Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5p8b_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.786 2.089 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.713 1.878 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.972 2.180 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.944 2.126 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.659 1.875 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.963 2.121 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.862 2.045 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.476 2.857 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.840 2.196 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.930 2.137 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.934 2.136 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.009 2.257 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.263 2.405 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.121 2.270 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.741 1.942 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.907 2.081 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.861 2.078 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.761 1.981 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.932 2.119 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.073 2.248 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.823 1.997 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.814 1.980 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.029 2.231 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.778 2.132 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.781 1.961 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 2.967 2.116 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.930 2.115 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.832 1.974 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.936 2.103 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.909 2.069 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.946 2.120 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.960 2.181 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.767 2.192 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.878 2.072 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.339 2.491 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.550 1.926 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.913 2.194 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.925 2.152 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.855 2.026 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.912 2.081 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.675 1.871 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.939 2.198 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 3.001 2.200 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.115 2.274 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.785 2.091 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 3.008 2.167 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.920 2.084 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.836 2.014 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.187 2.336 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.725 1.939 GLN 56.A N GLN 56.A OE1 GLN 56.A H 2.861 2.086 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 2.982 2.161 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 3.039 2.262 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.812 2.004 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.914 2.065 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.671 1.884 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.879 2.052 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.084 2.264 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.967 2.122 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.794 2.006 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.332 2.708 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.856 2.048 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.673 1.948 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.278 2.437 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H 2.994 2.195 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.867 2.024 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.053 2.209 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.905 2.077 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.046 2.262 TRP 75.A NE1 ASP 88.A O TRP 75.A HE1 2.922 2.327 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.253 2.479 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.917 2.096 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.821 1.983 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.869 2.026 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 2.995 2.146 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.797 2.029 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.100 2.316 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 3.024 2.240 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.087 2.295 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.109 2.457 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.950 2.092 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.640 1.827 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.847 2.038 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.997 2.232 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.709 1.991 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.893 2.050 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.782 1.962 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.853 2.060 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.946 2.096 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.759 1.937 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.799 1.941 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 3.041 2.382 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.127 2.297 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.250 2.472 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.696 1.845 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.861 2.016 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.747 1.987 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 3.052 2.203 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.767 1.997 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.092 2.250 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.909 2.084 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.855 2.081 SER 113.A OG SER 84.A O SER 113.A HG 3.407 2.713 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 2.937 2.218 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.320 2.499 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.655 1.853 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.869 2.069 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.115 2.340 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.120 2.300 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.858 2.020 ILE 122.A N ASP 119.A O ILE 122.A H 3.414 2.562 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.928 2.080 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.895 2.209 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 3.067 2.237 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.014 2.342 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.809 1.995 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.835 1.978 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.077 2.224 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.018 2.157 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.970 2.118 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 3.010 2.157 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.065 2.315 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.033 2.261 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.783 1.959 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 3.008 2.178 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.899 2.067 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.928 2.260 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.917 2.063 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.924 2.072 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.967 2.116 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.034 2.209 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H 2.944 2.093 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.914 2.117 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.808 1.979 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.945 2.190 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.924 2.184 LEU 152.A N ALA 148.A O LEU 152.A H 3.235 2.608 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H 3.233 2.485 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.999 2.215 SER 154.A N GLY 172.A O SER 154.A H 3.151 2.562 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.787 2.106 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.036 2.254 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.843 2.061 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.881 2.081 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.888 2.129 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.294 2.626 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.862 2.023 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.751 1.915 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.926 2.137 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.876 2.052 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.097 2.318 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.807 1.959 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.744 1.918 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.928 2.127 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.454 2.880 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.682 1.845 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.059 2.227 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.943 2.111 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.891 2.043 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.738 1.987 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.832 2.053 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.257 2.401 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.844 2.014 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.866 2.033 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.861 2.031 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.902 2.134 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.714 1.901 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.219 2.450 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.742 1.921 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.055 2.296 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.949 2.170 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.857 2.000 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.850 2.029 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.742 1.885 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.000 2.216 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.940 2.109 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.904 2.078 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 2.979 2.223 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.969 2.132 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 2.991 2.138 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.901 2.082 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.719 2.143 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.891 2.123 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.221 2.367 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD1 THR 222.A HG1 2.803 2.213 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.636 1.916 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.005 2.145 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.865 2.020 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.982 2.188 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.090 2.260 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.883 2.035 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.040 2.207 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.027 2.250 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.713 1.889 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.027 2.187 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.879 2.049 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 3.001 2.214 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.018 2.177 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.032 2.195 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.025 2.174 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.035 2.219 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.785 1.928 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 2.998 2.181 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.761 1.958 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.080 2.299 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.779 1.956 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.898 2.064 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.887 2.135 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.892 2.042 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.995 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.903 2.067 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.941 2.134 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.885 2.034 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.975 2.204 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.872 2.098 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.989 2.168 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.745 1.962 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.031 2.308 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.814 2.052 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.951 2.101 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.750 1.902 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H 2.982 2.228 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.939 2.099 ASP 279.A N ASP 276.A O ASP 279.A H 3.277 2.425 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 3.016 2.210 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.824 2.003 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.774 1.996 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.887 2.036 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H 2.993 2.142 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.790 1.943 CYS 290.A SG ASP 279.A OD2 no hydrogen 3.901 N/A PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.839 2.036 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.046 2.202 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.798 2.141 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.897 2.067 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.032 2.204 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.835 2.012 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.816 2.007 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.599 1.794 ALA 298.A N SER 296.A OG ALA 298.A H 3.085 2.238 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H 2.824 1.994 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.807 1.977 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.845 2.051 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.748 2.006 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.760 1.948 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.097 2.373 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.969 2.299 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.981 2.134 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H 2.810 1.972 LYS 311.A NZ ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3 2.742 1.888 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.134 2.325 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 3.013 2.178 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.792 1.970 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.055 2.229 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.815 1.977 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.766 1.934 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.980 2.169 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.943 2.113 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.750 1.992 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.071 2.293 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.106 2.375 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.083 2.231 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.933 2.115 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.938 2.126 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.924 2.115 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.764 1.934 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.784 2.040 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.148 2.544 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.845 1.988