Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5p53_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.812 2.001 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.786 1.910 SER 1.A OG SER 151.A O SER 1.A HG 3.037 2.200 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.985 2.189 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.983 2.169 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.630 1.842 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.924 2.086 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.865 2.048 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.475 2.862 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.875 2.222 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.913 2.127 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.889 2.097 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.042 2.263 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.292 2.440 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.051 2.197 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.700 1.891 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.881 2.056 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.887 2.105 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.817 2.047 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.929 2.101 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.012 2.185 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.840 2.017 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.821 1.981 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.035 2.238 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.762 2.119 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.816 1.994 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 2.996 2.141 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.927 2.115 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.818 1.959 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.934 2.097 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.898 2.060 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.888 2.063 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.911 2.097 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.768 2.210 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.934 2.113 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.296 2.442 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.614 1.976 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.686 1.909 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.961 2.252 TRP 42.A NE1 TYR 79.A OH TRP 42.A HE1 2.820 2.118 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.872 2.101 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.944 2.123 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.891 2.091 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.666 1.849 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.922 2.182 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.956 2.150 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.057 2.214 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.713 2.009 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.955 2.098 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.842 2.007 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.858 2.029 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.115 2.264 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.751 1.936 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.014 2.192 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.980 2.195 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.898 2.140 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.919 2.070 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.715 1.934 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.833 1.999 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.035 2.209 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.973 2.126 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.757 1.955 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.332 2.694 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.825 2.012 THR 65.A OG1 THR 25.A O THR 65.A HG1 3.381 2.550 THR 66.A N SER 64.A OG THR 66.A H 3.395 2.613 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.626 1.885 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.321 2.480 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H 2.981 2.198 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.831 1.977 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.122 2.272 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.885 2.069 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.033 2.252 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.214 2.456 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.292 2.526 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.898 2.066 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.857 2.019 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.916 2.076 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 2.979 2.129 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.689 1.888 SER 84.A N SER 113.A OG SER 84.A H 2.937 2.133 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.124 2.336 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 3.026 2.232 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.030 2.232 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.134 2.491 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.939 2.081 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.605 1.793 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.817 2.021 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.994 2.229 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.739 2.000 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.908 2.070 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.812 1.992 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.860 2.067 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.964 2.109 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.722 1.887 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.825 1.970 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.991 2.334 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.152 2.325 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.215 2.435 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.726 1.877 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.862 2.012 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.825 2.080 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.989 2.138 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.781 2.020 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.163 2.325 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.946 2.132 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.873 2.107 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 2.992 2.316 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.252 2.424 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.709 1.899 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.864 2.064 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.099 2.302 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.106 2.281 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.785 1.947 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.889 2.043 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.889 2.165 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.991 2.162 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.018 2.350 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.862 2.053 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.880 2.023 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.027 2.178 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.037 2.178 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.950 2.100 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.975 2.120 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.067 2.312 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.021 2.266 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.740 1.914 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.985 2.155 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.848 2.018 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.936 2.256 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.904 2.054 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.908 2.056 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.939 2.085 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.033 2.209 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H 2.989 2.135 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.921 2.082 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.813 1.981 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.924 2.157 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.913 2.157 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H 3.142 2.368 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.957 2.182 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.797 2.108 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.028 2.221 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.827 2.040 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.874 2.075 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.909 2.149 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.236 2.585 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.807 1.956 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.792 1.963 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.888 2.105 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.872 2.058 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.149 2.385 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.800 1.956 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.813 1.977 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.947 2.130 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.425 2.868 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.674 1.840 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.009 2.167 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.927 2.098 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.910 2.064 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.789 2.035 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.848 2.064 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.239 2.387 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE1 GLN 192.A HE21 3.223 2.611 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 3.036 2.258 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.897 2.071 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.907 2.063 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.861 2.033 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD2 THR 198.A HG1 2.394 1.687 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.828 2.068 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.774 1.956 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.234 2.444 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.766 1.934 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.057 2.299 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.957 2.182 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.798 1.949 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.878 2.048 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.763 1.910 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.027 2.245 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.913 2.089 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.865 2.047 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 2.996 2.241 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.963 2.134 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.009 2.157 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.908 2.091 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.776 2.227 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.940 2.191 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.222 2.366 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD1 THR 222.A HG1 2.714 2.111 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.659 1.928 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.067 2.208 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.902 2.062 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.985 2.194 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.054 2.221 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.916 2.082 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.097 2.281 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.048 2.266 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.721 1.886 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.029 2.187 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.883 2.054 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.952 2.166 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.012 2.175 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 2.990 2.150 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.070 2.215 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.002 2.195 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.863 2.004 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.004 2.195 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.833 2.007 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.089 2.344 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.763 1.943 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.883 2.044 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.868 2.095 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.902 2.054 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.834 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.884 2.035 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.951 2.148 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.882 2.033 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.930 2.147 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.875 2.086 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.946 2.116 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.804 2.044 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.073 2.377 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.901 2.124 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.915 2.066 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.768 1.916 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H 2.946 2.175 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.942 2.106 ASP 279.A N ASP 276.A O ASP 279.A H 3.271 2.420 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.984 2.181 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.851 2.035 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.839 2.050 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.980 2.129 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H 2.983 2.129 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.793 1.941 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.793 1.992 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.018 2.171 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.752 2.120 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.883 2.057 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.056 2.226 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.835 2.017 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.813 1.999 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.629 1.828 ALA 298.A N SER 296.A OG ALA 298.A H 3.032 2.177 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H 2.821 1.974 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.843 2.009 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.866 2.063 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.781 2.018 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.767 1.952 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.075 2.340 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.991 2.371 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.956 2.114 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H 2.842 2.001 LYS 311.A NZ ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3 2.838 1.969 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.153 2.360 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.976 2.151 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.827 2.015 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.050 2.226 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.771 1.943 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.810 1.972 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.942 2.135 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.908 2.061 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.771 2.027 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.086 2.284 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.080 2.345 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.049 2.201 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.838 2.020 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.923 2.107 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.929 2.122 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.780 1.948 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.839 2.097 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.142 2.543 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.808 1.955