Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5r2a_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.868 2.012 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.785 1.933 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.970 2.173 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.943 2.127 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.605 1.835 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.915 2.079 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.872 2.065 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.443 2.825 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.888 2.237 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.888 2.082 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.884 2.038 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.139 2.378 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.122 2.212 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.814 1.978 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.886 2.057 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.885 2.103 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.820 2.041 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.921 2.102 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.010 2.179 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.856 2.041 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.822 1.983 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.036 2.241 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.743 2.063 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.788 1.964 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.008 2.156 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.935 2.127 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.810 1.951 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.958 2.125 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.888 2.048 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.891 2.071 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.907 2.102 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.800 2.030 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.923 2.113 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.330 2.476 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.687 1.916 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.967 2.258 TRP 42.A NE1 TYR 79.A OH TRP 42.A HE1 3.050 2.298 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.882 2.119 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.955 2.136 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.881 2.079 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.666 1.856 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.913 2.153 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.934 2.141 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.053 2.209 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.720 2.006 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.998 2.153 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.984 2.146 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.824 1.998 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.140 2.286 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.775 1.950 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.026 2.196 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 3.252 2.444 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.890 2.129 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.932 2.084 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.714 1.918 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.815 1.978 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.038 2.217 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.958 2.111 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.735 1.930 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.324 2.683 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.863 2.059 THR 65.A OG1 THR 25.A O THR 65.A HG1 3.401 2.567 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.613 1.854 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.270 2.432 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H.B 2.962 2.181 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.846 1.999 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.107 2.257 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.878 2.054 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.055 2.273 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.177 2.412 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.396 2.589 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.907 2.062 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.951 2.075 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 3.259 2.377 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 3.190 2.349 SER 84.A N SER 113.A OG SER 84.A H 2.992 2.172 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.264 2.418 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 2.974 2.191 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.018 2.221 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.090 2.440 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.936 2.080 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.589 1.799 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.811 2.007 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.984 2.222 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.738 2.001 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.917 2.078 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.817 1.997 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.887 2.096 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.969 2.113 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.701 1.872 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.835 1.981 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.963 2.289 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.127 2.296 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.193 2.413 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.729 1.882 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.868 2.018 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.806 2.068 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.961 2.115 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.762 2.028 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.131 2.298 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.993 2.129 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.894 2.104 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.274 2.453 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.668 1.851 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.905 2.123 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.125 2.296 ILE 122.A N ASP 119.A O ILE 122.A H 3.052 2.151 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.911 2.064 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.895 2.150 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 3.004 2.174 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.029 2.372 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.839 2.026 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.889 2.032 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.065 2.217 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.035 2.177 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.973 2.119 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.960 2.104 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.056 2.305 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.031 2.397 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.658 2.036 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.985 2.153 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.837 2.007 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.905 2.241 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.899 2.057 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.918 2.064 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.971 2.118 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.037 2.214 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H 2.971 2.116 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.922 2.095 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.829 1.999 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.953 2.196 LYS 149.A N.A PHE 145.A O LYS 149.A H.A 2.902 2.396 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.916 2.213 LEU 152.A N LYS 149.A O.A LEU 152.A H 3.353 2.595 LEU 152.A N LYS 149.A O.B LEU 152.A H 3.011 2.228 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.933 2.151 SER 154.A N GLY 172.A O SER 154.A H.A 3.135 2.546 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.807 2.126 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.038 2.229 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.836 2.042 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.877 2.067 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.907 2.154 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.128 2.414 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.680 1.792 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.774 1.948 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.877 2.092 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.879 2.061 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.138 2.370 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.789 1.943 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.811 1.981 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.925 2.115 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.419 2.841 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.662 1.824 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.041 2.200 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.957 2.137 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.923 2.085 THR 186.A N LEU 325.A O.A THR 186.A H 2.748 1.979 THR 186.A N LEU 325.A O.B THR 186.A H 2.846 2.118 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.844 2.065 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.238 2.382 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 2.933 2.109 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.903 2.081 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.921 2.073 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.869 2.042 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.820 2.066 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.746 1.950 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.234 2.450 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.784 1.949 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.040 2.272 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.921 2.144 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.772 1.923 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.896 2.062 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.774 1.918 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.029 2.250 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.913 2.090 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.878 2.058 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 3.017 2.267 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.968 2.140 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.042 2.190 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.873 2.055 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.736 2.071 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 2.921 2.107 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.038 2.180 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.872 2.018 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.969 2.171 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.029 2.197 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.915 2.077 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.078 2.262 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.044 2.263 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.714 1.874 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.031 2.188 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.863 2.033 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.948 2.163 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.037 2.196 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.002 2.167 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.027 2.172 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.043 2.240 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 3.018 2.114 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 3.116 2.323 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.786 1.964 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.921 2.088 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.885 2.126 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.867 2.026 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.919 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.884 2.027 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.944 2.138 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.898 2.047 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.943 2.155 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.888 2.105 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.961 2.130 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.821 2.063 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.019 2.309 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.904 2.131 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.903 2.051 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.744 1.892 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H.A 2.930 2.155 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.918 2.073 ASP 279.A N ASP 276.A O.A ASP 279.A H 3.388 2.533 ASP 279.A N ASP 276.A O.B ASP 279.A H 3.203 2.348 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.983 2.169 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.836 2.022 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.839 2.048 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.965 2.113 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H.B 3.001 2.145 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.784 1.939 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.813 1.967 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.044 2.206 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.759 2.118 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.868 2.048 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.013 2.183 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.837 2.012 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.808 1.987 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.635 1.819 ALA 298.A N.A SER 296.A OG ALA 298.A H.A 3.041 2.187 ALA 298.A N.B SER 296.A OG ALA 298.A H.B 3.040 2.194 ILE 300.A N.A SER 297.A O ILE 300.A H.A 2.884 2.028 ILE 300.A N.B SER 297.A O ILE 300.A H.B 2.880 2.025 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.836 2.010 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.880 2.018 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.764 1.980 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.723 1.949 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 2.986 2.314 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.979 2.373 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.946 2.105 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H.A 2.831 1.987 LYS 311.A NZ.A ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3.A 2.780 1.924 LYS 311.A NZ.B ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2.B 2.777 1.954 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.147 2.360 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.952 2.131 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.821 2.005 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.037 2.206 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.777 1.946 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.799 1.952 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.950 2.136 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.874 2.031 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.768 2.032 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.120 2.322 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.084 2.340 LEU 325.A N.A THR 186.A O LEU 325.A H.A 3.068 2.227 LEU 325.A N.B THR 186.A O LEU 325.A H.B 3.072 2.248 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H.A 2.852 2.044 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.918 2.103 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.937 2.143 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.770 1.916 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.850 2.097 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.137 2.547 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.806 1.942