Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5sap_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.994 2.198 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.945 2.130 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.621 1.967 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.930 2.096 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.898 2.090 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.908 2.112 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.872 2.079 LEU 13.A N ASP 11.A OD1 LEU 13.A H 3.078 2.307 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.259 2.405 ASP 15.A N ASP 11.A OD1 ASP 15.A H 3.014 2.164 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.688 1.919 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.886 2.061 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.900 2.125 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.830 2.069 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.920 2.096 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 2.995 2.172 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.863 2.047 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.818 1.980 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.039 2.240 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.741 2.029 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.791 1.966 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 3.039 2.184 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.935 2.125 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.803 1.944 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.935 2.100 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.909 2.071 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.888 2.067 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.884 2.075 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.795 2.034 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.883 2.072 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.311 2.456 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.699 1.883 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.970 2.250 TRP 42.A NE1 TYR 79.A OH TRP 42.A HE1 2.813 2.106 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.890 2.121 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.951 2.134 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.913 2.113 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.713 1.922 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.905 2.146 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.941 2.149 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.033 2.181 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.700 1.906 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 3.007 2.160 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.984 2.189 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.849 2.028 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.112 2.257 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.768 1.954 GLN 56.A N GLN 56.A OE1 GLN 56.A H 2.848 2.066 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.051 2.226 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O.A GLN 56.A HE21 3.092 2.323 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O.B GLN 56.A HE21 2.887 2.124 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.900 2.131 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.920 2.070 TYR 59.A OH ASP 92.A OD2 TYR 59.A HH 2.714 1.908 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.836 2.001 LYS 63.A N.A THR 60.A O LYS 63.A H.A 3.042 2.226 LYS 63.A N.B THR 60.A O LYS 63.A H.B 3.042 2.232 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.968 2.118 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 3.314 2.680 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 2.753 1.956 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.867 2.066 THR 66.A OG1 SER 64.A OG THR 66.A HG1 3.267 2.681 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD1 THR 66.A HG1 2.649 1.959 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.265 2.427 LYS 68.A N.A THR 91.A O LYS 68.A H.A 2.969 2.179 LYS 68.A N.B THR 91.A O LYS 68.A H.B 2.977 2.187 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.825 1.971 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.159 2.310 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.886 2.061 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.061 2.272 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.203 2.435 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.311 2.541 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.915 2.082 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.890 2.057 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.970 2.145 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 3.065 2.212 SER 84.A N SER 113.A OG SER 84.A H 2.973 2.162 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.135 2.355 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 2.971 2.181 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.032 2.238 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.117 2.478 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.942 2.091 TYR 90.A OH GLU 47.A OE1 TYR 90.A HH 2.812 2.088 THR 91.A N LYS 68.A O.A THR 91.A H 2.808 2.022 THR 91.A N LYS 68.A O.B THR 91.A H 2.843 2.038 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.964 2.199 THR 93.A N ASP 92.A OD1 THR 93.A H 2.755 2.026 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.902 2.064 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.811 1.990 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.868 2.076 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.937 2.080 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.823 1.969 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.950 2.280 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.118 2.285 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.207 2.435 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.729 1.882 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.865 2.017 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.829 2.087 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.949 2.111 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.793 2.044 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.147 2.309 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.949 2.130 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.878 2.121 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 3.010 2.373 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.197 2.367 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.665 1.899 GLU 118.A N.A SER 114.A O GLU 118.A H.A 2.890 2.107 GLU 118.A N.B SER 114.A O GLU 118.A H.B 2.847 2.023 ASP 119.A N.A PHE 116.A O ASP 119.A H.A 3.017 2.177 ASP 119.A N.B PHE 116.A O ASP 119.A H.B 3.164 2.411 THR 121.A N ASP 119.A OD1.B THR 121.A H 3.133 2.310 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1.B THR 121.A HG1 2.818 1.993 ILE 122.A N ASP 119.A O.A ILE 122.A H 3.242 2.385 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.896 2.048 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.912 2.183 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.994 2.168 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 2.998 2.333 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.844 2.031 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.891 2.034 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.055 2.204 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.048 2.194 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.981 2.127 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.959 2.101 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE2 ASN 134.A HD21 3.053 2.288 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.052 2.296 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.741 2.052 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.961 2.128 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.840 2.007 GLN 140.A NE2.A THR 132.A O GLN 140.A HE22.A 2.775 2.105 GLN 140.A NE2.A ASN 134.A O GLN 140.A HE21.A 2.975 2.124 GLN 140.A NE2.B THR 132.A O GLN 140.A HE22.B 3.042 2.260 GLN 140.A NE2.B ASN 134.A O GLN 140.A HE21.B 2.839 1.992 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.941 2.084 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.953 2.100 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.062 2.234 ASP 146.A N.A THR 143.A OG1 ASP 146.A H.A 3.008 2.159 ASP 146.A N.B THR 143.A OG1 ASP 146.A H.B 2.984 2.130 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.927 2.092 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.816 1.991 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.938 2.181 LYS 149.A N.B PHE 145.A O LYS 149.A H.B 2.813 2.128 LYS 149.A NZ.A GLY 319.A O LYS 149.A HZ2.A 3.056 2.214 SER 151.A N.A ALA 148.A O SER 151.A H.A 2.937 2.220 SER 151.A N.B ALA 148.A O SER 151.A H.B 2.944 2.232 SER 151.A OG.B ALA 148.A O SER 151.A HG.B 2.838 2.048 LEU 152.A N LYS 149.A O.A LEU 152.A H 3.157 2.406 LEU 152.A N LYS 149.A O.B LEU 152.A H 3.000 2.224 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.953 2.175 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.815 2.144 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.060 2.248 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.822 2.031 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.891 2.083 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.911 2.171 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.318 2.610 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.845 2.015 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.798 1.984 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.879 2.096 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.881 2.066 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.132 2.358 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.807 1.962 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.813 1.981 THR 177.A N ASP 175.A OD1 THR 177.A H 2.969 2.153 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 2.696 1.858 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 3.462 2.903 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.037 2.196 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.932 2.106 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.929 2.091 THR 186.A N LEU 325.A O.A THR 186.A H 2.754 1.990 THR 186.A N LEU 325.A O.B THR 186.A H 2.867 2.158 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.854 2.067 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.300 2.441 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.878 2.051 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.925 2.075 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.849 2.019 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD1.A THR 198.A HG1 2.520 1.852 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.847 2.088 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.750 1.993 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.231 2.447 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.760 1.998 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.057 2.301 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.939 2.165 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.801 1.950 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.883 2.050 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.745 1.887 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.014 2.234 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.928 2.108 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.874 2.049 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 3.014 2.262 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.942 2.109 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.024 2.170 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.885 2.063 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.771 2.267 GLY 221.A N ASP 219.A OD1 GLY 221.A H 2.933 2.195 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.206 2.354 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD2 THR 222.A HG1 2.635 2.045 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.050 2.191 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.937 2.099 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.971 2.176 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.033 2.201 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.894 2.054 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.101 2.280 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.023 2.249 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.724 1.889 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.026 2.179 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.876 2.050 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.974 2.189 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.007 2.165 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.003 2.166 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.077 2.220 LYS 243.A N.A VAL 252.A O LYS 243.A H.A 2.996 2.191 LYS 243.A N.B VAL 252.A O LYS 243.A H.B 3.004 2.206 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.842 1.983 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.025 2.196 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.892 2.095 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.122 2.394 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.770 1.953 VAL 252.A N LYS 243.A O.A VAL 252.A H 2.892 2.053 VAL 252.A N LYS 243.A O.B VAL 252.A H 2.852 2.024 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.877 2.109 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.903 2.052 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.980 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.898 2.041 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.928 2.124 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.896 2.045 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.935 2.148 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.880 2.099 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.963 2.131 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.812 2.055 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.024 2.294 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.878 2.110 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.904 2.054 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.747 1.896 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H.A 2.924 2.155 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.928 2.084 ASP 279.A N ASP 276.A O.A ASP 279.A H 3.262 2.405 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.964 2.162 GLY 281.A N ASP 279.A OD1 GLY 281.A H 2.817 1.999 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.811 2.014 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.967 2.113 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H.B 3.027 2.173 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.806 1.962 CYS 290.A SG ASP 279.A OD1 no hydrogen 3.915 N/A PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.842 2.038 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.049 2.206 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.751 2.107 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.888 2.067 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.017 2.186 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.854 2.034 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.808 2.004 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.659 1.822 ALA 298.A N.A SER 296.A OG ALA 298.A H.A 3.056 2.214 ALA 298.A N.B SER 296.A OG ALA 298.A H.B 3.053 2.202 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H 2.799 1.949 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.840 2.013 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.886 2.078 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.771 1.994 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.770 1.965 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.019 2.286 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.973 2.339 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.956 2.114 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H.B 2.845 1.998 LYS 311.A NZ.A ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2.A 3.052 2.208 LYS 311.A NZ.B ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2.B 2.508 1.684 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.145 2.357 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.974 2.150 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.822 2.006 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.048 2.215 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.778 1.950 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.801 1.957 ASN 318.A N.A THR 324.A O ASN 318.A H.A 2.952 2.139 ASN 318.A N.B THR 324.A O ASN 318.A H.B 2.957 2.144 ASN 318.A ND2.A THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22.A 2.873 2.023 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.762 2.014 ALA 320.A N ASN 318.A OD1.A ALA 320.A H 3.162 2.365 ALA 320.A N ASN 318.A OD1.B ALA 320.A H 2.954 2.117 THR 324.A N ASN 318.A O.A THR 324.A H 3.089 2.342 THR 324.A N ASN 318.A O.B THR 324.A H 3.091 2.343 LEU 325.A N.A THR 186.A O LEU 325.A H.A 3.099 2.253 LEU 325.A N.B THR 186.A O LEU 325.A H.B 3.106 2.295 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H.A 2.859 2.043 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.910 2.101 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.920 2.112 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD1 LYS 330.A HZ2 2.767 1.891 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.829 2.028 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.818 1.960