Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5p5v_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.833 1.984 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.783 1.927 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.982 2.184 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.976 2.161 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.643 1.873 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.917 2.080 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.867 2.049 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.484 2.871 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.877 2.224 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.907 2.114 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.911 2.112 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.038 2.274 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.273 2.420 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.058 2.207 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.689 1.876 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.870 2.043 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.899 2.103 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.828 2.055 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.934 2.116 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.023 2.198 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.841 2.023 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.824 1.985 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.043 2.243 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.764 2.105 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.795 1.979 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.002 2.147 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.938 2.129 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.804 1.944 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.948 2.114 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.899 2.062 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.898 2.071 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.919 2.107 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.792 2.227 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.919 2.102 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.295 2.444 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.621 2.004 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.697 1.922 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.971 2.261 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.883 2.106 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.960 2.136 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.893 2.082 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.703 1.894 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.927 2.176 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.956 2.166 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.066 2.220 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.737 2.034 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.963 2.105 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.867 2.034 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.861 2.031 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.156 2.305 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.763 1.948 GLN 56.A N GLN 56.A OE1 GLN 56.A H 2.850 2.081 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 2.995 2.168 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.996 2.213 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.885 2.121 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.940 2.091 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.706 1.926 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.840 2.003 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.029 2.208 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.971 2.126 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.788 1.987 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.336 2.695 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.842 2.032 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.637 1.898 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.268 2.435 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H 2.979 2.188 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.847 1.993 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.125 2.277 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.892 2.068 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.052 2.272 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.195 2.427 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.310 2.537 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.912 2.086 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.850 2.007 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.905 2.060 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 3.094 2.239 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.826 2.023 SER 84.A N SER 113.A OG SER 84.A H 2.977 2.169 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.149 2.369 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 2.997 2.202 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.036 2.240 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.119 2.482 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.936 2.078 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.675 1.862 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.820 2.024 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.985 2.224 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.757 2.025 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.903 2.063 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.825 2.006 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.872 2.079 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.954 2.098 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.708 1.874 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.845 1.991 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.973 2.322 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.144 2.317 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.194 2.415 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.738 1.889 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.867 2.017 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.818 2.080 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.991 2.143 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.796 2.050 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.142 2.302 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.964 2.148 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.856 2.091 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 2.995 2.319 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.278 2.452 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.713 1.912 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.907 2.109 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.084 2.290 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.113 2.295 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.788 1.954 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.901 2.055 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.904 2.178 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.992 2.165 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.009 2.335 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.859 2.043 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.888 2.032 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.039 2.189 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.027 2.167 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.958 2.106 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.968 2.113 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.058 2.300 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.029 2.273 THR 135.A N ASP 40.A OD2 THR 135.A H 3.438 2.624 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.742 1.916 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.975 2.146 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.855 2.026 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.960 2.292 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.914 2.072 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.928 2.074 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.955 2.101 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.028 2.203 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H 2.973 2.126 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.914 2.073 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.832 2.005 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.949 2.184 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.909 2.154 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H 3.177 2.419 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.955 2.182 SER 154.A N GLY 172.A O SER 154.A H 3.134 2.532 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.809 2.120 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.045 2.236 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.838 2.045 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.873 2.072 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.903 2.145 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.224 2.571 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.813 1.963 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.785 1.956 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.893 2.108 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.880 2.068 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.159 2.389 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.806 1.963 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.818 1.997 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.917 2.099 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.381 2.815 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.674 1.837 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.060 2.219 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.931 2.110 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.911 2.069 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.793 2.044 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.842 2.063 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.269 2.417 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.910 2.086 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.905 2.061 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.865 2.033 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD2 THR 198.A HG1 2.541 1.827 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.847 2.090 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.757 1.940 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.249 2.466 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.763 1.934 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.056 2.297 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.942 2.166 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.800 1.949 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.884 2.057 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.766 1.910 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.051 2.283 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.913 2.091 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.879 2.061 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 3.003 2.253 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.960 2.131 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 2.997 2.143 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.899 2.078 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.776 2.220 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.907 2.165 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.234 2.378 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD1 THR 222.A HG1 2.759 2.153 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.686 1.952 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.065 2.206 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.917 2.076 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.996 2.203 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.067 2.233 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.931 2.095 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.094 2.270 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.043 2.255 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.734 1.901 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.023 2.177 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.873 2.041 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.953 2.161 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.012 2.176 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 2.989 2.150 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.067 2.211 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.027 2.222 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.862 2.002 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.006 2.182 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.870 2.051 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.122 2.377 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.782 1.961 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.908 2.072 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.875 2.109 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.873 2.027 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.964 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.908 2.060 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.945 2.141 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.899 2.051 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.940 2.156 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.881 2.089 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.949 2.115 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.802 2.034 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.073 2.369 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.913 2.138 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.926 2.075 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.758 1.907 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H 2.937 2.163 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.935 2.095 ASP 279.A N ASP 276.A O ASP 279.A H 3.300 2.445 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.982 2.181 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.847 2.018 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.833 2.044 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.963 2.112 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H 2.995 2.141 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.787 1.933 CYS 290.A SG ASP 279.A OD2 no hydrogen 3.911 N/A PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.815 2.016 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.015 2.166 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.768 2.140 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.900 2.076 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.026 2.197 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.849 2.032 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.830 2.019 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.644 1.846 ALA 298.A N SER 296.A OG ALA 298.A H 3.033 2.178 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H 2.813 1.971 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.844 2.010 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.880 2.075 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.779 2.013 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.782 1.972 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.070 2.333 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.995 2.372 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.968 2.124 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H 2.850 2.006 LYS 311.A NZ ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2 2.814 1.953 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.146 2.356 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.963 2.140 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.843 2.028 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.039 2.212 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.795 1.969 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.796 1.954 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.963 2.153 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.896 2.057 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.767 2.028 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.094 2.288 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.090 2.356 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.080 2.232 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.842 2.021 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.901 2.084 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.927 2.121 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.776 1.938 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.842 2.093 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.147 2.545 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.812 1.953