Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5p54_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.825 1.972 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.776 1.941 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.986 2.189 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.968 2.153 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.615 1.839 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.921 2.085 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.873 2.054 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.489 2.883 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.882 2.223 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.905 2.109 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.900 2.105 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.030 2.260 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.276 2.420 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.051 2.200 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.703 1.893 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.864 2.040 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.892 2.105 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.826 2.052 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.928 2.112 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.010 2.182 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.831 2.011 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.801 1.961 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.050 2.256 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.772 2.115 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.804 1.988 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.012 2.157 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.940 2.129 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.800 1.940 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.951 2.117 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.897 2.059 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.886 2.058 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.908 2.099 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.775 2.213 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.910 2.091 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.300 2.449 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.618 2.004 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.681 1.901 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.958 2.244 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.882 2.104 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.955 2.132 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.884 2.080 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.701 1.888 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.933 2.187 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.950 2.156 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.063 2.225 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.720 2.020 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.958 2.103 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.886 2.054 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.846 2.013 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.121 2.270 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.758 1.947 GLN 56.A N GLN 56.A OE1 GLN 56.A H 2.854 2.079 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 2.984 2.159 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.974 2.189 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.889 2.127 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.934 2.085 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.712 1.931 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.831 1.999 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.033 2.205 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.982 2.136 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.775 1.974 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.339 2.691 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.837 2.026 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.614 1.876 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.281 2.444 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H 2.962 2.177 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.828 1.975 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.103 2.255 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.876 2.058 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.033 2.257 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.188 2.419 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.304 2.537 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.909 2.083 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.835 1.993 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.894 2.044 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 3.092 2.238 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.811 2.014 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.113 2.334 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 3.003 2.204 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.028 2.232 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.107 2.458 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.932 2.076 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.652 1.842 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.805 2.013 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 3.004 2.243 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.731 1.995 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.913 2.073 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.819 2.000 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.867 2.075 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.956 2.101 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.701 1.869 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.823 1.968 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.985 2.319 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.127 2.299 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.193 2.414 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.739 1.888 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.860 2.011 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.812 2.072 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.996 2.144 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.792 2.042 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.145 2.306 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.954 2.138 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.851 2.089 SER 113.A OG SER 84.A O SER 113.A HG 3.254 2.543 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 2.974 2.300 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.267 2.443 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.686 1.881 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.888 2.089 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.074 2.279 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.146 2.326 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.779 1.947 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.897 2.049 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.906 2.186 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.992 2.163 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.000 2.324 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.858 2.041 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.887 2.030 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.043 2.193 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.027 2.167 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.952 2.099 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.962 2.108 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.042 2.283 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.033 2.279 THR 135.A N ASP 40.A OD2 THR 135.A H 3.429 2.614 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.740 1.912 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.986 2.156 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.853 2.025 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.930 2.261 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.930 2.083 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.901 2.047 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.939 2.083 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.030 2.204 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H 2.975 2.124 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.917 2.079 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.830 2.001 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.940 2.181 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.916 2.169 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H 3.184 2.433 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.953 2.186 SER 154.A N GLY 172.A O SER 154.A H 3.141 2.542 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.805 2.132 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.041 2.238 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.835 2.044 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.877 2.071 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.911 2.150 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.224 2.559 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.816 1.971 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.794 1.966 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.885 2.102 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.881 2.066 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.147 2.379 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.796 1.952 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.816 1.988 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.922 2.108 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.655 1.820 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.057 2.213 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.929 2.107 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.929 2.086 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.790 2.039 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.840 2.055 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.276 2.423 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE1 GLN 192.A HE21 3.275 2.676 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 3.080 2.357 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.898 2.075 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.903 2.061 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.852 2.021 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD2 THR 198.A HG1 2.483 1.773 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.844 2.090 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.744 1.926 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.247 2.461 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.755 1.926 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.073 2.312 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.947 2.174 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.784 1.933 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.889 2.063 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.764 1.909 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.032 2.256 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.924 2.102 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.880 2.060 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 2.995 2.245 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.958 2.130 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 2.994 2.140 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.898 2.078 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.762 2.206 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.919 2.183 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.237 2.381 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD1 THR 222.A HG1 2.733 2.132 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.680 1.940 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.072 2.212 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.909 2.067 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.990 2.199 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.053 2.216 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.913 2.075 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.096 2.273 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.046 2.258 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.730 1.896 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.030 2.185 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.864 2.034 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.957 2.171 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.003 2.167 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 2.989 2.153 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.071 2.217 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.008 2.203 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.855 1.997 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 2.999 2.171 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.866 2.047 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.111 2.378 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.785 1.969 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.890 2.052 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.864 2.093 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.879 2.032 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.955 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.897 2.049 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.939 2.134 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.901 2.051 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.929 2.144 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.862 2.067 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.927 2.090 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.802 2.044 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.049 2.343 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.900 2.127 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.907 2.056 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.740 1.888 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H 2.943 2.164 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.914 2.075 ASP 279.A N ASP 276.A O ASP 279.A H 3.303 2.450 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.966 2.166 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.836 2.014 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.836 2.050 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.983 2.133 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H 3.002 2.147 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.781 1.929 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.815 2.013 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.015 2.167 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.753 2.123 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.902 2.075 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.030 2.202 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.851 2.039 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.814 1.997 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.612 1.816 ALA 298.A N SER 296.A OG ALA 298.A H 3.011 2.157 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H 2.821 1.977 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.841 2.005 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.872 2.069 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.782 2.016 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.776 1.967 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.071 2.334 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.988 2.365 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.974 2.132 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H 2.848 2.006 LYS 311.A NZ ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2 2.780 1.914 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.136 2.347 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.971 2.149 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.828 2.010 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.053 2.228 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.794 1.971 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.789 1.947 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.939 2.129 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.885 2.038 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.772 2.027 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.104 2.310 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.076 2.340 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.072 2.225 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.829 2.012 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.910 2.099 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.909 2.104 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.770 1.926 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.827 2.076 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.150 2.552 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.797 1.937