Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5lvo_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 5.A NZ GLU 29.A OE2 LYS 5.A HZ2 2.799 1.918 ARG 6.A N ASP 9.A OD2 ARG 6.A H 2.804 2.068 GLU 8.A N GLU 8.A OE2.A GLU 8.A H.A 2.803 1.983 ASP 9.A N ARG 6.A O ASP 9.A H 2.931 2.099 PHE 10.A N PRO 7.A O PHE 10.A H 3.071 2.253 LYS 11.A N ARG 28.A O LYS 11.A H 2.862 2.038 GLY 13.A N LEU 26.A O GLY 13.A H 2.753 1.895 LEU 16.A N VAL 24.A O LEU 16.A H 2.723 1.941 GLY 17.A N VAL 24.A O GLY 17.A H 3.315 2.572 GLY 19.A N SER 22.A O GLY 19.A H 2.905 2.160 THR 23.A N ILE 40.A O THR 23.A H 2.939 2.126 VAL 24.A N GLY 17.A O VAL 24.A H 2.866 2.007 VAL 25.A N ILE 38.A O VAL 25.A H.B 2.888 2.063 LEU 26.A N LYS 14.A O LEU 26.A H 2.913 2.068 ALA 27.A N TYR 36.A O ALA 27.A H 2.861 2.068 ARG 28.A N LYS 11.A O ARG 28.A H 2.886 2.052 GLU 29.A N ARG 34.A O GLU 29.A H 2.878 2.051 LEU 30.A N ASP 9.A O LEU 30.A H 2.879 2.034 THR 32.A N GLU 29.A O THR 32.A H 3.312 2.518 SER 33.A N GLU 29.A O SER 33.A H 2.729 1.968 ARG 34.A N THR 32.A OG1 ARG 34.A H 3.116 2.258 TYR 36.A N ALA 27.A O TYR 36.A H 2.906 2.079 ALA 37.A N LEU 87.A O ALA 37.A H 2.932 2.177 ILE 38.A N VAL 25.A O ILE 38.A H 2.814 1.969 LYS 39.A N PHE 85.A O LYS 39.A H 2.933 2.169 LYS 39.A NZ.A GLU 58.A OE1 LYS 39.A HZ3.A 3.218 2.623 LYS 39.A NZ.A GLU 58.A OE2 LYS 39.A HZ3.A 2.923 2.038 LYS 39.A NZ.B GLU 58.A OE2 LYS 39.A HZ1.B 2.631 1.745 ILE 40.A N THR 23.A O ILE 40.A H 2.784 1.966 LEU 41.A N LEU 83.A O LEU 41.A H 2.934 2.113 LYS 43.A N GLU 81.A O LYS 43.A H 2.828 2.013 LYS 43.A NZ GLN 78.A OE1 LYS 43.A HZ1 2.589 1.784 LYS 43.A NZ ASP 79.A O LYS 43.A HZ2 2.784 2.012 HIS 45.A N GLU 42.A O HIS 45.A H 3.137 2.539 ILE 46.A N GLU 42.A O ILE 46.A H 3.020 2.176 ILE 47.A N LYS 43.A O ILE 47.A H 2.814 1.963 LYS 48.A N ARG 44.A O LYS 48.A H 2.906 2.063 GLU 49.A N HIS 45.A O GLU 49.A H 2.966 2.209 ASN 50.A N ILE 47.A O ASN 50.A H 3.387 2.528 LYS 51.A N ILE 46.A O LYS 51.A H 2.901 2.046 TYR 54.A N LYS 51.A O TYR 54.A H 2.994 2.370 VAL 55.A N LYS 51.A O VAL 55.A H 3.171 2.355 THR 56.A N VAL 52.A O THR 56.A H.B 2.987 2.135 THR 56.A OG1.A VAL 52.A O THR 56.A HG1.A 2.956 2.197 THR 56.A OG1.B VAL 52.A O THR 56.A HG1.B 3.266 2.466 THR 56.A OG1.B PRO 53.A O THR 56.A HG1.B 3.245 2.763 ARG 57.A N PRO 53.A O ARG 57.A H 2.924 2.120 ARG 57.A NE.A GLY 153.A O ARG 57.A HE.A 2.980 2.199 ARG 57.A NH1.B ALA 155.A O ARG 57.A HH11.B 2.821 1.997 ARG 57.A NH2.A GLY 153.A O ARG 57.A HH21.A 2.968 2.197 GLU 58.A N TYR 54.A O GLU 58.A H 2.929 2.109 ARG 59.A N VAL 55.A O ARG 59.A H 3.114 2.270 ARG 59.A NE.A ASP 60.A OD1.A no hydrogen 3.386 N/A ASP 60.A N THR 56.A O ASP 60.A H.B 2.887 2.042 VAL 61.A N ARG 57.A O VAL 61.A H 2.794 1.937 MET 62.A N GLU 58.A O MET 62.A H 3.013 2.161 SER 63.A N ARG 59.A O SER 63.A H.A 2.948 2.153 SER 63.A OG.A ARG 59.A O SER 63.A HG.A 2.672 1.903 SER 63.A OG.B ASP 60.A O SER 63.A HG.B 2.813 1.984 ARG 64.A N VAL 61.A O ARG 64.A H 2.987 2.189 ARG 64.A NE ASP 60.A OD2.B ARG 64.A HE 2.916 2.187 ARG 64.A NH2 ASP 60.A OD2.B ARG 64.A HH21 3.241 2.547 LEU 65.A N MET 62.A O LEU 65.A H 3.125 2.285 ASP 66.A N TYR 123.A OH ASP 66.A H 2.834 2.066 PHE 69.A N HIS 67.A ND1 PHE 69.A H 3.016 2.180 PHE 70.A N HIS 67.A O PHE 70.A H 3.340 2.535 VAL 71.A N ILE 149.A O VAL 71.A H 3.001 2.184 LYS 72.A N SER 88.A OG LYS 72.A H 3.034 2.199 TYR 74.A N GLY 86.A O TYR 74.A H 2.772 1.963 PHE 77.A N TYR 84.A O PHE 77.A H 3.050 2.258 ASP 79.A N LYS 82.A O ASP 79.A H 2.945 2.143 GLU 81.A N ASP 79.A OD1 GLU 81.A H 3.044 2.306 LYS 82.A N ASP 79.A OD1 LYS 82.A H 2.852 2.129 LYS 82.A NZ.B GLU 42.A OE2 LYS 82.A HZ2.B 2.680 1.820 LEU 83.A N LEU 41.A O LEU 83.A H 2.900 2.078 TYR 84.A N PHE 77.A O TYR 84.A H 2.811 2.032 TYR 84.A OH ASP 79.A OD2 TYR 84.A HH 2.801 2.015 PHE 85.A N LYS 39.A O PHE 85.A H 2.844 2.028 GLY 86.A N PHE 75.A O GLY 86.A H 2.810 1.957 LEU 87.A N ALA 37.A O LEU 87.A H 2.840 2.026 SER 88.A N LYS 72.A O SER 88.A H 2.963 2.200 ASN 92.A N LEU 141.A O ASN 92.A H 2.891 2.128 ASN 92.A ND2 ASN 142.A O ASN 92.A HD22 2.932 2.097 GLY 93.A N ALA 90.A O GLY 93.A H 3.193 2.356 LEU 95.A N ILE 139.A O LEU 95.A H 2.804 1.974 LYS 97.A N GLU 94.A O LYS 97.A H 3.100 2.393 LYS 97.A NZ ASN 92.A O LYS 97.A HZ1 3.169 2.430 TYR 98.A N LEU 95.A O TYR 98.A H 2.980 2.305 TYR 98.A OH ASN 92.A O TYR 98.A HH 3.252 2.429 ILE 99.A N LEU 95.A O ILE 99.A H 3.253 2.446 ARG 100.A N LEU 96.A O ARG 100.A H 2.984 2.148 LYS 101.A N LYS 97.A O LYS 101.A H 3.086 2.302 ILE 102.A N TYR 98.A O ILE 102.A H.B 3.024 2.169 GLY 103.A N ILE 99.A O GLY 103.A H 2.757 1.985 SER 104.A OG.A VAL 203.A O SER 104.A HG.A 2.616 2.114 PHE 105.A N LEU 202.A O PHE 105.A H.B 2.811 1.987 CYS 109.A N ASP 106.A OD1 CYS 109.A H 2.806 1.953 THR 110.A N ASP 106.A O THR 110.A H 2.867 2.014 THR 110.A OG1 PHE 105.A O THR 110.A HG1 3.405 2.921 THR 110.A OG1 ASP 106.A O THR 110.A HG1 2.879 2.123 ARG 111.A N GLU 107.A O ARG 111.A H 2.826 1.986 ARG 111.A NH1 GLU 107.A OE2 ARG 111.A HH12 3.084 2.315 ARG 111.A NH2 GLU 107.A OE2 ARG 111.A HH22 3.023 2.234 ARG 111.A NH2 PHE 268.A O ARG 111.A HH21 2.903 2.116 PHE 112.A N THR 108.A O PHE 112.A H 2.980 2.173 TYR 113.A N CYS 109.A O TYR 113.A H 3.030 2.170 TYR 113.A OH MET 145.A O TYR 113.A HH 2.648 1.840 THR 114.A N THR 110.A O THR 114.A H 2.907 2.063 THR 114.A OG1 THR 110.A O THR 114.A HG1 2.753 2.076 ALA 115.A N ARG 111.A O ALA 115.A H 2.875 2.051 GLU 116.A N PHE 112.A O GLU 116.A H 2.969 2.152 ILE 117.A N TYR 113.A O ILE 117.A H 3.006 2.180 VAL 118.A N THR 114.A O VAL 118.A H 2.855 2.013 SER 119.A N ALA 115.A O SER 119.A H.B 2.892 2.052 SER 119.A OG.A ALA 115.A O SER 119.A HG.A 3.067 2.279 ALA 120.A N GLU 116.A O ALA 120.A H 2.913 2.093 LEU 121.A N ILE 117.A O LEU 121.A H 2.865 2.026 GLU 122.A N VAL 118.A O GLU 122.A H 2.859 2.031 TYR 123.A N SER 119.A O TYR 123.A H 3.174 2.351 LEU 124.A N ALA 120.A O LEU 124.A H.A 2.926 2.096 HIS 125.A N LEU 121.A O HIS 125.A H 2.798 1.938 HIS 125.A NE2 ASP 191.A OD2 HIS 125.A HE2 2.863 2.005 GLY 126.A N GLU 122.A O GLY 126.A H 2.951 2.163 LYS 127.A N TYR 123.A O LYS 127.A H 3.211 2.534 LYS 127.A N LEU 124.A O LYS 127.A H 3.057 2.358 GLY 128.A N HIS 125.A O GLY 128.A H 2.889 2.054 ILE 129.A N LEU 124.A O ILE 129.A H 3.098 2.273 ILE 130.A N LYS 156.A O ILE 130.A H 2.919 2.117 HIS 131.A N ASP 191.A OD2 HIS 131.A H 2.859 2.027 HIS 131.A NE2 THR 150.A O HIS 131.A HE2 2.899 2.068 ARG 132.A N ASP 191.A OD1 ARG 132.A H 2.920 2.064 ARG 132.A NE THR 154.A O ARG 132.A HE 2.829 2.021 ARG 132.A NH2 THR 154.A O ARG 132.A HH21 3.068 2.370 ARG 132.A NH2 ALA 155.A O ARG 132.A HH21 3.307 2.732 ASP 133.A N HIS 131.A ND1 ASP 133.A H 2.994 2.174 LYS 135.A NZ THR 172.A OG1 LYS 135.A HZ3 2.822 1.966 GLU 137.A N GLU 137.A OE1.A GLU 137.A H.A 2.831 2.032 ASN 138.A N LYS 135.A O ASN 138.A H 2.896 2.104 ASN 138.A ND2 ASP 133.A O ASN 138.A HD22 2.898 2.071 ASN 138.A ND2 ASP 151.A OD2 ASN 138.A HD21 2.902 2.278 ILE 139.A N PRO 136.A O ILE 139.A H 3.207 2.357 LEU 140.A N GLN 148.A O LEU 140.A H 2.878 2.079 LEU 141.A N GLY 93.A O LEU 141.A H 2.792 2.178 ASN 142.A N HIS 146.A O ASN 142.A H 2.985 2.155 ASP 144.A N ASN 142.A OD1 ASP 144.A H 2.987 2.354 MET 145.A N ASN 142.A O MET 145.A H 2.877 2.037 HIS 146.A N ASN 142.A OD1 HIS 146.A H 2.979 2.186 HIS 146.A ND1 GLU 116.A OE2 HIS 146.A HD1 2.642 1.818 ILE 147.A N GLU 116.A OE1 ILE 147.A H 2.998 2.158 GLN 148.A N LEU 140.A O GLN 148.A H 2.757 2.001 GLN 148.A NE2 PRO 68.A O GLN 148.A HE22 2.755 2.214 GLN 148.A NE2 ILE 147.A O GLN 148.A HE21 2.865 2.019 ILE 149.A N PHE 69.A O ILE 149.A H 2.879 2.031 THR 150.A N ASN 138.A O THR 150.A H 2.969 2.151 ALA 155.A N PHE 152.A O ALA 155.A H 3.082 2.239 LYS 156.A N ILE 130.A O LYS 156.A H 2.964 2.166 LEU 158.A N GLY 128.A O LEU 158.A H 2.807 1.979 SER 159.A N GLN 164.A OE1 SER 159.A H.A 2.967 2.126 SER 159.A OG.B GLN 164.A OE1 SER 159.A HG.B 3.311 2.610 GLU 161.A N SER 159.A OG.A GLU 161.A H 3.223 2.606 LYS 163.A N PRO 160.A O LYS 163.A H 3.197 2.375 GLN 164.A N SER 159.A O GLN 164.A H 3.201 2.406 GLN 164.A NE2 ARG 166.A O GLN 164.A HE21 2.881 2.053 ARG 166.A NE SER 185.A OG ARG 166.A HE 2.875 2.132 ARG 166.A NH2 SER 185.A O ARG 166.A HH21 3.260 2.589 ARG 166.A NH2 SER 185.A OG ARG 166.A HH21 3.095 2.382 ALA 167.A N ALA 186.A O ALA 167.A H 2.844 2.024 THR 172.A OG1 ASP 133.A OD1 THR 172.A HG1 2.640 1.969 THR 172.A OG1 ASP 133.A OD2 THR 172.A HG1 3.555 2.926 GLN 174.A N GLN 174.A OE1.A GLN 174.A H 2.756 1.981 TYR 175.A N THR 172.A O TYR 175.A H 2.909 2.087 TYR 175.A OH GLN 201.A OE1 TYR 175.A HH 2.614 1.796 SER 177.A OG SER 190.A OG SER 177.A HG 3.337 2.523 GLU 179.A N GLU 179.A OE1 GLU 179.A H 2.716 1.916 LEU 180.A N SER 177.A O LEU 180.A H 3.192 2.601 LEU 181.A N SER 177.A O LEU 181.A H 3.336 2.521 THR 182.A N PRO 178.A O THR 182.A H 2.857 2.084 THR 182.A OG1 PRO 178.A O THR 182.A HG1 3.044 2.231 GLU 183.A N GLU 179.A O GLU 183.A H 2.773 1.967 LYS 184.A N LEU 180.A O LYS 184.A H 3.109 2.433 ALA 186.A N ALA 167.A O ALA 186.A H 2.947 2.138 CYS 187.A N SER 190.A OG CYS 187.A H 2.918 2.074 LYS 188.A NZ.A HIS 125.A O LYS 188.A HZ2.A 2.886 2.333 LYS 188.A NZ.A GLU 255.A OE2 LYS 188.A HZ1.A 2.873 2.033 LYS 188.A NZ.B GLU 255.A OE1 LYS 188.A HZ3.B 3.462 2.664 SER 190.A N CYS 187.A O SER 190.A H 2.888 2.135 SER 190.A OG GLU 179.A OE2 SER 190.A HG 2.713 1.955 ASP 191.A N LYS 188.A O ASP 191.A H 2.967 2.208 LEU 192.A N SER 189.A O LEU 192.A H 2.928 2.314 TRP 193.A N SER 189.A O TRP 193.A H 3.166 2.371 ALA 194.A N SER 190.A O ALA 194.A H 3.222 2.400 LEU 195.A N ASP 191.A O LEU 195.A H 2.874 2.065 GLY 196.A N LEU 192.A O GLY 196.A H 2.989 2.176 CYS 197.A N TRP 193.A O CYS 197.A H 3.077 2.262 CYS 197.A SG TRP 193.A O CYS 197.A HG 3.621 2.600 ILE 198.A N ALA 194.A O ILE 198.A H 2.898 2.102 ILE 199.A N LEU 195.A O ILE 199.A H 2.877 2.036 TYR 200.A N GLY 196.A O TYR 200.A H 3.058 2.203 TYR 200.A OH ASP 227.A O TYR 200.A HH 2.600 1.815 GLN 201.A N CYS 197.A O GLN 201.A H 2.952 2.149 LEU 202.A N ILE 198.A O LEU 202.A H 2.866 2.057 VAL 203.A N ILE 199.A O VAL 203.A H 3.195 2.424 VAL 203.A N TYR 200.A O VAL 203.A H 3.197 2.576 ALA 204.A N TYR 200.A O ALA 204.A H 2.808 1.959 GLY 205.A N GLN 201.A O GLY 205.A H 2.838 2.066 ARG 210.A NH1 PRO 207.A O ARG 210.A HH11 2.827 2.023 LEU 216.A N ASN 213.A OD1 LEU 216.A H 3.081 2.350 PHE 218.A N GLU 214.A O PHE 218.A H 2.949 2.127 ALA 219.A N GLY 215.A O ALA 219.A H 3.043 2.235 LYS 220.A N LEU 216.A O LYS 220.A H 3.294 2.506 ILE 221.A N ILE 217.A O ILE 221.A H 2.928 2.106 ILE 222.A N PHE 218.A O ILE 222.A H 3.139 2.317 LYS 223.A N LYS 220.A O LYS 223.A H 3.245 2.589 LEU 224.A N ILE 221.A O LEU 224.A H 3.032 2.188 GLU 225.A N LYS 220.A O GLU 225.A H 2.923 2.068 ARG 237.A N PHE 233.A O ARG 237.A H 2.893 2.081 ARG 237.A NE GLU 241.A OE2 ARG 237.A HE 2.934 2.095 ARG 237.A NH2 GLU 241.A OE2 ARG 237.A HH21 3.383 2.692 ASP 238.A N PRO 234.A O ASP 238.A H 3.010 2.185 LEU 239.A N LYS 235.A O LEU 239.A H 3.073 2.256 VAL 240.A N ALA 236.A O VAL 240.A H 2.893 2.046 GLU 241.A N ARG 237.A O GLU 241.A H 2.938 2.099 LYS 242.A N ASP 238.A O LYS 242.A H 3.087 2.436 LYS 242.A N LEU 239.A O LYS 242.A H 2.952 2.269 LYS 242.A NZ ASP 238.A OD1 LYS 242.A HZ3 3.214 2.550 LYS 242.A NZ ASP 238.A OD2 LYS 242.A HZ3 2.957 2.075 LEU 243.A N VAL 240.A O LEU 243.A H 3.033 2.224 LEU 244.A N VAL 240.A O LEU 244.A H 2.836 1.984 THR 249.A N ASP 247.A OD1 THR 249.A H 2.923 2.118 THR 249.A OG1 ASP 247.A OD1 THR 249.A HG1 2.701 1.862 THR 249.A OG1 ASP 247.A OD2 THR 249.A HG1 3.499 2.898 LYS 250.A N ASP 247.A O LYS 250.A H 2.908 2.081 ARG 251.A NE VAL 245.A O ARG 251.A HE 2.876 2.093 ARG 251.A NH1 GLU 179.A OE1 ARG 251.A HH12 3.423 2.779 ARG 251.A NH1 GLU 179.A OE2 ARG 251.A HH12 2.828 1.984 ARG 251.A NH1 SER 189.A O ARG 251.A HH11 3.029 2.250 ARG 251.A NH2 GLU 179.A OE1 ARG 251.A HH22 2.761 1.916 ARG 251.A NH2 VAL 245.A O ARG 251.A HH21 3.027 2.282 LEU 252.A N LYS 242.A O LEU 252.A H 2.977 2.139 CYS 254.A N ARG 251.A O CYS 254.A H 3.008 2.158 CYS 254.A SG ARG 251.A O CYS 254.A HG 3.234 2.326 GLU 256.A N GLU 256.A OE1 GLU 256.A H 2.783 2.026 MET 257.A N CYS 254.A O MET 257.A H 3.050 2.373 GLU 258.A N GLU 255.A O GLU 258.A H 3.028 2.208 GLY 259.A N CYS 254.A O GLY 259.A H 2.885 2.065 TYR 260.A OH HIS 125.A ND1 TYR 260.A HH 2.761 1.964 LYS 264.A N TYR 260.A O LYS 264.A H 2.878 2.029 LYS 264.A NZ.A GLU 122.A OE1 LYS 264.A HZ1.A 2.731 1.926 LYS 264.A NZ.B GLU 122.A OE1 LYS 264.A HZ2.B 3.544 2.720 LYS 264.A NZ.B GLU 122.A OE2 LYS 264.A HZ2.B 2.925 2.110 ALA 265.A N GLY 261.A O ALA 265.A H 3.025 2.306 HIS 266.A N LEU 263.A O HIS 266.A H 3.020 2.166 HIS 266.A NE2 ASP 238.A OD2 HIS 266.A HE2 2.829 2.015 PHE 268.A N HIS 266.A ND1 PHE 268.A H 2.910 2.050 PHE 269.A N HIS 266.A O PHE 269.A H 2.879 2.060 GLU 270.A N PRO 267.A O GLU 270.A H 3.125 2.299 VAL 272.A N PHE 269.A O VAL 272.A H 2.901 2.043 GLN 279.A N ASN 276.A O GLN 279.A H 2.898 2.065 GLN 280.A N LEU 277.A O GLN 280.A H 3.091 2.284 GLN 280.A NE2 THR 273.A O GLN 280.A HE22 2.938 2.158 GLN 280.A NE2 GLU 275.A O.B GLN 280.A HE21 3.645 2.998