Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5sam_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.991 2.194 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.975 2.161 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.670 1.872 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.918 2.078 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.897 2.083 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.871 2.091 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.908 2.122 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.867 2.071 LEU 13.A N ASP 11.A OD1 LEU 13.A H 3.057 2.287 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.279 2.424 ASP 15.A N ASP 11.A OD1 ASP 15.A H 3.050 2.194 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.693 1.901 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.876 2.048 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.899 2.102 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.819 2.047 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.920 2.095 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 2.996 2.165 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.838 2.022 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.825 1.989 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.072 2.272 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.765 2.053 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.808 1.984 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.027 2.179 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.946 2.136 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.818 1.959 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.958 2.123 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.884 2.048 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.907 2.083 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.872 2.050 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.772 2.127 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.904 2.095 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.303 2.470 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.689 1.872 TRP 42.A N LEU 125.A O.A TRP 42.A H 2.954 2.240 TRP 42.A N LEU 125.A O.B TRP 42.A H 2.986 2.285 TRP 42.A NE1 TYR 79.A OH TRP 42.A HE1 2.796 2.088 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.867 2.101 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.948 2.129 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.901 2.092 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.752 2.070 SER 45.A OG ALA 109.A O SER 45.A HG 3.356 2.961 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.897 2.135 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.945 2.132 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.068 2.216 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.677 1.848 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.993 2.138 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.888 2.071 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.859 2.033 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.137 2.282 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.736 1.908 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.021 2.196 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.984 2.194 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.875 2.111 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.925 2.075 TYR 59.A OH ASP 92.A OD2 TYR 59.A HH 2.714 1.897 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.825 1.989 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.034 2.216 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.983 2.133 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 3.329 2.700 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 2.736 1.935 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.844 2.035 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD1 THR 66.A HG1 2.655 1.856 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.315 2.474 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H 2.964 2.167 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.826 1.970 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.111 2.260 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.902 2.082 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.060 2.290 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.183 2.413 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.259 2.489 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.939 2.110 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.873 2.054 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.900 2.069 SER 83.A N ASP 81.A OD2 SER 83.A H 2.922 2.077 SER 83.A OG ASP 81.A OD2 SER 83.A HG 2.701 1.920 SER 84.A N SER 113.A OG SER 84.A H 2.975 2.183 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.113 2.327 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 3.041 2.254 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.049 2.273 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.081 2.412 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.935 2.079 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.809 2.018 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.988 2.228 THR 93.A N ASP 92.A OD1 THR 93.A H 2.747 2.010 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.894 2.054 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.786 1.968 SER 95.A OG THR 100.A OG1 SER 95.A HG 2.724 2.083 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.858 2.064 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.940 2.083 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.814 1.961 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.990 2.349 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.115 2.295 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.236 2.452 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.747 1.902 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.842 1.997 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.812 2.064 SER 108.A OG GLU 47.A OE1 SER 108.A HG 2.995 2.228 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.971 2.133 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.800 2.098 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.134 2.304 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.930 2.120 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.865 2.093 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 2.999 2.326 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.269 2.443 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.687 1.924 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.871 2.071 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.105 2.282 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.043 2.210 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.775 1.987 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.877 2.030 LEU 125.A N.A TRP 42.A O LEU 125.A H.A 2.895 2.160 LEU 125.A N.B TRP 42.A O LEU 125.A H.B 2.881 2.125 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.984 2.149 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.022 2.390 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.859 2.047 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.887 2.031 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.082 2.235 SER 131.A OG ASP 146.A OD2 SER 131.A HG 2.787 2.109 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.023 2.163 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.972 2.119 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.967 2.110 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE2 ASN 134.A HD21 3.105 2.359 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.024 2.258 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.740 1.910 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.966 2.129 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.833 2.002 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.917 2.239 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.877 2.021 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.955 2.102 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.919 2.070 LYS 142.A NZ ASP 146.A OD2 no hydrogen 3.567 N/A THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.005 2.174 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H 2.963 2.109 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.891 2.051 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.842 2.007 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.933 2.180 LYS 149.A N ASP 146.A O LYS 149.A H 3.343 2.537 LYS 149.A NZ GLY 319.A O no hydrogen 3.005 N/A SER 151.A N.A ALA 148.A O SER 151.A H.A 2.925 2.218 SER 151.A N.B ALA 148.A O SER 151.A H.B 2.923 2.206 LEU 152.A N ALA 148.A O LEU 152.A H 3.159 2.497 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H 3.142 2.442 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.966 2.185 SER 154.A N GLY 172.A O SER 154.A H.A 3.137 2.519 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.799 2.130 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.037 2.227 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.833 2.042 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.874 2.072 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.906 2.158 TYR 163.A OH ASP 276.A O.B TYR 163.A HH 3.095 2.448 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.270 2.582 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.842 2.006 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.809 1.975 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.890 2.107 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.886 2.076 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.160 2.383 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.792 1.949 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.793 1.959 THR 177.A N ASP 175.A OD1 THR 177.A H 2.917 2.110 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.058 2.211 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.931 2.101 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.920 2.073 THR 186.A N LEU 325.A O.A THR 186.A H 2.759 1.991 THR 186.A N LEU 325.A O.B THR 186.A H 2.876 2.161 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.832 2.043 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.291 2.435 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.884 2.052 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.875 2.025 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.869 2.037 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD1.A THR 198.A HG1 2.598 1.938 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.796 2.035 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.766 1.992 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.201 2.412 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.758 1.922 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.027 2.266 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.946 2.170 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.786 1.937 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.868 2.034 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.726 1.874 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.050 2.264 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.907 2.087 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.866 2.047 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 3.003 2.249 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.958 2.133 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.007 2.152 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.882 2.067 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.756 1.925 GLY 221.A N ASP 219.A OD1 GLY 221.A H 2.910 2.167 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.253 2.401 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.649 1.909 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.089 2.229 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.906 2.066 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.966 2.168 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.046 2.215 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.911 2.067 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.078 2.249 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.035 2.255 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.724 1.885 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.001 2.157 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.888 2.058 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.941 2.151 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.028 2.189 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.011 2.170 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.061 2.207 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 3.031 2.224 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.843 1.983 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 2.991 2.157 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.884 2.073 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.103 2.366 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.766 1.944 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.894 2.062 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.849 2.084 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.910 2.059 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.932 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.909 2.057 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.949 2.144 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.891 2.041 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.933 2.146 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.852 2.074 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.974 2.145 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.806 2.028 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.079 2.373 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.908 2.142 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.903 2.055 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.739 1.885 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H.A 2.917 2.163 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.921 2.082 ASP 279.A N ASP 276.A O.A ASP 279.A H 3.265 2.408 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.969 2.167 GLY 281.A N ASP 279.A OD1 GLY 281.A H 2.828 2.005 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.846 2.053 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.942 2.089 SER 287.A OG SER 289.A O SER 287.A HG 3.537 3.061 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H.A 3.010 2.156 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.795 1.942 PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.838 2.042 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.051 2.207 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.731 2.078 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.889 2.066 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.050 2.219 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.854 2.043 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.821 2.002 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.610 1.806 ALA 298.A N.A SER 296.A OG ALA 298.A H.A 3.026 2.176 ALA 298.A N.B SER 296.A OG ALA 298.A H.B 3.017 2.169 ILE 300.A N.A SER 297.A O ILE 300.A H.A 2.984 2.222 ILE 300.A N.B SER 297.A O ILE 300.A H.B 2.802 1.953 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.791 1.959 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.883 2.069 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.769 1.976 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.781 1.967 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.038 2.317 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.956 2.306 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.939 2.107 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H.B 2.841 1.992 LYS 311.A NZ.A ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3.A 2.987 2.142 LYS 311.A NZ.B ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2.B 2.686 1.855 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.126 2.330 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.970 2.148 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.823 2.005 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.052 2.217 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.785 1.954 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.787 1.942 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.943 2.132 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.916 2.076 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.748 1.997 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.092 2.272 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.076 2.347 LEU 325.A N.A THR 186.A O LEU 325.A H.A 3.077 2.242 LEU 325.A N.B THR 186.A O LEU 325.A H.B 3.081 2.266 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H.A 2.862 2.054 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.931 2.124 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.926 2.137 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD1 LYS 330.A HZ2 2.769 1.953 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.802 2.088 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.171 2.555 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.821 1.974