Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5oyx_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.860 2.040 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.700 1.819 SER 1.A OG SER 151.A O SER 1.A HG 3.126 2.289 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 3.059 2.266 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.975 2.164 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.573 1.804 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.948 2.108 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.825 2.006 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.505 2.903 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.829 2.165 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.891 2.073 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.930 2.132 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 2.998 2.223 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.322 2.473 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.114 2.262 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.697 1.888 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.904 2.076 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.880 2.088 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.797 2.043 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.920 2.110 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.044 2.217 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.784 1.967 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.792 1.946 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.041 2.247 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.747 2.086 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.759 1.922 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 2.908 2.053 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.921 2.114 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.803 1.944 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.936 2.100 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.891 2.047 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.958 2.132 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.899 2.110 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.831 2.261 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.900 2.092 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.277 2.424 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.684 1.914 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.950 2.261 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.910 2.126 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.909 2.092 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.896 2.079 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.701 1.883 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.894 2.131 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 3.008 2.203 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.051 2.215 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.720 2.031 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.962 2.118 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.964 2.126 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.853 2.016 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.122 2.269 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.802 1.980 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 2.987 2.157 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 3.005 2.205 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.951 2.164 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.907 2.059 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.728 1.953 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.820 1.978 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.066 2.235 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.952 2.106 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.776 1.973 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.347 2.727 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.859 2.053 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.657 1.916 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.311 2.485 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H 2.954 2.163 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.862 2.012 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.030 2.193 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.921 2.097 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.080 2.300 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.226 2.456 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.323 2.566 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.916 2.074 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.813 1.969 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.889 2.071 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 2.994 2.143 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.747 1.957 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.116 2.328 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 2.992 2.228 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.024 2.228 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.111 2.501 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.914 2.059 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.571 1.761 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.768 1.951 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.925 2.139 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.704 1.961 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.879 2.041 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.824 2.012 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.797 2.007 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.999 2.151 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.715 1.879 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.786 1.933 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.980 2.317 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.174 2.349 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.161 2.374 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.692 1.842 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.888 2.041 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.755 1.988 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.991 2.157 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.775 2.002 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.102 2.255 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.991 2.177 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.842 2.088 SER 113.A OG SER 84.A O SER 113.A HG 3.371 2.679 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 3.011 2.300 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.379 2.553 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.709 1.925 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.863 2.059 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.033 2.240 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.176 2.352 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.896 2.069 ILE 122.A N ASP 119.A O ILE 122.A H 3.417 2.562 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.924 2.079 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.883 2.196 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 3.031 2.206 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.081 2.409 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.877 2.077 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.858 2.003 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.062 2.212 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.008 2.149 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.955 2.103 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.964 2.104 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.080 2.318 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.067 2.307 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.734 1.911 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.911 2.069 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.863 2.023 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.850 2.205 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.850 1.999 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.918 2.065 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.886 2.034 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.058 2.236 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H 3.033 2.185 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.951 2.128 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.850 2.011 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.999 2.248 LYS 149.A N PHE 145.A O LYS 149.A H 2.866 2.272 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.880 2.137 LEU 152.A N ALA 148.A O LEU 152.A H 3.202 2.588 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H 3.195 2.458 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.944 2.147 SER 154.A N GLY 172.A O SER 154.A H 3.175 2.567 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.756 2.064 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.032 2.226 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.759 1.973 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.842 2.029 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.899 2.107 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.233 2.578 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.780 1.934 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.777 1.939 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.861 2.069 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.871 2.054 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.122 2.356 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.847 1.997 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.752 1.911 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.901 2.089 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.390 2.825 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.671 1.834 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.077 2.237 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.946 2.123 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.917 2.071 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.708 1.960 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.840 2.043 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.261 2.405 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 2.939 2.098 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.798 1.975 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.884 2.039 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.856 2.032 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.864 2.114 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.737 1.916 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.212 2.428 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.780 1.960 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.066 2.302 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.962 2.187 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.788 1.936 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.868 2.045 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.745 1.889 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.049 2.262 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.930 2.102 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.918 2.091 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 2.996 2.249 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.972 2.140 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 2.996 2.141 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.822 2.009 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.727 2.167 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.849 2.089 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.320 2.464 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD1 THR 222.A HG1 2.612 2.021 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.634 1.926 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.042 2.183 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.895 2.055 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.987 2.187 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.047 2.209 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.879 2.049 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.045 2.238 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 2.995 2.227 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.720 1.895 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.040 2.204 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.863 2.034 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 3.002 2.221 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.016 2.173 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 2.988 2.148 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.083 2.231 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.012 2.208 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.832 1.976 SER 247.A OG SER 245.A OG SER 247.A HG 2.884 2.203 VAL 248.A N SER 245.A O VAL 248.A H 3.225 2.603 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.032 2.249 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.739 2.022 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.067 2.273 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.825 1.984 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.893 2.058 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.878 2.129 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 3.165 2.313 CYS 255.A SG SER 288.A O no hydrogen 2.827 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.755 1.907 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.933 2.127 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.903 2.051 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.985 2.209 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.881 2.113 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.950 2.117 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.752 1.973 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.121 2.408 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.924 2.185 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.965 2.120 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.813 1.970 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H 2.971 2.203 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.965 2.120 ASP 279.A N ASP 276.A O ASP 279.A H 3.331 2.478 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.931 2.125 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.815 1.985 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.866 2.085 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.929 2.079 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H 2.978 2.125 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.786 1.938 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.836 2.025 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.040 2.210 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.739 2.071 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.900 2.071 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.048 2.222 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.834 2.013 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.827 2.016 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.587 1.787 ALA 298.A N SER 296.A OG ALA 298.A H 3.041 2.189 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H 2.858 2.009 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.776 1.948 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.863 2.056 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.764 2.018 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.788 1.971 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.076 2.335 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 3.011 2.360 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.971 2.122 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H 2.820 1.974 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.058 2.261 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.908 2.081 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.813 1.996 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.033 2.193 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.793 1.963 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.821 1.973 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 3.032 2.234 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.879 2.031 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.791 2.031 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.103 2.306 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.067 2.330 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.032 2.180 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.909 2.086 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.914 2.090 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.899 2.099 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.742 1.902 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.758 2.001 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.208 2.619 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.781 1.927