Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5p87_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.842 1.992 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.779 1.926 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.990 2.191 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.957 2.137 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.630 1.857 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.946 2.106 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.879 2.058 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.484 2.882 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.872 2.211 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.886 2.102 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.907 2.113 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.037 2.278 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.260 2.406 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.073 2.220 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.663 1.853 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.869 2.039 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.892 2.100 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.809 2.041 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.907 2.082 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.023 2.191 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.852 2.031 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.805 1.968 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.029 2.238 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.748 2.088 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.782 1.967 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.009 2.157 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.926 2.115 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.803 1.944 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.907 2.072 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.898 2.062 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.871 2.043 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.900 2.101 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.770 2.213 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.892 2.073 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.298 2.444 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.573 1.948 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.676 1.895 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.976 2.275 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.880 2.108 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.947 2.124 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.900 2.094 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.692 1.900 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.924 2.171 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.920 2.119 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.070 2.225 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.703 2.007 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.945 2.090 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.921 2.086 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.822 2.001 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.107 2.256 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.763 1.949 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.048 2.220 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.974 2.186 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.877 2.094 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.944 2.095 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.687 1.909 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.816 1.981 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.008 2.183 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.955 2.110 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.756 1.956 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.328 2.701 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.870 2.064 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.638 1.915 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.224 2.390 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H 2.992 2.190 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.859 2.004 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.125 2.274 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.870 2.047 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.079 2.309 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.199 2.424 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.297 2.515 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.924 2.097 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.818 1.971 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.810 1.962 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 3.063 2.208 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.785 1.996 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.137 2.357 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 2.984 2.191 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.008 2.218 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.062 2.393 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.914 2.057 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.691 1.872 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.793 1.997 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.971 2.212 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.707 1.967 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.914 2.072 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.807 1.989 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.864 2.071 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.963 2.108 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.688 1.855 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.812 1.959 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.981 2.337 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.139 2.317 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.190 2.420 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.741 1.891 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.852 2.005 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.799 2.054 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.977 2.137 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.797 2.042 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.130 2.290 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.896 2.077 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.844 2.073 SER 113.A OG SER 84.A O SER 113.A HG 3.310 2.623 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 2.993 2.322 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.277 2.454 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.725 1.924 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.862 2.078 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.106 2.315 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.098 2.273 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.809 1.973 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.903 2.058 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.909 2.187 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.994 2.168 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.025 2.368 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.856 2.041 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.890 2.033 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.056 2.203 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.014 2.156 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.968 2.114 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.967 2.110 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.061 2.310 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.026 2.266 THR 135.A N ASP 40.A OD2 THR 135.A H 3.411 2.599 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.752 1.924 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.988 2.160 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.851 2.017 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.901 2.234 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.947 2.102 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.906 2.052 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.970 2.121 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.024 2.197 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H 2.968 2.122 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.918 2.092 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.798 1.970 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.935 2.167 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.913 2.176 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H 3.125 2.368 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.969 2.199 SER 154.A N GLY 172.A O SER 154.A H 3.114 2.509 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.790 2.106 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.037 2.233 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.805 2.015 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.876 2.072 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.892 2.139 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.273 2.590 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.839 1.999 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.831 2.010 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.875 2.090 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.877 2.062 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.126 2.358 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.799 1.951 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.792 1.955 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.940 2.132 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.429 2.875 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.676 1.841 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.065 2.224 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.907 2.080 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.930 2.086 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.806 2.052 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.841 2.060 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.265 2.410 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 3.028 2.347 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.880 2.051 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.892 2.049 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.867 2.037 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD2 THR 198.A HG1 2.552 1.859 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.844 2.097 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.749 1.937 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.230 2.452 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.744 1.918 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.051 2.299 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.936 2.162 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.772 1.917 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.893 2.070 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.756 1.901 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.000 2.215 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.901 2.071 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.843 2.025 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 2.997 2.250 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.963 2.131 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.012 2.158 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.898 2.081 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.722 2.174 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.914 2.176 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.220 2.364 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD1 THR 222.A HG1 2.748 2.152 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.626 1.916 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.067 2.207 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.910 2.073 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.977 2.181 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.070 2.235 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.898 2.070 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.098 2.279 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.032 2.246 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.692 1.862 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.034 2.186 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.891 2.060 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.962 2.185 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.022 2.182 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 2.992 2.152 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.077 2.223 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.027 2.221 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.850 1.992 SER 247.A OG SER 245.A OG SER 247.A HG 3.011 2.440 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 2.989 2.154 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.831 2.008 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.059 2.314 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.774 1.953 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.866 2.030 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.871 2.108 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.910 2.068 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.994 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.910 2.066 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.924 2.116 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.897 2.050 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.947 2.163 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.862 2.065 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.938 2.105 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.805 2.055 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.043 2.337 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.905 2.137 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.923 2.073 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.761 1.910 ASP 276.A N ASP 276.A OD1 ASP 276.A H 2.389 1.721 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H 2.977 2.201 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.944 2.106 ASP 279.A N ASP 276.A O ASP 279.A H 3.265 2.411 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 3.006 2.208 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.846 2.015 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.840 2.051 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.957 2.108 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H 3.029 2.175 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.773 1.925 CYS 290.A SG ASP 279.A OD2 no hydrogen 3.898 N/A PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.799 2.002 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.022 2.173 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.750 2.105 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.905 2.085 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.051 2.217 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.830 2.015 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.835 2.017 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.612 1.816 ALA 298.A N SER 296.A OG ALA 298.A H 3.016 2.162 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H 2.832 2.003 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.855 2.023 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.851 2.051 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.786 2.029 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.760 1.943 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.052 2.309 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.974 2.327 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.980 2.137 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H 2.849 2.017 LYS 311.A NZ ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2 2.812 1.962 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.134 2.346 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.952 2.131 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.814 1.996 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.064 2.239 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.785 1.958 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.808 1.969 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.958 2.144 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.888 2.044 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.762 2.013 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.093 2.284 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.073 2.339 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.089 2.241 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.825 2.010 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.921 2.104 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.899 2.095 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.773 1.937 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.829 2.078 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.134 2.537 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.816 1.960