Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5r1v_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.848 2.113 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.811 1.964 SER 1.A OG SER 151.A O SER 1.A HG 3.065 2.225 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.982 2.185 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.969 2.154 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.623 1.849 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.908 2.071 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.882 2.067 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.482 2.961 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.845 2.130 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.902 2.102 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.871 2.012 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.368 2.490 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 2.996 2.110 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.685 1.885 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.866 2.039 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.895 2.100 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.820 2.050 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.915 2.096 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 2.994 2.165 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.842 2.020 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.831 1.992 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.022 2.226 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.764 2.069 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.790 1.965 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.026 2.174 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.932 2.124 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.804 1.944 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.953 2.123 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.910 2.075 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.903 2.087 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.882 2.073 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.781 2.054 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.880 2.066 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.308 2.461 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.682 1.899 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.973 2.260 TRP 42.A NE1 TYR 79.A OH TRP 42.A HE1 2.824 2.131 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.875 2.108 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.952 2.134 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.890 2.088 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.704 1.892 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.883 2.129 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.941 2.157 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.055 2.211 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.704 2.010 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.990 2.138 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.888 2.050 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.856 2.032 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.124 2.270 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.740 1.916 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.045 2.227 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.970 2.176 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.896 2.124 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.922 2.074 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.712 1.900 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.836 2.000 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.032 2.215 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.960 2.111 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.755 1.951 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.325 2.682 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.857 2.054 THR 65.A OG1 THR 25.A O THR 65.A HG1 3.394 2.563 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.621 1.899 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.268 2.428 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H.B 2.979 2.205 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.837 1.989 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.124 2.276 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.882 2.060 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.047 2.270 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.207 2.444 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.281 2.514 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.907 2.077 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.866 2.032 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.873 2.043 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 3.023 2.168 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.706 1.911 SER 84.A N SER 113.A OG SER 84.A H 2.942 2.143 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.115 2.333 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 2.983 2.194 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.022 2.227 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.107 2.456 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.945 2.088 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.606 1.812 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.824 2.022 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.986 2.219 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.735 1.997 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.896 2.057 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.806 1.985 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.887 2.091 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.944 2.087 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.692 1.868 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.821 1.966 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.954 2.283 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.126 2.298 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.203 2.426 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.742 1.897 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.873 2.024 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.809 2.067 SER 108.A OG GLU 47.A OE1 SER 108.A HG 2.674 2.071 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.976 2.132 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.810 2.080 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.147 2.309 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.955 2.137 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.858 2.085 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 3.021 2.382 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.285 2.464 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.680 1.870 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.884 2.083 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.087 2.284 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.068 2.238 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.761 1.923 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.897 2.050 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.925 2.201 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.980 2.148 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 2.994 2.321 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.849 2.032 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.875 2.019 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.033 2.183 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.029 2.170 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.960 2.106 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.971 2.115 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.057 2.301 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.045 2.287 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.737 1.915 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.981 2.147 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.841 2.014 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.881 2.207 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.911 2.072 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.929 2.075 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.937 2.084 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.032 2.206 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H 2.976 2.123 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.907 2.077 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.805 1.976 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.908 2.144 LYS 149.A N.A PHE 145.A O LYS 149.A H.A 2.896 2.395 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.882 2.142 LEU 152.A N LYS 149.A O.A LEU 152.A H 3.312 2.551 LEU 152.A N LYS 149.A O.B LEU 152.A H 3.014 2.230 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.938 2.168 SER 154.A N GLY 172.A O SER 154.A H.A 3.141 2.531 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.815 2.131 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.044 2.233 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.831 2.038 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.877 2.071 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.906 2.149 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.949 2.090 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.765 1.932 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.895 2.114 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.872 2.061 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.140 2.369 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.788 1.944 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.816 1.991 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.922 2.109 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.371 2.814 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.655 1.818 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.038 2.197 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.939 2.124 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.916 2.075 THR 186.A N LEU 325.A O.A THR 186.A H 2.749 1.980 THR 186.A N LEU 325.A O.B THR 186.A H 2.859 2.141 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.833 2.047 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.263 2.406 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 3.057 2.386 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.888 2.057 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.917 2.070 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.848 2.017 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD2.A THR 198.A HG1 2.548 1.843 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.830 2.071 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.755 1.950 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.236 2.448 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.768 1.928 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.049 2.285 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.944 2.167 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.785 1.935 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.900 2.067 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.756 1.903 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.027 2.239 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.918 2.096 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.855 2.034 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 3.002 2.251 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.960 2.134 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.018 2.164 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.863 2.046 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.770 2.120 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.938 2.198 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.222 2.366 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.796 2.107 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.062 2.202 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.905 2.062 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.986 2.189 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.055 2.224 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.920 2.079 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.075 2.258 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.032 2.251 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.720 1.880 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.032 2.187 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.852 2.022 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.929 2.140 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.013 2.176 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 2.996 2.162 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.033 2.177 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.022 2.221 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.848 1.989 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 2.990 2.157 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.878 2.079 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.095 2.375 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.772 1.958 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.914 2.075 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.864 2.100 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.870 2.022 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.883 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.889 2.034 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.939 2.132 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.904 2.054 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.934 2.142 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.870 2.081 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.957 2.124 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.796 2.035 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.037 2.335 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.914 2.137 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.908 2.058 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.746 1.893 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H.A 2.936 2.175 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.923 2.082 ASP 279.A N ASP 276.A O.A ASP 279.A H 3.271 2.415 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 3.061 2.229 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.953 2.175 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.785 2.062 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.959 2.107 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H.B 3.001 2.147 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.795 1.943 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 3.039 2.196 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.014 2.169 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.748 2.107 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.886 2.060 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.013 2.186 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.836 2.017 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.835 2.015 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.626 1.796 ALA 298.A N.A SER 296.A OG ALA 298.A H.A 3.038 2.187 ALA 298.A N.B SER 296.A OG ALA 298.A H.B 3.040 2.188 ILE 300.A N.A SER 297.A O ILE 300.A H.A 2.954 2.148 ILE 300.A N.B SER 297.A O ILE 300.A H.B 2.793 1.939 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.826 1.995 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.874 2.066 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.766 1.986 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.781 1.970 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.150 2.396 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.981 2.350 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.954 2.114 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H.A 2.834 1.990 LYS 311.A NZ.A ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3.A 2.811 1.960 LYS 311.A NZ.B ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2.B 2.782 1.955 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.151 2.362 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.953 2.131 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.828 2.017 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.040 2.216 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.785 1.958 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.791 1.949 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.941 2.128 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.863 2.019 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.765 2.022 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.126 2.318 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.061 2.316 LEU 325.A N.A THR 186.A O LEU 325.A H.A 3.065 2.223 LEU 325.A N.B THR 186.A O LEU 325.A H.B 3.070 2.251 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H.A 2.853 2.042 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.914 2.098 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.922 2.123 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.771 1.923 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.822 2.065 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.124 2.536 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.812 1.950