Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5lvn_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 3.A NZ GLU 27.A OE2 LYS 3.A HZ2 2.564 1.697 ARG 4.A N ASP 7.A OD2 ARG 4.A H 2.794 2.056 ASP 7.A N ARG 4.A O ASP 7.A H 2.923 2.103 PHE 8.A N PRO 5.A O PHE 8.A H 3.053 2.261 LYS 9.A N ARG 26.A O LYS 9.A H 2.851 2.022 GLY 11.A N LEU 24.A O GLY 11.A H 2.721 1.860 LEU 14.A N VAL 22.A O LEU 14.A H 2.724 1.927 GLY 15.A N VAL 22.A O GLY 15.A H 3.273 2.521 GLY 17.A N SER 20.A O GLY 17.A H 2.920 2.137 THR 21.A N ILE 38.A O THR 21.A H 3.018 2.218 VAL 22.A N GLY 15.A O VAL 22.A H 2.853 1.995 VAL 23.A N ILE 36.A O VAL 23.A H 2.886 2.059 LEU 24.A N LYS 12.A O LEU 24.A H 2.966 2.124 ALA 25.A N TYR 34.A O ALA 25.A H 2.864 2.084 ARG 26.A N LYS 9.A O ARG 26.A H 2.905 2.075 ARG 26.A NH1 SER 31.A O ARG 26.A HH11 2.863 2.111 GLU 27.A N ARG 32.A O GLU 27.A H 2.858 2.033 LEU 28.A N ASP 7.A O LEU 28.A H 2.892 2.044 THR 30.A N GLU 27.A O THR 30.A H 3.368 2.576 THR 30.A OG1 GLU 27.A OE1 THR 30.A HG1 2.669 2.095 SER 31.A N GLU 27.A O SER 31.A H 2.761 2.060 ARG 32.A N THR 30.A OG1 ARG 32.A H 3.130 2.283 TYR 34.A N ALA 25.A O TYR 34.A H 2.850 2.034 TYR 34.A OH GLU 27.A OE1 TYR 34.A HH 3.347 2.554 ALA 35.A N LEU 85.A O ALA 35.A H 2.909 2.170 ILE 36.A N VAL 23.A O ILE 36.A H 2.819 1.966 LYS 37.A N PHE 83.A O LYS 37.A H 2.919 2.138 LYS 37.A NZ GLU 56.A OE1 LYS 37.A HZ3 3.084 2.329 LYS 37.A NZ GLU 56.A OE2 LYS 37.A HZ3 2.739 1.914 ILE 38.A N THR 21.A O ILE 38.A H 2.746 1.935 LEU 39.A N LEU 81.A O LEU 39.A H 2.852 2.022 LYS 41.A N GLU 79.A O LYS 41.A H 2.892 2.056 LYS 41.A NZ GLN 76.A OE1 LYS 41.A HZ1 2.673 2.053 LYS 41.A NZ ASP 77.A O LYS 41.A HZ2 2.882 2.137 HIS 43.A N GLU 40.A O HIS 43.A H 3.076 2.476 ILE 44.A N GLU 40.A O ILE 44.A H 3.045 2.219 ILE 45.A N LYS 41.A O ILE 45.A H 2.875 2.021 LYS 46.A N ARG 42.A O LYS 46.A H 2.904 2.078 GLU 47.A N HIS 43.A O GLU 47.A H 2.925 2.124 ASN 48.A N ILE 45.A O ASN 48.A H 3.258 2.405 LYS 49.A N ILE 44.A O LYS 49.A H 2.822 1.976 TYR 52.A N LYS 49.A O TYR 52.A H 3.040 2.398 VAL 53.A N LYS 49.A O VAL 53.A H 3.187 2.358 THR 54.A N VAL 50.A O THR 54.A H 2.949 2.097 THR 54.A OG1 VAL 50.A O THR 54.A HG1 3.012 2.272 ARG 55.A N PRO 51.A O ARG 55.A H 2.915 2.117 ARG 55.A NH1 ALA 153.A O ARG 55.A HH11 2.849 2.007 GLU 56.A N TYR 52.A O GLU 56.A H 2.891 2.062 ARG 57.A N VAL 53.A O ARG 57.A H 3.172 2.326 ASP 58.A N THR 54.A O ASP 58.A H.B 2.918 2.066 VAL 59.A N ARG 55.A O VAL 59.A H 2.805 1.949 MET 60.A N GLU 56.A O MET 60.A H 2.963 2.112 SER 61.A N ARG 57.A O SER 61.A H.B 2.967 2.185 SER 61.A OG.A ARG 57.A O SER 61.A HG.A 2.633 1.887 SER 61.A OG.B ASP 58.A O SER 61.A HG.B 2.913 2.077 ARG 62.A N VAL 59.A O ARG 62.A H 2.969 2.137 ARG 62.A NE ASP 58.A OD2.B ARG 62.A HE 3.095 2.329 ARG 62.A NH2 ASP 58.A OD2.B ARG 62.A HH21 3.142 2.401 LEU 63.A N MET 60.A O LEU 63.A H 3.115 2.258 ASP 64.A N TYR 121.A OH ASP 64.A H 2.923 2.103 PHE 67.A N HIS 65.A ND1 PHE 67.A H 3.015 2.187 PHE 68.A N HIS 65.A O PHE 68.A H 3.313 2.520 VAL 69.A N ILE 147.A O VAL 69.A H 2.979 2.170 LYS 70.A N SER 86.A OG LYS 70.A H 2.976 2.128 TYR 72.A N GLY 84.A O TYR 72.A H 2.752 1.926 PHE 75.A N TYR 82.A O PHE 75.A H 3.034 2.249 ASP 77.A N LYS 80.A O ASP 77.A H 3.018 2.251 GLU 79.A N ASP 77.A OD1 GLU 79.A H 2.939 2.188 LYS 80.A N ASP 77.A OD1 LYS 80.A H 2.816 2.071 LEU 81.A N LEU 39.A O LEU 81.A H 2.850 2.026 TYR 82.A N PHE 75.A O TYR 82.A H 2.841 2.040 TYR 82.A OH ASP 77.A OD2 TYR 82.A HH 3.042 2.248 PHE 83.A N LYS 37.A O PHE 83.A H.A 2.872 2.036 GLY 84.A N PHE 73.A O GLY 84.A H 2.786 1.937 LEU 85.A N ALA 35.A O LEU 85.A H 2.838 2.034 SER 86.A N LYS 70.A O SER 86.A H 2.934 2.186 ASN 90.A N LEU 139.A O ASN 90.A H 2.915 2.151 ASN 90.A ND2 ASN 140.A O ASN 90.A HD22 2.954 2.120 ASN 90.A ND2 GLU 141.A O ASN 90.A HD21 3.486 3.031 GLY 91.A N ALA 88.A O GLY 91.A H 3.202 2.359 LEU 93.A N ILE 137.A O LEU 93.A H 2.798 1.960 LYS 95.A N GLU 92.A O LYS 95.A H 3.061 2.369 LYS 95.A NZ ASN 90.A O LYS 95.A HZ1 3.143 2.391 TYR 96.A N LEU 93.A O TYR 96.A H 2.931 2.261 TYR 96.A OH ASN 90.A O TYR 96.A HH 3.261 2.441 ILE 97.A N LEU 93.A O ILE 97.A H 3.215 2.409 ARG 98.A N LEU 94.A O ARG 98.A H 2.968 2.143 LYS 99.A N LYS 95.A O LYS 99.A H 3.142 2.384 ILE 100.A N TYR 96.A O ILE 100.A H 2.998 2.152 GLY 101.A N ILE 97.A O GLY 101.A H 2.762 1.977 SER 102.A OG.A VAL 201.A O SER 102.A HG.A 2.581 1.867 PHE 103.A N LEU 200.A O PHE 103.A H.A 2.803 1.987 CYS 107.A N ASP 104.A OD1 CYS 107.A H 2.786 1.935 THR 108.A N ASP 104.A O THR 108.A H 2.843 1.988 THR 108.A OG1 PHE 103.A O THR 108.A HG1 3.424 2.978 THR 108.A OG1 ASP 104.A O THR 108.A HG1 2.857 2.093 ARG 109.A N GLU 105.A O ARG 109.A H 2.817 1.971 ARG 109.A NH1 GLU 105.A OE2 ARG 109.A HH12 3.166 2.405 ARG 109.A NH2 GLU 105.A OE2 ARG 109.A HH22 3.039 2.236 ARG 109.A NH2 PHE 266.A O ARG 109.A HH21 2.899 2.119 PHE 110.A N THR 106.A O PHE 110.A H 2.964 2.150 TYR 111.A N CYS 107.A O TYR 111.A H 3.024 2.164 TYR 111.A OH MET 143.A O TYR 111.A HH 2.629 1.819 THR 112.A N THR 108.A O THR 112.A H 2.881 2.041 THR 112.A OG1 THR 108.A O THR 112.A HG1 2.759 2.076 ALA 113.A N ARG 109.A O ALA 113.A H 2.847 2.023 GLU 114.A N PHE 110.A O GLU 114.A H 2.999 2.185 ILE 115.A N TYR 111.A O ILE 115.A H 3.026 2.196 VAL 116.A N THR 112.A O VAL 116.A H 2.840 1.998 SER 117.A N ALA 113.A O SER 117.A H.A 2.919 2.082 SER 117.A OG.A ALA 113.A O SER 117.A HG.A 2.987 2.214 ALA 118.A N GLU 114.A O ALA 118.A H 2.930 2.135 LEU 119.A N ILE 115.A O LEU 119.A H 2.871 2.035 GLU 120.A N VAL 116.A O GLU 120.A H 2.872 2.036 TYR 121.A N SER 117.A O TYR 121.A H 3.172 2.357 LEU 122.A N ALA 118.A O LEU 122.A H 2.929 2.105 HIS 123.A N LEU 119.A O HIS 123.A H 2.763 1.905 HIS 123.A NE2 ASP 189.A OD2 HIS 123.A HE2 2.839 1.983 GLY 124.A N GLU 120.A O GLY 124.A H 2.940 2.146 LYS 125.A N TYR 121.A O LYS 125.A H 3.206 2.507 LYS 125.A N LEU 122.A O LYS 125.A H 3.070 2.388 GLY 126.A N HIS 123.A O GLY 126.A H 2.887 2.049 ILE 127.A N LEU 122.A O ILE 127.A H 3.105 2.276 ILE 128.A N LYS 154.A O ILE 128.A H 2.900 2.096 HIS 129.A N ASP 189.A OD2 HIS 129.A H 2.868 2.030 HIS 129.A NE2 THR 148.A O HIS 129.A HE2 2.884 2.049 ARG 130.A N ASP 189.A OD1 ARG 130.A H 2.865 2.008 ARG 130.A NE THR 152.A O ARG 130.A HE 2.782 1.970 ARG 130.A NH2 THR 152.A O ARG 130.A HH21 3.049 2.351 ARG 130.A NH2 ALA 153.A O ARG 130.A HH21 3.257 2.685 ASP 131.A N HIS 129.A ND1 ASP 131.A H 3.021 2.208 LYS 133.A NZ THR 170.A OG1 LYS 133.A HZ3 2.793 1.925 ASN 136.A N LYS 133.A O ASN 136.A H 2.919 2.132 ASN 136.A ND2 ASP 131.A O ASN 136.A HD22 2.886 2.072 ASN 136.A ND2 ASP 149.A OD2.B ASN 136.A HD21 3.060 2.436 ILE 137.A N PRO 134.A O ILE 137.A H 3.247 2.396 LEU 138.A N GLN 146.A O LEU 138.A H 2.899 2.085 LEU 139.A N GLY 91.A O LEU 139.A H 2.762 2.111 ASN 140.A N HIS 144.A O ASN 140.A H 2.930 2.108 ASP 142.A N ASN 140.A OD1 ASP 142.A H 3.023 2.389 MET 143.A N ASN 140.A O MET 143.A H 2.921 2.079 HIS 144.A N ASN 140.A OD1 HIS 144.A H 2.968 2.167 HIS 144.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 144.A HD1 2.637 1.809 ILE 145.A N GLU 114.A OE1 ILE 145.A H 2.980 2.139 GLN 146.A N LEU 138.A O GLN 146.A H 2.743 1.994 GLN 146.A NE2 PRO 66.A O GLN 146.A HE22 2.679 2.091 GLN 146.A NE2 ILE 145.A O GLN 146.A HE21 2.874 2.034 ILE 147.A N PHE 67.A O ILE 147.A H 2.851 2.005 THR 148.A N ASN 136.A O THR 148.A H 2.933 2.110 ALA 153.A N PHE 150.A O ALA 153.A H 3.079 2.232 LYS 154.A N ILE 128.A O LYS 154.A H 2.946 2.156 LEU 156.A N GLY 126.A O LEU 156.A H 2.777 1.965 SER 157.A N GLN 162.A OE1 SER 157.A H 2.963 2.134 LYS 161.A N PRO 158.A O LYS 161.A H 3.205 2.373 GLN 162.A N SER 157.A O GLN 162.A H 3.105 2.290 GLN 162.A NE2 ARG 164.A O GLN 162.A HE21 2.914 2.095 ARG 164.A NE SER 183.A OG.A ARG 164.A HE 3.130 2.357 ARG 164.A NH1 SER 183.A O ARG 164.A HH11 3.387 2.742 ARG 164.A NH1 SER 183.A OG.A ARG 164.A HH11 3.135 2.378 ALA 165.A N ALA 184.A O ALA 165.A H 2.821 2.005 THR 170.A OG1 ASP 131.A OD1 THR 170.A HG1 2.620 1.947 TYR 173.A N THR 170.A O TYR 173.A H 2.944 2.120 TYR 173.A OH GLN 199.A OE1 TYR 173.A HH 2.644 1.825 VAL 174.A N ALA 171.A O VAL 174.A H 3.427 2.591 SER 175.A OG SER 188.A OG SER 175.A HG 3.361 2.546 GLU 177.A N GLU 177.A OE1 GLU 177.A H 2.753 1.959 LEU 178.A N SER 175.A OG LEU 178.A H 3.402 2.582 LEU 179.A N SER 175.A O LEU 179.A H 3.332 2.521 THR 180.A N PRO 176.A O THR 180.A H 2.884 2.110 THR 180.A OG1 GLU 181.A OE2 THR 180.A HG1 3.062 2.403 GLU 181.A N GLU 177.A O GLU 181.A H 2.763 1.968 LYS 182.A N LEU 178.A O LYS 182.A H 3.164 2.517 SER 183.A OG.B ASN 166.A OD1 SER 183.A HG.B 2.758 2.045 ALA 184.A N ALA 165.A O ALA 184.A H 2.922 2.117 CYS 185.A N SER 188.A OG CYS 185.A H 2.941 2.098 LYS 186.A NZ.A GLU 253.A OE2 LYS 186.A HZ3.A 2.820 2.039 SER 187.A OG ALA 246.A O SER 187.A HG 2.734 1.917 SER 188.A N CYS 185.A O SER 188.A H 2.879 2.109 SER 188.A OG GLU 177.A OE2 SER 188.A HG 2.687 1.921 ASP 189.A N LYS 186.A O ASP 189.A H 2.962 2.205 LEU 190.A N SER 187.A O LEU 190.A H 2.927 2.318 TRP 191.A N SER 187.A O TRP 191.A H 3.144 2.362 ALA 192.A N SER 188.A O ALA 192.A H 3.247 2.419 LEU 193.A N ASP 189.A O LEU 193.A H 2.874 2.057 GLY 194.A N LEU 190.A O GLY 194.A H 2.976 2.163 CYS 195.A N TRP 191.A O CYS 195.A H 3.049 2.237 CYS 195.A SG TRP 191.A O CYS 195.A HG 3.595 2.553 ILE 196.A N ALA 192.A O ILE 196.A H 2.892 2.104 ILE 197.A N LEU 193.A O ILE 197.A H 2.881 2.034 TYR 198.A N GLY 194.A O TYR 198.A H 3.056 2.200 TYR 198.A OH ASP 225.A O TYR 198.A HH 2.612 1.830 GLN 199.A N CYS 195.A O GLN 199.A H 2.954 2.145 LEU 200.A N ILE 196.A O LEU 200.A H 2.866 2.056 VAL 201.A N ILE 197.A O VAL 201.A H 3.259 2.499 VAL 201.A N TYR 198.A O VAL 201.A H 3.191 2.543 ALA 202.A N TYR 198.A O ALA 202.A H 2.786 1.938 GLY 203.A N GLN 199.A O GLY 203.A H 2.831 2.047 ARG 208.A NH1.B PRO 205.A O ARG 208.A HH11.B 2.833 2.061 LEU 214.A N ASN 211.A OD1 LEU 214.A H 2.937 2.188 ILE 215.A N ASN 211.A O ILE 215.A H 3.368 2.575 PHE 216.A N GLU 212.A O PHE 216.A H 2.948 2.125 ALA 217.A N GLY 213.A O ALA 217.A H 3.087 2.285 LYS 218.A N LEU 214.A O LYS 218.A H.A 3.302 2.504 LYS 218.A NZ.A ARG 208.A O.A LYS 218.A HZ3.A 2.340 1.611 LYS 218.A NZ.A ARG 208.A O.B LYS 218.A HZ3.A 2.523 1.815 ILE 219.A N ILE 215.A O ILE 219.A H 2.903 2.076 ILE 220.A N PHE 216.A O ILE 220.A H 3.126 2.296 LYS 221.A N LYS 218.A O LYS 221.A H 3.232 2.571 LEU 222.A N ILE 219.A O LEU 222.A H 3.005 2.165 GLU 223.A N LYS 218.A O GLU 223.A H 2.914 2.059 ARG 235.A N PHE 231.A O ARG 235.A H 2.867 2.056 ARG 235.A NE GLU 239.A OE2 ARG 235.A HE 2.989 2.148 ARG 235.A NH2 GLU 239.A OE2 ARG 235.A HH21 3.484 2.801 ASP 236.A N PRO 232.A O ASP 236.A H 2.991 2.159 LEU 237.A N LYS 233.A O LEU 237.A H 3.075 2.245 VAL 238.A N ALA 234.A O VAL 238.A H 2.878 2.029 GLU 239.A N ARG 235.A O GLU 239.A H 2.918 2.080 LYS 240.A N ASP 236.A O LYS 240.A H 3.078 2.447 LYS 240.A N LEU 237.A O LYS 240.A H 2.929 2.234 LYS 240.A NZ ASP 236.A OD1 LYS 240.A HZ3 3.102 2.422 LYS 240.A NZ ASP 236.A OD2 LYS 240.A HZ3 2.941 2.066 LEU 241.A N VAL 238.A O LEU 241.A H 2.990 2.180 LEU 242.A N VAL 238.A O LEU 242.A H 2.833 1.978 THR 247.A N ASP 245.A OD1 THR 247.A H 2.965 2.149 THR 247.A OG1 ASP 245.A OD1 THR 247.A HG1 2.696 1.857 THR 247.A OG1 ASP 245.A OD2 THR 247.A HG1 3.517 2.911 LYS 248.A N ASP 245.A O LYS 248.A H 2.986 2.146 ARG 249.A NE VAL 243.A O ARG 249.A HE 2.840 2.040 ARG 249.A NH1 GLU 177.A OE1 ARG 249.A HH12 3.409 2.769 ARG 249.A NH1 GLU 177.A OE2 ARG 249.A HH12 2.840 1.999 ARG 249.A NH1 SER 187.A O ARG 249.A HH11 3.028 2.255 ARG 249.A NH2 GLU 177.A OE1 ARG 249.A HH22 2.751 1.908 ARG 249.A NH2 VAL 243.A O ARG 249.A HH21 3.013 2.274 LEU 250.A N LYS 240.A O LEU 250.A H 3.019 2.186 CYS 252.A N ARG 249.A O CYS 252.A H 2.981 2.132 CYS 252.A SG ARG 249.A O CYS 252.A HG 3.237 2.347 GLU 254.A N GLU 254.A OE1 GLU 254.A H 2.752 1.986 MET 255.A N CYS 252.A O MET 255.A H.A 2.980 2.297 GLU 256.A N GLU 253.A O GLU 256.A H.A 2.918 2.088 GLY 257.A N CYS 252.A O GLY 257.A H 2.903 2.069 TYR 258.A OH HIS 123.A ND1 TYR 258.A HH 2.775 1.976 LYS 262.A N TYR 258.A O LYS 262.A H 2.854 2.003 LYS 262.A NZ GLU 120.A OE1 LYS 262.A HZ2 2.709 1.907 LYS 262.A NZ GLU 120.A OE2 LYS 262.A HZ2 3.203 2.405 ALA 263.A N GLY 259.A O ALA 263.A H 2.995 2.289 HIS 264.A N LEU 261.A O HIS 264.A H 3.041 2.189 HIS 264.A NE2 ASP 236.A OD2 HIS 264.A HE2 2.796 1.979 PHE 266.A N HIS 264.A ND1 PHE 266.A H 2.932 2.072 PHE 267.A N HIS 264.A O PHE 267.A H 2.875 2.046 GLU 268.A N PRO 265.A O GLU 268.A H 3.152 2.313 VAL 270.A N PHE 267.A O VAL 270.A H 2.919 2.063 GLN 277.A N ASN 274.A O GLN 277.A H 2.906 2.066 GLN 278.A N LEU 275.A O GLN 278.A H 3.149 2.342 GLN 278.A NE2 THR 271.A O GLN 278.A HE22 2.830 2.043 GLN 278.A NE2 GLU 273.A O GLN 278.A HE21 3.550 2.864