Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5mrk_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 3.A N GLU 6.A OE1 THR 3.A H 2.798 1.974 THR 3.A OG1 TYR 183.A O THR 3.A HG1 2.696 1.873 GLU 6.A N THR 3.A OG1 GLU 6.A H 3.158 2.323 LYS 7.A N THR 3.A O LYS 7.A H 3.078 2.278 TRP 8.A N LEU 4.A O TRP 8.A H 2.896 2.065 TRP 8.A NE1 TYR 23.A OH TRP 8.A HE1 3.110 2.458 LYS 9.A N GLY 5.A O LYS 9.A H 2.817 2.028 ALA 10.A N GLU 6.A O ALA 10.A H 2.999 2.163 ARG 11.A N LYS 7.A O ARG 11.A H 3.001 2.157 ARG 11.A NH1 ASP 241.A OD1 ARG 11.A HH12 3.253 2.429 ARG 11.A NH2 ASP 241.A OD1 ARG 11.A HH22 3.487 2.735 LEU 12.A N TRP 8.A O LEU 12.A H 2.837 2.000 ASN 13.A N LYS 9.A O ASN 13.A H 3.041 2.262 ASN 13.A ND2 SER 148.A O ASN 13.A HD21 2.859 2.037 GLN 14.A N ARG 11.A O no hydrogen 2.922 N/A MET 15.A N LEU 12.A O no hydrogen 3.298 N/A SER 16.A N GLU 19.A OE2 SER 16.A H 2.682 1.835 GLU 19.A N SER 16.A OG GLU 19.A H 3.163 2.308 PHE 20.A N SER 16.A O PHE 20.A H 2.922 2.080 TYR 21.A N ALA 17.A O TYR 21.A H 2.998 2.159 SER 22.A N LEU 18.A O SER 22.A H 3.026 2.199 TYR 23.A N GLU 19.A O TYR 23.A H 2.883 2.067 TYR 23.A OH LEU 236.A O TYR 23.A HH 2.764 1.962 LYS 24.A N PHE 20.A O LYS 24.A H 2.924 2.158 LYS 24.A NZ SER 211.A OG LYS 24.A HZ2 3.384 2.532 LYS 25.A NZ GLU 30.A OE1 LYS 25.A HZ1 2.905 2.175 SER 26.A N TYR 23.A O SER 26.A H 3.105 2.281 GLY 27.A N ARG 245.A O GLY 27.A H 2.967 2.269 ILE 28.A N LYS 25.A O ILE 28.A H 3.243 2.384 THR 29.A N PRO 206.A O THR 29.A H 3.024 2.175 GLU 30.A N LYS 248.A O GLU 30.A H 2.816 2.086 ARG 33.A NH1 ALA 50.A O ARG 33.A HH12 2.961 2.171 ARG 33.A NH1 ASP 252.A OD2 ARG 33.A HH11 3.396 2.641 ARG 33.A NH2 ALA 50.A O ARG 33.A HH22 3.078 2.328 ARG 37.A N ARG 33.A O ARG 37.A H 2.730 1.898 ARG 38.A N GLU 34.A O ARG 38.A H 3.104 2.279 ALA 39.A N GLU 35.A O ALA 39.A H 3.305 2.448 LEU 40.A N ALA 36.A O LEU 40.A H 2.984 2.125 LYS 41.A N ARG 37.A O LYS 41.A H 3.022 2.235 ASP 42.A N ARG 38.A O ASP 42.A H 2.761 1.953 GLY 43.A N LEU 40.A O GLY 43.A H 3.348 2.544 VAL 44.A N ALA 39.A O VAL 44.A H 3.002 2.177 ARG 53.A NH1 VAL 31.A O ARG 53.A HH12 3.120 2.342 GLY 54.A N SER 52.A OG GLY 54.A H 2.914 2.175 SER 55.A OG GLY 82.A O SER 55.A HG 2.670 1.899 LEU 58.A N GLY 54.A O LEU 58.A H 3.115 2.284 ARG 59.A N SER 55.A O ARG 59.A H 2.899 2.053 ARG 59.A NH1 GLU 251.A O ARG 59.A HH12 3.224 2.535 ARG 59.A NH2 GLU 250.A OE1 ARG 59.A HH21 3.019 2.223 ARG 59.A NH2 GLU 251.A O ARG 59.A HH22 2.838 2.022 TRP 60.A N ALA 56.A O TRP 60.A H 2.958 2.155 LEU 61.A N LYS 57.A O LEU 61.A H 3.257 2.446 VAL 62.A N LEU 58.A O VAL 62.A H 2.839 2.005 GLU 63.A N ARG 59.A O GLU 63.A H 2.685 1.831 ARG 64.A N TRP 60.A O ARG 64.A H 3.241 2.513 ARG 64.A NH1 TRP 60.A O ARG 64.A HH11 3.520 2.716 GLY 65.A N VAL 62.A O GLY 65.A H 3.187 2.347 TYR 66.A N LEU 61.A O TYR 66.A H 3.024 2.323 TYR 70.A N THR 138.A OG1 TYR 70.A H 3.065 2.232 GLY 71.A N LYS 92.A O GLY 71.A H 2.847 2.019 LYS 72.A N ASP 137.A OD2 LYS 72.A H 2.909 2.065 LYS 72.A NZ GLU 134.A OE1.A LYS 72.A HZ1 2.557 1.699 LYS 72.A NZ PRO 135.A O LYS 72.A HZ3 3.160 2.309 VAL 73.A N GLU 95.A O VAL 73.A H 2.798 1.939 ILE 74.A N THR 138.A O ILE 74.A H 2.977 2.152 ASP 75.A N LYS 97.A O ASP 75.A H 2.819 2.005 LEU 76.A N LEU 140.A O LEU 76.A H 2.860 2.003 GLY 77.A N TYR 99.A O GLY 77.A H 2.725 2.079 CYS 78.A N TYR 99.A O CYS 78.A H 3.144 2.358 CYS 78.A SG GLY 79.A O CYS 78.A HG 3.539 2.364 ARG 80.A NE VAL 51.A O ARG 80.A HE 2.969 2.428 ARG 80.A NH2 VAL 51.A O ARG 80.A HH21 2.694 2.139 GLY 81.A N CYS 78.A O GLY 81.A H 2.796 2.184 SER 84.A OG ASP 75.A OD2 SER 84.A HG 2.797 1.967 TYR 85.A N GLY 81.A O TYR 85.A H 2.889 2.050 TYR 85.A OH MET 110.A O TYR 85.A HH 2.349 1.526 TYR 86.A N GLY 82.A O TYR 86.A H 3.275 2.455 ALA 87.A N TRP 83.A O ALA 87.A H 2.948 2.100 ALA 88.A N SER 84.A O ALA 88.A H 3.052 2.298 THR 89.A N TYR 86.A O THR 89.A H 3.062 2.241 THR 89.A OG1 TYR 86.A O THR 89.A HG1 2.727 1.890 ILE 90.A N ALA 87.A O ILE 90.A H 3.009 2.155 VAL 93.A N ILE 90.A O VAL 93.A H 3.050 2.258 GLN 94.A N GLY 71.A O no hydrogen 2.825 N/A GLU 95.A N GLY 71.A O GLU 95.A H 3.350 2.605 VAL 96.A N ILE 119.A O VAL 96.A H 2.942 2.118 LYS 97.A N VAL 73.A O LYS 97.A H 2.768 1.954 GLY 98.A N ARG 121.A O GLY 98.A H 2.845 1.998 TYR 99.A N ASP 75.A O TYR 99.A H 2.961 2.158 THR 100.A N LYS 123.A O THR 100.A H 2.904 2.099 GLY 103.A N GLU 108.A OE2 GLY 103.A H 2.948 2.094 HIS 106.A N GLY 103.A O HIS 106.A H 3.231 2.400 GLU 107.A N GLU 107.A OE1 GLU 107.A H 2.496 1.766 MET 110.A N ARG 80.A O MET 110.A H 2.890 2.038 VAL 112.A N TYR 85.A OH VAL 112.A H 3.099 2.295 GLN 113.A N ALA 45.A O GLN 113.A H 2.780 1.959 GLY 116.A N GLY 258.A O GLY 116.A H 3.336 2.615 TRP 117.A N SER 114.A O TRP 117.A H 2.856 2.128 ASN 118.A ND2 ARG 260.A O ASN 118.A HD21 2.655 1.868 ILE 119.A N GLY 116.A O ILE 119.A H 3.127 2.276 VAL 120.A N TRP 117.A O VAL 120.A H 3.312 2.518 ARG 121.A N VAL 96.A O ARG 121.A H 2.977 2.176 LYS 123.A N GLY 98.A O LYS 123.A H 2.824 2.021 SER 124.A OG GLU 108.A OE1 SER 124.A HG 2.887 2.107 GLY 125.A N LYS 101.A O GLY 125.A H 2.931 2.233 VAL 126.A N THR 100.A O VAL 126.A H 2.957 2.099 PHE 129.A N ASP 127.A OD1 PHE 129.A H 3.098 2.315 HIS 130.A N ASP 127.A O HIS 130.A H 2.910 2.071 MET 131.A N VAL 128.A O MET 131.A H 3.268 2.434 ASP 137.A N LYS 72.A O ASP 137.A H 3.085 2.362 THR 138.A N LYS 72.A O THR 138.A H 2.996 2.153 THR 138.A OG1 TYR 70.A O THR 138.A HG1 3.012 2.342 LEU 139.A N ALA 174.A O LEU 139.A H 2.991 2.172 LEU 140.A N ILE 74.A O LEU 140.A H 2.771 1.959 CYS 141.A N CYS 176.A O CYS 141.A H 2.966 2.169 ASP 142.A N LEU 76.A O ASP 142.A H 3.269 2.453 SER 147.A N GLU 153.A OE2 SER 147.A H 2.961 2.138 SER 149.A N SER 147.A OG SER 149.A H 2.996 2.154 VAL 152.A N SER 149.A OG VAL 152.A H 3.122 2.316 GLU 153.A N SER 149.A O GLU 153.A H 3.196 2.354 GLU 154.A N PRO 150.A O GLU 154.A H 2.903 2.059 ALA 155.A N GLU 151.A O ALA 155.A H 3.132 2.311 ARG 156.A N VAL 152.A O ARG 156.A H 2.921 2.075 ARG 156.A NH1 GLU 145.A O ARG 156.A HH11 2.849 2.067 ARG 156.A NH1 SER 146.A O ARG 156.A HH12 3.329 2.750 THR 157.A N GLU 153.A O THR 157.A H 2.964 2.132 THR 157.A OG1 GLU 153.A O THR 157.A HG1 2.813 2.022 LEU 158.A N GLU 154.A O LEU 158.A H 2.934 2.102 ARG 159.A N ALA 155.A O ARG 159.A H 3.050 2.247 VAL 160.A N ARG 156.A O VAL 160.A H 3.058 2.209 LEU 161.A N THR 157.A O LEU 161.A H 2.868 2.070 SER 162.A N LEU 158.A O SER 162.A H 2.934 2.130 MET 163.A N ARG 159.A O MET 163.A H 3.043 2.213 VAL 164.A N VAL 160.A O VAL 164.A H 2.799 1.971 GLY 165.A N LEU 161.A O GLY 165.A H 3.040 2.321 LEU 168.A N VAL 164.A O LEU 168.A H 2.932 2.110 GLU 169.A N GLY 165.A O GLU 169.A H 2.943 2.236 LYS 170.A N TRP 167.A O LYS 170.A H 2.872 2.131 ARG 171.A N LEU 168.A O ARG 171.A H 2.857 2.063 GLY 173.A N ASP 137.A O GLY 173.A H 2.933 2.337 ALA 174.A N ASP 137.A O ALA 174.A H 3.145 2.408 PHE 175.A N SER 219.A OG PHE 175.A H 3.167 2.370 CYS 176.A N LEU 139.A O CYS 176.A H 2.957 2.173 ILE 177.A N TRP 217.A O ILE 177.A H 2.914 2.119 LYS 178.A N CYS 141.A O LYS 178.A H 2.812 1.973 LYS 178.A NZ GLY 144.A O LYS 178.A HZ2 3.111 2.355 VAL 179.A N MET 215.A O VAL 179.A H 2.751 1.901 CYS 181.A N THR 157.A OG1 CYS 181.A H 2.989 2.289 TYR 183.A OH GLU 153.A OE1 TYR 183.A HH 2.752 1.961 THR 184.A OG1 GLU 154.A OE2 THR 184.A HG1 2.435 1.616 MET 187.A N THR 184.A OG1 MET 187.A H 3.263 2.444 MET 188.A N THR 184.A O MET 188.A H 2.858 2.027 GLU 189.A N SER 185.A O GLU 189.A H 2.999 2.157 THR 190.A N THR 186.A O THR 190.A H 2.783 1.993 THR 190.A OG1 THR 186.A O THR 190.A HG1 2.921 2.146 LEU 191.A N MET 187.A O LEU 191.A H 2.923 2.133 GLU 192.A N MET 188.A O GLU 192.A H 2.974 2.167 ARG 193.A N GLU 189.A O ARG 193.A H 3.179 2.340 LEU 194.A N THR 190.A O LEU 194.A H 3.006 2.179 GLN 195.A N LEU 191.A O GLN 195.A H 2.779 1.965 GLN 195.A NE2 GLY 200.A O GLN 195.A HE21 3.088 2.246 GLN 195.A NE2 SER 223.A O GLN 195.A HE22 2.917 2.111 ARG 196.A N GLU 192.A O ARG 196.A H 2.915 2.129 ARG 197.A N ARG 193.A O ARG 197.A H 3.053 2.322 ARG 197.A N LEU 194.A O ARG 197.A H 3.175 2.586 ARG 197.A NE GLU 169.A OE2 ARG 197.A HE 2.946 2.237 ARG 197.A NE TYR 198.A OH ARG 197.A HE 3.148 2.360 ARG 197.A NH2 GLU 169.A OE1 ARG 197.A HH21 3.272 2.517 ARG 197.A NH2 GLU 169.A OE2 ARG 197.A HH21 2.633 1.829 TYR 198.A N LEU 194.A O TYR 198.A H 2.785 1.965 TYR 198.A OH GLU 169.A OE2 TYR 198.A HH 2.531 1.851 GLY 199.A N GLN 195.A O GLY 199.A H 2.756 2.008 GLY 201.A N VAL 218.A O GLY 201.A H 2.926 2.141 VAL 203.A N TYR 216.A O VAL 203.A H 2.917 2.164 ARG 204.A NH1 THR 212.A O ARG 204.A HH12 2.729 1.976 ARG 204.A NH1 GLU 214.A O ARG 204.A HH11 2.779 2.038 ARG 204.A NH2 ARG 209.A O ARG 204.A HH22 2.842 2.191 ARG 204.A NH2 THR 212.A O ARG 204.A HH22 2.908 2.215 SER 208.A N VAL 205.A O SER 208.A H 2.956 2.117 SER 208.A OG GLU 214.A OE2 SER 208.A HG 2.694 1.947 ARG 209.A NH1 LEU 207.A O ARG 209.A HH11 3.221 2.507 ASN 210.A N LYS 24.A O ASN 210.A H 2.950 2.143 ASN 210.A ND2 TYR 23.A O ASN 210.A HD22 2.793 1.941 ASN 210.A ND2 SER 26.A O ASN 210.A HD21 2.907 2.079 THR 212.A N ARG 209.A O THR 212.A H 3.233 2.376 HIS 213.A ND1 HIS 213.A O HIS 213.A HD1 2.614 1.919 GLU 214.A N THR 212.A OG1 GLU 214.A H 3.132 2.351 MET 215.A N VAL 179.A O MET 215.A H 3.118 2.281 TYR 216.A N VAL 203.A O TYR 216.A H 2.856 2.013 TYR 216.A OH ASP 142.A OD1 TYR 216.A HH 3.062 2.232 TRP 217.A N ILE 177.A O TRP 217.A H 2.751 1.914 TRP 217.A NE1 GLY 199.A O TRP 217.A HE1 3.049 2.265 VAL 218.A N GLY 201.A O VAL 218.A H 2.842 2.030 SER 219.A N PHE 175.A O SER 219.A H 3.127 2.395 GLY 220.A N TYR 66.A O GLY 220.A H 3.046 2.279 ALA 221.A N VAL 218.A O ALA 221.A H 3.340 2.504 LYS 222.A NZ ALA 221.A O no hydrogen 3.450 N/A SER 223.A OG LEU 202.A O SER 223.A HG 3.481 2.983 LYS 227.A N ASN 224.A OD1 LYS 227.A H 2.846 2.010 SER 228.A N ASN 224.A O SER 228.A H 3.048 2.197 SER 228.A OG ASN 224.A O SER 228.A HG 3.393 2.782 SER 228.A OG THR 225.A O SER 228.A HG 2.923 2.183 VAL 229.A N THR 225.A O VAL 229.A H 2.935 2.087 SER 230.A N ILE 226.A O SER 230.A H 2.820 1.980 THR 231.A N LYS 227.A O THR 231.A H 2.821 1.973 THR 231.A OG1 LYS 227.A O THR 231.A HG1 2.782 2.029 THR 232.A N SER 228.A O THR 232.A H 3.181 2.367 THR 232.A OG1 SER 228.A O THR 232.A HG1 3.218 2.457 SER 233.A N VAL 229.A O SER 233.A H 2.968 2.139 SER 233.A OG VAL 229.A O SER 233.A HG 3.359 2.577 GLN 234.A N SER 230.A O GLN 234.A H 2.898 2.072 GLN 234.A NE2 SER 230.A O GLN 234.A HE21 3.533 2.891 LEU 235.A N THR 231.A O LEU 235.A H 3.003 2.160 LEU 236.A N THR 232.A O LEU 236.A H 2.998 2.167 LEU 237.A N SER 233.A O LEU 237.A H 2.928 2.080 GLY 238.A N GLN 234.A O GLY 238.A H 2.974 2.123 ARG 239.A N LEU 235.A O ARG 239.A H 3.241 2.490 ARG 239.A NH1 ASN 210.A OD1 ARG 239.A HH11 2.880 2.068 MET 240.A N LEU 237.A O MET 240.A H 2.935 2.156 ASP 241.A N GLY 238.A O ASP 241.A H 3.256 2.444 ARG 244.A NE SER 22.A O ARG 244.A HE 3.025 2.444 ARG 244.A NH1 ARG 245.A O ARG 244.A HH11 3.019 2.344 ARG 245.A N SER 26.A OG ARG 245.A H 2.969 2.127 LYS 248.A N ILE 28.A O LYS 248.A H 2.858 2.016 GLU 250.A N GLU 30.A O GLU 250.A H 2.920 2.134 VAL 253.A N ASP 252.A OD1 VAL 253.A H 2.682 1.952 ASN 254.A ND2 GLY 47.A O ASN 254.A HD21 3.499 2.851 LEU 255.A N GLY 48.A O LEU 255.A H 2.845 2.028 ARG 260.A N ASN 118.A OD1 ARG 260.A H 2.862 2.049 ARG 260.A NH1 ALA 88.A O ARG 260.A HH11 2.738 1.971 ARG 260.A NH1 ILE 90.A O ARG 260.A HH12 2.932 2.237 ARG 260.A NH2 ILE 90.A O ARG 260.A HH22 3.499 2.941 ARG 260.A NH2 ARG 91.A O ARG 260.A HH22 2.921 2.195