Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5mrd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 2.A NZ GLU 26.A OE2 LYS 2.A HZ2 2.885 1.996 ARG 3.A N ASP 6.A OD2 ARG 3.A H 2.758 2.020 GLU 5.A N GLU 5.A OE1.A GLU 5.A H.A 2.699 1.907 GLU 5.A N GLU 5.A OE1.B GLU 5.A H.A 2.871 2.107 ASP 6.A N ARG 3.A O ASP 6.A H 2.856 2.025 PHE 7.A N PRO 4.A O PHE 7.A H 3.054 2.248 LYS 8.A N ARG 25.A O LYS 8.A H 2.816 2.003 GLY 10.A N LEU 23.A O GLY 10.A H 2.694 1.835 LEU 13.A N VAL 21.A O LEU 13.A H 2.676 1.851 GLY 14.A N VAL 21.A O GLY 14.A H 3.348 2.598 GLY 16.A N SER 19.A O GLY 16.A H 2.687 1.836 THR 20.A N ILE 37.A O THR 20.A H 2.924 2.146 VAL 21.A N GLY 14.A O VAL 21.A H 2.863 2.015 VAL 22.A N ILE 35.A O VAL 22.A H.A 2.906 2.078 LEU 23.A N LYS 11.A O LEU 23.A H 2.892 2.049 ALA 24.A N TYR 33.A O ALA 24.A H 2.854 2.066 ARG 25.A N LYS 8.A O ARG 25.A H.B 2.908 2.076 ARG 25.A NH1.B SER 30.A O ARG 25.A HH11.B 2.812 2.183 GLU 26.A N ARG 31.A O GLU 26.A H 2.856 2.030 LEU 27.A N ASP 6.A O LEU 27.A H 2.920 2.072 THR 29.A N GLU 26.A O THR 29.A H 3.312 2.501 SER 30.A N GLU 26.A O SER 30.A H 2.736 1.975 ARG 31.A N THR 29.A OG1 ARG 31.A H 3.105 2.252 TYR 33.A N ALA 24.A O TYR 33.A H 2.892 2.063 ALA 34.A N LEU 84.A O ALA 34.A H 2.954 2.203 ILE 35.A N VAL 22.A O ILE 35.A H 2.839 2.002 LYS 36.A N PHE 82.A O LYS 36.A H 2.911 2.119 LYS 36.A NZ GLU 55.A OE1 LYS 36.A HZ3 2.667 1.825 ILE 37.A N THR 20.A O ILE 37.A H 2.761 1.937 VAL 38.A N LEU 80.A O VAL 38.A H 2.835 2.005 LYS 40.A N GLU 78.A O LYS 40.A H 2.864 2.020 LYS 40.A NZ GLN 75.A OE1 LYS 40.A HZ1 2.511 1.636 LYS 40.A NZ ASP 76.A O LYS 40.A HZ2 2.812 1.936 VAL 43.A N GLU 39.A O VAL 43.A H 3.306 2.452 ASN 44.A N LYS 40.A O ASN 44.A H 2.927 2.096 LYS 45.A N ARG 41.A O LYS 45.A H 2.765 1.945 ASN 47.A N ASN 44.A O ASN 47.A H 3.132 2.283 LYS 48.A N VAL 43.A O LYS 48.A H 2.902 2.090 TYR 51.A N LYS 48.A O TYR 51.A H 2.961 2.339 VAL 52.A N LYS 48.A O VAL 52.A H 3.385 2.575 GLN 53.A N ILE 49.A O GLN 53.A H 2.898 2.052 ARG 54.A N PRO 50.A O ARG 54.A H 2.875 2.086 ARG 54.A NH1 ALA 152.A O ARG 54.A HH11 2.875 2.036 GLU 55.A N TYR 51.A O GLU 55.A H 3.005 2.172 LYS 56.A N VAL 52.A O LYS 56.A H 3.137 2.302 ASP 57.A N GLN 53.A O ASP 57.A H 2.926 2.077 VAL 58.A N ARG 54.A O VAL 58.A H 2.915 2.062 MET 59.A N GLU 55.A O MET 59.A H 2.942 2.089 SER 60.A N LYS 56.A O SER 60.A H.A 2.970 2.179 SER 60.A OG.A LYS 56.A O SER 60.A HG.A 2.848 2.105 SER 60.A OG.B LYS 56.A O SER 60.A HG.B 3.516 3.049 SER 60.A OG.B ASP 57.A O SER 60.A HG.B 2.743 1.935 ARG 61.A N VAL 58.A O ARG 61.A H 2.976 2.169 ARG 61.A NE ASP 57.A OD2 ARG 61.A HE 2.935 2.140 ARG 61.A NH2 ASP 57.A OD2 ARG 61.A HH21 3.138 2.423 LEU 62.A N MET 59.A O LEU 62.A H 3.126 2.271 ASP 63.A N TYR 120.A OH ASP 63.A H 2.804 2.022 PHE 66.A N HIS 64.A ND1 PHE 66.A H 3.005 2.148 PHE 67.A N HIS 64.A O PHE 67.A H 3.189 2.376 VAL 68.A N ILE 146.A O VAL 68.A H.A 2.965 2.114 LYS 69.A N SER 85.A OG.B LYS 69.A H 2.851 1.993 TYR 71.A N GLY 83.A O TYR 71.A H 2.787 1.960 PHE 74.A N TYR 81.A O PHE 74.A H 3.042 2.245 ASP 76.A N LYS 79.A O ASP 76.A H 2.883 2.077 GLU 78.A N ASP 76.A OD1 GLU 78.A H 2.891 2.161 LYS 79.A N ASP 76.A OD1 LYS 79.A H 2.849 2.166 LEU 80.A N VAL 38.A O LEU 80.A H 2.853 2.026 TYR 81.A N PHE 74.A O TYR 81.A H 2.820 2.001 TYR 81.A OH ASP 76.A OD2 TYR 81.A HH 2.902 2.098 PHE 82.A N LYS 36.A O PHE 82.A H 2.881 2.090 GLY 83.A N PHE 72.A O GLY 83.A H 2.820 1.978 LEU 84.A N ALA 34.A O LEU 84.A H 2.816 2.013 SER 85.A N LYS 69.A O SER 85.A H.B 3.034 2.311 SER 85.A OG.A GLN 145.A OE1.A SER 85.A HG.A 3.550 2.895 ASN 89.A N LEU 138.A O ASN 89.A H 2.888 2.136 ASN 89.A ND2 ASN 139.A O ASN 89.A HD22 2.966 2.133 GLY 90.A N ALA 87.A O GLY 90.A H 3.185 2.350 LEU 92.A N ILE 136.A O LEU 92.A H 2.825 1.996 LYS 94.A N GLU 91.A O LYS 94.A H 3.043 2.323 LYS 94.A NZ ASN 89.A O LYS 94.A HZ1 3.108 2.520 LYS 94.A NZ TYR 95.A OH LYS 94.A HZ1 3.563 2.850 TYR 95.A N LEU 92.A O TYR 95.A H 2.961 2.300 TYR 95.A OH ASN 89.A O TYR 95.A HH 3.137 2.322 ILE 96.A N LEU 92.A O ILE 96.A H 3.172 2.369 ARG 97.A N LEU 93.A O ARG 97.A H 2.989 2.150 LYS 98.A N LYS 94.A O LYS 98.A H 3.011 2.230 ILE 99.A N TYR 95.A O ILE 99.A H.B 3.049 2.197 GLY 100.A N ILE 96.A O GLY 100.A H 2.692 1.934 PHE 102.A N.A LEU 199.A O PHE 102.A H.A 2.806 1.960 PHE 102.A N.B LEU 199.A O PHE 102.A H.B 2.813 1.986 CYS 106.A N ASP 103.A OD1 CYS 106.A H 2.796 1.943 THR 107.A N ASP 103.A O THR 107.A H 2.843 1.992 THR 107.A OG1 PHE 102.A O THR 107.A HG1 3.409 2.916 THR 107.A OG1 ASP 103.A O THR 107.A HG1 2.883 2.148 ARG 108.A N GLU 104.A O ARG 108.A H 2.823 1.990 ARG 108.A NH1 GLU 104.A OE2 ARG 108.A HH12 3.128 2.371 ARG 108.A NH2 GLU 104.A OE2 ARG 108.A HH22 3.047 2.263 ARG 108.A NH2 PHE 265.A O ARG 108.A HH21 2.931 2.133 PHE 109.A N THR 105.A O PHE 109.A H 2.963 2.144 TYR 110.A N CYS 106.A O TYR 110.A H 3.038 2.180 TYR 110.A OH MET 142.A O TYR 110.A HH 2.632 1.812 THR 111.A N THR 107.A O THR 111.A H 2.911 2.070 THR 111.A OG1 THR 107.A O THR 111.A HG1 2.771 2.106 ALA 112.A N ARG 108.A O ALA 112.A H 2.864 2.047 GLU 113.A N PHE 109.A O GLU 113.A H 2.988 2.173 ILE 114.A N TYR 110.A O ILE 114.A H 2.982 2.154 VAL 115.A N THR 111.A O VAL 115.A H 2.846 2.011 SER 116.A N ALA 112.A O SER 116.A H.B 2.858 2.020 SER 116.A OG.A ALA 112.A O SER 116.A HG.A 3.033 2.263 ALA 117.A N GLU 113.A O ALA 117.A H 2.927 2.121 LEU 118.A N ILE 114.A O LEU 118.A H 2.876 2.047 GLU 119.A N VAL 115.A O GLU 119.A H 2.875 2.037 TYR 120.A N SER 116.A O TYR 120.A H 3.203 2.390 LEU 121.A N ALA 117.A O LEU 121.A H 2.909 2.074 HIS 122.A N LEU 118.A O HIS 122.A H 2.777 1.918 HIS 122.A NE2 ASP 188.A OD2 HIS 122.A HE2 2.858 1.999 GLY 123.A N GLU 119.A O GLY 123.A H 2.966 2.186 LYS 124.A N TYR 120.A O LYS 124.A H 3.138 2.459 LYS 124.A N LEU 121.A O LYS 124.A H 3.056 2.375 GLY 125.A N HIS 122.A O GLY 125.A H 2.895 2.054 ILE 126.A N LEU 121.A O ILE 126.A H 3.188 2.360 ILE 127.A N LYS 153.A O ILE 127.A H 2.942 2.135 HIS 128.A N ASP 188.A OD2 HIS 128.A H 2.875 2.046 HIS 128.A NE2 THR 147.A O HIS 128.A HE2 2.907 2.064 ARG 129.A N ASP 188.A OD1 ARG 129.A H 2.876 2.021 ARG 129.A NE THR 151.A O ARG 129.A HE 2.807 2.040 ARG 129.A NH2 THR 151.A O ARG 129.A HH21 2.954 2.243 ASP 130.A N HIS 128.A ND1 ASP 130.A H 3.035 2.221 LYS 132.A NZ THR 169.A OG1 LYS 132.A HZ3 2.755 1.874 GLU 134.A N GLU 134.A OE1.A GLU 134.A H.A 2.801 2.005 ASN 135.A N LYS 132.A O ASN 135.A H 2.844 2.036 ASN 135.A ND2 ASP 130.A O ASN 135.A HD22 2.838 2.039 ASN 135.A ND2 ASP 148.A OD2 ASN 135.A HD21 3.027 2.409 ILE 136.A N PRO 133.A O ILE 136.A H 3.292 2.441 LEU 137.A N GLN 145.A O LEU 137.A H 2.894 2.087 LEU 138.A N GLY 90.A O LEU 138.A H 2.749 2.048 ASN 139.A N HIS 143.A O ASN 139.A H 2.916 2.081 ASP 141.A N ASN 139.A OD1 ASP 141.A H 2.940 2.317 MET 142.A N ASN 139.A O MET 142.A H 2.865 2.027 HIS 143.A N ASN 139.A OD1 HIS 143.A H 3.044 2.269 HIS 143.A ND1 GLU 113.A OE2 HIS 143.A HD1 2.646 1.814 ILE 144.A N GLU 113.A OE1 ILE 144.A H 3.016 2.175 GLN 145.A N LEU 137.A O GLN 145.A H.A 2.747 1.989 GLN 145.A NE2.A PRO 65.A O GLN 145.A HE22.A 2.599 2.063 GLN 145.A NE2.A ILE 144.A O GLN 145.A HE21.A 2.976 2.126 ILE 146.A N PHE 66.A O ILE 146.A H 2.847 2.002 THR 147.A N ASN 135.A O THR 147.A H 2.964 2.134 ALA 152.A N PHE 149.A O ALA 152.A H 3.112 2.268 LYS 153.A N ILE 127.A O LYS 153.A H 2.943 2.144 LEU 155.A N GLY 125.A O LEU 155.A H 2.807 1.984 SER 156.A N GLN 161.A OE1 SER 156.A H 2.948 2.108 LYS 160.A N PRO 157.A O LYS 160.A H 3.224 2.407 GLN 161.A N SER 156.A O GLN 161.A H 3.138 2.338 GLN 161.A NE2 ARG 163.A O GLN 161.A HE21 2.907 2.074 ARG 163.A NE SER 182.A OG ARG 163.A HE 2.877 2.160 ARG 163.A NH2 SER 182.A O ARG 163.A HH21 3.173 2.524 ARG 163.A NH2 SER 182.A OG ARG 163.A HH21 3.045 2.332 ALA 164.A N ALA 183.A O ALA 164.A H 2.839 2.016 THR 169.A OG1 ASP 130.A OD1 THR 169.A HG1 2.633 1.936 GLN 171.A N GLN 171.A OE1.A GLN 171.A H 2.707 1.947 TYR 172.A N THR 169.A O TYR 172.A H 2.887 2.061 TYR 172.A OH GLN 198.A OE1 TYR 172.A HH 2.603 1.786 SER 174.A OG SER 187.A OG SER 174.A HG 3.355 2.539 GLU 176.A N GLU 176.A OE1 GLU 176.A H 2.786 1.981 LEU 177.A N SER 174.A O LEU 177.A H 3.195 2.602 LEU 178.A N SER 174.A O LEU 178.A H 3.343 2.536 THR 179.A N PRO 175.A O THR 179.A H 2.848 2.071 GLU 180.A N GLU 176.A O GLU 180.A H 2.733 1.937 LYS 181.A N LEU 177.A O LYS 181.A H 3.190 2.549 ALA 183.A N ALA 164.A O ALA 183.A H 2.926 2.120 CYS 184.A N SER 187.A OG CYS 184.A H 2.931 2.090 LYS 185.A NZ.A GLU 252.A OE2 LYS 185.A HZ3.A 2.362 1.540 LYS 185.A NZ.B GLU 252.A OE2 LYS 185.A HZ2.B 3.266 2.545 SER 187.A N CYS 184.A O SER 187.A H 2.886 2.122 SER 187.A OG GLU 176.A OE2 SER 187.A HG 2.696 1.929 ASP 188.A N LYS 185.A O ASP 188.A H 2.942 2.174 LEU 189.A N SER 186.A O LEU 189.A H 2.918 2.296 TRP 190.A N SER 186.A O TRP 190.A H 3.131 2.339 ALA 191.A N SER 187.A O ALA 191.A H 3.246 2.420 LEU 192.A N ASP 188.A O LEU 192.A H 2.910 2.105 GLY 193.A N LEU 189.A O GLY 193.A H 2.986 2.186 CYS 194.A N TRP 190.A O CYS 194.A H 3.071 2.261 CYS 194.A SG TRP 190.A O CYS 194.A HG 3.648 2.644 ILE 195.A N ALA 191.A O ILE 195.A H 2.885 2.109 ILE 196.A N LEU 192.A O ILE 196.A H 2.870 2.024 TYR 197.A N GLY 193.A O TYR 197.A H 3.058 2.204 TYR 197.A OH ASP 224.A O TYR 197.A HH 2.594 1.809 GLN 198.A N CYS 194.A O GLN 198.A H 2.954 2.163 LEU 199.A N ILE 195.A O LEU 199.A H 2.858 2.048 VAL 200.A N ILE 196.A O VAL 200.A H 3.170 2.402 VAL 200.A N TYR 197.A O VAL 200.A H 3.172 2.553 ALA 201.A N TYR 197.A O ALA 201.A H 2.781 1.934 GLY 202.A N GLN 198.A O GLY 202.A H 2.820 2.044 ARG 207.A NH1 PRO 204.A O ARG 207.A HH11 2.720 1.934 LEU 213.A N ASN 210.A OD1 LEU 213.A H 3.158 2.407 ILE 214.A N ASN 210.A O ILE 214.A H 3.403 2.604 PHE 215.A N GLU 211.A O PHE 215.A H 2.908 2.089 ALA 216.A N GLY 212.A O ALA 216.A H 3.023 2.216 LYS 217.A N LEU 213.A O LYS 217.A H.A 3.268 2.475 LYS 217.A NZ.A ARG 207.A O LYS 217.A HZ1.A 2.444 1.660 ILE 218.A N ILE 214.A O ILE 218.A H 2.921 2.084 ILE 219.A N PHE 215.A O ILE 219.A H.B 3.083 2.256 LYS 220.A N LYS 217.A O LYS 220.A H 3.233 2.571 LEU 221.A N ILE 218.A O LEU 221.A H 3.060 2.218 GLU 222.A N LYS 217.A O GLU 222.A H 2.903 2.049 ARG 234.A N PHE 230.A O ARG 234.A H 2.930 2.131 ARG 234.A NE GLU 238.A OE2 ARG 234.A HE 2.908 2.065 ARG 234.A NH2 GLU 238.A OE2 ARG 234.A HH21 3.385 2.699 ASP 235.A N PRO 231.A O ASP 235.A H 3.025 2.193 LEU 236.A N LYS 232.A O LEU 236.A H 3.047 2.225 VAL 237.A N ALA 233.A O VAL 237.A H 2.898 2.050 GLU 238.A N ARG 234.A O GLU 238.A H 2.905 2.077 LYS 239.A N ASP 235.A O LYS 239.A H 3.063 2.436 LYS 239.A N LEU 236.A O LYS 239.A H 2.948 2.244 LYS 239.A NZ ASP 235.A OD1 LYS 239.A HZ3 3.102 2.431 LYS 239.A NZ ASP 235.A OD2 LYS 239.A HZ3 2.930 2.054 LEU 240.A N VAL 237.A O LEU 240.A H 3.042 2.238 LEU 241.A N VAL 237.A O LEU 241.A H 2.812 1.955 THR 246.A N ASP 244.A OD1 THR 246.A H 2.949 2.122 THR 246.A OG1 ASP 244.A OD1 THR 246.A HG1 2.689 1.849 THR 246.A OG1 ASP 244.A OD2 THR 246.A HG1 3.465 2.862 LYS 247.A N ASP 244.A O LYS 247.A H 2.998 2.172 ARG 248.A NE VAL 242.A O ARG 248.A HE 2.821 2.010 ARG 248.A NH1 GLU 176.A OE1 ARG 248.A HH12 3.427 2.790 ARG 248.A NH1 GLU 176.A OE2 ARG 248.A HH12 2.878 2.034 ARG 248.A NH1 SER 186.A O ARG 248.A HH11 3.003 2.229 ARG 248.A NH2 GLU 176.A OE1 ARG 248.A HH22 2.733 1.885 ARG 248.A NH2 VAL 242.A O ARG 248.A HH21 3.036 2.312 LEU 249.A N LYS 239.A O LEU 249.A H 2.983 2.146 CYS 251.A N ARG 248.A O CYS 251.A H 3.013 2.173 CYS 251.A SG ARG 248.A O CYS 251.A HG 3.233 2.340 GLU 253.A N GLU 253.A OE1 GLU 253.A H 2.791 2.026 MET 254.A N CYS 251.A O MET 254.A H.A 2.987 2.307 GLU 255.A N GLU 252.A O GLU 255.A H 2.947 2.127 GLY 256.A N CYS 251.A O GLY 256.A H 2.885 2.060 TYR 257.A OH HIS 122.A ND1 TYR 257.A HH 2.803 2.003 LYS 261.A N TYR 257.A O LYS 261.A H 2.828 1.981 LYS 261.A NZ.A GLU 119.A OE1 LYS 261.A HZ2.A 2.953 2.066 LYS 261.A NZ.B GLU 119.A OE2 LYS 261.A HZ2.B 2.905 2.130 ALA 262.A N GLY 258.A O ALA 262.A H 3.023 2.303 HIS 263.A N LEU 260.A O HIS 263.A H 3.040 2.187 HIS 263.A NE2 ASP 235.A OD2 HIS 263.A HE2 2.721 1.897 PHE 265.A N HIS 263.A ND1 PHE 265.A H 2.923 2.067 PHE 266.A N HIS 263.A O PHE 266.A H 2.857 2.027 GLU 267.A N PRO 264.A O GLU 267.A H 3.147 2.310 VAL 269.A N PHE 266.A O VAL 269.A H 2.867 2.009 GLN 276.A N ASN 273.A O.A GLN 276.A H 3.189 2.410 GLN 276.A N ASN 273.A O.B GLN 276.A H 2.987 2.193 GLN 277.A N LEU 274.A O GLN 277.A H 3.023 2.209 GLN 277.A NE2 THR 270.A O GLN 277.A HE22 2.955 2.244 GLN 277.A NE2 GLU 272.A O.A GLN 277.A HE21 3.692 3.126 GLN 277.A NE2 ASN 273.A OD1 GLN 277.A HE21 2.710 1.909