Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5r3a_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.863 2.120 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.782 1.929 SER 1.A OG SER 151.A O SER 1.A HG 3.093 2.254 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.977 2.182 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.975 2.158 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.623 1.862 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.925 2.088 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.865 2.048 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.450 2.900 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.853 2.152 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.909 2.118 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.891 2.084 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.047 2.278 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.289 2.435 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.067 2.210 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.681 1.879 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.887 2.062 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.897 2.111 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.800 2.039 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.907 2.086 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.014 2.191 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.845 2.025 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.815 1.972 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.012 2.218 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.769 2.067 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.785 1.950 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.023 2.169 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.927 2.116 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.790 1.930 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.962 2.127 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.905 2.067 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.899 2.077 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.903 2.106 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.787 2.019 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.866 2.046 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.303 2.456 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.688 1.905 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.948 2.237 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.887 2.109 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.943 2.128 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.874 2.071 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.695 1.885 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.912 2.157 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.932 2.146 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.044 2.198 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.733 2.010 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.998 2.143 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.923 2.083 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.860 2.036 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.133 2.279 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.723 1.896 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.019 2.202 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.998 2.211 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.864 2.089 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.907 2.059 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.713 1.905 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.820 1.988 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.031 2.212 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.962 2.113 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.768 1.970 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.318 2.676 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.822 2.014 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.622 1.874 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.320 2.481 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H.B 2.959 2.177 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.854 2.001 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.112 2.262 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.900 2.077 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 2.998 2.216 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.196 2.431 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.285 2.517 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.896 2.070 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.834 1.993 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.966 2.130 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 2.935 2.082 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.660 1.857 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.124 2.351 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 2.994 2.198 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.026 2.234 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.136 2.505 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.955 2.100 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.571 1.795 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.797 1.996 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.979 2.217 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.742 2.008 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.896 2.057 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.783 1.960 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.866 2.072 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.966 2.111 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.713 1.883 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.822 1.968 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.961 2.285 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.120 2.294 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.194 2.412 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.727 1.878 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.863 2.015 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.804 2.068 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.982 2.134 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.795 2.061 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.120 2.285 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.974 2.160 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.819 2.046 SER 113.A OG SER 84.A O SER 113.A HG 3.252 2.643 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 2.995 2.342 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.276 2.453 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.688 1.882 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.876 2.079 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.091 2.275 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.112 2.289 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.725 1.890 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.894 2.043 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.904 2.182 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.999 2.171 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 2.983 2.306 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.848 2.033 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.866 2.009 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.068 2.224 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.022 2.163 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.977 2.123 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.975 2.119 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.023 2.274 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.043 2.290 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.726 1.907 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.966 2.131 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.862 2.033 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.884 2.230 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.924 2.084 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.929 2.073 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.931 2.076 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.017 2.194 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H 2.967 2.111 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.903 2.076 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.803 1.971 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.907 2.140 LYS 149.A N.A PHE 145.A O LYS 149.A H.A 2.887 2.374 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.905 2.183 LEU 152.A N LYS 149.A O.A LEU 152.A H 3.273 2.519 LEU 152.A N LYS 149.A O.B LEU 152.A H 3.057 2.282 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.954 2.174 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.826 2.157 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.051 2.244 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.838 2.047 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.868 2.063 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.927 2.169 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.253 2.562 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.844 2.006 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.780 1.947 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.892 2.111 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.876 2.068 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.161 2.397 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.796 1.951 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.814 1.992 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.909 2.097 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.397 2.827 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.629 1.790 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.050 2.207 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.951 2.128 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.909 2.064 THR 186.A N LEU 325.A O.A THR 186.A H 2.745 1.992 THR 186.A N LEU 325.A O.B THR 186.A H 2.887 2.188 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.844 2.056 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.265 2.408 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE1 GLN 192.A HE21 3.135 2.537 GLN 192.A NE2 GLU 196.A OE2 GLN 192.A HE21 2.964 2.169 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.895 2.069 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.901 2.052 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.841 2.015 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD2.A THR 198.A HG1 2.526 1.791 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.840 2.087 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.745 1.943 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.230 2.445 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.750 1.911 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.039 2.274 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.936 2.159 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.779 1.931 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.876 2.043 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.760 1.906 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.045 2.279 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.926 2.106 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.872 2.055 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 3.002 2.256 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.974 2.150 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.012 2.161 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.865 2.048 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.741 2.070 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.955 2.231 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.211 2.354 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.684 1.964 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.071 2.212 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.876 2.035 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.960 2.164 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.016 2.180 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.888 2.046 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.094 2.278 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.013 2.231 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.712 1.872 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.026 2.178 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.880 2.056 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.952 2.180 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.027 2.190 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.000 2.165 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.051 2.196 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 2.999 2.194 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.840 1.981 SER 247.A OG SER 245.A OG SER 247.A HG 3.066 2.502 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 2.989 2.155 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.858 2.043 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.091 2.334 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.760 1.938 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.871 2.034 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.892 2.123 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.883 2.036 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.837 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.885 2.030 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.954 2.147 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.916 2.066 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.939 2.148 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.879 2.080 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.925 2.089 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.771 1.998 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.062 2.349 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.886 2.105 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.913 2.063 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.755 1.903 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H.A 2.938 2.173 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.917 2.080 ASP 279.A N ASP 276.A O.A ASP 279.A H 3.420 2.567 ASP 279.A N ASP 276.A O.B ASP 279.A H 3.110 2.254 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.966 2.161 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.845 2.030 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.825 2.034 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.927 2.073 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H.A 2.974 2.123 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.804 1.950 CYS 290.A SG ASP 279.A OD2 no hydrogen 3.919 N/A PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.815 2.015 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.017 2.172 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.732 2.069 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.907 2.087 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.015 2.184 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.809 1.984 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.815 2.005 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.595 1.764 ALA 298.A N.A SER 296.A OG ALA 298.A H.A 3.049 2.199 ALA 298.A N.B SER 296.A OG ALA 298.A H.B 3.044 2.195 ILE 300.A N.A SER 297.A O ILE 300.A H.A 2.984 2.206 ILE 300.A N.B SER 297.A O ILE 300.A H.B 2.786 1.936 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.817 1.989 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.866 2.057 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.781 2.004 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.754 1.941 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 2.999 2.246 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.975 2.337 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.945 2.106 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H.B 2.832 1.986 LYS 311.A NZ.A ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3.A 2.904 2.044 LYS 311.A NZ.B ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2.B 2.754 1.914 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.145 2.357 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.930 2.106 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.832 2.023 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.043 2.207 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.803 1.972 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.799 1.952 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.940 2.125 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.873 2.028 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.772 2.026 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.073 2.268 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.089 2.342 LEU 325.A N.A THR 186.A O LEU 325.A H.A 3.046 2.209 LEU 325.A N.B THR 186.A O LEU 325.A H.B 3.050 2.232 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H.A 2.829 2.014 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.890 2.076 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.927 2.126 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.775 1.936 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.842 2.100 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.165 2.577 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.813 1.959