Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5m1y_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N THR 40.A OG1 LYS 1.A H3 2.894 2.006 LYS 1.A NZ GLU 7.A OE2 LYS 1.A HZ1 2.571 1.744 PHE 3.A N PHE 38.A O PHE 3.A H 2.781 1.937 GLY 4.A N GLU 7.A OE1 GLY 4.A H 2.851 2.015 ARG 5.A NH1 TRP 123.A O ARG 5.A HH11 2.974 2.164 ARG 5.A NH1 ARG 125.A O ARG 5.A HH12 2.804 1.994 ARG 5.A NH2 ARG 125.A O ARG 5.A HH22 3.093 2.383 CYS 6.A SG ARG 125.A O no hydrogen 3.659 N/A LEU 8.A N GLY 4.A O LEU 8.A H 3.029 2.202 ALA 9.A N ARG 5.A O ALA 9.A H 3.218 2.421 ALA 10.A N CYS 6.A O ALA 10.A H 2.910 2.119 ALA 11.A N GLU 7.A O ALA 11.A H 3.284 2.457 MET 12.A N LEU 8.A O MET 12.A H 2.849 2.021 LYS 13.A N ALA 9.A O LYS 13.A H 2.870 2.047 LYS 13.A NZ LEU 129.A O LYS 13.A HZ3 3.325 2.628 ARG 14.A N ALA 10.A O ARG 14.A H 3.037 2.212 HIS 15.A N ALA 11.A O HIS 15.A H 3.184 2.350 GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 2.764 2.004 LEU 17.A N MET 12.A O LEU 17.A H 2.916 2.065 TYR 20.A N LEU 17.A O TYR 20.A H 3.219 2.363 GLY 22.A N ASN 19.A O GLY 22.A H 3.032 2.231 TYR 23.A N TYR 20.A O TYR 23.A H 3.081 2.275 LEU 25.A N ASP 18.A OD1 LEU 25.A H 2.762 1.958 ASN 27.A N SER 24.A O ASN 27.A H 2.835 2.120 ASN 27.A ND2 SER 24.A O ASN 27.A HD22 3.401 2.630 TRP 28.A N LEU 25.A O TRP 28.A H 2.922 2.311 VAL 29.A N LEU 25.A O VAL 29.A H 3.022 2.231 CYS 30.A N GLY 26.A O CYS 30.A H 2.887 2.034 CYS 30.A SG ARG 114.A O no hydrogen 3.690 N/A ALA 31.A N ASN 27.A O ALA 31.A H 2.907 2.111 ALA 32.A N TRP 28.A O ALA 32.A H 3.136 2.297 LYS 33.A N VAL 29.A O LYS 33.A H 2.999 2.207 LYS 33.A NZ ASN 37.A OD1 LYS 33.A HZ2 3.091 2.241 PHE 34.A N CYS 30.A O PHE 34.A H 3.226 2.460 GLU 35.A N ALA 31.A O GLU 35.A H 2.844 2.104 SER 36.A N ALA 32.A O SER 36.A H 2.962 2.120 SER 36.A OG ALA 32.A O SER 36.A HG 3.132 2.362 ASN 37.A N LYS 33.A O ASN 37.A H 2.949 2.310 ASN 39.A N SER 36.A O ASN 39.A H 3.131 2.302 THR 40.A N LYS 1.A O THR 40.A H 2.899 2.050 THR 40.A OG1 LEU 84.A O THR 40.A HG1 3.404 2.834 GLN 41.A N ASN 39.A OD1 GLN 41.A H 3.136 2.289 ALA 42.A N ASN 39.A O ALA 42.A H 3.184 2.332 ASN 44.A N ASP 52.A O ASN 44.A H 3.106 2.294 ASN 44.A ND2 GLN 57.A OE1 ASN 44.A HD22 2.667 1.818 ASN 46.A N SER 50.A O ASN 46.A H 2.911 2.071 ASN 46.A ND2 ASP 48.A OD2 ASN 46.A HD22 2.726 2.046 ASN 46.A ND2 SER 50.A OG ASN 46.A HD21 2.803 2.148 THR 51.A N SER 60.A OG THR 51.A H 3.261 2.410 ASP 52.A N ASN 44.A O ASP 52.A H 2.743 1.897 TYR 53.A N ILE 58.A O TYR 53.A H 2.709 1.937 TYR 53.A OH ASP 66.A OD2 TYR 53.A HH 2.980 2.175 GLY 54.A N ALA 42.A O GLY 54.A H 2.909 2.093 GLN 57.A N GLY 54.A O GLN 57.A H 3.100 2.276 GLN 57.A NE2 ALA 42.A O GLN 57.A HE22 3.256 2.621 GLN 57.A NE2 GLY 54.A O GLN 57.A HE21 2.914 2.066 ILE 58.A N TYR 53.A O ILE 58.A H 2.804 2.050 ASN 59.A ND2 SER 50.A OG ASN 59.A HD21 3.088 2.276 ASN 59.A ND2 ASP 52.A OD1 ASN 59.A HD22 2.643 1.811 SER 60.A N THR 51.A O SER 60.A H 3.192 2.537 ARG 61.A N ASN 59.A OD1 ARG 61.A H 2.668 1.842 TRP 63.A N ASN 59.A O TRP 63.A H 3.342 2.522 ARG 68.A N ASP 66.A OD1 ARG 68.A H 2.822 1.993 THR 69.A OG1 ASP 66.A OD1 THR 69.A HG1 3.105 2.332 THR 69.A OG1 ASP 66.A OD2 THR 69.A HG1 3.129 2.508 SER 72.A OG SER 60.A O SER 72.A HG 2.777 2.152 ASN 74.A ND2 ILE 78.A O ASN 74.A HD21 3.626 3.120 LEU 75.A N TRP 62.A O LEU 75.A H 2.625 1.830 CYS 76.A N TRP 63.A O CYS 76.A H 2.916 2.097 CYS 76.A SG CYS 94.A O no hydrogen 3.934 N/A ASN 77.A N ASN 74.A O ASN 77.A H 3.192 2.372 ILE 78.A N ASN 74.A OD1 ILE 78.A H 3.036 2.224 CYS 80.A N ASN 65.A O CYS 80.A H 3.074 2.263 ALA 82.A N PRO 79.A O ALA 82.A H 3.009 2.220 LEU 83.A N CYS 80.A O LEU 83.A H 3.190 2.400 LEU 84.A N SER 81.A O LEU 84.A H 2.982 2.149 SER 85.A OG ASP 87.A O SER 85.A HG 2.468 1.795 THR 89.A N ASP 87.A OD1 THR 89.A H 3.176 2.347 THR 89.A OG1 ASP 87.A OD1 THR 89.A HG1 2.601 1.799 VAL 92.A N ILE 88.A O VAL 92.A H 2.910 2.069 ASN 93.A N THR 89.A O ASN 93.A H 3.020 2.171 CYS 94.A N ALA 90.A O CYS 94.A H 3.283 2.439 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 2.770 1.979 LYS 96.A N VAL 92.A O LYS 96.A H 2.973 2.215 LYS 96.A NZ HIS 15.A O LYS 96.A HZ1 2.778 1.941 ILE 98.A N CYS 94.A O ILE 98.A H 3.032 2.225 VAL 99.A N ALA 95.A O VAL 99.A H 2.912 2.084 SER 100.A N LYS 97.A O SER 100.A H 3.201 2.483 SER 100.A OG LYS 96.A O SER 100.A HG 2.951 2.273 ASP 101.A N ILE 98.A O ASP 101.A H 3.107 2.299 ASN 106.A N ASN 103.A O ASN 106.A H 3.297 2.509 ASN 106.A ND2 ASN 103.A O ASN 106.A HD22 2.885 2.286 TRP 108.A N MET 105.A O TRP 108.A H 2.965 2.138 TRP 108.A NE1 LEU 56.A O TRP 108.A HE1 2.796 2.137 ALA 110.A N GLU 35.A OE2 ALA 110.A H 3.271 2.520 TRP 111.A NE1 ASN 27.A OD1 TRP 111.A HE1 3.054 2.286 ARG 112.A N TRP 108.A O ARG 112.A H 3.075 2.284 ASN 113.A N VAL 109.A O ASN 113.A H 3.061 2.279 ARG 114.A N ALA 110.A O ARG 114.A H 2.947 2.209 CYS 115.A N TRP 111.A O CYS 115.A H 2.860 2.120 LYS 116.A N TRP 111.A O LYS 116.A H 2.765 1.968 LYS 116.A NZ ASN 106.A OD1 LYS 116.A HZ2 2.919 2.033 THR 118.A N CYS 115.A O THR 118.A H 3.132 2.326 THR 118.A OG1 CYS 115.A O THR 118.A HG1 2.494 1.674 ALA 122.A N ASP 119.A O ALA 122.A H 3.116 2.256 TRP 123.A N VAL 120.A O TRP 123.A H 2.841 1.992 ILE 124.A N GLN 121.A O ILE 124.A H 3.307 2.461 ARG 125.A N ALA 122.A O ARG 125.A H 3.292 2.458 CYS 127.A SG ARG 125.A O no hydrogen 3.552 N/A