Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5ma9_B.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 5.A N LYS 2.A O GLU 5.A H 3.115 2.354 LEU 6.A N GLY 3.A O LEU 6.A H 3.195 2.400 PHE 7.A N GLU 4.A O PHE 7.A H 3.153 2.313 THR 8.A OG1 GLU 5.A O no hydrogen 3.316 N/A VAL 11.A N GLY 34.A O VAL 11.A H 2.935 2.114 ILE 13.A N GLY 32.A O ILE 13.A H 2.913 2.086 LEU 14.A N LEU 115.A O LEU 14.A H 2.967 2.154 VAL 15.A N GLY 30.A O VAL 15.A H 2.871 2.036 GLU 16.A N ASN 117.A O GLU 16.A H 2.905 2.076 LEU 17.A N VAL 28.A O LEU 17.A H 2.808 1.964 ASP 18.A N ILE 119.A O ASP 18.A H 2.855 2.004 GLY 19.A N PHE 26.A O GLY 19.A H 2.872 2.029 ASP 20.A N LEU 121.A O ASP 20.A H 3.040 2.363 VAL 21.A N HIS 24.A O VAL 21.A H 3.021 2.209 ASN 22.A N GLY 123.A O ASN 22.A H 2.903 2.067 ASN 22.A ND2 PHE 126.A O ASN 22.A HD21 2.963 2.235 GLY 23.A N ASP 20.A OD1 GLY 23.A H 2.967 2.260 HIS 24.A N VAL 21.A O HIS 24.A H 2.917 2.075 LYS 25.A NZ ASP 20.A OD2 LYS 25.A HZ2 2.997 2.229 PHE 26.A N GLY 19.A O PHE 26.A H 2.955 2.136 SER 27.A N THR 49.A OG1 SER 27.A H 3.034 2.226 VAL 28.A N LEU 17.A O VAL 28.A H 2.912 2.076 SER 29.A N ILE 46.A O SER 29.A H 2.998 2.199 GLY 30.A N VAL 15.A O GLY 30.A H 2.784 1.994 GLU 31.A N LYS 44.A O GLU 31.A H 3.086 2.299 GLY 32.A N ILE 13.A O GLY 32.A H 3.296 2.568 GLU 33.A N THR 42.A O GLU 33.A H 3.067 2.278 GLY 34.A N VAL 11.A O GLY 34.A H 2.981 2.174 ASP 35.A N LYS 40.A O ASP 35.A H 2.852 2.036 THR 37.A N ASP 35.A OD1 THR 37.A H 3.187 2.401 THR 37.A OG1 THR 8.A O no hydrogen 3.209 N/A THR 37.A OG1 ASP 35.A OD1 no hydrogen 3.233 N/A TYR 38.A N ASP 35.A O TYR 38.A H 3.062 2.276 GLY 39.A N ALA 36.A O GLY 39.A H 3.307 2.555 LYS 40.A N ASP 35.A O LYS 40.A H 3.074 2.238 LEU 41.A N GLU 218.A O LEU 41.A H 2.820 1.991 THR 42.A N GLU 33.A O THR 42.A H 2.999 2.144 THR 42.A OG1 GLU 33.A O no hydrogen 3.406 N/A LEU 43.A N LEU 216.A O LEU 43.A H 2.993 2.156 LYS 44.A N GLU 31.A O LYS 44.A H 3.058 2.258 LYS 44.A NZ ASP 206.A OD2 LYS 44.A HZ3 2.757 1.905 LYS 44.A NZ GLU 209.A OE1 LYS 44.A HZ1 2.895 2.071 PHE 45.A N MET 214.A O PHE 45.A H 2.765 1.929 ILE 46.A N SER 29.A O ILE 46.A H 2.828 2.001 CYS 47.A N ASP 212.A O CYS 47.A H 2.918 2.091 CYS 47.A SG SER 27.A O no hydrogen 3.708 N/A CYS 47.A SG THR 49.A OG1 no hydrogen 3.442 N/A CYS 47.A SG GLY 50.A O no hydrogen 3.177 N/A THR 48.A N SER 27.A O THR 48.A H 2.916 2.196 THR 48.A OG1 SER 27.A O no hydrogen 3.263 N/A LYS 51.A NZ ASP 212.A OD2 LYS 51.A HZ3 3.108 2.448 LEU 52.A N ASP 212.A OD2 LEU 52.A H 2.853 1.999 TRP 56.A NE1 ASP 212.A OD1 TRP 56.A HE1 2.929 2.078 THR 58.A N PRO 55.A O THR 58.A H 2.981 2.216 THR 58.A OG1 PRO 55.A O no hydrogen 2.671 N/A THR 58.A OG1 TYR 102.A OH no hydrogen 2.876 N/A LEU 59.A N TRP 56.A O LEU 59.A H 2.968 2.133 VAL 60.A N PRO 57.A O VAL 60.A H 3.347 2.497 LEU 63.A N LEU 59.A O LEU 63.A H 2.971 2.140 PHE 67.A N VAL 64.A O PHE 67.A H 2.968 2.126 SER 68.A N GLN 65.A O SER 68.A H 3.077 2.226 SER 68.A OG GLN 65.A O no hydrogen 2.776 N/A ARG 69.A N VAL 220.A O ARG 69.A H 2.911 2.055 ARG 69.A NE THR 221.A OG1 ARG 69.A HE 3.219 2.400 ARG 69.A NH2 THR 221.A OG1 ARG 69.A HH21 3.352 2.587 MET 74.A N PRO 71.A O MET 74.A H 2.794 1.960 LYS 75.A N ASP 72.A O LYS 75.A H 3.315 2.476 LYS 75.A NZ ASP 72.A OD1 LYS 75.A HZ2 3.557 2.800 HIS 77.A N MET 74.A O HIS 77.A H 2.920 2.084 LYS 81.A N ASP 78.A OD1 LYS 81.A H 3.209 2.365 LYS 81.A NZ SER 68.A O LYS 81.A HZ2 2.946 2.134 LYS 81.A NZ ASP 78.A OD2 LYS 81.A HZ3 2.694 2.028 SER 82.A OG PHE 79.A O no hydrogen 2.685 N/A ALA 83.A N PHE 79.A O ALA 83.A H 3.235 2.598 MET 84.A N LYS 81.A O MET 84.A H 3.057 2.216 GLY 87.A N ALA 83.A O GLY 87.A H 2.734 1.949 TYR 88.A N VAL 108.A O TYR 88.A H 2.926 2.158 VAL 89.A N THR 182.A O VAL 89.A H 2.755 1.935 GLN 90.A N ALA 106.A O GLN 90.A H 2.799 1.981 GLU 91.A N GLN 180.A O GLU 91.A H 2.865 2.016 ARG 92.A N THR 104.A O ARG 92.A H 3.044 2.232 ARG 92.A NE GLN 179.A OE1 ARG 92.A HE 2.861 2.154 ARG 92.A NH1 THR 61.A O ARG 92.A HH12 2.787 1.988 ARG 92.A NH2 GLN 179.A OE1 ARG 92.A HH21 2.854 2.167 THR 93.A N TYR 178.A O THR 93.A H 2.960 2.188 ILE 94.A N TYR 102.A O ILE 94.A H 2.759 1.920 PHE 95.A N ASP 176.A O PHE 95.A H 2.886 2.053 PHE 96.A N GLY 100.A O PHE 96.A H 3.050 2.254 LYS 97.A N LEU 174.A O LYS 97.A H 3.040 2.213 ASP 99.A N PHE 96.A O ASP 99.A H 2.927 2.215 GLY 100.A N ASP 99.A OD1 GLY 100.A H 2.784 2.134 ASN 101.A N ILE 124.A O ASN 101.A H 3.163 2.365 TYR 102.A N ILE 94.A O TYR 102.A H 2.959 2.199 TYR 102.A OH THR 58.A OG1 no hydrogen 2.876 N/A LYS 103.A N LYS 122.A O LYS 103.A H 2.834 2.002 LYS 103.A NZ ASN 101.A OD1 LYS 103.A HZ1 2.762 2.017 THR 104.A N ARG 92.A O THR 104.A H 2.883 2.057 ARG 105.A N GLU 120.A O ARG 105.A H 3.003 2.194 ARG 105.A NH1 GLU 107.A OE2 ARG 105.A HH12 3.444 2.641 ARG 105.A NH2 GLU 107.A OE2 ARG 105.A HH22 3.540 2.765 ALA 106.A N GLN 90.A O ALA 106.A H 2.804 2.003 GLU 107.A N ARG 118.A O GLU 107.A H 2.986 2.201 VAL 108.A N TYR 88.A O VAL 108.A H 2.927 2.074 LYS 109.A N VAL 116.A O LYS 109.A H 3.060 2.256 LYS 109.A NZ GLU 107.A OE1 LYS 109.A HZ3 2.816 2.018 PHE 110.A N PRO 85.A O PHE 110.A H 3.174 2.331 GLU 111.A N THR 114.A O GLU 111.A H 2.903 2.063 THR 114.A N GLU 111.A O THR 114.A H.B 3.401 2.574 THR 114.A OG1 ASP 113.A OD1.A no hydrogen 3.180 N/A LEU 115.A N PRO 12.A O LEU 115.A H 2.911 2.118 VAL 116.A N LYS 109.A O VAL 116.A H 2.846 1.988 ASN 117.A N LEU 14.A O ASN 117.A H 2.896 2.072 ASN 117.A ND2 THR 62.A O ASN 117.A HD21 3.345 2.559 ASN 117.A ND2 LEU 63.A O ASN 117.A HD22 2.944 2.235 ARG 118.A N GLU 107.A O ARG 118.A H 2.980 2.137 ARG 118.A NH1 GLU 16.A OE2 ARG 118.A HH11 3.032 2.222 ARG 118.A NH2 GLU 111.A OE1 ARG 118.A HH22 3.187 2.356 ILE 119.A N GLU 16.A O ILE 119.A H 2.731 1.895 GLU 120.A N ARG 105.A O GLU 120.A H 2.904 2.057 LEU 121.A N ASP 18.A O LEU 121.A H 2.810 1.980 LYS 122.A N LYS 103.A O LYS 122.A H 2.887 2.045 GLY 123.A N ASP 20.A O GLY 123.A H 2.695 1.850 ILE 124.A N ASN 101.A O ILE 124.A H 3.103 2.315 PHE 126.A N ASN 22.A OD1 PHE 126.A H 3.190 2.341 LYS 127.A N ASP 99.A OD1 LYS 127.A H 2.832 2.018 LYS 127.A NZ ASP 98.A O LYS 127.A HZ1 2.886 2.134 GLU 128.A N GLU 128.A OE2 GLU 128.A H 2.732 2.001 ASP 129.A N ASP 129.A OD1 ASP 129.A H 2.700 2.055 GLY 130.A N LYS 127.A O GLY 130.A H 2.972 2.128 ASN 131.A ND2 GLN 173.A OE1 ASN 131.A HD22 3.049 2.238 GLY 134.A N GLY 130.A O GLY 134.A H 2.888 2.213 HIS 135.A N ILE 132.A O HIS 135.A H 3.003 2.177 LYS 136.A N ASN 131.A O LYS 136.A H 2.924 2.076 GLU 138.A N ASN 166.A O GLU 138.A H 2.923 2.084 TYR 139.A OH SER 204.A O no hydrogen 2.673 N/A ASN 140.A ND2 GLU 138.A OE1 ASN 140.A HD21 3.029 2.190 ASN 142.A ND2 ARG 164.A O ASN 142.A HD22 2.806 1.968 ASN 142.A ND2 ASN 166.A OD1 ASN 142.A HD21 2.999 2.146 SER 143.A OG THR 199.A O no hydrogen 2.607 N/A HIS 144.A N THR 199.A OG1 HIS 144.A H 2.975 2.193 VAL 146.A N LEU 197.A O VAL 146.A H 2.827 1.988 TYR 147.A N ASN 160.A O TYR 147.A H 3.025 2.188 ILE 148.A N HIS 195.A O ILE 148.A H 2.910 2.051 MET 149.A N LYS 158.A O MET 149.A H 2.930 2.121 ASP 151.A N GLY 156.A O ASP 151.A H 2.748 1.898 GLN 153.A N GLN 153.A OE1 GLN 153.A H 2.824 2.017 LYS 154.A N ASP 151.A O LYS 154.A H 3.101 2.342 ASN 155.A N LYS 152.A O ASN 155.A H 2.888 2.071 GLY 156.A N ASP 151.A O GLY 156.A H 3.050 2.203 ILE 157.A N ASN 181.A O ILE 157.A H 3.057 2.256 LYS 158.A N MET 149.A O LYS 158.A H 2.831 2.062 VAL 159.A N GLN 179.A O VAL 159.A H 2.900 2.070 ASN 160.A N TYR 147.A O ASN 160.A H 3.046 2.234 PHE 161.A N HIS 177.A O PHE 161.A H 3.418 2.604 ILE 163.A N ALA 175.A O ILE 163.A H 2.953 2.108 ARG 164.A N HIS 144.A NE2 ARG 164.A H 3.040 2.200 ARG 164.A NH1 SER 143.A O ARG 164.A HH12 3.015 2.293 ARG 164.A NH2 SER 143.A O ARG 164.A HH22 3.054 2.343 HIS 165.A N GLN 173.A O HIS 165.A H 2.872 2.018 ILE 167.A N SER 171.A O ILE 167.A H 2.859 2.013 GLU 168.A N LYS 136.A O GLU 168.A H 2.957 2.211 GLY 170.A N ILE 167.A O GLY 170.A H 3.002 2.178 SER 171.A N ASP 169.A OD1 SER 171.A H 3.042 2.200 SER 171.A OG ASP 169.A OD1 no hydrogen 2.639 N/A GLN 173.A N HIS 165.A O GLN 173.A H 2.829 1.979 GLN 173.A NE2 LYS 97.A O GLN 173.A HE21 2.967 2.121 GLN 173.A NE2 LEU 174.A O GLN 173.A HE22 2.941 2.093 ALA 175.A N ILE 163.A O ALA 175.A H 2.843 2.028 ASP 176.A N PHE 95.A O ASP 176.A H 2.811 2.007 HIS 177.A N PHE 161.A O HIS 177.A H 2.833 1.999 HIS 177.A ND1 ALA 175.A O HIS 177.A HD1 2.887 2.085 HIS 177.A NE2 THR 61.A OG1 no hydrogen 2.710 N/A TYR 178.A N THR 93.A O TYR 178.A H 2.952 2.098 TYR 178.A OH ASP 176.A OD2 no hydrogen 3.001 N/A GLN 179.A N VAL 159.A O GLN 179.A H 2.899 2.179 GLN 179.A NE2 GLN 65.A OE1 GLN 179.A HE21 2.853 2.016 GLN 179.A NE2 ASN 181.A OD1 GLN 179.A HE22 2.956 2.114 GLN 180.A N GLU 91.A O GLN 180.A H 2.892 2.073 ASN 181.A N ILE 157.A O ASN 181.A H 3.012 2.171 ASN 181.A ND2 GLN 90.A OE1 ASN 181.A HD21 2.840 2.011 THR 182.A N VAL 89.A O THR 182.A H 3.036 2.249 ILE 184.A N GLY 87.A O ILE 184.A H 2.960 2.101 LEU 190.A N SER 82.A OG LEU 190.A H 2.904 2.060 ASP 193.A N HIS 77.A ND1 ASP 193.A H 3.010 2.193 HIS 195.A N ILE 148.A O HIS 195.A H 3.158 2.349 HIS 195.A ND1 ASP 193.A O HIS 195.A HD1 2.870 2.012 HIS 195.A NE2 TYR 70.A OH HIS 195.A HE2 2.782 1.936 TYR 196.A N ALA 223.A O TYR 196.A H 3.189 2.331 LEU 197.A N VAL 146.A O LEU 197.A H 2.767 1.972 SER 198.A N THR 221.A O SER 198.A H 2.865 2.043 THR 199.A N HIS 144.A O THR 199.A H 3.037 2.299 THR 199.A OG1 HIS 144.A O no hydrogen 3.343 N/A GLN 200.A N PHE 219.A O GLN 200.A H 2.841 2.061 ALA 202.A N LEU 217.A O ALA 202.A H 2.816 2.028 SER 204.A N VAL 215.A O SER 204.A H 2.900 2.128 LYS 205.A NZ TYR 139.A OH LYS 205.A HZ3 3.563 2.856 ASP 206.A N HIS 213.A NE2 ASP 206.A H 2.834 2.067 ASN 208.A N ASP 206.A OD1 ASN 208.A H 2.966 2.122 GLU 209.A N ASP 206.A O GLU 209.A H 3.068 2.215 ARG 211.A N GLU 209.A OE2 ARG 211.A H 3.133 2.293 ARG 211.A NE GLU 209.A OE2 ARG 211.A HE 3.538 2.735 HIS 213.A ND1 ARG 211.A O HIS 213.A HD1 2.780 1.984 MET 214.A N PHE 45.A O MET 214.A H 2.859 2.063 VAL 215.A N SER 204.A O VAL 215.A H 2.985 2.140 LEU 216.A N LEU 43.A O LEU 216.A H 2.892 2.038 LEU 217.A N ALA 202.A O LEU 217.A H 3.022 2.180 GLU 218.A N LEU 41.A O GLU 218.A H 3.067 2.273 PHE 219.A N GLN 200.A O PHE 219.A H 2.885 2.051 VAL 220.A N GLY 39.A O VAL 220.A H 2.880 2.087 THR 221.A N SER 198.A O THR 221.A H 3.127 2.306 THR 221.A OG1 ARG 69.A O no hydrogen 3.371 N/A THR 221.A OG1 ALA 222.A O no hydrogen 3.271 N/A ALA 222.A N ARG 69.A O ALA 222.A H 2.699 1.842 ALA 223.A N TYR 196.A O ALA 223.A H 2.890 2.073