Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5r1y_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.816 1.968 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.793 1.922 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.968 2.168 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.964 2.146 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.622 1.871 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.914 2.074 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.901 2.082 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.510 3.003 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.865 2.142 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.893 2.096 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.898 2.094 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.055 2.283 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.301 2.445 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.068 2.214 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.680 1.883 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.875 2.049 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.890 2.091 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.818 2.052 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.917 2.087 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.011 2.187 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.843 2.019 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.819 1.979 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.029 2.227 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.763 2.077 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.784 1.955 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.007 2.152 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.934 2.116 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.808 1.949 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.974 2.143 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.970 2.241 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.947 2.082 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.896 2.086 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.793 2.058 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 3.106 2.289 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.370 2.526 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.739 2.130 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.691 1.905 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.886 2.149 TRP 42.A NE1 TYR 79.A OH TRP 42.A HE1 2.972 2.286 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.875 2.104 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.944 2.124 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.913 2.115 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.700 1.885 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.898 2.146 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.976 2.186 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.061 2.215 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.710 2.013 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.958 2.103 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.885 2.045 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.836 2.006 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.154 2.300 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.749 1.923 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.031 2.212 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.852 2.072 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.883 2.113 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.907 2.059 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.701 1.889 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.840 2.001 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.025 2.211 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.938 2.088 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.780 1.978 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.333 2.683 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.811 2.004 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.629 1.892 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.321 2.484 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H.B 2.968 2.190 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.855 2.006 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.116 2.267 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.889 2.067 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.043 2.259 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.225 2.461 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.296 2.532 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.918 2.086 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.873 2.031 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 3.143 2.311 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 2.984 2.114 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.790 1.998 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.156 2.378 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 2.987 2.198 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.027 2.231 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.128 2.488 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.958 2.102 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.544 1.769 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.805 2.002 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.980 2.213 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.748 2.013 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.888 2.049 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.810 1.987 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.866 2.071 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.947 2.091 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.703 1.883 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.813 1.958 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.962 2.283 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.112 2.280 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.209 2.427 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.736 1.887 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.886 2.040 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.814 2.074 SER 108.A OG GLU 47.A OE1 SER 108.A HG 2.684 2.088 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.984 2.137 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.776 2.041 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.140 2.303 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.964 2.152 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.866 2.102 SER 113.A OG SER 84.A O SER 113.A HG 3.248 2.609 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 3.056 2.254 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.292 2.471 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.674 1.863 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.890 2.079 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 2.989 2.225 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 2.967 2.131 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.821 1.983 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.881 2.032 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.912 2.145 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 3.152 2.333 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.017 2.357 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.888 2.087 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.873 2.017 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.049 2.200 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.022 2.164 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.964 2.108 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.982 2.127 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.065 2.316 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.030 2.277 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.722 1.899 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.979 2.146 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.831 2.000 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.929 2.258 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.928 2.085 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.941 2.087 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.925 2.072 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.023 2.195 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H 2.983 2.132 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.906 2.067 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.824 1.989 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.916 2.153 LYS 149.A N.A PHE 145.A O LYS 149.A H.A 2.914 2.415 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.907 2.185 LEU 152.A N LYS 149.A O.A LEU 152.A H 3.292 2.541 LEU 152.A N LYS 149.A O.B LEU 152.A H 3.017 2.246 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.948 2.175 SER 154.A N GLY 172.A O SER 154.A H.A 3.158 2.559 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.800 2.115 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.046 2.236 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.818 2.025 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.864 2.056 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.914 2.154 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.243 2.595 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.802 1.950 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.791 1.962 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.871 2.093 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.871 2.049 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.145 2.380 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.799 1.954 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.796 1.956 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.928 2.120 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.387 2.821 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.651 1.813 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.031 2.187 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.946 2.125 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.913 2.067 THR 186.A N LEU 325.A O.A THR 186.A H 2.755 1.999 THR 186.A N LEU 325.A O.B THR 186.A H 2.872 2.171 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.839 2.053 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.266 2.408 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE1 GLN 192.A HE21 3.317 2.677 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 3.072 2.253 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.887 2.060 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.910 2.064 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.857 2.030 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD2.A THR 198.A HG1 2.524 1.819 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.836 2.079 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.746 1.935 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.218 2.428 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.768 1.929 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.048 2.287 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.937 2.161 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.766 1.920 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.889 2.054 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.766 1.910 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.042 2.262 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.919 2.096 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.881 2.063 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 2.999 2.239 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.969 2.143 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.035 2.183 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.875 2.055 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.765 2.096 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 3.007 2.191 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.204 2.348 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.678 1.965 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.081 2.222 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.907 2.065 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.982 2.189 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.044 2.216 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.892 2.052 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.078 2.260 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.045 2.262 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.710 1.870 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.038 2.196 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.860 2.030 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.948 2.171 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.029 2.190 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.003 2.172 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.042 2.186 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.019 2.212 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.862 2.002 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.011 2.173 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.882 2.071 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.106 2.361 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.784 1.967 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.897 2.063 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.868 2.104 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.875 2.028 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.844 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.876 2.023 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.953 2.146 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.890 2.040 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.932 2.142 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.882 2.098 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.949 2.116 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.800 2.029 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.071 2.366 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.897 2.121 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.910 2.060 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.753 1.898 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H.A 2.937 2.184 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.924 2.084 ASP 279.A N ASP 276.A O.A ASP 279.A H 3.328 2.474 ASP 279.A N ASP 276.A O.B ASP 279.A H 3.318 2.463 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.976 2.170 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.841 2.022 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.847 2.056 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.955 2.101 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H.A 2.991 2.137 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.793 1.940 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.827 2.024 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.025 2.177 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.748 2.091 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.901 2.079 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.032 2.202 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.816 1.989 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.819 2.002 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.600 1.784 ALA 298.A N.A SER 296.A OG ALA 298.A H.A 3.047 2.199 ALA 298.A N.B SER 296.A OG ALA 298.A H.B 3.045 2.193 ILE 300.A N.A SER 297.A O ILE 300.A H.A 2.998 2.208 ILE 300.A N.B SER 297.A O ILE 300.A H.B 2.825 1.973 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.831 1.996 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.876 2.067 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.770 1.992 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.753 1.939 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.063 2.333 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.972 2.337 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.954 2.115 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H.A 2.832 1.989 LYS 311.A NZ.A ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3.A 2.884 2.022 LYS 311.A NZ.B ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2.B 2.729 1.891 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.151 2.368 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.945 2.125 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.832 2.021 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.033 2.203 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.782 1.953 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.790 1.950 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.942 2.129 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.866 2.015 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.766 2.019 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.124 2.315 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.080 2.334 LEU 325.A N.A THR 186.A O LEU 325.A H.A 3.046 2.210 LEU 325.A N.B THR 186.A O LEU 325.A H.B 3.053 2.229 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H.A 2.851 2.046 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.915 2.101 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.931 2.128 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.766 1.926 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.830 2.079 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.158 2.576 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.809 1.956