Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5omj_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 7.A NE2 THR 12.A O GLN 7.A HE21 3.296 2.462 GLN 7.A NE2 GLU 89.A OE2 GLN 7.A HE22 2.720 1.998 VAL 9.A N PHE 6.A O VAL 9.A H 3.128 2.345 LYS 10.A N PHE 6.A O LYS 10.A H 2.866 2.016 LYS 10.A NZ ASP 4.A O LYS 10.A HZ1 3.351 2.575 ALA 11.A N GLN 7.A O ALA 11.A H 2.777 2.040 THR 12.A OG1 ILE 13.A O THR 12.A HG1 2.750 1.927 ASP 14.A N GLU 89.A OE2 ASP 14.A H 2.887 2.031 GLU 16.A N ASP 14.A OD1 GLU 16.A H 3.051 2.286 HIS 17.A N ASP 14.A O HIS 17.A H 3.057 2.214 MET 19.A N HIS 17.A ND1 MET 19.A H 2.981 2.169 LYS 21.A N HIS 17.A O LYS 21.A H 3.039 2.257 LEU 22.A N PRO 18.A O LEU 22.A H 2.803 1.972 TYR 23.A N MET 19.A O TYR 23.A H 2.947 2.152 GLU 24.A N PHE 20.A O GLU 24.A H 2.981 2.190 LYS 25.A N LYS 21.A O LYS 25.A H 3.157 2.326 ALA 26.A N LEU 22.A O ALA 26.A H 2.903 2.135 LYS 27.A N TYR 23.A O LYS 27.A H 3.036 2.243 LYS 27.A NZ GLU 24.A OE2 LYS 27.A HZ1 2.956 2.093 ARG 28.A N GLU 24.A O ARG 28.A H 3.233 2.544 ARG 28.A N LYS 25.A O ARG 28.A H 3.164 2.535 ASN 29.A N LYS 25.A O ASN 29.A H 2.879 2.090 TRP 32.A NE1 ASP 199.A OD2 TRP 32.A HE1 2.839 2.049 ALA 35.A N ASN 33.A OD1 ALA 35.A H 2.944 2.153 ASP 36.A N ASN 33.A O ASP 36.A H 2.909 2.060 ILE 37.A N PRO 34.A O ILE 37.A H 3.088 2.235 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 3.265 2.424 SER 40.A OG ASP 38.A OD1 SER 40.A HG 2.680 1.965 GLN 41.A NE2 ASP 45.A OD1 GLN 41.A HE21 2.665 1.977 GLN 43.A N PHE 39.A O GLN 43.A H 2.840 2.124 LYS 44.A N SER 40.A O LYS 44.A H 3.202 2.381 ASP 45.A N GLN 41.A O ASP 45.A H 2.798 1.956 PHE 46.A N ASP 42.A O PHE 46.A H 2.979 2.138 ALA 47.A N GLN 43.A O ALA 47.A H 3.063 2.254 SER 48.A N LYS 44.A O SER 48.A H 2.941 2.083 SER 48.A OG ASP 45.A O SER 48.A HG 3.130 2.341 LEU 49.A N PHE 46.A O LEU 49.A H 3.260 2.476 THR 50.A N GLU 53.A OE2 THR 50.A H 2.755 1.896 THR 50.A OG1 GLU 53.A OE2 THR 50.A HG1 2.663 1.825 LYS 54.A N THR 50.A O LYS 54.A H 2.730 1.893 LYS 54.A NZ ALA 47.A O LYS 54.A HZ1 3.430 2.769 LYS 54.A NZ LEU 49.A O LYS 54.A HZ2 2.792 2.116 ILE 55.A N SER 51.A O ILE 55.A H 3.128 2.356 SER 56.A N GLU 53.A O SER 56.A H 2.994 2.248 LEU 58.A N ILE 55.A O LEU 58.A H 3.271 2.506 VAL 61.A N ALA 57.A O VAL 61.A H 3.334 2.491 ALA 62.A N LEU 58.A O ALA 62.A H 2.946 2.185 GLY 63.A N PRO 59.A O GLY 63.A H 3.244 2.462 PHE 64.A N LEU 60.A O PHE 64.A H 3.123 2.318 SER 65.A N VAL 61.A O SER 65.A H 2.844 2.027 SER 65.A OG GLN 112.A OE1 SER 65.A HG 2.966 2.133 ALA 66.A N ALA 62.A O ALA 66.A H 3.250 2.395 GLY 67.A N GLY 63.A O GLY 67.A H 2.956 2.178 GLU 68.A N PHE 64.A O GLU 68.A H 2.811 1.953 GLU 69.A N SER 65.A O GLU 69.A H 3.024 2.193 ALA 70.A N ALA 66.A O ALA 70.A H 2.774 1.964 VAL 71.A N GLY 67.A O VAL 71.A H 3.029 2.204 THR 72.A N GLU 68.A O THR 72.A H 2.972 2.117 THR 72.A OG1 GLU 68.A O THR 72.A HG1 2.958 2.159 LEU 73.A N GLU 69.A O LEU 73.A H 3.056 2.302 ASP 74.A N ALA 70.A O ASP 74.A H 2.774 2.073 ILE 75.A N VAL 71.A O ILE 75.A H 3.096 2.278 ALA 79.A N ILE 75.A O ALA 79.A H 3.106 2.291 HIS 80.A N LEU 76.A O HIS 80.A H 2.979 2.166 ALA 81.A N PRO 77.A O ALA 81.A H 2.825 1.989 LEU 82.A N MET 78.A O LEU 82.A H 3.009 2.226 ALA 83.A N ALA 79.A O ALA 83.A H 2.926 2.106 ARG 84.A N HIS 80.A O ARG 84.A H 2.916 2.098 ARG 84.A NH1 TYR 146.A O ARG 84.A HH12 3.098 2.505 ARG 84.A NH2 LEU 145.A O ARG 84.A HH22 2.642 1.830 GLN 85.A N ALA 81.A O GLN 85.A H 3.224 2.408 GLN 85.A NE2 ASP 149.A O GLN 85.A HE22 3.333 2.789 GLN 85.A NE2 ASP 149.A OD2 GLN 85.A HE21 2.614 1.762 GLY 86.A N ALA 83.A O GLY 86.A H 2.764 1.946 ARG 87.A N LEU 82.A O ARG 87.A H 3.015 2.172 ARG 87.A NE ASP 90.A OD1 ARG 87.A HE 2.979 2.128 ARG 87.A NH2 ASP 90.A OD1 ARG 87.A HH21 3.459 2.769 ARG 87.A NH2 ASP 90.A OD2 ARG 87.A HH21 3.345 2.635 VAL 91.A N ARG 87.A O VAL 91.A H 3.175 2.402 LEU 92.A N LEU 88.A O LEU 92.A H 2.931 2.097 PHE 93.A N GLU 89.A O PHE 93.A H 3.108 2.278 LEU 94.A N ASP 90.A O LEU 94.A H 2.849 2.037 THR 95.A N VAL 91.A O THR 95.A H 3.064 2.366 THR 95.A N LEU 92.A O THR 95.A H 3.235 2.533 THR 95.A OG1 LEU 92.A O THR 95.A HG1 2.722 1.884 THR 96.A OG1 PHE 93.A O THR 96.A HG1 2.632 1.850 PHE 97.A N PHE 93.A O PHE 97.A H 3.045 2.247 MET 98.A N LEU 94.A O MET 98.A H 2.841 2.054 HIS 99.A N THR 95.A O HIS 99.A H 3.050 2.216 ASP 100.A N THR 96.A O ASP 100.A H 2.797 1.944 GLU 101.A N PHE 97.A O GLU 101.A H 3.066 2.256 ALA 102.A N MET 98.A O ALA 102.A H 3.050 2.275 LYS 103.A N HIS 99.A O LYS 103.A H 2.942 2.095 LYS 103.A NZ TRP 32.A O LYS 103.A HZ2 2.944 2.085 HIS 104.A N ASP 100.A O HIS 104.A H 2.810 2.032 HIS 104.A ND1 GLU 68.A OE2 no hydrogen 2.995 N/A HIS 104.A NE2 ASP 199.A OD2 HIS 104.A HE2 3.067 2.237 VAL 105.A N GLU 101.A O VAL 105.A H 2.829 2.024 GLU 106.A N ALA 102.A O GLU 106.A H 2.922 2.099 MET 107.A N LYS 103.A O MET 107.A H 2.722 1.900 PHE 108.A N HIS 104.A O PHE 108.A H 3.353 2.507 SER 109.A N VAL 105.A O SER 109.A H 3.190 2.420 ARG 110.A N GLU 106.A O ARG 110.A H 2.907 2.064 ARG 110.A NE GLU 106.A OE1 ARG 110.A HE 2.820 1.984 ARG 110.A NH2 GLU 106.A OE1 ARG 110.A HH21 3.236 2.551 TRP 111.A N MET 107.A O TRP 111.A H 3.118 2.325 GLN 112.A N PHE 108.A O GLN 112.A H 3.021 2.184 GLN 113.A N SER 109.A O GLN 113.A H 2.893 2.041 ALA 114.A N ARG 110.A O ALA 114.A H 2.872 2.084 VAL 115.A N TRP 111.A O VAL 115.A H 2.882 2.033 GLY 116.A N GLN 112.A O GLY 116.A H 3.136 2.523 GLY 116.A N GLN 113.A O GLY 116.A H 3.151 2.411 ILE 117.A N GLN 112.A O ILE 117.A H 2.948 2.187 GLN 119.A N GLN 119.A OE1 GLN 119.A H 2.771 1.936 GLN 119.A NE2 GLY 116.A O GLN 119.A HE22 2.733 1.916 MET 120.A N ILE 117.A O MET 120.A H 2.989 2.160 SER 123.A N ASP 121.A OD2 SER 123.A H 2.708 1.869 SER 123.A OG ASP 121.A OD2 SER 123.A HG 2.458 1.775 PHE 125.A N LEU 122.A O PHE 125.A H 3.132 2.280 HIS 126.A N SER 123.A O HIS 126.A H 3.224 2.379 HIS 126.A NE2 ALA 62.A O HIS 126.A HE2 2.851 1.995 ASN 127.A ND2 GLY 238.A O ASN 127.A HD21 3.428 2.684 TYR 130.A N ASN 127.A OD1 TYR 130.A H 3.166 2.328 TYR 130.A OH GLY 63.A O TYR 130.A HH 2.613 1.938 LYS 131.A N ASN 127.A O LYS 131.A H 2.990 2.152 ARG 132.A N ASP 128.A O ARG 132.A H 2.925 2.201 ARG 132.A N HIS 129.A O ARG 132.A H 3.030 2.407 ARG 132.A NH1 GLU 136.A OE2 ARG 132.A HH11 2.937 2.137 ARG 132.A NH2 GLU 140.A OE1 ARG 132.A HH22 3.440 2.724 ILE 133.A N HIS 129.A O ILE 133.A H 3.294 2.533 ILE 133.A N TYR 130.A O ILE 133.A H 3.116 2.528 PHE 134.A N TYR 130.A O PHE 134.A H 2.910 2.057 TYR 135.A N LYS 131.A O TYR 135.A H 2.816 2.106 TYR 135.A OH HIS 126.A ND1 TYR 135.A HH 2.880 2.044 ALA 137.A N ARG 132.A O ALA 137.A H 2.813 1.983 LEU 138.A N ILE 133.A O LEU 138.A H 2.896 2.105 GLU 140.A N GLU 136.A O GLU 140.A H 2.938 2.121 ALA 141.A N ALA 137.A O ALA 141.A H 3.114 2.260 MET 142.A N LEU 138.A O MET 142.A H 3.160 2.349 ASN 143.A N PRO 139.A O ASN 143.A H 2.869 2.026 ASN 143.A ND2 PRO 139.A O ASN 143.A HD22 3.035 2.256 ARG 144.A N GLU 140.A O ARG 144.A H 3.005 2.169 ARG 144.A NE ASP 148.A OD2 ARG 144.A HE 2.606 1.831 ARG 144.A NH2 ASP 148.A OD2 ARG 144.A HH21 2.755 2.061 LEU 145.A N MET 142.A O LEU 145.A H 3.013 2.177 TYR 146.A N ASN 143.A O TYR 146.A H 3.052 2.198 ALA 147.A N ARG 144.A O ALA 147.A H 2.966 2.180 ASP 148.A N ARG 144.A O ASP 148.A H 2.991 2.316 SER 150.A N ASP 148.A OD1 SER 150.A H 3.107 2.262 SER 150.A OG ASP 148.A OD1 SER 150.A HG 2.998 2.401 ALA 153.A N SER 150.A OG ALA 153.A H 3.283 2.479 VAL 154.A N SER 150.A O VAL 154.A H 2.876 2.058 ILE 155.A N PRO 151.A O ILE 155.A H 2.756 1.904 ARG 156.A N GLU 152.A O ARG 156.A H 3.018 2.210 ALA 157.A N ALA 153.A O ALA 157.A H 2.989 2.164 ALA 158.A N VAL 154.A O ALA 158.A H 2.986 2.127 THR 159.A N ILE 155.A O THR 159.A H 2.968 2.228 THR 159.A N ARG 156.A O THR 159.A H 3.220 2.619 THR 159.A OG1 ILE 155.A O THR 159.A HG1 2.736 1.936 VAL 160.A N ARG 156.A O VAL 160.A H 2.958 2.111 TYR 161.A N ALA 157.A O TYR 161.A H 2.970 2.119 TYR 161.A OH GLU 101.A OE1 no hydrogen 3.028 N/A ASN 162.A N ALA 158.A O ASN 162.A H 2.772 1.951 MET 163.A N THR 159.A O MET 163.A H 3.091 2.295 VAL 165.A N VAL 160.A O VAL 165.A H 3.109 2.249 THR 167.A N ILE 164.A O THR 167.A H 3.142 2.381 THR 167.A OG1 MET 163.A O THR 167.A HG1 2.873 2.174 LEU 168.A N ILE 164.A O LEU 168.A H 2.837 2.012 ALA 169.A N VAL 165.A O ALA 169.A H 2.920 2.163 SER 171.A N THR 167.A O SER 171.A H 3.140 2.296 SER 171.A OG THR 167.A O SER 171.A HG 2.757 2.015 GLY 172.A N LEU 168.A O GLY 172.A H 2.926 2.216 GLY 172.A N ALA 169.A O GLY 172.A H 2.889 2.290 TYR 173.A N ALA 169.A O TYR 173.A H 2.909 2.128 TYR 173.A OH GLU 200.A OE1 TYR 173.A HH 2.502 1.836 TYR 174.A N GLU 170.A O TYR 174.A H 3.116 2.342 THR 175.A N SER 171.A O THR 175.A H 2.750 1.908 THR 175.A OG1 SER 171.A O THR 175.A HG1 2.916 2.158 PHE 176.A N GLY 172.A O PHE 176.A H 3.042 2.248 ARG 177.A N TYR 173.A O ARG 177.A H 3.188 2.398 ARG 177.A NE ASP 194.A OD1 ARG 177.A HE 3.404 2.740 ARG 177.A NH1 ASN 197.A OD1 ARG 177.A HH12 3.076 2.259 ARG 177.A NH2 ASP 194.A OD1 ARG 177.A HH21 2.719 1.864 GLN 178.A N TYR 174.A O GLN 178.A H 2.960 2.102 TYR 180.A N PHE 176.A O TYR 180.A H 2.994 2.236 ALA 183.A N ILE 179.A O ALA 183.A H 3.071 2.221 LEU 185.A N TYR 180.A O LEU 185.A H 2.935 2.129 PHE 186.A N ASP 45.A OD2 PHE 186.A H 2.771 1.922 GLY 188.A N ASP 42.A OD2 GLY 188.A H 2.761 1.979 LEU 189.A N ASP 42.A OD1 LEU 189.A H 2.881 2.062 LEU 190.A N PHE 186.A O LEU 190.A H 2.964 2.161 GLN 191.A N PRO 187.A O GLN 191.A H 2.881 2.070 GLY 192.A N GLY 188.A O GLY 192.A H 2.963 2.116 ILE 193.A N LEU 189.A O ILE 193.A H 2.852 2.013 ASP 194.A N LEU 190.A O ASP 194.A H 2.960 2.205 TYR 195.A N GLN 191.A O TYR 195.A H 3.172 2.348 LEU 196.A N GLY 192.A O LEU 196.A H 2.850 2.010 ASN 197.A N ILE 193.A O ASN 197.A H 2.946 2.180 ASN 197.A ND2 GLU 170.A OE2 ASN 197.A HD21 3.286 2.551 ASN 197.A ND2 ASN 197.A O ASN 197.A HD22 2.727 1.946 MET 198.A N ASP 194.A O MET 198.A H 3.090 2.323 ASP 199.A N TYR 195.A O ASP 199.A H 2.971 2.132 GLU 200.A N LEU 196.A O GLU 200.A H 2.852 2.094 GLY 201.A N MET 198.A O GLY 201.A H 3.257 2.517 ARG 202.A N ASP 199.A O ARG 202.A H 2.940 2.283 ARG 202.A NH2 ASP 100.A OD1 ARG 202.A HH21 3.501 2.886 ARG 202.A NH2 ASP 100.A OD2 ARG 202.A HH21 2.965 2.189 ARG 202.A NH2 ASP 199.A OD1 ARG 202.A HH22 2.850 2.103 HIS 203.A N ASP 199.A O HIS 203.A H 3.424 2.615 HIS 203.A ND1 TYR 161.A OH no hydrogen 3.061 N/A HIS 203.A ND1 GLU 200.A OE2 no hydrogen 2.960 N/A HIS 203.A NE2 ASP 100.A OD2 HIS 203.A HE2 2.762 1.920 ILE 204.A N GLU 200.A O ILE 204.A H 2.990 2.139 GLN 205.A N GLY 201.A O GLN 205.A H 3.138 2.381 PHE 206.A N ARG 202.A O PHE 206.A H 2.932 2.109 GLY 207.A N HIS 203.A O GLY 207.A H 3.142 2.354 ILE 208.A N ILE 204.A O ILE 208.A H 2.982 2.183 TYR 209.A N GLN 205.A O TYR 209.A H 2.921 2.067 THR 210.A N PHE 206.A O THR 210.A H 2.916 2.084 THR 210.A OG1 PHE 206.A O THR 210.A HG1 2.899 2.176 ILE 211.A N GLY 207.A O ILE 211.A H 2.916 2.093 GLN 212.A N ILE 208.A O GLN 212.A H 2.789 1.946 GLN 212.A NE2 GLN 212.A O GLN 212.A HE21 3.514 2.984 GLN 212.A NE2 ASN 216.A OD1 GLN 212.A HE21 3.051 2.230 GLN 212.A NE2 SER 282.A O GLN 212.A HE22 2.472 1.691 ARG 213.A N TYR 209.A O ARG 213.A H 3.032 2.203 ILE 214.A N THR 210.A O ILE 214.A H 3.343 2.557 VAL 215.A N ILE 211.A O VAL 215.A H 3.017 2.208 ASN 216.A N GLN 212.A O ASN 216.A H 2.726 1.938 GLU 217.A N ILE 214.A O GLU 217.A H 3.233 2.432 ARG 220.A N ASP 218.A OD1 ARG 220.A H 3.121 2.293 TYR 221.A N ASP 218.A O TYR 221.A H 3.369 2.535 TYR 222.A N GLU 219.A O TYR 222.A H 2.931 2.259 LEU 224.A N ARG 220.A O LEU 224.A H 3.222 2.489 PHE 225.A N TYR 221.A O PHE 225.A H 2.943 2.086 ILE 226.A N TYR 222.A O ILE 226.A H 3.118 2.271 ARG 227.A N GLU 223.A O ARG 227.A H 2.886 2.056 TYR 228.A N LEU 224.A O TYR 228.A H 2.860 2.044 MET 229.A N PHE 225.A O MET 229.A H 3.003 2.153 ASP 230.A N ILE 226.A O ASP 230.A H 2.920 2.066 GLU 231.A N ARG 227.A O GLU 231.A H 2.877 2.086 LEU 232.A N TYR 228.A O LEU 232.A H 3.246 2.566 LEU 232.A N MET 229.A O LEU 232.A H 2.930 2.178 TRP 233.A N MET 229.A O TRP 233.A H 3.111 2.474 TRP 233.A N ASP 230.A O TRP 233.A H 3.104 2.410 HIS 235.A N LEU 232.A O HIS 235.A H 2.864 2.146 HIS 235.A ND1 HIS 129.A ND1 HIS 235.A HD1 2.974 2.197 VAL 236.A N LEU 232.A O VAL 236.A H 3.094 2.277 ILE 237.A N TRP 233.A O ILE 237.A H 2.820 1.993 GLY 238.A N PRO 234.A O GLY 238.A H 3.041 2.228 TYR 239.A N HIS 235.A O TYR 239.A H 3.164 2.450 TYR 239.A N VAL 236.A O TYR 239.A H 3.237 2.561 VAL 240.A N VAL 236.A O VAL 240.A H 3.066 2.255 ASP 241.A N ILE 237.A O ASP 241.A H 2.746 1.893 TYR 242.A N GLY 238.A O TYR 242.A H 3.196 2.380 LEU 243.A N TYR 239.A O LEU 243.A H 2.910 2.076 THR 244.A N VAL 240.A O THR 244.A H 2.691 1.848 THR 244.A OG1 VAL 240.A O THR 244.A HG1 3.326 2.711 GLU 245.A N ASP 241.A O GLU 245.A H 2.798 1.939 LEU 246.A N TYR 242.A O LEU 246.A H 3.209 2.599 LEU 246.A N LEU 243.A O LEU 246.A H 3.198 2.511 GLY 247.A N LEU 243.A O GLY 247.A H 3.147 2.358 LYS 248.A N THR 244.A O LYS 248.A H 3.004 2.172 GLN 250.A N GLY 247.A O GLN 250.A H 3.266 2.461 ARG 255.A N GLN 251.A O ARG 255.A H 2.822 1.977 THR 256.A N GLN 252.A O THR 256.A H 2.922 2.081 THR 256.A OG1 GLN 252.A O THR 256.A HG1 2.969 2.212 TYR 257.A N LEU 253.A O TYR 257.A H 3.158 2.335 ALA 258.A N ARG 255.A O ALA 258.A H 2.967 2.181 LEU 259.A N ALA 254.A O LEU 259.A H 2.784 1.963 LEU 265.A N ASP 262.A O LEU 265.A H 3.117 2.296 LEU 266.A N ASP 262.A O LEU 266.A H 3.262 2.434 ARG 267.A N TYR 263.A O ARG 267.A H 2.927 2.067 ARG 267.A NH1 ASP 241.A OD1 ARG 267.A HH11 2.590 1.971 HIS 268.A ND1 ASP 264.A O HIS 268.A HD1 2.456 1.624 TYR 269.A N LEU 265.A O TYR 269.A H 2.892 2.090 VAL 270.A N LEU 266.A O VAL 270.A H 3.003 2.217 ILE 271.A N ARG 267.A O ILE 271.A H 3.131 2.382 LYS 272.A N HIS 268.A O LYS 272.A H 2.732 1.932 GLN 273.A N TYR 269.A O GLN 273.A H 2.749 1.952 GLN 273.A NE2 TYR 269.A OH GLN 273.A HE21 2.951 2.278 PHE 274.A N VAL 270.A O PHE 274.A H 2.886 2.034 ASN 275.A N ILE 271.A O ASN 275.A H 2.983 2.159 LEU 276.A N LYS 272.A O LEU 276.A H 3.120 2.311 ARG 277.A N GLN 273.A O ARG 277.A H 3.043 2.265 ARG 277.A NE GLY 166.A O ARG 277.A HE 2.746 1.900 ARG 277.A NH1 GLN 280.A OE1 ARG 277.A HH11 2.965 2.113 ARG 277.A NH2 GLY 166.A O ARG 277.A HH21 3.268 2.601 LYS 278.A NZ ASP 230.A OD1 LYS 278.A HZ1 2.403 1.713 LYS 278.A NZ ASP 230.A OD2 LYS 278.A HZ1 3.342 2.486 LYS 279.A N ASN 275.A O LYS 279.A H 3.195 2.382 GLN 280.A N LEU 276.A O GLN 280.A H 3.040 2.432 GLN 280.A N ARG 277.A O GLN 280.A H 3.159 2.444 ILE 281.A N LYS 278.A O ILE 281.A H 3.128 2.278 THR 284.A N SER 282.A OG THR 284.A H 3.061 2.211