Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5oyv_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.847 2.123 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.785 1.922 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 3.011 2.213 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.940 2.122 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.653 1.875 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.964 2.122 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.852 2.039 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.513 2.914 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.868 2.201 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.904 2.120 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.930 2.128 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 2.998 2.205 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.317 2.461 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.048 2.194 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.657 1.864 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.851 2.023 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.898 2.100 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.811 2.033 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.952 2.143 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.015 2.182 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.827 2.007 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.773 1.927 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.044 2.248 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.709 2.035 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.772 1.940 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.005 2.151 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.982 2.168 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.804 1.943 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.916 2.079 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.891 2.055 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.917 2.090 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.932 2.131 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.774 2.205 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.901 2.090 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.283 2.431 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.569 1.934 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.678 1.902 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.974 2.260 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.870 2.097 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.946 2.121 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.892 2.065 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.690 1.881 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.921 2.162 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.977 2.189 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.045 2.205 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.781 2.079 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.972 2.126 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.916 2.081 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.855 2.020 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.110 2.257 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.768 1.937 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.036 2.200 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.925 2.149 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.898 2.104 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.899 2.051 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.730 1.960 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.823 1.989 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.051 2.223 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.968 2.122 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.754 1.945 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.303 2.686 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.873 2.065 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.642 1.900 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.326 2.508 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H 2.976 2.183 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.846 1.998 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.075 2.230 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.896 2.082 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.046 2.272 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.238 2.468 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.296 2.525 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.931 2.095 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.803 1.954 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.833 2.003 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 3.001 2.151 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.722 1.934 SER 84.A N SER 113.A OG SER 84.A H 2.896 2.076 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.147 2.360 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 3.024 2.225 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.087 2.287 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.154 2.513 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.985 2.130 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.597 1.802 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.801 1.999 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.963 2.197 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.746 2.018 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.889 2.049 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.848 2.031 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.837 2.045 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.970 2.115 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.695 1.862 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.814 1.960 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.969 2.285 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.138 2.314 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.165 2.380 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.744 1.892 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.846 1.995 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.838 2.096 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 3.023 2.172 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.777 2.014 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.129 2.293 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.958 2.145 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.836 2.082 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 3.033 2.340 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.324 2.499 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.653 1.850 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.866 2.070 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.116 2.311 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.143 2.310 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.828 1.992 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.899 2.054 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.928 2.208 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 3.022 2.192 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.021 2.330 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.844 2.026 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.867 2.012 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.029 2.185 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.032 2.172 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.958 2.109 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.989 2.133 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.054 2.295 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.104 2.351 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.734 1.911 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.980 2.147 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.876 2.053 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.808 2.009 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.886 2.168 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.885 2.029 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.890 2.034 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.049 2.220 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H 2.956 2.105 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.910 2.084 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.814 1.988 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.984 2.230 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.887 2.130 LEU 152.A N ALA 148.A O LEU 152.A H 3.248 2.621 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H 3.165 2.421 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.982 2.206 SER 154.A N GLY 172.A O SER 154.A H 3.147 2.503 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.803 2.128 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.043 2.235 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.825 2.036 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.873 2.067 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.916 2.141 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.264 2.625 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.780 1.925 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.805 1.977 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.892 2.104 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.883 2.064 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.153 2.396 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.823 1.975 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.809 1.975 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.918 2.119 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.614 1.777 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.052 2.211 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.961 2.145 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.910 2.071 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.754 1.998 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.831 2.040 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.250 2.393 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 2.879 2.095 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.867 2.037 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.886 2.040 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.884 2.057 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD2 THR 198.A HG1 2.505 1.792 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.833 2.068 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.725 1.910 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.215 2.427 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.764 1.940 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.074 2.313 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.941 2.165 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.791 1.939 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.889 2.055 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.770 1.920 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.050 2.275 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.900 2.071 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.886 2.073 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 3.006 2.255 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.962 2.131 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.052 2.196 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.875 2.057 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.734 2.178 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.862 2.113 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.254 2.397 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD1 THR 222.A HG1 2.709 2.110 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.609 1.916 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.048 2.190 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.929 2.089 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 3.012 2.223 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.047 2.208 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.902 2.074 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.070 2.246 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.061 2.291 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.705 1.873 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.051 2.207 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.863 2.043 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.952 2.145 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 2.955 2.116 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.012 2.173 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.137 2.283 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.045 2.234 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.878 2.018 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.016 2.191 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.771 1.956 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.110 2.350 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.780 1.960 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.899 2.065 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.900 2.161 CYS 255.A SG PHE 253.A O no hydrogen 4.031 N/A CYS 255.A SG SER 288.A O no hydrogen 2.769 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.749 1.905 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.937 2.140 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.902 2.054 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.920 2.131 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.869 2.091 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.951 2.113 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.806 2.034 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.108 2.420 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.924 2.155 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.936 2.087 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.782 1.929 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H 2.979 2.191 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.949 2.107 ASP 279.A N ASP 276.A O ASP 279.A H 3.309 2.455 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.962 2.156 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.890 2.045 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.850 2.069 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.957 2.110 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H 2.989 2.136 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.751 1.922 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.804 1.988 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.009 2.163 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.747 2.065 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.909 2.079 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.113 2.284 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.830 2.018 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.820 2.003 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.625 1.823 ALA 298.A N SER 296.A OG ALA 298.A H 3.021 2.166 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H 2.822 1.974 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.827 1.991 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.883 2.078 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.775 2.018 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.751 1.935 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.046 2.327 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.999 2.372 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.957 2.111 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H 2.835 1.991 LYS 311.A NZ ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3 2.751 1.897 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.133 2.340 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.968 2.136 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.819 1.999 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.067 2.234 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.772 1.947 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.811 1.977 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.981 2.172 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.866 2.030 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.741 2.003 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.032 2.252 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.112 2.371 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.046 2.200 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.851 2.029 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.956 2.142 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.890 2.080 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.765 1.914 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.803 2.041 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.106 2.524 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.805 1.938