Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5rph_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ALA 1.A N TYR 25.A O ALA 1.A H3 2.870 1.993 GLN 3.A N TYR 23.A O GLN 3.A H 2.832 1.988 GLN 3.A NE2 THR 81.A O GLN 3.A HE22 2.821 1.987 ALA 6.A N SER 21.A O ALA 6.A H 2.810 2.006 TRP 8.A NE1 THR 206.A O TRP 8.A HE1 2.984 2.282 ALA 11.A N PRO 7.A O ALA 11.A H 3.225 2.388 ARG 12.A N TRP 8.A O ARG 12.A H 2.795 2.041 ARG 12.A NE ASP 187.A OD1 ARG 12.A HE 2.800 1.959 ARG 12.A NH1 ARG 12.A O ARG 12.A HH11 3.162 2.446 ARG 12.A NH1 SER 15.A O ARG 12.A HH12 2.834 2.203 ARG 12.A NH2 ASP 187.A OD1 ARG 12.A HH21 3.508 2.895 ARG 12.A NH2 ASP 187.A OD2 ARG 12.A HH21 2.769 1.921 ILE 13.A N.A GLY 9.A O ILE 13.A H.A 3.087 2.315 SER 14.A N ALA 11.A O SER 14.A H.A 3.277 2.532 SER 15.A N ARG 12.A O SER 15.A H 3.178 2.362 SER 15.A OG SER 17.A O SER 15.A HG 2.673 2.186 SER 17.A N SER 15.A OG SER 17.A H 2.951 2.095 TYR 23.A N GLN 3.A O TYR 23.A H 3.003 2.206 TYR 23.A OH VAL 84.A O TYR 23.A HH 2.696 1.901 TYR 24.A N SER 14.A OG TYR 24.A H 2.943 2.089 TYR 25.A N ALA 1.A O TYR 25.A H 3.039 2.246 ASP 26.A N TYR 236.A OH ASP 26.A H 2.851 1.993 SER 28.A N ASP 26.A OD1 SER 28.A H 2.925 2.074 SER 28.A OG ASP 26.A OD1 SER 28.A HG 2.744 1.981 ALA 29.A N ASP 26.A O ALA 29.A H 3.014 2.319 GLN 31.A N.A SER 28.A O GLN 31.A H.A 2.862 2.004 SER 33.A N GLY 30.A O SER 33.A H 3.048 2.207 SER 33.A OG GLY 30.A O SER 33.A HG 2.652 1.821 CYS 34.A N.A GLY 126.A O CYS 34.A H.A 3.045 2.280 CYS 34.A SG.A ASN 122.A O no hydrogen 3.461 N/A VAL 35.A N GLN 89.A O VAL 35.A H.A 2.805 1.980 TYR 36.A N VAL 128.A O TYR 36.A H 2.825 1.994 TYR 36.A OH ASP 117.A OD2 TYR 36.A HH 2.698 1.858 VAL 37.A N PHE 91.A O.A VAL 37.A H 2.884 2.068 ILE 38.A N SER 130.A O ILE 38.A H 3.160 2.306 ASP 39.A N VAL 93.A O ASP 39.A H 2.998 2.179 THR 40.A N ASP 39.A OD1 THR 40.A H 2.804 2.069 THR 40.A OG1 ASP 65.A OD1 THR 40.A HG1 2.753 2.160 GLU 43.A N THR 71.A OG1 GLU 43.A H 2.846 2.032 HIS 46.A N GLU 43.A O HIS 46.A H 3.078 2.222 HIS 46.A NE2 SER 216.A O.A HIS 46.A HE2 2.859 2.020 GLU 48.A N HIS 46.A ND1 GLU 48.A H 3.090 2.233 PHE 49.A N HIS 46.A O PHE 49.A H 2.949 2.098 GLU 50.A N PRO 47.A O GLU 50.A H 3.165 2.441 ARG 52.A N PHE 49.A O ARG 52.A H 2.871 2.018 ARG 52.A NE GLU 50.A OE1 ARG 52.A HE 3.355 2.631 ARG 52.A NH1 GLY 78.A O ARG 52.A HH12 2.861 2.095 ARG 52.A NH1 THR 88.A O ARG 52.A HH11 2.912 2.085 ARG 52.A NH2 GLU 50.A OE1 ARG 52.A HH21 2.951 2.146 ARG 52.A NH2 GLY 78.A O ARG 52.A HH22 2.923 2.180 GLN 54.A N.A LEU 90.A O GLN 54.A H.A 3.018 2.276 VAL 56.A N GLY 92.A O VAL 56.A H 2.886 2.031 THR 58.A OG1 SER 62.A O THR 58.A HG1 2.864 2.027 TYR 59.A N LYS 94.A O TYR 59.A H 3.277 2.509 TYR 60.A N THR 58.A OG1 TYR 60.A H 3.089 2.259 TYR 60.A OH VAL 95.A O TYR 60.A HH 2.664 1.856 ARG 64.A N SER 62.A OG ARG 64.A H 2.959 2.104 GLY 66.A N ASP 98.A OD1 GLY 66.A H 2.921 2.153 ASN 67.A N ASP 65.A OD1 ASN 67.A H 2.995 2.167 ASN 67.A ND2 ASP 98.A O ASN 67.A HD22 2.996 2.161 GLY 68.A N ASP 65.A OD1 GLY 68.A H 2.913 2.066 GLY 68.A N ASP 65.A OD2 GLY 68.A H 3.220 2.566 HIS 69.A N ASN 67.A OD1 HIS 69.A H 2.976 2.157 HIS 69.A ND1 ASP 39.A OD1 HIS 69.A HD1 2.609 1.754 GLY 70.A N THR 40.A OG1 GLY 70.A H 2.910 2.089 THR 71.A N ASP 65.A OD2 THR 71.A H 3.011 2.230 THR 71.A OG1 ASP 65.A OD2 THR 71.A HG1 2.684 1.958 HIS 72.A N GLY 68.A O HIS 72.A H 2.895 2.087 HIS 72.A NE2 ARG 218.A O HIS 72.A HE2 3.010 2.327 CYS 73.A N HIS 69.A O CYS 73.A H 3.008 2.161 CYS 73.A SG SER 224.A O CYS 73.A HG 3.382 2.391 ALA 74.A N GLY 70.A O ALA 74.A H 2.857 2.006 GLY 75.A N THR 71.A O GLY 75.A H 2.931 2.128 THR 76.A N HIS 72.A O THR 76.A H 3.090 2.320 VAL 77.A N CYS 73.A O VAL 77.A H 3.079 2.284 GLY 78.A N ALA 74.A O GLY 78.A H 2.993 2.220 SER 79.A N GLY 75.A O SER 79.A H 2.975 2.141 SER 79.A OG GLY 75.A O SER 79.A HG 2.722 1.899 ARG 80.A N GLU 48.A O ARG 80.A H 2.958 2.129 ARG 80.A NE GLU 48.A OE2 ARG 80.A HE 3.044 2.198 THR 81.A N GLU 48.A OE1 THR 81.A H 2.805 1.960 TYR 82.A N SER 79.A OG TYR 82.A H 2.986 2.247 GLY 83.A N SER 79.A O GLY 83.A H 2.950 2.284 VAL 84.A N THR 76.A O VAL 84.A H 2.939 2.163 ALA 85.A N VAL 77.A O ALA 85.A H 2.863 2.006 LYS 86.A NZ GLN 3.A OE1 LYS 86.A HZ1 2.747 2.081 LYS 86.A NZ ARG 80.A O LYS 86.A HZ2 2.903 2.077 LYS 86.A NZ GLY 83.A O LYS 86.A HZ3 2.886 2.115 LYS 87.A N.A ALA 29.A O LYS 87.A H.A 2.813 2.016 THR 88.A N ALA 85.A O THR 88.A H.A 3.293 2.435 THR 88.A OG1 SER 33.A OG THR 88.A HG1 2.832 2.072 GLN 89.A N SER 33.A O GLN 89.A H 3.191 2.333 LEU 90.A N ARG 52.A O LEU 90.A H 2.902 2.048 PHE 91.A N.A VAL 35.A O PHE 91.A H.A 2.945 2.117 GLY 92.A N GLN 54.A O.A GLY 92.A H.A 2.836 2.011 VAL 93.A N VAL 37.A O VAL 93.A H 3.069 2.228 LYS 94.A N LYS 57.A O LYS 94.A H 2.867 2.027 LYS 94.A NZ THR 40.A O LYS 94.A HZ3 2.815 2.138 LYS 94.A NZ LEU 96.A O LYS 94.A HZ2 2.837 2.011 VAL 95.A N ASP 39.A O VAL 95.A H 3.000 2.385 LEU 96.A N ASP 39.A O LEU 96.A H 3.084 2.270 ASP 97.A N SER 101.A O ASP 97.A H 2.756 1.917 ASN 99.A N ASP 97.A OD1 ASN 99.A H 2.855 2.135 GLY 100.A N ASP 97.A O GLY 100.A H 2.910 2.066 SER 101.A N ASP 97.A OD1 SER 101.A H 3.055 2.208 TYR 104.A OH.A GLY 136.A O TYR 104.A HH.A 2.953 2.312 ILE 107.A N GLN 103.A O ILE 107.A H 3.059 2.241 ILE 108.A N TYR 104.A O.A ILE 108.A H 2.894 2.052 ALA 109.A N SER 105.A O ALA 109.A H 2.979 2.137 GLY 110.A N THR 106.A O GLY 110.A H 2.858 2.057 MET 111.A N ILE 107.A O MET 111.A H 3.003 2.213 ASP 112.A N ILE 108.A O ASP 112.A H 3.027 2.181 PHE 113.A N ALA 109.A O PHE 113.A H 2.817 2.040 VAL 114.A N GLY 110.A O VAL 114.A H 3.088 2.296 ALA 115.A N MET 111.A O ALA 115.A H 3.138 2.328 SER 116.A N ASP 112.A O SER 116.A H 3.238 2.469 SER 116.A N PHE 113.A O SER 116.A H 3.187 2.573 ASP 117.A N PHE 113.A O ASP 117.A H 2.685 1.839 LYS 118.A N VAL 114.A O LYS 118.A H 3.117 2.292 LYS 118.A NZ ALA 115.A O LYS 118.A HZ3 2.657 2.047 LYS 118.A NZ SER 151.A OG LYS 118.A HZ2 3.144 2.403 ASN 119.A N SER 116.A O ASN 119.A H 2.968 2.162 ASN 119.A ND2 SER 116.A O ASN 119.A HD22 3.371 2.843 ASN 120.A N ASP 117.A O ASN 120.A H 2.743 1.899 ARG 121.A N LYS 118.A O ARG 121.A H 3.162 2.320 ARG 121.A NE ASP 117.A OD2 ARG 121.A HE 2.867 2.017 ARG 121.A NH2 ASP 117.A OD1 ARG 121.A HH21 2.906 2.123 ARG 121.A NH2 ASP 117.A OD2 ARG 121.A HH21 3.405 2.737 LYS 125.A N GLY 32.A O LYS 125.A H 2.938 2.082 GLY 126.A N CYS 123.A O GLY 126.A H 2.946 2.157 VAL 128.A N CYS 34.A O.A VAL 128.A H 2.925 2.137 ALA 129.A N MET 154.A O.A ALA 129.A H 2.795 1.966 SER 130.A N TYR 36.A O SER 130.A H 2.807 1.962 LEU 131.A N.A ALA 156.A O LEU 131.A H.A 2.910 2.098 SER 132.A OG SER 224.A O SER 132.A HG 2.703 2.187 GLY 135.A N SER 170.A O GLY 135.A H 2.957 2.148 SER 138.A N SER 170.A OG SER 138.A H 2.862 2.028 VAL 141.A N SER 138.A OG VAL 141.A H.A 3.085 2.243 ASN 142.A N SER 138.A O ASN 142.A H 3.034 2.189 ASN 142.A ND2 SER 173.A OG ASN 142.A HD21 2.925 2.068 SER 143.A N.A SER 139.A O.A SER 143.A H.A 2.869 2.056 ALA 144.A N SER 140.A O.A ALA 144.A H.A 3.046 2.247 ALA 145.A N VAL 141.A O ALA 145.A H 3.068 2.240 ALA 146.A N ASN 142.A O ALA 146.A H 2.840 2.024 ARG 147.A N SER 143.A O.A ARG 147.A H 2.828 2.017 ARG 147.A NE ASP 112.A OD1 ARG 147.A HE 2.924 2.067 ARG 147.A NH2 ASP 112.A OD1 ARG 147.A HH21 3.510 2.843 ARG 147.A NH2 ASP 112.A OD2 ARG 147.A HH21 2.843 2.024 LEU 148.A N ALA 144.A O LEU 148.A H 3.006 2.180 GLN 149.A N ALA 145.A O GLN 149.A H 3.008 2.166 GLN 149.A NE2 ALA 245.A O GLN 149.A HE22 3.108 2.362 SER 150.A N ALA 146.A O SER 150.A H 2.856 2.011 SER 151.A N ARG 147.A O SER 151.A H 2.912 2.167 SER 151.A N LEU 148.A O SER 151.A H 3.236 2.612 SER 151.A OG LEU 148.A O SER 151.A HG 2.752 1.913 GLY 152.A N GLN 149.A O GLY 152.A H 2.989 2.139 MET 154.A N.A VAL 127.A O MET 154.A H.A 2.950 2.125 VAL 155.A N GLN 149.A OE1 VAL 155.A H.A 3.013 2.160 ALA 156.A N ALA 129.A O ALA 156.A H 2.950 2.096 VAL 157.A N CYS 178.A O VAL 157.A H 2.830 1.998 ALA 158.A N LEU 131.A O.A ALA 158.A H 3.068 2.277 ALA 159.A N VAL 180.A O ALA 159.A H 2.885 2.121 GLY 160.A N THR 223.A OG1 GLY 160.A H 3.035 2.245 ASN 162.A N ASN 194.A OD1 ASN 162.A H.A 2.882 2.195 ASN 163.A N PHE 192.A O ASN 163.A H 2.981 2.179 ALA 164.A N ASN 194.A OD1 ALA 164.A H 2.959 2.166 ALA 166.A N TYR 195.A O ALA 166.A H 2.790 1.955 ARG 167.A N ASP 165.A OD1 ARG 167.A H 2.920 2.070 ASN 168.A N ASP 165.A O ASN 168.A H 3.439 2.584 TYR 169.A N ALA 166.A O TYR 169.A H 3.089 2.279 SER 170.A N GLY 135.A O SER 170.A H 2.811 2.001 SER 170.A OG ASN 142.A OD1 SER 170.A HG 2.716 2.005 SER 173.A N TYR 169.A O SER 173.A H 2.910 2.204 SER 173.A OG TYR 169.A O SER 173.A HG 2.735 2.032 GLU 174.A N PRO 171.A O GLU 174.A H 2.999 2.145 SER 176.A N GLU 174.A OE2 SER 176.A H 3.076 2.242 SER 176.A OG GLU 174.A OE2 SER 176.A HG 2.777 1.971 CYS 178.A N VAL 155.A O CYS 178.A H 2.911 2.069 THR 179.A N ASP 200.A OD2 THR 179.A H 2.882 2.038 THR 179.A OG1 ALA 172.A O THR 179.A HG1 2.685 1.962 VAL 180.A N VAL 157.A O VAL 180.A H 2.897 2.121 GLY 181.A N ILE 201.A O GLY 181.A H 2.905 2.088 ALA 182.A N SER 193.A OG ALA 182.A H 3.003 2.155 SER 183.A N GLY 203.A O SER 183.A H 2.949 2.173 ASP 184.A N ARG 188.A O ASP 184.A H 2.914 2.150 TYR 186.A N ASP 184.A OD1 TYR 186.A H 2.899 2.153 ASP 187.A N ASP 184.A O ASP 187.A H 2.939 2.138 ARG 188.A N ASP 184.A OD1 ARG 188.A H 2.979 2.130 ARG 188.A NE ASP 184.A OD2 ARG 188.A HE 2.826 1.991 ARG 188.A NH2 ASP 184.A OD2 ARG 188.A HH21 3.160 2.453 ARG 189.A N SER 262.A O ARG 189.A H 2.931 2.074 ARG 189.A NE ASN 263.A O ARG 189.A HE 2.830 1.993 ARG 189.A NH1 ASN 163.A OD1 ARG 189.A HH12 2.855 2.020 ARG 189.A NH1 SER 193.A O ARG 189.A HH11 2.779 2.195 ARG 189.A NH2 ASN 163.A OD1 ARG 189.A HH22 3.355 2.678 SER 190.A N ALA 182.A O SER 190.A H 2.860 2.007 SER 190.A OG THR 206.A OG1 SER 190.A HG 2.723 2.026 SER 193.A N SER 190.A O SER 193.A H 2.997 2.144 SER 193.A OG ASN 194.A O SER 193.A HG 2.922 2.085 ASN 194.A N GLY 160.A O ASN 194.A H 2.897 2.058 ASN 194.A ND2 ALA 159.A O ASN 194.A HD22 2.913 2.169 ASN 194.A ND2 ASN 162.A OD1 ASN 194.A HD21 3.004 2.195 TYR 195.A N ALA 164.A O TYR 195.A H 2.993 2.205 GLY 196.A N THR 268.A OG1 GLY 196.A H 2.789 1.998 LEU 199.A N GLY 196.A O LEU 199.A H 3.150 2.329 ASP 200.A N THR 179.A O ASP 200.A H 2.936 2.081 PHE 202.A N LEU 271.A O PHE 202.A H 2.887 2.097 GLY 203.A N GLY 181.A O GLY 203.A H 2.916 2.097 GLY 205.A N SER 183.A O GLY 205.A H 2.810 1.956 THR 206.A N SER 183.A O THR 206.A H 3.256 2.540 ASP 207.A N SER 221.A OG ASP 207.A H 2.825 1.986 ILE 208.A N ILE 220.A O ILE 208.A H 2.922 2.065 SER 210.A N ARG 218.A O SER 210.A H 3.041 2.236 SER 210.A OG HIS 72.A O SER 210.A HG 2.776 1.993 THR 211.A OG1 THR 71.A O THR 211.A HG1 2.780 2.159 TRP 212.A N SER 216.A O.A TRP 212.A H 2.879 2.082 GLY 214.A N GLU 43.A OE1 GLY 214.A H 2.830 2.059 GLY 215.A N GLU 43.A OE2 GLY 215.A H 2.872 2.077 SER 216.A N.A TRP 212.A O SER 216.A H.A 3.232 2.472 ARG 218.A N SER 210.A O ARG 218.A H 3.021 2.241 ILE 220.A N ILE 208.A O ILE 220.A H.A 3.150 2.377 GLY 222.A N GLY 205.A O GLY 222.A H 2.825 2.013 THR 223.A N ASN 161.A OD1.A THR 223.A H 2.809 1.955 THR 223.A OG1 ASN 161.A OD1.A THR 223.A HG1 2.867 2.048 SER 224.A OG HIS 69.A NE2 SER 224.A HG 3.035 2.303 MET 225.A N GLY 222.A O MET 225.A H 2.992 2.190 THR 227.A N THR 223.A O THR 227.A H 3.096 2.272 THR 227.A OG1 THR 223.A O THR 227.A HG1 2.855 2.050 HIS 229.A N ALA 226.A O HIS 229.A H 3.043 2.451 HIS 229.A ND1 MET 225.A O HIS 229.A HD1 2.855 2.082 VAL 230.A N ALA 226.A O VAL 230.A H 3.320 2.521 ALA 231.A N THR 227.A O ALA 231.A H 2.906 2.069 GLY 232.A N PRO 228.A O GLY 232.A H 2.884 2.029 LEU 233.A N HIS 229.A O LEU 233.A H 2.892 2.076 ALA 234.A N VAL 230.A O ALA 234.A H 2.847 2.008 ALA 235.A N ALA 231.A O ALA 235.A H 3.036 2.198 TYR 236.A N GLY 232.A O TYR 236.A H 2.941 2.104 LEU 237.A N LEU 233.A O LEU 237.A H 2.858 2.051 MET 238.A N.A ALA 234.A O MET 238.A H.A 2.829 1.985 THR 239.A N ALA 235.A O THR 239.A H.A 2.951 2.104 THR 239.A OG1 GLN 31.A O.A THR 239.A HG1 3.204 2.703 LEU 240.A N TYR 236.A O LEU 240.A H 3.146 2.361 GLY 241.A N MET 238.A O.A GLY 241.A H 2.914 2.090 LYS 242.A N.A LEU 237.A O LYS 242.A H.A 3.031 2.225 THR 244.A N SER 247.A OG THR 244.A H 3.377 2.586 SER 247.A N THR 244.A O SER 247.A H 3.184 2.484 SER 247.A N THR 244.A OG1 SER 247.A H 3.264 2.539 TYR 251.A N SER 247.A O TYR 251.A H.A 2.895 2.076 ILE 252.A N ALA 248.A O ILE 252.A H 2.817 1.980 ALA 253.A N CYS 249.A O ALA 253.A H 2.956 2.119 ASP 254.A N ARG 250.A O.A ASP 254.A H 2.823 2.014 THR 255.A N TYR 251.A O THR 255.A H 2.991 2.265 THR 255.A OG1 TYR 251.A O THR 255.A HG1 2.844 2.033 THR 255.A OG1 ILE 252.A O THR 255.A HG1 3.507 3.049 ALA 256.A N ALA 253.A O ALA 256.A H 3.349 2.495 ASN 257.A N LEU 272.A O ASN 257.A H 2.966 2.225 ASN 257.A ND2 SER 15.A O ASN 257.A HD21 2.926 2.243 GLY 259.A N ASN 270.A O GLY 259.A H 2.934 2.092 LEU 261.A N ASN 270.A OD1 LEU 261.A H 3.004 2.159 SER 262.A N ASP 187.A O SER 262.A H 2.871 2.065 THR 268.A N PRO 265.A O THR 268.A H 3.013 2.169 ASN 270.A ND2 LEU 261.A O ASN 270.A HD21 2.832 2.046 LEU 272.A N ASN 257.A O LEU 272.A H 2.901 2.088 ALA 273.A N PHE 202.A O ALA 273.A H 2.931 2.090 ASN 275.A N ILE 13.A O.A ASN 275.A H 2.798 2.000 ASN 275.A ND2 TYR 24.A O ASN 275.A HD21 2.999 2.166 TYR 277.A N ASN 275.A OD1 TYR 277.A H 2.959 2.135 GLN 278.A NE2 ASN 276.A O GLN 278.A HE21 3.525 3.054