.A H 3.291 2.465 VAL 68.A N ILE 146.A O VAL 68.A H 2.924 2.089 LYS 69.A N SER 85.A OG LYS 69.A H 2.970 2.115 TYR 71.A N GLY 83.A O TYR 71.A H 2.783 1.947 PHE 74.A N TYR 81.A O PHE 74.A H 3.017 2.235 ASP 76.A N LYS 79.A O ASP 76.A H 2.931 2.144 GLU 78.A N ASP 76.A OD1 GLU 78.A H 2.951 2.229 LYS 79.A N ASP 76.A OD1 LYS 79.A H 2.905 2.168 LEU 80.A N LEU 38.A O LEU 80.A H 2.827 2.008 TYR 81.A N PHE 74.A O TYR 81.A H 2.824 2.015 PHE 82.A N LYS 36.A O PHE 82.A H 2.856 2.028 GLY 83.A N PHE 72.A O GLY 83.A H 2.848 1.996 LEU 84.A N ALA 34.A O LEU 84.A H 2.868 2.066 SER 85.A N LYS 69.A O SER 85.A H 2.955 2.222 ASN 89.A N LEU 138.A O ASN 89.A H 2.891 2.118 ASN 89.A ND2 ASN 139.A O ASN 89.A HD22 2.948 2.115 ASN 89.A ND2 GLU 140.A O ASN 89.A HD21 3.524 3.067 GLY 90.A N ALA 87.A O GLY 90.A H 3.244 2.398 LEU 92.A N ILE 136.A O LEU 92.A H 2.811 1.976 LYS 94.A N GLU 91.A O LYS 94.A H 3.035 2.300 LYS 94.A NZ ASN 89.A O LYS 94.A HZ1 3.083 2.352 TYR 95.A N LEU 92.A O TYR 95.A H 2.989 2.335 TYR 95.A OH ASN 89.A O TYR 95.A HH 3.214 2.398 ILE 96.A N LEU 92.A O ILE 96.A H 3.195 2.384 ARG 97.A N LEU 93.A O ARG 97.A H 2.980 2.141 LYS 98.A N LYS 94.A O LYS 98.A H 3.079 2.294 ILE 99.A N TYR 95.A O ILE 99.A H.A 3.019 2.159 GLY 100.A N ILE 96.A O GLY 100.A H 2.725 1.955 SER 101.A OG.A VAL 200.A O SER 101.A HG.A 2.735 2.055 PHE 102.A N LEU 199.A O PHE 102.A H.B 2.825 1.996 CYS 106.A N ASP 103.A OD1 CYS 106.A H 2.838 1.987 THR 107.A N ASP 103.A O THR 107.A H 2.852 2.003 THR 107.A OG1 PHE 102.A O THR 107.A HG1 3.401 2.922 THR 107.A OG1 ASP 103.A O THR 107.A HG1 2.875 2.116 ARG 108.A N GLU 104.A O ARG 108.A H 2.819 1.977 ARG 108.A NH1 GLU 104.A OE2 ARG 108.A HH12 3.158 2.398 ARG 108.A NH2 GLU 104.A OE2 ARG 108.A HH22 3.050 2.256 ARG 108.A NH2 PHE 265.A O ARG 108.A HH21 2.887 2.092 PHE 109.A N THR 105.A O PHE 109.A H 2.968 2.158 TYR 110.A N CYS 106.A O TYR 110.A H 3.049 2.189 TYR 110.A OH MET 142.A O TYR 110.A HH 2.622 1.811 THR 111.A N THR 107.A O THR 111.A H 2.880 2.039 THR 111.A OG1 THR 107.A O THR 111.A HG1 2.765 2.069 ALA 112.A N ARG 108.A O ALA 112.A H 2.868 2.032 GLU 113.A N PHE 109.A O GLU 113.A H 2.993 2.196 ILE 114.A N TYR 110.A O ILE 114.A H 3.014 2.182 VAL 115.A N THR 111.A O VAL 115.A H 2.833 1.990 SER 116.A N ALA 112.A O SER 116.A H.A 2.909 2.071 SER 116.A OG.A ALA 112.A O SER 116.A HG.A 3.022 2.243 ALA 117.A N GLU 113.A O ALA 117.A H 2.912 2.086 LEU 118.A N ILE 114.A O LEU 118.A H 2.886 2.051 GLU 119.A N VAL 115.A O GLU 119.A H 2.872 2.057 TYR 120.A N SER 116.A O TYR 120.A H 3.187 2.373 LEU 121.A N ALA 117.A O LEU 121.A H 2.937 2.106 HIS 122.A N LEU 118.A O HIS 122.A H 2.777 1.917 HIS 122.A NE2 ASP 188.A OD2 HIS 122.A HE2 2.846 1.988 GLY 123.A N GLU 119.A O GLY 123.A H 2.943 2.162 LYS 124.A N TYR 120.A O LYS 124.A H 3.150 2.459 LYS 124.A N LEU 121.A O LYS 124.A H 3.058 2.377 LYS 124.A NZ ARG 61.A O LYS 124.A HZ2 2.891 2.005 GLY 125.A N HIS 122.A O GLY 125.A H 2.887 2.050 ILE 126.A N LEU 121.A O ILE 126.A H 3.126 2.292 ILE 127.A N LYS 153.A O ILE 127.A H 2.914 2.103 HIS 128.A N ASP 188.A OD2 HIS 128.A H 2.866 2.032 HIS 128.A NE2 THR 147.A O HIS 128.A HE2 2.904 2.063 ARG 129.A N ASP 188.A OD1 ARG 129.A H 2.895 2.037 ARG 129.A NE THR 151.A O ARG 129.A HE 2.796 2.036 ARG 129.A NH2 THR 151.A O ARG 129.A HH21 2.996 2.278 ASP 130.A N HIS 128.A ND1 ASP 130.A H 3.001 2.183 LYS 132.A NZ THR 169.A OG1 LYS 132.A HZ3 2.796 1.937 ASN 135.A N LYS 132.A O ASN 135.A H 2.885 2.093 ASN 135.A ND2 ASP 130.A O ASN 135.A HD22 2.849 2.031 ASN 135.A ND2 ASP 148.A OD2.A ASN 135.A HD21 3.021 2.383 ILE 136.A N PRO 133.A O ILE 136.A H 3.238 2.389 LEU 137.A N GLN 145.A O LEU 137.A H 2.917 2.108 LEU 138.A N GLY 90.A O LEU 138.A H 2.800 2.130 ASN 139.A N HIS 143.A O ASN 139.A H 2.917 2.085 ASP 141.A N ASN 139.A OD1 ASP 141.A H 3.001 2.376 MET 142.A N ASN 139.A O MET 142.A H 2.909 2.071 HIS 143.A N ASN 139.A OD1 HIS 143.A H 3.037 2.240 HIS 143.A ND1 GLU 113.A OE2 HIS 143.A HD1 2.660 1.830 ILE 144.A N GLU 113.A OE1 ILE 144.A H 2.991 2.147 GLN 145.A N LEU 137.A O GLN 145.A H 2.758 1.997 GLN 145.A NE2 PRO 65.A O GLN 145.A HE22 2.681 2.103 GLN 145.A NE2 ILE 144.A O GLN 145.A HE21 2.869 2.015 ILE 146.A N PHE 66.A O ILE 146.A H 2.855 2.015 THR 147.A N ASN 135.A O THR 147.A H 2.950 2.117 ALA 152.A N PHE 149.A O ALA 152.A H 3.087 2.235 LYS 153.A N ILE 127.A O LYS 153.A H 2.926 2.134 LEU 155.A N GLY 125.A O LEU 155.A H 2.831 2.008 SER 156.A N GLN 161.A OE1 SER 156.A H.A 2.944 2.097 SER 156.A OG.B GLN 161.A OE1 SER 156.A HG.B 3.329 2.655 GLU 158.A N SER 156.A OG.A GLU 158.A H 3.208 2.609 LYS 160.A N PRO 157.A O LYS 160.A H 3.126 2.301 GLN 161.A N SER 156.A O GLN 161.A H 3.118 2.310 GLN 161.A NE2 ARG 163.A O GLN 161.A HE21 2.916 2.092 ARG 163.A NE SER 182.A OG ARG 163.A HE 3.042 2.227 ARG 163.A NH1 SER 182.A O ARG 163.A HH11 3.342 2.637 ARG 163.A NH1 SER 182.A OG ARG 163.A HH11 3.225 2.506 ALA 164.A N ALA 183.A O ALA 164.A H 2.825 1.996 THR 169.A OG1 ASP 130.A OD1 THR 169.A HG1 2.631 1.937 THR 169.A OG1 ASP 130.A OD2 THR 169.A HG1 3.560 2.938 GLN 171.A N GLN 171.A OE1.A GLN 171.A H 2.796 2.018 TYR 172.A N THR 169.A O TYR 172.A H 2.906 2.083 TYR 172.A OH GLN 198.A OE1 TYR 172.A HH 2.618 1.802 SER 174.A OG SER 187.A OG SER 174.A HG 3.361 2.545 GLU 176.A N GLU 176.A OE1 GLU 176.A H 2.763 1.964 LEU 177.A N SER 174.A O LEU 177.A H 3.171 2.563 LEU 178.A N SER 174.A O LEU 178.A H 3.327 2.504 THR 179.A N PRO 175.A O THR 179.A H 2.843 2.109 THR 179.A OG1 PRO 175.A O THR 179.A HG1 3.045 2.237 GLU 180.A N GLU 176.A O GLU 180.A H 2.778 1.962 LYS 181.A N LEU 177.A O LYS 181.A H 3.144 2.489 ALA 183.A N ALA 164.A O ALA 183.A H 2.958 2.149 CYS 184.A N SER 187.A OG CYS 184.A H 2.937 2.095 SER 186.A OG ALA 245.A O SER 186.A HG 2.749 1.927 SER 187.A N CYS 184.A O SER 187.A H 2.895 2.138 SER 187.A OG GLU 176.A OE2 SER 187.A HG 2.732 1.958 ASP 188.A N LYS 185.A O ASP 188.A H 2.957 2.204 LEU 189.A N SER 186.A O LEU 189.A H 2.945 2.345 TRP 190.A N SER 186.A O TRP 190.A H 3.166 2.382 ALA 191.A N SER 187.A O ALA 191.A H 3.250 2.422 LEU 192.A N ASP 188.A O LEU 192.A H 2.867 2.060 GLY 193.A N LEU 189.A O GLY 193.A H 2.990 2.162 CYS 194.A N TRP 190.A O CYS 194.A H 3.071 2.255 CYS 194.A SG TRP 190.A O CYS 194.A HG 3.602 2.567 ILE 195.A N ALA 191.A O ILE 195.A H 2.913 2.105 ILE 196.A N LEU 192.A O ILE 196.A H 2.886 2.045 TYR 197.A N GLY 193.A O TYR 197.A H 3.059 2.203 TYR 197.A OH ASP 224.A O.A TYR 197.A HH 2.650 1.858 TYR 197.A OH ASP 224.A O.B TYR 197.A HH 2.627 1.842 GLN 198.A N CYS 194.A O GLN 198.A H 2.930 2.123 LEU 199.A N ILE 195.A O LEU 199.A H 2.860 2.043 VAL 200.A N ILE 196.A O VAL 200.A H 3.201 2.418 VAL 200.A N TYR 197.A O VAL 200.A H 3.201 2.601 ALA 201.A N TYR 197.A O ALA 201.A H 2.815 1.971 GLY 202.A N GLN 198.A O GLY 202.A H 2.836 2.049 ARG 207.A NH2 PRO 204.A O ARG 207.A HH21 2.775 2.010 LEU 213.A N ASN 210.A OD1 LEU 213.A H 3.124 2.389 PHE 215.A N GLU 211.A O PHE 215.A H 2.974 2.163 ALA 216.A N GLY 212.A O ALA 216.A H 3.050 2.244 LYS 217.A N LEU 213.A O LYS 217.A H 3.325 2.535 LYS 217.A NZ ARG 207.A O LYS 217.A HZ1 2.567 1.859 ILE 218.A N ILE 214.A O ILE 218.A H 2.945 2.112 ILE 219.A N PHE 215.A O ILE 219.A H.A 3.114 2.293 LYS 220.A N LYS 217.A O LYS 220.A H 3.233 2.569 LEU 221.A N ILE 218.A O LEU 221.A H 3.030 2.186 GLU 222.A N LYS 217.A O GLU 222.A H 2.934 2.081 ARG 234.A N PHE 230.A O ARG 234.A H 2.931 2.127 ARG 234.A NE GLU 238.A OE2 ARG 234.A HE 2.956 2.135 ARG 234.A NH2 GLU 238.A OE2 ARG 234.A HH21 3.355 2.662 ASP 235.A N PRO 231.A O ASP 235.A H 3.000 2.172 LEU 236.A N LYS 232.A O LEU 236.A H 3.058 2.236 VAL 237.A N ALA 233.A O VAL 237.A H 2.890 2.038 GLU 238.A N ARG 234.A O GLU 238.A H 2.943 2.124 LYS 239.A N ASP 235.A O LYS 239.A H 3.103 2.484 LYS 239.A N LEU 236.A O LYS 239.A H 2.936 2.222 LYS 239.A NZ ASP 235.A OD1 LYS 239.A HZ3 3.129 2.432 LYS 239.A NZ ASP 235.A OD2 LYS 239.A HZ3 2.977 2.105 LEU 240.A N VAL 237.A O LEU 240.A H 3.024 2.214 LEU 241.A N VAL 237.A O LEU 241.A H 2.852 1.998 THR 246.A N ASP 244.A OD1 THR 246.A H 2.961 2.132 THR 246.A OG1 ASP 244.A OD1 THR 246.A HG1 2.774 1.934 THR 246.A OG1 ASP 244.A OD2 THR 246.A HG1 3.505 2.907 LYS 247.A N ASP 244.A O LYS 247.A H 3.001 2.172 ARG 248.A NE VAL 242.A O ARG 248.A HE 2.862 2.073 ARG 248.A NH1 GLU 176.A OE1 ARG 248.A HH12 3.457 2.824 ARG 248.A NH1 GLU 176.A OE2 ARG 248.A HH12 2.826 1.981 ARG 248.A NH1 SER 186.A O ARG 248.A HH11 2.988 2.216 ARG 248.A NH2 GLU 176.A OE1 ARG 248.A HH22 2.782 1.938 ARG 248.A NH2 VAL 242.A O ARG 248.A HH21 3.022 2.272 LEU 249.A N LYS 239.A O LEU 249.A H 3.024 2.194 CYS 251.A N ARG 248.A O CYS 251.A H 2.959 2.118 CYS 251.A SG ARG 248.A O CYS 251.A HG 3.216 2.360 GLU 253.A N GLU 253.A OE1 GLU 253.A H 2.803 2.037 MET 254.A N CYS 251.A O MET 254.A H.A 2.971 2.251 GLU 255.A N GLU 252.A O GLU 255.A H 2.982 2.159 GLY 256.A N CYS 251.A O GLY 256.A H 2.926 2.095 TYR 257.A OH HIS 122.A ND1 TYR 257.A HH 2.765 1.961 LYS 261.A N TYR 257.A O LYS 261.A H 2.869 2.018 LYS 261.A NZ GLU 119.A OE1 LYS 261.A HZ2 2.952 2.063 ALA 262.A N GLY 258.A O ALA 262.A H 3.027 2.314 HIS 263.A N LEU 260.A O HIS 263.A H 3.014 2.160 HIS 263.A NE2 ASP 235.A OD2 HIS 263.A HE2 2.791 1.969 PHE 265.A N HIS 263.A ND1 PHE 265.A H 2.908 2.049 PHE 266.A N HIS 263.A O PHE 266.A H 2.889 2.059 GLU 267.A N PRO 264.A O GLU 267.A H 3.119 2.279 VAL 269.A N PHE 266.A O VAL 269.A H 2.883 2.028 GLN 276.A N ASN 273.A O GLN 276.A H 2.952 2.110 GLN 277.A N LEU 274.A O GLN 277.A H 3.122 2.316 GLN 277.A NE2 THR 270.A O GLN 277.A HE22 2.926 2.108 GLN 277.A NE2 GLU 272.A O GLN 277.A HE21 3.363 2.704